spezielle genetik und molekularbiologie ss 2006 ribosomes mol. biol. of the cell
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Spezielle Genetik und Molekularbiologie SS 2006
Ribosomes
Mol. Biol. of the Cell
Spezielle Genetik und Molekularbiologie SS 2006
Prokaryotic ribosome
Mol. Biol. of the Gene
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Eukaroytic ribosome
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Sedimentation of ribosomes
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The „ribosome cycle“
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Polyribosomes (polysome)
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Peptidyl transferase reaction
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tRNA binding sites
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Overview on translation initiation
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Ribosome binding site (Shine-Dalgarno sequence) on mRNA
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Internal start site are important for polycistronic mRNAs
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N-formyl methionine
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Initiation factors bound to the ribosome
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Sequence of events during initiation in prokaryotes
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Capping
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Translation initiation in eukaryotes
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Start codon identification in eukaryotes
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Kozak sequence at start codon:G/ANNAUGG
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Circular polysomes in eukaryotes
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Circular polysomes
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Short upstream ORFs in eukaryotes
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Internal ribosome entry sites in eukaryotes (IRES)
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Overview of the elongation phase
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Binding of aa-tRNA to the A-site
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EF-Tu:protection of ester from hydrolysischeck for correct codon recognition
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Codon recognition by the anticodon
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EF-Tu GTP hydrolysis in codon recognition
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Accommodation as the second recognition control step
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Translocation
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Release factors
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Class I (stop codon recognition)prokaryotic:RF1: UAG, UAARF2: UGA, UAA
eukaryotic:eRF1: UAA, UAG, UGA
Class II (diss. of class I factors)RF3eRF3
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Action of release factors
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Ribosome recycling factor
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