perfiles de expresiÓn gÉnica y diagnÓstico / pronÓstico en cÁncer
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PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO EN CÁNCER. 17 DE JUNIO MONTSERRAT SERÉS ROIG 2013 GENÓMICA Y PROTEÓMICA - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
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PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO
EN CÁNCER
17 DE JUNIO MONTSERRAT SERÉS ROIG 2013 GENÓMICA Y PROTEÓMICA CURSO 2012-2013
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DEFINICIONES
• EXPRESIÓN GÉNICA : proceso por el cual todos los organismos procariotas y eucariotas transforman la información por los ácidos nucleicos ( DNA ) en las proteinas necesarias para su desarollo y funcionamiento .
• PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA : medida de expresión de varios genes en una célula en un momento dado.
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METODOS DE DETECCIÓN
GEN PORTERO : •Secuencia conocida .•Caraterísticas visulamente identificables .•Luminiscentes / fluorecentes .
NOTHERN BLOT : •Sonda radioactiva-mRNA•Electroforesis en gel •Separación de fragmentos según su tamaño .
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WESTERN BLOT : •Detectar proteinas específicas . •Electroforesis en gel . •Unión mediante Ag-Ac .
HIBRIDACIÓN IN SITU : •Capacidad de AANN de hibridación .•Complementariedad •Sonda marcada con isotopo radioactivo con secuencia de ADN o ARN .
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PCR : •gran número de copias . •Fragmento ADN en particular .
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MICROARRAYS ( chip de ADN ) •Superficie sólida a la cual se une una colección de ADN •Medir el nivel de hibridación entre sonda y molécula diana (target ) mediante fluorescencia .
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APLICACIONES
• Estudio de expresión de genes . • Clasificar enfermedades • Identificar genes específicos de ciertas
patologias . • Predicción de respuesta a un tratamiento . • Detección de polimorfismo de un gen ( SNP’s).
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DIAGNÓSTICO/ PRONÓSTICO EN CÁNCER
• Pulmon / hígado / mama / próstata / digestivos / hematológicos / pancreas etc .
• Clasificación de subtipos .• Diagnóstico . • Pronóstico : - respuesta a un tratamiento - supervivencia del paciente .• Buscar nuevas moléculas diana ( TARGETS ) .
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CÁNCER / GENÉTICA • Visualizar el cáncer como una enfermedad genética .
(mutaciones heredables ) • Ciertos genes se convierten en oncogenes causantes de
cáncer .• Otros genes , supresores , previenen el crecimiento
incontrolado de células ; si son anulados provocan aparición de cáncer .
• Las mutaciones aisladas , generalmente no son suficientes para causar cáncer , sino que producen cambios que predisponen a las células al crecimiento maligno .
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EL CANCER ES UN PROCESO DE MUCHAS ETAPAS
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CLASIFICIÓN MOLECULAR EN EL CÁNCER DE MAMA
• Clasificado en 4 subtipos : luminal A / luminal B / Her2neu / Basal Like .
• Estudio descriptivo transversal en 399 pacientes . • Seguimiento en 5 años .• Se mide : - EFECTIVIDAD DEL TRATAMIENTO - PRONÓSTICO
- CLASIFICACIÓN GENÉTICA - RIESGO • DIAGNÓSTICO INICIAL : mediante biopsias guiadas por
ultrasonidos .
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CÁNCER DE MAMA DESDE EL PUNTO DE VISTA INMUNOHISTOQUÍMICO
Luimnal A Luminal B Herb2Neu Basal Like
estrogeno positivo positivo negativo negativo
progestageno Positivo/negativo positivo negativo negativo
Gen C-erB2 negativo positivo positivo negativo
Pre / postmenopausa
post post pre pre
diagnóstico precoz precoz tardío tardío
pronóstico favorable favorable desfavorable desfavorable
Diferenciado/ indiferenciado
diferenciado diferenciado indiferenciado indiferenciado
edad precoz precoz tardía tardía
Tratamiento inicial IQ IQ QT QT
Diseminación precoz
negativa negativa positiva positiva
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DIAGNÓSTICO GENÉTICO
MICROARRAYS : •Identificar la expresión génica .•Precisión en el diagnóstico .•Un pronóstico más preciso .•Selectividad en el tratamiento con QT :-menos morbi/mortalidad inducida por el tratamiento QT.-menos coste -más índice de curación
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GENÉTICA EN CÁNCER DE MAMA
• De los 4 subtipos luminal A / B son menos agresivos respecto a los otros 2 .
• Diagnóstico subclinico mayor en luminal A / B.• Menor / mayor agresividad . • Selectividad del tratamiento .• Posibilidad de realización de un ONCOTYPE
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TCGA( The Cancer Genome Atlas )
• Artículo publicado : « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study « .
• Publicación del análisis genético de 7 cánceres , entre ellos el endometrial .
• Publicado en el New England Journal of Medecine .
• Intenta caracterizar el análisis genómico de hasta 20 cánceres diferentes .
• Gracias a la contribución de muchos pacientes en proporcionar sus datos clínicos
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Cáncer de Endometrio• 4 subtipos . • Analizar similitudes con otros cánceres comunes
(ovario , mama , colorectal ) .• Determinar que pacientes se benefician de un
tratamiento más agresivo . • Es el 4° cancer más común en U.S en mujeres . • Clasificamos 2 tipos :- Endometrial : asociado a un exceso de estrógenos y
obesidad . - Seroso : más común en mujeres en edad post
menopáusica .
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OBJETIVOS DEL ESTUDIO
• Clasificar la mortalidad asociada segun el tipo de cáncer .
• Adecuar un tratamiento agresivo a cada subtipo . • identificación de mutaciones : - Gen supresor TP53- Extensión de «copy numbers « Que proporcinan mayor agresividad al tipo serosos.
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• Compartir características genéticas con otros tipos de cánceres :
- Ovario seroso / basal-like mama / endometrio comparten similar « copy numbers « y mutación en el gen TP53 .
- Menos frecuente la mutación en el gen PTEN - Endometrio- colorectal comparten la
mutación en el gen POLE involucrado en la reparación del ADN .
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CONCLUSIONES
• TCGA permite conocer el perfil genético de ciertos cánceres .
• Mayor efectividad en los tratamientos de ciertos cánceres con diferente perfil genético .
• Asociación de anomalías genéticas entre cánceres .
• Contribución pública del conocimiento de la genética de un cáncer para un mejor futuro en su manejo y tratamiento
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BIBLIOGRAFIA
• « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study «. Broad Institute of MIT and Harvard .8 de mayo 2013
• Clasificación molecular del cáncer de mama y su correlación – J.Uribe , C. Herenandez, F.Menolascino . Rev Venez Oncol 2010;22(2):109-116.
• Pubmed : perfiles de expresión génica en cáncer .
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MUCHAS GRACIAS