en kræftcelles egenskaber (udvalg):
DESCRIPTION
Er resistent over for " programmeret celledød ". Kan danne metastaser. En kræftcelles egenskaber (udvalg):. Normal celle. Kræftcelle. Deler sig ukontrolleret. Gen-forandringer. Tumordannelse – ophobning af forandringer i cellens gener. Spirende kræftceller. Fuldmodne kræftceller. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
En kræftcelles egenskaber (udvalg):
Deler sig ukontrolleret
Normal celle Kræftcelle
Er resistent over for "programmeret celledød"
Kan danne metastaser
Tumordannelse – ophobning af forandringer i cellens generTumordannelse – ophobning af forandringer i cellens generTumordannelse – ophobning af forandringer i cellens generTumordannelse – ophobning af forandringer i cellens gener
Gen-forandringerGen-forandringer
Normale cellerSpirende kræftceller
Fuldmodne kræftceller
To hovedtyper af cancerrelaterede generTo hovedtyper af cancerrelaterede generTo hovedtyper af cancerrelaterede generTo hovedtyper af cancerrelaterede gener
1. Tumorsuppressor-gener1. Tumorsuppressor-gener
Gener, der forhindrer en normal celle i at blive til en kræftcelleGener, der forhindrer en normal celle i at blive til en kræftcelle- skal - skal inaktiveresinaktiveres for at have en kræftfremkaldende effekt for at have en kræftfremkaldende effekt
1. Tumorsuppressor-gener1. Tumorsuppressor-gener
Gener, der forhindrer en normal celle i at blive til en kræftcelleGener, der forhindrer en normal celle i at blive til en kræftcelle- skal - skal inaktiveresinaktiveres for at have en kræftfremkaldende effekt for at have en kræftfremkaldende effekt
2. Proto-oncogener2. Proto-oncogener
Gener, der kan omdanne en normal celle til en kræftcelleGener, der kan omdanne en normal celle til en kræftcelle- skal - skal aktiveresaktiveres for at have en kræftfremkaldende effekt for at have en kræftfremkaldende effekt
2. Proto-oncogener2. Proto-oncogener
Gener, der kan omdanne en normal celle til en kræftcelleGener, der kan omdanne en normal celle til en kræftcelle- skal - skal aktiveresaktiveres for at have en kræftfremkaldende effekt for at have en kræftfremkaldende effekt
Inaktivering af Inaktivering af tumorsuppressor-tumorsuppressor-genergenerInaktivering af Inaktivering af tumorsuppressor-tumorsuppressor-genergener
772211 33 44 55 665’5’ 3’3’MutationMutationMutationMutation
T182IT182IT182IT182I
MetyleringMetylering MetyleringMetylering 772211 33 44 55 665’5’ 3’3’
CHCH33CHCH33 CHCH33CHCH33 CHCH33CHCH33
DeletionDeletionDeletionDeletion 772211 33 665’5’ 3’3’
Inaktivering af Inaktivering af tumorsuppressor-tumorsuppressor-genergenerInaktivering af Inaktivering af tumorsuppressor-tumorsuppressor-genergener
772211 33 44 55 665’5’ 3’3’MutationMutationMutationMutation
T182IT182IT182IT182I
Mutation: Ændring i rækkefølgen af baser i DNA-kodenMutation: Ændring i rækkefølgen af baser i DNA-koden
-Arg-Lys-Met-Lys-Pro-Trp-Leu--Arg-Lys-Met-Lys-Pro-Trp-Leu-
-CGG-AAG-ATG-AAG-CCC-TGG-TTG--CGG-AAG-ATG-AAG-CCC-TGG-TTG-
Normal:Normal:** DNADNA
ProteinProtein
Efter mutation:Efter mutation:
-Arg-Lys-Met-Lys-His-Trp-Leu--Arg-Lys-Met-Lys-His-Trp-Leu-
-CGG-AAG-ATG-AAG-CAC-TGG-TTG--CGG-AAG-ATG-AAG-CAC-TGG-TTG-** DNADNA
ProteinProtein
Påvisning af mutationer
Mutant Normal
A C G T A C G T
Ile Asn254 254
ACTA
C/TT/AACCA
[
2 - Identifikation ved sekvensanalyse1 – Påvisning ved PCR/DGGE
1 3 4 5 62 7 98
DNA meltingDNA melting
Gradual heatingGradual heatingAbrupt heatingAbrupt heating
--
++
Incr
easi
ng d
enat
uran
t co
nc.
Incr
easi
ng d
enat
uran
t co
nc.
Ele
ctro
phor
esis
Ele
ctro
phor
esis
Wild-type DNAWild-type DNA Mutant DNAMutant DNA
**
**
****
**
**
Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)
PCRPCR
DGGEDGGE
Mutant DNAMutant DNA
Wild-type DNAWild-type DNA
**
**
**** HomoduplicesHomoduplices
HomoduplicesHomoduplices
HeteroduplicesHeteroduplices
Heteroduplex analysisHeteroduplex analysis
**
HeteroduplicesHeteroduplices
**
ACCCGTCAGATGCGATGTGGGCAGTCTACGCTAC
CH3 CH3
CH3CH3
DNACH3 CH3
CH3CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
Maintenance methylation (after DNA replication):
ACCCGTCAGATGCGATGTGGGCAGTCTACGCTAC
CH3 CH3
ACCCGTCAGATGCGATGTGGGCAGTCTACGCTAC
CH3 CH3
CH3CH3
DNMT1
Promoter Exon 1 Exon 2
Transcription
CpG island
DNA methylation => transcriptional silencing
X
Bisulfite modification of DNA Bisulfite modification of DNA
5’-CCGACCG-3’5’-CCGACCG-3’
CH3 CH3 CH3 CH3
Methylated DNAMethylated DNA
5’-CCGACCG-3’5’-CCGACCG-3’
Sodium bisulfiteSodium bisulfite
5’-UCGAUCG-3’5’-UCGAUCG-3’
CH3 CH3 CH3 CH3
5’-UUGAUUG-3’5’-UUGAUUG-3’
5’-TCGATCG-3’5’-TCGATCG-3’
PCRPCR
5’-TTGATTG-3’5’-TTGATTG-3’
Unmethylated DNAUnmethylated DNA
Detection of aberrant APC methylation by melting curve analysisDetection of aberrant APC methylation by melting curve analysis
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
Methylated APCMethylated APCUnmethylated APCUnmethylated APC
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
#8#8
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
#7#7
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
#10#10
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
80 82 84 86 88 90
Temperature (°C)
-dF/
dT
#9#9
Ac
Ac Ac
Ac
Ac Ac
Ac
Ac Ac
Ac
Ac Ac
Ac
Ac Ac
A c
Ac Ac
M B DM B D
M B D
M B DM B D
M B D
HD
HD
HDHDHD
HDHDHDHDHDHD
HDHDHD
MBD Methyl-CpG-binding domain protein
HDHD Histone deacetylase
Core histones
Ac
M B DM B DM B D
M B D
M B D
M B D
HDHD
HD
HDAcHDHDHDHD
M B D
Ac
Ac
AcAcAc
Ac
Ac
AcAcAcAcAc
Ac
AcAc
Ac
Ac
Ac
Ac
AcAc
Ac
M B DM B DM B D
M B D
M B D
M B D
HDHD
HD
HDAcHDHDHDHD
M B D
Reactivation of gene transcription
Inhibitors of histone deacetylases(Trichostatin A)
AcAc Ac
Inhibitors of DNA methylation(5-aza-2’-deoxycytidine)
TSA + 5
-aza
-Cdr
TSA5-
aza-
Cdr
HO2
ER
GAPDH (control)
MDR1
CacNa1g
Reactivation of gene transcription in breast cancer cells (MDA-MB-231)by inhibition of DNA methylation and/or histone deacetylation
Methotrexate (MTX)
A reduced folate analogue
Used in the treatment of various malignancies
Acquired resistance is a major problem in cancer treatment
Cellular uptake occurs mainly via the reduced folate carrier (RFC)
Methotrexate (MTX)
A reduced folate analogue
Used in the treatment of various malignancies
Acquired resistance is a major problem in cancer treatment
Cellular uptake occurs mainly via the reduced folate carrier (RFC)
MTX
Lysosome
MTX
MTX
FPGS
MTX(glu)nMTX(glu)n
MTX
GGH
MTX
FH2 FH4
DHFRPurine synthesis (ATP, GTP)
UMPTMP
DNA Nucleus
MTX
RFC
MTX
MTX
MTX
FPGS
MTX(glu)nMTX(glu)n
MTX
GGH
MTX
2 4
DHFR(ATP, GTP)
MTX
0
20
40
60
80
100
0.001 0.01 0.1 1 10 100MTX concentration (µM)
Ce
ll n
um
be
r (%
of
con
tro
l)
MDA-MB-231
MCF-7
0
20
40
60
80
100
0.001 0.01 0.1 1 10 100MTX concentration (µM)
Ce
ll n
um
be
r (%
of
con
tro
l)
MDA-MB-231
MCF-7
MDA-MB-231 breast cancer cells are inherently MTX resistantMDA-MB-231 breast cancer cells are inherently MTX resistant
0
20
40
60
80
100
0.001 0.01 0.1 1 10 100MTX concentration (µM)
Ce
ll n
um
be
r (%
of
con
tro
l)
vector
RFC.3
RFC.5
RFC-EGFP.1
RFC-EGFP.2
0
20
40
60
80
100
0.001 0.01 0.1 1 10 100MTX concentration (µM)
Ce
ll n
um
be
r (%
of
con
tro
l)
vector
RFC.3
RFC.5
RFC-EGFP.1
RFC-EGFP.2
Transfection of MDA-MB-231 cells with RFCTransfection of MDA-MB-231 cells with RFC
Worm et al. (2001) J. Biol. Chem. 276:39990
RFC promoter methylation in MDA-MB-231 cellsRFC promoter methylation in MDA-MB-231 cells
UU
MM
Methylation-specific PCRMethylation-specific PCR
MCF-7
MCF-7
MDA-MB-231
MDA-MB-231
Sss I
Sss I
PBLPBL
H 2O
H 2O
Worm et al. (2001) J. Biol. Chem. 276:39990
RFC
0.2 µ
M 5
-Aza
-CdR
0.1 µ
M 5
-Aza-C
dR
TSA + 0
.5 µ
M 5
-Aza-C
dR
TSA + 0
.2 µ
M 5
-Aza
-CdR
TSA0.5
µM
5-A
za-C
dR
G AP DH
M DA-MB-231M CF-7
M
500 bp600 bp
300 bp
200 bp
H O2
Reactivation of RFC expression by 5-aza-2’-deoxycytidine
Worm et al. (2001) J. Biol. Chem. 276:39990
00
2020
4040
6060
8080
100100
0.010.01 0.10.1 11 1010 100100
MTX concentration (µM)MTX concentration (µM)
Cel
l nu
mb
er (
% o
f co
ntr
ol)
Cel
l nu
mb
er (
% o
f co
ntr
ol) ControlControl
DPMDPM
5-aza-CdR5-aza-CdR
5-aza-CdR + DPM5-aza-CdR + DPM
5-Aza-2’-deoxycytidine + dipyridamole increases MTX sensitivity in MDA-MB-231 cells
5-Aza-2’-deoxycytidine + dipyridamole increases MTX sensitivity in MDA-MB-231 cells
Worm et al. (2001) J. Biol. Chem. 276:39990Worm et al. (2001) J. Biol. Chem. 276:39990
En kræftcelles egenskaber (udvalg):
Deler sig ukontrolleret
Normal celle Kræftcelle
Er resistent over for "programmeret celledød"
Kan danne metastaser
En kræftcelles egenskaber (udvalg):
Deler sig ukontrolleret
Normal celle Kræftcelle
Skematisk fremstilling af celledelingscycklus
En celle i deling
Checkpoint: Kontrolpunkt, hvor celledeling stopper, og DNA-skader repareres, inden delingen går videre
Checkpoints kontrolleres af proteiner – oncogener og tumorsuppressorer
Nogle aktører i kontrol af cellecyklus (G1)
Normalt DNA: Proteinet varetager sin funktion og holder cellens deling i skak
Muteret DNA: Proteinet er defekt, og cellens deling løber løbsk
Forskellige gen-forandringer kan have samme effekt
Genetiske forandringer i Genetiske forandringer i p16-Rb-Cdk4p16-Rb-Cdk4-signalvejen i -signalvejen i modermærkekræftmodermærkekræft
123456789
101112131415161718192021222324
Rb Cdk4p16
p53 – DNA’ets vogterp53 – DNA’ets vogter
p53
Ved begrænset DNA-skade stopper p53 cellecyklus
Ved begrænset DNA-skade stopper p53 cellecyklus
Ved omfattende DNA-skade inducerer p53 celledød
Ved omfattende DNA-skade inducerer p53 celledød
MånederMåneder
Ingen mutationerIngen mutationer
00
,2,2
,4,4
,6,6
,8,8
11
00 2020 4040 6060 8080 100100 120120 140140 160160
Ove
rleve
lse
Ove
rleve
lse
Lymfekræft: Sammenhæng mellem Lymfekræft: Sammenhæng mellem overlevelse og mutationer i overlevelse og mutationer i p16 p16 og og p53p53
Lymfekræft: Sammenhæng mellem Lymfekræft: Sammenhæng mellem overlevelse og mutationer i overlevelse og mutationer i p16 p16 og og p53p53
Mutationer i entenp16p16 ellereller p53p53Mutationer i entenp16p16 ellereller p53p53
Mutationer i bådep16p16 ogog p53p53Mutationer i bådep16p16 ogog p53p53
Nedarvning af modermærkekræftNedarvning af modermærkekræft
Nedarvning af modermærkekræftNedarvning af modermærkekræft