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CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2013 American Chemical Society. All rights reserved.

SciFinder 数据库培训

李凤梅

SciFinder 高级培训师

2015.05.25


• 介绍

– SciFinder Web中的内容

• SciFinder Web中的物质检索

– SciFinder Web中的物质结果及物质检索方法

– SciFinder Web中的结构检索

• SciFinder Web中的反应检索

– SciFinder Web中的反应记录及反应检索

– SciFinder Web中的反应设计

• SciFinder Web中具体物质的文献和反应检索

• SciFinder Web中的主题检索注意事项

提纲


SciFinder的覆盖内容

SciFinder Reactions

References

• MARPAT

• >107万专利中的Markush结构• 回溯到1961年• 每天更新

CHEMCATS®

• CHEMCATS 提供物质的供应商信息• >6700万商业信息• >2800万不同种类物质• >880 个全球范围内的供应机构• >990 商品目录的覆盖• 每周更新

CAS REGISTRYSM

• >9580万有机无机物质• >6500万生物序列• >4亿条实验和预测数据• 物质报道文献，回溯到1802年• 每天更新

CAplusSM

• >4000万期刊，专利，学位论文记录.• >1万种科技期刊的覆盖• 63家专利发行机构的专利• 1997年以来的3.65亿条引文记录• 回溯到1800年• 每天更新MEDLINE®

• > 1900万条生命科学相关文献• > 5600 期刊• 回溯到1946年• 每天更新

CASREACT®

• CAS提供的反应信息包含:– 反应中的结构信息

– 反应中所有物质的CAS No

– 详细的反应条件

– 实验过程

• >6160万单步多不反应• >1350万物质合成制备信息• 反应回溯到 1840

• 反应条件起始于 2003

• 每天更新CHEMLIST®

• 全球范围内的法规信息

• >31.2万的化合物• 1980至今的数据• 每周更新

http://www.cas.org/content/at-a-glance







• 介绍










提纲


SciFinder 中的物质检索

– 具体物质优选CAS RN或者化学名称检索– 有机物，天然产物及衍生物 ---结构比较方便– 无机物 ---分子式比较方便– 高分子化合物 ---首先分子式其次结构


利用化学名称检索青蒿素

此处输入物质CAS RN或者化学名称、商品名、俗名


青蒿素记录页面

一个完整的物质结果界面包含：

•物质详情连接•文献连接•反应连接•商品信息连接•管制品信息连接•谱图连接•实验性质连接


青蒿素详情—各种标识及常见理化性质

物质的的CAS号、分子式、结构式、化学名、别名，以及常见性质数值


展开或折叠

青蒿素详情—总览


点击相应类别查看不同性质

青蒿素详情—实验性质


直接打开谱图

青蒿素详情—实验谱图信息

谱图可以导出至本地电脑


预测谱图

青蒿素详情—预测性质

预测性质


青蒿素详情—管制信息

各国管制法规信息


针对那些靶点做过研究

青蒿素详情—生物活性及靶点信息

做过哪些类型的生物活性研究


点击交叉处的钩，快速获取制备专利

青蒿素详情—文献分类

根据物质的研究方向将文献分类


• 介绍










提纲


结构式检索

17


SciFinder结构绘制工具

重复基团工具

铅笔

元素周期表

可变基团

碳链工具

选择工具

旋转工具

环锁定工具

正电子

橡皮

常用基团

R基团定义工具

可变位置连接工具

模版工具

原子锁定工具

镜面旋转工具

负电子

索套选择工具

常见环，多元环工具

C原子和单键恢复工具

结构检索选择

单双键，RS构型，不确定键定义工具

结构和反应切换功能

18


精确结构检索


勾选Single component


勾选Single component，精确检索结果集

获得物质本身、同位素标记物、带电物质等


不勾选Single component，结果集增加混合物、盐

增加的七百多个物质为混合物或盐


SciFinder中亚结构检索—Substructure

23

亚结构检索用于了解物质修饰情况时，建议勾选单组分


亚结构检索结果包含精确检索结果和附加取代的答案

结构中黑色部分为附加取代，浏览整个结果集可以了解物质修饰情况


复杂结构绘制举例1—检索金属配合物

N

P

P

tBuBut

tBu

tBu

Ni

Cl

BF4

该结构中包含：

配体金属阳离子阴离子


检索界面

26

任何一种结构,使用精确结构都可以检索到


NH

Cl

CHON

NH

CHO

ClNH

N

CHO

Cl

N

NH

Cl

CHO

NH

Cl CHO NH

N

Cl CHO NH

O

N

Cl CHO NH

Cl CHO

。。。。。。

复杂结构绘制举例2—使用通式结构检索


结构定义

用亚结构检索获得所有的物质


亚结构检索结果


• 介绍










提纲


SciFinder Web中的反应记录

1. 反应分组功能2. 反应排序功能3. 反应后处理功能4. 反应全景及实验过程5. SciPlanner


SciFinder反应检索

Allow variability only as specified: 仅在特定位点发生变化Substructure:亚结构检索，允许有更多取代情况


反应检索界面


精确反应检索结果


Group by Document 按照出处文献分类显示

来自同一篇文献的反应都被整合到一起并集中显示


Group by Transformation 按照反应类型分类显示

同一类反应被整合到一起并以通式结构集中显示；仅适用于单步反应，未被分类的反应显示在结果集最后


获得有实验步骤的反应结果集


• 介绍










提纲


SciFinder中的包含不同碎片的反应检索

检索要求：

– 某个结构中包含环和Cbz，环上存在Br或者I

– 寻找脱Cbz的一步反应

定义困难：

如何定义这个环系，杂环？C环？Cbz和环的连接方法


有些人会这么定义

尝试进行检索


检索结果

存在我们想要的结果集


但是，更多的是„„

存在大量的环与Cbz不在一个结构上的反应


从物质检索出发进行碎片反应检索

这种类型的反应，需要先去检索和反应相关的物质


亚结构物质检索，获得所有可能的反应物

44

需要定义为单一组分和具备反应物或者试剂角色的物质


所有可能的反应物

45

获得所有的可能的反应物，并获得这些物质作为反应物的反应


可能反应物所参与的反应

这里的反应中的反应物都包含我们要求的结构，这时需进一步把产物限定进去并标明原子对应。


第一次限定，获得单步反应

限定反应步数为一步反应


第二次限定，限定反应中心

48

反应中心沿用之前的定义


限定后的结果

49

都是我们想要的反应结果


• 介绍










提纲


具体物质的文献

获得1476篇氯虫苯甲酰胺的研究文献（包括专利、期刊）


删选出专利

利用文献后处理工具Refine将专利找出，共548篇


按研究领域删选

CA Section Title 帮助了解研究领域


查看具体专利了解制剂详情


利用导航条返回之前检索页面


分析专利发表机构，发现行业竞争者

巴斯夫、拜耳、杜邦等公司是这个领域的领先者

中国广西的一家公司是国内的领先者

这些数据可导出用于简单的市场分析


利用排序找出第一篇专利

可更改为升序

点击Title, 打开查看文献详情


第一篇专利

这篇专利是第一篇报道氯虫苯甲酰胺制备的专利专利申请机构为杜邦申请日期2001年8月13日优先权日期2001年8月13日


该专利的专利族信息

根据这些专利族信息可以解读杜邦公司对于该专利的专利布局


该专利的优先权信息

优先权信息可以帮助判断专利保护日期及到期时间


CAS对于该专利所做的索引

……….

对于重要的概念

做了索引并有一段文字描述说明文献研究内容

对于重要的物质做了索引并且有一段文字描述这些物质的研究情况


返回初始文献页面利用Categorize功能分析

基于索引词按照学科方向进行系统分类


系统分类找出物质的分析文献

分析方面的文献HPLC，液质联用质谱等


HPLC及其与质谱联用的分析文献


返回初始文献页面利用Refine精简文献

使用关键词精简文献


工艺条件改进相关的文献

66


具体物质的合成反应路线


合成反应路线


实验条件及反应出处


来自原文的实验操作过程


反应中所用试剂、催化剂

可以直接查看实验操作过程的反应数量


物质的商业来源

72

可以直接Export到Excel中，又或者使用分析工具，对商业信息进行处理

72


• 介绍










提纲


SciFinder Web中的主题检索

主题：Catalyst of reductive amination

关键词用介词链接


主题检索的候选项

“Concept”表示做了同意词的扩展

“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中

“present anywhere in the reference” 表示同时出现在一段话中


有任何疑问欢迎随时联系我！

李凤梅

SciFinder 培训师

Mail：[email protected]

Tel: 021-64453167-8029

QQ： 2292230112

mailto:[email protected]

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