ispitivanje tolerancije soja pseudomonas aeruginosasan...

20
Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosa san ai Pseudomonas aeruginosa san ai na kadmijum, bakar i živu Milena Rikalović Gordana Gojgić-Cvijović* Milena Rikalović, Gordana Gojgić Cvijović , Miroslav M. Vrvić i Ivanka Karadžić** Hemijski fakultet u Beogradu *Centar za hemiju, IHTM **Institut za hemiju, Medicinski fakultet u Beogradu

Upload: vankien

Post on 03-Feb-2018

220 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosa san ai Pseudomonas aeruginosa san ai na kadmijum, bakar i živuj

Milena Rikalović Gordana Gojgić-Cvijović* Milena Rikalović, Gordana Gojgić Cvijović , Miroslav M. Vrvić i Ivanka Karadžić**

Hemijski fakultet u Beograduj g*Centar za hemiju, IHTM**Institut za hemiju, Medicinski fakultet u Beogradu

Page 2: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Zagađenje okoline teškim metalima se širi paralelno Zagađenje okoline teškim metalima se širi paralelno sa razvojem industrije

Page 3: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Toksični efekat metala se može podeliti u tri pgrupe

blokiranje esencijalnih bioloških funkcionalnih grupa na j j g pbiomolekulima zamena esencijalnih metalnih jona u biomolekulima modifikovanje aktivne konformacije biomolekula

% zastupljenosti u kontaminiranoj sredini iforma u kojoj se metal nalazi

Page 4: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

N fi i l ških f k i k ič i C Na osnovu fizioloških efekata i toksičnosti Cu pripada grupi srednje toksičnosti zajedno sa Zn, Ni, Co, W, V, Cr, dok Cd and Hg spadaju u , , , , , , g p jvisiko toksičnu grupu uz As, Ag, Sb, Pb i U

Alternativa – BIOREMEDIJACIJA - vijabilna Alternativa BIOREMEDIJACIJA vijabilna ili mrtva biomasa bakterija, algi, gljiva ili fitoremedijacija

Page 5: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Biosorpcija na površini ćelijepovršini ćelijeIntracelularno usvajanje

Biosorpcija Bioakumulacijausvajanje

Biohemijske transformacije

Bioakumulacija

transformacije

Page 6: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar
Page 7: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

1. Gajenje mikroba P. aeruginosa san ai2. MIK za Hg, Cu i Cd3. Dinamika usvajanja kadmijuma4 Praćenje promene elektroforetskog profila 4. Praćenje promene elektroforetskog profila proteina fermentacione tečnosti (FT) i biomase (BM)biomase (BM)

Page 8: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Pseudomonas sp. Gram -, rasprostranjeni, sposobni su d l š š k k ( č da metabolišu širok spektar supstrata (aromatični i alifatični ugljovodonici, industrijski otpad)

Soj san ai izolovan iz industrijskog mineralnog ulja za sečenje metala, specifično prirodno okruženje (alkalno redukovana voda bogato ugljovodonicima)(alkalno, redukovana voda, bogato ugljovodonicima)

Malobrojne publikacije vezane za Cr, Cd, Cu, Zn i Pb

Page 9: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

S j j k i i h lji (T l k Soj je aktiviran na hranljivom agru (Torlak, Srbija) na 30 ºC, 24 h. Predfermentacija LB medijum ( 5 g/l NaCl 10 Predfermentacija LB medijum ( 5 g/l NaCl, 10 g/l pepton I i ekstrakt kvasca 5 g/l), na 30 ºC, 250 tresaka/min, 24 h. , 50 tresaka/m n, h. Fermentacija LB medijum sa 100 mM CdCl2, na 30 ºC, 250 tresaka/min, 5 dana

Page 10: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Metal MIK* Literatura**

Cd 2 mM 0 95 do 6 Cd 2 mM 0.95 do 6 mM

C 4 M 2 d 10 Cu 4 mM 2 do 10 mM

Hg < 0.5 mM < 0.5 mM

*24 h, 30 stepeni, 550 nm, colorimetar Selecta, Spain**nativni sojevi

Page 11: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

humani karcinogenhumani karcinogenzamenom Fe2+ ili Zn2+ jonaOslobađanje Fe koji generiše j j gOH radikalePeroksidacija lipidaOKSIDATIVNI STRESOKSIDATIVNI STRESCBT tip hemosmotskih antiportera P ATPaze i CDFantiportera, P-ATPaze i CDF

Page 12: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

P ć j k ij Cd Praćenje promene koncentracije Cd u FT i BM

Koncentracija metala određivana je k i atomskom apsorpcionom

spektrometrijom

Page 13: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

140 Cd mg/mL FT

Cd mg/ BM U

112,41

100

120 Cd mg/g BM

85,8

71 7

76,4580

mg/

ml

55,560,75

71,7

40

60Cd,

35,2

23,5827,1429,3

21,59

6 376 5 98 7 154 63

20

40

00

6,376 5,98 7,15 5,064,630

1 2 3 4 5 6 7

Dani fermentacije

Sl. 1. Dinamika usvajanja kadmijuma

Page 14: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

komparativni proteomiks, zatim In silico identifikacija proteina lu gelu

up regulacija enzima koji su uključeni u: metaboličke putanje transporta e-, metabolizam histidina, sinteza amino kiselina, metabolizam purina i pirimidina i sintezu kofaktorametabolizam purina i pirimidina i sintezu kofaktora(obezbeđivanje ATP)

Page 15: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

3.SDS66.2 kDa

45 kDa45 kDa

35 kDa

25 kDa

18.25 kDa

LB FT Cd FT LB BM Cd BM

18.25 kDa

14.4 kDa

LB FT Cd FT LB BM Cd BMSl. 2. SDS elektroforeza proteina FT i BM P. aeruginosa san ai (10% gel, bojeno CBB-om)

Page 16: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Od MO d b d Odgovor MO ne mora da bude identičan, bezobzira na vrstu, pa očekujemo specifičnosti vezane i za soj očekujemo specifičnosti vezane i za soj san aiUsvajanje metala zavisi od nutrijentata Usvajanje metala zavisi od nutrijentata koji su dostupni (LB i MM različita ekspresija)p j )Prilikom optimizacije procesa bioremedijacije moraju se uzeti u obzir i fi i l ški kti i h i ii fiziološki aspekti i mehanizmi

Page 17: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

P i i j t l t Cd C P. aeruginosa san ai je tolerantan na Cd, Cu , Hg sa MIK vrednostima 2, 4, 0.5 mM redom, u poredjenju sa ostalim nativnim sojevima je na por j nju sa osta m nat n m soj ma j na sredini (literatura)Dinamika sa Cd pokazala je da je najintenzivnija faza usvajanja metala tokom najintenzivnija faza usvajanja metala tokom prvih 24h. Smanjenje koncentracije Cd2+ u j j jfermetacionoj tečnosti 4 puta. Soj ima potencijal da bude primenjen u procesima bioremedijacijebioremedijacije

Page 18: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

Elektroforetski profil proteina FT i BMElektroforetski profil proteina FT i BMmikroba gajenog na LB medijumu sa i bez Cd pokazuje znacajne razlikep j jDalje eksperimente usmeriti na distribuciju metala i odgovor MO na nivou proteoma, tj.

ć j f kt t t ški t li praćenje efekta stresa teškim metalima na proteinsku ekspresiju *www.emsl.pnl.gov(Environmental Molecular Sciences Laboratory US)(Environmental Molecular Sciences Laboratory, US)

Page 19: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

O j d j d ž d Ovaj rad je podržan od strane Ministarstva za nauku i tehnološki

j blik S bij j k N razvoj republike Srbije projekat No. III 43004A i h l i d N F ji TRIAutori su zahvalni dr N. Fujiwara sa TRI(Technology Research Institute),O k J lj b j d iji j Osaka, Japan, na ljubaznoj donaciji soja i B. Potkonjaku sa IHTM-a na AAS

li ianalizi.

Page 20: Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan …p43004/ref/2011_49shd_mrikalovic_prez.pdf · Ispitivanje tolerancije soja Pseudomonas aeruginosasan ai na kadmijum, bakar

HVALA NA PAŽNJIHVALA NA PAŽNJI