滋賀医大srws第三回ovid medline検索と文献管理

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系系系系系系系系系系系系系系系系系系系系系系系系 Ovid Medline 系系 系系系系 系系系系系系系系系系系系系系 Hospital Care Research Unit 系系 系 / 系系 系系

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Health & Medicine


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Page 1: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

系統的レビュー研究計画書作成ワークショップ第三回 Ovid Medline 検索 文献管理

兵庫県立尼崎総合医療センター Hospital Care Research Unit

辻本 啓 / 片岡 裕貴

Page 2: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

復習:系統的検索とは?

~~を高めた検索のこと

逆は~~的検索

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Page 3: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

前回の復習

検索式の構造は?

→P + IO は入れない!

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Page 4: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

各要素の構造は?

統制語+ free word でした

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Page 5: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

今回の目標

• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる

• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで

検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式

をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが

できる

 

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Page 6: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

Ovid は検索できるデータベースがいっぱい!

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下にスクロールするとMEDLINE が出てきます

Page 7: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

MEDLINE がいっぱい!

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Page 8: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

MEDLINE がいっぱい!

お経:以下 2 つを選択すれば OK !

Ovid MEDLINE(R)<1946 to Present with Daily Update>

Ovid MEDLINE(R)In-Process & Other Non-Indexed Citations

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MEDLINE でも advanced search

ゼロから作るのは大変なのでまた似た P 、似た I のレビューの組み合わせで検索式を作りましょう!

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先人に学ぶ

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Advanced search を選択

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1. こちらに入れると

2. こちらに出てきます

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0. ここは気にしなくて OK !

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知らない記号がたくさん $?

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MEDLINE via Ovid のゆらぎの演算子

前方一致  $, $n (=n 文字目までの制限でゆらぎを許容 )

ワイルドカード  #, ? ( # は何か word が必ず入るが、 ? はなくても OK )

例: disease$=disease, diseases など dog$2= dog, dogs (≠doghouse) wom#n= woman, women colo?r= color, colour

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MEDLINE via Ovid の位置演算子

近接演算子: ADJ もしくは スペース=その語順で近接している語を hit

近接演算子: ADJn= 語順不同で n 語以内に近接しているものを hit

例: blood pressure = blood adj pressure

例: continuous adj2 dialysis =continuous peritoneal dialysis, continuous venoveous dialysis etc.

 

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ストップワード

出現頻度の高い一般的な語 ( 例 :the, or, of など ) は、ノイスを低減するため、検索対象から除外されることがあります。

それらの語をストップワードと呼ひます。

※ 仕様が結構変わるらしいので、ストップワードであることが分からなかったら試しに検索してみましょう

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MEDLINE® 2016 Database Guide

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(参考)応用編:変な結果だったら、簡単に動作確認

何故かマニュアルと違う動作をすることがあります

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MEDLINE® 2016 Database Guide

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“.mp.” って?

Multi-purpose の略いろいろなフィールドをいっぺんにフリーワード検索してくれる便利機能→ 迷ったらこれで!対象は title, original title, abstract, name of substance word, subject heading word など詳しくはhttp://demo.ovid.com/demo/documents/docs/English/MP%20fields.pdf

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“.tw.” って?

フリーワードでタイトルを検索してくれる先行研究がこれなら今回はこれで OK !

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“/”  スラッシュ

スラッシュで統制語を示します

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用語の説明 1 :フィルターとは?

検索で研究デザインを指定する式のこと

→Cochrane review などの系統的レビューで使われるものには、 RCT 用があります他は系統的レビューでは普通は使いません!

プロトコルができた段階で、必要であればコピペで追加してもらいます!

今回は学習不要です。

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用語の説明 2 : variant spellings とは?

“tumour” と” tumor”“hematoma” と” Haematoma” など

想定されるものがあれば or で加える

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MeSH はどうやって検索する?

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MeSH はどうやって検索する?

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MeSH はどうやって検索する?ほとんど” explode” で OK

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Page 27: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

MeSH はどうやって検索する? ほとんどの場合すべての subheading を選択

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MeSH はどうやって検索する? 検索式に挿入

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Page 29: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

MeSH はどうやって検索する?

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文献がたくさん!

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Page 31: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

文献管理ソフト

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文献管理ソフトの使い方

どれも使ったことない人は、講義スライドの終わりにの Mendeley資料を添付しています。系統的レビューでは必須です。

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文献管理ソフトが手に入ったら

レビュー計画書の簡単な Background を 3-5 文程度で書いてみましょう!今回は日本語です!

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背景の構造 ( PICO の例の計画書のテンプレ)

背景1. 対象となる疾患について(リファレンスをつけてください) 2. 対象となる介入方法について 3. 介入方法が有効なメカニスム 4. 本レビューを実施する意義 

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背景( PICO の例)

(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 )         (引用 1).(例 : 致死率など )        (引用 2).

近年_ (I: 介入内容 )  _は___のようなを効果が言われおり臨床試験で__アウトカムを改善したことが報告されている (引用 1) . 

系統的レビューとして (P: 病態 )に対する (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .

<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862

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片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変

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背景1

対象となる疾患の疫学データ

( 例 : P の世界での実数 etc.)   (引用 1).

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背景2

その介入について

近年  (I: 介入内容 )    の臨床試験で介入の効果が報告されている (引用 1).

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背景3

その介入が有効となるメカニスム

(I: 介入内容 )  は△△を予防することにより○○のアウトカムを改善すると考えられている (引用 2).

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Page 39: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

背景4

本レビューを実施する意義

系統的レビューとして (P: 病態 ) に対する_ (I: 介入内容 )  を評価したものは報告されていない .

それゆえ、今回 (PICO) に関して系統的レビューを行った .

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Page 40: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

簡単な Background ができたら

文献管理ソフトを使って引用文献をつけます

指定引用形式: Vancouver

※趣旨は引用をつける練習なので、Background は簡単でいいです。

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Page 41: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

Vancouver 式を知らなくても OK

文献管理ソフトで選択できます!

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Page 42: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

引用文献をつけてみる (例)

(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 )         (引用 1).(例 : 致死率など )        (引用 2).

近年_ (I: 介入内容 )  __ の臨床試験で〜の効果が報告されている (引用 1). 

系統的レビューとして (P: 病態 )に対する_ (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .

<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862

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片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変

Page 43: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

今回の目標

• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる

• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで

検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式

をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが

できる

 

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参考資料

1. Lefebvre C, Manheimer E, Glanville J. Chapter 6: Searching for studies. Box 6.4 d. Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0 (updated March 2011). 2010. 1-46 p. available from http://community.cochrane.org/handbook

2. 『看護研究者・医療研究者のための系統的文献検索概説』諏訪敏幸 近畿病院図書室協議会 2013

3. Ovid Online Training http://www.ovid.com/site/support/training.jsp#tabs1

“MEDLINE” https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zGizVDdlez34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineIntro“Special techniques in MEDLINE”https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zFvzXHuX2z34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineSpecialTechniques

4. 片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @尼崎 グループワークシート

5. MEDLINE® 2016 Database Guideavailable from http://access.ovid.com/training/ja/docs/FieldGuide_MEDLINE_JPN.pdf

6. Ovid 講習会ビデオシリースhttp://access.ovid.com/training/ja/

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[ 参考スライド ] Mendeley の使い方

たくさんある中で free の Mendeley を紹介宿題はどのソフトを使ってもいいです!

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参考スライドの目標 ( Mendeley の場合)

• 文献管理ソフトをインストールできる• Wordへのプラグインをインストールで

きる• Word 内で文章への citation を入れるこ

とができる• 参考文献リスト (Bibliography) を入れ

ることができる

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Page 47: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

1. Mendeley のダウンロード

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使い方はたくさん動画があります。

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日本語  https://www.youtube.com/channel/UCyftgRDCOa09RYl63QBFPdg

英語https://www.youtube.com/user/MendeleyResearch

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Mendeley と MS word を使った引用文献リスト作り方

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https://www.youtube.com/watch?v=zkrVbBSrK_w

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[ 参考 ] PubMed について

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同じデータベース( MEDLINE を検索している)→ ほとんど同じと考えてください

欠点:1. 検索に使える演算子が少ない複雑な free word 検索が必要な場合は検索の難易度が上がる or ノイスが増える2. 検索結果のダウンロードが面倒(件数上限があり、前半 /後半など、分けてやらないといけない)

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MEDLINE via PubMed での注意

1. 近接演算子はつかえない2. ワイルドカードは使えない3. 前方一致は * のみ (400パターンまで許

容 )4. Automatic Term Mapping が作動5. “and” や” or” などは必ず大文字で使用

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Automatic Term Mapping とは

free word(= 統制語でない言葉 ) をそのままPubMed で入れると生じる便利な機能(系統的レビューの本番の検索では邪魔)

語尾に[ tiab]などのサーチタグをつけることで off できる※ また、フレース検索は””で囲わないとこの機能でバラバラにされて検索される

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