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Processamento de RNA
Grupo:
Rodrigo Rossi de Araújo nº USP 7144403
Edvaldo Maciel Vasconcelos nº USP 7275921
Seminário de Bioquímica II Prof. Dr. Julio César Borges
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Introdução
• Sintetizados a partir de um DNA na forma de precursores (transcritos primários);
• Devem sofrer processamento para atingir estado maduro;
• Três tipos de RNA:
(mais importantes).
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Processamento de rRNA
• Pré-rRNA: possui informação para mais que um rRNA;
• São transcritos pela RNA polimerase I como um conjunto de 3 componentes ribossômicos – 28S, 18S e 5.8S;
• Clivado por nucleases, os rRNAs são formados e adquirem sua estrutura característica.
• Processado no nucléolo.
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Processamento de mRNA
• Ocorre antes da tradução;
• Os processos chave são:
• Adição de uma capa metilizada (“Capping”);
• Adição da cauda poli-Adenilada (“poliadenilação”);
• “SPLICING” e remoção
dos introns e exons.
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Adição do ‘Cap’
• Logo após a RNA polimerase II começar a transcrição, uma capa metilizada (Methyl-Guanine Cap) é adicionada a extremidade 5’ do mRNA;
• Ao término da transcrição, o RNA polimerase libera a parte encapada do pré-mRNA.
• Em eucariotos o ‘cap’ é uma molécula de 7-metilguanosina, adicionado ao nucleosídeo 5’ por uma ponte 5’-5’ trifosfato.
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• Fosforilase hidrolisa fosfato
do pre-mRNA;
• Guanil-transferase adiciona
um GTP;
• Metiltransferase adiciona
os grupos metil na molécula.
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• RNA polimerase transporta proteínas processadoras de mRNA;
• Capeamento é iniciado logo após a transcrição.
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• A adição do “Cap” reduz a exposição do mRNA a nucleases e fosfatases, provendo maior estabilidade;
• Não é degradada nos pontos 5’ e nos primers metilados.
• Aumenta a chance desse mRNA ser “capturado” pelos sistemas tradutores, aumentando a síntese de proteína.
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Poliadenilação
• Cauda com cerca de 200 A’s;
• Protege o RNA da degradação por nucleases (não necessariamente prevenindo-o como o caso do capeamento);
• Retarda a degradação do RNA, aumentando seu tempo de vida.
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• Sequências específicas de nucleotídeos (AAUAAA) sinaliza final da transcrição;
• Pre-mRNA é ligado pelas enzimas CstF (Cleavage stimulation factor) e CPSF (Cleavage and polyadenilation specificity factor);
• A extremidade 3’ do mRNA é então movida na configuração correta para a clivagem;
• Poli-A polimerase liga-se ao mRNA e o cliva na extremidade 3’.
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• O complexo se dissocia e a 3’ clivada é degenerada rapidamente;
• A poli-A polimerase sintetiza então, a cauda poli-adenilato adicionando resíduos de adenina ao local de clivagem;
• Essa síntese consome ATP;
• Ao chegar ao final da cauda, a poli-A polimerase é sinalizada para parar de adicionar resíduos.
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Processo de Splicing
• Íntrons: parte do transcrito primário que não está incluída no mRNA, tRNA e rRNA maduro;
• Exon: parte do transcrito primário que chega ao citoplasma como parte de uma molécula de RNA;
• Spliceossomo: estrutura de vários complexos proteicos que se organiza em torno do RNA, para iniciar o processo.
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Processo de Splicing
• O splicing consiste na retirada dos íntrons de um RNA precursor;
• A excisão dos íntrons requer uma extrema precisão das enzimas envolvidas no processo;
• Um único nucleotídeo alterado em um exon pode levar a uma alteração do processo de leitura;
• Existem algumas sequências relativamente conservadas nos limites íntron-exon.
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Processo de Splicing
• Na extremidade 5’ tem-se a sequência GU e em 3’ a sequência AG;
• Há uma adenina aproximadamente 18-20 nucleotídeos do extremo 3’ do íntron;
• Sítio A de ramificação, seguido de uma região rica em pirimidina.
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Processo de Splicing
• A sequência de consenso no ponto de corte 5’ dos vertebrados é AGGUAAGU;
• Na extremidade 3’ do RNA, o consenso é um trecho contendo 10 pirimidinas (C ou U), seguidas por uma base qualquer, sequência final AG.
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Processo de Splicing 1 - Mediado por “spliceossomos”;
2 – Auto – splicing.
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Processamento de tRNA
• Moléculas pequenas que capturam e transportam os aminoácidos;
• Possuem alta especificidade, 1 tRNA 1aa;
• Sintetizado a partir da RNAP III;
• Os tRNAs funcionam como adaptadores.
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Processamento de tRNA
• Transcrito inicial 50% maior do que o tamanho final (Pré-tRNA);
• Alguns transcritos contem duas ou mais cópias do mesmo ou diferentes tRNA;
• As alças do tRNA estão envolvidas no reconhecimento dele quando chega ao ribossomo.
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Processamento de tRNA
• Pré-tRNA que contém informação de vários tRNA, logo sofre clivagem;
• há uma etapa adicional: a adição do trinucleotídeo CCA na extremidade 3;
• Além disso ele sofre “splicing” e remoção das sequências intercaladas (íntrons).
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Processamento de tRNA
• Clivagem do transcrito primário.
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• Primeiramente, o tRNA é clivado nos 2 pontos do íntron por uma endonuclease;
• A ligação dos dois exons é feita por uma RNA-ligase;
• Liberando o fosfato do exon 5’.
Processamento de tRNA
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• Modificação pós-transcricional;
• As moléculas de tRNA maduras contêm um grande número de nucleotídeos raros;
• A maioria das modificações envolve metilação e/ou tiolação e dependem de cisteína, treonina.
Processamento de tRNA
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Processamento de tRNA
• Estrutura do tRNA da fenilalanina.
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Referências Bibliográficas
[1] LEHNINGER, A. L. Princípios de bioquímica. São Paulo: Savier, 1985;
[2] VOET, Donald; VOET, Judith G.: Bioquímica. 3ª Ed. Artmed: Porto Alegre, 2006;
[3]http://www2.bioqmed.ufrj.br/prosdocimi/RNA/splicing.htm
[4] http://www.youtube.com/watch?v=eWPOzNVyocs;