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Optical Tweezers Grier, A revolution in optical manipulation. Nature 424, 810-816 (14 August 2003) Miklós, et al., Folding-Unfolding Transitions in Single Titin Molecules Characterized with Laser Tweezers. Science 276, 1112 (1997) Gijs et al., An Integrated Laser Trap/Flow Control Video Microscope for the Study of Single Biomolecules. Biophysical Journal 79, 1155–1167 (2000) Galburt et al., Single molecule transcription elongation. Methods 48, 323–332 (2009)

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Optical Tweezers

• Grier, A revolution in optical manipulation. Nature 424, 810-816 (14 August 2003)

• Miklós, et al., Folding-Unfolding Transitions in Single Titin Molecules Characterized with Laser Tweezers. Science 276, 1112 (1997)

• Gijs et al., An Integrated Laser Trap/Flow Control Video Microscope for the Study of Single Biomolecules. Biophysical Journal 79, 1155–1167 (2000)

• Galburt et al., Single molecule transcription elongation. Methods 48, 323–332 (2009)

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~ 6 µm

~ 10 µm

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Orígenes y evolución

Fundamentos

Arreglos experimentales típicos

Caracterización

Estudio de biopolímeros – Titina

Off – Topic: ADN, transcripción y elongación de ARN

Estudio del mecanismo de transcripción del ADN – Backtacking

Conclusiones

Off – Topic: jugando un poco más…

Topics

Introducción Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Temario

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

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201020052000199519901985198019751970

Ashkin demuestra el efecto

de la presión de radiación

en esferas de látex y

contruye la primer trampa

óptica

Ashkin logra desarrollar

la primer “pinza óptica”

(single beam)

Ashkin y Dziedzic

demuestran la primera

aplicación biológica:

manipulación de virus y

bacterias

Block et al. Primera

aplicación para estudio

de motores moleculares

(Kinesina)

Bustamante, Block, Spudich

Estudios de motores moleculares

Bustamante et al. Estudio

de ADN y su transcripción

Chu: Nobel 1997

(junto a Cohen –

Tannoudji)

Chu: Secretario

de energía de

E.E.U.U.

Origen y evolución

Ashkin & friends juegan mucho

con esferas de varios tamaños

y algunos láser

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

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La técnica: Fundamentos

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

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( )( )xPFm

NAd

x εελε ,2

23

p

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La técnica: Fundamentos

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

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La técnica: Prestaciones

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

•Desplazamientos 3D

•De 1 pN a 100 pN con resoluciones de hasta 100 aN

•Se atrapan partículas de ~10 nm hasta ~10 µm

•La trampa resulta lineal en rango de µm

• 50 mW=> trampas de unos 0.2 pN/nm para esferas de 1 µm

•Utilizando polarizaciones circulares pueden ejercerse torques

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La técnica: Arreglos típicos

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

“Fuente óptica” (Ashkin and Dziedzic, 1971)

Permite suspender suspender partículas donde

la presión de radiación es contrarestada por la

gravedad.

Sin aplicación importante

Haces contrapropagante (Ashkin, 1970)

La presión de radiación de ambos lasers se

cancelan en un punto, manteniendo las

fuerzas radiales debidas al gradiente.

Se obtiene una trampa con estabilidad 3D;

sin embargo esta configuración resulta

complicada de alinear y maniobrar.

Trampa de haz único (Ashkin et al. 1986)

Permite el confinamiento y la manipulación en

3D con sencillez y precisión.

La fuerza restitutiva resulta lineal con el

desplazamiento en un rango amplio.

Permite ejercer torques y controlar rotaciones

utilizando polarización circular.

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La técnica: Arreglos típicos

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Detector de cuadrante

(178mW, 835nm)

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La técnica: Caracterización de las pinzas

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Gijs et al. Biophysical Journal 79, 1155–1167 (2000)

Cámara de ensayos

Caracterizacón de la trampa óptica

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Aplicación: Biopolímeros

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Gijs et al. Biophysical Journal 79, 1155–1167 (2000)

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Page 12: OpticalTweezers - users.df.uba.arusers.df.uba.ar/bragas/Optica en la nanoescala... · Estudio del mecanismo de transcripción del ADN – Backtacking ... Temario OpticalTweezers–R

Aplicación: Caracterización de Titina

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Miklós, et al. Science 276, 1112 (1997)

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Page 13: OpticalTweezers - users.df.uba.arusers.df.uba.ar/bragas/Optica en la nanoescala... · Estudio del mecanismo de transcripción del ADN – Backtacking ... Temario OpticalTweezers–R

Off Topic: algo del ADN

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

0.34nm

2.5 nm

50 nm

0.2 – 20 µm

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

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Aplicación: Jugando con ADN

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Bustamante, et al. Current Opinion in Structural Biology 10, 3 (2000)

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Off Topic: Transcribiendo ADN

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

10 nm

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Aplicación: Estudio de ARN pol II

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

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Aplicación: Estudio de ARN pol II

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Modos de trabajo

Sin feedback

Con feedback

Caracterización de fuerza

Backtracking “espontáneo”

Caracterización de velocidad

Backtracking “inducido”

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Aplicación: Estudio del Backtracking

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Galburt et al., Methods 48, 323–332 (2009)

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Backtracking “espontáneo”

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Aplicación: Estudio del Backtracking

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Galburt et al., Methods 48, 323–332 (2009)

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Backtracking “inducido”

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Aplicación: Estudio del Backtracking

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

Galburt et al., Methods 48, 323–332 (2009)

Optical Tweezers – R. M. Gazoni

Se observa

Se detiene la transcripción y ya no se reanuda

Continua elongación (transcripción) durante el “salto”

Se detiene la elongación durante el “salto” y luego reanuda la transcripción

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Conclusiones

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

• Técnica muy útil y de relativa sencillez para manipular partículas individuales

• Permitió la caracterización mecánica de motores moleculares, sólo realizables en bulk hasta

el momento

• En biología permite la separación y ordenamiento individual de células

• Su aplicación en el estudio de los procesos de transcripción de ADN en forma individual

permitiría aprender más sobre los procesos de verificación y backtracking.

• Extendiendo este estudio a actividad de otras proteínas / estructuras, se podría arrojar luz en

lo referente a los errores de copia de ADN o síntesis de proteínas.

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Off – Topic: Jugando un poco mas…

Motivación Historia La técnicaAplicación:biopolímeros

Off - TopicAplicación:Backtracking

Conclusiones

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