תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...central virology laboratory...

Central Virology Laboratory 2016 משרד הבריאות- המעבדות לבריאות הציבור מסונפת לביה"ס לבריאות הציבור, אוניברסיטת ת"א2016 דוח שנתי- המעבדה המרכזית לנגיפים

Upload: others

Post on 28-Jul-2020

9 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

Central Virology Laboratory

2016

המעבדות לבריאות הציבור - משרד הבריאות

מסונפת לביה"ס לבריאות הציבור, אוניברסיטת ת"א

2016

תי שנ

ח דו

פינגי

לת

כזימר

הדה

עבהמ

המרכז הרפואי עש חיים שיבאתל השומר 52621, ישראל

טל: 03-5302388, פקס: 03-5302457

Chaim Sheva Medical CenterTel-Hashomer, 52621, IsraelTel: 972-3-530-2388, Fax: 972-3-530-2457

Page 2: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפיםCentral Virology Laboratory

מסונפת לביה"ס לבריאות הציבור, אוניברסיטת ת"א

דוח שנתי 2016

Page 3: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא
Page 4: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

תוכן עיניינים:

4 חברי צוות המעבדה

6 הקדמה - פרופ׳ אלה מנדלסון

8 רשימת בדיקות המעבדה

11 המרכז הלאומי לנגיפי פוליו, אנטרו וגורמי שלשולים

16 המרכז הארצי לנגיפים בסביבה

18 B19 ולבדיקות הפטיטיס נגיפית ופרבו HIV מרכז ארצי לאימות בדיקות

22 המרכז הלאומי לשפעת ונגיפי דרכי הנשימה

26 המרכז הלאומי לאדמת, חצבת, חזרת ותחום נגיפי פוליומה

30 המרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים

34 המרכז הארצי לנגיפי שלבקת

37 EBV -ו CMV תחום אבחון נגיפי

40 תחום אבחון מולקולרי בשיטת Real Time PCR )טקמן(

42 הבטחת איכות

44 היחידה לקרקעי מזון ותרביות

45 מאמרים

46 השתתפות בכנסים, גרנטים והרצאות

Page 5: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

מנהלת המעבדה לוירולוגיה קליניתוהמרכז הארצי לאימות הדבקה באיידס:

ד"ר ארנה מור

צוות: ד"ר יעל גוזלן

ד"ר אפרת בוכריסמגר' אביה רקובסקי

גב' ווקס מרינהגב' זהבה יוספי

סטודנט: מר רועי מוסקונה

מתנדבות: גב' רות פבל

גב' ציפורה מליק

מנהלת המרכז הלאומי לפוליו ונגיפי אנטרו:ד"ר מרב וייל

צוות:מגר' אילנה זילברשטיין

גב' לאה וייס

מנהלת היחידה לנגיפי הרפס ומחלות מין ויראליותומנהלת מרכז ארצי לשלבקת:

ד"ר שרה דברת

צוות:מגר' מזל בוק

גב' צביה סופייב

מנהלת היחידה לנגיפים נשימתייםומנהלת המרכז הלאומי לשפעת ונגיפי דרכי הנשימה:

ד"ר מיכל מנדלבוים

צוות:מגר' ליאורה רגב

גב' הילדה שהרבני

אחראית ניטור תחלואת שפעת בקהילה:ד"ר רקפת פנדו

עובדי מחקר:מגר' ירון דרורי

מגר' נחמיה פרידמן

סטודנטית:גב' סיוון שרעבי

מתנדב:מר סלובוקין יוסף

מנהל היחידה לנגיפי הסביבה ותרביות רקמה:מגר' יוסף מנור – פרש לגימלאות ביוני 2016

ד"ר איתי בראור – מנהל המרכז הארצי

צוות: מגר' זקלין אלפנדרימגר' אירנה אגובייב

גב' טובה הלמותמר סעיד )צביקה( כהן

סגנית מנהלת המעבדה לוירולוגיה קליניתומנהלת המרכז הלאומי לאדמת, חצבת, חזרת ותחום נגיפי פוליומה:

ד"ר ויקטוריה אינדנבאום

צוות:מגר' טל לוין

גב' תמר פרנק

חברי הצוותמנהלת המעבדה: פרופ' אלה מנדלסון

סגנית מנהלת המעבדה: ד"ר דנית סופר

4 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

Page 6: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 5

סגן מנהל המעבדה לוירולוגיה סביבתיתומנהל מרכז ארצי לנגיפים זואונוטיים:

ד"ר יניב לוסטיג

צוות:מגר' שירי כץ - ליקבורניק

מגר' בתיה מנשה גב' רוית קורן

:)CMV( מרכזת תחום לנגיף ציטומגלומגר' מיכל טפרברג

צוות:גב' גילה גולדפלדגב' רובינוב ז'אנה

מתנדבת:גב' לילי בן יוסף

:Taqman מנהל מדורד"ר מוסה הינדייה

צוות:ד"ר דניאלה רם

מגר' וירג'יניה לוימגר' רוברטו אזר

גב' אריג' כבת'גב' אירנה ז'ורניסט

מנהלת הבטחת איכות:מגר' נאווה צורי

מנהלן המעבדה )אמרכ"ל(:ד"ר דנית סופר )מ"מ זמנית(

ע. בכירה למנהלן )אמרכלות(:גב' שושנה מני

מזכירות הנהלה:גב' לילך מורדקוביץ

צוות המשרד:גב' יהודית סגינר

גב' שרונה חיימובגב' בתיה אברמוביץ

גב' דיאנה אולמייב – בת שירות לאומי

מזכירה:גב' זהבה יוספי

רכש:גב' רויטל יחזקאל

גב' רינה בראון

הנהלת חשבונות:גב' ויקטוריה ארסלנוב

אחראי בית חיות:מר מרקביצה אולג

צוות עובדי בית החיות:מר אליהו חבה

מתנדב:מר עזרא עג'ם

מנהל סטרליזציה:מר אליהו חבה

נהג קניין:מר גיא בראזני

Page 7: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

6 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

שנת 2016 הייתה שנה מאתגרת ומרתקת במעבדה המרכזית לנגיפים כמרבית השנים שקדמו לה והדו"ח השנתי מהווה הזדמנות טובה

לסקור שנה זו בהיבט כוללני.במישור הארגוני - נמשכה תחלופת העובדים הנובעת מפרישת הדור הוותיק לגמלאות וכניסת דור חדש של חוקרים ועובדים. אחד האתגרים הגדולים ביותר למעבדה הוא שמירת הידע והעברתו מדור לדור תוך כדי פיתוח וקידום שיטות העבודה והמחקר והתאמתם

לטכנולוגיות העתיד.כחלק מהפיתוח המקצועי של המעבדה הוחלט להקים יחידה חדשה לביואינפורמטיקה. תהליך ההקמה מתארך עקב גיוס חוקרת מחו"ל שאליה יצטרפו שני עובדים בעלי ידע מתאים. מטרת היחידה הינה לספק את הכלים האנליטיים המתקדמים הנדרשים כיום בתחום

האפידמיולוגיה והאבחון של מחלות נגיפיות.פרויקט שיפוץ תשתיות המעבדה נמשך והמעבדה ממשיכה לשנות את מראיה ופניה תוך מתן תחושת רווחה לעובדים מחד והקצאת שטחים ייעודיים למכשור מעבדתי מתקדם מאידך שמאפשרת הטמעת

טכנולוגיות מבוססות אוטומציה. בתחילת השנה פרש לגמלאות מתי יצחקי - אחראי מנהל המעבדה, לאחר כארבעים שנות שרות. עד לאיוש המשרה מחדש, לקראת תחילת שנת 2017, רוכזה הפעילות המנהלית בידי צוות הניהול הבכיר של המעבדה שהשקיע רבות בהכנסת נהלים חדשים וייעול תהליכים מול גופי משרד הבריאות השונים האחראים על המעבדה- מינהל שירותי בריאות הציבור, גזברות אזורית בתל אביב, משאבי אנוש בשיבא ועוד.

כסיוע ותמיכה בכל השינויים הארגוניים העוברים על המעבדה נמשך הייעוץ הארגוני על ידי חברת שביט אשר תרם רבות ליכולת המעבדה

להתמודד עם כל האתגרים שלפניה.נקודות ראויות לציון בהיבט המקצועי בכל אחד ואחד מתחומי הפעילות של המעבדה באו לידי ביטוי בפעילות המרכזים הארציים והיחידות

השונות כמסוכם בקיצור להלן.

במרכז הלאומי לנגיפי פוליו, אנטרו וגורמי שלשולים )רוטה ונורו(: המרכז הוסמך על ידי אב"ע לשיטות מולקולריות מתקדמות לזיהוי ואפיון הנגיף. כמו"כ הושמדו עפ"י דרישת WHO כל מאגרי פוליו זן 2 לאחר שב- 2015 נגיף הבר מזן זה הוכרז כנכחד. כיום המעבדה אינה מורשית לעבוד עם נגיפי פוליו זן 2 חיים ומכאן שלא ניתן לבצע סקרים אפידמיולוגיים לחסינות לזן 2 ומחקרי עומק. מאידך בבדיקות קליניות נמצאו 2 ילדים פלשתיניים מדוכאי חיסון המאושפזים בישראל

כמפרישים פוליו זן 2 ממקור תרכיבי עם מוטציות החזרה. ממצא זה ממחיש את הפוטנציאל להתפרצות תחלואה בפוליו זן 2 שמקורו תרכיבי שיועבר מחולים כאלה לקהילות שבהן שיעור החסינות דעך באופן משמעותי. התחלואה בנגיפי אנטרו התאפיינה ב % גבוה של מקרי מנינגיטיס מנגיף EV–30 ומקרים ספורדיים מנגיפים אחרים.

במרכז הארצי לנגיפים בסביבה:למרכז התמנה מנהל חדש, ד"ר איתי בר אור, במקומו של מגר' יוסי מנור שפרש לאחר שנים רבות של פעילות מרשימה ביותר בה התפתחה במרכז הארצי פעילות ענפה כולל מערך מחקר ופיתוח

נרחב ויוצא דופן באיכותו וחשיבותו.

:B19 )ולבדיקות לדלקת כבד )הפטיטיס HIV במרכז הארצי לאימות בדיקותבמרכז הארצי לאימות הדבקה בנגיף HIV נוספה פעילות משמעותית בתחום נגיפי הפטיטיס, במטרה להקים מרכז ארצי להפטיטיס. בצמוד למרכז ארצי זה, נוספו בדיקות אבחון מולקולריות לנגיפי הפטיטיס מסוג A ,E ו- דלתא וכן הוכנסו בדיקות עמידות לתרופות לנגיפי

הפטיטיס B ו- C באמצעות ריצוף. בתחום התחלואה ב-HIV – ניכר המשך הירידה בהופעת נשאים חדשים בוגרים בכל קבוצות הסיכון, אם כי קיימת מגמת עלייה קלה במספר הנשאים שלא ידועה לגביהם קבוצת סיכון. כמו"כ נמשך המעקב אחרי יעילות השיטה המולקולרית המהירה QUAL באבחון הדבקה ראשונית בעיקר במקרים בהם ישנו ספק בתוצאות הבדיקות הסרולוגיות המקובלות. המלצה בנדון הועברה למשרד הבריאות. במרכז ארצי זה החל שימוש בשיטות אנליזות מולקולריות מתקדמות )NGS( בשלב זה למטרות מחקריות, בעזרת סטודנט לתואר שני

שלמד באוניברסיטת ת"א.

במרכז הלאומי לשפעת ונגיפי דרכי הנשימה:במרכז הארצי לשפעת מתנהל מעקב רציף אחר זני נגיפי השפעת הפעילים בחורף בישראל והתאמתם לזני החיסון. בעונת החורף 17 A(H1N1( במקום A(H3H2( הדומיננטי היה A 2016 נגיף שפעת –שהיה פעיל בשנים 16 – 2015. לזן זה הייתה התאמה בינונית בלבד

לזן החיסון.

במרכז הלאומי לאדמת, חצבת, חזרת )MMR( ותחום נגיפי פוליומה:במרכז הארצי לאדמת, חצבת וחזרת בא לידי ביטוי מהפך בשיטת בדיקות האבחון והמעבר מאבחון סרולוגי לאבחון מולקולרי. השיטות המולקולריות מאפשרות גם לבצע אנליזות עומק הנותנות מידע

הקדמה לדו״ח 2016מנהלת המרכז: פרופ' אלה מנדלסון

Page 8: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 7

אפידמיולוגי חשוב ביותר: האם מדובר בנגיף מקומי או בנגיף שהובא מחו"ל, איתור שרשרות הדבקה מקומית ועוד.

בשנת 2016 תועדו במרכז הארצי 8 מקרי חצבת כאשר 2 מתוכם היו מקרים ספורדיים מיובאים ואילו השלישי, אף שהיה מיובא, לא היה קשור לשני קודמיו וגרם לשרשרת הדבקה בשני מחזורים עם 5

מקרים. במקביל בוצעו אבחנות גנוטיפיות של מקרי החזרת.

במרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים:המרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים התמודד ב- 2016 עם הופעת נגיף הזיקה והגחתו העולמית. במרכז פותחו במהירות שיטות אבחון וזיהוי במטרה לזהות תחלואה במטיילים החוזרים מאזורים אנדמיים. נערכו מספר מחקרים חשובים בתחום שיטות האבחון שפורסמו בעיתונים מובילים בעולם. במקביל נערכו מספר מחקרים חשובים נוספים המסכמים את המצב האפידמיולוגי של נגיף קמ"ה בישראל

ופורסמו מאמרים אחדים בנושא.

המרכז הארצי לנגיפי שלבקת )הרפס(:במרכז הארצי לשלבקת פותח מבחן מולקולרי המאפשר הבחנה בין נגיף וריצלה פראי לנגיף תרכיבי. בהמשך נעשה שימוש בשיטה זו

ואובחנו שני מקרי תחלואה מנגיף תרכיבי.

:EBV -ו CMV תחום אבחון נגיפיביחידה לבדיקות CMV הופיעה בשנה זו עליה בדרישה לבדיקות רטרוספקטיביות של ילודים להדבקה תוך רחמית בנגיף. הבדיקה נעשית בדגימות דם שנלקחו בלידה למטרות סקר ילודים למחלות מטבוליות שונות )כרטיסי גטרי(. מתוך 80 דגימות שנבדקו – 8 )10%( נמצאו חיוביות לנגיף ואושררה הדבקה תוך רחמית. נתונים אלה חשובים לדיון הנדרש בצורך בבדיקות סקר לנגיף CMV בילודים.

תחום אבחון מולקולרי בשיטת Real Time PCR )טקמן(:היחידה לבדיקות מולקולריות מהירות, המכונה "מדור טקמן" הרשימה כתמיד בפעילותה האינטנסיבית תוך שהיא מוסיפה מבחני מעבדה חדשים, משפרת ומעדכנת תבחינים ובסה"כ מקיימת את לב הפעילות הקלינית השוטפת של המעבדה ברמה היומיומית וגם נותנת מענה מיידי לאתגרים חדשים, נגיפים מגיחים ונגיפים חוזרים. בשנת 2016 פותחו ביחידה זו תבחינים חדשים לנגיף הזיקה ונוספו מספר ריאקציות

מסוג "מולטיפלקס".

הבטחת איכות:בתחום הבטחת איכות המעבדה מפתחת את כל הכלים הנדרשים להסמכה על פי תקן מעבדות ISO-15189 זאת בתקווה שבשלב כלשהוא יימצא המימון הנדרש להסמכת כל מעבדות בריאות הציבור

על פי תקן זה.

הפעילות המחקרית והאקדמית:במקביל לפעילות השגרתית של המעבדה גם הפעילות המחקרית נמשכה באופן נמרץ כאשר כל יחידות המעבדה מעורבות בפעילות זאת. בוצעו מחקרים קליניים ואפידמיולוגיים, חלקם בשיתוף פעולה עם גופי מחקר וחוקרים מחוץ למעבדה: רופאים, חוקרים באוניברסיטאות ובמוסדות מחקר בארץ ובחו"ל, ובגופים שונים של משרד הבריאות: מעבדות לבריאות הציבור, המרכז הלאומי

לבקרת מחלות, האגף לאפידמיולוגיה, ולשכות בריאות. מקומה הייחודי והמרכזי של המעבדה כגוף מקשר בין התחומים השונים מקנה לה את היכולת לקדם שתוף פעולה אקדמי ומחקרי בין כל הגופים השונים. תוצרי המחקרים באו לידי ביטוי בפרסומים בספרות המדעית ובהשתתפות בכנסים בישראל ובחו"ל והצגת עבודות המחקר. כמו כן נמשכה הדרכת סטודנטים לתארים מתקדמים

במסגרת הפקולטה לרפואה באוניברסיטת תל אביב.בסמסטר ב' הובילו חוקרי המעבדה קורס אקדמי ייחודי בביה"ס לבריאות הציבור של אוניברסיטת ת"א אליו היא מסונפת, בנושא: "שיטות מעבדתיות לאבחון וניטור של מחלות זיהומיות נבחרות

ואיכות מזון ומי שתיה"

עובדים מצטיינים:בשנת 2016 נערך במעבדה תהליך לבחירת "עובד מצטיין". לוועדה הוגשו 6 מועמדות אשר אחת מהן נבחרה להיות העובדת המצטיינת שתשתתף בתחרות הארצית של משרד הבריאות. יחד עם זאת חברי הועדה הכירו בתרומתן של כל המועמדות ובטקס שנערך הוענקו

להן תעודות הוקרה.

ולסיום, ברצוני להודות ולהביע את הוקרתי והערכתי הרבה לכל עובדי המעבדה לנגיפים אשר בזכות חריצותם, התלהבותם, יושרם ויכולותיהם המקצועיות הגבוהות ויוצאות הדופן מובילים את המעבדה כגוף מצטיין שנה אחרי שנה. אין ספק כי העובדים היו ונשארו הנכס

העיקרי והחשוב ביותר של המעבדה לנגיפים.תודות גם לכל הממונים עלינו והמסייעים לנו במשרד הבריאות ובשיבא ולכל אלה הנותנים לנו את התמיכה והכלים לביצוע כל המוטל עלינו. תודה מיוחדת ליוסי שכטר משיבא על סיועו בתהליך שיפוץ המעבדה, לדניאל רוטנברג, גזבר ת"א, על הסדרת התכנון התקציבי ומערך הרכש של המעבדה, לחברת "שביט" -דותן וחדוה, היועצים הארגוניים המלווים אותנו, לד"ר רם דולמן מנהל אגף המעבדות בשיבא, לאתי לביא ואורית בר ממשאבי אנוש בשיבא, לפרופ' איתמר גרוטו, ראש שירותי בריאות הציבור וכיום משנה למנכ"ל משרד הבריאות, לפרופ' דני כהן ראש ביה"ס לבריאות הציבור, אוניברסיטת ת"א ולעוד רבים

וטובים אשר קצרה היריעה למנותם.

Page 9: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

8 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

רשימת הבדיקות הוירולוגיות האבחנתיות

בדיקות סרולוגיותחומר קליניבדיקהנגיף

Chikungunya VirusIgG ,IgMנסיוב

Congo Crimean Hemorrhagic Fever VirusIgG ,IgMנסיוב

CMV xIgG ,IgMנסיוב

Dengue VirusIgG ,IgMנסיוב

EBVIgG ,IgM ,EBNAנסיוב

Hanta VirusIgGנסיוב, שתן

HHV-6IgG ,IgMנסיוב

HHV-7IgGנסיוב

HHV-8IgGנסיוב

HIVGeeniusנסיוב

HSV 1, 2IgG ,IgM ,typingCSF ,נסיוב

Japanese Encephalitis VirusIgG ,IgMנסיוב

Measles VirusIgG ,IgMCSF ,נסיוב

Mumps VirusIgG ,IgMנסיוב

Parvo B19 VirusIgG ,IgMנסיוב

PoliovirusNeutralization Antibodiesנסיוב

Rubella VirusIgG ,IgM ,Avidityנסיוב

Rift Valley Fever VirusIgG ,IgMנסיוב

Sand Fly VirusIgG ,IgMCSF + נסיוב

Sindbis VirusIgG ,IgMנסיוב

Tick Borne Encephalitis VirusIgG ,IgMCSF + נסיוב

VZVIgG ,IgMנסיוב

WNVIgG ,IgMCSF + נסיוב

Yellow Fever VirusIgG ,IgMנסיוב

Zika VirusIgG ,IgMנסיוב

בידוד וזיהוי נגיף/ אנטיגן נגיפיחומר קליניתרביות/ שיטהנגיף

RotavirusImmunoblotצואה

Poliovirus, EnterovirusBGM, RD, L20B, HukiCSF ,צואה

Flu, Para, Adeno, RSV Huki, MDCK, A549, MRC5ביופסיות ,)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

Page 10: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 9

)RT / PCR ,PCR( בדיקות מולקולריותAdeno VirusPCRביופסיות ,)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

Avian Influenza VirusRT-PCR)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

CMVPCRביופסיות ,BAL ,מי שפיר

CMVQuantitative PCRדם מלא

DengueRT-PCRנסיוב

EBVQuantitative PCRדם מלא

Enterovirus, PoliovirusRT- PCRצואה ,CSF

H1N1 VirusRT-PCRביופסיות ,)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

HAVRT-PCRדם מלא

HBVResistance to Drugsדם מלא

HCVResistance to Drugsדם מלא

HDVViral Loadדם מלא

HEVRT-PCRדם מלא

HHV-6PCRמי שפיר ,CSF ,דם מלא

HHV-8PCRדם מלא, ביופסיות, נוזל פריטונאלי

HIVPCR, Viral load, Resistance to drugsדם מלא

hMPVRT-PCRביופסיות ,)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

HSV 1, 2PCRCSF

Influenza A,B VirusRT-PCRביופסיות ,)NPS( משטחי גרון ואף, שאיבות

JCVPCRביופסית מוח ,CSF

BKVPCRשתן, דם מלא

Measles VirusRT-PCRביופסית מוח, שתן, משטח אף ולוע ,CSF

MumpsVirusRT-PCRנוזל מבלוטות רוק ,CSF ,ביופסיה, שתן

NorovirusRT-PCRצואה,כיח

Parainfluenza VirusRT-PCRביופסיות ,)NPS( משטחי אף ולוע, שאיבות

Parvo B19 VirusPCRמח- עצם

RSVRT-PCRביופסיות ,)NPS( משטחי אף ולוע, שאיבות

Rubella VirusRT-PCRמשטח אף ולוע, שתן

Rift Valley Fever VirusRT-PCRנסיוב

Sindbis VirusRT-PCRCSF ,נסיוב

VZVPCRנוזלי שלפוחית ,CSF

WNVRT-PCRביופסיות ,CSF ,נסיוב

Yellow Fever VirusRT-PCRנסיוב, דם מלא

Zika VirusRT-PCRדם מלא, שתן, מי שפיר, נוזל זרע

Page 11: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

10 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

סיכום הבדיקות הקליניות – התפלגות לפי גורם ושיטה

טבלה מס' 1:מספר בדיקות קליניות לפי גורם

טבלה מס' 2:מספר בדיקות קליניות לפי שיטה

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

35000

40000

0

10000

20000

30000

40000

50000

60000

70000

Molecular Serology Virus isolation/identification

Page 12: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 11

נושאי פעילות המרכז:אבחון מעבדתי של פוליו במקרים של שיתוק חד-רפה.. 1קביעת רמת נוגדנים מנטרלים לפוליו בנבדקים ובקבוצות . 2

אוכלוסיה נבחרות.זיהוי ואפיון נגיפי אנטרו ממקרים חשודים לדלקת קרום המוח . 3

ומחלות נוספות.זיהוי ואפיון נגיפי רוטה ונורו ממקרים של דלקת מעי חריפה. . 4בקרת איכות.. 5מחקר ופיתוח.. 6

אבחון מעבדתי של פוליו במקרים של שיתוק . 1חד-רפה

שיתוקיים פוליו מקרי נצפו לא היום ועד 1989 מאז מקרי של הפעיל הניטור נמשך 2016 בשנת בישראל. עד בחולים )Acute Flaccid Paralysis( חד-רפה שיתוק גיל 15 באוכלוסיית ישראל וברשות הפלסטינאית, בהתאם מבצע בנוסף )אב"ע(. העולמי הבריאות ארגון לדרישות המרכז בדיקות לחולים עם תסמינים שיתוקיים גם בחולים נבדקו זה מניטור שהתקבלו הדגימות כל .15 גיל מעל ממקרים דגימות לאנטרו-כללי. ישירה מולקולרית בשיטה של ילדים עד גיל 15 שנים נזרעות בתרביות תאים ייחודיות לבידוד פוליו ואילו דגימות ממקרים מעל גיל 15 נזרעות רק

אם הדגימה נמצאה חיובית מולקולרית לאנטרו. סה"כ בשנת 2016 נבדקו במרכז 137 דגימות צואה ו- 2

דגימות CSF, שהתקבלו מ- 70 חולים עם שיתוק חד-רפה על פי הפירוט בטבלה מס' 1:

טבלה מס' 1:מקרי שיתוק רפה אשר נבדקו במעבדה בשנת 2016.

הרשותישראל הפלסטינית/עזה

מס׳מקרים

מס׳ מס׳CSFצואות

מקרים מס׳

צואות

163324692עד גיל 15

812000מעל גיל 15

מכלל המקרים שנבדקו, 14 מקרים נמצאו חיוביים מולקולרית לנגיפי אנטרו שאינם פוליו, 8 מתוכם בודדו בתרביות ו- 11 אופיינו גנוטיפית,

כפי שמפורט בטבלה מס' 2:

טבלה מס' 2:אפיון נגיפי אנטרו שאינם פוליו ממקרים של שיתוק רפה בשנת 2016.

מס׳ מקרים

מס׳מקרים חיוביים לאנטרו בבדיקה

מולקולרית

בדוד בתרביות

תאים

הנגיפיםשאופיינו

)מבידוד או מדגימת מקור(

ישראל ,1654/5EV-71, CVB-3עד גיל 15

CVA-2, EV-11

ישראל80מעל גיל 15

הרשותהפלסטינית/

עזה4694/9

CVA-20, CVB3 (2),CVA-2, CVA-1, CVB-5, EV-12

גם בשנה זו קיבל המרכז הסמכה על ידי ארגון הבריאות העולמי כמרכז לאומי לפוליו לשלוש פעילויות שונות: )1( בידוד נגיף הפוליו בתרביות תאים )2( זיהוי מולקולרי של זן הפוליו )3( ריצוף הפוליו. מתן ההסמכה מחייב עמידה בקריטריונים של אב"ע שכוללים: ביצוע מבחני בקרת איכות, דיווח שנתי על היקף פעילות המעבדה בנושא הפוליו בפרט ואנטרו-וירוסים בכלל, דיווח שבועי אודות ניטור AFP, שימוש בשיטות עבודה וריאגנטים מומלצים ויישום מקרי כל הדרישות ביחס לאחסון דגימות ובידודי נגיף הפוליו ורישומם.

דרישה נוספת של אב"ע לשנת 2016 הייתה השמדת מאגרי 2 ואיסור שימוש בו במדינת ישראל ובמעבדה בפרט. פוליו זן

דרישה זו הגיעה בעקבות:הכרזה על הכחדה של פוליו פראי מזן 2 בעולם )ספטמבר 2015(.. 1החלפת השימוש בתרכיב חי מוחלש המכיל את 3 זני התרכיב . 2

בתרכיב מסוג bOPV שאינו כולל את זן 2 בכל העולם )אפריל 2016(.רק מעבדות מסוימות בעולם מורשות להחזיק ולעבוד עם זן זה בתנאי בטיחות מחמירים במיוחד. בשל דרישה זו הושמדו כל

המרכז הלאומי לנגיפי פוליו,אנטרו וגורמי שלשולים

מנהלת המרכז: ד"ר מרב וייל

צוות המרכז: מגר' אילנה זילברשטיין, גב' לאה וייס

זיהוי גנוטיפי של פוליו: מגר' ז'קלין אלפנדרי, מגר' אפרת אסולין

Page 13: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

12 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

המאגרים של פוליו מזן 2 במעבדה והופסק השימוש בנגיף המוחלש מזן 2 לבדיקות כייל נוגדנים לזן זה.

2. קביעת רמת נוגדנים מנטרלים לפוליו בנבדקים ובקבוצות אוכלוסייה נבחרות.

דגימות נסיוב המתקבלות למרכז נבדקות לקביעת כייל נוגדנים המנטרלים כלפי שלושת זני הנגיף. החל מאוגוסט 2016 הופסקה בדיקת כייל נוגדנים מנטרלים כנגד זן 2, עקב דרישות אב"ע. הסיבות העיקריות לבדיקה הן: ברור סטטוס החיסוני של הנבדק וברור חשד לחסר חיסוני מולד )תגובת הנבדק לחיסוני השגרה(. בנוסף, מופנות בדיקות של עובדי בריאות שנדרשים להציג חסינות לפוליו במידה ואין ברשותם תיעוד על קבלת החיסון בעבר.בשנת 2016 נבדקו 1450 דגימות נסיוב לקביעת רמת כייל נוגדנים מנטרלים לפוליו לזנים 1 ו-3. 641 דגימות מתוכם נבדקו גם לזן 2. הממצאים המעבדתיים מסוכמים בטבלה מס' 3:

טבלה מס' 3:מספר ואחוז המחוסנים בכייל מחסן, מחסן נמוך ובלתי מחוסנים

לשלושת זני הפוליו.

פוליו כייל נוגדניםזן 1

פוליו זן 2

פוליו זן 3

8< לא מחוסן9124מס׳

%0.6%0.2%1.7%

8 מחוסן נמוך6219מס׳

%0.4%0.3%1.4%

8> מחוסן14356381407מס׳

%99%99.5%97%

ניתן לראות כי אחוז גבוה )97%≥( של האוכלוסייה מחוסן לשלושת זני הנגיף. אחוזי החסינות לזן 3 הינה הנמוכה ביותר.

בדיקות סרולוגיות לסקרי אוכלוסייה:בשנת 2016 לא בוצעו סקרים לקביעת החסינות לפוליו במסגרת

מעקב אחרי תכניות חיסון או בקבוצות נבחרות כלשהן.

זיהוי ואפיון נגיפי אנטרו ממקרים חשודים לדלקת .3קרום המוח ומחלות נוספות.

בשיטת מבוצע קליניות בדגימות אנטרו נגיפי אבחון Real-Time RT-PCR על ידי מדור TaqMan. בשנת 2016 התקבלו 1921 דגימות קליניות מתוכם 257 )13.4%( נמצאו חיוביות לאנטרו. בטבלה מס' 4 מתוארת התפלגות הדגימות ואחוזי

החיוביים לפי סוג הדגימה. בהמשך, בטבלה מס' 5 ישנו פירוט של אחוזי הדגימות החיוביות לפי חודשי השנה ולפי סוג הדגימה.

טבלה מס' 4: התפלגות הדגימות לבדיקת נגיפי אנטרו ואחוזי החיוביים לפי

סוג הדגימה.

חומרדגימה

מס׳דגימות

מס׳% חיובייםחיוביים

CSF81212014.8

99211011.1צואה/ משטח רקטלי

551120.0דרכי נשימה

P.M 22522.7דגימות

600נוזל פלוארלי

341132.3שונות

192125713.4סה”כ

טבלה מס' 5:אחוזי חיוביים לאנטרו ב- Real-Time RT-PCR, לפי חודשי השנה

בדגימות מסוג: CSF או צואה.

בשיטת האנטרו נגיפי לכלל חיוביות שנמצאו דגימות Real-Time RT-PCR ושנותר מהן חומר קליני, נזרעו לתרביות תאים לצורך בידוד הנגיף ואפיונו. מרבית מהדגימות שלא נותר מהן חומר או שלא בודדו בתרביות תאים אופיינו באופן ישיר מדגימת

המקור. סה"כ סווגו כ- 70% מכלל הדגימות החיוביות.

צואותCSFחודש

10.7 )6/56(7 )7/100(ינואר

9.6 )5/52(6.7 )5/75(פברואר

24.1 )14/58(27.4 )26/95(מרץ

13.0 )9/69(18.6 )16/86(אפריל

11.9 )8/67(12.8 )10/78(מאי

19.3 )16/83(6.8 )5/73(יוני

20.7 )17/82(14.7 )11/75(יולי

10.8 )8/74(9.2 )7/76(אוגוסט

14.5 )11/76(1.3 )1/78(ספטמבר

14.3 )10/70(6.3 )4/64(אוקטובר

18.4 )9/49(12.1 )11/91(נובמבר

9.2 )7/76(6.9 )7/101(דצמבר

Page 14: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 13

מגמות תחלואה בנגיפי אנטרו בשנת 2016:לאנטרו החיוביים באחוזי משמעותית עליה נצפתה 2016 בשנת ב- CSF בחודשים מרץ-אפריל )ראה טבלה מס' 5(. עליה זו תוארה גם

CSF ב- כשליש מהחיוביים .EV-30 ויוחסה לגנוטיפ ברחבי הארץ 0-2 שנים. בשאר חודשי השנה נצפתה בגילאי היו זו בתקופה נוספים דומיננטיים זנים התפרצותית. לא שגרתית, תחלואה CVB-5 ו- CVA-9 ,EV-11 ,CVA-6 היו: השנה במהלך שזוהו

)טבלה מס' 6(.

אפיון נגיפי פוליו בדגימות שמתקבלות לבדיקת אנטרו:בתחילת שנת 2014 הוסף החיסון המוחלש לפוליו )bOPV( לחיסוני ילד ולכן דגימת צואה של הילדות. הנגיף המוחלש מופרש בצואה שקיבל חיסון מוחלש יכולה להכיל פוליו תרכיבי למשך מס' שבועות

מקבלת החיסון.

פוליו נגיף בודד 2016 בשנת שהתקבלו הצואה דגימות מכלל תרכיבי מסוג 1 ו/או 3 מארבע דגימות צואה של ילדים מתחת לגיל וקיבלו את ילדים אלו נמצאו ללא בעיות של חסר אימוני שנתיים. חיסוני הילדות כנדרש. בנוסף, אופיין נגיף מסוג iVDPV-2 משני ילדי חולים בבית ומאושפזים הפלסטינית ברשות שמתגוררים ,SCID

שיבא )מפורט בסעיף 6 פיתוח ומחקר(.

זיהוי ואפיון נגיפי רוטה ונורו ממקרים של דלקת .4מעי חריפה:

המרכז מזהה ומאפיין נגיפים הגורמים לגסטרואנטריטיס חריף ובכללם נגיפי רוטה ונורו בחולים מאושפזים ובמסגרת חקירת

התפרצויות.

אבחון נגיפי רוטה . 1)זיהוי Dipstick באמצעות מבוצע הרוטה נגיף אבחון אנטיגן נגיפי(. במהלך 2016 נבדקו במרכז 727 דגימות של חולים מאושפזים לנוכחות נגיף הרוטה. מס' קטן של דגימות נמצאו חיוביות לנגיף זה )n=47(. עיקר הדגימות החיוביות זוהו בחודשי החורף, ה"עונה החמה" של נגיף לחיסון מיוחס )6.5%( הנמוך החיוביים אחוז הרוטה. לא בילדות. הניתן במסגרת חיסוני השגרה Rotateq ה- במאושפזים החיוביים באחוזי משמעותי שינוי נצפה בניטור זאת, לעומת קודמות. חורף לעונות ביחס התחלואה שנגרם על ידי נגיף הרוטה בקהילה )שמבוצע ע"י המלב"ם( נצפתה עליה משמעותית באחוז החיוביים לעונות בהשוואה ,2015-2016 החורף בעונת לרוטה של לרוטה החיוביות מהדגימות מייצג מדגם קודמות. ניטור זה הועברו למרכז להמשך אפיון גנוטיפי. הגנוטיפ

.G9P8 -הדומיננטי שזוהה הינו

אבחון נגיפי נורו .2 בשיטת מבוצע קליניות בדגימות נורו נגיפי אבחון המבחן .TaqMan מדור ידי על Real-Time RT-PCR

2016 בשנת .II מזן Norovirus מזהה המולקולרי שהתקבלו דגימות כולל זה מספר דגימות. 574 נבדקו מהתפרצויות. וכן ספורדיים תחלואה ממקרי

178 דגימות צואה נבדקו מ- 17 התפרצויות שונות: 14 מהצבא ו- 3 מבתי אבות/מחלקת גריאטריה. מתוך כלל ההתפרצויות רק שלוש נגרמו על ידי נורו; במחלקה

חודש

CVA

-10

CVA

-6

CVB

-1

CVB

-3

EV-1

1

EV-2

0

EV-3

0

EV-9

EVA

-71

CVA

-2

CVB

-4

EV-3

CVA

-24

CVA

-4

EVC

-99

CVA

-9

EV-1

4

CVA

-1

EV-1

5

EV-1

2

CVB

-5

EV-3

3

EV-2

5

CVA

-8

EV-1

8

CVA

-16

CVA

-5

EV-5

111111411ינואר

1141111פברואר

1122911מרץ

31141211אפריל

138121מאי

23211131111יוני

3313171יולי

31211111אוגוסט

11111ספטמבר

21112אוקטובר

111712111נובמבר

111312דצמבר

115241376142283133143212151125311סה"כ

טבלה מס' 6:אפיון גנוטיפי של נגיפי האנטרו, בהתאם לחודשי השנה )לכלל סוגי חומרי הדגימה(.

Page 15: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

14 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

גריאטרית בבית חולים ובשני בתי אבות. ממקרי תחלואה 46 דגימות, 396 התקבלו מאושפזים( )בעיקר ספורדיים

מהן נמצאו חיוביים לנורו )11.6%(.

בקרת איכות .5בדיקות לביצוע הסמכה קיבל לפוליו הלאומי המרכז

לבידוד פוליו בתרביות תאים, אפיון גנוטיפי של זני הפוליו באמצעות )Real Time-PCR (ITD וריצוף נגיפי פוליו לשנת 2016. הסמכה זו מבוססת על עמידה בהצלחה בשלוש אב"ע. של שונים (Proficiency tests( חיצוניים מבחנים

QCMD מסוג חיצוני במבחן בהצלחה עמד המרכז .Enterovirus -ו Norovirus -ל

מחקר ופיתוח .6זיהוי של נגיפי Parecho בילדים בני פחות משנה. 1

לאלו דומים קליניים לסימנים גורמים Parecho נגיפי שנגרמים על ידי נגיפי אנטרו שכוללים: גסטרואנטריטיס, רפה. שיתוק ואף ממנינגיטיס הנשימה, בדרכי זיהומים בנוסף נגיפים אלו זוהו בארה"ב בדגימות שנלקחו בנתיחות עיקר שנתיים. גיל עד לתינוקות שבוצעו המוות שלאחר

התחלואה בספרות היא בילדים מתחת לגיל שנתיים.

Parecho-1 זו, נגיפים משפחת של זנים נכללו בעבר האנטרו נגיפי קבוצת בתוך ,Parecho-2-ו

)Echo-22 ו- Echo-23( ובודדו בתרביות תאי כלית קוף. עם אלו שנגיפים התברר המולקולריות, השיטות התפתחות ( ואינם מזוהים שונים באזור השמור של נגיפי האנטרו )על ידי הפריימרים סגוליים לשאר נגיפי האנטרו. לאור השונות הגנטית הזו, הוצאו נגיפי Parecho מתוך משפחת האנטרו והם מהווים כיום משפחה עצמאית בכלל נגיפי הפיקורנה.

Real-Time PCR בשיטת Parecho נגיפי לנוכחות בדיקה הדגימות בכל לשבוע אחת של בתדירות כסקר מבוצעת אנטרו. לבדיקת לגיל שנה שמתקבלות ילדים מתחת של חיוביות נמצאו דגימות 46 שנבדקו הדגימות 558 מכלל

2016 בשנת Parecho ל- החיוביים אחוז .Parecho ל- בשלוש החיוביים לאחוזי ביחס ביותר הגבוה היה )8.2%(שנים הקודמות )3.6-6.5%(. צריך לקחת בחשבון שממצא הדגימות מכלל השיטה. רגישות מהעלאת לנבוע יכול זה החיוביות: 39 דגימות היו דגימות צואה ו- 7 דגימות מנוזל

שדרה.

ע"י Vaccine Derived Polio Virus )VDPV(- 2 הפרשת .2)Severe Combined Immunodeficiency( SCID ילדי

כאשר אנשים עם חסר אימוני מקבלים חיסון מוחלש של המוחלש הנגיף מהנגיף. "להפטר" קושי להם יש פוליו עובר רפלקציה במערכת העיכול שלהם ומשתנה לאורך לאחר לשנה. הנגיפי בגנום שנוי 1% של בממוצע זמן מוגדר הנגיף הנוקלאוטידים, במס' 0.6-1% של שינוי

כ- Vaccine Derived Polio Virus. במהלך שינויים אלו הנגיף יכול לעבור החזרה בנקודות ההחלשה ולחזור להיות נגיף

אלים.

מסוג נגיפים שני אופיינו 2016 בשנת SCID ילדי בשני Vaccine Derived Polio Virus (VDPV( -2

הפלסטינית. ברשות ומתגוררים בישראל שמאושפזים

מסוג נגיף זוהה 2015 שנת בסוף :1 מס' מקרה Vaccine Derived Polio Virus (VDPV( -2 בצואה של ילדה

בת חמישה חודשים עם חסר אימוני. נגיף זה עבר החזרה הנוירוירולנטיות. ההחלשה נקודות בשתי (Reversion(

מקורו של הנגיף הוא בנגיף תרכיבי מזן 2 שהילדה קיבלה בגיל חודשיים כחלק מחיסוני השגרה. החיסון ניתן טרם האבחנה שהיא עם חסר אימוני מסוג SCID. נערך מעקב לחודש, אחת הילדה של בצואה הנגיף הפרשת אחרי בחודש הנגיף הפרשת להפסקת עד כשנה במשך אוקטובר 2016. ככל הנראה, בשל הצלחת השתלת מח-

עצם.

זוהה 2016 ספטמבר בחודש :2 מס' מקרה ילד בצואה של Vaccine Derived Polio Virus (VDPV( - 2

הפלסטינית ברשות שמתגורר חודשים, 9 בן נוסף זה נגיף אימוני. חסר של לבירור בישראל ומאושפז ההחלשה נקודות בשתי (Reversion( החזרה עבר מאושפזת שבה במחלקה שהה הילד הנוירוירולנטיות. הילדה ממקרה מס' 1 ועל כן היה חשוב לשלול קשר בין בטבלה שמוצגות כפי הריצוף, תוצאות המקרים. שני גם הנגיפים. שני בין משמעותי שוני מדגימות 7 מס' תרכיבי פוליו בנגיף הוא הנגיף של מקורו זה, במקרה השגרה, מחיסוני כחלק חודשיים בגיל שקיבל 2 מסוג .SCID מסוג אימוני חסר עם ילד שהוא האבחנה טרם בנוסף, באופן נדיר, נגיף זה זוהה גם במשטח הגרון של הפרשת אחרי מעקב נערך אלו ממצאים לאור הילד. לחודש נכון לחודש. ובמשטח הגרון אחת הנגיף בצואה בדגימות זה נגיף להפריש ממשיך הילד 2017 אפריל

צואה ובמשטחי גרון.

מקרים אלו מדגימים את העובדה שהנגיף התרכיבי מזן 2 יכול להיות ולהוות אלים להיות יכול פוטנציאלית חיסון, מדוכאי באנשים חבוי מקור להמשך העברה לאוכלוסיה. בתקופה זו בו אב"ע מוביל מהלכים

Page 16: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 15

2 בזן שימוש )הפסקת 2 זן של סופית ארדיקציה לצורך דרמטיים תרכיבי והכלתו במתקנים ייחודיים(, יש לקחת בחשבון הימצאות של

מקרים מסוג זה ולהבין שהנגיף לא יעלם כ"כ מהר מהעולם.

טבלה מס' 7 : השוואה של השינויים באזור המקודד לחלבון VP1 של נגיף

.SCID -בשני ילדי ה VDPV2 -ה

iVDPV-2 Case 2

iVDPV- 2 Case 1

Sabin 2 )Vaccine strain(

NucleotidePosition

TG10

TC26

GA40

GA44

TC62

AG63

TC69

AG117

GA147

GA186

R(A/G(A288

AAG308

TC364

CCT*428

Y (C/T(T438

GA459

TC486

TC516

Y (C/T(T519

R(A/G(G531

C540

K (G/T)T664

Y (C/T(T723

R(A/G(G756

YG765

GA769

Y (C/T(C831

AT849

R(A/G(897

1614Total

* מוטצית ההחלשה הנוירוירולנטית של הזן 2 תרכיבי בעמדה 428 .)Reversion( שעברה החזרה VP1 באזור המקודד לחלבון

הפרשת נגיף תרכיבי חי מוחלש )OPV( בדגימות צואה .3

מאיה ידי על גמר עבודת בוצעה 2016 שנת במהלך אודליה ד"ר של בהנחייתה תל-אביב מאוניברסיטת רז, חי מסוג תרכיבי פוליו נגיף הפרשת משך בנושא: חורין הייתה העבודה מטרת צואה. בדגימות )OPV( מוחלשהפרשתו משך ואת הנגיף הפרשת שיעור את לבחון bOPV במסגרת בדגימות צואה של תינוקות שחוסנו ב- כך, לצורך וחצי. ושנה שנה חצי בגילאי השגרה חיסוני קבלת לאחר מתינוקות צואה דגימות 30 כ- נאספו דגימות 25 וכ- bOPV בתרכיב ראשונה חיסון מנת .bOPV מפעוטות לאחר קבלת מנת חיסון שניה בתרכיבממועד ימים 20 ו- 10 כעבור נאספו הצואה דגימות 3 וסייבין 1 סייבין הזנים לנוכחות ונבדקו החיסון קבלת .PCR Real-Time בדיקת באמצעות התרכיבי הנגיף של

גבוהה הפרשה רמת הדגימו הראשוניים הממצאים יותר של שני זני התרכיב בקרב מקבלי המנה הראשונה כעבור השניה, המנה מקבלי לעומת החיסון של מקבלת ימים 20 כעבור התרכיב. מקבלת ימים עשרה הראשונה המנה מקבלי של ההפרשה רמת התרכיב בלבד. 3 לזן ביחס גבוהה ממקבלי המנה השניה היתה זהות. היו ההפרשה רמות 1 לזן ביחס זאת, לעומת פחתה ההפרשה הגיל, קבוצות בשתי מקרה בכל שנת ימשיך במהלך זה מחקר הזמן. נקודות שתי בין קבוצה. בכל 60 ל- המדגם גודל להשלמת 2017

Page 17: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

16 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

המרכז הארצילנגיפים בסביבה

מנהל המרכז: ד"ר איתי בר אור

צוות המרכז: מגר' אירנה אגובייב, מגר' ז'קלין אלפנדרי, מגר' אפרת אסולין ומר סעיד )צביקה( כהן

נושאי פעילות המרכז:ניטור נגיף פוליו בשפכים.. 1ניטור נגיפים אנטריים בדגימות מים ומי קולחין.. 2ניטור בוצות ממט"שים.. 3

1. מעקב אחר נגיפי פוליו בשפכיםבשנת 2016 המשכנו את הניטור המורחב אחר נגיף הפוליו בשפכים

בעקבות חדירתו של נגיף פוליו פראי בשנת 2013.טיפול מתקני 13 הינם בישראל שנדגמים האתרים מספר

שפכים )מט"ש( ושתי נקודות ישירות מקווי ביוב. בנוסף נבדקים גם 4 אתרים בעזה ו 9 אתרים ברשות הפלסטינית. באפריל 2016, בהתאם להנחיות ארגון הבריאות העולמי, הופסק השימוש בחיסון חי מוחלש המכיל את שלושת זני הפוליו בתחומי הרשות הפלסטינית ועזה. כתחליף לחיסון זה ניתן חיסון חי מוחלש המכיל פוליו זן 1 ו- 3 בלבד. כתוצאה מכך החל מחודש מאי לא נמצא נגיף פוליו תרכיבי מזן 2 בשפכים שמקורם בעזה וברשות הפלסטינית. סה"כ השנה נבדקו 132 דגימות שפכים בתחומי מדינת ישראל ובנוסף נבדקו 18 דגימות שפכים מעזה ו- 108 דגימות שפכים מהרשות. הדגימות עובדו ונבדקו בהתאמה לנהלים

של ארגון הבריאות העולמי.ניתוח הממצאים בשטחי מדינת ישראל מוצגים בטבלה מס' 1 ומראים:

בכל הדגימות לא נמצאו זני פוליו פראיים וגם לא זני פוליו . 1תרכיבי רוורטנטי.

בדומה לשנה שעברה, כ 74% מכלל הדגימות היו חיוביות . 2לנגיף פוליו תרכיבי.

יותר. 3 3 נמצא באחוזים גבוהים נגיף פוליו תרכיבי מזן )כ 60%( בשפכים מאשר נגיף פוליו תרכיבי מזן 1 )כ 42%(. נתונים אלו משקפים את החיסון הניתן לילדים במסגרת

תוכנית החיסון הלאומית. זן 2 נמצאו . 4 דגימות שהכילו את נגיף הפוליו התרכיבי

עד אפריל 2016 באזור ירושלים. ממצאים אלו קשורים לאוכלוסיית הרשות אשר חיסנה את אוכלוסייתה בחיסון המוחלש הכולל את זן 2 עד אפריל 2016. לכן לאחר חודש

זה לא נמצא יותר נגיף פוליו תרכיבי מזן 2 בשפכים. ארגון הבריאות העולמי קבע שמדד לאיכות הדיגום וביצוע . 5

בדיקות המעבדה יהיה ממצא של נגיפים אנטריים בלפחות 40% מכלל דגימות השפכים הנבדקות. בשנת 2016 ניתן

לראות שרק 9% מדגימות השפכים נתנו ממצא שלילי לנגיפים אנטריים. ממצא זה מצביע על איכות טובה מאוד

של דיגום ושיטות המעבדה.

טבלה מס' 1:ניתוח ממצאים בדגימות שפכים לניטור נגיף הפוליו בשנת 2016.

מספר אחוזהדגימות

9773.5חיובי לפוליו תרכיבי כללי

5642.4חיובי לפוליו תרכיבי זן 1

32.3חיובי לפוליו תרכיבי זן 2

7959.8חיובי לפוליו תרכיבי זן 3

9773.5כלל הדגימות החיוביות לפוליו תרכיבי

00כלל הדגימות החיוביות לפוליו פראי

00כלל הדגימות החיוביות לפוליו תרכיבי רוורטנטי

2317דגימות חיוביות רק לנגיפי אנטרו

129דגימות שליליות לנגיפי אנטרו

132כלל הדגימות

סיכום· תוכנית הניטור לנגיף הפוליו בישראל מכסה כ 50-70%

מהאוכלוסייה תוך ייצוג כל המחוזות.· הדיגום הינו איכותי וכך גם שיטות העיבוד במעבדה מה

שמחזק את וודאות הממצאים.· תוצאות הניטור מראות שכבר שלוש שנים שישראל

חופשיה מזן פוליו פראי.

2. ניטור נגיפים אנטריים בדגימות מים ומי קולחיןבשנה זו בוצעו שני פרויקטים עיקריים:

המשך ניטור המאגרים להשבת מי שיטפונות והעשרה של . 1אקוויפרים המשמשים מקור מי שתיה.

ניטור פרויקט השבת מי קולחין מהשפד"ן לשימוש חקלאי . 2על ידי החדרתו לקרקע.

Page 18: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 17

טבלה מס' 2:סיכום ממצאי בדיקות המים השונים.

כמות בדיקותסוגי מים ממצאים חיוביים

לנגיפיםאנטריים-תרביות

ממצאים חיוביים לנגיפים

אנטריים- מולקולרי

ממצאים חיוביים לפאג’ים

-400מי שתיה

3232/2קולחין שפדן

2000מים מושבים שפדן

9סה”כ

שיטות: בשתי שימוש ידי על התבצעו המעבדה בדיקות שונות תאים רקמות על דוגמה זריעת של קלסית שיטה )RD, BGM ו -HUKI( ושיטה מולקולרית הבודקת קבוצות נגיפים אנטריים )נגיפי אנטרו, נגיפי אדנו, נגיפי נורו ונגיפי פאראקו(. קבוצות

אלו נבחרו בשל שכיחותן הגבוהה בסביבה כסמנים לזיהום.

· בשנת 2016 כמות הגשמים באזור צפון הארץ היתה נמוכה. דבר זה גרם לחוסר זרימה של מים בנחלי מנשה נדגמו לא לכן במאגר. החילחול לאזור הגעתם ואי ישראל של הדרומי באזור זאת לעומת אלו. קידוחי כמות הגשמים הייתה ממוצעת ואפשרה פעילות של מאגר שקמה וביצוע דיגומי מים. השנה בפרויקט זה לא נמצאו זיהומים בקידוחי השאיבה )ראה טבלה מס' 2(.

· מי קולחין מהשפד"ן )תחנה 6( מנוטרים באופן שיגרתי מים אלו משמשים כמקור קולחין כבר מספר שנים. בחקלאות. חוזר שימוש לצורך לקרקע להחדרה קבוע באופן מזוהמים הקולחין שמי הראו הבדיקות לאי פאג'ים בדיקות בנוסף אנושי. ממקור בנגיפים טובה אינדיקטיבית כשיטה לשמש ממשיכות קולי לזיהום במים אלו )ראה טבלה מס' 2(. המים המושבים בפרויקט זה נמצאו ללא גורמים מזהמים משני הסוגים.

3. ניטור נגיפים אנטריים בבוצותהמדור ממשיך בניטור סקר הבוצות ממט"שים שטופלו לרמה המוגדרת בוצה סוג א' ומשמשת לדישון חקלאי. השנה נבדקו 95 בוצות שהתקבלו דרך שתי מעבדות פרטיות המרכזות את הרוב המכריע של הבוצות בארץ לצורך בדיקות בקטריאליות, ומעבירות דוגמאות אל המעבדה לביצוע בדיקות לנגיפים. בנוסף בתחילת 2017 מסתיים ההיתר שניתן לשפד"ן להזרמת בוצות לים תיכון. אי לכך השפד"ן הקים מתקן טיפול בבוצות שהוא הגדול ביותר בעולם. דגימות בוצה מהמתקן החדש נשלחו אלינו לבדיקת נוכחות נגיפים אנטריים כפיילוט לקראת הפעלת

המתקן במתכונתו המלאה. בדיקות הבוצה מתבצעות באמצעות שיטה מולקולרית ל-4 סוגי נגיפים )נגיפי אנטרו, נגיפי אדנו, נגיפי נורו ונגיפי פאראקו( ושיטת

.)HUKI- ו RD, BGM( זריעת דוגמה על רקמות תאים שונות

Page 19: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

18 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז:1 . HIV -בדיקות לנגיף ה

.HIV ½ 1.1 בדיקות סרולוגיות לאימות להדבקה ב 1.2 בדיקות Real Time PCR ובדיקות QUAL לזיהוי הדבקה

.HIV -ב .HIV-1 1.3 בדיקות עומס נגיפי לנשאי

1.4 ריצוף נגיפי ה HIV-1 לצורך קביעת עמידות או התאמה לטיפולים תרופתיים.

בדיקות לנגיפי הפטיטיס. 2HEV -ו HAV בדיקות לאבחון הפטטיטיס ויראלית מסוג -

HDV בדיקות עומס נגיפי להפטיטיס דלתא - - ריצוף נגיפי HCV ו- HBV לצורך קביעת עמידות או

התאמה לטיפולים תרופתיים- קביעת גנוטיפ נגיף HCV )בעזרת ריצוף(

בדיקות לנגיף פרבו. 3 - סרולוגיה

- בדיקות מולקולרית לאבחון פרבו

HIV -1. בדיקות לנגיף ה HIV 1/2 -1.1 בדיקות סרולוגיות לאימות להדבקה ב

בשנה זו התקבלו 955 דגימות לאימות ובוצעו 923 בדיקות. טבלה מס' 1 מסכמת את התפלגות תוצאות 923 בדיקת האימות של

הדבקה ב- HIV לפי מעבדות שולחות.

טבלה מס' 1: תוצאת בדיקות אימות לפי מרכז שולח )נכללות בדיקות חוזרות

לאותו נבדק(

סה"כ מעבדה שולחתבדיקות

חיובי%

מסופק%

שלילי %

13686%1%13%איכילוב

3476%3%21%בלינסון

2793%0%7%הדסה ירושלים

1292%0%8%העמק עפולה

4351%10%88%מד”א

5786%2%12%מכבי

2986%0%14%סורוקה

5992%2%7%קפלן

3697%0%3%רמב”ם

1926%26%47%רשות הפלסטינאית

7486%1%12%שיבא

560%0%40%אחר

גיל מין, לפי 2016 ב שנתגלו הבוגרים הנשאים מספר תאור וקבוצות סיכון של הנשאים:

בשנת 2016 התגלו 389 נשאים חדשים, 12 מתוכם )3%( היו תיירי מרפא. תרשים מס' 1 מתאר את התפלגות כל הנשאים הבוגרים לפי גיל ומין 69% )267/389( מהנשאים שנתגלו השנה היו גברים

ו37% מתוכם התגלו מתחת לגיל 34.

טבלה מס' 2 מתארת את התפלגות הנשאים לפי קבוצות סיכון ולפי מין. 32% מהנשאים שייכים לקבוצת הסיכון MSM. קבוצת הסיכון הכוללת )ׂOGE-F( הזרים היא קבוצת הסיכון של בגודלה השנייה 25% מהנשאים שנתגלו וקבוצת הסיכון השלישית בגודלה היא של

ההטרוסקסואלים - 17% מהנשאים.

HIV מרכז ארצי לאימות בדיקותB19 ולבדיקות הפטיטיס נגיפית ופרבו

מנהלת המרכז: ד"ר ארנה מור

צוות המרכז: ד"ר יעל גוזלן, ד"ר אפרת בוכריס, מגר' אביה רקובסקי, מגר' רחל שירזי, גב' מרינה ווקס, גב' זהבה יוספי, ד"ר דניאלה רם

Page 20: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 19

השוואת ממצאי השנים 2011-2016בשש העיקריות הסיכון לקבוצות הנשאים התפלגות השוואת הירידה את מדגישה להלן( ,2 מס' )תרשים האחרונות השנים במספר הנשאים ברוב קבוצות הסיכון )MSM, יוצאי ארצות אנדמיות זרים OGE-F ובעיקר ישראלים OGE-IL(. העליה במספר הנשאים

בקבוצת הסיכון HETERO גם היא נבלמה.

טבלה מס' 2:תאור הנשאים הבוגרים שנתגלו לפי קבוצת סיכון ומין

מיןקבוצת סיכון

סה״כHETEROOGE-ILMSMOGE-Fתיירותתורמי דםנרקומנים

לא ידועמרפא

301112453257512268זכר

40201432276121נקבה

11 לא ידוע

7031126962791217389סה״כ

מקרא:גברים המקיימים יחסי מין עם גברים : MSM

יוצאי ארצות אנדמיות שאינם אזרחי ישראל : OGE-F יוצאי ארצות אנדמיות שהינם אזרחי ישראל )עולים מאתיופיה וישראלים שנדבקו בארצות אנדמיות ל-HIV שאינן ברה"מ לשעבר( : OGE-IL

מזריקי סמים )כולל גם מספר קטן של אסירים ועובדות-מין : IDU נשאים המקיימים יחסי מין הטרוסקסואליים : HETERO

0

20

40

60

80

100

15-24 25-34 35-44 45-54 55-64 >65 ageunknown

# of

new

infe

ctio

ns

age

male

020406080

100120140160180

MSM OGE-F OGE-IL IDU Hetero Unknown

#of

indi

vidu

als

Risk groups

2011 2012 2013 2014 2015 2016

תרשים מס' 2:התפלגות נשאים בוגרים שאובחנו בשנים 2011 - 2016 לפי קבוצות סיכון

תרשים מס' 1:תאור מספר הנשאים הבוגרים שנתגלו השנה לפי מין וגיל.

Page 21: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

20 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

HIV -לזיהוי הדבקה ב QUAL ובדיקות PCR בדיקות 1.2להדבקה בחשד PCR בדיקות 185 בוצעו 2016 בשנת ב- HIV, רובן )n=176( מילדים החשודים בהדבקה מהורה חיובי. כך התגלה ילד חיובי שנולד ב- 2016 ונדבק מאימו. של QUAL HIV XPERT בדיקות השנה הכנסנו בנוסף לאיבחון השיטה יעילות את לבדוק במטרה ספייד חברת

הדבקה ראשונית.נמצא ששימוש ב-QUAL נתן תשובה סופית מיידית ל- 41 הבדיקה הסרולוגית מנבדקים שתשובת )10.5%( דגימות או שלילית היתה שלהם ביורד( מתוצרת גיניוס )בערכת מסופקת ונדרשה בדיקה חוזרת כדי להגיע למסקנה סופית )12( 29% אלה, מקרים 41 מתוך ההדבקה. מצב לגבי HIV. אלה נשאים שנמצאים בשלב אכן נמצאו חיוביים ל- והחשש גבוהה בגופם הנגיף שכמות הסרולוגי, ההיפוך

להדבקה הינו עצום. כבדיקה QUAL ה בדיקת את להכניס ממליצים אנו הסירולוגית בדיקה שתשובת דגימה לכל שגרתית

בערכת הגיניוס שלה שלילית או מסופקת.

HIV-1 1.3 בדיקות עומס נגיפי לנשאי2043 בדיקות לעומס נגיפי בוצעו השנה. ברוב המקרים )80%( ערך נמוך מ- 40 עותקים למ"ל, ערך המעיד על הצלחת העומס הנגיפי טיפול תרופתי. ב- 6.9% מהבדיקות נמצא עומס נגיפי גבוה מ-10000 עותקים למ"ל. 1856 מהדגימות נלקחו מנשאים המטופלים בתרופות נמצאו )1620/1856( הדגימות, 87% רוב מתוכן, רטרוורליות. אנטי

כבעלות עומס נגיפי קטן מ-40 עותקים למ"ל.

1.4 ריצוף נגיפי ה HIV-1 לצורך קביעת עמידות או התאמה לטיפולים תרופתיים

פרוטאז ורברס טרנסקריפטז בשנת 2016 התקבלו 242 בדיקות עמידות לרברס טרנסקריפטז נמוך נגיפי נמצאו בעלות עומס כי בוצעו לא ולפרוטאז מתוכן 31 115 .197 ל- סופית תשובה נמסרה הבדיקה. לביצוע מהנדרש )58%( בדיקות היו של נבדקים נאיביים לפני טיפול תרופתי ו- 83 לנשאים מטופלים. מבין 90 הנשאים שנדבקו השנה נמצאו 31% B ורק 10% )9( נדבקו A, 47% )42( בזן )28( שנדבקו בנגיף מזן בזן C. שאר הנשאים )12%, שהם 11 נשאים( שנדבקו בזנים אחרים.

בנאיביים תרופתי לטפול עמידות המקנות מוטציות של באנליזה 11.1% כי נמצא )Bennet et al, 2009 לפי אנליזה ,TDRM(בדיקת ושנבדקו השנה שהתגלו הנשאים 90 - מ נשאים( 10(עמידות, נדבקו בנגיף עמיד. עמידות נמצאה לתרופות כנגד רברס בפרוטאז. בנאיביים עמידות מוטציות נמצאו לא טרנסקריפטז. נאיביים בחולים העמידות מוטציות את מתאר 6 מס' תרשים כנגד היו שנתגלו העמידות מוטציות שכל ניכר השנה. שנתגלו

תרופות מסוג נונ-נוקלאוזידים.

בדיקת עמידות באינטגרז ל 23% מתוכם דגימות מתוכן 22 מנבדקים מטופלים. נבדקו 30 ,)1( Int-E92Q כדלהלן: באינטגרז עמידות מוטציות נמצאו ,)2( Int-Q148R ,)1( Int-S147G ,)1( Int-G140A ,)2( Int-E138A/k

נאיביים. בחולים באינטגרז עמידויות נמצאו לא .)2( Int-R263K ו

בדיקות טרופיזם השנה נשלחו רק 2 דגימות לבדיקת טרופיזם לפיהן החולים נמצאו מתאימים למרבירוק. כמות הבדיקות מעידה על ירידה משמעותית

בשימוש בתרופה בישראל.

תרשים מס' 3:)TDRMׂ( מוטציות עמידות בחולים נאיביים

0123456

K101E K103NS V106AV/I E138A/Q G190A

NNRTI

# of

TDR

M

TDRM

Page 22: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 21

3. בדיקות לנגיף פרבו3.1 סרולוגיה

קיום לבדוק במטרה סרולוגית לבדיקה דם דגימות 907 התקבלו נוגדנים מסוג IgM ו-IgG כנגד הנגיף מתוכן בוצעו בדיקות ל-876 נשים של 72% מתוכן מנשים, )71%( הבדיקות רוב דגימות. 40%( שיבא החולים מבית התקבלו הבדיקות רוב .20-45 בגיל

מהבדיקות(. 26% מהבדיקות התקבלו מילדים מתחת לגיל 20.

טבלה מס' 4 מסכמת את התוצאות שהתקבלו בבדיקות שבוצעו.

טבלה מס' 4:סיכום תוצאות הבדיקות הסרולוגיות

סה״כ בדיקותסה״כ חיוביים )%(סוג הנוגדניםIgG 576 )66%(876IgM 128 )15%(876

3.2 בדיקות מולקולריות לאבחון פרבונבדקו מתוכן מולקולריות, לבדיקות דגימות 290 התקבלו השנה

282. טבלה מס' 5 מסכמת את הממצאים.

טבלה מס' 5: תוצאות הבדיקות המולקולריות לאבחון הדבקה בפרבו לפי חומר הדגימה

מס׳חומר הדגימה% סה״כהחיוביים

החיוביים7487.5%מח עצם3619618%דם מלא

21811%ביופסית שריר הלב/ נוזל מהלב3475%דם טבורי2450%מי שפיר22100%דם עוברי

csf(11010%(אחר5328219%סה״כ

נגיף הפטיטיס

מספר דגימות גנוטיפממצאים ייחודיים לנגיף/ הערותשנתקבלו

HAV3.2017 -הדגימות הגיעו בסוף השנה, בוצעו וידווחו ב

HBV*18.בדגימה אחת נמצאה עמידות לתרופותD1-3D2-1D3-1

HCV*158

.baseline -66 דגימות נשמרו כ75 הגיעו לבדיקת גנוטיפ.

17 דגימות הגיעו לבדיקת עמידות )שגם להן נקבע גנוטיפ(. מוטציות עמידות שנמצאו הינם:

NS3- Q80K ,D168VNS5A- L31M ,Y93H

1a-91b-60

1d-32-2

3a-114m-2

HDV2629 דגימות נוספות שהגיעו בשנים קודמות או דגימות שנשלחו

לבדיקת הפטיטיס B נבדקו גם הן.מתוך סה”כ 55 דגימות 46 דגימות נמצאו חיוביות.

1

HEV31

3 דגימות נמצאו חיוביות.בנוסף נבדקו:

204 דגימות ביוב, מתוכן אחת חיובית.84 דגימות דם מחזירים, מתוכן 2 חיוביות.

28 דגימות צואה מחזירים, מתוכן 2 חיוביות.2 דגימות מביובי חזירייה, שתיהן חיוביות.

בני אדם-1חזירים-3

* הפער בין מספר הדגימות שהתקבלו למספר הדגימות עם תוצאות נובע מעומס נגיפי נמוך שלא אפשר ריצוף או קביעת גנוטיפ.

2. בדיקות לנגיפי הפטיטיסטבלה מס' 3 מסכמת את הפעילות שנעשתה במעבדה במהלך 2016. נכללים כל סוגי הנגיפים ועיקר התוצאות שנתקבלו.

טבלה מס' 3:סיכום תוצאות של נגיפי ההפטיטיס

פעילויות נוספות של המרכז הארצי במהלך 2016בדיקות איכות חיצוניות

המרכז עמד בהצלחה בבדיקות חיצוניות שכללו:בדיקה של RCPA לזיהוי של PARVO בשיטה סרולוגית. 12 . HIV לאימות הדבקה ב LABQUALITY בדיקה של

מחקר עבור גוזלן יעל ולדר' מור ארנה לדר' צעיר חוקר מלגת ופיתוח בתחום חקר הכבד. המלגה הועקה ע"י החברה הישראלית

לחקר הכבד, יוני 2016.

Page 23: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

22 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז:אבחון מחלות הנגרמות ע"י נגיפי דרכי הנשימה.. 1מרכז לאומי לשפעת.. 2מחקר ופיתוח.. 3

1. אבחון מחלות הנגרמות ע"י נגיפי דרכי הנשימהמאושפזים בחולים הנשימה מדרכי נגיפים וזיהוי בידוד חולים מבתי שמקורן קליניות, דגימות מתקבלות במרכז הנגיפים הנשימה. בדרכי וירליות מחלות לאבחון ומיועדות הנבדקים במרכז כוללים את: A( Influenza ו- B( כולל את שפעת Parainfluenza 3 ,RSV ,Adeno ,(A(H1N1)pdm09( הפנדמית

.Human Metapneumovirus (hMPV( -ו

אבחון קליני ראשוני מתבצע בשיטת Real Time PCR )ע"י יחידת )Sequence( של נגיפי נשימה משמשות טקמן(. בדיקות רצף ,Adeno נגיף זני נגיפים שונים כגון אבחון תת סוגים של לזיהוי בנית עצים פילוגנטיים ואפיון התאמה של זני השפעת העונתי לזני החיסון. כמו כן מתבצע במרכז אבחון זני נגיף שונים גם בשיטות בשיטות נוגדנים ספציפיים לשפעת, רמת סרולוגיות לקביעת

.Neutralization -ו hemagglutination inhibition

נוספים נגיפים גם נגיפי נשימה נבדקים במרכז במקרים מיוחדים הכוללים את נגיפי ה-קורונה:

)Middle East Respiratory Syndrome (MERS וקורונות עונתיות

כגון: שפעת עופות נגיפי שפעת ,(NL63, HKU1, OC43, E229(

ה- נגיף ,H7N9 מסין עופות שפעת ,H5N8-ו H5N1 עופות Boca, נגיף Rhino ועוד.

נגיפי השפעת עונתית כאשר בד"כ היא נשימה בנגיפי התחלואה ו-RSV פעילים בעיקר בחורף בחודשים נובמבר עד פברואר )ראה טבלה מס' 1 ותמונה מס' 1(, נגיף ה-hMPV פעיל בעיקר בחודשים מרץ עד מאי. הנגיפים Adeno וה- Parainfluenza-3 פעילים בכל

עונות השנה.

במהלך שנת 2016 התקבלו 7,262 דגימות של חולים מאושפזים. נשימה. נגיפי לאבחון מולקולאריות בדיקות 39,874 מעל בוצעו ב-2,235 מהחולים המאושפזים )30.77%( זוהה לפחות נגיף אחד

של דרכי הנשימה.

המרכז הלאומי לשפעתונגיפי דרכי הנשימה

מנהלת המרכז: ד"ר מיכל מנדלבוים

צוות המרכז: מגר' ליאורה רגב, גב' הילדה שהרבני

אחראית ניטור תחלואת שפעת בקהילה: ד"ר רקפת פנדו

סטודנטים לדוקטורט: מגר' ירון דרורי ומגר' נחמיה פרידמן

סטודנטית לתואר שני: גב' סיון שרעבי

סטודנטים לרפואה המבצעים עבודת גמר: יניב גויכמן וגל יקותיאל

מתנדב: מר יוסף סלובודקין

טבלה מס' 1:התפלגות דגימות חיוביות לנגיפים שונים לפי עונות השנה.

סכום כוללאוק׳-דצמ׳יולי-ספט׳אפריל-יוניינואר-מרץנגיף נבדק/תקופהFlu A1436267290Flu B260452271

H1N1-S4151232432RSV166202205393

Adeno1574646139388hMPV13439614193

Parainfluenza-31014828912681247172967202235סה”כ

Page 24: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 23

RSV 1.1 נגיףנגיף ה-Respiratory Syncytial Virus( RSV) שייך למשפחת נדבקים הילדים מרבית למעשה .Paramyxoviridea ה- בווירוס ה-RSV במהלך שנות חייהם הראשונות, אך לרוב ושיעול בנזלת המלווה קלה בצורה המחלה מתבטאת וחולפת לאחר 5-7 ימים. במעט מהמקרים מתבטא הזיהום לתחלואה הגורמת יותר קשה במחלה RSV-ה בווירוס )ולא שכיחים( להגיע אף ריאתית העלולה במקרים קשים מופיעה המחלה בהם הגילאים נשימתית. לאי-ספיקה בצורתה הקשה יותר, עד כדי אשפוז הם עד שישה חודשים

וחומרת המחלה דועכת בהתאמה עם עליית הגיל. להגיע שמקדים הנגיף הוא RSV החורף בעונות בד"כ להופיע מתחיל הוא הנשימה, דרכי של לתחלואה ולגרום השפעת זני מגיעים ינואר סוף לקראת ורק בדצמבר כבר

.RSV כאשר כבר יש ירידה בתחלואה שלמתוך 6,377 חולים מאושפזים שנבדקו ל-RSV זוהה נגיף

RSV ב-393 )6.16%(.

Adeno 1.2 נגיפי DNA והוא נגיף Adenoviridae שייך למשפחת Adeno נגיףלנגיפי הנשימה. רוטיני במרכז הארצי היחיד הנבדק באופן הגורמים זנים 50 מעל מכילה Adeno-ה נגיפי משפחת נגדו הגנה יוצרת אחד זן של הדבקה אדם, בבני למחלה

בלבד, ולא נגד זנים אחרים. 388 ,2016 בשנת לאדנו שנבדקו דגימות 7,164 מתוך

דגימות היו חיוביות )5.4%(.

Parainfluenza 1.3 נגיפי .Paramyxoviridae שייך למשפחת Parainfluenza-נגיף הו-4(, 3,2,1( Parainfluenza של סוגים ארבעה ישנם Parainfluenza-3 הוא הפתוגני ביותר. הנגיף חודר לעומק דרכי הנשימה, בעיקר בתינוקות, בחולים אימונוסופרסיבים ש- ידוע ולברונכיט. ריאות לדלקות לגרום ויכול ובזקנים

Parainfluenza 3 פעיל כל השנה )ראה תמונה מס' 1(.מתוך 6,977 דגימות שנבדקו ל-Parainfluenza 3 ב-268

)3.8%( זוהה הנגיף.

hMPV 1.4 נגיףלמשפחת שייך Human Metapneumovirus

דרכי את התוקף RNA נגיף זהו ,Paramyxoviridae-ההנשימה העליונות ויכול לעבור בהדרגה לסמפונות ולריאות.

סה"כ בבדיקות שהתבצעו במהלך שנת 2016 לזיהוי הנגיף hMPV-ל חיוביים נמצאו 193 מאושפזים. חולים 6,980

שהם סה"כ 2.8% מהמקרים.

1.5 Influenza – שפעת ה- למשפחת השייך RNA נגיף הוא שפעת גבוה, בחום מתבטאת המחלה .Orthomyxoviridae

צמרמורת, כאבי ראש, כאבי שרירים, חולשה, חוסר תיאבון באף גודש לוע, כאב יבש, שיעול של נשימתיות ובעיות דגירה תקופת לאחר מופיעים אלה סימפטומים ונזלת.

קצרה יחסית של יום - יומיים מן ההדבקה.

תמונה מס' 1:תחלואה בנגיפי נשימה שנת 2016

Page 25: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

24 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

לשפעת, מאושפזים חולים 6,401 נבדקו 2016 בשנת חיוביים היו 271 .Flu A -ל חיוביים היו חולים 271 מהם לשפעת חיוביים מאושפזים B ו-430 מסוג למשפעת H1N1pdm. תחלואה עונתית של שפעת )חורף הפנדמית 2016-17( ניתן לראות בפרק מרכז לאומי לשפעת )סעיף 2(.

MERS – Beta Coronaתחלואה של ראשון מקרה בקטאר התגלה 2012 במרץ בנגיף קורונה חדש, שכונה בשם Beta Corona וכיום שמו .Middle East Respiratory Syndrome )MERS( בעולם העולמי הבריאות וארגון תמותה לכ-30% גורם הנגיף פרסם התראה עולמית והוציא חוזרי עבודה ושיטות לזיהוי

הנגיף החדש לכל העולם.

ה- למשפחת השייכים RNA נגיפי הם הקורונה, נגיפי RNA לנגיף במיוחד גדול גנום ובעלי Coronavirinae

)כ-26-32kb(. השם "קורונה" מתייחסת למראה האופייני של הוירויון תחת מיקרוסקופ אלקטרוני )EM( הנראה כתר

או הילה )קורונה בלטינית(.

בני להדביק גם כמסוגלים הידועים הנפוצים הקורונה זני אדם הם: HKU1 ,NL63 ,229E ו-OC43 הגורמים למחלה נשימתית באדם קלה למדי, ודומה להצטננות פשוטה אך בבני ריאות דלקת עם לפעמים גם נקשרים קורונה נגיפי

אדם, במיוחד אלה עם מערכת חיסונית מוחלשת.

מכל מאושפזים חולים 10 בישראל נבדקו 2016 בשנת נמצאו החולים כל עמון. ברבת מביקור שהגיעו הארץ

.MERS-שליליים לנגיף ה

מרכז לאומי לשפעת .2החורף, בעונת בישראל, השפעת בנגיפי התחלואה אחר מעקב המרכז עם פעולה בשיתוף ארצי, שפעת סקר במסגרת מתבצע הלאומי לבקרת מחלות. הסקר כולל מעל ל-20 מרפאות בפריסה דגימות בשבוע פעם שולחות המרפאות שפעת. לניטור ארצית נבדקות הדגימות ובמעבדה שפעת דמוית מחלה עם חולים של לנוכחות של נגיפי שפעת ו-RSV. המרכז הלאומי לבקרת מחלות בשפעת התחלואה התקדמות את המעדכן שבועי דוח מוציא חורף בעונת RSV-ו בשפעת התחלואה סיכום את בישראל.

2016-17 ניתן לראות בטבלה מס' 2.

טבלה מס' 2:תחלואה של שפעת באוכלוסייה בעונת חורף 2016-17

1,284מס׳ דגימות שהתקבלו

)36.5%( 469מס׳ דגימות חיוביות לשפעת

)97.9%( 459שפעת מסוג A – סה"כA)H1N1(pdm091 )0.2%(

H3N1/A458 )99.8%(

B 2.1%( 10שפעת מסוג(

RSV-10.9%( 140מס' דגימות חיוביות ל(

באוכלוסייה הדומיננטי הזן 2016-17 חורף שבעונת לראות ניתן לשנת הקודמת חורף לעונת בניגוד A(H3N2( מסוג שפעת היו 2015-16 שהיו מקרים בודדים בלבד של שפעת )A(H3N2 והזנים A(H1N1)pdm09 ושפעת ,56.4% B שפעת היו הדומיננטיים

42.8% )ראה תמונה מס' 2(.

תמונה מס' 2:דגימות חיוביות לשפעת מכלל הדגימות שנאספו ע"י רשת הניטור, בשיתוף פעולה עם המרכז הלאומי לבקרת מחלות 2016/2017

Page 26: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 25

ניתן לראות ששיא התחלואה של השפעת בעונת חורף 2016-17, התחיל מוקדם וכבר בחודש נובמבר אובחנו חולים חיוביים לשפעת.

התחלואה המשיכה עד חודש מרץ )ראה תמונה מס' 2(.

התאמה לזן החיסוןבישראל הדומיננטי השפעת זן 2016-17 החורף בעונת החיסון לזן בינונית התאמה שהראה A/H3N2 היה

.3C2a השייך לענף A/Hong Kong/4801/2014

3. מחקר ופיתוחהרוטינית לעבודה בנוסף נשימה ונגיפי לשפעת הלאומי במרכז

עסקנו במספר פרויקטים מחקריים בשנת 2016, לדוגמא:בישראל, . 1 B שפעת בנגיף הדבקה של אפידמיולוגי אפיון

חלק והתחלואה, החשיפה ומאפייני היקף בין השוואה הנוכחי המחקר שרעבי. סיון של המסטר מעבודת החשיפה היקף בין הקשר מהות של בהבנה יסייע Yamagata B שפעת של בשושלות והתחלואה

ו- Victoria ותוצאותיו יכולות להוביל לקביעת מדיניות בחיסון העונתי.

2 . Rhino-ה נגיף בין והקשר Rhino-ה בנגיף תחלואה ואסתמה, עבודת הגמר של הסטודנט לרפואה גל יקותיאל. בגיל ברינו בין התחלואה מטרת המחקר להבין את הקשר זה מחקר הילדות. בגיל אסתמה של להתפתחות הינקות אשפוז לאחר שנים 3 המבוצע טלפוני שאלון על מבוסס

בעקבות נגיף הרינו בבית חולים שיבא.הגמר . 3 עבודת לתחלואה, האדנו נגיף רמת בין הקשר

בין הקשר את מראה גויכמן, יניב לרפואה הסטודנט של בשיבא מאושפזים חולים של התחלואה של סימפטומים

לרמת הנגיף המחושבת.

Page 27: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

26 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז: בדיקות קליניות סרולוגיות לחצבת, חזרת ואדמת.. 1 אבחון קליני מולקולרי של חצבת, חזרת ואדמת. . 2 אפיון גנוטיפי של חצבת, חזרת ואדמת לצרכים . 3

אפידמיולוגיים וחקר התפרצויות.4 ..)JCV, BKV( אבחון קליני מולקולרי של נגיפי פוליומה בקרת איכות.. 5 מחקר ופיתוח )מו"פ(.. 6

מבואניתוח הממצאים בשטחי מדינת ישראל מוצגים בטבלה מס' 1 ומראים:המרכז הארצי הינו מעבדת ייחוס ארצית המבצעת בדיקות אבחון לחצבת, חזרת, אדמת, BKV ו- JCV ואימות של מקרים קליניים החשודים למחלות חצבת, חזרת ואדמת. בנוסף לכך, המרכז הארצי מבצע אפיון מולקולרי של הנגיפים הללו לצרכים אפידמיולוגיים וחקר ההתפרצויות. המרכז הארצי מוכר על ידי ארגון בריאות עולמי )אב"ע( כמרכז לאומי לחצבת ואדמת ועובר מגוון מבחני בקרת איכות שנתיים

של הארגון לשימור ההכרה )אקרדיטציה(.

בדיקות קליניות סרולוגיות. 1ביצוע בדיקות סרולוגיות נעשה לצורכי בירור סטטוס חיסוני או אבחון מקרה קליני. לבירור סטטוס חיסוני נשלחות דגימות IgG. הבדיקות מבוצעות בשיטת נסיוב לבדיקה של נוגדני )Enzyme Linked Fluorescent Assay (ELFA בערכת בדיקה

.Vidas המותאמת למכשיר bioMerieux של חברתלאבחון ואימות מקרים קליניים החשודים להדבקה בנגיף חצבת, חזרת או אדמת, מבצעים בדיקה של נוגדני IgM במקביל לבדיקה של .Enzyme Linked Fluorescent Assay (ELFA( בשיטת IgG נוגדני

בטבלה מס' 1 מוצג סיכום שנתי של בדיקות סרולוגיות, שבוצעו במרכז הארצי.

במהלך השנה נבדקו במרכז ארצי 1556 דגימות סרולוגיות.חלק מהדגימות נשלחו לצורכי בירור סטטוס חיסוני וחלק מהדגימות שנבדק גם לנוגדני IgM, נשלחו לאימות מקרים קליניים של חצבת IgM וחזרת. מרבית הדגימות שנתקבלו לאימות נוגדני אדמת

)כ-90%( הן של נשים הרות או של נשים בגיל פוריות ולא נשלחו בגלל חשד להדבקה בנגיף. בדיקה של נוגדני IgM במקרים בהם אין חשד להדבקה נעשית בניגוד להמלצות משרד הבריאות, הקובעות שלצורך קביעת סטטוס חיסוני של אדמת יש לבצע בדיקה של נוגדני IgG בלבד. רק 43 מתוך 522 דגימות, שנשלחו לבדיקה של נוגדני אדמת IgM, היו ממקרים חשודים להדבקה. למרות שכמעט 50% מהדגימות שנבדקו לנוגדני אדמת IgM יצאו חיוביות או גבוליות, במהלך 2016 אובחן מעבדתית רק מקרה אחד של אדמת. הסיבה לכך היא שהתוצאות החיוביות בנוגדני אדמת IgM נובעות מעליה פוליקלונלית בנוגדנים ולא מהמחלה. במהלך השנה נעשה מבחן אבידיטי ל 4 דגימות. בכל הדגימות אחוז אבידיטי היה גבוה מ 60%. כלומר בכל המקרים היה מדובר

בהדבקות ישנות או בחיסוני עבר.

המרכז הלאומי לחצבת,חזרת, אדמת ונגיפי הפוליומה

מנהלת המרכז: ד"ר ויקי אינדנבאום

צוות המרכז: מגר׳ טל לוין, גב׳ תמר פרנק

טבלה מס' 1:תוצאות סרולוגיות של בדיקות נסיוב שנשלחו למרכז ארצי במהלך 2016.

IgM IgG

סה"כ שלילי גבולי חיובי סה"כ שלילי גבולי חיובי מספרבדיקות חצבת

162 134 19 9 383 63 22 298

סה"כ שלילי גבולי חיובי סה"כ שלילי גבולי חיובי מספרבדיקות חזרת

318 207 58 53 456 85 21 350

סה"כ שלילי גבולי חיובי סה"כ <15IU/ml 15-30IU/ml ≥31IU/ml מספרבדיקות אדמת

522 283 92 147 717 65 94 558

Page 28: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 27

אבחון מולקולרי. 2אבחון סרולוגי של אדמת, חצבת וחזרת בעייתי באוכלוסייה .2.1מחוסנת, משום שעשויות להתקבל תוצאות שגויות הנובעות מעודף או חוסר רגישות של שיטות הבדיקה. Real time אבחון מולקולרי של מחלות אלו בשיטה שלPCR הוא מהיר ורגיש ויכול לתת אבחון של מקרה החשוד

להדבקה תוך 48 שעות מקבלת הדגימה. במהלך 2016 הגיעו למרכז הארצי 267 דגימות לבדיקה מולקולרית של חצבת, חזרת או אדמת )ראה טבלה מס' 2(, מתוכן 203 היו לחצבת. מספר דגימות יחסית גבוה, בהשוואה לשנים הקודמות, דבר הנובע מההתפרצות של חצבת שהייתה בין ינואר ליולי. בעקבות ההתפרצות, המודעות של הרופאים למחלה ולשליחת הדגימות לאבחון מולקולרי עלתה, וגרמה לעליה משמעותית בכמות הבדיקות.

טבלה מס' 2:סיכום מספר הדגימות שנשלחו למרכז הארצי ב - 2016, לאבחון

מולקולרי של חצבת, חזרת ואדמת, לפי תוצאותיהן.

נוזל פריקרדיאלי, נוזל מהעין, * דגימות נדירות כמו: מי שפיר, )Bronchoalveolar lavage (BAL, משטח מפצע.

מקרי מחלה של חצבת, חזרת ואדמת שאובחנו . 3מעבדתית ב 2016.

כל התוצאות החיוביות מולקולריות או סרולוגיות שהתקבלו למקרים חשודים, בשיתוף עם לשכות הבריאות, עברו חקירה אפידמיולוגית ומקרי מחלה של חצבת, חזרת ואדמת דווחו לאגף לאפידמיולוגיה ולאב"ע. המקרים המאובחנים של 2016 מסוכמים בטבלה מס' 3.

טבלה מס' 3:מקרים חיוביים של חצבת, חזרת ואדמת, שאובחנו מעבדתית

בישראל ב- 2016.

אפיון גנוטיפי של חצבת, חזרת ואדמת לצרכים . 4אפידמיולוגיים וחקר התפרצויות

בהתאם לדרישות אב"ע ומשרד הבריאות כל מקרה חיובי לחצבת חזרת או אדמת צריך לעבור חקירה אפידמיולוגית. אפיון וזיהוי של הגנוטיפ חשוב לחקירות אפידמיולוגיות, במיוחד במצבים בהם לא ניתן לקשור את המקרים החדשים למקרים מאובחנים קיימים.

אפיון גנוטיפי של דגימות רוק חיוביות לחזרת: בשנת 2016 אובחנו מעבדתית 11 מקרים של חזרת, 5 מהם אובחנו בשיטות מולקולריות )ראה טבלה מס' 2 ו- 3(. ריצוף של 2 מתוך ה 5 הראה שמדובר בזן G הנפוץ בישראל בשנים האחרונות. רוב

סוג דגימהאדמתחזרתחצבת

שליליחיובישליליחיובישליליחיובי

62612114שתן

538משטח אף גרון

532רוק

1563נוזל עמוד שדרה

2נסיוב

129*אחר

556035סה”כ

אדמתחזרתחצבתשיטת אבחון

17סרולוגית

33מולקולרית

321סרולוגית + מולקולרית

7111סה”כ מקרים

תרשים מס' 1:מקרי חצבת שזוהו בישראל ב - 2016.

Page 29: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

28 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

המקרים שאובחנו כחיוביים הם ממזרח ירושלים ומחברון. לחצבת: חיוביות שתן דגימות של גנוטיפי אפיון .4.1

בשנת 2016 זוהו 8 מקרים של מחלת חצבת, המתוארים בתרשים מס' 1. שבעה מהמקרים אובחנו מעבדתית. ששה מקרים אובחנו בשיטות מולקולריות ובוצע להם D8 שזוהה בכל הדגימות נפוץ במזרח ריצוף. גנוטיפ אסיה ואירופה. מקרה מספר Case1_2016( 1) יובא מהודו בחודש פברואר. מקור הדבקה של מקרה מספר Case2_2016( 2) לא ידוע ומכיוון שאובחן סרולוגית 3 ניתן לאפיין את הגנוטיפ. מקרה מספר היה לא )Case3_2016) הובא מתאילנד באוגוסט שנה שעברה וגרם לשרשרת הדבקה. רוב המגעים של מקרה מספר 3

)Case 4,6,7,8_2016) היו בתוך המשפחה.

אפיון גנוטיפי של מקרה אדמת: למרות שבישראל .4.2אין כמעט מקרי אדמת בשנים האחרונות, במזרח אירופה הנגיף ממשיך לגרום להתפרצויות. בסוף 2016 זוהה מקרה מיובא מצ'כיה. החשוד אפריל לא היה מחוסן ופיתח סימנים קליניים האופייניים למחלה. דגימות נסיוב ושתן נלקחו והוכח שמדובר בהדבקה ראשונית באדמת. בהמשך ריצוף הנגיף 2B הנפוץ במזרח אירופה. הראה שמדובר בגנוטיפ

5 .BKV -ו JCV אבחון קליני מולקולרי של נגיפי פוליומהDNA שמבססים הדבקה לטנטית נגיפי פוליומה הם נגיפי ברקמות הומניות. נגיפים אלה עלולים לעבור רה אקטיבציה בעיקר אצל מושתלים ומדוכאי חיסון. נגיף BKV מבסס הדבקה לטנטית בעיקר בכליות ורה אקטיבציה שלו עלולה להוביל

ל-BKV associated nephropathy, שבעקבותיה עשויה להתחולל דחיה של השתל. רה אקטיבציה של נגיף JCV, בחולים עם מערכת חיסון מדוכאת, עלולה להוביל לבעיות נוירולוגיות ולהתפתחות מחלת.Progressive Multifocal Leucoencephalopathy (PML( מלא ובדם בשתן BKV נגיף לזיהוי מולקולריות בדיקות עצם ומח כליה להשתלת מועמדים לחולים נעשות בנוזל JCV נגיף של אבחון ההשתלה. לאחר וכמעקב כמו: קשות נוירולוגיות מחלות באבחון לעזור יכול שדרה

JCV מזוהה גם בדגימות ביופסיה של המח. PML. כמו כן, :BKV במהלך השנה נעשו 2 שינויים מהותיים בבדיקות של נגיף BKV נגיף לנוכחות הבדיקות 14.06.16 מתאריך א. ולא בפלסמה. השינוי נעשה לאחר נעשות בדם מלא לפלסמה מלא דם בין ההשוואה תוצאות סיכום שעשה ב 2015 פרופ׳ לסטר שולמן. תוצאות ההשוואה מלא בדם BKV בכמות משמעותי הבדל שאין הראו ולכן אין צורך להפריד פלסמה מדם מלא. ובפלסמה,

JCV עברו ו- BKV 14.06.16 ההפקות של מתאריך ב. שינוי ,EasyMag למכשיר MagNa Pure ממכשיר שהביא לעליה ברגישות הבדיקה. השינוי נעשה לאחר ביצוע תיקוף והתייעצות עם סגנית מנהלת המעבדה ד"ר דנית סופר, ומנהל יחידת טקמן ד"ר מוסה הינדייה.

טבלה מס' 4:דגימות שהתקבלו במעבדה המרכזית לנגיפים במהלך 2016

.JCV ו BKV לזיהוי

סוג דגימהBKVJCV

שליליחיובישליליחיובי

6779שתן

29211דם מלא

6113נוזל עמוד שדרה

212ביופסיית מוח

386133סה”כ דגימות

בקרת איכות חיצונית. 6RCPA Serology QAP: התוכנית השנתית כוללת: .6.1 IgG, IgM מסוג אדמת של לנוגדנים סבבים 4ומבחן אבידיטי; 2 סבבים לנוגדנים של חצבת מסוג IgM ; ושני סבבים לנוגדנים של חזרת מסוג IgG ו- IgM. המרכז עמד בהצלחה בכל המבחנים. IgG ו-

Page 30: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 29

איכות בקרת בוצעה 2016 בשנת – QCMD .6.2טובות. תוצאות התקבלו .JCV ל- מולקולרית המערכות נמצאו בעלות רגישות וספציפיות גבוהה.

)Proficiency Testing (PT – מבחן בקרת איכות של .6.3אב"ע, המהווה את אחד ממבחני האקרדיטציה השנתיים של המרכז הארצי. אב"ע שולח 20 נסיובים שנבדקים במעבדה לנוכחות נוגדני חצבת ואדמת. התוצאות נשלחות למעבדת ייחוס של אב"ע. באם מתקבל ציון הנמוך מ 90% )=2 טעויות( המעבדה לא מקבלת הכרה שנתית. בשנת 2016 התקבל ציון 100 במבחן PT של אב"ע. המעבדה קיבלה הכרה שנתית כמרכז לאומי לחצבת ואדמת לשנת 2017 לאחר שעברה את כל מבחני ההכרה בהצלחה.

נוסף של אב"ע Re-Testing – מבחן בקרת איכות .6.4שבדומה ל PT מהווה אחד ממבחני ההכרה של המעבדה כמרכז לאומי לחצבת ואדמת. בתחילת 2017 נשלחו לאב"ע כ- 10% מכל הדגימות הסרולוגיות החיוביות, הגבוליות והשליליות שהיו לנו במהלך 2016 לחצבת ואדמת. אב"ע בודק ומוודא את נכונות תוצאות המעבדה.

Molecular PT – משנת 2015 אב"ע שולח גם מבחני בקרת .6.5איכות מולקולריים לזיהוי ואפיון של חצבת ואדמת. גם כאן Real התקבל ציון 100 לאחר שזוהו נכונה הדגימות בשיטתTime PCR ואופיינו נכונה הגנוטיפים של כל הדגימות.

מחקר ופיתוח. 7פרויקט נויטרליזציה של חזרת: הפרויקט החל בסוף .7.12015 והסתיים בתחילת 2017 )ראה פרטים בדוח עם בשיתוף הפרוייקט: על בקצרה .)2015 שנתי המרכז הלאומי לבקרת מחלות נאספו ונבדקו דמים משלוש קבוצות גיל: כשנתיים ממתן המנה השנייה של חיסון MMR, כ- 10 שנים מהמנה השנייה וכ- 20 שנה מהמנה השנייה. בסה"כ נבדקו 297 נסיובים ביכולתם לנטרל נגיף חזרת מזן פראי G5, לעומת יכולת הנסיובים לנטרל נגיף מזן חיסון JL. הפרויקט נמצא בשלב של סיכום התוצאות וניכר שישנו הבדל משמעותי וגדול בין יכולת הנסיובים לנטרל נגיף פראי לעומת נגיף מזן חיסון. ההבדל הולך וגדל ככל שמתרחקים ממועד מתן החיסון.

ריצוף מקרי חצבת מהתפרצות 2015 ובדיקת התאמה .7.2אפידמיולוגיים: נתונים לבין גנומיים שינויים בין בשיתוף עם מעבדת רפרנס של אב"ע בוצע ריצוף בהתפרצות שנאספו ,RNA דגימות ל-22 מורחב חצבת 2015. נבדקו מקטעים השייכים לחלבוני נגיף P ו H. נמצאה התאמה מלאה בין שינויים נקודתיים בנוקלאוטידים של המקטעים שרוצפו, לבין נתונים אפידמיולוגים. כמו כן הריצוף השלים את הנתונים האפידמיולוגיים החסרים ועזר לבנות שרשרת הדבקה של ההתפרצות. המחקר נמצא בשלבי כתיבה מתקדמים.

Page 31: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

30 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז:אבחון קדחת מערב הנילוס )קמ"ה( ומחלות זואונוטיות . 1

אנדמיות לישראל.אבחון מחלות זואונוטיות במטיילים.. 2אבחון מחלת הזיקה במטיילים.. 3ניטור יתושים לזיהוי ואפיון מולקולרי של נגיף קמ"ה.. 4מחקר ופיתוח.. 5

ומחלות )קמ"ה( הנילוס מערב קדחת אבחון .1זואונוטיות אנדמיות לישראל.

עיקר פעילות המרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים התרכזה בשנה זו באבחון תחלואה ב– קמ"ה. המרכז מאבחן חולים לקמ"ה מכל רחבי הארץ, מרכז נתונים אלו עם נתוני חולים הנבדקים בבתי החולים רמב"ם בחיפה ואיכילוב בתל אביב ומעבירם למשרד יחד עם נתוני התחלואה בנוסף המרכז מאגד את הבריאות. נתוני מיקום יתושים הנושאים את הנגיף לדוח משולב המועלה לאתר משרד הבריאות, ומתעדכן במשך עונת פעילות הנגיף.

בשנת 2016, זוהו על ידי סרולוגיה 86 חולים )לעומת 149 חולים בשנה שעברה(, מהם 50 מאובחנים ו- 36 משוערים. מקרים קליניים נמצאו מאזור עכו והגליל בצפון ועד באר שבע וערערה בדרום, סה"כ ב – 54 ישובים שונים. החולים מתגוררים בעיקר באזור גוש

דן והסביבה )26 חולים במחוזות תל אביב, פתח תקווה ורמלה( ואזור חיפה והסביבה )19 חולים במחוזות חיפה ועכו(, אזורים המאופיינים כאנדמיים לנוכחות הנגיף. השנה יש גם ריכוז חולים באזור חדרה )12 חולים(, אשקלון )10 חולים( ועמק יזרעאל )5 חולים(. מעניין לציין כי השנה אובחנו 3 חולים באזור ירושלים, אזור שנחשב כבעל פעילות נמוכה של הנגיף. גרף מס'1 מתאר את פעילות נגיף קמ"ה לפי חודשי השנה. שיא העונה היה בחודשים יולי, אוגוסט וספטמבר עם 15, 23 ו- 27 חולים בהתאמה. מאחר ומספר החולים השנתי והחודשי היה מאוד קרוב לממוצע הרב שנתי שנה זו מוגדרת כשנה ממוצעת. אובחנו כחיוביים סרולוגית שאובחנו חולים ושמונה עשרים RNA של הנגיף בנוזלי הגוף. זיהוי ה – ידי גם מולקולרית על

אבחון נגיפי ארבו אנדמיים נוספים בחולים:ם י נ ח ב ו א מ ה ם י פ ס ו נ ם י י מ ד נ א ם י י ט ו נ ו א ו ז ם י פ י ג נמשפחה מאותה נגיפים ארבעה הינם הארצי במרכז

Sandfly fever Naples virus, Toscana virus, Sandfly fever(המועברים (Cyprus virus, Sandfly fever Sicilian virusיתושים. ידי על המועבר הסינדביס ונגיף החול זבוב ידי על

Sandfly Fever – בדיקות לארבעת נגיפי זבוב החול, שהתגלו לראשונה באיטליה ובקפריסין, Sandfly Fever שנפוצה בכל אזור אגן הים גורמים למחלת ה – התיכון. ברוב המקרים היחשפות לנגיף גורמת למחלת חום, כאבי ראש ושרירים. בשנת 2016 נבדקו על ידי סרולוגיה 78 חולים 3 חולים נמצאו משוערים להדבקה בנגיף. לנגיפי זבוב החול. מבין החולים החיוביים לא זוהו נגיפים על ידי בדיקה מולקולרית, מספר התקבלו החיוביות הדגימות וכל מאחר הנראה ככל מהדם. נעלם כבר והנגיף הסימפטומים הופעת לאחר ימים

בדיקות לסינדביס1952. הוא נגיף הסינדביס התגלה לראשונה במצרים בשנת מועבר על ידי יתושים ונפוץ באזור דרום ומזרח אפריקה, מצרים, ישראל, הפיליפינים, אוסטרליה וצפון אירופה. נגיף זה גורם למחלת הסינדביס, מחלה דמוית שפעת בעלת תסמינים של כאבי מפרקים, הרגשה רעה ופריחה. בשנת 2016 נבדקו על ידי סרולוגיה 16 חולים

לנגיף הסינדביס אולם אף חולה לא אובחן במחלה.

אבחון מחלות זואונוטיות במטיילים .2סעיף זה דן במחלות הנגרמות על ידי נגיפים שאינם אנדמיים לישראל ולכן המרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים מאבחן מחלות

אלו אך ורק במטיילים.

מבין הגורמים למחלות המטיילים נבדקו השנה הנגיפים הבאים:

)Dengue( דנגהמחלת הדנגה נגרמת על ידי נגיף הדנגה ומועברת על ידי יתושים. תסמיניה כוללים חום, פריחה, כאבי ראש, שרירים ומפרקים. מחלת הדנגה נפוצה ביותר מ – 110 מדינות ובין 50 ל– 500 מליון אנשים חולים בה מידי שנה. מחלת הדנגה מאובחנת במרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים על ידי בדיקת רמת נוגדנים כנגד הנגיף בשילוב עם בדיקת רמת החלבון NS1 של הנגיף המופרש מהתאים לדם. המרכז עורך בדיקה מולקולרית וריצוף של נגיף הדנגה ממרבית

המרכז הארצילנגיפים זואונוטיים

מנהל המרכז: ד"ר יניב לוסטיג

צוות המרכז: מגר' שירי כץ – ליקבורניק, מגר' בתיה מנשה, גב' רוית קורן

סטודנטית לתואר שני: גב׳ נטלי אביזוב

Page 32: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 31

הדגימות החיוביות, מה שמאפשר זיהוי של הזן של הנגיף )קיימים 4 זנים(. זיהוי הזן הספציפי של הנגיף חשוב מאחר ואדם שחלה בזן אחד מחוסן כנגד אותו הזן, אולם במידה ויחלה בזן אחר, הוא עלול לפתח מחלה קשה יותר. בשנת 2016 נבדקו בסה"כ 181

חולים, מתוכם אובחנו 36 חולים חיוביים.

)Chikungunya( צ'יקונגוניהנגיף הצ'יקונגוניה שפרושו "זה אשר הולך מכופף" מועבר על ידי יתושים וגורם למחלת חום וכאבי מפרקים שיכולים להמשך חודשים ולפעמים אף שנים מההדבקה. המחלה הייתה נפוצה בעבר בעיקר במדינות מתפתחות באפריקה ובאסיה אולם בשנתיים האחרונות המחלה התפשטה למרכז אמריקה והקאריביים ואף אובחנה לראשונה בדרום ארצות הברית ובברזיל. המחלה מאובחנת על ידי בדיקת רמת נוגדנים כנגד הנגיף ולאחרונה אף על ידי זיהוי חומצות הגרעין של הנגיף בדם. בשנה זו נבדקו 136 חולים ו- 13

חולים אובחנו במחלה.

Tick Borne Encephalitis )TBE(TBE יכולה לגרום לתסמינים נוירולוגיים כגון דלקת מחלת ה – בקרום המוח, דלקת במוח או בשניהם. ב– 10-20% מהמקרים התסמינים הנוירולוגיים נשארים לאורך זמן. המחלה נפוצה בעיקר במרכז ובמזרח אירופה וברוסיה. נגיף ה – TBE הגורם למחלה, מועבר על ידי קרציות ומאובחן על ידי בדיקת רמת נוגדנים כנגד הנגיף. בשנת 2016 נבדקו 15 חולים וחולה אחד אובחן במחלה.

Crimean Congo Hemorrhagic Fever )CCHF(

או דם ידי על או קרציות ידי על מועברת CCHF ה מחלת באנשים קשה הינה המחלה נגועים. חיים בעלי של רקמות ואחוזי התמותה מגיעים לכ – 30% מהחולים. המחלה נפוצה באזור חצי האי קרים, טורקיה, קוסובו, פקיסטן ומרכז אפריקה. CCHF מאובחנת על ידי בדיקת רמת נוגדנים כנגד מחלת ה –

למחלה. שליליים היו שכולם חולים 3 נבדקו השנה הנגיף.

Yellow Fever )YF(מחלת ה– YF מועברת על ידי יתושים ונפוצה באזורים הטרופיים והסב-טרופיים של אפריקה ודרום אמריקה. תסמיני המחלה והקאות. בחילה תיאבון אובדן וגב, ראש כאבי חום, כוללים הנגיף. כנגד נוגדנים רמת בדיקת ידי על מאובחנת המחלה בשנת 2016 נבדקו 8 חולים ומתוכם חולה אחד אובחן במחלה.

Japanese Encephalitis )JE(ידי יתושים ונפוצה בעיקר במזרח JE מועברת על מחלת ה– יפתחו לא החולים של מוחלט רוב אסיה. מזרח ובדרום יפתחו דלקת קרום המוח. 250 חולים 1 מ– תסמינים – רק כנגד נוגדנים רמת בדיקת ידי על במרכז מאובחנת המחלה הנגיף. בשנת 2016 נבדקו 4 חולים שהיו כולם שלילים למחלה.

)Hantavirus( הנטהנגיף ההנטה משתייך למשפחה של נגיפים המועברים ממכרסמים קטנים לבני אדם דרך מגע או שאיפה של אדים של שתן, רוק או צואה שלהם. מספר זנים מהמשפחה יכולים לגרום למחלה קשה ואף למוות בבני אדם ואילו זנים אחרים אינם גורמים למחלה ידועה בבני אדם. המחלה מתחילה בדרך כלל עם סימפטומים דומים לשפעת )חום, כאבי ראש, כאבי שרירים(, ומתקדמת לכשל נשימתי או כשל כלייתי )תלוי בזן הנגיף( ומוות בכ-40% מהמקרים. המחלה מאובחנת במרכז על ידי בדיקת רמת נוגדנים כנגד הנגיף. בשנת

2016 נבדקו 4 חולים שהיו כולם שליליים למחלה.

אבחון מחלת הזיקה במטיילים .3בחודש ספטמבר של שנת 2015 החלה התפרצות של נגיף הזיקה 2015 לדרום ומרכז אמריקה בברזיל שהתפשטה בסוף שנת ובהמשך אף לקאריביים ולדרום מזרח אסיה. מחלת הזיקה היא

טבלה מס' 1:ריכוז תוצאות הבדיקות שהתקבלו לאיבחון נגיפים זואונוטיים.

* כולל חולים שנבדקו בביה"ח רמב"ם ואיכילוב.

מחלות מטייליםמחלות אנדמיות

WNVSFVSINDBISצ׳יקונגוניהזיקהדנגהTBECCHFYFJEHanta

מספר 4069253357242847398531028159בדיקות

מספר חולים 15367816181689136153844שהתקבלו

מספר חולים 3036201310100*86מאובחנים

Page 33: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

32 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

מחלה נגיפית המועברת בעיקר על ידי עקיצות יתושים. המחלה בחום, להתבטא יכולה והיא תסמינים, נטולת או קלה לרוב פריחה, כאבי פרקים, ו/או דלקת של לחמיות העיניים. יחד עם זאת, במקרים נדירים תיתכן הופעה של סיבוכים נוירולוגיים כגון תסמונת גיאן-ברה )Guillain-Barré syndrome). עיקר העיסוק במחלה זו נובע מהחשש כי אישה שנדבקה בנגיף זה במהלך יגרמו היריון עלולה להעביר את הנגיף לעובר, וכתוצאה מכך מומים נוירולוגיים ליילוד, ביניהם התפתחות מוגבלת של המוח. כיום אנחנו מאבחנים את המחלה על ידי זיהוי הנגיף בדגימות דם מלא ושתן ועל ידי זיהוי נוגדנים כנגד הנגיף בדגימות סרום. במהלך שנת 2016 נבדקו למחלת הזיקה 689 אנשים ו – 20 מהם נמצאו אובחנו במחלה. יש לציין כי כל החולים הגיעו מארצות אנדמיות לנגיף הזיקה. כמו כן, בקרב החולים לא היו נשים בהריון.

ניטור יתושים לזיהוי נגיף קמ"ה .4במסגרת תפקידיו, המרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים בודק המצאות של נגיף קמ"ה ביתושים ממין נקבה )המסוגלים להעביר את הנגיף לבני-אדם( הנאספים מכל רחבי הארץ. ניטור זה מתאפשר הודות לשיתוף פעולה הדוק בין המשרד לאיכות הסביבה האחראי ללכידת היתושים )על ידי פקחי הרשות(, המעבדה לאנטמולוגיה במעבדות המרכזיות בי"ם שמקבלת וממיינת את היתושים והמעבדה הארצית לנגיפים במשרד הבריאות שמעבדת את הדגימות ובודקת את נוכחות הנגיף ביתושים. בשנה זו לכידת היתושים הייתה מועטה מהרגיל ועל כן זוהו רק 11 אצוות יתושים חיוביים מתוך 408

שנבדקו )בשנה ממוצעת נבדקים כ – 650 אצוות יתושים(.

מפה מס' 1:מתארת את הפיזור המרחבי של מקומות מגורי החולים ומקומות

איסוף היתושים החיוביים.

טבלה מס' 2:מסכמת את נתוני היתושים שנאספו לאבחון נגיף קמ"ה ביתושים.

2016שנת בדיקה13389מס' יתושים שנבדקו

408מס' קב' יתושים11מס' קב' יתושים חיוביות

2.7%אחוז קב' יתושים חיוביים7מס' מקומות עם יתושים חיוביים

מחקר ופיתוח .5כנגד נוגדנים לזיהוי סרולוגית שיטה הכנסת פיתוח: לנגיפים 2016 המרכז הארצי – מתחילת שנת נגיף הזיקה כנגד נוגדנים לזיהוי סרולוגיות ערכות בחן מספר זואונוטיים הזיקה ובחר בקיט המזהה נוגדנים ספציפיים כנגד חלבון ה- NS1 של הנגיף. בדיקה זו שנכנסה לעבודה רוטינית בפברואר וביחד עם הבדיקה המולקולרית 2016 הינה ספציפית מאוד

הזיקה. חולים במחלת לאבחון טובה מאוד רגישות מספקת

מחקר: בשנת 2016 נערכו במרכז הארצי לנגיפים זואונוטיים מספר מחקרים קליניים ואפידמיולוגיים:

1. במחקר שנועד לשפר את שיטות האבחון של נגיף קדחת מערב הנילוס בחולים נמצא כי הנגיף קיים בדגימות דם מלא לזמן ממושך ובכמות רבה בהשוואה לדגימות נסיוב, שתן, סרום, נוזל שדרה ופלסמה שהיו מקובלות בעולם כדגימות מתאימות לאבחון.

2. בעקבות התפרצות הזיקה שארעה לפני כשנה וחצי בדרום אמריקה ושיטות האבחון הבעייתיות הקיימות, ניסינו למצוא דרכים משופרות ורגישות לזיהוי הנגיף בחולים. בעזרת מחקר שבוצע על דגימות מחולי זיקה שזוהו בישראל, ובהתבסס על הידע שנרכש במחקר דומה בנגיף קדחת מערב הנילוס השייך לאותה משפחת נגיפים כמפורט בסעיף הקודם, נמצא כי ניתן לזהות את נגיף הזיקה בדם מלא עד ל 2 חודשים מתחילת הסימפטומים. מחקר זה הגדיל מאד את טווח האבחון המולקולרי שהיה ידוע עד אז בעולם והגביר בצורה משמעותית את יכולת האבחון שלנו בישראל.

3. על מנת לבחון את שכיחות ההדבקה בקדחת מערב הנילוס באוכלוסייה בישראל נערך, בשיתוף פעולה עם המרכז הישראלי לבקרת מחלות סקר סרולוגי בקרב 3450 אנשים לבחינת נוגדני IgG כנגד קדחת מערב הנילוס באוכלוסייה. בסקר נמצא כי שיעור ההמצאות של נוגדנים המעידים על הדבקה בעבר הינו 11%.

Page 34: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 33

גרף מס' 1: תחלואה של קדחת מערב הנילוס בישראל 2016 ביחס לממוצע חולים 2011-15.

מפה מס׳ 1: מפת קמ"ה באנשים וביתושים.מפות פעילות הנגיף במרחב, בחולים ויתושים, מדגימה התאמה חלקית. יתושים הנגועים בקמ"ה נלכדו באזור גוש דן, עפולה,

ושדרות – אזורים בהם נצפתה גם תחלואה בבני אדם. מאידך נלכדו יתושים גם מחוץ לאזורי התחלואה. מיפוי, באדיבות יעל גלזר, המחלקה לאפידמיולוגיה, משרד הבריאות, ירושלים.

מפת דרוםמפת צפון

Page 35: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

34 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז:אבחון מולקולארי בשיטת Real Time PCR של נגיפי ההרפס . 1

.HHV8 ,HHV6 ,HSV1&2 ,VZV :הבאים בדיקות סרולוגיות לניטור נוגדנים כולל:. 2

.HHV6 ,VZV ,HSV בנסיובים לנגיפי IgM-ו IgG אבחון נוגדני - .HHV7 בנסיובים לנגיף IgG אבחון נוגדני -

.HSV2 או HSV1 בנסיובים כמכוונים כלפי IgG אפיון נוגדני - - אבחון נוגדני IgG בנסיובים כנגד אנטיגנים ליטיים ולטנטיים

.HHV8 לנגיף בדיקת יציבות לאציקלוויר.. 3מבדקי איכות פנימיים וחיצוניים.. 4מחקר ופיתוח.. 5

מבואנגיפי שלבקת המדביקים אדם כוללים 8 נגיפים שונים. במרכז VZV-ו HSV הארצי נבדקים הנגיפים המוזכרים לעיל כאשר נגיפימשתייכים לתת קבוצה אלפא וגורמים למגוון מחלות בדרגות חומרה שונות. נגיפים אלו מעורבים במצבים של אנצפליטיס, מננגיטיס ומנינגואנצפליטיס וכן בנגעים במקומות שונים בגוף. בחולים בעלי דיכוי חיסוני יכולים נגיפים אלו לחולל מחלה קשה ומסכנת חיים.כמו כן הם יכולים להדביק את העובר במהלך ההיריון או בעת הלידה. בעת המין באברי נגע נושאת האם כאשר הלידה תוצאת מעבדה חיובית במקרה זה תוביל לביצוע לידה בניתוח הלידה. בתעלת במעבר הילוד הדבקת למנוע כדי קיסרי הנגיף HHV6 משתייך לתת קבוצה ביתא ומדביק את מרבית בני האדם עד לגיל שנתיים. הנגיף יכול לעבור התלקחות במקרים בעקבות וכן לימפופרולפרטיביות מחלות חיסוני, כשל של השתלת איברים, מח עצם ולגרום לדחיית השתל. כמו כן דווחו צעירים. בילדים או סיבוכים של הדבקה ראשונית בתינוקות

נגיף HHV7 משתייך גם כן לקבוצת ביתא והוא דומה גנטית וקלינית לנגיף HHV6. הנגיף תוקף בעיקר ילדים צעירים, אחראי למופע של פריחה אופיינית המכונה Roseola ונשאר באופן סמוי כל החיים.

נגיף HHV8 המשתייך לקבוצה גמא הנו הגורם האטיולוגי למחלת הסרקומה על שם קפושי ומעורב במחלות סרטניות של לימפוציטים. תבחיני המעבדה כוללים זיהוי חומצת הגרעין של הנגיפים הללו ומבחנים

סרולוגיים ספציפיים.

אבחון מולקולארי של נגיפי הרפס בשיטת. 1 Real Time PCR

בחולים בנוזלי שדרה הנבדקים כי 1 לראות מטבלה מס' ניתן נמצא המרכזית העצבים מערכת של קליניים תסמינים עם VZV בשכיחות הגבוהה ביותר. כאשר התמונה הקלינית הנגיף היא של נגעים שלפוחתים, באברי גוף שונים ונשלחות דגימות משטחים מאותם אברי גוף, הרפס מטיפוס 1 והרפס מטיפוס 2 שכיחים במידה שווה באזורים גניטלים בעוד שבדגימות מאזור הפנים ומדרכי הנשימה העליונים נמצא בעיקר הרפס מטיפוס 1.והם בדם מלא מאחר בעיקר זוהו 8 והרפס 6 הנגיפים הרפס

מדביקים לימפוציטים.

המרכז הארצי לנגיפי שלבקתמנהלת המרכז: ד"ר שרה דברת

צוות המרכז: מגר' מזל בוק, הגב' צביה סופייב

Page 36: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 35

בדיקות סרולוגיות לניטור נוגדנים . 2בשנת 2016 בוצעו במרכז הארצי לנגיפי שלבקת 3302 בדיקות

סרולוגיות בהתאם לפרוט שלהלן. HHV6 ,HSV ,VZV לנגיפים IgM-ו IgG אבחון נוגדנים מטיפוס

בדיקת רמת נוגדנים לנגיפי שלבקת תורמת לאבחון רק במקרים ספציפיים עקב מורכבות הנובעת מהיווצרות נוגדני IgM לא רק בהדבקה ראשונית אלא גם כתוצאה מאירועי ראקטיבציה או כתוצאה מהדבקות בטיפוס שונה של נגיף. במקרים אלו ניתן למצוא נוכחות בו זמנית של נוגדנים מסוג IgG ומסוג IgM. בהדבקה ראשונית העלייה ברמת הנוגדנים מתקבלת 10 - 14 ימים לאחר הופעת הנגעים ונוכחות

נוגדנים מסוג IgM והעדר נוגדנים מסוג IgG יכולה להצביע על הדבקה ראשונית. בדיקת רמת נוגדני IgG חשובה במיוחד במקרה של חשיפת נשים בהריון ל-VZV. במידה והאישה אינה מחוסנת היא תחוסן .VZIG-Varicella Zoster Immunoglobulins בחיסון סביל מסוגסטטוס חיסוני כלפי נגיפים אלו נקבע גם עבור תורמי ומקבלי שתל

כחלק מפרוטוקול נדרש לפני ביצוע השתלה. בשנת 2016 הגיעו למרכז הארצי לנגיפי שלבקת 2545 דגימות .HSV ,VZV עבור נגיפי IgM-ו IgG נסיובים לקביעת נוכחות נוגדני

תוצאות הבדיקות מתוארות בטבלה מס' 2.

HSV1&2 ,VZVHHV6HHV8גורם

מספר חומר דגימה חיובי שליליבדיקות

HSV1 חיוביHSV2

חיובי VZV

מספר מספר חיובי שליליבדיקות

חיובישליליבדיקות

144113601313551111056770 נוזל שדרה

6236098241971286916133דם מלא

11000550110מח עצם

211--------נוזל פלוריאלי

---5443191123578651משטח מפצע

------22013552321משטח גניטלי/רקטלי

------121734242שטיפת פה

------51401001משטחים מאברי נשימה עליונים

------2823500כיחBAL3525802642110

313010013112110ביופסיות

------5550401משטח עין

------11000מי שפיר

31512666255861443372588028244סה”כ

טבלה מס' 1:תוצאות בדיקות מולקולאריות לנוכחות נגיפי הרפס בדגימות קליניות.

סוג נוגדן

HSVVZV

מספר אחוז שליליגבולי חיוביבדיקות

חיוביים מספר

אחוז שליליגבולי חיובי בדיקות חיוביים

IgG572424014874615474459677

IgM48238304097.087641257164.6

טבלה מס' 2:HSV ,VZV עבור נגיפי IgM-ו IgG תוצאות בדיקות נסיובים לנוכחות נוגדני

הסטטוס החיסוני כלפי נגיפי הרפס ווריצלה בדגימות נבדקים מעיד על תפוצה רחבה של נשאות לנגיפים אלו.

Page 37: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

36 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

אפיון נוגדנים מטיפוס IgG כמכוונים כלפי זן ספציפי HSV2 ו/או HSV1

מאחר וישנם שני טיפוסי נגיף, השונים זה מזה מבחינה אימנוגנית, ניתן להבדיל בין סוגי הנוגדנים באמצעות שיטת אימנובלוט המזהה

.G נוגדנים ספציפיים המכוונים כלפי גליקופרוטאין

.HSV כלפי IgG נוגדני לאפיון דגימות 72 התקבלו 2016 בשנת מתוכם 52 נמצאו חיוביים להרפס מטיפוס 1, 5 דגימות הצביעו על נוגדנים כנגד דגימות נשאו ואלו 7 2 נוגדנים כלפי הרפס מטיפוס

שני טיפוסי הנגיף.

HHV6 אפיון נוגדנים כנגד

מסוג נוגדנים לנוכחות נסיוב דגימות 402 נבדקו 2016 בשנת IgM. תוצאות הבדיקות נוגדנים מסוג ו-186 דגימות לנוכחות IgG

מסוכמות בטבלה מס' 3.

טבלה מס' 3: HHV6 כנגד IgM -ו IgG אבחון נוגדנים מסוג

סוג בדיקה

מספר בדיקות

מספר חיוביים

מספר גבוליים

מספר שליליים

אחוז חיוביים וגבוליים

IgG402362112692.7

IgM186292013726.3

HHV7 בנסיוב כנגד IgG אבחון נוגדנים מטיפוס

נסיובים 18 ומתוכם IFA נסיובים בשיטת 23 נבדקו בשנת 2016 נמצאו חיוביים, 2 נסיובים הראו ערך גבולי ו- 3 הראו צביעה בדגם

לא ספציפי.

HHV8 לנגיפי IgG אבחון נוגדנים מטיפוס

נוגדנים כנגד אנטיגן ליטי בשנת 2016 נבדקו 37 נסיובים לאבחון ואנטיגן לטנטי. טבלה מס' 4 מסכמת את התוצאות

טבלה מס' 4:אבחון נוגדנים כנגד אנטיגן ליטי ולטנטי

מספר בדיקות

חיובי לאנטיגן

ליטי ולטנטי

שלילי לאנטיגן

ליטי ולטנטי

שלילי לאנטיגן

לטנטי וחיובי/גבולי לאנטיגן ליטי

חיובי/ גבולי לאנטיגן

לטנטי שלילי לאנטיגן

ליטי

גבולי לאנטיגן

ליטי ולטנטי

741412361

של ראקטיבציה על מצביעה ליטי אנטיגן כלפי נוגדנים נוכחות לשלול או לאמת כדי נוספת בדיקה דורש גבולי מצב הנגיף. נוגדנים כלפי אנטיגן לטנטי בלבד נוגדנים. המצאות התפתחות יכולה לנבוע מנוכחות נוגדנים אוטואימוניים ואינה בהכרח מעידה

על נשאות של הנגיף.

בדיקת יציבות לאציקלוויר .3בשנת 2016 בודדו בתרבית 4 נגיפים מחולים החשודים כנשאים של נגיף עמיד לאציקלוויר. מתוכם 3 בידודים של נגיף נמצאו עמידים לאציקלוויר ובידוד אחד התגלה כרגיש לתרופה. רגישות נקבעת על פי ריכוז התרופה המעכב 50 אחוז מהאפקט הציטופתי של הנגיף. נגיף רגיש לעמיד הנו ערך בין cutoff להבדלה )ID50(. כאשר ערך ID50 של 2 מיקרוגרם למיליליטר. נגיף עבורו ערך ID50 עולה על 2

מיקרוגרם למיליליטר מוגדר זן יציב. נגיפים יציבים מבודדים במרבית המקרים מחולים בעלי מערכת חיסון לקויה כגון מושתלי מח עצם, בטיפול הנמצאים סרטניות במחלות חולים או אברים, מושתלי

כמותרפי.

מבדקי איכות פנימיים וחיצוניים .4המרכז הארצי לשלבקת משתתף במספר תכניות של בקרת איכות המאפשרות לבחון את יכולות המעבדה בהשוואה למעבדות ברחבי

העולם. התכניות בהן השתתפנו כוללות:

תכנית של RCPA Serology QAP במסגרתה נבדקים נסיובים . 1 HSV נגיפי כלפי IgM-ו IgG מסוג נוגדנים העדר לנוכחות בשיטת HSV כלפי הנוגדנים אפיון מבוצע כן כמו .VZV-ואימנובלוט. התוכנית כוללת שני סבבים ובכל סבב שתי דגימות הסבבים בשני הנגיפים שני עבור התוצאות לבדיקה. נסיוב

נכללו בקונצנזוס של כלל המשתתפים.

במבחן. 2 HSV/VZV נגיפי גנום גילוי לבדיקת QCMD תכנית קליניות דגימות 10 נשלחו נגיף כל עבור .Real-time PCR

לשני נחלקות הדגימות סבב. לכל דגימות 5 סבבים, בשני נגיף בכמות המחייבת core דגימות המכילות סוגים. דגימות בתחום נגיף המכילות דגימות educational ודגימות זיהוי

הגבולי. כל הדגימות המכילות נגיף זוהו )100% הצלחה(.

3 . 5 התקבלו .HHV-6 נגיף גנום גילוי לבדיקת QCMD תכנית דגימות הנושאות או נעדרות נגיף. כל הדגימות המכילות נגיף

זוהו )100% הצלחה(.

מחקר ופתוח .5לזן חיסוני ווריצלה זן בין להבדלה מבחן פותח 2016 בשנת ORF62. ההבדל בגן snp פראי המבוסס על רצוף שני אתרי T בזן פראי בשני אתרים אלו מתבטא במעבר של נוקלאוטיד 108 ,111 ו- 106 ,262 בעמדות חיסוני בזן C לנוקלאוטיד ללא החיסוני בזן יציבות נמצאו אלו עמדות הנגיפי. בגנום מעבר חזרה למצב בזן הבר. הפיתוח נעשה במסגרת פרויקט מחקר של סטודנטית לתואר ראשון מהאוניברסיטה הפתוחה.

Page 38: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 37

נושאי פעילות המרכז:.CMV -בדיקות לנגיף ה

1 ..real-time PCR בשיטת CMV אבחון איכותי וכמותי של2 ..IgM -ו IgG אבחון סרולוגי וניטור נוגדנים מטיפוסבקרת איכות.. 3

אבחון איכותי וכמותי של CMV בשיטת. 1.Real Time PCR

הדבקה ע"י נגיף ה-CMV נפוצה מאוד לאחר השתלות בכלל ולאחר השתלות מח עצם בפרט. ראקטיבציה ויראלית מתרחשת אצל 30-50% ממושתלי מח עצם אלוגניים ויכולה להוביל להתפתחות

.CMV של מחלת

CMV קיימות שתי אסטרטגיות למניעה של התפתחות מחלת במושתלים:

טיפול פרופילקטי ע"י תראפיה אנטי ויראלית אפקטיבית, הניתן . 1לכל החולים הנמצאים בסיכון לראקטיבציה.

טיפול פרה-אמפטיבי, במסגרתו ניתן טיפול אנטי ויראלי רק . 2.CMV לחולים אשר אצלם הוכחה ראקטיבציה של

באסטרטגיה השנייה יש צורך במרקרים ויראליים ספציפיים ורגישים אשר יאפשרו גילוי מוקדם של הדבקה ב-CMV, דבר המחייב בדיקות

מעקב בתדירות גבוהה.

CMV בדם החל משנת 2003 אנו מבצעים אבחון כמותי מהיר של )monitor( שמטרתו לעקוב ,Taqman real-time PCR מלא בשיטת

אחר הדבקה ב-CMV במושתלים. השנה התקבלו במעבדה 7392 דגימות דם מלא ממושתלים לצורך

מעקב, מתוכן 1860 נמצאו חיוביות )25.2%(.

בעקבות סקר היילודים שבצענו בשנת 2012 בדגימות רוק, מספר בתי חולים אימצו את דגימת הרוק כחומר הדגימה הראשוני לשם אבחון הדבקה תוך רחמית ב- CMV ואכן ניתן לראות שבשנתיים שנשלחו הרוק בדיקות בכמות גדולה עלייה חלה האחרונות למעבדה. )השנה התקבלו 1827 דגימות(. תוצאת בדיקת רוק חיובית מחייבת אישור סופי אשר מתבצע מדגימת שתן של התינוק. יש לזכור כי רק שתן חיובי ל- CMV מאשר כי הייתה הדבקה תוך רחמית.

בנוסף, אנו מקבלים דגימות שתן של יילודים ממס' מרכזים רפואיים אשר מעדיפים לשלוח שתן כדגימה ראשונית לשם אבחון הדבקה

תוך רחמית.בשנה הנוכחית נבדקו 482 דגימות שתן של יילודים החשודים בהדבקה תוך רחמית ב- CMV. הבדיקה נעשתה כאמור משתן שנלקח במהלך שלושת השבועות הראשונים לחיי התינוק. 67 יילודים )13.9%( נמצאו חיוביים ל- CMV, דבר המאשר כי הם נדבקו הדבקה תוך רחמית. הזיהוי והקביעה של יילודים המודבקים תוך רחמית חיוניים לטיפול

האפשרי המוצע להם.

אבחון של הדבקה תוך רחמית ב-CMV בזמן ההריון נעשה מדגימות מי-שפיר משבוע 21 ואילך של ההריון. תוצאה חיובית במי שפיר מוכיחה הדבקה של העובר אך אינה יכולה לנבא אם העובר אכן נפגע. השנה התקבלו 368 דגימות מי שפיר, מתוכן 38 )10.3%( נמצאו חיוביות.

שימוש בנייר גטרי לשם אבחון הדבקה תוך רחמית ב-CMV, הפך בשנים האחרונות לכלי עזר משמעותי מאוד, במיוחד כשמתעורר חשד להדבקה תוך רחמית בשלב מאוחר יותר בחיי התינוק, בו כבר לא ניתן לקבוע הדבקה תוך רחמית ע"י בדיקת שתן )כאשר התינוק בן יותר מ-3 שבועות(. ניירות הגטרי של כל התינוקות הנולדים בארץ נשמרים במעבדה לסקר יילודים של משרד הבריאות. בעקבות בקשה של ההורים טיפת דם אחת הספוגה ע"ג נייר הגטרי)DBS – Dried Blood Spot(, מגיעה למעבדה, וממנה אנו מבצעים הפקה של ה-DNA וביצוע PCR. תשובה חיובית מאשרת הדבקה

תוך רחמית.DBS מתוכן 8 דגימות )10%( השנה הגיעו למעבדה 80 דגימות

נמצאו חיוביות.

סה"כ בשנת 2016 התקבלו 10,638 דגימות לאבחון מהיר של 3246 כשמתוכן ,Taqman real-time PCR בשיטת CMV נגיף דגימות לאבחון איכותי בלבד, ו- 7392 דגימות דם ממושתלים

לאבחון כמותי.

פרוט הדגימות והתוצאות בטבלה מס' 1.

תחום אבחוןEBV -ו CMV נגיפי

מנהלת המרכז: מגר' מיכל טפרברג

צוות המרכז: גב' גילה גולדפלד, גב' ז'אנה רובינוב, גב' אריג' כבת

מתנדבת: גב' לילי בן יוסף

Page 39: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

38 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

טבלה מס' 1:

% חיובייםמס׳ חיובייםסה”כ דגימותחומר דגימה

7392186025.2דם מלא

18271246.8רוק

72014420.0שתן

3683810.3מי שפירDBS80810.0

752026.7ביופסיות למינהן

722433.3נוזל שטיפת ריאהCSF3126.5

25416.0משטחים למינהם

22731.8שאיבות חלל אף

7228.6נוזל זרע

300נוזלים למינהם

16956.2אחר

10,638224221.1סה”כ

IgM -ו IgG אבחון סרולוגי וניטור נוגדנים מטיפוס .2לסטטוס החיסוני של נוגדני CMV-IgG יש חשיבות גדולה מאוד בעת קבלת החלטות לפני השתלות איברים והשתלות מח עצם. ע"פ התוצאה המתקבלת מחליטים אם התורם מתאים והאם יש צורך לתת למועמד להשתלה טיפול אנטי ויראלי לפני ההשתלה. במקרה של תרומת איברים מתורם חי, לפני ניתוק ממכשירי החייאה, יש חשיבות לביצוע מיידי ומהיר של הבדיקה, ולכן במקרים אלו הבדיקה

מוגדרת כדגימה דחופה.

IgG בשנת 2016 התקבלו 808 נסיובים לאבחון סרולוגי מטיפוס ו-2315 נסיובים לאבחון סרולוגי של נוגדנים מטיפוס IgM. כל הנסיובים BioMerieux מתוצרת Vidas בערכה מסחרית ELISA נבדקו בשיטת

)צרפת(.במערכות הסרולוגיות הוכנסו לשימוש שוטף בקרים מסחריים.

התפלגות התוצאות מובאת בטבלה מס' 2.

טבלה מס' 2:

חיובי/שלילי/גבוליכלל הנסיובים

)%( EIA-IgG)%( EIA-IgM

149 )6.4(671 )83(מס׳ חיוביים

55 )2.4(10 )1.3(מס׳ גבוליים

2111 )91.2(127 )15.7(מס׳ שליליים

2315 )100(808 )100( סה”כ

בקרת איכות .3המדור השתתף בתוכנית של RCPA הכוללת בדיקות סרולוגיות לנגיף CMV. כמו כן השתתפנו בתוכנית של QCMD הכוללת אבחון איכותי

.Real-time PCR בשיטת CMV DNA וכמותי שלאת כל המבחנים עברנו בהצלחה.

EBV -בדיקות לנגיף ה1 ..real-time PCR בשיטת EBV אבחון איכותי וכמותי של2 ..EBV-אבחון סרולוגי וניטור נוגדנים לנגיף הבקרת איכות.. 3

EBV (Epstein-Bar Virus) הוא נגיף דנ"א ממשפחת ההרפס הנפוץ מאד באוכלוסיה. רוב ההדבקות בנגיף מתרחשות בזמן הילדות ואינן מלוות במחלה קשה. לעיתים תתבטא ההדבקה במחלה המאופיינת בעיקרה בעייפות, חום, כאבי גרון והגדלת בלוטות לימפה )מחלת הנשיקה(. תאי המטרה של הנגיף הם תאי B ולאחר הוירמיה מתרחשת

הדבקה לטנטית האופיינית לכל משפחת נגיפי ההרפס.בדיקות לנגיף נדרשות לעיתים במטופלים הנמצאים במעקב לאחר EBV במחלתם, כמו חולי השתלה, ולחולים החשודים למעורבות סרטן למינהם. בחולים אלו יכולה להתרחש ראקטיבציה של הנגיף

המתבטאת בעליה בעומס הנגיפי בדמו של החולה.

real-time PCR בשיטת EBV אבחון איכותי וכמותי של .1quantitative real time PCR נעשית בשיטת EBV בדיקת העומס הנגיפי של

הדבקה ראשונית ב- EBV מתאפיינת בערכי עומס נגיפי בתחומים של copies/ml 10³-105 עומס נגיפי הנמוך מ- copies/ml 10³ בדם החולה

מעיד לרוב על הדבקה בעבר ואינו מחייב התייחסות רפואית מיוחדת. לעומת זאת ראקטיבציה של הנגיף בחולים מושתלים מתאפיינת בערכים גבוהים יותר של מעל copies/ml 106. בדיקות כמותיות מבוצעות

בדם מלא ובפלסמה בלבד.בשנת 2016 התקבלו במעבדה 1448 בדיקות לאבחון מולקולרי של EBV. רוב הבדיקות הגיעו ממרפאות ומחלקות בשיבא. התפלגות

הבדיקות לפי חומר דגימה מובאת בטבלה מס' 4.

טבלה מס' 4:התפלגות הבדיקות ע"פ החומר הנבדק.

% חיובייםמס׳ חיובייםמספר בדיקותהחומר הנבדק

135537127.4דם מלא

372259.5פלסמה

1300שטיפת עיניים

BAL55100

18211.1נוזל שדרה

1100ביופסיות

9666.7אחר

144840628סה”כ

Page 40: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 39

טבלה מס' 5:מסכמת את תוצאות העומס הנגיפי של EBV מדגימות הדם

שהתקבלו.

מס׳ דגימות דם מלאערכי עומס נגיפי

984שלילי

<103122

103 – 104140

104 - 10587

>10522

1355סה”כ

ערכי עומס נגיפי גבוה )מעל ערכים של 104 עותקים למ"ל( המעידים על רפליקציה אקטיבית של הנגיף, נמצאו ב-109 דגימות דם מלא, שמהוות 8.0% מכלל הדגימות שנבדקו. ב-984 )72.6%( מהבדיקות בדם מלא לא זוהה נגיף כלל, תוצאה שיכולה להעיד על הדבקה בעבר שאינה מתבטאת ב-PCR חיובי, או לחילופין על כך שהנבדק

.EBV -לא נחשף לנגיף ה

EBV -אבחון סרולוגי וניטור נוגדנים ל .2אבחון סרולוגי ל- EBV נעשה בערכות של BioMerieux במכשיר הוידאס. בערכות אלה משתמשים בחלבוני EBV סינטטיים כמקור לאנטיגנים הנגיפיים. בשלב הראשון נבדקת נוכחות נוגדנים מסוג IgG כנגד אנטיגן הגרעין )EBNA(. ידוע כי נוגדנים אלה נוצרים כ- 2-4 חודשים לאחר ההדבקה בנגיף. על כן איתור נוגדנים כנגד EBNA מעיד על קיום הדבקה בעבר )previous infection(. במקרה זה אין צורך להמשיך ולבדוק קיום נוגדנים אחרים. אם התוצאה לבדיקת נוגדנים כנגד EBNA שלילית או לא החלטית, מבוצעות 2 בדיקות נוספות: בדיקה

לאיתור נוגדנים מסוג IgG כנגד שני חלבונים מוקדמים של הנגיף)VCA/EA IgG( המופיעים תוך שבוע מתחילת ההדבקה ונשארים כנגד IgM מסוג נוגדנים לנוכחות ובדיקה החיים, לכל לעיתים

ה- VCA. נוגדנים אלו נוצרים ראשונים לאחר ההדבקה ונעלמים תוך 4-6 שבועות. במצב של הדבקה חריפה שתי הבדיקות האחרונות תהיינה חיוביות, או רק הבדיקה ל- IgM כנגד ה- VCA תהיה חיובית

.)primary infection(

.EBV בשנת 2016 התקבלו במעבדה 1884 דגימות לזיהוי נוגדנים כנגדרוב הדגימות התקבלו מחולים המאושפזים בבית חולים שיבא. במידה ,EBNA והתקבלה דגימה של חולה שנבדק בעבר ונמצא חיובי לנוגדניאנו לא בודקים את הדגימה אלא מעדכנים את הלקוח כי נבדק בעבר.

טבלה מס' 1 מסכמת את התפלגות הבדיקות החיוביות והשליליות של הדגימות שהתקבלו במעבדה בהתאם לסוג הנוגדים שנבדקו. ,EBNA ל- חיוביים נמצאו מהנבדקים ש-79.4% לראות ניתן נוגדנים התגלו EBNA ל- השליליות מהבדיקות 46.5% ב-

ל - VCA/EA IgG ,ו-61 מהדגימות השליליות ל- )EBNA (17.2% היו .IgM -חיוביות ל

טבלה מס' 1:התפלגות הבדיקות הסרולוגיות לפי סוג הנוגדנים הנבדקים ושיעור

החיוביים בכל בדיקה.

סוג הנוגדנים

כמות בדיקות

שהתקבלו

מס׳ הבדיקות

שבוצעו

מס׳ החיוביים

% החיוביים

נוגדנים כנגד EBNA18841673132879.4

נוגדנים כנגד VCA/EA IgG188434416046.5

נוגדנים כנגד VCA IgM18843506117.4

טבלה מס' 2 מתארת את התפלגות המסקנות של המעבדה לאור הבדיקות הסרולוגיות שנעשו לנבדקים השונים. ניתן לראות כי ב- 2016 כ- 89% מהנבדקים נדבקו בנגיף בעבר ורק 3.6% מהנבדקים

היו בשלב ההדבקה החריפה בנגיף.

טבלה מס' 2:התפלגות התשובות לבדיקות הסרולוגיות שבוצעו בשנת 2016.

% נבדקיםמס׳ נבדקיםמסקנה

148889הדבקה בעבר

613.6הדבקה חריפה

EBV -1247.4שלילי ל

בקרת איכות .3.EBV הכוללת בדיקות סרולוגיות לנגיף RCPA המדור השתתף בתוכנית

כמו כן השתתפנו בתוכנית של QCMD הכוללת אבחון כמותי ואיכותי .Real time PCR בשיטת EBV-DNA של

Page 41: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

40 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

נושאי פעילות המרכז:בדיקות איכותיות וכמותיות לקביעת נוכחות נגיפים שונים . 1

.(Taqman( Real Time PCR בדגימות קליניות בשיטתהפקה של DNA מדגימות קליניות.. 2בקרת איכות בתחום המולקולרי.. 3הערכה ותיקוף של מכשור, קיטים, פריימרים ופרובים ופתוח . 4

תערובות )מולטיפלקסים( של פריימרים ופרובים לבדיקת מספר נגיפים בו זמנית.

מחקר ופיתוח. 5

נוכחות . 1 וכמותיות לקביעת בדיקות איכותיות )Taqman( נגיפים שונים בדגימות קליניות בשיטת

Real Time PCR

יחידת הטקמן נותנת שרות פנים מעבדתי למרכזים השונים בתחום האבחון המולקולרי הראשוני לגילוי חומצות גרעין של נגיפים בדגימות קליניות. באופן שוטף בודק מדור טקמן 53 יעדים בגנים

נגיפיים: CMV (IE & gB), HSV-1, HSV-2, VZV, HHV-6, HHV-8, EBV, HIV-1, HIV-2, Parvovirus, BKV, JCV, human and avian Influenza A (M, H1, H3, H5, H7, H9, N1, N9), Influenza B, RSV-A, RSV-B, hMPV, Adenovirus, Parainfluenza 3, Coronaviruses (229E, HKU1, NL63, OC43), Bocavirus, Rhinovirus, Parechovirus, Dengue viruses 1, 2, 3, 4, Usutu virus, RVF, CCHF, Chickungunya virus, SARS, Norovirus II, WNV (Mosquitoes and Human), Mumps virus, Measles virus, Rubella virus, Enterovirus, Enterovirus 68, Poliovirus

.SOAS, Sabin,1,3 and ZIKA MS2 והקוליפאז' RNase P הגן ההומני גם נבדקים כן כמו המשמשים לבקרת איכות פנימית בבדיקות השונות המבוצעות במרכז. לגבי חלק מהנגיפים נעשה זיהוי של מספר גנים שונים באותו הנגיף. למרבית הנגיפים התוצאה היא איכותית ובאחרים מחושבת תוצאה כמותית לכל דגימה. חלק מהנגיפים נבדקים מדי יום ואחרים בהתאם ללוח זמנים מוגדר מראש בהתחשב בסוג הנגיף

ובדחיפות התוצאות.בדיקה בשיטת- Real Time PCR רגישה מאוד, ויכולה לגלות אף עותק יחיד של הנגיף בדגימה הנבדקת. בהתאם לאופן העבודה

במעבדתנו סף הרגישות של השיטה הוא כ-50-100 עותקים למיליליטר בדגימה של החולה. הריאקציה אינה מבחינה בין נגיף פעיל לבין חומר גנטי שאינו אינפקטיבי. האינטרפטציה ביחס למשמעות התוצאה, תלויה בנגיף הנבדק, בחומר הדגימה של הנבדק ובערך התוצאה שהתקבל - והיא מבוצעת במרכז הארצי

הרלוונטי.נגיפיים בדגימות קליניות. גנים 94,726 2016 נבדקו בשנת כמות הבקרים מכל המרכזים הארציים שנבדקו במשך השנה)Controls per tests) מגיע ל- 42511, כמות הבקרים הפנימיים )RNaseP, MS2( בדגימות היא 32412 )IC per tests(. בנוסף לכך בבדיקות תיקוף והערכה )Validations( נבדקו כ- 5,000 1,2,3,4(. כפי שניתן לראות בגרף גנים שונים )תמונות מס' מס' 1 קיימת עליה מתונה במספר הבדיקות בהשוואה לשנת 2015.

הפקה של DNA מדגימות קליניות .2מסוג הפקה מכשיר לשימוש הוכנס 2016 שנת במהלך ההפקה המכשיר את המחליף Roche MagNaPure96 שוטף באופן מקבל המדור כיום .Roche MagnaPure32DNA בעזרת מכשיר אוטומטי מסוג דגימות קליניות וממצה מהן MagNaPure96. במכשיר זה ניתן להפיק עד 96 דגימות בריצה והוא תואם את נפח העבודה הגדל. המכשיר ידידותי מאוד לשימוש ומקצר את זמן העבודה שהושקע בהפקת חומצות גרעין. יתרון משמעותי RNA הינו היכולת להפיק MagNaPure96 לשימוש במכשיר מסוגמדגימות קליניות ביעילות גבוהה כפי שנמצא בולידציות שבוצעו עבור נגיפים שונים כגון נגיפי שפעת וזיקה. הפקות של RNA מתבצעות גם ע"י המרכזים הרלוונטיים תוך שימוש במכשירים שונים והם מועברים

ליחידת טקמן לבדיקה.בשנת 2016 מוצו במרכז 17548 דגימות קליניות, לעומת 17120

בשנת 2015 עליה של 2.5%.

בקרת איכות בתחום המולקולרי .3ביחידה מתקיימת בקרה מתמדת וקפדנית של איכות התוצאה. בכל הרצה נכללות ביקורת חיובית וביקורת שלילית לנגיף. כביקורות חיוביות משמשות חומצות הגרעין של הנגיף השלם, במידה וקיים בקר מסחרי מכומת ניתן לקבוע לפיו את מספר עותקי הנגיף בבקר. בקרים אלו משמשים את היחידה באופן שוטף ומהווים את הבסיס לאישור תקפות הבדיקות. בכל ההפקות מדם מלא

תחום אבחון מולקולאריבשיטת Real Time PCR )טקמן(

מנהל המרכז: ד"ר מוסא הינדייה, ד"ר דניאלה רם

צוות המרכז: מגר' שרה אורזיצר, מגר' וירג'ניה לוי, מגר' רוברטו אזר, גב' אריג' כבת, גב' אירנה ז'ורניסט

Page 42: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 41

ופלסמה ומשטחים נבדק גם גן הומאני -RNase P שקיים בגנום כעותק יחיד, ומאפשר מעקב אחר כל הבדיקה החל במיצוי וכלה במערכת ה-Real Time PCR, רמת גן זה מעידה גם על מספר התאים הלבנים בדגימה הנבדקת ולפיכך גם על תקפות הבדיקה ביחס לנגיפים המתרבים בתאים אלה. למעקב אחר שלבי הראקציה ,CSF( ונוכחות מעכבים בדגימות קליניות שונות RNA בנגיפי וצואה למשל(, מוסף לדגימה MS 2 שהוא פאג' שהחומר הגנטי

.RNA בו הואבקרת במבחני משתתפת המעבדה חיצונית: איכות בקרת QCMD. בשנת 2016 נבדקו הנגיפים הבאים איכות חיצוניים

CMV Enterovirus, HSV-1 ,2 ,VZV ,BKV ,EBV, וכן פנל מולקולרי לשפעת מזנים שונים שהתקבל מארגון הבריאות העולמי.

מחקר ופיתוח .4ב-2016 התחיל פיתוח ראקציה שמזהה את נגיף ה- ZIKA שמועבר ע"י יתושים וגורם לכאבי פרקים קשים בבני אדם במידה ונגיף זה מועבר מאישה הרה לעובר עשוי להיגרם לעובר נזק מוחי קשה המתבטא במיקרוצפליה. הפיתוח והתיקוף הסתיימו בשנת 2016

והבדיקה הקלינית אושרה.

גרף מס' 1:מספר גרמים שנבדקו ביחידת הטקמן לפי שנים

גרף מס' 2:מספר הגורמים שנבדקו עבור המרכזים השונים בשנת 2016

Page 43: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

42 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

גרף מס' 3:בדיקות לנגיפים שנעשו בכמויות גדולות בשנת 2016

גרף מס' 4:בדיקות לנגיפים שנעשו בכמויות קטנות בשנת 2016

Page 44: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 43

נושאי פעילות המרכז:ביצוע סקרי הנהלה.. 1מבדקים פנימיים וחיצוניים.. 2חריגות, אי-התאמות ופעולות מתקנות.. 3בקרת איכות.. 4הדרכות עובדים.. 5כיול למכשירים.. 6

במעבדה המרכזית לנגיפים קיימת התעדה למערכת איכות, בהתאם לדרישות תקןISO-9001 , החל משנת 2002 מטעם מכון התקנים הישראלי. מערך האיכות מוטמע היטב במעבדה, כך שמעורבים בפיתוחו, שימורו ושיפורו כל בעלי התפקידים במעבדה, החל בהנהלת המעבדה, מנהלי המרכזים הארציים והיחידות השונות ועובדי המעבדה, וכלה במערך המנהל והמשק הכולל את פקידות

הקבלה, אנשי הרכש ואנשי הסטרליזציה. המעבדה המרכזית לנגיפים הינה יחידה מקדמת איכות ומצוינות.

ביצוע סקרי הנהלה. 1בוצע סקר הנהלה בו נסקרו: מס' הבדיקות שבוצע בכל .1.1מרכז ארצי, מס' הדגימות שנשלחו מכל גורם שולח, נתונים על דגימות שהושמדו, נתונים על השתתפות בתכניות בקרת איכות חיצונית, נתונים על חריגות ותלונות לקוח, ביצוע מבדקים פנימיים וחיצוניים, וכיולים, נתונים על נתונים על תחזוקת מכשירים

הערכת ספקים, הדרכות עובדים וניהול סיכונים.הוצגו נתונים על תקציב המעבדה ונתוני איכות. .1.2

נקבעו יעדים בתחום השלמת כתיבת דוחות תיקוף, .1.3רישום מכשירים בשיבא ומניעת זיהומים.

מבדקים פנימיים וחיצוניים. 2בשנת 2016 בוצעו מבדקי איכות פנימיים במרכזים .2.1הארציים וביחידה להכנת מצעים. המבדקים בוצעו

על ידי צוות של שלושה עובדים.בוצעו 3 "מבדקי בזק" רוחביים על ידי מנהלת האיכות .2.2בנושאים: בדיקת שוני בין אצוות, קליטת דגימות והוצאת תשובות וניהול מלאי. הממצאים דווחו לסגנית

מנהלת המעבדה.

מבדק פיקוח שנתי של מכון התקנים נערך על ידי שני .2.3בודקים. התקבלו 8 ממצאים שתועדו וטופלו.

אירועים חריגים. 3)אי-התאמות, תלונות לקוח ופעולות מתקנות(

בשנת 2016 דווחו 72 אירועים חריגים, מתוכם 8 ממצאים ממבדק הפיקוח של מכון התקנים הישראלי בדצמבר 2015.

הבטחת איכות

מנהלת: מגר' נאוה צורי

Page 45: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

44 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

בקרת איכות. 4עלויות תכניות בקרת איכות חיצונית לשנת 2016: .4.1 30% ו 70% תכניות מולקולריות ,₪ 67,450 כ-

תכניות סרולוגיות.בשנת 2016 המעבדה השתתפה בהצלחה בתוכניות .4.2:(Proficiency Testing( בינלאומיות לבקרת איכות

מולקולאריות לבדיקות איכות בקרת תכניות Q C M D ל ש ת ו י נ כ ת : ף י ג נ י ו ה י ז ו

.(Quality Control for Molecular Diagnostics( CMV Whole Blood, EBV Whole Blood, לנגיפים:

HHV-6, Norovirus, hMPV, JCV, Enterviruses, Mumps,.Measles, Zika

תכנית של ארגון הבריאות העולמי למעבדות אדמת חברת של ואדמת חצבת וריצוף לזיהוי חצבת:

.INSTANDתכנית של ארגון הבריאות העולמי למעבדות שפעת:

WHO External Quality Assessment Program for the.Detection of Influenza Virus Type A by PCR

תכנית של ארגון הבריאות העולמי למעבדות פוליו – Proficiency test for National Laboratories of the WHO Polio Laboratory Network in the European Regionהכוללת 3 תכניות שונות: בידוד פוליו מתרביות תאים,

אפיון גנוטיפי של פוליו וריצוף זני פוליו.תכניות סרולוגיות לזיהוי נוגדנים כנגד נגיפים: תכנית סרולוגית של ארגון הבריאות העולמי

למעבדות אדמת וחצבת:.WHO Proficiency Panel for Measles and Rubella

Retesting, של ארגון הבריאות – תכנית סרולוגית העולמי למעבדות אדמת וחצבת.

Labquality תכנית לבקרת איכות לבדיקות סרולוגיות של.HIV לנגיף

RCPA תכניות לבקרת איכות לבדיקות סרולוגיות של CMV,EBV, VZV, Rubella, HSV Mumps, לנגיפים:

.Measles, Parvo B19 .Labquality תכנית לזיהוי אנטיגן נגיף הרוטה של

בשנת 2016 נמשך יישום הנוהל משנת 2014 לפיו כל .4.3דוח סופי של תכנית בקרת איכות חיצונית מנותח על ידי המנהל המקצועי ומנהלת האיכות וכאשר רלוונטי גם על ידי מנהל יחידת TaqMan. הניתוח תועד בטופס ייעודי אצל מנהלת האיכות. השימוש בטופס מבטיח

קריאה יסודית של הדוח, תוך מתן דגש על:השיטה המקובלת במעבדה לעומת שיטות מקובלות בעולם. ניתוח תוצאות לגביהן לא היה קונסנזוס – האם תלוי

שיטה/ מכשיר ספציפיים או קיימת בעיה כללית בזיהוי.הצעות לפעולה מתקנת כאשר נדרש.

ברוב מערכות הבדיקה במעבדה נעשה שימוש בבקרים .4.4מסחריים או בקרים בהכנה עצמית.

הדרכות עובדים. 5הדרכות כלל מעבדתיות: .5.1

בוצעה הדרכה בנושא איכות )נהלי חדר קבלת דגימות( ובטיחות )טיפול בשפך( על ידי מנהלת האיכות ויו"ר

ועדת בטיחות. בוצעה לומדת כיבוי אש + מבחן ותרגיל הפעלת מטף

לכלל העובדים מטעם מרכז רפואי שיבא.הדרכות פרטניות בנושאי איכות .5.2

איכות "הבטחת בקורס השתתפו עובדות שתי במעבדות בריאות הציבור" בהיקף של כ 60 שעות.

ביצוע כיולים. 6מערכת ניטור הטמפרטורות הוחלפה בסוף 2015. כיול .6.1הרגשים בשנת 2016 נעשה על ידי החברה במסגרת

הסכם השירות.נערכה כן כמו ותרמומטרים. ברומטר כוילו .6.2

ELISA ולידציה למכשירי האוטוקלאב וכוילו מכשיריREADER ומכשירי PCR. עלות כיולים חיצוניים לשנת

2016: כ 3000 ₪.המנדפים הביולוגיים והכימיים עברו ביקורת תקופתית. .6.3

פיפטורים כוילו על ידי המשתמשים. .6.4

Page 46: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 45

הכנת תרביות תאים, קרקעי מזון ותמיסות1 .Cell lines – שורות תאים

נעשו העברות רצופות של שורות התאים הבאות:

מס׳ העברותמוצא התרביתשם התרבית

BGM-Berg59כליית קוף

BHKכליית עובר אוגר-

L20B-NIBSCשל עכבר L cell74

HEp-2-cin58קנה נשימה אדם

Hu-kid65כליית אדם

RD-NIBSC63סרקומה אדם

MDCK/WHO100כליית כלב

MDCK/SIAT8כליית כלב

Vero/ATCC62כליית קוף

Vero/E661כליית קוף

Vero/SLAM55כליית קוף

RK-GSK11כליית ארנב

שימור תאים . 2 נמשך הטיפול בבנק התאים המוקפאים בחנקן נוזלי:

א. הקפאות לאחר דילול המלאיב. הפשרות של כל שורות התאים לפחות פעמיים בשנה

שורות התאים נבדקים לנוכחות מיקופלסמה בשיטת . 3PCR כל 4-5 חודשים.

הכנת תמיסות ומצעים:. 4

כמות בליטריםהמצע

M-199x25

Eagle MEM NAA200

Trypsin EDTA40

L-Glutamine2

PBSx1020

PBS180

120תמיסה לניקוי שולחנות

Antibiotic Sol8.2

44הכנות קטנות

Saline10

20500 מבחנותחלוקת מבחנות ליזיס

29ניקוי וכיול פיפטורים

היחידה לקרקעי מזון ותרביותמנהל המרכז: ד"ר איתי בר אור

צוות המרכז: מגר' אירנה אגובייב, מגר' ז'קלין אלפנדרי ומר סעיד )צביקה( כהן

Page 47: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

46 | המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016

1. Bercovich-Kinori A, Tai J, Gelbart IA, Shitrit A, Ben-Moshe S, Drori Y, Itzkovitz S, Mandelboim M, Stern-Ginossar N. A systematic view on Influenza induced host shut-off. Elife. 2016 Aug 15;5. pii: e18311.

2. Duev-Cohen A, Bar-On Y, Glasner A, Berhani O, Ophir Y, Levi-Schaffer F, Mandelboim M, Mandelboim O. The human 2B4 and NTB-A receptors bind the influenza viral hemagglutinin and co-stimulate NK cell cytotoxicity.Oncotarget. 2016 Mar 15;7(11):13093-105. doi: 10.18632/oncotarget.7597.

3. Diab M, Vitenshtein A, Drori Y, Yamin R, Danziger O, Zamostiano R, Mandelboim M, Bacharach E, Mandelboim O. Suppression of human metapneumovirus (HMPV) infection by the innate sensing gene CEACAM1. Oncotarget. 2016 Oct 11;7(41):66468-66479.

4. Human Herpesvirus 6B Downregulates Expression of Activating Ligands during Lytic Infection To Escape Elimination by Natural Killer Cells Schmiedel D, Tai J, Levi-Schaffer F, Dovrat S, Mandelboim O. J Virol. 2016 Oct 14;90(21):9608-9617. Print 2016 Nov 1.

5. Lustig Y, Lanciotti RS, Hindiyeh M, Keller N, Milo R, Mayan S, Mendelson E. (2016). Mutation in West Nile Virus Structural Protein prM during Human Infection. Emerg Infect Dis. 2016 Sep 15;22(9).

6. Lustig Y, Mannasse B, Koren R, Katz-Likvornik S, Hindiyeh M, Mandelboim M, Dovrat S, Sofer D, Mendelson E.(2016).Superiority of West Nile Virus RNA detection in whole blood for diagnosis of acute infection. J Clin Microbiol. 2016 Jun 22. pii: JCM.01283-16.

7. Lustig Y, Mendelson E, Paran N, Melamed S, Schwartz E (2016). Detection of Zika virus RNA in whole blood of imported Zika virus disease cases up to 2 months after symptom onset, Israel, December 2015 to April 2016. Euro Surveill. 2016 Jun 30;21(26).

8. Lustig Y, Mannasse B, Koren R, Katz-Likvornik S, Hindiyeh M, Mandelboim M, Dovrat S, Sofer D, Mendelson E. Superiority of West Nile Virus RNA Detection in Whole Blood for Diagnosis of Acute Infection. J Clin Microbiol. 2016 Sep;54(9):2294-7.

9. Lustig Y, Hindiyeh M, Orshan L, Weiss L, Koren R, Katz-Likvornik S, Zadka H, Glatman-Freedman A, Mendelson E, Shulman LM. Mosquito Surveillance for 15 Years Reveals High Genetic Diversity Among West Nile Viruses in Israel. J Infect Dis. 2016 Apr 1;213(7):1107-14.

10. Meltzer E, Leshem E, Lustig Y, Gottesman G, Schwartz E. (2016).The clinical spectrum of Zika virus in returning travelers. Am J Med. 2016 May 31.

11. Meir-Gruber L, Manor Y, Gefen-Halevi S, Hindiyeh MY, Mileguir F, Azar R, Smollan G, Belausov N, Rahav G, Shamiss A, Mendelson E, Keller N. Population Screening Using Sewage Reveals Pan-Resistant Bacteria in Hospital and Community Samples. PLoS One. 2016 Oct 25;11(10):e0164873.

12. Meltzer E, Lustig Y, Leshem E, Levy R, Gottesman G, Weissmann R, Rabi DH, Hindiyeh M, Koren R, Mendelson E, Schwartz E. Zika Virus Disease in Traveler Returning from Vietnam to Israel. Emerg Infect Dis. 2016 Aug;22(8):1521-2.

13. Rahav G, Hagin M, Maor Y, Yahalom G, Hindiyeh M, Mendelson E, Bin H. Primary Versus Nonprimary West Nile Virus Infection: A Cohort Study. J Infect Dis. 2016 Mar 1;213(5):755-61.

14. Shulman LM, Manor Y, Hindiyeh M, Sofer D, Mendelson E. Molecular Characterization of Polio from Environmental Samples: ISSP, The Israeli Sewage Surveillance Protocol. Methods Mol Biol. 2016;1387:55-107.

15. Salama M, Amitai Z, Amir N, Gottesman-Yekutieli T, Sherbany H, Drori Y, Mendelson E, Carmeli Y, Mandelboim M. Outbreak of adenovirus type 55 infection in Israel. J Clin Virol. 2016 May;78:31-5.

16. Scheuerman O, Barkai G, Mandelboim M, Mishali H, Chodick G, Levy I. Human metapneumovirus (hMPV) infection in immunocompromised children. J Clin Virol. 2016 Jun 17;83:12-16.

17. Sharabi S, Drori Y, Micheli M, Friedman N, Orzitzer S, Bassal R, Glatman-Freedman A, Shohat T, Mendelson E, Hindiyeh M, Mandelboim M. Epidemiological and Virological Characterization of Influenza B Virus Infections. PLoS One. 2016 Aug 17;11(8):e0161195. doi: 10.1371/journal.pone.0161195. eCollection 2016.

18. Talmi-Frank D, Altboum Z, Solomonov I, Udi Y, Jaitin DA, Klepfish M, David E, Zhuravlev A, Keren-Shaul H, Winter DR, Gat-Viks I, Mandelboim M, Ziv T, Amit I, Sagi I. Extracellular Matrix Proteolysis by MT1-MMP Contributes to Influenza-Related Tissue Damage and Mortality. Cell Host Microbe. 2016 Oct 12;20(4):458-470.

19. Weil, M., M. Mandelboim, E. Mendelson, Y. Manor, L. Shulman, D. Ram, G. Barkai, Y. Shemer, D. Wolf, Z. Kra-Oz, L. Weiss, R. Pando, M. Hindiyeh, and D. Sofer. 2017. Human enterovirus D68 in clinical and sewage samples in Israel. J Clin Virol 86:52-55.

20. Weil, M., L. M. Shulman, S. Heiman, T. Stauber, J. Alfandari, L. Weiss, I. Silberstein, V. Indenbaum, E. Mendelson, and D. Sofer. 2016. Prolonged excretion of type-2 poliovirus from a primary immune deficient patient during the transition to a type-2 poliovirus-free world, Israel, 2016. Euro Surveill 21.

21. Yaari, R., E. Kaliner, I. Grotto, G. Katriel, J. Moran-Gilad, D. Sofer, E. Mendelson, E. Miller, A. Huppert, E. Anis, E. Kopel, Y. Manor, O. Mor, L. Shulman, R. Singer, and M. Weil. 2016. Modeling the spread of polio in an IPV-vaccinated population: lessons learned from the 2013 silent outbreak in southern Israel. BMC Med 14:95.

22. Yaari R, Katriel G, Stone L, Mendelson E, Mandelboim M, Huppert A. Model-based reconstruction of an epidemic using multiple datasets: understanding influenza A/H1N1 pandemic dynamics in Israel. J R Soc Interface. 2016 Mar;13(116). pii: 20160099. doi: 10.1098/rsif.2016.0099.

23. Manor Y, Lewis M, Ram D, Daudi N, Mor O, Savion M, Kra-Oz Z, Shemer Avni Y, Sheffer R, Shouval D, Mendelson E. Evidenca for Hepatitis A virus endemic circulation in Israel despite universal toddlers' J Infect Dis. 2016 Dec 23. PII: JIW611.

רשימת מאמרים

Page 48: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

המעבדה המרכזית לנגיפים - דו״ח שנתי 2016 | 47

1. Evaluation of Xpert® HIV-1 Qual as an HIV-1 confirmatory assay. Orna Mor, Yael Gozlan, Ella Mendelson, Izchak Levi, Mari Bakhanashvili. Not accepted, by the Israeli AIDS society.

2. Is NGS analysis beneficial for the identification of resistance associated substitutions in patients failing direct acting antiviral treatment? Yael gozlan, Maria Likhter Orna Mor. Accepted by the Israeli society of liver diseases.

הרצאותזיהומיות מחלות של וניטור לאבחון מעבדתיות "שיטות קורס ניתן בביה"ס לבריאות נבחרות" - קורס אקדמי חד - סמסטריאלי ב, לתארים מתקדמים. במהלך סמסטר לימודים הציבור במסגרת

תשע"ו.

מרכזי הקורס: פרופ' אלה מנדלסון ופרופ' לסטר שולמן.

מרצים: ד"ר ארנה מור

בנושא: "HIV והפטיטיס".

פרופ' לסטר שולמן בנושא: "פוליו ואנליזות מולקולריות"

ובנושא: "גסטרואנטריטיס".

ד"ר מיכל מנדלבויםבנושא: "שפעת ונגיפים נשימתיים".

ד"ר מוסה הינדייהבנושא: " עמידות לתרופות בחיידקים".

פרופ' אלה מנדלסון בנושאים:

1. "מעבדות לבריאות הציבור בישראל ובעולם". 2. "מבוא לשיטות מעבדה".

3. "אבחון נגיפים זואונוטיים".4. "אבחון נגיפים הגורמים לפגיעה בעובר".

כמו"כ, הקורס כלל הרצאות בנושאי שחפת ובדיקות מעבדה לניטורמקורות מים ומזון שניתנו ע"י מרצים מהמעבדה לבריאות הציבור בתל אביב: ד"ר אפרת רורמן, ד"ר דרורה גולדבלט וד"ר ראנטה ברויאר.

1. Y. Gozlan, Z. Ben Ari, R. Moscona, A. Rakovsky, R. Shirazi, E. Weitzman, Tania Bradichevsky, P. Weiss, A. Hassid, K. Tsaraf, Y. Luria, Oren Shibolet, Eli Zuckerman, M. Brown, M. Cohen-Naftali, O. Peleg, E. Mendelson and O. Mor .Baseline and treatment failure resistance analysis in HCV GT1 patients treated with first and second generation direct acting antivirals. Israeli society of

the study of the liver annual meeting, Eilat, 2016.

1. Subtype analysis and the impact of resistance associated variants on 2nd generation DAA treatment outcome in a cohort of HCV GT1 carriers in Israel Y Gozlan, Z. Ben-Ari, R. Moscuna, A. Kabat, H. Shirazi, K. Tsaraf, E. Weizmann, T. Berdichevski, Y. Luria, E. Mendelson, O. Mor. 14th European Meeting on HIV & Hepatitis - Treatment Strategies & Antiviral Drug Resistance, Rome 2016.

2. D. Ram, Y. Manor, Y. Gozlan, E. Schwartz, Z. Ben-Ari, E. Mendelson, O. Mor Hepatitis E virus genotypes 3 in sewage and genotype 1 in sporadic acute cases in Israel. EASL 2016, Barcelona R. Moscona, D. Ram, M. Gelbart, A. Stern, E. Mendelson & O. Mor. The prevalence of transmitted drug resistance mutations as identified by next generation sequencing compared to population sequencing in recently infected HIV-1 carriers in Israel. ISM 2016, Bar Ilan.

3. Z. Ben Ari, Y. Gozlan, R. Moscuna, A. Rakovsky, M. Michaeli, Y Sandak, A. Hassid, K. Tsaraf, E. Weizman, E. Mendelson, O. Mor. Subtype analysis and resistamce associated variants in naïve HCV GT1 carriers in Israel. ISM 2016, Bar Ilan.

4. M. Michaeli, M. Wax, Y. Gozlan, A. Rakovsky and E. Mendelson and O. Mor. Resolution of Geenius HIV-1/2 negatibe or indeterminate results with XPERT QUAL assay. ISM 2016, Bar Ilan.

5. D. Ram, Y. Manor, Y. Gozlan, E. Schwartz, Z. Ben-Ari, E. Mendelson, O. Mor Hepatitis E virus genotypes 3 in sewage and genotype 1 in sporadic acute cases in Israel. ECMID 2016, Amsterdam.

6. D. Ram, Y. Manor, Y. Gozlan, E. Schwartz, Z. Ben Ari, E. Mendelson, P. Shaul, O. Mor. Hepatisis E? in Israel. Israeli society of the study of the liver annual meeting, Eilat, 2016

7. O. Mor, K. Olshtain-Pops. Integrase inhibitor (INI) resistance analysis in treatment naïve and experienced HIV-1 patients. Annual meeting for the Israeli AIDS society, Ein Gedi, 2016.

8. O. Mor, R. Shirazi, K. Olstein, I. Levy. HIV-1 in CSF and plasma of naïve and treated individuals. Annual meeting for the Israeli AIDS society, Ein Gedi, 2016.

גרנטים שהוגשו פוסטרים בכנסים

Page 49: תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה...Central Virology Laboratory 2016 תואירבה דרשמ - רוביצה תואירבל תודבעמה א"ת תטיסרבינוא

Central Virology Laboratory

2016

המעבדות לבריאות הציבור - משרד הבריאות

מסונפת לביה"ס לבריאות הציבור, אוניברסיטת ת"א

2016

תי שנ

ח דו

פינגי

לת

כזימר

הדה

עבהמ

המרכז הרפואי עש חיים שיבאתל השומר 52621, ישראל

טל: 03-5302388, פקס: 03-5302457

Chaim Sheva Medical CenterTel-Hashomer, 52621, IsraelTel: 972-3-530-2388, Fax: 972-3-530-2457