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NIH-image Autoradiograp hie et analyse d’images

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NIH-image. Autoradiographie et analyse d’images. Matériel. Ordinateur Mac Quadra 950 1 caméra vidéo n&b montée sur macroscope Wild 1 caméra vidéo n&b sur scanner programme NIH-image location: sous sol salle 127. Ordinateur Quadra 950. Grand écran 20” haute résolution - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: NIH-image

NIH-image

Autoradiographie

et analyse d’images

Page 2: NIH-image

• Ordinateur Mac Quadra 950

• 1 caméra vidéo n&b montée sur macroscope Wild

• 1 caméra vidéo n&b sur scanner

• programme NIH-image

• location:

sous sol salle 127

Matériel

Page 3: NIH-image

Ordinateur Quadra 950

• Grand écran 20” haute résolution

• 36 MB mémoire RAM

• 1.5 GB espace disque !

• 1 image 380KB

• Lecteur magnéto-optique pour disques 650MB

Page 4: NIH-image

Caméra vidéo sur macroscope

• résolution 512x768

• macroscope avec table lumineuse stabilisée

• grossissement

x6.5 - x32

avec des lentilles

x3.2 - x64

Page 5: NIH-image

LI

LII-III

LIV

LV

LVI

SCWM

500 µm

Prise d’image

Page 6: NIH-image

Caméra vidéo sur scanner

Permet l’importation d’images et de dessins de grande taille:

contours dessinés avec caméra-lucidaphotographies microscopie électronique

Page 7: NIH-image

NIH-image• grande facilité d’utilisation

• interface pour digitalisation

• toutes fonctions de:– morphométrie– densitométrie

• nombreuses macros et possibilité d’en créer facilement

• Version 1.61, constamment mis à jour

• sur Mac uniquement mais il existe un clône pour PC

Page 8: NIH-image

area length major axis minor axis1 348183 2426 936 4732 155369 1439 491 4033 199455 1635 546 4654 94775 1179 438 2765 151805 1566 561 3456 160772 1479 530 387

Analyse morphométrique

Page 9: NIH-image

Autoradiogramme

Micro-échelle:

8 bandes avec différentes concentrations de 14C

Page 10: NIH-image

Relation entre l’autoradiogramme et la coupe

histologique

DG

dessin

Page 11: NIH-image

DG

+

dessin

Page 12: NIH-image

Analyse densitométrique

Page 13: NIH-image

Analyse quantitative

-40%

-20%

0%

20%

40%

60%

80%

100%

A B C D E C/BD

NOR (n=11) brl (n=8) Tg8 (n=7) C3H (n=4)

Page 14: NIH-image

0

1540nC i/gr

IV

V

VI

II/III

I

I V

V

V I

I I / I I II

I V

V

V I

I I / I I II

I VV

V I

I I / I I I

I

I VV

V I

I I / I I I

I

I VV

V I

I I / I I I

I

BC

D C

D ensitom etric quantifica tion in corona l sections

Page 15: NIH-image

0 200 400 600 800 1000 1200

LI

LII-III

LIV

LVa

LVb

LVI

Right

Left

Analyse quantitative

couche à couche

Page 16: NIH-image

Plus d’informations ?

Gilles Bronchti 5199

et/ou

un superbe manuel sur place

mais c’est tellement facile . . .