enzimologie - biochimiero.files.wordpress.com · introducere in enzimologie reactii chimice...
TRANSCRIPT
Enzimologie
Ramura a biochimiei
Proprietatile
Activitatea
Semnificatia
Enzimelor
Majoritatea reactiilor biochimice
Catalizate de enzime
Bibliografie laborator
Worthington Enzyme Manual
http://www.worthington-biochem.com/index/manual.html
Introducere in enzimologie
Procesele biologiceReactii chimice
Enzime
Aplicatii in
industrie
alimentara
detergentilor
farmaceuticaShewale-Enzymes Everywhere-1996
Caracteristici ale enzimelor
Anhidraza carbonicăSpecificitate mare
Enzime
Metabolizează
medicamente
Oxidative (cit P450)
Specificitate mică
Conjugative (glucuronozil transferaza)
P. K. Rangachari, Advances in Physiology
Education, 2007, 31(2),140-144
Formarea acidului carbonic
În celula parietală gastrică
o Unicelulare E. coli
Pseudomonas aeruginosa
Lactobacillus
Microorganisme utilizate în biotransformari
newfoodeconomy.com
Factori de virulență produși de
Pseudomonas aeruginosa la nivelul
lumenului pulmonarShaan L. Gellatly & Robert E.W. Hancock Pathogens
and Disease (2013), 67, 159–173
Lactobacillus
casei
www.biose.com
o Drojdii Saccharomyces cerivisiae
Microorganisme utilizate în biotransformari
Petri cu S.cerevisiae
commons.wikimedia.org
Trafic intracelular al proteinelor în S. cerevisiae
o Fungi Aspergillus
Mucor
Microorganisme utilizate în biotransformari
Aspergillus niger
www.microbeworld.org www.daviddarling.info
Mucor
o Procariotele E. coli
Microorganisme utilizate în biotransformari
unicelulare
nu posedă organite celulare
Funcțiile celulare
la nivelul membranei celulare
citoplasmă
proteine, carbohidrați etc
Materialul genetic
cromozomi circulari, plasmide
(ADN circular mai mic)
biotechlearn.org.nz
o Procariotele Transformarea E. Coli
Microorganisme utilizate în biotransformari
Obținere de celule competente
www.mikeblaber.org
Ori - originea replicarii plasmidului pGLO
bla - gena care codează -lactamaza
GFP - gena care clonează proteina de interes
araC - gena care clonează proteina arabinoza C
odec.ca
o Procariotele Transformarea E. Coli
Manipularea plasmidelor
Microorganisme utilizate în biotransformari
bio.classes.ucsc.edu
o Tipuri de procariotele Archaea
Microorganisme utilizate în biotransformari
-O- în loc de grupare esterică în lipide
nu posedă perete celular peptidoglicanic
Se dezvoltă în medii extreme
termofile (T)
psihrofile (T)
barofile (P)
Izolarea de enzime din microorganisme termofile
Aquifex
Una dintre cele mai vechi Archaea
Hipertermofila 70-110 oC
Chemolitotrofică (săruri anorganice)
microbewiki.kenyon.edu
Aquifex pyrophilus
Microorganisme utilizate în biotransformari
Izolarea de enzime din microorganisme termofile
Thermotoga maritima
https://dnasu.org/DNASU/POMApril10.jsp
Un singur cromozom
circular (1.8 Megabaze)
Codează 1877 proteine
Temperatura optimă 80°C
Produce hidrogen
Microorganisme utilizate în biotransformari
Izolarea de enzime din microorganisme termofile
Thermoanaerobium
Pyrococcus
Sulfolobus acidocaldarius
jb.asm.org
Proteina AspA formează un înveliș
protector a în jurul ADN-ului
(în timpul diviziunii celulare)
Temperatura optimă 80°C
Produce H2S
http://factorialist.com/
o Tipuri de procariotele Eubacterii
o Gram pozitive
o Gram negative
Microorganisme utilizate în biotransformari
www.pinterest.com
violet de gentiana
(I2/KI)fuxina
Pseudomonele gram negative
Pseudomonas
Burkholderia
Zymomonas
Agrobacterium
Acetobacter
Gluconobacter
acide
Microorganisme utilizate în biotransformari
Pseudomonele gram negative
Se dezvoltă pe o paletă largă de surse de carbon
Posedă o paletă largă de enzime
Convertesc compușii naturali
xenobioticele
www.pinterest.com
Microorganisme utilizate în biotransformari
Pseudomonele gram negative
Bacteriile care produc acid acetic
2010.igem.org
Microorganisme utilizate în biotransformari
Pseudomonele gram negative
Bacteriile care produc acid alcooli
Reducerea asimetrica a 2-octanonei
Pei Xu, Peng-Xuan Du, Min-HuaZong1 Ning Li & Wen-Yong Lou
Scientific Reports , 6:26158, 2016
Microorganisme utilizate în biotransformari
Pseudomonele gram pozitive
Bogate în “GC”
Corynebacterium
www.dovemed.com
Rhodococcus
Rhodococcus opacus
http://www.nite.go.jp/
Cofactori enzimatici
Bugg,T.-Introduction to enzyme and coenzyme chemistry-Blackwell
Publishing-2004
Fragezirea carnii
Structura papainei (Pdb pap9; Pymol Viewer)
o E.F. Hoppe-Seyler
1862 hemoglobina cristalina
1871 descoperirea invertazei
1875 metoda de clasificare a proteinelor
Cristal de hemoglobina ovina
http://images.nigms.nih.gov/
Cristal de tripsina porcina
L. Pasteur (1876) descoperirea organismelor
anaerobe-Studii asupra berii, alterarea ei si cauzele
care o provoaca
Cai matabolice alternative care
preced procesul de glicoliza
Alba-Lois, L. & Segal-Kischinevzky, C. (2010)
Beer & Wine Makers. Nature Education 3(9):17
www.studyblue.com
Tipuri de microorganisme
Jokichi Takamine (1894)
Aspergillus oryzae
Taka-diastaza, amilaza (1894)
Alfa-amilaza (salivara)
PDB 1smd
o Eduard Buchner (1897)
descopera zimaza care
converteste zaharul in
alcool
o Fratii Buchner
drojdei uscata
fermentatia alcoolica
http://www.preproom.org/practicals
o David Keilin (1925)
descopera citocromul,
enzima importanta
in respiratia celulara
o James B. Sumner
1926 cristalizarea ureazei
1946 premiul Nobel
Dezvoltarea enzimologiei mecanistice
Structura 3D a cit c
http://cheminfo2011.
wikispaces.com/
Structura ureazei
(fasole PDB4GY7)
Bacillus licheniformis
Proteaze in industria detergentilor (1960)
Activitate endoglucanazică (hidrolazică)
https://www.ajas.info
phenelzine
Monoamin oxidaza A
Inhibitori folositi drept medicamente
teygen564s14.weebly.com
https://www.ki.si/en/odseki/