emilio tagliavini - chimica delle sostanze naturali 2007/08 27 formazione di malonil-coa

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 1 S N N O O H(NH -Enz) O H H Biotina + ATP O O HO P O O OH + ADP HO O O SC oA O S N N O O OH H + S N N O H H - P S N N O H H + SC oA O O HO M alonil-SCoA C arbossibiotina O O HO P O O OH FORMAZIONE DI MALONIL-CoA FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

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Page 1: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 1

S

N

N

O

OH(NH-Enz)

O

H

H

Biotina

+ ATP

O

OHOP

O

O

OH + ADPHO

O

O

SCoA

O

S

N

N

O

O

OH

H

+S

N

N

O

H

H

- P

S

N

N

O

H

H

+ SCoA

OO

HO

Malonil-SCoA

Carbossibiotina

O

OHOP

O

O

OH

FORMAZIONE DI MALONIL-CoAFORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Page 2: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 2

SCoA

OO

HO+ ACP-SH S-ACP

OO

HO+ CoASH

S-Cys

O

Enz

S-ACP

OO

HO S-ACP

OO

S-ACP

OOH

NADH - H2O

S-ACP

O

S-ACP

OO

HO S-ACP

OO

Ecc.

NADH

- CO2

- CO2

S-ACP

OHS Cys Enz

S-Cys

O

Enz

+ ACP-SH

S-Cys

O

Enz

MAT

KS KR DH

ER MAT

R S-ACP

O

+ CoASH R SCoA

O

+ ACP-SH R = C15, C17TE

SINTESI DEGLI ACIDI GRASSISINTESI DEGLI ACIDI GRASSI

Page 3: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 3

KS MAT DH ER KR ACP TE

Cys

SH

O

P

O

O O

HO

NO

NO

SH

H

H

CH2 Ser

Cys

HS

KSMATDHERKRACPTE

O

P

O

O O

HO

NO

NO

SH

H

H

ACP: Acyl Carrier Protein

MAT: Malonyl/Acetyl Transferase

KS: -Ketoacyl Synthase

KR: -Ketoacyl ReductaseDH: Dehydratase

ER: Enoyl Reductase

TE: Thioesterase

IL SISTEMA ENZIMATICOIL SISTEMA ENZIMATICO

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 4

S-ACP

O O

S-ACP

NADH

O

S-ACP S-ACP

OO

HO

O

S-ACP

O

+

Isomerasi

S-ACP

O

O2 / NADPH

9-Desaturasi

S-CoA

O

+ 2 H2O

Stearoil-S-ACP

FORMAZIONE DI ACIDI GRASSI INSATURIFORMAZIONE DI ACIDI GRASSI INSATURI

Page 5: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 5

ACIDI GRASSI MONO E POLIINSATURIACIDI GRASSI MONO E POLIINSATURI

Page 6: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 6

ACIDI GRASSI PIU’ COMUNIACIDI GRASSI PIU’ COMUNI

Page 7: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 7Un grasso

I grassi sono triacilgliceroli che a temperatura ambiente esistono come solidi o semisolidi

Page 8: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 8Un olio

Gli oli sono triacilgliceroli che a temperatura ambiente sono liquidi

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 9

Saponi e detergenti

RCOCH

O CH2OCR

O

CH2OCR

O

+ 3 NaOH saponificazione

CH2OH

CH

CH2OH

RCO-Na

+

O

+ 3

Trigliceride(un triestere del glicerolo)

1,2,3-propantriolo(glicerolo; glicerina)

C

O O_

Na+

“Testa” polare

“Coda” non polare

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 10

CH3(CH2)14CO2-Na

+2 + Ca++

[CH3(CH2)14CO2-]2Ca

++ Na++ 2

Sapone di sodio (solubile in acqua sotto forma di micelle)

Sale di calcio di un acido grasso (insolubile in acqua)

CH3(CH2)10CH2OH CH3(CH2)10CH2OSO-Na

+

O

O

1. H2SO4

2. NaOH

CH3(CH2)10CH2 CH3(CH2)10CH2 SO3-Na

+1. H2SO4

2. NaOH

Detergenti sintetici

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 11

Diacil Glicerolo

O OH

O

R

O

R

O

H2O

Acido Fosfatidico

PO O

O

R

O

R

O

-2 CoASH

Glicerol-P

PHO O

OH

+2 R SCoA

O

R SCoA

O

O O

O

R

O

R

O

R

O

Trigliceride

PO O

O

R

O

R

O

Acido Fosfatidico

+ CTP O O

O

R

O

R

O

P P Citidina- PP

+ R'OH O O

O

R

O

R

O

P

O

O-

OR'

- CMP

Fosfolipidi di Membrane

R' = CH2CH2N(CH3)3

CH2CH2NH2

CH2 CH CO2H

NH2HOOH

OHOH

OH

fosfatidilcolina

fosfatidiletanolamina

fosfatidilserina

fosfatidilinositolo

LIPIDI DELLE MEMBRANELIPIDI DELLE MEMBRANE

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 12

Fosfoacilgliceroli (Fosfolipidi)

Il gruppo OH terminale del glicerolo è esterificato con acido fosforico

Costituiscono il 40-50% delle membrane cellulari

Configurazione R

Acido fosfatidico

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 13

I più comuni fosfolipidi di membrana hanno un secondo legame estereo sul fosfato

Fosfatidiletanolammina (cefalina)

Fosfatidilcolina (lecitina)

Fosfatidilserina

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 14

Molecola di colesterolo

Testa polare

Catena apolare di un acido grasso

Le membrane biologiche sono costituite da un doppio strato fosfolipidico

Gli acidi grassi saturi diminuiscono la fluidità di membrana perchè le loro catene idrocarburiche possono impaccarsi in modo compatto

Gli acidi grassi insaturi hanno effetto opposto

Ingrandimento di un fosfolipide

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 15

OLI SICCATIVIOLI SICCATIVI

O

O OOR

O

O

H H

HHH

O2

OO

Triglicerideinsaturo

R

O

O OOR

O

O

RO

O OOR

O

OO

OH

-H

OOH

e

O + OH

Triglicerideinsaturo

R

O

O OOR

O

O

RO

O OOR

O

OO

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 16

OLI SICCATIVIOLI SICCATIVI

O

O OO

O

O

O O

OOO

O

O

O O

O

O OO

O

O

OO

OO

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 17

Vitamine lipo-solubili: Vitamina E (-tocoferolo)

O

CH3CH3

CH3 CH3 CH3

OH

CH3CH3

CH3

Quattro unità isopreniche unite testa-coda che cominciano qui e si estendono fino all’anello aromatico

Un etere dell’idrochinone tetrasostituito

La funzione della vitamina E nei sistemi biologici è quella di agire come antiossidante proteggendo i lipidi poliinsaturi dalla degradazione ossidativa

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 18

Alcuni antiossidanti sintetici, che hanno in comune con la vitamina E solo l’anello fenolico, vengono comunemente impiegati come additivi per la conservazione di alimenti e prodotti farmaceutici.

2,6-di-terz-butil-p-cresolo

(BHT; Idrossi toluene butilato)

3,5-di-terz-butil-4-idrossi-anisolo

(BHA; Idrossianisolo butilato)

OH

CH3

OH

OCH3

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 19

ROO + AH ROOH + A (1)

A + ROO ROOA (2)

La caratteristica essenziale di un antiossidante è interrompere la catena di autossidazione radicalica, ritardando quindi il processo di autossidazione.

Un buon antiossidante

1) reagisce con il radicale perossile più velocemente del substrato ossidabile ( possiede un idrogeno facilmente estraibile, reazione 1)

2) non propaga a sua volta la catena radicalica

Il risultato complessivo è che una molecola di antiossidante interrompe due catene radicaliche

Meccanismo di azione degli antiossidanti fenolici

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 20

NADH

S-CoA

O

R S-CoA

O

R+ H2O

S-CoA

O

R

OH

S-CoA

OO

R R S-CoA

O

FADH2FAD

NAD+

+S-CoA

OH

Retro-condensazionedi Claisen

HS CoA

Deidrogenazione

Tioestere piùcorto di due unità

Enolo dell'acetil-CoA

DEGRADAZIONE OSSIDATIVA DEGLI ACIDI GRASSIDEGRADAZIONE OSSIDATIVA DEGLI ACIDI GRASSI-OSSIDAZIONE)-OSSIDAZIONE)

Page 21: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 21

Acetoacetil-SCoA

SCoA

OOSCoA

O

+SCoA

O

SCoA

O

+SCoA

O

HO

O

(SACP)

(SACP)

(SACP)

Acido Mevalonico

HO2COH

OH

SCoA

O

VIE COMUNI DALL’ACETOACETATOVIE COMUNI DALL’ACETOACETATO

SCoA

OOOOO

Polichetidi

n volte

SCoA

ONADPH

Acidi grassi

n volte

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Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 22

R SEnz

OOOOO

Catena PolichetidicaR SCoA

O

+SCoA

O

HO

O

n

SEnz

OOOO

O O

COSEnzOH

-H2O

O O

COSEnz

HO OH

CO2H

Acido Orsellinico

SEnz

OOOO O

O

O

O

HO OH

O

OH

Floracetofenone

Reazionealdolica

Reazionedi Claisen

FORMAZIONE E CICLIZZAZIONE DI POLICHETIDIFORMAZIONE E CICLIZZAZIONE DI POLICHETIDI

Page 23: Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 27 FORMAZIONE DI MALONIL-CoA

Emilio Tagliavini - Chimica delle Sostanze Naturali 2007/08 23

COSEnzO

O O

O

O

O O

O HO

HO HO

OH HO

HO O

OH

O

COSEnz

OOOOO

COSEnz

O

O

O

OO

COSEnz

OOH

OH

O

O

OH

OH

COSEnz

O

OO

O

O

HO

OH O

COSEnz O

OOH

HO

COSEnzOOO

O

O O O

HO

OH OHO

COSEnz

HO

OH OHO

CO2H

O

Antrachinoni

[O]

[O]

[O]

Naftochinoni

ALCUNI SCHEMI DI CICLIZZAZIONE ALCUNI SCHEMI DI CICLIZZAZIONE DI CATENE POLICHETIDICHEDI CATENE POLICHETIDICHE