滋賀医大srws第三回ovid medline検索と文献管理
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系統的レビュー研究計画書作成ワークショップ第三回 Ovid Medline 検索 文献管理
兵庫県立尼崎総合医療センター Hospital Care Research Unit
辻本 啓 / 片岡 裕貴
復習:系統的検索とは?
~~を高めた検索のこと
逆は~~的検索
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前回の復習
検索式の構造は?
→P + IO は入れない!
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各要素の構造は?
統制語+ free word でした
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今回の目標
• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる
• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで
検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式
をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが
できる
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Ovid は検索できるデータベースがいっぱい!
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下にスクロールするとMEDLINE が出てきます
MEDLINE がいっぱい!
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MEDLINE がいっぱい!
お経:以下 2 つを選択すれば OK !
Ovid MEDLINE(R)<1946 to Present with Daily Update>
Ovid MEDLINE(R)In-Process & Other Non-Indexed Citations
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MEDLINE でも advanced search
ゼロから作るのは大変なのでまた似た P 、似た I のレビューの組み合わせで検索式を作りましょう!
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先人に学ぶ
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Advanced search を選択
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1. こちらに入れると
2. こちらに出てきます
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0. ここは気にしなくて OK !
知らない記号がたくさん $?
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MEDLINE via Ovid のゆらぎの演算子
前方一致 $, $n (=n 文字目までの制限でゆらぎを許容 )
ワイルドカード #, ? ( # は何か word が必ず入るが、 ? はなくても OK )
例: disease$=disease, diseases など dog$2= dog, dogs (≠doghouse) wom#n= woman, women colo?r= color, colour
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MEDLINE via Ovid の位置演算子
近接演算子: ADJ もしくは スペース=その語順で近接している語を hit
近接演算子: ADJn= 語順不同で n 語以内に近接しているものを hit
例: blood pressure = blood adj pressure
例: continuous adj2 dialysis =continuous peritoneal dialysis, continuous venoveous dialysis etc.
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ストップワード
出現頻度の高い一般的な語 ( 例 :the, or, of など ) は、ノイスを低減するため、検索対象から除外されることがあります。
それらの語をストップワードと呼ひます。
※ 仕様が結構変わるらしいので、ストップワードであることが分からなかったら試しに検索してみましょう
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MEDLINE® 2016 Database Guide
(参考)応用編:変な結果だったら、簡単に動作確認
何故かマニュアルと違う動作をすることがあります
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MEDLINE® 2016 Database Guide
“.mp.” って?
Multi-purpose の略いろいろなフィールドをいっぺんにフリーワード検索してくれる便利機能→ 迷ったらこれで!対象は title, original title, abstract, name of substance word, subject heading word など詳しくはhttp://demo.ovid.com/demo/documents/docs/English/MP%20fields.pdf
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“.tw.” って?
フリーワードでタイトルを検索してくれる先行研究がこれなら今回はこれで OK !
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“/” スラッシュ
スラッシュで統制語を示します
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用語の説明 1 :フィルターとは?
検索で研究デザインを指定する式のこと
→Cochrane review などの系統的レビューで使われるものには、 RCT 用があります他は系統的レビューでは普通は使いません!
プロトコルができた段階で、必要であればコピペで追加してもらいます!
今回は学習不要です。
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用語の説明 2 : variant spellings とは?
“tumour” と” tumor”“hematoma” と” Haematoma” など
想定されるものがあれば or で加える
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MeSH はどうやって検索する?
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MeSH はどうやって検索する?
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MeSH はどうやって検索する?ほとんど” explode” で OK
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MeSH はどうやって検索する? ほとんどの場合すべての subheading を選択
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MeSH はどうやって検索する? 検索式に挿入
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MeSH はどうやって検索する?
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文献がたくさん!
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文献管理ソフト
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文献管理ソフトの使い方
どれも使ったことない人は、講義スライドの終わりにの Mendeley資料を添付しています。系統的レビューでは必須です。
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文献管理ソフトが手に入ったら
レビュー計画書の簡単な Background を 3-5 文程度で書いてみましょう!今回は日本語です!
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背景の構造 ( PICO の例の計画書のテンプレ)
背景1. 対象となる疾患について(リファレンスをつけてください) 2. 対象となる介入方法について 3. 介入方法が有効なメカニスム 4. 本レビューを実施する意義
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背景( PICO の例)
(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 ) (引用 1).(例 : 致死率など ) (引用 2).
近年_ (I: 介入内容 ) _は___のようなを効果が言われおり臨床試験で__アウトカムを改善したことが報告されている (引用 1) .
系統的レビューとして (P: 病態 )に対する (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .
<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
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片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変
背景1
対象となる疾患の疫学データ
( 例 : P の世界での実数 etc.) (引用 1).
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背景2
その介入について
近年 (I: 介入内容 ) の臨床試験で介入の効果が報告されている (引用 1).
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背景3
その介入が有効となるメカニスム
(I: 介入内容 ) は△△を予防することにより○○のアウトカムを改善すると考えられている (引用 2).
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背景4
本レビューを実施する意義
系統的レビューとして (P: 病態 ) に対する_ (I: 介入内容 ) を評価したものは報告されていない .
それゆえ、今回 (PICO) に関して系統的レビューを行った .
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簡単な Background ができたら
文献管理ソフトを使って引用文献をつけます
指定引用形式: Vancouver
※趣旨は引用をつける練習なので、Background は簡単でいいです。
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Vancouver 式を知らなくても OK
文献管理ソフトで選択できます!
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引用文献をつけてみる (例)
(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 ) (引用 1).(例 : 致死率など ) (引用 2).
近年_ (I: 介入内容 ) __ の臨床試験で〜の効果が報告されている (引用 1).
系統的レビューとして (P: 病態 )に対する_ (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .
<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
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片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変
今回の目標
• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる
• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで
検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式
をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが
できる
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参考資料
1. Lefebvre C, Manheimer E, Glanville J. Chapter 6: Searching for studies. Box 6.4 d. Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0 (updated March 2011). 2010. 1-46 p. available from http://community.cochrane.org/handbook
2. 『看護研究者・医療研究者のための系統的文献検索概説』諏訪敏幸 近畿病院図書室協議会 2013
3. Ovid Online Training http://www.ovid.com/site/support/training.jsp#tabs1
“MEDLINE” https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zGizVDdlez34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineIntro“Special techniques in MEDLINE”https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zFvzXHuX2z34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineSpecialTechniques
4. 片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @尼崎 グループワークシート
5. MEDLINE® 2016 Database Guideavailable from http://access.ovid.com/training/ja/docs/FieldGuide_MEDLINE_JPN.pdf
6. Ovid 講習会ビデオシリースhttp://access.ovid.com/training/ja/
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[ 参考スライド ] Mendeley の使い方
たくさんある中で free の Mendeley を紹介宿題はどのソフトを使ってもいいです!
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参考スライドの目標 ( Mendeley の場合)
• 文献管理ソフトをインストールできる• Wordへのプラグインをインストールで
きる• Word 内で文章への citation を入れるこ
とができる• 参考文献リスト (Bibliography) を入れ
ることができる
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1. Mendeley のダウンロード
使い方はたくさん動画があります。
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日本語 https://www.youtube.com/channel/UCyftgRDCOa09RYl63QBFPdg
英語https://www.youtube.com/user/MendeleyResearch
Mendeley と MS word を使った引用文献リスト作り方
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https://www.youtube.com/watch?v=zkrVbBSrK_w
[ 参考 ] PubMed について
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同じデータベース( MEDLINE を検索している)→ ほとんど同じと考えてください
欠点:1. 検索に使える演算子が少ない複雑な free word 検索が必要な場合は検索の難易度が上がる or ノイスが増える2. 検索結果のダウンロードが面倒(件数上限があり、前半 /後半など、分けてやらないといけない)
MEDLINE via PubMed での注意
1. 近接演算子はつかえない2. ワイルドカードは使えない3. 前方一致は * のみ (400パターンまで許
容 )4. Automatic Term Mapping が作動5. “and” や” or” などは必ず大文字で使用
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Automatic Term Mapping とは
free word(= 統制語でない言葉 ) をそのままPubMed で入れると生じる便利な機能(系統的レビューの本番の検索では邪魔)
語尾に[ tiab]などのサーチタグをつけることで off できる※ また、フレース検索は””で囲わないとこの機能でバラバラにされて検索される
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さらに Pubmed を知りたい方は
PubMed Tutorialhttp://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/cover.html東大図書館 PubMed の使い方http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdfユサコ株式会社 MEDLINE 簡易マニュアルhttp://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/manual/medline_manual_1010.pdf山梨大学付属図書館PubMed と Ovid MEDLINE の比較一覧http://www.lib.yamanashi.ac.jp/db/ovid_ma/ovid%20medline%20vs%20pubmed%20for%20Yamanashi%20Univ_200712.pdf
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