surveillance programmée de la résistance aux antibiotiques ... · % resistance. ceftazidime. ......

Surveillance programmée de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries d’origine

animale : résultats majeurs en 2017

LNR résistance antimicrobienne Agnès Perrin-Guyomard, Anses

Laboratoire de Fougères

Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016

15/11/17 Rencontres scientifiques de l’Anses 2

Surveillance programmée, continue, harmonisée Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques chez les animaux producteurs d’aliments : volailles (années paires), animaux de boucherie (années impaires) Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques des bactéries d’origine alimentaire (diffusion dans la chaîne alimentaire et exposition du consommateur ) Suivre les tendances et les émergences


15/11/17 Rencontres scientifiques de l’Anses 3

Texte d’exécution Décision 2013/652/UE

Base réglementaire Directive zoonose 2003/99/CE

LNR Résistance Antimicrobienne

Laboratoires d’analyses agréés

Instructions techniques Notes de service DGAl

Pilotage

Services déconcentrés

Prélèvements

Isolements

CMI


Rencontres scientifiques de l’Anses

4

Filière : volailles Elevage : prélèvements d’environnements (contrôles officiels) Abattoir : carcasses et caeca Distribution : viandes fraîches de poulet

Prélèvements

Poule pondeuse Poulet de chair Dinde

15/11/17



5

Echantillonnage

- non ciblé, aléatoire

- uniforme sur tous les mois de l’année (du 01/01 au 31/12)

- représentatif de la production française, proportionnel à la population humaine

- au moins 300 prélèvements de caeca et 300 prélèvements de viandes

- 170 isolats pour chaque combinaison espèce bactérienne/espèce animale

15/11/17


Rencontres scientifiques de l’Anses 6

- Salmonella spp.

- Campylobacter jejuni

- Escherichia coli commensales indicatrices (flore dominante/caeca)

- Escherichia coli résistantes aux céphalosporines ou carbapénèmes BLSE/AmpC/Carba (flore sous-dominante/ caeca et viandes) : enrichissement et recherche sélective sur milieu avec antibiotiques

Isolements

15/11/17



7

Sensibilité aux ATBs

- Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) en milieu liquide

- Microplaques harmonisées au niveau européen

Panel 1 : E. coli/Salmonelles = 14 antibiotiques (9 familles) ; Campylobacter = 6 antibiotiques (4 familles)

Panel 2 : 10 antibiotiques (famille des β-lactamines)

- Interprétation selon les seuils épidémiologiques de l’EUCAST2

- Remontée des données à l’EFSA (rapport européen)

- Séquençage des souches présentant des profils d’intérêt (LRUE)

15/11/17



8 15/11/17

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca

Multirésistance (R) chez le poulet (N=188) et chez la dinde (N=182)

20,2

13,8

7,4

15,4

22,9

14,4

4,3

1,6

Sensible

1R

2R

3R

4R

5R

6R

7R

0 5 10 15 20 25

Pourcentage de souches dans la catégorie

18,7 12,6

16,5

15,9

14,8

17 3,3

0,5

0,5

Sensible

1R

2R

3R

4R

5R

6R

7R

8R

0 5 10 15 20

Pourcentage de souches dans la catégorie

17% en 2007* 4,5% en 2007*

AMP-TET-SMX-TMP AMP-TET-SMX-TMP-CIP



9 15/11/17

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

% re

sist

ance

Ampicilline

Sulphaméthoxazole

Tétracycline

Triméthoprime

Ciprofloxacine

Acide Nalidixique


Evolution dans le temps (% de résistance élevés)

Diminution significative. Testé par une régression linéaire simple



10 15/11/17

0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

20

2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

% re

sist

ance

Ceftazidime

Céfotaxime

Chloramphénicol

Gentamicine

Colistine

Méropénème

Diminution significative. Testé par une régression linéaire simple


Evolution dans le temps (% de résistance modérés à rares)



11 15/11/17


Evolution dans le temps (% de résistance élevés)

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

% ré

sist

ance

Ampicilline

Chloramphénicole

Ciprofloxacine

Acide Nalidixique

Sulphaméthoxazole

Tétracycline

Triméthoprime



12 15/11/17

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

% ré

sist

ance

Céfotaxime

Ceftazidime

Colistine

Gentamicine

Méropénème


Evolution dans le temps (% de résistance modérés à rares)



13 15/11/17

Caeca Viande

Flore dominante Flore sous-dominante (Recherche Sélective)

3,2% (N souches =188) 44% (N prélèvements =300) 63,2% (N prélèvements =321)

0,5% (N souches =182) 28% (N prélèvements =300)

E. coli résistantes aux céphalosporines

‒ Co-Résistances associées : TET et SMX majoritairement

‒ pas de souche productrice de carbapénèmase



14 15/11/17

Antibiotiques (Seuil épidémiologique en mg/L)

Poulet (N=188) Dindes (N=164)

n % [intervalle de confiance] n % [intervalle de

confiance]

Ciprofloxacine (0,5) 123 65,4 [58,6-72,2] 95 57,9 [50,4-65,5] Acide nalidixique (16) 119 63,3 [56,4-70,2] 88 53,7 [46,0-61,3]

Tétracycline (1) 127 67,6 [60,9-74,2] 115 70,1 [63,1-77,1]

Gentamicine (2) 0 0,0 [0,0-1,6] 0 0,0 [0-1,8]

Streptomycine (4) 2 1,1 [0,0-2,5] 1 0,6 [0-1,8]

Erythromycine (4) 0 0,0 [0,0-1,6] 0 0,0 [0-1,8]

Sensibilité aux antibiotiques/Campylobacter jejuni /caeca



15 15/11/17

20.2%

25,0%

54,8%

Sensibles

1R

2R

Sensibles

1R

2R

CIP-TET

23,2%

25,6%

50,6%

0,6%

Sensibles

1R

2R

3R

Sensibles

1R

2R

3R

CIP-TET

Sensibilité aux antibiotiques/ Campylobacter jejuni /caeca

Multirésistance (R) chez le poulet (N=188) et chez la dinde (N=164)



16 15/11/17

Sensibilité aux antibiotiques/ Campylobacter jejuni /caeca

Evolution dans le temps

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

100%

2009 2010 2011 2012 2013 2014 2016

% r

ésis

tanc

e

Tétracycline

Ciprofloxacine

Acide nalidixique

Streptomycine

Gentamicine

Erythromycine



17 15/11/17



18 15/11/17

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca Evolution dans le temps



19 15/11/17

Multirésistance/E. coli indicatrices/caeca



20 15/11/17

Travaux de recherche

Publiés



21 15/11/17

- Epidémiologie de la résistance à la colistine en élevage (Agnès Perrin-Guyomard, Isabelle Kempf, Yannick Blanchard, Pamela Houée, Laetitia Ledevendec)

- Caractérisation de plasmides de E. coli résistants aux céphalosporines de troisième génération isolés de poulets de chair (Fabrice Touzain, Laetitia Le Devendec, Claire de Boisseson, Sandrine Baron, Eric Jouy, Agnès Perrin-Guyomard, Blanchard Yannick, Isabelle Kempf)

- Analyse des résultats et propriétés des systèmes de surveillance : évaluation du lien entre usage et antibiorésistance et de l’impact des mesures de gestion des risques mises en place en France (Claire Chauvin, Julie David, Pascal Sanders, Agnès Perrin-Guyomard, Mireille Bruneau, Gérard Moulin, Anne Chevance, Eric Jouy)

Travaux de recherche

En cours


16/11/16 Rencontres scientifiques de l’Anses

22

Conclusions

‒ Campylobacter jejuni (poulet) : augmentation des % de R aux quinolones et fluoroquinolones

‒ E. coli : o Diminution de certains pourcentages de résistance o % de souches sensibles à tous les antibiotiques en progression

‒ E. coli BLSE : proportion de prélèvements de viandes de poulet + >50%

Perspectives ‒ Consolider la réduction des % de résistance

‒ Réduire la prévalence des E. coli BLSE dans la viande de poulet à la distribution

Remerciements

Les Services Déconcentrés

Les Laboratoires agréés

Anses Fougères Anses Maisons Alfort

Anses Lyon Anses Ploufragan

surveillance programmée de la résistance aux antibiotiques ... · % resistance. ceftazidime. ......

Documents