servicio de proteómica y bioquímica cabd · 2016-06-06 · electrophoresis cell for 1-d or 2-d...

Servicio de Proteómica y Bioquímica

CABD

Responsable científico: Belén Floriano Pardal

Responsable técnico: Laura Tomás Gallardo

Encuentro CABD-IG Junio 2016

SERVICIOS

Separación de proteínas mediante Electroforesis Nativa, Electroforesis

monodimensional SDS-PAGE y Electroforesis bidimensional 2D-PAGE.

Separación de proteínas de una mezcla compleja mediante purificación

de proteínas.

Estudios de proteómica cuantitativa mediante electroforesis.

bidimensional con marcaje fluorescente (2D-DIGE).

Estudios de proteómica cuantitativa sin gel (iTRAQ).

Estudios de interacciones moleculares (Biacore).

Caracterización de actividades enzimáticas.

Cuantificación de la expresión de proteínas mediante western blot.

Asistencia técnica en el diseño y realización de experimentos con

proteínas.

Entrenamiento personal en el uso de equipos o programas de análisis

de imagen.


Laboratorio de Espectrometría de Masas MALDI-TOF (Upo)

EQUIPAMIENTO

a) Miniprotean® Tetra-cell (Bio-Rad)

Electrophoresis cell for 1-D or 2-D gel electrophoresis to

run up to four minigels (7 x 8 cm) at the same time.

b) IPGphor (GE Healthcare)

Unit for Isoelectric focusing equipped with individual Strip

Holders (6 of 24 cm and 6 of 7 cm long) and a Manifold

Unit (to run up to 12 Immobiline DryStrips from 7 to 24 cm

at the same time).

c) Ettan Dalt six (GE Healthcare)

Electrophoresis cell for 2-D able to run up to 6 maxi gels

(24 x 20 cm) at the same time.

d) ÄKTA Explorer (GE Healthcare)

Platform for protein purification


e) BiacoreTM X100 (GE Healthcare)

f) Typhoon 9410 and Image scanner III

(GE Healthcare)

g) ChemiDoc XRS


1. Abengoa Research (Sevilla): Caracterización de celulasas.

2. IBVF-CSIC (Sevilla): Análisis proteómico de plantas de fresas.

3. Centro Médico Trigrama (Canarias): Análisis de los efectos de la ingesta de

placenta en mujeres tras el parto.

4. Universal Diagnostics, S.L. (Sevilla): Caracterización diferencial de proteínas

en plasma humano.

5. Estación Experimental El Zaidín-CSIC (Granada): Caracterización de la unión

de un regulador transcripcional a su región promotora mediante SPR.

6. CABIMER (Sevilla): Análisis de interacción de la alfa-sinucleína con la

chaperona Hsp70 mediante SPR.

7. Bionaturis: Purificación de proteínas.

8. Instituto de Biología Molecular e Celular (Oporto): Caracterización del

fosfoproteoma de discos imaginales de Drosophila.

SERVICIOS EXTERNOS



PROTEÓMICA APLICADA A BACTERIAS DE INTERÉS MEDIOAMBIENTAL

Laura Tomás Gallardo, Eduardo Santero y Belén Floriano

Visualización del 3% de la proteína presente en cada spot. Visualización del 97% de la proteína presente en cada spot.


2D-DIGE (Difference gel electrophoresis)

T/G

N/G

Naftaleno/tetralina


Tomás-Gallardo, L., Canosa, I., Santero, E., Camafeita, E., Calvo, E., López, J.A., and B. Floriano*. 2006. Proteomic and transcriptional characterization of aromatic degradation pathways in Rhodococcus sp. strain TFB. Proteomics 6:119-132. Tomás-Gallardo, L., Santero, E., Camafeita, E., Calvo, E., Schlömann, M., and B. Floriano*. 2009. Molecular and biochemical characterization of the tetralin biodegradation pathway in Rhodococcus sp. strain TFB. Microbial Biotechnology 2:262-273. Tomás-Gallardo, L., Santero, E., and Floriano B*. 2012. Involvement of a putative CRP-like binding sequence and a CRPlike protein in glucose-mediated catabolite repression of thn genes in Rhodococcus sp. strain TFB. Applied and Environmental Microbiology 78:5460-5462. Tomás-Gallardo, L., Gómez-Álvarez, H., Santero, E., and B. Floriano*, B. 2014. Combination of degradation pathways for naphthalene utilization in Rhodococcus sp. strain TFB. Microbial Biotechnology 7:100-113.



Proteome-wide search for PP2A substrates in fission yeast. Manuel Bernal, Jacob Zhurinsky, Ana B.

Iglesias-Romero, Maria A. Sanchez-Romero, Ignacio Flor-Parra, Laura Tomas-Gallardo, Antonio J. Perez-

Pulido, Juan Jimenez and Rafael R. Daga. Proteomics 2014, 14, 1367–1380


Total protein staining with Coomassie based stain (left panels) and

phosphoprotein-specific staining with ProQ Diamond stain (right panels)

of Gpd1 protein spots resolved in 2D gel.


ECM-Regulator timp Is Required for Stem Cell Niche Organization and Cyst Production in the

Drosophila Ovary. Pearson JR, Zurita F, Tomás-Gallardo L, Díaz-Torres A, Díaz de la Loza MdC, Franze K,

Martín-Bermudo D, Acaimo González-Reyes (2016). PLoS Genet 12(1): e1005763.

Proteómica cuantitativa sin gel

iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)



Chaperoned amyloid proteins for immune manipulation: a-Synuclein/Hsp70 shifts immunity toward a

modulatory phenotype. Adahir Labrador-Garrido, Marta Cejudo-Guillen, Rebecca Klippstein, Erwin J. De

Genst, Laura Tomas-Gallardo, María M. Leal, Javier Villadiego, Juan J. Toledo-Aral, Christopher M. Dobson,

David Pozo, & Cintia Roodveldt. Immunity, Inflammation and Disease. 2014; 2(4): 226–238

SPR (Surface Plasmon Resonance)

Servicio de Proteómica y Bioquímica

CABD

(ponga una proteína en su proyecto)

Responsable científico: Belén Floriano Pardal

[email protected]

Responsable técnico: Laura Tomás Gallardo

[email protected]

MUCHAS GRACIAS

mailto:[email protected]

mailto:[email protected]

servicio de proteómica y bioquímica cabd · 2016-06-06 · electrophoresis cell for 1-d or 2-d...

Documents