bioquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

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BIOQUIMICA BIOQUIMICA

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Page 1: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

BIOQUIMICABIOQUIMICA

Page 2: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Las actividades de y en las células Las actividades de y en las células son:son:

MovimientosMovimientos de átomos en de átomos en las moléculas que las formanlas moléculas que las forman

Page 3: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

ATOMOSATOMOSLa materia –seres vivos inclusive- está La materia –seres vivos inclusive- está constituida por elementosconstituida por elementos

Los elementos son por definición, Los elementos son por definición, sustancias que no pueden ser sustancias que no pueden ser desintegradasdesintegradas

La partícula más pequeña de un elemento La partícula más pequeña de un elemento es el átomoes el átomo

Page 4: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Hay 109 elementosHay 109 elementos– Se suele trabajar con unos 40 !Se suele trabajar con unos 40 !

Cada elemento se nombra con un símboloCada elemento se nombra con un símbolo

Cada elemento tiene su Cada elemento tiene su número atómico número atómico y su peso atómicoy su peso atómico

Todos los elementos se muestran en la Todos los elementos se muestran en la tabla periódicatabla periódica

Page 5: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En la tabla periódica los elementos se En la tabla periódica los elementos se ordenan por su nuúmero atómico, en ordenan por su nuúmero atómico, en orden creciente.orden creciente.

Los elementos con características Los elementos con características químicas comunes aparecen en la misma químicas comunes aparecen en la misma columnacolumna

Page 6: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua
Page 7: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua
Page 8: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

El comportamiento de una El comportamiento de una sustancia se puede deducir de sustancia se puede deducir de sustancias similaressustancias similares

Page 9: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Peso AtomicoPeso Atomico: se refiere a pesos : se refiere a pesos relativos en las reacciones químicasrelativos en las reacciones químicas– En un inicio se calcularon en relación al peso En un inicio se calcularon en relación al peso

del hidrógeno: todos los demás elementos del hidrógeno: todos los demás elementos serían múltiplos del hidrógeno (=1)serían múltiplos del hidrógeno (=1)

Los químicos adoptaron valores Los químicos adoptaron valores estándares en relación al átomo de estándares en relación al átomo de Carbono ( = 12 unidades atómicas de Carbono ( = 12 unidades atómicas de peso)peso)

En la tabla periódica el peso atómico está, En la tabla periódica el peso atómico está, debajo del símbolodebajo del símbolo

Page 10: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En la En la tabla periódicatabla periódica se puede observar se puede observar un patrón de las propiedades de los un patrón de las propiedades de los elementos:elementos:

Page 11: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Más livianos no metales

metales

grupo

Page 12: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Los átomos se combinan en proporciones Los átomos se combinan en proporciones de números de números enterosenteros para formar para formar

compuestos: compuestos: HH22OOLas reacciones químicas se describen Las reacciones químicas se describen usando ecuaciones químicas:usando ecuaciones químicas:

– 2H2H2 2 (g) + O(g) + O22 (g) 2H (g) 2H22O (l)O (l)

Page 13: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Una sustancia que contiene átomos de Una sustancia que contiene átomos de distintos elementos en proporción definida distintos elementos en proporción definida es un compuestoes un compuesto– La “composición” de un compuesto se ve en La “composición” de un compuesto se ve en

su fórmula químicasu fórmula química

Si los átomos están enlazados Si los átomos están enlazados fuertemente y físicamente se comportan fuertemente y físicamente se comportan como una unidad, como una unidad, esta unidad se llama esta unidad se llama molécula.molécula.

Page 14: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

MOLMOL

En un laboratorio, se trabaja con En un laboratorio, se trabaja con cantidades más grandes que un átomocantidades más grandes que un átomoUna cantidad estándar es el mol:Una cantidad estándar es el mol:– Cantidad de una sustancia que es igual –Cantidad de una sustancia que es igual –en en

gramos-gramos- a la suma de los pesos atómicos a la suma de los pesos atómicosMOL es una abreviación de peso molecular.MOL es una abreviación de peso molecular.

C + OC + O22 CO CO22

1mol 1mol de O 1 mol de dióxido de 1mol 1mol de O 1 mol de dióxido de carbonocarbono

molecularmolecular12.01 g 32.00 g 44.0112.01 g 32.00 g 44.01

Page 15: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Para los sólidos, líquidos y gases: se Para los sólidos, líquidos y gases: se puede convertir peso a moles (o moles a puede convertir peso a moles (o moles a peso)peso)Para las sustancias que no forman Para las sustancias que no forman moléculas se habla de moléculas se habla de peso en gramos peso en gramos de la fórmulade la fórmula– Ej: NaCl

Pero por facilidad, se habla de mol para describir cantidades en los 2 casos.

Page 16: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Estructura del AtomoEstructura del Atomo

Los pesos atómicos se explicaron cuando Los pesos atómicos se explicaron cuando los físicos rompieron los átomos y los físicos rompieron los átomos y encontraron tres partículas que los encontraron tres partículas que los componían:componían:– En un región nuclear densa: PROTONES En un región nuclear densa: PROTONES

cargados positivamentecargados positivamenteCada elemento tiene un número específico de Cada elemento tiene un número específico de protonesprotones

– El número atómico es el número de El número atómico es el número de protonesprotones

Page 17: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

A más de los protones, todos los átomos - A más de los protones, todos los átomos - excepto el Hídrógeno – tienen partículas excepto el Hídrógeno – tienen partículas neutras: NEUTRONES neutras: NEUTRONES

El número de protones y neutrones en el El número de protones y neutrones en el núcleo es igual (para los elementos más núcleo es igual (para los elementos más livianos)livianos)

Si se Si se redondea los pesos atómicosredondea los pesos atómicos, estos , estos coinciden con la suma de los electrones y coinciden con la suma de los electrones y protonesprotones

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La suma de los protones y neutrones es el La suma de los protones y neutrones es el

número de masa número de masa y se lo suele y se lo suele colocar como un numero a la izquierda:colocar como un numero a la izquierda:

ClCl35

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IsótoposIsótopos

Los protones en un átomo son constantes, Los protones en un átomo son constantes, pero puede variar el número de neutronespero puede variar el número de neutronesLos átomos que difieren por sus pesos Los átomos que difieren por sus pesos atómicos pero no por su número atómico atómicos pero no por su número atómico se llaman isótoposse llaman isótoposQuímicamente, el comportamiento de los Químicamente, el comportamiento de los isótopos de un mismo elemento es igual isótopos de un mismo elemento es igual porque tienen el mismo número de porque tienen el mismo número de electroneselectrones

Page 24: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

IONESIONES

En el átomo hay tres partículas, y una de En el átomo hay tres partículas, y una de ellas es negativaellas es negativaEstas partículas de muy poca masa están Estas partículas de muy poca masa están presentes formando una “nube” alrededor presentes formando una “nube” alrededor del núcleodel núcleoUn átomo neutro tiene el mismo número Un átomo neutro tiene el mismo número de protones y electronesde protones y electronesLos átomos que tienen un desequilibrio de Los átomos que tienen un desequilibrio de carga se llaman ionescarga se llaman iones

Page 25: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

El comportamiento de El comportamiento de muchos elementos está muchos elementos está influenciado por la carga influenciado por la carga de su ión, más que por de su ión, más que por cualquier otra propiedadcualquier otra propiedad

Page 26: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En la tabla periódica los elementos En la tabla periódica los elementos de la misma columna forman de la misma columna forman compuestos análogos porque sus compuestos análogos porque sus iones tienen la misma carga.iones tienen la misma carga.– Los halógenos tienden a ganar una Los halógenos tienden a ganar una

carga: -1carga: -1

– Los metales alcalinos a perder una Los metales alcalinos a perder una carga: +1carga: +1

Page 27: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En un compuesto las cargas se En un compuesto las cargas se equilibran si los iones + y – se equilibran si los iones + y – se equilibran: NaClequilibran: NaCl

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ElectronesElectrones

Se ubican alrededor del núcleo en nivelesSe ubican alrededor del núcleo en niveles

Los de menor energía están cerca del Los de menor energía están cerca del núcleo, los de mayor energía en las zonas núcleo, los de mayor energía en las zonas o niveles más alejadaso niveles más alejadas

Los electrones de la capa más alejada: Los electrones de la capa más alejada: son los electrones de valencia y son los electrones de valencia y determinan la química del elementodeterminan la química del elemento

Page 29: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Los átomos se pueden unir.Los átomos se pueden unir.

Pares de átomos: Pares de átomos: COMPARTEN electroneselectrones

Pares de átomos: Pares de átomos: TRANSFIEREN sus electronesTRANSFIEREN sus electrones

Page 30: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Principio: átomo es más estable Principio: átomo es más estable si la capa externa de electrones si la capa externa de electrones está completaestá completa

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ENLACES IONICOSENLACES IONICOS

ENLACES COVALENTESENLACES COVALENTES

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MOLECULAS MOLECULAS POLARESPOLARES

Y Y NO POLARESNO POLARES

Page 34: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En el agua, el oxígeno atrae a los En el agua, el oxígeno atrae a los electrones con más fuerza que el electrones con más fuerza que el hidrógeno:hidrógeno:

– El enlace está POLARIZADO:El enlace está POLARIZADO:

Un átomo tiene carga parcial negativa Un átomo tiene carga parcial negativa y el otro positivay el otro positiva

Page 35: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

O

H H

+ +

Esta es una molécula polar: molécula con distribución asimétrica de las cargas.

Page 36: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Las moléculas que tienen ENLACES NO Las moléculas que tienen ENLACES NO POLARIZADOS como los de Carbono e POLARIZADOS como los de Carbono e Hidrógeno se dice que son: NO Hidrógeno se dice que son: NO POLARESPOLARES

Estas moléculas son inertes Estas moléculas son inertes no no reaccionanreaccionan– Ejemplo: las grasasEjemplo: las grasas

Page 37: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

ENLACES NO ENLACES NO COVALENTESCOVALENTES

Page 38: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Son uniones más débilesSon uniones más débiles

Ocurren Ocurren entre las moléculaslas moléculas– Los enlaces covalentes ocurren entre Los enlaces covalentes ocurren entre

átomosátomos de una molécula de una molécula

No dependen de electrones compartidos sino de fuerzas de atracción entre regiones con carga eléctrica diferente– De la misma molécula o de dos moléculas

cercanas.

Page 39: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

La energía necesaria para romper La energía necesaria para romper estos enlaces es baja (1-5 estos enlaces es baja (1-5 kilocalorías por mol)kilocalorías por mol)

Se rompen y se forman Se rompen y se forman nuevamente con mucha facilidadnuevamente con mucha facilidad

Page 40: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Tipos de enlaces no Tipos de enlaces no covalentescovalentes

Page 41: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

ENLACES DE HIDROGENOENLACES DE HIDROGENO

En la unión de HIDROGENO con un En la unión de HIDROGENO con un átomo electronegativo:átomo electronegativo:– OXIGENOOXIGENO– NITROGENONITROGENO

Los electrones (2) compartidos se Los electrones (2) compartidos se desplazan mucho hacia el átomo desplazan mucho hacia el átomo electronegativoelectronegativo

Page 42: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Entre la mayor parte de Entre la mayor parte de moléculas polares se forman moléculas polares se forman enlaces de hidrógenoenlaces de hidrógeno

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Puente (enlace de hidrógeno)

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INTERACCIONES INTERACCIONES HIDROFOBICASHIDROFOBICAS

Las moléculas polares pueden interactuar Las moléculas polares pueden interactuar con el aguacon el agua

Las moléculas no polares son Las moléculas no polares son INSOLUBLES en el agua debido a: ?INSOLUBLES en el agua debido a: ?

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Solubles en el agua: HIDROFILICASSolubles en el agua: HIDROFILICAS– AminoácidosAminoácidos– AzúcaresAzúcares

Insolubles en el agua: HIDROFÓBICASInsolubles en el agua: HIDROFÓBICAS

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Cuando moléculas hidrofóbicas se Cuando moléculas hidrofóbicas se mezclan con agua:mezclan con agua:– Se ven obligadas a “reunirse” (formar Se ven obligadas a “reunirse” (formar

agregados) para tener la mínima superficie agregados) para tener la mínima superficie expuesta a las moléculas polares vecinasexpuesta a las moléculas polares vecinas

– Esta reunión o agrupamiento de moléculas no Esta reunión o agrupamiento de moléculas no polares se llama INTERACCION polares se llama INTERACCION HIDROFOBICAHIDROFOBICA

Esta interacción Esta interacción no se considera un no se considera un enlaceenlace puesto que no hay atracción entre puesto que no hay atracción entre las moléculas.las moléculas.

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Page 48: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

FUERZAS DE VAN DER FUERZAS DE VAN DER WAALSWAALS

Los grupos hidrofóbicos Los grupos hidrofóbicos sísí pueden formar pueden formar enlaces –débiles- por atracción enlaces –débiles- por atracción electrostáticaelectrostática

Page 49: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

En una molécula NO polar se puede En una molécula NO polar se puede observar que los electrones no siempre observar que los electrones no siempre están distribuidos simétricamente.están distribuidos simétricamente.

Hay instantes en que la DENSIDAD de Hay instantes en que la DENSIDAD de electrones puede ser mayor en un lado del electrones puede ser mayor en un lado del átomoátomo

Page 50: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Esta “asimetría transitoria” en la Esta “asimetría transitoria” en la distribución de electrones genera la distribución de electrones genera la separación de cargas (separación de cargas (dipolosdipolos) en la ) en la moléculamolécula

Si dos moléculas con dipolos transitorios Si dos moléculas con dipolos transitorios se encuentran cerca, se pueden generar se encuentran cerca, se pueden generar FUERZAS DE ATRACCIÓN FUERZAS DE ATRACCIÓN

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Esta atracción es un enlace van der Waals Esta atracción es un enlace van der Waals

Es muy débil:Es muy débil:– 1Kcal/mol1Kcal/mol

Además es muy sensible a la distancia Además es muy sensible a la distancia entre los átomosentre los átomos

Pero es una fuerza importante en la Pero es una fuerza importante en la interacción de moléculas biológicasinteracción de moléculas biológicas

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Page 53: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Propiedades del Propiedades del aguaagua

Page 54: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Entre las moléculas que Entre las moléculas que componen los seres vivos, componen los seres vivos, la más abundante: el aguala más abundante: el agua–Entre el 50% y 95 % del peso Entre el 50% y 95 % del peso

de cualquier sistema vivode cualquier sistema vivo–Además el líquido más Además el líquido más

abundante: cubre ¾ partes abundante: cubre ¾ partes de la Tierrade la Tierra

Page 55: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

El agua es “bastante El agua es “bastante extraordinaria”: extraordinaria”: –por sus propiedades físicas y por sus propiedades físicas y

químicasquímicas–Por ser el solvente de los Por ser el solvente de los

componentes celularescomponentes celularesInfluye en la organización y Influye en la organización y disposición espacial de todas disposición espacial de todas las otras moléculas biológicaslas otras moléculas biológicas

Page 56: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Consideremos su estructura Consideremos su estructura molecularmolecular

En Cada molécula: En Cada molécula: – un átomo de oxígenoun átomo de oxígeno– 2 átomos de hidrógeno2 átomos de hidrógeno– Cada átomo de hidrógeno se une al Cada átomo de hidrógeno se une al

oxígeno por un enlace covalenteoxígeno por un enlace covalente

La molécula de agua tiene carga neutra:La molécula de agua tiene carga neutra:– Tiene igual número de electrones y Tiene igual número de electrones y

protonesprotones– Pero es una molécula POLARPero es una molécula POLAR

Page 57: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

Un tetraedro, con el oxígeno en el centro

El oxígeno cargado negativamente, despoja al Hidrógeno de sus electrones (33% de carácter iónico)

Los hidrógenos tienen predominio de cargas positivas

La molécula se convierte en un dipolo

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Cuando una región cargada de una molécula se aproxima a una región de carga de otra molécula se forma un enlace: puente de hidrógeno

El agua es la molécula con más capacidad para formar puentes de hidrógeno

El enlace covalente tiene 20 veces más energía que el puente de hidrógeno

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Un puente de hidrógeno dura Un puente de hidrógeno dura 0,000000000001 segundo0,000000000001 segundo

Si se rompe uno se forma otroSi se rompe uno se forma otro

Pero el conjunto de puentes hace Pero el conjunto de puentes hace que una molécula de agua esté que una molécula de agua esté muy aferrada a otra y formen un muy aferrada a otra y formen un líquidolíquido

Las propiedades del agua están Las propiedades del agua están dadas por estos puentes de dadas por estos puentes de hidrógenohidrógeno

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TENSIÓN SUPERFICIALTENSIÓN SUPERFICIAL

Al caer una gota parece que está Al caer una gota parece que está unida por un hilo del borde, si se cae unida por un hilo del borde, si se cae la gota forma una esferala gota forma una esfera

Los insectos pueden caminar sobre el Los insectos pueden caminar sobre el aguaagua

Esto depende de la tensión Esto depende de la tensión superficialsuperficial

Page 61: BIOquímica atomos, enlaces entre moleculas, propiedades del agua

La tensión superficial depende de la La tensión superficial depende de la COHESIÓN entre las moléculas de aguaCOHESIÓN entre las moléculas de agua– Diferenciar adhesiónDiferenciar adhesión

La tensión superficial es la fuerza de La tensión superficial es la fuerza de atracción que sufren las moléculas hacia el atracción que sufren las moléculas hacia el centro del líquidocentro del líquido– En las moléculas de la superficie, predomina En las moléculas de la superficie, predomina

esta atracción hacia el centroesta atracción hacia el centro

Solo hay un líquido con mayor tensión Solo hay un líquido con mayor tensión superficial que el agua: el mercuriosuperficial que el agua: el mercurio

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Pero el agua, por sus cargas positivas o Pero el agua, por sus cargas positivas o negativas se puede unir a otras negativas se puede unir a otras superficies con carga eléctrica: superficies con carga eléctrica: “capacidad de mojar o humectante”“capacidad de mojar o humectante”

Esta sería otra fuerza, que influye en la Esta sería otra fuerza, que influye en la tensión superficial:tensión superficial:– Además debemos considerar:Además debemos considerar:

La adhesividad del agua (unión con otra La adhesividad del agua (unión con otra superficie)superficie)

La viscosidad (inverso de la velocidad de flujo)La viscosidad (inverso de la velocidad de flujo)

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