curso herramientas avanzadas de apoyo a la investigación (versión 2011)
DESCRIPTION
Curso impartido en el Programa de Formación de la Universidad Autónoma de Madrid en el curso 2010-2011.TRANSCRIPT
Herramientas Informáticas de Apoyo a la Investigación
(HIAI)
Mariano Rico. UAM 2011
Índice
• Parte 1: Buscando referencias bibliográficas y documentos
• Parte 2: Gestores de referencias• Parte 3: Creando artículos con gestión
automática de referencias• Parte 4: Reutilización de gráficos
Parte 1:Buscando referencias
bibliográficas y documentos
http://biblioteca.uam.es/
Buscando artículos
• http://biblioteca.uam.es Biblioteca Politécnica Recursos de … Guías temáticas
ISI Web of Knowledge
• Ministerio (http://www.accesowok.fecyt.es/)– Pincha “Acceso a la WOK”
• Bibliotecas UAM– http://biblioteca.uam.es/ Politécnica Recursos de…
Bases de datos Web of Knowledge
Registro “desde dentro”
• Pincha en “log in”• Sigue las instrucciones
Acceso a ISI sin estar en la UAM• Opción 1: Usar VPN (“El atajo”)
– Simula estar en la UAM– Suele dar problemas de instalación– Ver las instrucciones en
http://groups.google.com/group/cursoHerramInformUAM/web/acceso-a-la-uam-con-vpn
• Opción 2: (desde sept 07)– Identificación manual (si falla la automática)
• http://www.accesowok.fecyt.es• Usuario: univ.autmad.wok• Contraseña: h7qmkya5pf (la misma para todos los usuarios)• Correo UAM (@uam.es)
Creación de consultas en ISI
Ejemplos
• TS=myoblast* AND AU=Zimmermann R* • SO=(Journal of Ecology OR Ecology
Letters) AND TI=birch • #2 AND #4 • (#1 OR #2) NOT #3 • TS=lactose AND #1
Nuevos formatos de búsqueda (Jul 2006)
Novedades marzo 2011• Truncamiento a mano izquierda de un término. (*hydroxy* recupera Dihydroxylation,
Dihydroxylations, Dihydroxylated, etc.).• Recuperación de las distintas variaciones de una palabra– recupera la palabra
singular y plural ( mice y mouse) la palabra en inglés británica o americana (colour o color) y otras variaciones de una palabra.
• Buscar los nombres completos de los autores.• Los resultados se ordenarán automáticamente por año de publicación y no por la
fecha de indexación.• Más opciones para ordenar los resultados.• Eliminación del límite de resultados de búsquedas• Visualización de los abstracts en la página de resultados.• Crear un informe de citas de la lista marcada.• Las veces que ha sido citado un articulo, ahora incluye las citas de todas las
fuentes de citas en la WOK (Web of Science, Biosis Citation Index y Chinese Citation Index). Se puede ver el total de citas de todas las bases y el total por la base individual.
• Buscar artículos con el Researcher ID de autores (visita www.researcherid.com)• Más información sobre WOK 5.2 en http://www.accesowok.fecyt.es/?page_id=2633
Ordenando
• Por fecha (por defecto)• Por número de citas
Refinando
• Por Subject Area, Document Type, Authors…• Mira todos en “more options/values” • Al final está “Analyze Result” (también debajo
del desplegable de “sort by”.
Exportando (1/2)
• A “Endonote, RefMan, Procite”– Genera un fichero .cgi– Las referencias son añadidas a ese fichero
• Lo puede leer JavRef
• A “Other Reference Software”– BibTeX (lo saca mal (muchas llaves))
Exportando (2/2)
• Si ya tienes EndNote instalado, puede ser que EndNote “capture” el fichero, esto es, se abra la aplicación EndNote en lugar de descargar el fichero
• Para evitarlo hay que deshacer la vinculáción entre el tipo de archivo “.ciw” y EndNote
ISI Proceedings
• No aparece núm refs, pero sí “relevancia”– ¡OJO! Esta “relevancia” es realmente “grado
de ajuste de cada referencia a los datos de la consulta”. Esto es:• Número de términos de la consulta• Número de veces que el término aparece• Grado de proximidad de los términos
ISI Proceedings. Cited vs. Citing
• ¡OJO! Una vez seleccionada la referencia, no confundid:– “Cited references”: el num. Refs. citadas en
el/por artículo) con– “Citing Articles”: los artículos que mencionan
a este. Sólo en Web of Science, aunque a veces ponen un enlace directo desde la referencia de ISI Proceedings
Salvando la historia de búsquedas
Novedad (Jul 2006): RSS
Análisis en ISI Proceedings
• No hay análisis por “Subject category”• Interesante análisis por “Source Title”
Related Records
• Si dos artículos tienen referencian a las mismas fuentes, se asume que están relacionados, aunque sus títulos, abstracts o palabras clave no hagan referencia a los mismos términos
Citation alerts
• Te envían un mail cada vez que aparece un artículo citando uno de los de tu lista
• Se añaden elementos a la “Cited Articles List” pinchando “Create citation alert” cuando se está viendo un Full Record.
Índice de impacto de una revista
• En ISI ir a Journal Citation Report (JCR)• Buscar revista
– Con un año de retraso
• Se muestra en detalle– Cálculo del índice de impacto de la revista– Tendencia del índice de impacto
• Revistas parecidas a una dada• Búsqueda de revistas por área de
conocimiento
Factor-h (1/2)
• Cálculo preciso del impacto de las publicaciones de un autor– Se basa en el número de veces que son citados tus artículos– ANECA/ACAP no usa este índice (aún), sino el impacto de la
revista en la que se publican tus artículos– Usado ya en España para conceder (o no) proyectos según el h
del investigador principal/es. Proyectos Consolider piden h> 5
• Significado del factor h: Un h = 40 (media de los últimos premios nobel) significa 40 artículos con más de 40 referencias
• Más información en– http://www.elpais.com/articulo/futuro/factor/h/clasificacion/cientificos/siglo/XXI/elpfutpor/2005122
1elpepifut_5/Tes– http://www.nature.com/nature/journal/v448/n7155/full/448737a.html – http://www.nature.com/nature/journal/v436/n7053/full/436900a.html
Factor-h. (2/2)
• Ejemplo– Búsqueda de AU=Rico M AND OG=Aut*
– Selecciono Gomez JM, Rico M, Garcia-Sanchez F, et al.
– Click en Rico M– Saca todos los artículos de ese autor (no de
todos los autores Rico M). Click en “Citation Report”
– Se obtiene un análisis detallado del cálculo del factor-h
Más información
SI NO ESTÁ EN ISI
• Ver http://dice.cindoc.csic.es/• Usado por la ANECA• Impacto de las revistas de
Humanidades, Ciencias Sociales, y Jurídicas
DICE
• Bases de datos gratuitas• http://bddoc.csic.es:8080/index.jsp
• Bases de datos por suscripción (enviar formulario que aparece en sitio web. Misma URL pero 80808085. ¿Mejoras respecto a la gratuita?)
• La mejor para humanidades (Sumarios ISOC Ciencias Sociales y Humanidades)
• Aplicación Web en castellano
Biblioteca del CSIC
Humanidades
• CSIC para Humanidades:Summaries ISOC - database on Social Sciences and Humanities
• RESH http://resh.cindoc.csic.es/index.php – Equivalente al JCR para para revistas españolas de
humanidades
• LATINDEX http://www.latindex.unam.mx/ – Lista de revistas hispano-americanas y españolas
• DIALNET http://dialnet.unirioja.es/ – Revistas de Ciencias y Humanidades. Tiene suscripciones tipo
ISI
• PsycINFO http://www.apa.org/psycinfo/ – Para Psicología
DIALNET
• Búsqueda de revistas de Derecho• Búsqueda de artículos
– Bajas pdf (si registrado)– Bajas referencia bibliográfica
• Un poco escondido
Registro en DIALNET
• Rellenar formulario y nos envía un mail para confirmar registro (unos 10 min)
• “Mi Dialnet” (sólo usuarios registrados)
Búsqueda en DIALNET (1/2)
• Para usuarios registrados– Para no registrados hay una búsqueda peor
• Ejemplo:– Términos de la búsqueda: “leyes”– Resultado:
Búsqueda en DIALNET (2/2)
Referencias en DIALNET (1/2)
• Seleccione los artículos y pulse “Selección”. Esto se añade al “carrito”.
Referencias en DIALNET (2/2)
• Para salvar las referencias del carrito– “Selección” y seleccionar formato
Google Scholar
• Buscar en Google Scholar (GS) (http://scholar.google.com)– Agrupa no sólo artículos de revistas sino
también libros (ISI no tiene libros)– Por ejemplo, este artículo apareció en GS y
nos llevó al portal de la ACM
Google Scholar (1/4)
• A partir del título del artículo obtenemos– Pinchando el enlace nos lleva al pdf– Agrupaciones (posiblemente el mismo artículo)– Autores. Útil para ver publicaciones del autor– Cited by. Los artículos que lo citan (aparecen típicamente más
que en ISI)– Related articles. En ISI son artículos con las mismas
referencias, en GS son artículos “similares” (¿palabras?)– Pueden aparecer enlaces a la BL (British Library, para
comprarlo) o a bibliotecas que tienen una copia en papel
Google Scholar (2/4)
• Si seleccionamos “cited by” nos sale la lista de artículos ordenada a su vez por número de citas. – Útil para ver la evolución de una idea a través de
distintos autores.
Google Scholar (3/4)
• Si seleccionamos autor– Saca las publicaciones del autor ordenadas
por número de “cited by”
Google Scholar (4/4)
• Autores con el mismo apellido
Google Scholar (4/5)
• El secreto mejor guardado– Pinchar en “Scholar Preferences”
• No aparece seleccionado inicialmente– Seleccionar el formato de exportación– No olvidar salvar las preferencias
DBLP
• También gratis– Más de 960.000 publicaciones (Nov 07)
• Revistas, congresos, libros…• http://www.informatik.uni-trier.de/~ley/db/index.html
DBLP. Búsqueda por Autor
• Dado el apellido saca todos los nombres completos (nombre + apellido)
• Búsqueda avanzada
DBLP. Características (1/2)
• EE: Es el enlace al DOI– En el ejemplo es http://dx.doi.org/10.1007/11531371_45– Si pinchamos en él nos lleva a la fuente
• En este ejemplo nos lleva a http://www.springerlink.com/content/5mkjjkmb9ch1kq8u/
– El DOI es interesante guardarlo (en JabRef, por ejemplo) para tener el enlace “oficial” al documento
DBLP. Características (1/2)
• Si pinchamos el número– En este ejemplo “4”– Nos lleva a la referencia BibTex
• Que podemos meter en JabRef
DBLP. Otros criterios de búsqueda
• Título del artículo• Nombre de la conferencia• Journal (Nombre abreviado)
Nueva interfaz
INSPEC. Búsqueda avanzada
INSPEC. Resultados
INSPEC. Búsqueda Visual
Otras fuentes. Science Direct
• Exporta formato RIS (leíble por JabRef y EndNote) y RefWorks
Otras fuentes. Scopus
• La UAM no tiene licencia
Referencias de libros
• Amatex (http://www.2ndminute.org:8080/amatex/pages/main.jsp)
– Libros de Amazon Bibtex
Desaparecido
Referencias de libros
• Lead2Amazon (http://http://lead.to/amazon/en/)
– Libros de Amazon Bibtex
MENDELEY
Mendeley
• mendeley.com página web de tus publicaciones
• Gestor de referencias (web y local)
• Plugin para Word
• Red social
Mendeley. Plugin Word (1/2)
Mendeley. Plugin Word (2/2)
Mendeley. Web Importer
MICROSOFT ACADEMIC
http://academic.research.microsoft.com
Búsqueda por dominio
Visual Explorer
Co-author path
Lista de Organizaciones poráreas de conocimiento
Lista de Personas poráreas de conocimiento
Lista de revistas poráreas de conocimiento
Lista de congresos poráreas de conocimiento
Lista de congresos poráreas de conocimiento
PUBLISH OR PERISH
Publica o perece
•El título lo dice todo
•Aplicación gratuita
•Calcula
• El factor-h máximo (usa Google Scholar) de un autor
• El impacto de cualquier revista (incluso no ISI)
Parte 2:Gestores de Referencias
¿Para qué vale? (1/2)
• Para tener un “cajón de referencias”– Al escribir nuestros artículos citamos siempre
a los artículos de nuestro “cajón”.– Mis “amadas” referencias (se les coge cariño)
• Se refinan con el tiempo, con más info en “Review” (JabRef), más detalles, …
• Se clasifican y reclasifican• Tienen un “ciclo de vida” hasta quedar obsoletas
– Cajón único información centralizada
¿Para qué vale? (2/2)
• Para formatear las referencias según lo indicado por la editorial– Formatos más comunes (ver monash.edu.au)
• AIP American Institute of Physics• APA American Psychological Association• Chicago or notes-bibliography• Harvard or author-date• IEEE Institute of Electrical and Electronics Engineers• Turabian• Vancouver or numeric or footnote-endnote, for Biomedical
publications
¿Qué gestor uso?
• Los más populares son – EndNote (de pago)– RefWorks (licencia UAM)
• El mejor (el que yo uso)– JabRef (gratis)
JABREF
JabRef
• Es una aplicación Java Web Start (JWS)– Multiplataforma (Windows, Linux, Mac…)– Actualizaciones automáticas
• Es open source– En SourceForge. Muy activo.– Página web: http://jabref.sourceforge.net
• Exporta a muchos formatos– EndNote, bibTeXML,
OpenOffice bibliography, …
• Importa – ISI, MedLine, y otros muchos– … y Refer/EndNote
• Requiere Java 1.5
JabRef.Instalación
htt
p:/
/jabre
f.so
urc
efo
rge.n
et/
docu
menta
tion.p
hp
• Vía Java Web Start (JWS). La mejor opción para estar actualizado
1.- Ir a una página web con JNLP.• Lo más sencillo. Sin instalación. Click & Run. Necesita JRE
instalado.• Crea un icono de acceso en el escritorio
2.- Usar el javaws de JRE (Java Runtime Env.)• Agrupa todas las aplicaciones JWS• Recomendable: Poner un icono de acceso a javaws en Start
• Instalación en local– Bajar JabRef-2.2b.jar (o la versión que sea)
• Ir a http://sourceforge.net/projects/jabref/• Buscar página de Dowload y navegar hasta llegar al .jar
(o .exe).Descargarlo– Ejecutarlo. Un doble clic al .jar (o .exe) debería arrancar la
aplicación (o el instalador).
JabRef. Ventajas• Gestiona un fichero .bib
– Mismo fichero que Bibtex útil para usuarios de Latex y CiteMaker (Adobe)
• Java Multiplataforma – Windows, Unix (Linux), Mac …
• Inserta referencias en el procesador de texto– Led, WinEd, Lyx/Kile , emacs…
• Comprobación de links huérfanos a ficheros• Comprobaciones de integridad
– Tools Scan Database Integrity Check• Excelente gestión de grupos (clasificación de las
referencias)
• Permite insertar nuestros comentarios acerca del artículo
• La búsqueda incluye el texto de Revisión• No se puede cargar en EndNote
JabRef. Revisión
• Búsqueda por “todo” (cualquier campo)• Búsqueda por campos. Ejemplos:
– author = Rico – title = “Web Semántica”
• Operadores lógicos y paréntesis– (author = miller or title|keywords = "image
processing") and not author = brown
• Expresiones Regulares– author = G.mez (para Gómez y Gomez)
JabRef. Búsqueda
JabRef. Grupos
• Mejor una demostración
JabRef. Gestión de duplicados
En la importaciónHerramienta de gestión de
duplicados
JabRef. DOI
• www.doi.org• Sistema para asignar una URL
permanente a los documentos– Aunque los documentos cambien de
ubicación• Su DOI seguirá apuntando al documento
• Basado en “Agencias Registradoras”
• http://dx.doi.org/ Para doi URL
JabRef y Word
htt
p:/
/ww
w.u
og
uelp
h.c
a/~
gard
nerw
/rese
arc
h/b
ib.h
tm
• No diseñado para Word. No se pueden comunicar directamente.
• Comunicación indirecta:– Se puede convertir a EndNote y de ahí a Word
• Se puede usar un plugin para Word llamado Write-N-Cite (de RefWorks (http://www.refworks.com))
– Se puede cargar en RefWorks• No carga citedreferences, owner, pdf, review, timestamp• Antes obliga a generar la bibliografía en un formato
intermedio (fichero .rwt). En la versión moderna ya no es necesario
JabRef vs. EndNote (1/2)
• JabRef gestiona mejor la clasificación– Permite clasificar por keyword, añadiendo/borrando mis
keywords (para clasificación) al meter/sacar referencias de los grupos
– En EndNote se debe hacer una a una– Detección de pertenencia a varios grupos
• Para un grupo seleccionado permite saber qué referencias tienen al menos una keyword común
– Permite crear un conjunto de keywords “más frecuentes” útiles para clasificar (Tools -> Manage Content Selectors)
• JabRef permite anotaciones (pestaña Review) de cada referencia. EndNote no.– Se permite búsqueda
JabRef vs. EndNote (2/2)
• EndNote muestra el aspecto final (en el documento) de la referencia.– JabRef no lo muestra, dejando esta tarea a
• bibtex en el caso de Latex• EndNote o Write-N-Cite (RefWorks) en el caso de
Word
JabRef. Detalles útiles (1/2)
• Directorio de archivos pdf por omisión– En pestaña “General” Campo “Pdf”
Browse: Abrirá ese directorio inicialmente– Se almacena únicamente el nombre del
fichero pdf (sin el path completo)– Útil si cambiamos el directorio de archivos pdf
JabRef. Detalles útiles (2/2)
• Búsqueda en Bases de Datos Bibliográficas– MedLine. Para medicina– CiteSeer. Para Computer Science (no me
funciona a veces)– IEEEXplore. Ciencias e ingeniería
• Incorpora los resultados encontrados a nuestra BD
Datos XMP en el pdf (1/2)
• XMP es un formato de datos• JabRef permite insertar los datos de una
referencia en el pdf asociado a la referencia.
Datos XMP en el pdf (2/2)
• Si no se desean escribir todos los datos (por ejemplo, la review) se puede indicar
• A partir del pdf con los datos XMP se puede crear la referencia completa en JabRef– Arrastra el pdf a la lista de referencias
JabRef.Export BibtexEndNote
• La conversión de tipos es la siguiente:
BibTeX -> Endnote misc, other -> Generic unpublished -> Manuscript manual -> Computer Program article -> Journal Article book -> Book booklet -> Personal Communication inbook,incollection -> Book Section inproceedings -> Conference Proceedings techreport -> Report mastersthesis, phdthesis -> Thesis
Ver http://jabref.sourceforge.net/help/EndNoteFilters.html
Cargar en JabRef referencias de EndNote• EndNote no exporta bibtex. • Refworks sí lee ficheros y librerías
EndNote.• Solución
– Cargar desde Refworks la librería (o fichero) EndNote
– Exportar desde Refworks en formato BibTex.– Cargar en JabRef el fichero bibtex
ISI odia a BibTeX
• Si en ISI exportamos referencias en formato BibTeX obtenemos campos con dobles llaves– Esto pasa desde 2008
• Solución– Activar una opción en JabRef que elimina las
llaves de más• OptionsPreferences
ENDNOTE
EndNote. Web vs. Local
• Versión Web accesible desde ISI– Para EndNote < “versión X” hay que usar un
plug-in (“Cite-While-You-Write”) para Word• No confundir con Write-N-Cite de RefWorks• La instalación no deja un “ejecutable”, sino una
nueva barra de herramientas en Word• Pide identificación (email y contraseña)
• Versión local. Un instalador convencional.
EndNote Local. Instalación
• EndNote es de Thomson (creadora de ISI)• Es de pago• Para Windows y Mac (no para Unix(Linux))• Sitio web: http://www.endnote.com
• Descarga directa de una versión de evaluación (30 días) de última versión (X4): http://download1.isiresearchsoft.com/demos/ENX401Inst.exe
– (Últimas versiones en http://download1.isiresearchsoft.com/demos)
• Si está instalado Word, le añade un conjunto de botones
EndNote. Usándolo en Word
• Aparece una barra de herramientas nueva
Word 2003
Word 2007
EndNote Local. Ventana principal
Mis referenciasAspecto de la referenciaseleccionada (en azul), usando el “formato de revista” selecionado
“Formato de revista” selecionado
EndNote. Cargando referencias de JabRef• Exporta desde JabRef (todas o sólo las
refs releccionadas) en formato “Endnote(.txt)”
• Importa desde EndNote con “Import Option = EndNote Import”(¡ojo!, no confundir con EndNote Library)
Clasificación en EndNote
• Editar la referencia. Añadir “keywords”.– Se mantienen las keywords originales– Se añaden las nuevas keywords (en rojo)
Para saber cuáles son las tuyas, usa namespaces
Enlace a archivos
• Pueden ser .pdf, imágenes, .doc, etc.
El icono indicafichero adjunto
Subject Bibliography
• Tools -> Subject Bibliography• Subject Fields: típicamente “keywords”• Subject terms: los valores
Cambiando tus keywords
• Cambiemos myStatus.unread por myStatus.read
URL, Link to pdf e Image (1/2)
• No confundirlos.Puede haber varias: externas o internas.Indica la referencia bibliográfica(no el artículo en sí)
Puede haber varias: externas o internas.Indica la hubicación delartículo en sí. Sólo pdf’s.
Sólo una: externa o internaPuede ser cualquier tipode archivo
URL, Link to pdf e Image (2/2)
Esto añade (link To…),o abre (Open Link) la URL
Esto lleva al web site de ISI y muestralos datos de esta referencia
Listas de términos (LT)
“,” no es un delimitadorsalvo que se indique
• LTs para keywords, autores, y revistas • Se pueden hacer otras LTs• Se pueden indicar otros delimitadores
– Útil para rehacer la lista de keywords
Import
• Casi cualquier formato– Usando “filtros” para programas comerciales– ¡¡¡Pero no .bib !!!
• Ejemplos:– ISI CD (Citation indexes)– ISI CE (Referencias)– PubMed
Export
• Fatal. Sólo formatos propietarios– XML– Rtf– Txt– HTML
• No puede generar .bib
EndNote. Soporte
• Sitio web (www.endnote.com) muy completo– Parches– Nuevos “output styles” (por ejemplo, LNCS)– Nuevos “Import filters”– Nuevos “Word Templates”
EndNote. ¡Ojo!
• EndNote pasa la información a Word mediante “campos ocultos”. – La pega: si se modifica la referencia en
EndNote No se actualiza en Word.– La ventaja: Word es autosuficiente no
depende de EndNote una vez insertada la referencia
• Verlo con un ejemplo
REFWORKS
Desde fuera de la UAM
• ID UAM: “RWUAutoMadrid”
Librerías EndNote
• Refworks puede cargar librerías EndNote– Y luego guardarlas en formatos que entiende
JabRef
Importando referencias JabRef
• Ha dejado de funcionar el filtro “JabRef Open Source Bibliography”
• Usa el filtro BibTex
RefWorks. Instalación (1/2)
• RefWorks NO es una aplicación de escritorio– Es una aplicación web “No net, no fun”
• Usa un “añadido” (plug-in) para Word llamado Write-N-Cite (WNC)– WNC III para Windows Vista/7 y Word 2007, ó
Windows XP y Word 2003. (www.refworks.com/appupdate/wnc3inst.exe)
– WNC 2.5 para Mac (http://www.refworks.com/Refworks/WNCDownload.asp)
– WNC para los demás (www.refworks.com/appupdate/wncinstall.exe)
RefWorks. Instalación (2/2)
• En la instalación se puede marcar “Allow working Offline”– Esto permite trabajar sin estar conectado a
Internet– La pega: no se pueden cambiar los datos,
sólo insertar referencias– Es de esperar que se mejore y permita
edición y sincronización automática
Import en RefWorks
• Importa EndNote y bibTeX (JabRef) directamente
• Multitud de otros filtros
Utilidad “Output Style Preview”
• El formato de la revista
Write-N-Cite
• Plug-in para Word– Añade una ventana
flotante (no es una nueva barra de tareas como en EndNote)
– Gestiona dos ficheros• Fuente con refs {{ }}• Generado con el
formato adecuado
Backup
• Permite hacer backup/restore de toda la información almacenada en RefWorks
Ventajas e inconvenientes
• Exporta a EndNote, Bibtex, y básicos• Importa EndNote, Bibtex y muchos otros• Online: ubicuidad. Pega: “No net, no fun”• Backup / Restore. Ficheros propietarios (.rwb)• Write-N-Cite para Word• ¿Ventaja?: clasificación básica basada en carpetas• ¿Utilidad?: Gestión de listas de RSS Feeds• Genera página web con todas las referencias
PROBLEMAS ABIERTOSDonde no llega la tecnología
Tipos de documento
• JabRef usa BibTex internamente.– Bibtex define varios tipos de documentos– Cada tipo tiene unos campos obligatorios
• En JabRef se ve si una ref es completa
• EndNote define otro conjunto de documentos– No hay manera de saber si una ref es completa– La conversión bibtexEndNote es delicada (suele
funcionar bien, pero si falla es muy complicado cambiarlo en EndNote)
Tipos de documentos. Caso real
• Un artículo publicado en Lecture Notes in Computer Science (LNCS) BibTex / EndNote– ¿Es un article / Journal Article?
• En contra: No es un journal (publicación periódica)• A favor: tiene ISSN como las revistas (journals)
– ¿Es un Proceeding / Conference Proceedings?• A favor: son fruto de una conferencia
– ¿Es un InBook / Book Section?• A favor: tiene ISBN, editores, y el Publisher es la editorial Springer)• En contra: no es igual que un libro-libro
– ¿Es un Book / Book?• Seguro que no. Si acaso, el editor del congreso podría decir que es
un libro.
El contenido. Estilo
• Guías de estilo (para Ciencias)– IEEE
• Buscar en Google “IEEE Style Guide Special Sections” (La URL es variable)
• Buscar “Article Preparation and Submission” en www.ieee.org
– ACM• http://www.acm.org/pubs/submissions/submission.
htm
• Errores comunes: Buscar “preparation of papers for IEEE Transactions and Journals” en Google
El contenido. Revisores profesionales de estilo• http://www.prof-editing.com/ (recomendación IEEE)• http://www.journalexperts.com (recomendación Elsevier)• http://www.journalexperts.com/ (usado CNB)• http://www.bostonbioedit.com/• http://www.internationalscienceediting.com/• http://www.asiascienceediting.com/• http://www.bioscsiencewriters.com/• http://www.biomeditor.com/• http://www.oleng.com.au/• http://davidherron.tripod.com/index-6.html• http://documentclinic.com
Parte 3:Creando artículos con gestión
automática de referencias
Latex vs. Word
• Latex es abierto– Word no
• Empezar a escribir– En Word es sencillo– Con Latex cuesta más
• Documento complejo– Word se lía
• Referencias, figuras…
– Latex funciona• Converge a 0 bugs (última versión: 3.141592 / Diciembre 2002)
– Desde 1980http://www.ifs.hr/~mpinter/miktex.html
MS Word. “He visto cosas…”• “He visto cosas en Word que vosotros no creeríais...”
– He visto listas de items formateadas a base de espacios en blanco.– He visto docenas de retornos de carro seguidos al final de una página, para forzar
el cambio a la página siguiente.– He visto una tabla de contenidos de un documento de 300 páginas, generada
totalmente a mano «para evitar problemas».– He visto documentos llenos de imágenes en formato bitmap, ocupando gigas y que
tardan minutos en «repaginarse».– He visto menús desplegables de «Estilos» con centenares de estilos definidos,
ninguno usado de forma consistente en el documento.– He visto siete tipos diferentes de «bullets» en el mismo documento, con niveles de
indentación inconsistentes.– He visto documentos impresos llenos de «¡Error! Marcador no definido»– He visto intentos de crear documentos multi-archivo con Word. Nunca he visto uno
que funcionara.– He visto horas de trabajo desaparecidas por un súbito cuelgue, y copias de
respaldo irrecuperables.– He visto listas de enumerables cuya numeración, en lugar de comenzar en 1,
continuaba de otras de capítulos anteriores, sin que el autor lo notara hasta después de imprimir.
– He visto documentos impresos que no se parecen a lo que se veía en pantalla.– He visto documentos que, al cambiar de ordenador, cambian completamente su
paginación debido a que se usa una impresora diferente.– He visto el mensaje «¿Desea guardar los cambios efectuados en el documento?»
sin haber hecho ningún cambio.– He visto un documento que, al avanzar tras la última página, se copiaba y pegaba
a sí mismo en ese punto, de forma recursiva, aumentando su tamaño hasta colapsar el sistema.
• “Todos esos momentos se perderán en el tiempo, como lágrimas de alegría en la lluvia. Es hora de LaTeX”.
Gra
cias
a h
ttp:/
/ltx
.blo
gsp
ot.
com
/2007/1
1/h
e-v
isto
-cosa
s.htm
l
WORD
Usando WORD
• Todo el mundo sabe usar Word• ¿O no?
– Plantillas de editoriales– Estilos dentro de las plantillas
• Corta y pega de texto mezcla de estilos
– Editor integrado de fórmulas– Referencias cruzadas– Generadores de “Índice”, “Tabla de
contenidos”, y “Lista de Figuras”
LATEX
Aprendiendo Latex
• Tutorial de SlideShare– http://www.slideshare.net/XEmacs/latex-introd
uction-for-word-users
• Latex para documentos en castellano– http://www.aq.upm.es/Departamentos/Fisica/a
gmartin/webpublico/latex/FAQ-CervanTeX/FAQ-CervanTeX.html#toc3
Herramientas para Latex
• En Windows. Opciones:– Miktex (gratuito) + LatexEditor (LEd) (gratuito)
http://www.latexeditor.org/
– Miktex (gratuito) + WinEdt (vers. evaluación)• Miktex:
– http://www.miktex.org/– http://docs.miktex.org/manual/
• WinEdt:– http://www.winedt.com/
– De pago: Scientific WorkPlace, etc.
Una prueba de Latex
• Poner el siguiente texto en el editor
• Guardarlo con el nombre prueba.tex• Compilar el documento
prueba.tex prueba.dvi
• Generar pdfPrueba.dvi prueba.pdf
\documentclass{article} \begin{document} My first \TeX~document. \end{document}
Insertando referencias en latex
• Desde JabRef– Insertar referencias en Led / WinEdt
• Poner código latex para leer la bibliografía– Uso de plantillas bibliográficas
• named.bst (tipo Harvard, i.e. Autor, año)
• Invocar bibtex – .bib .bbl
• Invocar latex– .tex + .bbl .dvi pdf
Conversión latex rft (Word)
• Ver http://www.tug.org/utilities/texconv/textopc.html
• Conversión de fórmulas, tablas… difícil• No conozco ninguno que funcione bien
Parte 4:Reutilización de gráficos
La pega de la Suite MS Office
• Una gráfica no puede escalarse– Los tamaños de letra han quedado fijados por
el usuario– Si se re-escala se mantiene el tamaño de
letra– Grosor de línea no cambia
• Un bloque de texto sí 04080
033332720207202772033
7 027727
332700 0
1307207
00 0
00
400 00
0 00
0
7134073805373
Skills in new technologies
N.A.
%u
sers
Gráficos vectoriales vs. bitmaps
• A cierto nivel de zoom parecen lo mismo
• Vectorial • Bitmap/raster
Herramientas para gestión de gráficos vectoriales y bitmaps• Vectoriales
– Corel Draw (de pago). Descarga pesada: ~250 MB• Gráfico Office a CorelDraw: Edit Paste SpecialPicture
(Enhanced Metafile) para tener un objeto Corel.• Demo, ejemplo con póster (http://
mariano.rico.googlepages.com/poster_ISWC04.ok.cdr)
– MS Visio (licencia UAM)• Muy cerrado (pocos formatos de entrada/salida)
– Adobe Ilustrator (de pago). CNB tiene licencia.• Bitmaps
– Photoshop (NO licencia UAM)• Demo, ejemplo con imagen (
http://mariano.rico.googlepages.com/Bio_Figure2.jpg)
– GIMP (gratis y muy completo)– MS Picture Manager (Viene con la Suite Office)
Vectoriales con Power Point (1/2)
• Pegas– Si reescalo el dibujo
• El grosor de las líneas no cambia• El texto sí, si se ha hecho con cuidado
• Ventajas– Entorno conocido (más vales malo...)– Hay gente que hace pósters con PP
• Feos, muy feos ;-)
Vectoriales con Power Point (2/2)
• El copia y pega de Office– Si creo un gráfico vectorial con PowerPoint, lo
selecciono, lo “copio”, y lo “pego” en Word...– Aparece en Word, pero... NO ES VECTORIAL
• Haz zoom sobre el gráfico y lo verás pixelado
– Motivo: el “pegado” por defecto convierte la imagen vectorial en un bitmap
– Solución: Inicio PegarPegado especial Pegar como “Imagen (metarchivo de Windows)”
Conversiones
• GhostView– La mejor conversión (vectorial vectorial/bitmap)
• ps pdf• ps eps (para usar en Latex o Corel)• ps png, gif, jpeg…
• Para generar un archivo postscript (.ps). Lo mejor:– Una impresora postscript genérica
• Aunque no la tengas físicamente (no es fácil engañar a Windows)• Configura como impresora Color o Escala de Grises• Descargar Drivers de Adobe (“generic postscript printer” en Google)
• Para generar ficheros pdf:– Soluciones Adobe (de pago): Acrobat (no el Reader)– Desde Word: Instalar el generador de pdf (Guardar Como PDFo XPS)
– PdfCreator (gratuito)• Crea una nueva impresora “virtual” que “imprime” ficheros pdf
– Con PrimoPDF (gratuito) • Crea una nueva impresora “virtual” que “imprime” ficheros pdf
Resolución: pixels, dpi, ppp
• dpi = dots per inch = puntos por pulgada (ppp)
• Ejemplo con una foto digital– Tamaño en pixels: 3072 x 2304 (jpeg 1.76MB)
• Para un artículo. Debe ocupar 4’’ y tener 300dpi– 1 pulgada = 2.52 cm– 4´´ son 4´´ x 300dpi = 1200 puntos (pixels)– Hay que reducir la imagen en un factor 3072/1200 =
2.56– Imagen óptima: 1200 x 2304/2.56 = 1200 x 900
• Para un póster. Debe ocupar 20cm y tener 300dpi– 20 cm = 8’’ a 300dpi = 2400 pixels (el doble que antes)– Imagen óptima: 2400 x 1800
Gráficos en artículos
• Vectoriales para “cajas y flechas”– Reutilizables (para pósters, por ejemplo)– Resolución infinita– Formatos (eps, ps, cdr..)
• ps (eps), tiff , pdf, etc permiten vectores + bitmaps• Bitmaps para fotos o captura de pantalla
– ¿A qué resolución?• Resolución de imagen• Resolución de impresión
– ¿En qué formato? (jpeg, gif, png, tiff…)• Formatos con pérdida (jpeg) fotos
– Compresión variable mayor o menor calidad• Formatos sin pérdida (gif, png) figuras con líneas, pantallazos
– Compresión fija
Fuentes incrustadas en PDF (1/3)• El formato pdf no es tan sólido como
parece– Las fuentes pueden no ir incrustadas en el
fichero
• Ejemplo de generación sin fuentes incrustadas– De .tex a .dvi con dvi2ps (caso de Led,
WinEdt)– De .ps a .pdf con ghostview
• Propiedades del pdf generado (abrir en adobe reader y Fichero Propiedades Fuentes)
• Solución: incrustar fuentes– Con PrimoPDF (en grupo Google archivo
Freeware_PrimoPDF.executable renombrado a .exe)
• A partir de un pdf se envía a la “impresora” PrimoPDF, de ahí sale un diálogo para generar el nuevo pdf
• Las propiedades del pdf serán estas:
– Ver ejemplo RicoAICOMM2010.pdf y RicoAICOMM2010.primopdf.pdf
Fuente incrustada
Fuente NO incrustada
Fuentes incrustadas en PDF (2/3)
¡¡Fuentes incrustadas!!
• Word 2007 puede generar pdf– No viene activado inicialmente– Ver “Guardar como”
• Seguir las instrucciones para instalar formatos pdf y xps
– Ventajas:• Si el fichero Word tiene las fuentes incrustadas
genera un pdf con las fuentes incrustadas• Mantiene los enlaces (links internos y externos) en
el pdf generado.
Fuentes incrustadas en PDF (3/3)
SPSS y ficheros vectoriales .eps
• Desde SPSS se puede exportar una gráfica en formato eps
Ejercicio
• Documento a partir de plantilla (TRANS-JOUR.doc en Google Group)
• Añadir imágenes vectoriales y de bitmap (EjemploImagen*.jpg en Google Group)
• Poner referencias del cajón• Generar pdf con fuentes incrustadas
Parte 5:Extras
“Trucos” de Word
• Referencias cruzadas– Para figuras, tablas, secciones…
• Guionado– Para partir las palabras por el sitio adecuado– En Word 2007: Diseño de página Guiones
• Word 2007 tiene su propio gestor de referencias– Es muy simple
• Incrustar fuentes– Guarda como “PDF o XPS”
“Trucos” de PowerPoint
• Incrustar fuentes (distinto de Word)• Paste Special
– Imágenes: Windows Metafile– Texto: Unformatted Text
• Autoformas Conectores
“Trucos” de pdf
• Uso de gráficas generadas (e.g. de Excel)– Para generar un fichero en formato vectorial
(eps)• Genera un pdf (que se vea entera la gráfica)• Recorta la “página” con Adobe Acrobat
(DocumentCrop Pages) hasta tener sólo la figura• Exporta en formato eps (FileExportPostscript)
Utilidades gratuitas
• Google Notebook– Registrarse. Sólo desde aquí se puede descargar la
extensión de Firefox• Del.icio.us
– Gestión de bookmarks. Hay extensión para Firefox.• Google Sites
– 100 MB para crear sitios (páginas) web– WYSIWYG de verdad
• Wuala– Sincronización de archivos y backup– En Wuala puedes cambiar espacio de tu disco por espacio en la
web ¡¡todo el espacio que quieras!! – Dropbox ofrece menos sitio y menos funcionalidad
¿Alguna pregunta?
• ¿Alguna curiosidad?– Herramientas– Cómo hacer…