“soluciones de big data como herramientas de mejoramiento...

“Soluciones de Big Data como herramientas de mejoramiento genético”

Ing Agr. Nicolas Garcia DutriezGerente de Proyectos y Coordinación

Resumen

• Descripción del problema

• Metodología de trabajo / Soluciones en producción

• Análisis Información y necesidades a mediano-largo plazo

Don Mario hoy

750Empleados

187 Localidades Investigacion

9Estaciones

Headquarters CAMBÉParaná State

BRASILPto Nacional (TO) – Rio

Verde (GO) – P.Fundo (RS) y L. de Rio V. (MT)

HeadquartersSan Isidro

ARGENTINA

CHACABUCOProvincia de Bs As

ARGENTINA

321 R&D Localidades

CHARATAProvincia de Chaco

ARGENTINA

DEWITTArkansas

EEUU

Don Mario en la cadena de valor

Genetica y semillas de

soja

Produccion primaria Industrialización

Produccionde granos

Production:

•Harina•Aceite•Biodiesel•Alimentacion animal•Alimentos humana

Mercados int y ext

Otros insumosBiotecnología

19 LOCS – 40.000 PLOTS

6 EMPLOYEE

32.000.000 has

70 LOCS – 350.000 PLOTS

50 EMPLOYEES

28.000.000 has

60 LOCS - 675.000 PLOTS

72 EMPLOYEES

19.000.000 has


3 EMPLOYEES

1.000.000 has


3 EMPLOYEES

1.500.000 has2 LOCS – 500 PLOTS

400.000 has

6 LOCS – 2700 PLOTS

3 EMPLOYEES

2.500.000 has

PROGRAMA GLOBAL DE MEJORAMIENTO

BASE DE GERMOPLASMA

• Amplitud: esta definida por el tamaño o escala del programa y por la cantidad de individuos evaluados año tras año. Medición: variedades y microparcelas.

• Diversidad: es la variabilidad genética que existe entre los individuos evaluados. A > Diversidad > probabilidad de encontrar variedades adaptadas a la s distintas exigencias agroecológicas.

• Distribución Espacial: Red de Ensayos . Nos permite explorar la Amplitud y la Diversidad con el mayor grado de precisión posible. Atender las necesidades de las distintas micro y macro regiones , encontrando el mejor producto para cada una de ellas.

INVERSIÓN EN INVESTIGACIÓN

PONER TEXTO FUERA DE IMAGEN

INVESTIGACION DESARROLLO Y PROMOCION

20/70 LOCALIDADESx 3 REPETICIONES

PRODUCCION




6 LOCALIDADESx 2 REPETICIONES

6 LOCALIDADESx 1 REPETICIONES

1 LOCALIDADES x 1 REPETICIONES

50/70 LOCALIDADES

22/70 LOCALIDADES40 PRECOMERCIALES

300 ELITE LINES

1.000 LINEAS ELITE

10.000 LINEAS PREAVANZADAS

40.000 LINEAS PRELIMINARES

400.000 SURCOS PROGENIE

1000 a 4000 ha. Pre- básica

50a 150 ha. Fundadora seed

3 ha. Breeder

200 Kg.

10 Kg.

VARIEDADES COMERCIALES

CB - POBLACIONES

5-6 AÑOS

Programa de mejoramiento global

Escala programa mejoramiento

Sistema Investigación

Biotecnología

Escala & Complejidad

PBS

Baufest

MASTERPLAN PBS-MAX

• 7 PERSONAS TRABAJANDO

• ALTA INVERSIONAnálisis Transacción

Base de Datos de Información

Biológica de Variedades

Base de Datos Transaccional

Business Analytics

Statistical Analysis

Sistema de Investigación *

Laboratory Information Management System

Colaboración: Portal de Investigación

Búsqueda Consolidada

SeguridadSeguridad

Portal de Capacitación y Self ServicePortal de Colaboración

E-learningGestión del Conocimiento Base de Datos Documental

Planificacion PBS-MAX

� Cría� Testing

• Ensayos• Incrementos

� Análisis• Análisis de Lógica• Análisis Estadísticos• Análisis de Negocio

Reportes� Operaciones

Macroprocesos Contexto Interno Contexto Interno

� Stewardship� Seguridad� Trigo� Sanidad

ago sep oct nov dic ene feb mar abr ## jun jul ago sep oct nov dic ene feb mar abr ## jun jul ago sep oct nov dic ene feb mar abr ## jun jul ago sep oct nov dic

2012 2013 2014 2015

PLAN

CAMP

12-13

CLAVES POR SIST. + SEL FINAL

PESADA 12-13

REORG.MENUS

INCREMENTOS

USA

SEL PREL Y CONTROL DE

TIRADA

PYTO BAUFEST

BRASIL

PY BOL-TUCU

DESARROLO DE HERRAMIENTAS DM

LOG GALPON

SEL +

INTEGRACION BRASIL

AYUDA

ANAL.SANIT. INCREMENT

IMPL. TABLETS

REPORTES

CRIA

INICIO PYTO

BAUFEST

TABLETA

SANIDAD

GALPON

COSTOS-VIABILIDAD

LIMS SHAREPOINT

HERRAMIENTAS DE ANÁLISIS

INTEGRACION USA

CONECTIVIDAD BRASIL + TUCUMAN + DE WITT

COSTOS-VIABILIDADEJECUCION

SIS NUEVO (Fase 1)

SIS ACTUAL:EVOL

PESADA 13-14

USABRASIL

TUCUMAN

PESADA + SEL ASINC

ANALISIS BAUFEST

Estructura / Equipos de trabajo

� Negocio� Conexiones

Datos Fenotipicos

Datos de rendimiento: 1,200,000

Datos sanitarios: 600,000

Datos de campo: 3,000,000

Datos Laboratorio de Biotecnologia

Seleccion de genes de Traits

Fingerprint

Nuevos marcadores

Seleccion de genes de Traits

Analisis de Pureza

Seleccion assistida por marcadores

Presencia adventicia

Datapoints : 5,000,000

ADN de la soja

• 20 Cromosomas

• 46,400 genes (mas del doble que el humano)

• 1,100,000,000 pares de bases

Célula

Núcleo Cromossomo

DNA

Gene

Fragmento de ADN responsable por el control de uma

determinada caracteristica

Marcadores moleculares

ACTGCTATGCTAGCTAGCTGACTAGCTGATCGATGCTGACTAGCTA

ACTGCTATGCTAGCTAGGTGACTAGCTGATCGATGCTGACTAGCTA

ACTGCTATGCTAGCTAGCTGACTAGCTGATCGATGCTGACTAGCTA



Suscetível

Suscetível

Resistente

Resistente

Resistente

SNP (Single Nucleotide Polimorphism)

Secuencia de DNA ligada a un gen o dentro de la secuencia del gen de interes

Biotecnologia GDM

Selección asistida por marcadores moleculares

• Selección de genes de interés

• Backcross asistido

• Fingerprints

• Selección de regiones con QTL

Selección genómica amplia

• Valor genético

• Blup

El futuro

Análisis complejos

Rendimiento

Sanidad

Marcadores moleculares

Infometeorologica

Info suelos

Data mining

Modelos de simulación

GWS

Predicciones

Interpretacionde resultados

/ interacciones

Muchas Gracias!

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