fiche cours medisup

8/18/2019 Fiche Cours Medisup

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!"#$% '% #()*+ ,-. /+0*)#0)*% %0 1*(1*"%0%+ '%+ 1*(0%",%+

203456789:; 6?4; ;@ A46@B; CD

)*+$*, +*-./0 ' 1*$% "2 3*,3*2#% )*+$*, +*-./0 4 1*$% "2 3*,3*2#%

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)*270"2+/ "2 5#*8#"--0 30++0 ",,/0


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', -./!).!/" 0/'+1'/" 2"- 0/(."'3"-

41 4'1'-(3 0"0.'2'5!"

2"6'3'.'(3-

47879:; =:8E7?=; ?)@Aqui est constituée à l’intérieur des cellules lors de la traduction

(lecture de l’ARN messager par tout le système complexe de la synthèse des protéines). Elle s’établit entre la fonction carboxylique d’un AA et la fonction amine d’un autre ABC

0=7?=9 %


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".10"- 2! -"5!"3)1]"

DEFINITION

Q09L@A=;^8I=d’une CZ8[;= HAC>AH= HAC>AH= = ; K2$5*%%J


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41 )*/(+1.(]/10*'" 4'5!'2" *1!." 0"/6(/+13)" N*04)O "3 0*1-" '3b"/-"" N/0 *04)O"BB= ?= ?L>=HE7;=H CZ8@A= Z7:ZF?8;>:`;=formée à chaque cycle de dégradation d’Edman Q

Principe

I660 0%+ +#J% 2+$6$%/0 5*2# 52#$1$0# 2,0 5#*+/$,0C

C’est uneEL>Z:?= 9L7D=; ","6=+$K20; A *2 ?= 8I= 9 0660permet de séparer les composés d’un mélange pour pouvoir les identifier.

Elle est basée sur l’affinité des composés=;>H= c 7:;;87H= 8[ *2 >'[A

I62+$*, 9

60% "3$=;A9 80,+0# 1*# a$*6*8= b,1*#-"+$*,A #03H0#3H0H8 6"L7;=B8 A=BB=9 L7;=9 =;87H=9, d’une base de données, de la protéine séquencée et identifiée "703 6"K206600660% $,+0#"8$%%0,+ :0P 9 60 McdObeta, le collagène de type 2, le collagène de type 7 … sont des partenaires de l’isoforme 7 de la fibronectine).


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'2"3.'6')1.'(3 2"- "d./"+'."- 3 ". ),."/+'314"- 01/ )4'b1]" "3ef+1.'5!"

+L>Z:?=

Clivage enzymatique de l’AA N ou CO+0#-$,"6 5"# 2,0_ =P:505+$ =; ),term de l’AA qu’elles H=C:;;8799=;>Q

Ces enzymes peut être utilisée en combinaison afin d’obtenirC

!*2# 3H"K20 505+$


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'', )(36(/+1.'(3 ./'2'+"3-'(33"44" -./!).!/" 2"- 0/(."'3"-

/"41.'(3 -./!).!/" 0/'+1'/" h )(36(/+1.'(3 ./'2'+"3-'(33"44"

Q" %+#23+2#0 5#$-"$#0 :0,3H"V,0-0,+ 0, BB%A HAC>AH=9

9=C:;?87H=9

Q" 6$"$%*, 505+$ interactions avec l’environnement en créant des régionsH=D? 0+ )O@ +#*5 /6*$8,/% DE ';9>8UB= 9=AB=Q une hélice α gauche n’est pas symétrique d’une hélice α droite. W+".$6$%/0 5"# 9

B%%*3$"+$*, 5"# ( DE.H7H8?AC>7:;;=BB=9 d’AAs 9

! g/"6$%/0% 5"# ! Formation d’HydroxyLys et d’HydroxyPro ! d*#-"+$*, 0% -* :!" $ %&'()*+ A 3*66"8J,0 $,%+".60C


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->HAC>AH=9 U=>8

6=A7BB=>9 8

Formation d’un cylindre fermé

IP 9 5#*+/$,0


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-./!).!/" ."/.'1'/"

6(/+1.'(3 2" 41 -./!).!/" ."/.'1'/" N'''O

2LT7;7>7:;9

Q" %+#23+2#0 +0#+$"$#0 0%+ 60 6" %+#23+2#0 %5"+$"60 K20 5#0,< 2,0 5#*+/$,0 86*.26"$#0 5"#H= ?= B8 CZ8[;= 9AH=BB=,EVE=Q

!*2# 2,0 5#*+/$,0 HAC>AH= >=H>787H=:C:;T:HE8>7:; ;8>7D= A 50#-0+ 6"T:;C>7:; U7:B:I7@A=Q

Forces d’interaction=> 9>8U7B7>L

C:;T:HE8>7:;;=BB=?=9 L7;=9

Q"9>8U7B7>L =9

0:;>9 ?79ABTAH=9_ 7;>=H8C>7:;9C:D8B=;>=9

60% 562% #"#0% =PC=997D=E=;> 9>8UB=9 s’établissent entre 2 résidus de 3=%+/$,0C ΔG: _ ,WaJ nohE:B

';>=H8C>7:;9;:;,C:D8B=;>=9

47879:;9 ZF?H:


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1210.1.'(3 2"- 0/(."'3"- 1 4"!/ "3b'/(33"+"3.

4=9 L7;=9 9:BAUB=9

2LT7;7>7:;

I660% %*,+ ,*-.#02%0%C I660% 3*-5#0,,0,+ 60% 5#*+/$,0% 7/H$326/0% 5"# 60 +*##0,+ 3$#326"+*$#0; =H;= ?=9 E=EUH8;=9 306626"$#0%C

Les ancrages membranaires peuvent se faire par un ancrage de la protéine par une chaîne d’acide gras 9 B7879:; 8E7?=entre l’extrémité aminoterminale d’une protéine et l’ 8C7?= EFH79>7@A= B7879:;9 >Z7:,=9>=H0,+#0 60 3"#.*,=60 7:;

I660% %*,+ 3*-560P0%C I660% %*,+ "HAC>AH= ?=9 L7;=9E=EUH8;87H=9

T, =pour l’eau et les lipides.

G0% 6*8$3$06% K2$ 50#-0++0,+


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2'66"/"3."- -./!).!/"- ."/.'1'/"-

->HAC>AH= 9AHAC>AH=

Correspond à des hélices alpha composées d’une séqu0,30


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-./!).!/" 5!1."/31'/"

2"6'3'.'(3 T,0 5#*+/$,0 " 2,0 %+#23+2#0 K2"+0#,"$#0 ::B7I:ELH7@A=A K2",< 0660 0%+ 3*-5*%/0 AH8>7:; ?=9 L7;=9C

+LC8;79E=9d’action

Q0% "80,+%


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1]"3.- 0*f-'5!"-

"BLD8>7:; ?= B8>=EAH=

L’apport d’énergie au milieu augmente les mouvements browniens (vibrationnels) entre les atomes b6 = " "6*#% #25+2#0 9O

>H6*#"+0% 9 %261*3H6*#"+0%; H=5*3H6*#$+0 =9 E:BLCAB=97:; C:;C=;>HL=O

T#/0; 3H6*#2#0 A

>HG9 _ 899=g ?L;8>AH8;> C 7:;7@A=

"--*,$2- K2"+0#,"$#0:3H"#80 S %2# 60 )A

6*,820 3H"V,0H=


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-(4!&'4'."

2"6'3'.'(3 Q"9:BAU7B7>L ?=9 L7;=9 AH= ''' C I660 502+ N+#0 -*; 5@; 3*,%+",+0 7:;C

W0260% 30#+"$,0% 5#*+/$,0% 7:;

-7 T:H>= C:;9>8;>= ?7LB=C>H7@A=

3"% effet 9:BAU7B798;>

" -7 T87UB= :L>Z8;:B :A 8CL>:;=A 9 7;>=H8C>7:;9 LB=C>H:9>8>7@A=9 => formation d’agrégats insolubles

:16*326"+$*, 6 *2 :)@hA4W?h F;'OF;4 ]A 9

0110+9:BAU7B798;> utilisé pour un meilleur rendement de l’extraction de protéines

W$LB=DL= 9 7;9:BAU7B798>7:; :D #06"#8"80A 3"#


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1004')1.'(3 2" 4 ’1!]+"3.1.'(3 2" 41 6(/)" '(3'5!" 1! 6/1).'(33"+"3. 2"- 0/(."'3"-

2LT7;7>7:;

Q0 1#"3+$*,,0-0,+ ?=9 C:;C=;>H8>7:;9 CH:7998;>=9 ?=9

L7;=9 ?A 9LHAE 98;IA7;

IP 9A>7B798>7:; ?’A;= 9:BA>7:; 98>AHL= ?=sulfate d’ammonium :h]; U Fj>A 9

précipitation des globulines (sulfate d’ammonium à 2M) l’albumine#0%+0 0, %*62+$*, DE 0660 0%+ 52#$1$/0

]/+H*:; Q IP 9 6" -"%%0 -*6/326"$#0


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'b, TECHNIQUES D’ETUDES DES PROTEINES

CHROMATOGRAPHIE D’EXCLUSION N6'4./1.'(3 -!/ ]"4 -"0*12"dO

&!.

C’est une technique de chromatographie donc de 1#"3+$*,,0-0,+ H= B= B8 >87BB= ?= B8 L7;="%%$-$6/0 U 2,0 %5HJ#0 :#"=*, D #"=*,7:;;87H= 0%+ 2,0 %+#23+2#0 5*#02%0; 3*,+0,",+ 2,I=B3*-5*%/ =9 U7BB=9Q >H"K20 .$660 0%+ 3*,%+$+2/0 H= ?=9 8B:;;8I=

Q0% 3*6*,,0% %*,+ /+"6*,,/0% "703 9


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.")*3'5!"- !.'4'-13. 4" )1/1)."/" 1+0*(."/" 2"- 0/(."'3"-

0/(0/'"."- "4")./'5!"- 2"- 0/(."'3"-

0H:L98EGH=9

Q0% 5#*5#$/+/% "-5H*+J#0% 7;7>78B=E=;> =9 CZ8HIL=9 ;LI8>7D=E=;> %$ 2,LCZ8;I=AH 2"1",C=BBAB:9= 0%+ 2+$6$%/C

Les protéines s’accrochent à la phase stationnaire, de charge *55*%/0C

-L7:;

T,0 D8H78>7:; ?A Q

T, %2$7$


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Pour déterminer sa masse moléculaire, on a analysé un peptide XU27 par chromatographie d’exclusion àl’aide d’une colonne de Séphadex®. Le volume d’élution (Ve) pour le peptide XU27 était de 60 ml.'9:S94, B61 81; =*86)1; 2)*+,- ./*0 1, 234,5+316+- ./30 71 89 :*8*441 5,9314, +1;


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L’identification de l’acide aminé C"terminal d’un peptide est effectuée par ^#0 action de l’iodoacétamide K0 réaction d’une carboxypeptidase (0 +59:,3*4 76 73,S3*,S+53,*8M0 dégradation d’Edman &0 +59:,3*4 76 d+3,*4 T>@@

#$%&'()" "38

La chymotrypsine catalyse l’hydrolyse ^#0 71; 8393;*4;


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(*4:1+494, 89 ;*86X383,5 71;


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(*4:1+494, 89 ;,+6:,6+1 71; I %1; ;,+6:,6+1; ;1:*4793+1; 75


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%9 ;*86X383,5 71; Is’élève en général quand la température dépasse 40°C LI 1;, )9Z3)981 96


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La diéthylaminoéthyl cellulose est un échangeur de cations couramment utilisé en chromatographie d’échad’ions

+*M

&4 ;*86,3*4 794; 64 )38316 71


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/006

#$%&'()" "369

La dénaturation n’altère pas la structure primaire des protéines

+*M

%1; 9V14,; 7549,6+94,; ;*4, :9


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/016 /014 /01/ /011 /010 /008

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