korcsmáros tamás - félrebeszélés sejtszinten - budapest science meetup október

21
Félrebeszélés sejtszinten A jelátviteli hálózatok és a rák Korcsmáros Tamás Hálózatbiológiai-csoport ELTE Genetikai tanszék

Upload: budapest-science-meetup

Post on 07-Jul-2015

483 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

Page 1: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Félrebeszélés sejtszintenA jelátviteli hálózatok és a rák

Korcsmáros Tamás

Hálózatbiológiai-csoportELTE Genetikai tanszék

Page 2: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

A rákos sejtek legfontosabb tulajdonságai 2000-ben

Ellenállás a sejthalálnak

Angiogenezis beindítása

Osztódási immortalitás elérése

Növekedés-gátlók elkerülése

Osztódási jelek fenntartása

Szöveti invázió és metasztázis

Page 3: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Mi a jelátvitel?

Sejten belüli információs és irányító rendszer

Page 4: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október
Page 5: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

SignaLink Egységesen gyűjtött útvonal-adatbázis

• 3 többsejtű állat

• 8 biokémiailag definiált útvonal

• Kézzel gyűjtött, egységes adatszerkezet

• Minden kapcsolat irányított és a leíró hivatkozást is tartalmazza

• Több útvonalban is szerepet játszó fehérjéket és cross-talkokat is

tartalmaz

Page 6: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Útvonalak gerincei

Page 7: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Útvonalak gerincei és perifériája

Page 8: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Jelátviteli útvonalak hálózata

Page 9: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Útvonal-alapú keresztbeszélgetés megjelenítés

Jelátviteli útvonalak hálózata

Page 10: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Korcsmaros és mtsai, Bioinformatics (2010)

Az útvonalak keresztbeszélgetés-hálózata három többsejtű állatban

NHR

Page 11: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Korcsmaros és mtsai, Bioinformatics (2010)

Az útvonalak keresztbeszélgetés-hálózata három többsejtű állatban

Page 12: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Korcsmáros et al., Bioinformatics, 2010

A keresztbeszélgetések kulcsfontosságúak a jelátviteli hálózat komplexitásában

BemenetLigandok

KimenetTranszkripciósfaktorok

Útvonalakés kereszt-beszélgetéseik(cross-talk)

Page 13: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Mediátor 1 A

Mediátor 1 B

Mediátor 1 C

Cross-talkCross-talk

Kritikus pontok mint a jelterjedés szabályozói

Izoforma csoport

Mediátor 1 A

Funkció 1 Funkció 2

Részben eltérő funkció

Transzkripciós faktor 1

Transzkripciós faktor 2

Részben eltérő reguláció

Jelterjedésben közvetlenül résztvevő fehérjék:

Ligand 1

Receptor 1

Ligand 2

Receptor 2

Mediátor 2

Mediátor 3

Mediátor 1 B

Mediátor 1 C

Page 14: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Kritikus pontok daganatokban

Khi-négyzet teszt: *** p<0,001

• Gyakrabban mutálódnak rákban, szignifikánsan több köztük a másodlagos mutáció.

• Központi szerepükből adódóan feltehetően a malignitást emelik.

Page 15: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

A rákos sejtek legfontosabb tulajdonságai 2011-ben

Sejtenergetika szabályozásának megváltoztatása

Immun-pusztítás elkerülése

Genom instabilitás és felpörgetett mutáció

Tumorserkentő gyulladás

Valószínű új jellemzők

Lehetővé tevő jellemzők

Page 16: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Köszönöm a figyelmet!

Page 17: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október
Page 18: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Kutatási területek

• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése

• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata

• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata

Page 19: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Kutatási területek

• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése

• A jelátviteli hálózat kóros (pl.: rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata

• Az öregedés hálózatos és rendszerszintű vizsgálata

Page 20: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Kutatási területek

• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése

• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata

• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata

Page 21: Korcsmáros Tamás - Félrebeszélés sejtszinten - Budapest Science Meetup Október

Kutatási területek

• A sejt kommunikációs hálózatainak feltérképezése, evolúciójuk megismerése

• A sejtek öregedésének hálózatos és rendszerszintű vizsgálata

• A kommunikációs hálózat kóros (rákos) elváltozásainak rendszerszintű vizsgálata

• vizsgálata