la microbiologia clinica nella diagnosi di sepsi del laboratorio di microbiologia nella diagnosi di...

La Microbiologia Clinica

nella diagnosi di sepsi

sessione “La Sepsi”

C. Giraldi

La SEPSI è una delle più gravi sindromi infettive La SEPSI è una malattia progressiva

REVIEW Clinical Microbiology and Infection, Volume 19 Number 6, June 2013

The three most common aetiologies of BSI are

E. coli, S. aureus and S. pneumoniae,

which occur at approximate rates of 35, 25 and 10

per 100 000 population, respectively.

Ruolo del laboratorio di Microbiologia


identificazione agente eziologico e ATB

tempestività step by step risultato

epidemiologia locale

Diagnosis

Obtain appropriate cultures before starting antibiotics

provided this does not significantly delay antimicrobial

administration

Obtain two or more BCs

One or more BCs should be percutaneous

One BC from each vascular access device in place > 48 hrs

Culture other sites as clinically indicated

Sample any source of infection, if safe to do so


Emocoltura

Coltura sito d’infezione

isolamento colturale del

microrganismo dal sangue

batteriemia

batteriemie in corso di IVU

endocardite infettiva

febbri di origine sconosciuta

sepsi associate a catetere endovascolare

batteriemie associate a polmonite

meningiti

EMOCOLTURA



Frequenza di Positività di Emocolture da

Pazienti Adulti con Differenti Infezioni

Cellulite acuta 2%

Infezione del piede diabetico/vascolare 10%

Malattia febbrile acuta in neutropenico 20%

Pielonefrite 20%

Polmonite acquisita in comunità 30%

Meningite batterica acuta 50%

Osteomielite acuta 50%

Cellulite necrotizzante 80%

Endocardite batterica 95%

Tromboflebite batterica suppurativa acuta 100%

Stratton CW Antimicrobics Infect Dis Newsletter 2000; 18:9-13

Efficacia e significato clinico dipendono da:

fase pre-analitica

interpretazione del risultato

EMOCOLTURA

Personale che effettua il prelievo

Sede del prelievo

Sterilizzazione della cute

Momento del prelievo

Numero dei prelievi

Volume del sangue

Ottimizzazione della procedura

EMOCOLTURA

What is OUTSIDE the Box? Ehmeyer S., Laessig R. Clin Chem Lab Med 2007; 4(6):766-773

Lavare le mani prima e dopo il prelievo

Indossare guanti nei passaggi di raccolta e trasporto

Ricerca del sito di prelievo mediante palpazione

Disinfezione della cute:

• sgrassare con alcool 70% (o Clorexidina)

• disinfettare con Iodoforo (Iodiopovidone)

• applicare con movimento circolare verso l’esterno, l'azione

disinfettante è tempo-dipendente

QUANDO LA CUTE È ASCIUTTA È PRONTA PER IL PRELIEVO

MAI PUNGERE PRIMA DI 1-3 MINUTI

Antiseptic skin preparation

EMOCOLTURA

prelievo

team addestrato e dedicato per il prelievo

da 4,8% a 1% Weinbaum, J Clin Microbiol, 2001

da 4,2% a 2,2% Shifman, Arch Pathol Lab Med, 1996

EMOCOLTURA

riduzione della contaminazione

Tempo del prelievo

Prima di iniziare la terapia antibiotica

Prima della sommistrazione dell’antibiotico

Nell’arco di 5-10’ eccezione: infezioni endovascolari, quali endocardite o sepsi CVC correlate*

(*) As a practical matter, blood cultures should be obtained simultaneously (or over a short timeframe). Drawing blood at intervals

is only indicated when it is necessary to document continuous bacteremia in patients with suspected infective endocarditis or

other endovascular (e.g., catheter-related) infections.

CLSI publication M47-A—Principles and Procedures for Blood Cultures

EMOCOLTURA

2 - 3 set (anaerobi + aerobi):

per aumentare la possibilità di isolare il microrganismo in causa

differenzia la vera batteriemia dalle contaminazioni

Numero di emocolture

163 malati (non endocarditi) 20 mL per set (Cockerill FR, 2004)

blood cultures

n. 1 2 3

diagnostic (%) 63 80 96

EMOCOLTURA

Optimal volume of blood for culture

“The volume of blood is the single most important factor for successful

recovery of microorganisms from the blood stream of patients”

EMOCOLTURA

Towns ML, Infect Dis Clin N Am, 2002

The volume of blood sample:

40-60 ml”

Sistemi di coltura

Tempi di incubazione

Identificazione e ATB

Interpretazione dei risultati

Ottimizzazione della procedura

EMOCOLTURA

What is in the Box? Ehmeyer S., Laessig R. Clin Chem Lab Med 2007; 4(6):766-773

metabolismo del microorganismo

Sistemi commerciali automatizzati

Strumento modulare


TIPOLOGIA FLACONI

• Prelievo con modalità di tipo Vacutainer • Dopo il prelievo nessuna manipolazione dei flaconi

VANTAGGI ATTESI

• Monitoraggio continuo

• Precocità dei risultati

• Misura indiretta della carica batterica (batteriemia correlata ai cateteri vascolari)

• Tempo massimo di incubazione (5 -7gg)


MICROORGANISMI “FASTIDIOUS”

► tempi più lunghi di coltura, almeno 2 - 3 settimane di incubazione

► alcuni microorganismi possono generare segnali molto deboli

o anche nessun segnale di crescita

Microscopia (colorazione di Gram)

Subcoltura cieca delle emocolture negative


Towns ML, Infect Dis Clin N Am, 2002

Efficacia e significato clinico dipendono da:

fase pre-analitica

interpretazione del risultato

EMOCOLTURA

Emocoltura positiva

Interpretazione del risultato

RUOLO PATOGENO

DEL MICRORGANISMO

ISOLATO

IDENTIFICAZIONE

DEI MICROORGANISMI

CONTAMINANTI

Interpreting a “Positive” Blood Culture

True Bacteremia: Unlikely Uncertain Likely

• S. aureus

• S. pneumoniae

• Enterobacteriaceae

• P. aeruginosa

• C. albicans

• Corynebacterium spp.

• Non-anthracis Bacillus spp.

• Propionibacterium acnes

• S. coagulase-negative

staphylococci

Source: Kim SD, et al: Infect Control Hosp Epidemiol 2000;21:213-7

pre-test probability patient risk factors prosthetic devices clinical evidence

post-test probability # positive / # cultures compare antibiograms compare genotypes

12 Steps to Prevent Antimicrobial Resistance: Hospitalized Adults

Step 7: Treat infection, not contamination

Emocoltura positiva

intepretazione del risultato

N° emocolture +

N° emocolture eseguite

Algoritmo di Weinstein


“ significato indeterminato” (se CoNS)

Weinstein MP et al. J Clin Microbiol 2003, 41: 2275-2278

Emocoltura positiva


N° 1 emocoltura +

N°1 emocoltura eseguita



Emocoltura positiva


N° 1 emocoltura +

N°2-3 emocolture eseguite

‘probabile contaminante’ (se CoNS)

no identificazione di specie, no antibiogramma



Emocoltura positiva


N° 2 o >2 emocolture + entro 48 h

per un probabile contaminante # da CoNS

IDENTIFICAZIONE DI SPECIE

• stessa specie → ATB

• specie diverse → probabili contaminanti → No ATB



Emocoltura positiva


N° 2 o >2 emocolture + per CoNS

IDENTIFICAZIONE DI SPECIE

• Isolati con = profilo biochimico → ATB • Isolati con ≠ profilo biochimico → probabili contaminanti → No ATB

Prior antibiotic therapy

Fastidious extracellular bacteria such as Abiotrophia, HACEK group bacteria,

Clostridium, Brucella, Legionella, Mycobacterium, and Bartonella spp.

Cell-dependent organisms, i.e. Coxiella burnetii

Fungi

EMOCOLTURE NEGATIVE

Why?


Emocoltura

Coltura sito d’infezione

CRBSI:

Catheter Related Blood Stream Infection

BATTERIEMIE e SEPSI ASSOCIATE alla PRESENZA

di CATETERE VENOSO CENTRALE (CVC)

contaminazione superficie esterna catetere

colonizzazione microbica all’interno del lume del catetere

Isolamento dello stesso microrganismo da emocolture di CVC e vena periferico prelevate

contemporaneamente da CVC che da vena periferica e con un differenziale di tempo di 2hr

Mermel LA Clin Infect Dis 2001

Sepsi CVC-correlata

diagnosi

DTP >120 minuti

da CVC da vena periferica

Sepsi e diagnosi precoce

Attività lavorativa di Microbiologia su 7 giorni

EMOCOLTURA

NEGATIVO

Referto

definitivo

POSITIVO

Proposta di Percorso Diagnostico presentato durante il XXXVII Congresso Nazionale AMCLI - Stresa, 5-8 ottobre 2008

Ceppoteca

Identificazione

Antibiogramma

MIC

Referto

definitivo,

commentato

Sottocolture

Esame

microscopico

Identificazione

diretta

Antibiogramma

diretto

Referto

preliminare

Referto

preliminare

Gram + Gram -

o

INFORMAZIONI CLINICHE:

Se in terapia Quali antibiotici Portatore di valvole protesiche Sospetto di Infezione Ospedaliera (IO) Sospetto di Community-Acquired Cocchi Gram +

Identificazione

Antibiogramma

automatizzato

VRE MRSA

E test antibiotici in terapia

Se IO: E test glicopeptidi

Bacilli Gram -

Identificazione

Antibiogramma

automatizzato

E test antibiotici in terapia

Se IO: E test ESBL +

E test Carbapenemici


Diagnosi molecolare

Risultati definitivi

ID + ATB

72-96 h

Colonie

24 h

ID + ATB

24 ore

Colorazione

di Gram => 2 h

DIAGNOSTICA MOLECOLARE

e/o

PROTEOMICA

IBRIDAZIONE TRAMITE TECNOLOGIA MICROARRAY

Substrato del Test

TECNOLOGIA MICROARRAY

Empio di lettura

del Microarray

Il test viene ripetuto diverse volte sul Microarray, se tutti i risultati

sono concordi viene prodotto il referto

PNA FISH

Peptide Nucleic Acid Fluorescent In Situ Hybridization

Tecnologia FilmArray DID

102 pozzetti,in ogni pozzetto primer specie specifici, tutti I target testati in 3 pozzetti diversi, per

ogni pozzetto vengono generate curve di Melting

Emocoltura + E.coli

TAT 1h

Pannello per emocoltura Gram + :

• S. aureus

• S. pyogenes

• S. agalactiae

• S. pneumoniae

• Coagulase Neg. Staph.

• Enterococcus spp.

• Streptococcus spp

• L. monocytogenes

Funghi:

• C. albicans/dubliniensis

• C. parapsiolosis/tropicalis

• C. glabrata

• C. krusei

Gram - :

• H. influenzae

• N. meningitidis

• P. aeruginosa

• E. coli

• A. Spp

• A. baumannii

• E. Cloacae

• Enteric spp. Pan

• K. pneumoniae

• K. oxytoca

• S. marcescens

Resistenze:

• mecA

• Van A/B

• KPC

MALDI-TOF-MS

Sample plate

Analyte molecules in matrix substance

Acceleration

grids

Drift tube Ion detector

Mass spectrum

Vacuum system

Vacuum

lock

Mass spectrum essentially reflects analyte molecules

Principle

48

Bacterial Lysis &

DNA Extraction

Gram (-) • Escherichia coli • Klebsiella (pneumoniae, oxyt.) • Serratia marcescens • Enterobacter (cloacae, aerog.) • Proteus mirabilis • Pseudomonas aeruginosa • Acinetobacter baumanii • Stenotrophomonas maltophilia

Gram (+) • Staphylococcus aureus

• CoNS

• Streptococcus pneumoniae

• Streptococcus spp.

• Enterococcus faecium

• Enterococcus faecalis

Fungi • Candida (albicans,

tropicalis

parapsilosis)

• Candida (krusei, glabrata)

• Aspergillus (fumigatus)

PCR Analysis

MRSA (mecA)

VRE (van A, B)

Sample Preparation

Sample whole blood

Septifast : Analytical Concept

* Microrganismi non rilevabili mediante Septifast (1) Prelievo eseguito successivamente all’inizio della terapia (2) Emocoltura con flora polimicrobica, presenza di DNA di A. fumigatus confermata dalla positività dell’Ag galattomannano

TOT septifast emocoltura Concordanza Septifast

ed emocoltura

K. pneumoniae 6 6 (1) 5 83,3%

E. aerogenes/ cloacae 1 1 1 100%

E.coli 7 5 7 71,40%

S.aureus 2 2 2 100%

L. monocytogenes* 1 0 1 0%

P. mirabilis 1 1 1 100%

P. aeruginosa 1 1 1 100%

E. faecalis 1 1 0 0%

A. fumigatus 1 1 (2) 0 0%

M. morganii* 1 0 1 0%

P. stuartii* 1 0 1 0%

Negativi 31 30 28 93%

n. 46 pz con sospetto clinico di sepsi

UU.OO di Medicina e Oncologia Pediatrica

range età 2-80 anni (età media 40 28,9)

MICROBIOLOGIA – CS

Campioni per sospetto clinico di sepsi

Anno 2012

indagine neg POS totale

PUNTA CATETERE VASCOLARE 166 93 259

TAMPONE DA EXIT SITE 42 19 61

EMOCOLTURA 3450 579 4029

EMOCOLTURA PER MICETI 210 0 210

TOTALE 691 (15%) 4559

MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA

Direttore dr. Cristina Giraldi

http://www.ilquotidianoweb.it/

Agenti eziologici

rilevati nel sospetto clinico di sepsi

A.baumannii 4% E.cloacae

2%

E.coli 18%

K.pneumoniae 11%

P.mirabilis 1%

P.aeruginosa 5%

S.aureus 20%

S. non aureus 25%

S.agalactiae 2%

E.faecalis 3%

E.faecium 3%

Candida sp. 6%



bb Gram- 39%

Co Gram+ 43%

FUNGHI 11%

ALTRI 7%

RIANIMAZIONE 2012

% (n.28) microorganismi isolati da emocolture e CVC



A. baumannii 7%

E. aerogenes 3% E.coli

3%

K.pneumoniae 7%

P.mirabilis 7%

P.aeruginosa 11%

S.aureus 25%

CoNS 14%

E.faecalis 4%

L.monocitogenes 4%

C.striatum 4%

C.albicans 11%

RIANIMAZIONE 2012

% (n.28) microorganismi isolati da emocolture e CVC



Gestione Informatica

del laboratorio di Microbiologia

Azienda Ospedaliera - Cosenza

PROGRAMMA DEDICATO DI ELABORAZIONE

EPIDEMIOLOGICA

SISTEMA INFORMATICO

ACCREDITATO

DI GESTIONE DEI LABORATORI

Epidemiologia locale

Impostazione terapia empirica

Limitare la diffusione dei MDR

http://www.ilquotidianoweb.it/

0

100

200

300

400

500

600

700 isolati 2012

Azienda Ospedaliera di Cosenza UOC Microbiologia e Virologia Direttore dr. Cristina Giraldi



% RESISTENZA

ANNI

2009-2010-2011-2012

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

E. coli

2009 % R

2010 % R

2011 % R

2012 % R

ESBL 22 %



0

10

20

30

40

50

60

70

80

Klebsiella pneumoniae

2009 % R

2010 % R

2011 % R

2012 % R

ESBL 65% CPE 30%



KLEB 1 KLEB 2 KLEB 3 KLEB 4 KLEB 5

Ampicillina R R R R R

Amox ac.clav I R R R R

Piperacillina R R R R R

Pipe/tazob S R R R R

Cefazolina R R R R R

Cefotaxime R R R R R

Gentamicina S R S S R

Nitrofurantoina R R R R R

Norfloxacina R R R R R

Ciprofloxacina R R R R R

Tetraciclina S I S S R

Amikacina S S R R R

Ceftazidime R R R R R

Imipenem S S R R R

Meropenem S S R R R

Cefepime R R R R R

Cefoxitina S R R R R

Trim/sulf S R R R R

Tigeciclina S S S S R

Levofloxacina R R R R R

2009 2011/12

ALERT KLEBSIELLA PNEUMONIAE

0

20

40

60

80

100

Acinetobacter baumannii

2009

2010

2011

2012

0

20

40

60

80

100

Pseudomonas aeruginosa

2009 % R

2010 % R

2011 % R

2012 % R



0

10

20

30

40

Staflococco aureo

2009 % R

2010 % R

2011 % R

2012 % R

MRSA 35%



0

10

20

30

40

50

LINEZOLID GENTAMICINA HL

TEICOPLANINA VANCOMICINA IMIPENEM

Enterococcus faecalis

2009 % R

2010 % R

2011 % R

2012 % R

Microbiologia

elaborazione dati epidemiologici

REPARTI

CAPI DIPARTIMENTO

CIO

N. campioni positivi e negativi/anno

N. microrganismi identificati/indagini/anno

Chemio sensibilità-resistenza microorganismi isolati/anno

Report di confronto antibiotico- resistenza (%) vs anni precedenti

RIANIMAZIONE 2012

Report “indagini”



indagine neg pos totale

ANTIGENE CLOSTRIDIUM DIFFICILE 0 1 1

ANTIGENE HELICOBACTER PYLORI 1 0 1

ANTIGENE LEGIONELLA 1 0 1

ANTIGENE STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE 1 0 1

BILE 1 0 1

BRONCOASPIRATO 209 112 321

COLTURE DI SORVEGLIANZA 31 18 49

COPROCOLTURA 8 1 9

DNA CHLAMYDIOPHILA PNEUMONIAE 1 0 1

DNA LEGIONELLA PNEUMOPHILA 1 0 1

DNA MYCOPLASMA PNEUMONIAE 1 0 1

EMOCOLTURA 295 34 239

ESSUDATO FARINGO-TONSILLARE 16 0 16

LIQUIDO DA DRENAGGIO 2 3 5

LIQUIDO PERITONEALE 1 0 1

LIQUOR CEFALORACHIDIANO 27 16 43

PROTESI 3 3 6

PUNTA CATETERE VASCOLARE 9 11 20

PUNTA CATETERE VESCICALE 5 51 56

PUS DA RACCOLTA PROFONDA 0 1 1

RICERCA CLOSTRIDIUM DIFFICILE NELLE FECI 3 0 3

TAMPONE DA FERITA PROFONDA 1 5 6

TAMPONE FARINGEO PER RICERCA MRSA 2 0 2

TAMPONE NASALE PER RICERCA S. AUREUS 1 0 1

TAMPONE RETTALE PER RICERCA VRE 1 0 1

TOSSINA A,B CLOSTRIDIUM DIFFICILE 1 2 3

URINOCOLTURA 239 71 310

totale 861 329 1100

RIANIMAZIONE 2012 - Report “microorganismi isolati/ campioni”

microrganismo punta

catetere vascolare

liquido da drenaggio

emocoltura

urinocoltura

colture di sorveglian

za LCR

punta catetere vescicale

tamp ferita profonda

broncoaspirato

protesi coprocol

tura totale

ACINETOBACTER BAUMANNII 0 0 2 3 0 2 2 1 13 0 0 23

AEROMONAS HYDROPHILA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1

BURKOLDERIA CEPACIA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

CITROBACTER FREUNDII 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

CITROBACTER SPP. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1

ENTEROBACTER AEROGENES 1 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 3

ENTEROBACTER CLOACAE 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 2

ESCHERICHIA COLI 0 0 1 16 0 0 4 0 8 0 0 29

KLEBSIELLA OXYTOCA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1

KLEBSIELLA PLANTICOLA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

KLEBSIELLA PNEUMONIAE 0 0 2 11 2 0 6 0 6 0 0 27

MORGANELLA MORGANII 0 0 0 3 0 0 1 0 0 0 0 4

PROTEUS MIRABILIS 2 0 0 1 0 0 3 0 2 0 0 8

PROTEUS PENNERI 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1

PSEUDOMONAS AERUGINOSA 1 0 2 6 2 0 11 0 17 0 0 39

SERRATIA MARCESCENS 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

STENOTROPHOMONAS MALTOPHILIA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

STAPHYLOCOCCUS AUREUS 1 0 6 0 2 1 1 0 21 0 0 32

STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS 0 0 2 0 0 1 0 0 0 1 0 4

STAPHYLOCOCCUS HAEMOLYTICUS 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1

STAPHYLOCOCCUS HOMINIS 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1

ENTEROCOCCUS FAECALIS 0 0 1 4 0 0 2 0 0 0 0 7

ENTEROCOCCUS FAECIUM 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1

LISTERIA MONOCYTOGENES 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1

CORYNEBACTERIUM STRIATUM 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1

CAMPYLOBACTER JEJUNI 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1

HAEMOPHILUS INFLUENZAE 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 6

CANDIDA ALBICANS 0 0 2 4 8 0 0 1 1 0 0 16

CANDIDA FAMATA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1

CANDIDA GLABRATA 0 0 0 0 2 0 0 0 3 0 0 5

CANDIDA KRUSEI 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 3

CANDIDA PARAPSILOSIS 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1

CANDIDA TROPICALIS 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2



0 2 4 6 8 10 12 14 16 18

ACINETOBACTER BAUMANNII

AEROMONAS HYDROPHILA

BURKOLDERIA CEPACIA

CITROBACTER SPP.

ENTEROBACTER SPP.

ESCHERICHIA COLI

KLEBSIELLA PNEUMONIAE

MORGANELLA MORGANII

PROTEUS SPP.

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

SERRATIA MARCESCENS

STENOTROPHOMONAS MALTOPHILIA

STAPHYLOCOCCUS AUREUS

CoNS

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE

ENTEROCOCCUS FAECALIS

ENTEROCOCCUS FAECIUM

LISTERIA MONOCYTOGENES

CORYNEBACTERIUM STRIATUM

CAMPYLOBACTER JEJUNI

HAEMOPHILUS INFLUENZAE

CANDIDA ALBICANS E NONA

RIANIMAZIONE 2012

Report “pattern chemiosensibilita’ e resistenza”

Acinetobacter baumannii antibiotico R S TOT % R

CEFEPIME 22 0 22 100 LEVOFLOXACINA 7 0 7 100 AMOXIC/AC.CLAV 22 0 22 100 IMIPENEM 17 5 22 77 MEROPENEM 3 2 5

TRIMETHOSULFAM. 4 2 6 67

PIPERAC/ TAZOBAC 21 0 21 100 COLISTINA 0 17 17 0 GENTAMICINA 21 1 22 95

Escherichia coli antibiotico R S TOT % R

CEFEPIME 5 24 29 17 LEVOFLOXACINA 5 7 12 42 AMIKACINA 0 29 29 0 AMOXIC/AC.CLAV 12 17 29 41 CEFTAZIDIME 7 22 29 24 IMIPENEM 0 23 23 0 MEROPENEM 0 24 24 0 CEFOTAXIME 9 20 29 31 GENTAMICINA 2 27 29 7 PIPERAC/ TAZOBAC 2 15 17 12


antibiotico R S TOT % R

CEFEPIME 22 4 26 84

AMIKACINA 18 8 26 69

LEVOFLOXACINA 10 2 12 83

AMOXIC/AC.CLAV 22 4 26 84

CEFTAZIDIME 23 3 26 88

IMIPENEM 11 5 16 69

MEROPENEM 18 5 23 78

CEFOTAXIME 23 3 26 88

GENTAMICINA 3 23 26 11

PIPERAC/ TAZOBAC 20 3 23 87



CEFEPIME 11 27 38 29


AMOXIC/AC.CLAV 38 0 38 100

IMIPENEM 3 34 37 8

MEROPENEM 3 35 38 8 TRIMETHOSULFAM. 19 0 19 100

GENTAMICINA 6 32 38 16

COLISTINA 0 34 34 0

PIPERAC/ TAZOBAC 11 15 26 42

Staphylococcus aureus


OXACILLINA 4 25 29 14

LINEZOLID 0 29 29 0

ERITROMICINA 5 24 29 17


TEICOPLANINA 0 29 29 0

DAPTOMICINA 0 21 21 0

CLINDAMICINA 5 24 29 17

VANCOMICINA 0 29 29 0



RIANIMAZIONE 2012

% resistenza 2009-10-11-12

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Acinetobacter baumannii

0

10

20

30

40

50

60

70

E.coli

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90


0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100


0

5

10

15

20

25

30

35

Stafilococcus aureus



rilievo tempestivo di germi sentinella ad elevata pericolosità

Alert organisms

Microbiologia e CIO

diffondersi rapidamente anche con cluster epidemici

causare infezioni gravi

diffusione di resistenze agli antimicrobici

Alert organisms Report IFIC 2008

MICRORGANISMI AD ELEVATA

DIFFUSIBILITÀ E PERICOLOSITÀ

• S.pyogenes

• Legionella spp.

• Micobatteri

• Bacillus anthracis

• Aspergillus spp.

• Salmonella e Shigella

• Clostridium difficile

• S.maltophilia

MICRORGANISMI CHE POSSONO

DIFFONDERE RESISTENZE ATB Methicillin-resistent S.aureus (MRSA) Vancomycin-intermediate S.aureus (VISA) Vancomycin –resistent enterococci (VRE) MDR P.aeruginosa MDR A.baumannii MDR M.tuberculosis ESBL enterobacteria

CPE enterobacteria

Clostridium difficile

azienda ospedaliera Cosenza

alert organims 2011/12

0 10 20 30 40 50 60 70 80 90

Klebs

C.diffic

Acin

Pseud

MRSA

Proteu

Enterob

E.coli

Salmo

Enteroco

Campil

Legio

TBC

Listeria

S.gr.A

ceppi 2012 ceppi 2011 MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA


0 5 10 15 20 25 30 35 40

K.pneumoniae

E.coli

P.mirabilis

C.freundii

S.maltophilia

A.baumannii

P.aeruginosa

MRSA

E.faecalis

L.monocitogenes

C.difficile

RIANIMAZIONE

Alert organism

2012

2011

22% KPC 81% KPC

%

0 5 10 15 20 25 30 35 40

K.pneumoniae

E.coli

P.mirabilis

C.freundii

S.maltophilia

A.baumannii

P.aeruginosa

MRSA

E.faecalis

L.monocitogenes

C.difficile

RIANIMAZIONE

Alert organism

2013

2012

2011

22% KPC 81% KPC

70% KPC

%

www.laboratoriovirologiacs.it

grazie

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la microbiologia clinica nella diagnosi di sepsi del laboratorio di microbiologia nella diagnosi di...

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