如何使用scifinder获取医药信息 -...

如何使用SciFinder获取医药信息

--文献部分

中国药科大学

2018.06.07

ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute

朱传娴

客户顾问

[email protected]

ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 2

提纲

• 美国化学文摘社及SciFinder简介

• SciFinder中的文献检索

• 文献检索案例分析

• 文献检索上机练习


美国化学文摘社—Chemical Abstracts Service

•ACS的分支机构

•创建于1907年，简称”CAS”

•最早创立了《化学文摘》

•密切关注，索引和提炼着全球化学相关的文献和专利

•总部座落于俄亥俄州的哥伦布市


CAS——构建最高质量的化学数据库

CAS Scientists

Patents, journals,

web, catalogs, etc.


CAS——构建最高质量的化学数据库

CHEMLIST>34.6万个化学管制品

目录15个国际和国家目录

CHEMCATS

>1.02亿商用化学品>3300万独特的物质>660 个全球化学品供应商>750 化学品目录

CAS REGISTRY>1.18亿个独特物质

>6600百万个基因序列>68亿条物质属性值

CASREACT>7660万条单步多步反

应>1400万条合成制备信

息

MARPAT>113万代表有机或者

金属有机的马库什结构

CAplus>4300万篇杂志，专利，

论文等63家专利授权机构的专

利 CIN化学工业札记>170万条记录，包

括：摘要；题录；CAS 号；化学名

CAS数据库——源于化学，超越化学

生物化学：农化产品管控信息,生化遗传学,发酵,免疫化学,药理学

有机化学各领域：氨基酸,生物分子,碳水化合物,有机金属化合物,类固醇

大分子化学各领域：纤维素、木质素、造纸;涂料、墨水染料、有机颜料 ;合成橡胶 ;纺织品、纤维

应用化学各领域：大气污染,陶瓷,精油、化妆品,化石燃料,黑色金属、合金

物理、无机、分析化学各领域：表面化学,催化剂,相平衡,核现象,电化学



Tips:1. 98%以上的文献，都经过人工索引2. 用Index Term标引文献中的重要技术术语3. 用CAS RN标引出文献中的重要物质4. 用CAS Role标引文献中重要物质的研究领域

CAS数据库最具价值的内容——人工索引


CAS人工标引解决的问题

检索词的同义词拓展：解决不同科研人员由于教育背景、语言、表达

习惯不同导致的对同一个技术术语描述的差异。

用名称、分子式等检索化合物，会导致检索不全、不准的问题。CAS

RN很好的解决了该问题，帮助检索人员实现精准定位化合物的目标。

利用SciFinder中的标引信息（Index Term，CAS RN，CAS Role），

提高效率，启发思路。


SciFinder覆盖的数据库

CHEMLIST>34.6万个化学管制品

目录15个国际和国家目录

CHEMCATS

>1.02亿商用化学品>3300万独特的物质>660 个全球化学品供应商>750 化学品目录

CAS REGISTRY>1.18亿个独特物质

>6600百万个基因序列>68亿条物质属性值

CASREACT>7660万条单步多步反

应>1400万条合成制备信

息

MARPAT>113万代表有机或者

金属有机的马库什结构

CAplus>4300万篇杂志，专利，

论文等63家专利授权机构的专

利Medline

>2200万篇生命科学尤

其是生物医学方面的期刊文献

>5600种期刊文献


SciFinder登录网址: https://scifinder.cas.org/

输入SciFinder帐号和密码


SciFinder主界面

工具栏

检索入口

检索完，请点击退出

已保存的结果集

定题追踪


提纲






SciFinder检索——文献检索

文献检索方法– 主题检索

– 作者名检索

– 机构名检索

– 文献标识符检索

– 期刊名称和专利信息（公开号，申请号等）

– 从物质，反应获得文献

检索策略推荐– 关注某特定领域的文献：主题检索

– 关注物质有关的文献：先获得物质，再获得文献

– 关注某科研人员的文献：作者名检索

– 关注某机构科研进展：机构名检索


文献检索——主题

主题检索：纳米技术在癌症免疫疗法中的应用

检索式：nano with Immunotherapy of cancer

关键词之间用介词连接：in, with, of...


主题检索的候选项

“Concepts”表示对主题词做了同义词的扩展；

“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中;

“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中；


按被引次数排序— Citing References

Citing Reference: 帮助找到最重要的文献

17

文献检索结果


文献分析工具

获取原文

SciFinder提供强大的文献处理工具，帮助处理文献


文献检索结果的Analyze

本领域研究人员本领域研究机构、

合作伙伴、竞争对手期刊涉及学科领域


文献检索结果的AnalyzeIndex Term：

帮助用户了解涉及到的重要技术术语，并修正检索词

选择感兴趣的内容，点击Apply


文献检索结果的Analyze

Publication Year: 分析领域发展趋势

0

20

40

60

80

100

120

140

160

180

1999 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018

文献数量


文献检索结果的Refine

Refine：帮助用户迅速获得需要的文献


文献检索结果的Categorize

Categorize学科分类功能，基于Index Term，根据大学科方向对文献进行自动分类。

学科领域主分类

学科领域副分类

Index Term 选中的Index Term


结果集的保存— Save, Print, Export

Citation manager: 保存成RIS等格式，可导入

EndNote 等文献管理工具

Offline Review：保存成PDF，RTF等格式，

用于脱机浏览

Save：保存在服务器上，方便以

后登陆查看，每次可存1万条记录。

Export：导出至本地电脑。

Print：打印成PDF格式文献详细信息

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文献信息—题录、摘要、索引


重要概念重要物质

文献详情界面包括：1. 标题2. 摘要3. 文献中重要的技术术语4. 文献中重要的物质5. 书目信息6. 获得文献中的物质，反应7. 参考文献8. 链接原文


文献检索小结

主题检索时，使用介词 in, with, of 等作为连接词

跟据检索要求选择合适的候选项

通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围

尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益

使用Categorize可以让系统来实现自动分类


提纲






主题检索：阿奇霉素的结构修饰

检索式： Modification of Azithromycin


浏览结果集发现关键词


获得检索结果集之后首先要随机浏览记录，判断是否是相关文献、是否符合检索要求、是否有更好的关键词，如有必要需要调整检索式

Save：保存结果集于服务器上，方便随时查看浏览结果集发现关键词


获得重要相关词，可再次检索



文献分析工具

获得全面的结果集是做好文献调研的首要条件SciFinder提供强大的文献处理工具，帮助处理文献



利用Inder Term选词

主题检索：植物中天然活性成分的抗癌研究

检索式： Natural Active Component with Anti Cancer



“Concepts”表示对主题词做了同义词的扩展；

“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中;

“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中；

主题检索的候选项

只有153篇吗？


利用Index Term选词

文献分析工具



Index Term基于内容的分析工具，发现natural products, Pharmaceutical 这个和天然活性成分很相关的词

是否用这个词去检索，效果会更好？



新的检索式：

Natural Product with anti cancer

更换检索词后，结果放大近70倍

灵活运用Analyze与Categorize


经常遇到的问题：

1. 如何检索药物的剂型方面的文献？

2. 如何获得药物药代动力学方面的文献？

3. 如何获得药物药理学相关的文献？

4. 如何获得药物分析方面的文献？

……



有哪些分析阿莫西林组份的方法？Amoxicillin

物质标示符包括CAS RN.和化学名称。化学名称可以是通用名称、商品名、俗名



毒理副作用

药分

药物晶形

由物质信息获得特定或全部文献，

然后在文献结果集中筛选相关研

究领域的文献



如何准确获得分析阿莫西林成分的文献？


STN中的CAS Role


巧用CAS Role

查找纯化双氧水（7722-84-1）的文献


巧用CAS Role

噪音信息


巧用CAS Role


巧用CAS Role

浏览记录，判断是否符合要求

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巧用CAS Role

都是需要的文献

52

善用Categorize

检索文献：

1. 去除N-甲基甲酰胺（123-39-7）的文献？

2. 用N-甲基甲酰胺（123-39-7）作洗脱剂的文献？

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善用Categorize

去除N-甲基甲酰胺（123-39-7）

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善用Categorize

需要的文献

55

善用Categorize

噪音信息更多，如何去除？

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善用Categorize

57

善用Categorize

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避免标引时差引起的漏检

对核心期刊及核心专利机构发布的专利的标引在2-3周内完成

9大核心专利机构发布的专利2日内收录进SciFinder

核心期刊的文献7日内收录进SciFinder

在收录至标引期间的文献可能会漏检！

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检索治疗肝病的药物Daclatasvir的相关文献

通过检索物质获得文献准确，但是不够新

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通过主题直接检索物质名称，发现最新的文献

61


通过PY限定最新的文献，与通过物质检索获得的结果集合并

62


标引未完成

目标物质未做重点研究

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中药的检索

从主题检索：中药的拉丁学名和中文名都要检

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中药的检索


提纲





检索“多功能载药蛋白纳米粒”的文献。被引次数最高的文献来自哪

份期刊？发文最多的研究机构是哪家？该研究领域专利多还是期刊

多？在中国发文最多的机构是哪一家？其中研究紫杉醇（paclitaxel）

的有多少文献？

检索阿莫西林有哪些剂型？

检索中药五味子的相关文献。找出分析五味子素（ Schisandrin）的

相关文献

检索你导师发表的文章，并判断他的主要研究方向。


文献检索练习


美国化学文摘社北京代表处

010-62508026

[email protected]

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