genetica polomorfismos-1
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UNIVERSIDAD TECNICA PARTICULAR DE LOJA
GENETICA CLINICA Y PATOLOGIA MOLECULAR
POLIMORFISMOS
un polimorfismo es una variación en la secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos de una población.
los polimorfismos se distinguen terminológicamente de las mutaciones porsu frecuencia.
Un polimorfismo puede consistir en la sustitución de una simple base nitrogenada(por ejemplo, la sustitución
de una A (adenina) por una C (citosina)
afectan nuestro fenotipo (Estatura: alta/baja; Cabello: claro/oscuro; Color de ojos
Tipos de polimorfismo
Polimorfismos en el número de repetición en tandem VNTR
Polimorfismo de nucleótido simple SNP
Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción RFLP
POLIMORFISMO DE NUCLEÓTIDO SIMPLE SNP
Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las variaciones genómicas humanas, y aparecen cada 1,300 bases , a lo largo del genoma humano
Dos tercios de los SNP corresponden a la sustitución de una citosina (C) por una
timina (T).
Estas variaciones en la secuencia del ADN pueden afectar a la respuesta de los individuos a enfermedades, bacterias, virus, productos químicos, fármacos
Clasificación de los SNPs
Los SNP que tienen implicaciones funcionales sobre los niveles de expresión génica se denominan SNP reguladores (rSNP)
los que alteran la traducción de los ARN mensajeros (ARNm), el corte y empalme, la eficiencia para potenciar o inhibir el corte y empalme, la estabilidad de los ARNm y la función de las proteínas (sin alterar su estructura) se denominan SNP ARN estructurales (srSN
la importancia funcional de los rSNP y srSNP en el desarrollo de enfermedades comunes como hipertensión arterial (HTA), obesidad, artritis reumatoide, enfermedad arterial corona
Algunos SNPs están localizados en zonas que codifican proteínas y otros en zonas no
codificantes.
Los SNPs ofrecen análisis genéticos basados en el análisis de SNPs, que puedan revelar información acerca del riesgo de padecer ciertas enfermedades, como Parkinson,
diabetes, trastorno bipolar, etc
DETECCIÓN
Polimorfismo en la longitud de fragmentos de restricción (SNP-RFLP),
electroforesis en gel para
visualizar fragmentos de
ADN
HPLCPCR
• Electroforesis capilar
• Polimorfismo de conformación de cadena simple.
Existen una gran variedad de métodos analíticos que permiten descubrir nuevos SNP e identificar SNP conocidos en las secuencias de ADN. Entre los
más destacados, podemos encontrar los siguientes
Nomenclatura
Entre la gran variedad de SNP que existen, mostraremos algunos a modo de ejemplo para luego mostrar la asociación entre una patología y numerosos SNPs lo cual nos indica que puede haber multitud de SNPsasociados a una misma enfermedad:
rs6311 y rs6313, SNP
en el gen HTR2A
(receptor de serotonina)
del cromosoma 13 humano
rs3091244 es un ejemplo de SNP trialélicoen el gen CRP(relacionado con procesos
de inflamación) del cromosoma 1 en humanos
Un SNP en el gen F5 es
responsable de un tipo de
trombosis debido a la
presencia del factor V Leiden
El gen TAS2R38determina la
percepción del sabor de la
feniltiocarbamida y tiene
descritos hasta seis SNP
Dentro de diversas patologías ,como es el Cáncer de páncreas, pueden existir numerosos SNPs que se consideran factores de
riesgo para padecer la enfermedad
Rs1561927 en una región no génica entre PVT1 and
LINC00977. Pero su desequilibrio de ligamiento esta
asociado con otro SNPs implicado en
cáncer ovárico
Rs7190458 en el ultimo exón de
BCAR1. La proteinaadaptadora BCAR1
coordina el ciclo celular, organización del citoesqueleto y migración celular.
PCR en tiempo real
Método basado en la aplicación de la técnica dePCR y en la creación de dos sondas alelo específicas, las cuales emiten una señal fluorescente al unirse al templado. Este tipo de análisis es más utilizado hoy en día porque ya existen sondas prediseñadas para un sinnúmero de polimorfismos.
• Bibliografia:
• (bustin SA, 2005; 34: 597-601.10 FOY)Bustin SA, Benes V, Nolan T, Pfaffl MW. Quantitative real-time RT-PCR-a perspective. J Mol Endocrinol. 2005; 34: 597-601.10. Foy