sirna@rnai

22
หหหหหหห 1 - หหหหหหหหหหหหหหหหหหหหห RNAi Technology คคคคคคคค RNA interference (RNAi) คคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคค คคค คคคคค คคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค double strand RNA (dsRNA) คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค messenger RNA (mRNA) คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคค คคคคคคคคคค RNAi คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค eukaryotic cell คคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคค 3 คคคค คคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคค (genome) คคค jumping genes คคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค RNAi คคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคค dsRNA คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค dsRNA คคคคคคคคคคคค short interference RNA (siRNA)คคค Dicer คคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคค Dicer คค คคคคคคคคคค RISC complex คคคคคคคคค คคคคคคคคค RNA คคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคค RNAi คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค (genome) คคค Jumping genes (transposons) คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคค Jumping genes คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค คคคคคคคคคคคคค Jumping genes คคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคคค

Upload: api-19918078

Post on 16-Nov-2014

116 views

Category:

Documents


9 download

TRANSCRIPT

Page 1: siRNA@RNAi

หน้�าที่�� 1 - ความหมายและความสำ�าค�ญ RNAi Technology

ความหมายRNA interference (RNAi) ค�อ กระบวนการในการควบค�มการแสดงออกของลั�กษณะทางพั�นธุ�กรรมอย�างหน��ง ซึ่��งพับท�!งในพั�ช ส�ตว$ แลัะมน�ษย$ โดยอาศั�ยการท'างานของช(!นส�วน double strand RNA (dsRNA) ซึ่��งเม��อผ่�านกระบวนการต�างๆแลั,ว จะม.ผ่ลัไปย�บย�!งการท'างานของ messenger RNA (mRNA) ของย.นหน��งๆอย�างจ'าเพัาะ จ�งม.ผ่ลัย�บย�!งการท'างานของย.นน�!นได, ความส'าค�ญRNAi เป2นกระบวนการท.�เก(ดข�!นโดยปกต(ตามธุรรมชาต(ของ eukaryotic cell

ท��วไป ซึ่��งกระบวนการเหลั�าน.!ม.ความส'าค�ญมากต�อการด'ารงอย3�ของส(�งม.ช.ว(ต โดยเฉพัาะส(�งม.ช.ว(ตช�!นต'�า หน,าท.�ส'าค�ญของกระบวนการน.!อาจกลั�าวโดยสร�ปได,เป2น 3 ด,าน ค�อ การป5องก�นแลัะต�อต,านการต(ดเช�!อไวร�ส การป5องก�นจ.โนม (genome) จาก jumping genes แลัะ การควบค�มการแสดงออกของย.น RNAi ม.ความส'าค�ญในกระบวนการป5องก�นแลัะต�อต,านการต(ดเช�!อไวร�ส โดยเฉพัาะอย�างย(�งในส(�งม.ช.ว(ตช�!นต'�า ไวร�สหลัายชน(ดม.สารพั�นธุ�กรรมเป2นแบบ dsRNA ซึ่��งเม��อไวร�สเหลั�าน.!ปลัดปลั�อยสารพั�นธุ�กรรมเข,าส3�เซึ่ลัลั$ dsRNA จะถู3กต�ดเป2น short interference RNA

(siRNA)โดย Dicer ซึ่��งเป2นเอ7นไซึ่ม$ท.�ม.อย3�แลั,วในส(�งม.ช.ว(ตบางชน(ด จากน�!น Dicer

จะกระต�,นให, RISC complex เข,ามาจ�บ แลัะต�ดสาย RNA เก(ดการย�บย�!งการสร,างโปรต.น ท'าให,ไวร�สไม�สามารถูก�อโรคได, RNAi ย�งม.ความส'าค�ญในการป5องก�นจ.โนม (genome) จาก Jumping genes

(transposons) ซึ่��งเป2นลั'าด�บของด.เอ7นเอ ท.�สามารถูเคลั��อนท.�ไปได,ท��วจ.โนมของส(�งม.ช.ว(ต แลัะพับ Jumping genes ได,ในส(�งม.ช.ว(ตท�กชน(ด ซึ่��งในกรณ.ท.� Jumping

genes เคลั��อนไปอย3�ในต'าแหน�งท.�ไม�ถู3กต,องแลัะม.ความส'าค�ญจะท'าให,เก(ดความเส.ยหาย แก�เซึ่ลัลั$ของส(�งม.ช.ว(ตได, Jumping genes หลัายๆชน(ดท'างานโดยการถูอดรห�ส ด.เอ7นเอ ให,เป2น RNA ก�อน แลัะจากน�!นจะถูอดรห�สกลั�บเป2นด.เอ7นเอแลั,วไปแทรกอย3�ในต'าแหน�งอ��นๆของจ.โน มต�อไป บ�อยคร�!งท.� RNA ท.�เก(ดข�!นจะเป2น dsRNA

แลัะเป2นต�วเร(�มต,นกระบวนการ RNAi ด�งน�!น RNAi จ�งม.บทบาทช�วยป5องก�นจ.โนมจาก Jumping genes โดยการท'าลัาย dsRNA นอกจากน�!น RNAi ย�งเป2นกลัไก

Page 2: siRNA@RNAi

ส'าค�ญท.�ม.บทบาทในการควบค�มการแสดงออกของย.น ท.�พับในส�ตว$หลัายชน(ด ต�!งแต�ระด�บกลั��มหนอนพัยาธุ(จนถู�งระด�บส�ตว$เลั.!ยงลั3กด,วยน'!านม พับว�าย.นหลัายร,อยต'าแหน�งในจ.โนมของมน�ษย$จะได,ร�บการถูอดรห�สออกมาเป2น RNA ขนาดเลั7กท.�เร.ยกว�า microRNA (miRNA) ซึ่��ง miRNA จะบรรจ�ช(!นส�วนของลั'าด�บของย.นต�างๆ ด�งน�!น miRNA เหลั�าน.!จ�งอาจเก(ดเป2นโครงสร,างสายค3�ได, เช�น เก(ดเป2น hairpin RNA

(hpRNA) เม��อเก(ดเป2น hpRNA ท.�เป2น dsRNA ข�!นจะเป2นการกระต�,นให,เร(�มกระบวนการ RNAi ท'าให,เก(ดการย�บย�!งการแสดงออกของย.น ป8จจ�บ�นเป2นท.�ทราบก�นว�า miRNA ม.บทบาทส'าค�ญต�อการพั�ฒนาของส(�งม.ช.ว(ตแลัะการควบค�มการท'างานของเซึ่ลัลั$ โดยม.ส�วนร�วมในกระบวนการพั�!นฐานทางช.วว(ทยาต�างๆ ไม�ว�าจะเป2นการเปลั.�ยนแปลังไปท'าหน,าท.�เฉพัาะของเซึ่ลัลั$ (cell differentiation) การตายตามโปรแกรมเฉพัาะของเซึ่ลัลั$ (apoptosis) เป2นต,น

ประว�ต(พั�ฒนาการของความร3 ,ความเข,าใจเก.�ยวก�บ RNAi คาดว�าเร(�มข�!นเม��อ ในป; 1990

Jorgensen แลัะคณะ รายงานปรากฏการณ$ท.�เขาท'าการทดลัองในการพัยายามท'าให,ส.ของดอกพั(ท3เน.ย (petunia) ม.ส.เข,มข�!น โดยการใส�ย.นท.�จะกระต�,นการสร,างรงคว�ตถู�ส.แดงจากภายนอกเข,าไป แต�ผ่ลัท.�พับ ค�อ ย.นสารส.ของดอกพั(ท3เน.ย หย�ดการท'างานลัง ซึ่��งในขณะน�!นย�งไม�สามารถูอธุ(บายได,ว�าอะไรเป2นสาเหต�ของปรากฏการณ$ด�งกลั�าว แต�เม��อมองย,อนกลั�บไป อาจถู�อได,ว�า Richard Jorgensen แลัะคณะเป2นกลั��มบ�คคลัแรกท.�รายงานถู�งลั�กษณะท.�คลั,ายก�บผ่ลัจากการเก(ดกระบวน การ RNAi ในป;เด.ยวก�นน.!ย�งม.การค,นพับปรากฏการณ$ท.�คลั,ายก�นอ.กโดย van der Krol แลัะคณะเม��อท'าการใส� dihydroflavonol-4-reductase (DFR) or chalcone

synthase (CHS) genes เข,าไปในดอกพั(ท3เน.ยแลัะ Smith แลัะคณะเม��อท'าการใส� chimaeric polygalacturonase (PG) gene ในมะเข�อเทศั ซึ่��งในป;1990 น.!ได,ม.การก'าหนดช��อเร.ยกปรากฏการณ$ด�งกลั�าวว�า post transcriptional gene

silencing (PTGS) ต�อมาในป; 1992 Macino แลัะ Romano ได,ม.การค,นพับปรากฏการณ$ท.�ใกลั,เค.ยงก�นใน Neurospora crassa เม��อใส�ย.นท.�ท'าให,ม.การแสดงลั�กษณะเผ่�อกโดยพับว�า Neurospora crassa บางส�วนไม�ม.การแสดงลั�กษณะ

Page 3: siRNA@RNAi

เผ่�อก ซึ่��ง Macino แลัะ Romano เร.ยกปรากฏการณ$ด�งกลั�าวว�า quelling

อย�างไรก7ตามย�งไม�ม.ผ่3,ท.�สามารถูอธุ(บายได,ว�าอะไรค�อกลัไกท.�ท'าให,เก(ด ลั�กษณะด�งกลั�าว จนกระท��งในป; 1998 ม.น�กว(ทยาศัาสตร$ชาวอเมร(ก�น 2 คน ค�อ Andrew Z. Fire

แลัะ Craig C. Mello ได,รายงานการศั�กษา RNAi แลัะกลัไกท.�เก.�ยวข,องจากการศั�กษาแสดงออกของย.นในหนอนต�วกลัม Caenorhabditis elegans (C.

elegans) โดยพับว�าเม��อฉ.ด mRNA (sense) ท.�ควบค�มการสร,างโปรต.นกลั,ามเน�!อ ร�วมก�บ antisense RNA ของ mRNA ด�งกลั�าว ให,แก� C. elegan พับว�าหนอนม.การเคลั��อนท.�แบบกระต�ก (twitching movements) คลั,ายลั�กษณะการเคลั��อนท.�ของหนอนกลั��มท.�ขาดย.นท.�ท'าหน,าท.�สร,างโปรต.น กลั,ามเน�!ออย�างสมบ3รณ$ ในขณะท.� การฉ.ดเฉพัาะ sense หร�อ antisense RNA เพั.ยงอย�างเด.ยวไม�พับการเปลั.�ยนแปลังด�งกลั�าว จากผ่ลัการทดลัอง Fire แลัะคณะต�!งสมม�ต(ฐานว�า sense แลัะ antisense RNA

ท.�ถู3กฉ.ดเข,าไปอาจจ�บเข,าค3�ก�นเก(ดเป2น dsRNA แลัะ dsRNA ท.�เก(ดข�!นม.ผ่ลัไปย�บย�!งการแสดงออกของย.นกลั,ามเน�!อท.�ม.รห�สเด.ยวก�นน�!น ต�อมาเม��อได,ทดลัองฉ.ด dsRNA

ท.�ม.รห�สพั�นธุ�กรรมของโปรต.นหลัายๆชน(ดของหนอนต�วกลัม พับว�า การฉ.ดอาร$เอ7นเอสายค3�ท.�ม.รห�สพั�นธุ�กรรมหน��งๆเข,าไป ม.ผ่ลัในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นท.�ม.รห�สจ'าเพัาะน�!นๆเม��อได,ผ่ลัการทดลัองท.�ช�ดเจน Fire แลัะคณะ จ�งรายงานว�า dsRNA ม.ความสามารถูย�บย�!งการแสดงออกของย.นได, แลัะเร.ยกกระบวนการท.�เก(ดข�!นท�!งหมดน.!ว�า RNA

interference (RNAi) ซึ่��ง RNAi ม.ความจ'าเพัาะต�อย.นท.�ม.รห�สเข,าค3�ก�นก�บ dsRNA ท.�ฉ.ดเข,าไป นอกจากน.!ย�งพับว�า ผ่ลัจาก RNAi ท.�เก(ดในเซึ่ลัลั$ท.�ฉ.ด dsRNA

เข,าไป ย�งสามารถูแพัร�กระจายจากเซึ่ลัลั$หน��งไปย�งอ.กเซึ่ลัลั$หน��ง ต�อๆ ก�นไป จนท��วท�กเซึ่ลัลั$ของต�วอ�อนของหนอนต�วกลัม แลัะย�งสามารถูถู�ายทอดไปย�งร� �นต�อไปได,ด,วย แลัะจากท.�พับว�าการฉ.ด dsRNA เข,าไปเพั.ยงเลั7กน,อยสามารถูก�อให,เก(ดผ่ลัย�บย�!งการแสดงออกของย.นได, ท'าให,เข,าใจว�ากระบวนการ RNAi เป2นกระบวนการท.�อาจเก(ดการส�งเคราะห$เพั(�มข�!นเองภายในเซึ่ลัลั$ได, หลั�งจาก Andrew Fire แลัะ Craig Mello

รายงานการค,นพับกระบวนการ RNAi เผ่ยแพัร�ลังในวารสาร Nature เม��อป; 1998

บทความน.!กระต�,นให,เก(ดความสนใจในการศั�กษาเก.�ยวก�บ RNAi เพั(�มข�!นอ.กมากมาย

Page 4: siRNA@RNAi

อาท(เช�น การศั�กษาของ Misquitta แลัะ Paterson ท.�พับการรบกวนการแสดงออกของ MyoD gene ใน Drosophila โดยใช,กระบวนการ RNAi การศั�กษาของ Ngô แลัะ คณะท.�พับการกระต�,นให,ม.การท'าลัาย mRNA ใน Trypanosoma

brucei โดยใช, double strand RNA การศั�กษาของ Waterhouse แลัะ คณะท.�พับกระบวนการต�อต,านการต(ดไวร�สในพั�ช ในป; 1998 แลัะการศั�กษาของ van

West แลัะคณะท.�พับกระบวนการย�บย�!งการแสดงออกของย.นใน Phytophthora

infestans ในป; 1999 เป2นต,น ต�อมาในป; 2001 จากการศั�กษาของ Elbashir

แลัะคณะพับว�า Duplexes of 21-nucleotide RNAs สามารถูกระต�,นให,เก(ดกระบวนการ RNAi ในเซึ่ลัลั$ส�ตว$เลั.!ยงลั3กด,วยนมได, แลัะในป; 2002 วารสาร Science ได,ยกย�องว�า RNAi เป2นเทคโนโลัย.แห�งป; ซึ่��งในป;เด.ยวก�นน.!ย�งม.การค,นพับ recombinant Dicer โดย Provost แลัะคณะ จากน�!นองค$ความร3 ,เก.�ยวก�บ RNAi

ในด,านต�างๆ ท�!งความร3 ,เก.�ยวก�บกลัไก องค$ประกอบในกระบวนการ RNAi ก7พั�ฒนาข�!นเร��อยๆ ตามลั'าด�บ แลัะจากการค,นพับกระบวนการ RNAi ท'าให, Andrew Fire แลัะ Craig Mello ได,ร�บรางว�ลัโนเบลั สาขาแพัทยศัาสตร$แลัะสร.รศัาสตร$ประจ'าป; 2006

Andrew Fire แลัะ Craig Mello

http://130.15.90.245/index.5.jpg

Page 5: siRNA@RNAi

หน้�าที่�� 3 - กลไกการเก�ดกระบวน้การ RNAi

กลัไกการเก(ดกระบวนการ RNAi

RNA interference (RNAi) ถู�อเป2นกระบวนการในการควบค�มการแสดงออกของลั�กษณะทางพั�นธุ�กรรมอย�างหน��ง ด�งน�!นเพั��อความเข,าใจในกระบวนการ RNAi จ�งขอกลั�าวถู�ง การแสดงออกของย.นแลัะการควบค�มการแสดงออกของย.นก�อนจะกลั�าวถู�งการท'างาน ของกระบวนการ RNAi

การแสดงออกของย.น(Nelson and Cox, 2000)

การแสดงออกของย.น หมายถู�ง การถูอดรห�สพั�นธุ�กรรมของย.นจากด.เอ7นเอเป2น mRNA แลั,วเก(ดการแปลัรห�สเป2นโปรต.น รห�สพั�นธุ�กรรมของย.นในด.เอ7นเอ เป2นต�วก'าหนดชน(ดของโปรต.นท.�เซึ่ลัลั$สร,าง โดยเร(�มจากการถูอดรห�สพั�นธุ�กรรมท.�อย3�ในด.เอ7นเอเป2น mRNA ในน(วเคลั.ยส แลัะแปลัรห�สเป2นโปรต.นในไซึ่โตพัลัาสซึ่�ม ซึ่��งโปรต.นน.!ม.ความเก.�ยวข,องในท�กกระบวนการของส(�งม.ช.ว(ต เช�น เป2นเอ7นไซึ่ม$ท.�ใช,ในการย�อยอาหาร เป2นส�วนประกอบของต�วร�บส�ญญาณ (receptor) แลัะ แอนต(บอด.! (antibody) ท.�ปกป5องร�างกายจากส(�งแปลักปลัอมต�างๆจ.โนมของคนประกอบด,วยย.นประมาณ 30,000 ชน(ดแต�จะม.เพั.ยงบางย.นเท�าน�!นท.�สามารถูใช,งานได,ในแต�ลัะเซึ่ลัลั$ เพัราะม.การควบค�มการแสดงออกของย.นให,เก(ดข�!นเฉพัาะส�วนท.�ต,องการเท�าน�!น เร.ยกกระบวนการในการควบค�มให,ม.การแสดงออกเฉพัาะย.นท.�ต,องการว�า การควบค�มการแสดงออกของย.น (regulation of gene

expression)

Page 6: siRNA@RNAi

การควบค�มการแสดงออกของย.น (Regulation of gene expression)

(Nelson and Cox, 2000)

( www.mie.utoronto.ca/.../biopic/biofigures.htm)

การแสดงออกของย.นเป2นการถู�ายทอดข,อความทางช.วภาพัหร�อข,อความทางพั�นธุ�กรรมท.� บรรจ�อย3�ใน ด.เอ7นเอไปย�ง mRNA แลั,วจ�งแปลัรห�สไปเป2นโปรต.น ในเซึ่ลัลั$ร�างกายของส(�งม.ช.ว(ตท�กเซึ่ลัลั$ม.ข,อม3ลัทางพั�นธุ�กรรมหร�อย.นเหม�อนก�น แต�ในระหว�างการเจร(ญเต(บโตแลัะการเปลั.�ยนสภาพั (differentiation) แต�ลัะเซึ่ลัลั$ม.กลัไกการควบค�มการแสดงออกของย.นเหลั�าน.!ต�างเวลัาหร�อต�างวาระก�น การควบค�มการแสดงออกของย.นอาจแบ�งเป2น 2 ช�วงค�อ ช�วงระหว�างกระบวนการถูอดรห�สพั�นธุ�กรรม (transcription) โดยเป2นการควบค�มการส�งเคราะห$ mRNA ซึ่��งลั'าด�บเบสท.�อย3�บนสาย mRNA ถู3กก'าหนดโดยลั'าด�บของเบสในสายแม�พั(มพั$ด.เอ7นเอ ช�วงระหว�างกระบวนการแปลัรห�สพั�นธุ�กรรมมาเป2นโพัลั.เปปไทด$ (polypeptide)

หร�อโปรต.นโดยเป2นการส�งเคราะห$ โพัลั.เปปไทด$ หร�อการสร,างโปรต.น

Page 7: siRNA@RNAi

การควบค�มการแสดงออกของย.นม.ผ่ลัต�อปร(มาณของโปรต.นท.�ถู3กสร,างข�!น แลัะม.ข�!นตอนการควบค�มด�งน.!(สามารถูเข,าชมรายลัะเอ.ยดได,ท.� บทความการควบค�มการแสดงออกของย.น ) ค�อ

1.การควบค�มระด�บจ.โนม(Genomic control)

2.การควบค�มการถูอดรห�ส (Transcriptional control)

3.การควบค�มหลั�งการถูอดรห�ส (Post-transcriptional control)

4.การควบค�มการแปลัรห�ส (Translation control)

5.การควบค�มหลั�งการการแปลัรห�ส (Post-translation control)

การควบค�มการแสดงออกของย.นโดย RNAi

กระบวนการ RNAi เป2นการควบค�มการแสดงออกของย.นในข�!นตอน posttranscriptional processing ของ mRNA ซึ่��งจากการศั�กษาการควบค�มการแสดงออกของย.นโดยกระบวนการ RNAi ท.�เก(ดภายในเซึ่ลัลั$ของคนแลัะส�ตว$หลัายชน(ดพับว�าม.กลัไกคลั,ายก�นโดยจ.โนมม.การ ก'าหนดการสร,างโมเลัก�ลั RNA

ขนาดเลั7กท.�เร.ยกว�า micro RNA (miRNA) ซึ่��งเป2น double-stranded RNA

(dsRNA) แลัะเป2นจ�ดเร(�มต,นในการกระต�,นกลัไกการท'างานของ RNAi ในการข�ดขวางการสร,างโปรต.น RNAi จ�งม.บทบาทในการควบค�มการแสดงออกของย.น แลัะม.บทบาทส'าค�ญต�อการควบค�มลั�กษณะทางพั�นธุ�กรรม ควบค�มการท'างานของเซึ่ลัลั$ แลัะรวมถู�งการพั�ฒนาของส(�งม.ช.ว(ต

หน้�าที่�� 4 - องค�ประกอบที่��เก��ยวข้�องใน้กระบวน้การ RNAi Dicer

Page 8: siRNA@RNAi

(it.wikipedia.org/wiki/RNA_interference)

Dicer ค�อ RNAse III nuclease ท'าหน,าท.�ต�ด double-stranded RNA แลัะ pre-microRNA ออกเป2น double-stranded RNA สายส�!นๆ ซึ่��งยาว 20-25

น(วคลั.โอไทด$ เร.ยกว�า small interfering RNA (siRNA) โครงสร,างของ Dicer

ประกอบไปด,วย RNase 2 โดเมน (domain) แลัะ PAZ 1 โดเมน Dicer เป2นต�วกระต�,นปฏ(ก(ร(ยา (catalyze) ในข�!นตอนแรกของ RNA interference pathway

แลัะเป2นจ�ดเร(�มต,นในการสร,าง RNA-induced silencing complex (RISC)

(Provost et al, 2002; Macrae et al, 2006; Jaronczyk et al, 2005; Bernstein et al, 2001)

Small Interfering RNA(Elbashir et al. 2001)

Small Interfering RNA (siRNA) บางคร�!งร3 ,จ�กก�นในช��อ short interfering

RNA หร�อ silencing RNA โครงสร,างโมเลัก�ลัของ siRNA เป2น dsRNA สายส�!นๆ (ประมาณ 21 น(วคลั.โอไทด$)โดยม.น(วคลั.โอไทด$ 2 ต�วย��นออกมา (overhange) จากปลัาย 3' ของแต�ลัะสาย ผ่ลัจากการต�ดของ Dicer ท'าให,ได,สาย siRNA ท.�ม.ปลัาย 5' เป2นหม3�ฟอสเฟต แลัะปลัาย 3' เป2นหม3�ไฮดรอกซึ่(ลั ป8จจ�บ�นทราบว�า siRNA ม.บทบาทในว(ถู. RNAi แลัะเก.�ยวข,องก�บกระบวนการทางช.วภาพัท.�หลัากหลัาย เช�น กระบวนการต�อต,านไวร�ส หร�อการเปลั.�ยนแปลังโครงสร,างโครมาต(นในจ.โนมArgonaute

Page 9: siRNA@RNAi

(www.mskcc.org/mskcc/html/630)

Argonaute (Ago) เป2นเอ7นไซึ่ม$ท.�เป2นส�วนประกอบส'าค�ญของ RNA-induced

silencing complex (RISC) complex ท.�ท'าหน,าท.�แยก RNA สายค3�เป2นสายเด.�ยว แลัะเป2นส�วนส'าค�ญในการน'า siRNA เข,าส3�กระบวนการ RNAi จากการศั�กษาในแมลังหว.�(Drosophila spp.) พับว�าม. Ago 5 ชน(ด โดย Ago ต�างชน(ดก�นจะท'าหน,าท.�แตกต�างก�น แต� Ago ท.�ม.ความส'าค�ญค�อ Ago1 ท'าหน,าท.�แยก miRNA สายค3�ให,เป2นสายเด.�ยว แลัะ Ago2 ท'าหน,าท.�แยก siRNA สายค3�ให,เป2นสายเด.�ยว โครงสร,าง Ago แบ�งเป2น 2 โดเมน ค�อ PAZ แลัะ Piwi โดย PAZ domain เป2นส�วนประกอบท�!งใน Ago แลัะ Dicer ( PAZ domain ใน Dicer อาจม.หน,าท.�แตกต�างออกไป)

โครงสร,างของ PAZ domain ประกอบด,วย 2 ส�วน ค�อ บร(เวณท.�ม.ลั�กษณะ oligonucleotide-binding (OB) fold ซึ่��งท'าหน,าท.�ในการจ�บก�บกรดน(วคลั.อ(ก แลัะบร(เวณท.�ม.ลั�กษณะเป2น beta-hairpin ตามด,วย alpha-helix โดย PAZ

domain ท'าหน,าท.�จ�บก�บกรดน(วคลั.อ(ก 2 ต�ว ท.�ย��นออกมาจากปลัาย 3' ของ siRNA

เพั��อช�วยให, siRNA จ�บก�บ mRNA เป5าหมายได,เสถู.ยรมากข�!น ส�วน Piwi domain

ม.ค�ณสมบ�ต(คลั,าย RNase ซึ่��งเป2นเอ7นไซึ่ม$ท.�ต�ด RNA จาก DNA-RNA hybrids

จ�งเข,าใจว�า Piwi อาจท'าหน,าท.�ในการต�ด mRNA ให,ก�บ RISC(Rand et al,

2005; Sen and Blau, 2005)

RNA-induced silencing complex (RISC)

Page 10: siRNA@RNAi

( www.mskcc.org/mskcc/html/63099.cfm)

RNA-induced silencing complex (RISC) ค�อกลั��มของโปรต.นท.�ท'าหน,าท.�ร �วมก�นในการแยก siRNA สายค3�เป2นสายเด.�ยว แลั,วช�วยจ�บสายท.�เป2น antisence ของ siRNA ท.�แยกออกมา แลั,วรวมเข,าก�บ RISC เป2น RISC complex โดยสาย antisence siRNA ท.�เร.ยกว�า guide RNA ม.เบสค3�สมก�บ mRNA เป5าหมาย แลัะช�วยให, RISC complex เข,าจ�บแลัะท'าลัาย mRNA เป5าหมายได,อย�างแม�นย'า RISC

ประกอบด,วยไรโบน(วคลั.โอโปรต.น คอมเพัลั7กซึ่$ (ribonucleoprotein complex;

RNP) หลัายชน(ด แต�ม.เพั.ยงบางชน(ดเท�าน�!นท.�สามารถูท'างานในกระบวนการ RNAi

ท�!งน.!ส�ตว$ต�างชน(ดจะม.องค$ประกอบของ RISC ท.�แตกต�างก�น เน��องจาก RNAi ของส�ตว$บางชน(ดต,องอาศั�ย RISC complex เพั��อให,ท'างานได, ในขณะท.�ส�ตว$บางชน(ดอาศั�ยการท'างานของ RISC เพั.ยงอย�างเด.ยว(Preall et al, 2006; Gregory,

2005; Sen et al, 2005)

Page 11: siRNA@RNAi

หน้�าที่�� 5 - กระบวน้การที่�างาน้ข้อง RNAi

กระบวนการท'างานของ RNAi

(fig.cox.miami.edu/.../gene/how_siRNA_works.htm)

1. Dicer ซึ่��งม. dsRNA-specific endonuclease ท.�สามารถูจดจ'าแลัะจ�บ dsRNA ท.�ม.ความคลั,ายคลั�ง (homologue) ก�บ mRNA เป5าหมาย จะต�ดสาย dsRNA ออกเป2นสายส�!นๆ ท.�เร.ยกว�า small interference RNA (siRNA) ท.�ม.ความยาวประมาณ 21-25 ค3�เบส2. Argonaute 2 เข,ามาจ�บ siRNA ด�งกลั�าวเก(ดเป2น ribonucleoprotein

complex (RNP) แลัะเหน.�ยวน'าให,โปรต.นชน(ดอ��นเข,ามารวมก�นเพั��อสร,างเป2น RNAi-silencing complex (RISC)

3. RISC ท'าการแยก siRNA สายค3�ออกเป2นสายเด.�ยว โดยสายเด.�ยวท.�เป2น antisense ของ siRNA ม.ลั'าด�บเบสท.�เป2นค3�สมก�บ mRNA เป5าหมาย (sense) จ�งเป2นต�วก'าหนดความจ'าเพัาะแลัะการจดจ'าให, RISC complex เข,าจ�บแลัะท'าลัาย mRNA เป5าหมายได,อย�างแม�นย'า4. RISC ท.�ม. siRNA สายเด.�ยวรวมอย3�ด,วย (RISC complex) เข,าจ�บก�บ mRNA

Page 12: siRNA@RNAi

เป5าหมายโดยอาศั�ยลั'าด�บเบสค3�สมระหว�าง siRNA แลัะ mRNA เป5าหมาย จากน�!น mRNA จะถู3กย�อยโดย slicer ใน RISC complex แลัะพับว�า RISC ท.�ม. miRNA

สายเด.�ยวรวมอย3�ด,วย จะท'าหน,าท.� ท'าลัาย   mRNA ในพั�ช แต�ในส�ตว$จะท'าหน,าท.�กดการแปลัรห�ส(Translational repression)

5. mRNA ท.�ถู3กย�อยจะถู3กท'าลัาย เป2นผ่ลัให,ไม�ม. mRNA ผ่�านเข,าส3�กระบวนการแปลัรห�สไปเป2นโปรต.น ท'าให,ไม�ม.การสร,างโปรต.นจากย.นน�!นเก(ดข�!น การท'างานของ RNAi

จ�งเป2น posttranscriptional regulation of gene expression หร�อ posttranscriptional gene silencing

(สามารถูเข,าชมภาพัเคลั��อนไหวท.�http://www.nature.com//focus/rnai/animations/index.html)

หน้�าที่�� 6 - การประย!กต์�ใช้�เที่คโน้โลย� RNAi

การประย�กต$ใช,เทคโนโลัย. RNAi

ป8จจ�บ�นม.การพั�ฒนาเทคโนโลัย. RNAi มาใช,ประโยชน$อย�างหลัากหลัาย โดยอาศั�ยหลั�กในการน'า dsRNA หร�อ siRNA เข,าส3�ร �างกาย (transfection) เพั��อกระต�,นกลัไกการท'างานของ RNAi (Genc et al, 2004)ซึ่��งร3ปแบบของ dsRNA หร�อ siRNA

ท.�น'าเข,าส3�ร �างกาย ม.อย3� 5 ชน(ด ค�อ1.ร3ปของ dsRNA ส�งเคราะห$สายยาว2.ร3ปของ dsRNA ส�งเคราะห$ท.�ผ่�านการต�ดโดย dicer เป2น siRNA

3.ร3ปของ dsRNA ท.�ผ่�านการถูอดรห�สจาก ด.เอ7นเอ ในหลัอดทดลัองแลัะใช, dicer

ต�ดเป2น siRNA

4.ร3ปของ siRNA expression vector

5.ร3ปของ PCR derived siRNA cassette

การน'า dsRNA เข,าส3�ร �างกายในร3ปแบบข,างต,นน.! สามารถูแบ�งออกเป2น 2 ก�ลั�ม ค�อ 1. ว(ธุ.การข,อท.� 1-3 เป2นการน'าเข,าส3�ไซึ่โตพัลัาสซึ่�ม (cytoplasm)

2. ว(ธุ.การข,อท.� 4-5 เป2นการน'าเข,าส3�น(วเคลั.ยส (nucleus) ในร3ปของ short

hairpin RNA (shRNA) เพั��อส�งออกไปส3�ไซึ่โตพัลัาสซึ่�ม (cytoplasm) ต�อไป

Page 13: siRNA@RNAi

หน้�าที่�� 7 - เที่คโน้โลย� RNAi ใน้ป%จจ!บ�น้และอน้าคต์(การน้�าเที่คโน้โลย� RNAi ไปใช้�ใน้พื(ช้)

เทคโนโลัย. RNAi ในป8จจ�บ�นแลัะอนาคตในป8จจ�บ�นม.การน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,เป2นเคร��องม�อในงานว(จ�ยด,านต�างๆ มากมาย ซึ่��งอาจสร�ปโดยรวมได,เป2น 3 ด,าน ค�อ การน'าไปใช,ในพั�ช การน'าไปใช,ในทางการแพัทย$ แลัะการน'าไปใช,ในด,านการศั�กษา

การน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ในพั�ช

การน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ในพั�ช ส�วนใหญ�แลั,วจะม��งเน,นการน'า RNAi ไปเป2นเคร��องม�อในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นเป5าหมายท.�จ'าเพัาะ หร�อต'าแหน�ง promoters ของย.นน�!น เพั��อปร�บปร�งพั�นธุ�$พั�ชให,ได,ลั�กษณะใหม�ๆ ท.�ต,องการซึ่��งสามารถูถู�ายทอดไปส3� ร� �นหลั�งได, การสร,าง dsRNA ในพั�ชม.หลัายว(ธุ. เช�น การสร,างพั�ชปร�บปร�งพั�นธุ�$ท.�ผ่ลั(ต sense RNA แลัะ พั�ชปร�บปร�งพั�นธุ�$ท.�ผ่ลั(ต antisense

RNA แยกต,นก�น แลั,วน'าท�!ง 2 ต,นมาผ่สมข,ามก�น ท'าให,เก(ดต,นพั�ชท.�ผ่ลั(ต dsRNA

พับว�า ต,นพั�ชท.�ผ่ลั(ต dsRNA ม.ประส(ทธุ(ภาพัในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นได,ด.กว�าต,นท.�ผ่ลั(ตเพั.ยง sense หร�อ anti-sense RNA เพั.ยงอย�างเด.ยว (Wang et

al, 2001) นอกจากน.! ว(ธุ. hpRNA โดยการสร,างลั'าด�บท�!ง sense แลัะ antisense RNA ให,อย3�ใน promoter เด.ยวก�นโดยม. intron ค��นกลัางระหว�างลั'าด�บ sense แลัะ antisense ลั'าด�บเหลั�าน.!จะสร,างเป2น hpRNA หลั�งจากผ่�านกระบวนการถูอดรห�ส ซึ่��งว(ธุ.การใหม�น.!ม.ประส(ทธุ(ภาพัในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นในพั�ชได,ด. กว�า dsRNA โดยจะให,ผ่ลั 80-100% (Mallory et al, 2001) ด�งน�!นจ�งม.การน'าว(ธุ. hpRNA มาใช,ก�นอย�างแพัร�หลัายต�วอย�างการน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ในพั�ช 1. การใช, RNAi ในการเปลั.�ยนแปลังกระบวนการ metabolism ของพั�ชในการผ่ลั(ตสารต�างๆให,ลัดหร�อเพั(�มปร(มาณสารบางชน(ดท.�พั�ชสร,างแลัะเก7บ สะสมไว, เพั��อการน'าไปใช,ประโยชน$ในจ�ดประสงค$เฉพัาะต�อไป เช�น

Page 14: siRNA@RNAi

- ในธุรรมชาต(พับว�า ข,าวสายพั�นธุ�$หน��งม. hpRNA ท.�ม.ผ่ลัในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นของ glutelin ซึ่��งเป2นโปรต.นหลั�กในเมลั7ดข,าว ท'าให,เก(ดข,าวสายพั�นธุ�$ท.�ม.โปรต.นต'�า จ�งม.การน'าเทคโนโลัย. RNAi ผ่ลั(ตข,าวสายพั�นธุ�$น.!มาใช,ในทางการค,า เป2นข,าวส'าหร�บผ่3,ปAวยโรคไตท.�จ'าเป2นต,องควบค�มปร(มาณโปรต.นในอาหาร (Meins,

2000)

- การสร,างพั�ชกาแฟให,ม.ปร(มาณคาเฟอ.นน,อยลัง โดยปร�บปร�งพั�นธุ�กรรมพั�ชให,สามารถูสร,าง antisense hpRNA ของย.น CaMxMt1 ซึ่��งเป2นย.นท.�ม.ส�วนในกระบวนการสร,างคาเฟอ.น antisense hpRNA กระต�,นให,เก(ดกระบวนการ RNAi

จ�งม.ผ่ลัย�บย�!งการสร,างสารคาเฟอ.น ท'าให,ม.ปร(มาณคาเฟอ.นลัดลัง (Ogita et al,

2003)

2. การใช, RNAi ในการเพั(�มความต,านทานต�อโรคในพั�ช เช�น- การสร,างพั�ชยาส3บ (Nicotiana tabacum) ท.�ม.ความต,านทานต�อ tobamovirus โดยใช,เทคโนโลัย. RNAi ในการย�บย�!งการแสดงออกของย.น TOM1

แลัะ TOM3 ซึ่��งเป2นย.นท.�ถูอดรห�สได,เป2นโปรต.นท.�จ'าเป2นต�อการเพั(�มจ'านวนของไวร�ส ด�งน�!นไวร�สจ�งไม�สามารถูเพั(�มจ'านวนได, ด�งน�!นพั�ชยาส3บปร�บปร�งพั�นธุ�$จ�งม.ความต,านทานต�อเช�!อไวร�สชน(ดน.! (Asano et al, 2005)

- ไม,ผ่ลัย�นต,น พั�ชตระก3ลัถู��ว แลัะพั�ชไม,ประด�บหลัายชน(ดจะม.ย.น iaam แลัะย.น ipt

ซึ่��งเป2นย.นท.�ม.ความส'าค�ญท.�ท'าให,เก(ดโรค Crown gall disease จากเช�!อแบคท.เร.ย Agrobacterium tumefaciens จ�งม.การใช, RNAi ในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นท�!ง 2 ต'าแหน�ง ท'าให,พั�ชม.ความต,านทานต�อโรค Crown gall disease

(Dunoyer et al, 2006)

หน้�าที่�� 8 - เที่คโน้โลย� RNAi ใน้ป%จจ!บ�น้และอน้าคต์(การน้�าเที่คโน้โลย� RNAi ไปใช้�ที่างการแพืที่ย�) การน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ทางการแพัทย$

การร�กษาโรคท.�เก(ดจากเช�!อไวร�สในป8จจ�บ�นม.การน'าเทคโนโลัย. RNAi มาใช,ในการย�บย�!งไวร�สก�อโรคหลัายชน(ด ค�อ hepatitis C virus (HCV), dengue (DEN) virus, severe acute

Page 15: siRNA@RNAi

respiratory syndrome (SARS) coronavirus, poliovirus, influenza A virus, hepatitis delta virus (HDV), human rhinovirus (HRV), hepatitis B virus (HBV), herpes simplex virus type-1 (HSV-1), human papillomavirus (HPV), JC virus (JCV), Epstein Barr virus

(EBV) แลัะ cytomegalovirus (CMV) แต�ท.�ก'าลั�งอย3�ในความสนใจแลัะม.ผ่3,ศั�กษาก�นมาก ค�อ Human immunodeficiency virus-1 (HIV-1)

การใช, RNAi ในการย�บย�!ง HIV-1 ม.การศั�กษารายงานไว,มากมาย โดยใช, RNAi

ทดลัองย�บย�!งการแสดงออกของย.นหลัายต'าแหน�ง แลัะทดลัองใช,เวคเตอร$หลัายชน(ด แต�ผ่ลัท.�ได,ตรงก�น ค�อ การท'างานในระยะแรกสามารถูย�บย�!ง HIV-1 ได, แต�เม��อเลั.!ยงเซึ่ลัลั$ไว,เป2นเวลัานาน HIV-1 ม.ความสามารถูในการหลับหลั.ก เพัราะม.กลัไกการย�บย�!งการท'างานของ RNAi อย�างหลัากหลัาย เช�น point mutation, double point

mutation, partial หร�อ complete deletion of the target sequence

เป2นต,น ด�งน�!นจ�งม.ผ่3,เสนอว�า การใช, siRNA combination therapy (SIRCT)

ค�อ การใช, siRNA เพั��อย�บย�!งการแสดงออกของย.นไวร�สหลัายต'าแหน�งร�วมก�นน�าจะเลั.�ยงการหลับหลั.ก ของไวร�สได, แต�ย�งไม�ม.รายงานผ่ลัการทดลัองด�งกลั�าว (Ben

and Joost, 2006)

การร�กษามะเร7ง ว(ธุ.การในการร�กษามะเร7งท.�ใช,ก�นมากในป8จจ�บ�นค�อ เคม.บ'าบ�ด (chemotherapy)

แต�ว(ธุ.การน.!ม.ข,อจ'าก�ดในการใช, ค�อ ร�างกายผ่3,เป2นมะเร7งจะสร,าง P-glycoprotein

ซึ่��งเป2นโปรต.นท.�ท'าให,ยาท.�ผ่3,เป2นมะเร7งได,ร�บจากการท'าการร�กษาโดยเคม. บ'าบ�ดถู3กก'าจ�ดออกจากเซึ่ลัลั$ ท'าให,การร�กษาโดยเคม.บ'าบ�ดม.ประส(ทธุ(ภาพัต'�า ด�งน�!นการใช,เทคโนโลัย. RNAi เพั��อย�บย�!งการสร,าง P-glycoprotein ในร�างกายผ่3,ท.�เป2นมะเร7ง ท'าให,การร�กษาโดยเคม.บ'าบ�ดม.ประส(ทธุ(ภาพัส3งข�!น ซึ่��งจากการศั�กษาของ Rumpold

แลัะคณะในป; 2005 พับว�า สามารถูใช,เทคโนโลัย. RNAi ในการย�บย�!งการสร,าง P-

glycoprotein ซึ่��งท'าให,เซึ่ลัลั$มะเร7งไวต�อ imatinib ลัดลังได,

การปลั3กถู�ายเน�!อเย��อการปลั3กถู�ายไตส�วนใหญ�จะพับป8ญหาการตาย (apoptosis) ของเซึ่ลัลั$บ�ผ่น�งท�อไต (renal tubular epithelial cells) จากการบาดเจ7บท.�เก(ดจากเลั�อดมาเลั.!ยงอ.ก

Page 16: siRNA@RNAi

คร�!งหลั�งการขาดเลั�อด (ischemia-reperfusion injury) โปรต.นท.�ม.ส�วนส'าค�ญในกระบวนการเหลั�าน.! ค�อ Fas ซึ่��งจากการศั�กษาของ Hamar แลัะคณะในป;2004

พับว�าสามารถูใช,เทคโนโลัย. RNAi ย�บย�!งการสร,าง Fas ในหน3ซึ่��งท'าให,เซึ่ลัลั$บ�ผ่น�งท�อไตม.ความต,านทานต�อการตายมากข�!น แลัะเก(ดการบาดเจ7บท.�เก(ดจากเลั�อดมาเลั.!ยงอ.กคร�!งหลั�งการขาดเลั�อดน,อยลังได,

การชะลัอว�ย (anti-aging)

ในป; 2003 Kenyon แลัะคณะได,ท'าการทดลัองเพั��อเพั(�มอาย�ข�ยในหนอนต�วกลัม C.

elegans โดยสามารถูปร�บปร�งพั�นธุ�กรรมให,ม.อาย�ย�นยาวกว�าปกต( โดยใช,เทคโนโลัย. RNAi ในการย�บย�!งการแสดงออกของ Daf-2 ซึ่��งเป2นย.นของต�วร�บ (receptor)

ของฮอร$โมนอ(นซึ่3ลั(น (insulin) แลัะ insulin-like growth factor 1 (IGF-1)

นอกจากน.!ย.น Daf-2 ย�งม.ผ่ลัต�อการส�บพั�นธุ�$ด,วย ในธุรรมชาต(พับว�าในสภาวะท.�ไม�เหมาะสมหร�อขาดแคลันอาหาร ย.น Daf-2 จะท'างานลัดลัง ท'าให, C. elegans ท.�อาย�น,อยแสดงอาการกระต�อร�อร,น ม.ช.ว(ตช.วา แลัะม.การพั�ฒนาไปส3�การส�บพั�นธุ�$ก�อนอาย�ท.�แท,จร(ง แต� C. elegans ท.�โตเต7มว�ยแลั,วจะอาย�ย�นมากข�!น จากการทดลัองใช, RNAi ในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นน.! นอกจากจะพับว�าท'าให,หนอนอาย�ย�นข�!นแลั,ว ย�งพับว�าหนอนทดลัองม.ส�ขภาพัด.ตลัอดช�วงอาย�ท.�ยาวนานข�!น แสดงว�าการย�บย�!งการแสดงออกของย.นน.!ไม�น�าจะรบกวนย.นอ��นๆ ท.�จ'าเป2นของหนอน ผ่ลัการทดลัองด�งกลั�าวท'าให,เก(ดความสนใจเป2นอย�างมาก เพัราะ insulin/IGF-1

pathway เป2นว(ถู.ท.�ควบค�มการม.ช.ว(ตย�นยาวในส�ตว$หลัายๆชน(ด รวมท�!งในส�ตว$เลั.!ยงลั3กด,วยนม

หน้�าที่�� 9 - เที่คโน้โลย� RNAi ใน้ป%จจ!บ�น้และอน้าคต์(การน้�าเที่คโน้โลย� RNAi ไปใช้�ใน้การศึ*กษาว�จ�ย)

การน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ในการศั�กษาว(จ�ยเทคโนโลัย. RNAi จ�ดว�าเป2นเคร��องม�อท.�ม.ประโยชน$มากต�อการน'ามาใช,เพั��อศั�กษาหน,าท.�ของย.น เพั��อน'าความร3 ,เหลั�าน�!นไปประย�กต$ใช,สาขาว(ชาต�างๆ เหต�ผ่ลัท.�ว(ธุ.การน.!ม.การน'ามาใช,ก�นอย�างแพัร�หลัายแลัะม.ความน(ยมเพั(�มข�!น เร��อยๆ เพัราะการย�บย�!งการแสดงออกของย.นด,วยว(ธุ.การอ��นๆ เช�น ‘gene knock-out’ ต,องท'าให,โครงสร,างของย.นเปลั.�ยนแปลังไป อาจท'าให,ย.นท.�อย3�

Page 17: siRNA@RNAi

ในต'าแหน�งน�!น หร�อต'าแหน�งข,างเค.ยงเส.ยหาย แลัะอาจส�งผ่ลัต�อส(�งม.ช.ว(ตน�!นๆ แต�ด,วยเทคโนโลัย. RNAi สามารถูย�บย�!งการแสดงออกของย.นหลั�งจากเก(ดกระบวนการถูอดรห�ส ด�งน�!นจ�งไม�ท'าให,เก(ดการเปลั.�ยนแปลังสารพั�นธุ�กรรมของส(�งม.ช.ว(ตต�วอย�างการน'าเทคโนโลัย. RNAi ไปใช,ในด,านการศั�กษา 1. การใช,เทคโนโลัย. RNAi ในการศั�กษาจ.โนมของ C.elegans โดยใช,แบคท.เร.ยเป2นส��อน'าให,เก(ดกระบวนการ RNAi เพั��อส�งเกตผ่ลัท.�เก(ดข�!นจากการย�บย�!งการแสดงออกของย.น 16,757 ย.น (จากท�!งหมด 19,757 ย.น) แลัะจ�ดกลั��มย.นท.�แสดงออกเป2นลั�กษณะท.�คลั,ายก�น (Kamath et al, 2003)

2. การใช,เทคโนโลัย. RNAi ในการศั�กษาย.นท.�จ'าเป2นต�อการอย3�รอดของ Heterodera glycines (H.glycines) ซึ่��งเป2นหนอนพัยาธุ(ท.�ก�อให,เก(ดถู�งน'!า (cyst) ของต,นถู��วเหลั�อง (Glycine max) เพั��อน'าไปใช,ในการควบค�มหนอนพัยาธุ(ชน(ดน.! โดยการใช,เทคโนโลัย. RNAi ย�บย�!งการแสดงออกของย.นท.�คาดว�าเป2นย.นท.�จ'าเป2นต�อหนอนพัยาธุ( แลัะส�งเกตว�าการขาดย.นใดจะท'าให,หนอนพัยาธุ(ตาย (Alkharouf et al, 2007)

3. การศั�กษา RNAi ท.�เก.�ยวข,องก�บการท'างานของย.นท.�ควบค�มนาฬิ(กาช.วภาพัของร�างกาย เป2นการศั�กษาเพั��อให,เก(ดความเข,าใจกลัไกการท'างานของนาฬิ(กาช.วภาพัท.�ม.อย3�ใน ร�างกายของส(�งม.ช.ว(ตต�!งแต�แบคท.เร.ยจนถู�งมน�ษย$ ซึ่��งจะม. circadian

rhythms ท.�สอดคลั,องก�บการท'างานของร�างกายท.�เก(ดข�!นในช�วงเวลัากลัางว�น หร�อกลัางค�น เช�น การหลั�บแลัะการต��น โดยท'าการศั�กษาใน Drosophila spp.

(Nawathean et al, 2005) แลัะแมลังอ��นๆ พับว�า สามารถูพับ clock genes

ได,ท�!งในสมองแลัะอว�ยวะอ��นๆ โดย clock genes ท.�พับในระบบส�บพั�นธุ�$เพัศัผ่3,จะควบค�มจ�งหวะท.�ท'าให,เก(ดการผ่สมพั�นธุ�$ แลัะวงจรการปลั�อย sperm ในแต�ลัะว�น ส�วนใน Drosophila spp. เพัศัเม.ย clock genes ม.ความส�มพั�นธุ$ก�บระด�บความสามารถูในการออกไข�ท.�ข�!นก�บความสมบ3รณ$ของ โภชนาการ นอกจากน.!การท'างานของ clock genes อาจม.ความเก.�ยวข,องก�บการป5องก�นส(�งม.ช.ว(ตจากความเคร.ยดแลัะการแก�ก�อนว�ย การศั�กษาน.!ถู3กน'าไปประย�กต$ใช,ในการศั�กษากลัไกการท'างานของนาฬิ(กาช.วภาพัท.� เก.�ยวข,องก�บมน�ษย$ ในด,านของระบบส�บพั�นธุ�$ โภชนาการ แลัะ การย�ดอาย�ข�ยของมน�ษย$ จากท.�กลั�าวมาข,างต,นจะเห7นได,ว�าในอนาคตเทคโนโลัย. RNAi จะเป2นเทคโนโลัย.ท.�ส'าค�ญ

Page 18: siRNA@RNAi

ในการปร�บปร�งพั�นธุ�$พั�ช การป5องก�นร�กษาโรค ตลัอดจนเป2นเคร��องม�อในการศั�กษาหน,าท.�ของย.นในพั�ช ส�ตว$ แลัะมน�ษย$

หน้�าที่�� 10 - ข้�อเสำ�ยข้องเที่คโน้โลย� RNAi

ข,อเส.ยของเทคโนโลัย. RNAi

เทคโนโลัย.หลัากหลัายท.�ม.การน'ามาใช,ในป8จจ�บ�นต�างม.ท�!งข,อด. แลัะข,อเส.ย ผ่3,ท.�น'าเทคโนโลัย.น�!นไปใช,จ�งต,องพั(จารณาอย�างรอบคอบ เลั�อกว(ธุ.การท.�เหมาะสมท.�ส�ดในการน'าไปใช,เพั��อให,เก(ดประโยชน$ส3งส�ด แลัะลัดผ่ลักระทบหร�อข,อเส.ยของเทคโนโลัย.น�!น เทคโนโลัย. RNAi ก7เช�นเด.ยวก�น แม,ว�าจะม.ข,อด.มากมายด�งท.�กลั�าวมาแลั,ว แต�เทคโนโลัย. RNAi ก7ม.ข,อเส.ยหลัายประการ เช�น1.ไม�สามารถูปร�บต�วตามการหลับหลั.กของไวร�สบางชน(ดได, ท'าให,การใช,เทคโนโลัย.น.!ม.ช�วงเวลัาจ'าก�ดในการย�บย�!งการแสดงออกของย.น จนเม��อไวร�สเปลั.�ยนแปลังพั�นธุ�กรรมไปก7ไม�สามารถูย�บย�!งการแสดงออกของย.นได,2.ไม�สามารถูประมาณช�วงเวลัาท.� RNAi ให,ผ่ลัในการย�บย�!งการแสดงออกของย.นได,3.ท'าให,ลั'าด�บพั�นธุ�กรรมของโฮสต$เปลั.�ยนแปลัง เน��องจากช(!นส�วน siRNA สามารถูเข,าไปแทรกในลั'าด�บพั�นธุ�กรรมของโฮสต$ได,4.อาจเก(ดการย�บย�!งการแสดงออกของย.นอ��นท.�ไม�ใช�ย.นเป5าหมาย เน��องจาก siRNA

เป2นลั'าด�บน(วคลั.โอไทด$สายส�!น ๆ ซึ่��งไม�เพั.ยงแต�ม.ความจ'าเพัาะก�บ ต'าแหน�งเบสท.�เป2นค3�สมก�นเท�าน�!น แต�ย�งม.โอกาสท.�จะไปจ�บก�บเบสค3�สมอ��นท.�ม.ความคลั,ายคลั�งก�นได,5.ไวร�สท.�ใช,เป2นส��อในการน'าย.นเข,าส3�เซึ่ลัลั$อาจก�อโรคหร�อไปกระต�,นให, oncogene

ท'างาน6.RNAi ท.�ใช,ในการด�ดแปลังพั�นธุ�กรรมพั�ชท.�ใช,เป2นอาหาร อาจส�งผ่ลัก�บผ่3,บร(โภค7.ประส(ทธุ(ภาพัของ RNAi ข�!นอย3�ก�บค�ณสมบ�ต(ของ เวคเตอร$ 8.เป2นเทคโนโลัย.ท.�ต,องอาศั�ยความเข,าใจแลัะช'านาญในการว(เคราะห$9.ค�าใช,จ�ายในการท'าการทดลัองส3ง เน��องจากต,องใช,เคร��องม�อประกอบหลัายอย�าง10.เทคโนโลัย.น.!เป2นเทคโนโลัย.ใหม� ม.การค,นพับมาไม�เก(น 10 ป; ด�งน�!นข,อม3ลัต�างๆท.�ได,มาจ�งย�งสามารถูเปลั.�ยนแปลังได,อย3�เสมอหากม.การค,น พับข,อม3ลัต�างๆเพั(�มข�!น

Page 19: siRNA@RNAi

หน้�าที่�� 12 - การประย!กต์�ใช้� RNAi ใน้ประเที่ศึไที่ย หน,าน.!ต,องการความช�วยเหลั�อในการแก,ไข ช�วยแก,ไขได,ท.�น.� ในประเทศัไทยม.การน'า RNAi มาประย�กต$ในหลัายทาง ด�งน.! การศั�กษาผ่ลัของการใช, RNA interference (RNAi) ต�อการเก(ด passage effect ของแบคค(วโลัไวร�ส Th-HaNPV ในเซึ่ลัลั$แมลัง Helicoverpa zea (Hz) การศั�กษาผ่ลัของการใช, RNA interference (RNAi) ในการย�บย�!งการแสดงออกของย.น GFP ในเซึ่ลัลั$ Helicoverpa zea(Hz)การย�บย�!งการเจร(ญของเซึ่ลัลั$มะเร7งเต,านมโดยใช,เทคน(ค RNAi ย�บย�!งการท'าหน,าท.�ของย.น WT1 การใช,เทคน(ค RNA Interference

(RNAi) ในการย�บย�!งการท'างานของย.นท.�ก'าหนดการสร,างโปรต.นห�,มอน�ภาคไวร�สใบด�างในกลั,วยไม,สก�ลัหวาย RNAi-mediated Suppression of Os2AP

Converts Non-aromatic to Aromatic Rice การใช, RNAi เพั(�มความต,านทานโรคก�,ง