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Biologie des mammifères marins: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies pathologie et autopsies Jauniaux T., Jauniaux T., Service de Pathologie Service de Pathologie Université de Liège Université de Liège

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Page 1: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Biologie des mammifères marins: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsiespathologie et autopsies

Jauniaux T., Jauniaux T., Service de PathologieService de Pathologie

Université de LiègeUniversité de Liège

Page 2: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

En pratique: 15 h théorie + 10 h TP (autopsie)

Pour autopsie: bottes et tablier!!!

Me contacter:

[email protected]@mumm.ac.be

04/36640780477/252302

Page 3: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Introduction générale- Introduction- Contexte légal et politique- Bioindicateur- Organisation du réseau MARIN- Echouage et autopsie- Principales menaces pour les mammifères marins

Principales lésions et causes de mortalité des petits cétacés

Principales lésions et causes de mortalité des phoques

Principales lésions et causes de mortalité des grands cétacés

Page 4: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Cétacés (79 espèces)

Mysticètes : cétacés à fanons : baleines

Odontocètes : cétacés à dents : dauphins

Pinnipèdes (33 espèces)

Phocidae : phoques

Otariidae : otaries

Odobenidae : morse

Siréniens(4 espèces)

Dugongidae : dugong

Trichechidae : lamantins

Autres

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??

Page 7: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

« … cet animal appartenait à l’embranchement des vertébrés, à la classe des mammifères, au groupe des pisciformes, et finalement à l’ordre des

cétacés. Quant à la famille dans laquelle il prenait rang, baleine, cachalot ou dauphin, quant au genre dont il faisait partie, quant à l’espèce dans

laquelle il convenait de le ranger, c’était une question à élucider ultérieurement. Pour la résoudre, il fallait disséquer ce monstre inconnu,

… »

Jules Vernes,

Vingt mille lieues sous les mers

Page 8: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Introduction générale- Contexte légal et politique- Bioindicateur- Organisation du réseau MARIN- Echouage et autopsie- Principales menaces pour les mammifères marins

Principales lésions et causes de mortalité des cétacés

Principales lésions et causes de mortalité des phoques

Page 9: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Accords de conservation et de protection des mammifères marins en Mer du Nord et Méditerranée : cadre légal-conventions et lois-

- international : Convention on International Trade in Endangered Species, Convention on Migratory Species

- européen: directive Habitat- régional: Agreement on the Conservation of Small Cetaceans of the Baltic and North Sea (ASCOBANS), Agreement on the Conservation of Cetaceans in the Black Sea,Mediterranean Sea and contiguous Atlantic area (ACCOBAM), OSPAR

- national: lois

ESPECES PROTEGEES

Page 10: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Pour la Belgique :

Directive européenne Habitat (1992): cétacés Conférences Internationales de la Mer du Nord (La Haye, 1990; Esbjerg, 1995): cétacés et pinnipèdes ASCOBANS (1994): Agreement on the Conservation of Small Cetaceans of the Baltic and North Sea Arrêté Royal visant la protection des espèces menacées dans les espaces marins sous juridiction de la Belgique (14/02/02)

Page 11: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Bioindicateurs

Longue espérance de vieMammifères (homeothermiques)Environnement pollué“Top predator”

Accumulation des contaminants lipophiles dans la chaîne alimentaire et processus de bioaccumulation.

Mammifères marins : -premiers à exhiber les signes associés à l’exposition aux polluants- concentrations elevées en contaminants

Oeuf ou poule

concentrations elevées en contaminants lesions

Approche multidisciplinaire

Page 12: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Buts- Détermination des causes de mortalité des mammifères marins morts à la côte belge et dans les régions avoisinantes;- Analyses des toxiques présents dans ces espèces;- Gestion des animaux vivants

MoyensFinancé par un programme fédéral

associant: biologistestoxicologistes pathologistes

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Page 14: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Mammifères marins de la Mer du Nord

CetacésMarsouin communLagénorhynquesDauphin bleu-et-blancCachalot

Petit rorqualRorqual commun

Pinnipèdes Phoque communPhoque gris

…lorsque échoués!

Mysticète

Odontocète

Phoque commun

Cachalot Rorqual commun

Marsouin commun

Page 15: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Petit rorqual Baleine à bosse

Dauphin bleu-et-blanc Grand dauphin

Page 16: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

0

20

40

60

80

100

120

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007

Toutes espèces confondues

Page 17: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

ALARME(autorités communales)

IRSNB UGMM

ULg

ECHOUAGE

intervention

Page 18: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Niveau d ’intervention

1

12 (protection civile)

3

Vivants Morts

Sea Life CenterBlangenberghe

DelphinariumHarderwijk

autopsies

Salle d ’autopsieULg

Salle d ’autopsieULg

Plage

ob

ligato

ire

Page 19: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

1. Prise en charge par l’UGMM

2. Appel d’un vétérinaire

3. Transport vers un centre de réhabilitationcentre de réhabilitation

Matériel adéquat

Page 20: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Centre de réhabilitation = Delphinarium d’Harderwijk Delphinarium d’Harderwijk (Hollande)(Hollande)

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Page 22: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

AUTOPSIES:

raisons scientifiques, politiques, médiatiques et sanitaires

Equipe: Pathologiste vétérinaire, accompagné d ’assistants et d ’étudiants (Céto-club)Protocole précisMatériel et infrastructure

Idéalement, l ’autopsie de tous les animaux échoués, quelque soit l ’état de conservation (1 à 5) , la taille (0,8 m à 19 m)

Page 23: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Autopsie de mammifères marins

Relevé systématique de lésionsCollecte de tissus pour l ’examen toxicologique

MAIS AUSSI

Echantillons pour examens bactériologiques, virologiques, parasitologiques et mycologiques

Analyses multidisciplinaires

Page 24: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Repro HP. Viro. Bact. Parasi ML POPs Alim Genet

Peau alcool

Glande mammaire G/D lait lait lait

Dents 3 5:-20°C

Graisse

Muscle

Foie parasite

Surrénale

Ganglion mésentérique

Rate

Gonade

Tractus reproducteur complet

Prostate G/D

Estomac +ulcère parasite

Restes alimentaires

Intestin

Rein alcool

Vessie

Pancreas

Poumon parasite

Ganglion bronchique

Coeur G/D sang

Aorte

Oesophage +ulcère

Thymus

Thyroide

Système nerveux central

Hypophyse

Sang

Placenta, cordon, membrane

Conduit auditif

Oeil

Squelette/einture pelvienne

Lésions

Page 25: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Histopathologie : prélèvement au formol

Virologie : prélèvement à sec (1 cm3) , -80°C ou –20°C

Bactériologie: prélèvement (1 cm3) à sec ou sur milieu de transport ; 4°C

Parasitologie : parasite dans alcool 70 % glycériné

Toxicologie: Métaux lourds (>50 g.): prélèvement à sec, en sachet plastique, –20°CPolluants organiques persistants (>50 g.): : en feuilles d'aluminium, –20°C

Contenu stomacal (analyse alimentaire)Prélèvement (max.) à sec , –20°C

Génétique : prélèvement (1 cm3) dans alcool 70 %

Page 26: Biologie des mammifères marins: pathologie et autopsies Jauniaux T., Service de Pathologie Université de Liège

Principales menaces pour les mammifères marins en Mer du Nord

Capture dans les filets

Infection virale: Morbillivirus

Infestations parasitaires

Infections bactériennes

Contaminants

Divers

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1. Capture dans les filets (by catch) :- Première cause de mortalié des marsouins- Taux de capture > taux de croissance de la population (2 - 4%)- Population estimée : 350.000 (2% : 7.000)

1.1. Evaluation par observateur

Country Fishing area Period Annual rate Reference

Denmark North Sea 1993-1994 4629* (7000**) Vinther, 1996

Denmark Baltic and Nort h Seas 1994-1998 6785 Vinther, 1999

Great-Britain I rish Sea 1993-1994 2200 Tregenza et al., 1997

Sweden Skagerrak 1996-1997 113 Carlström et Bergren, 1999

Great-Britain North Sea 1995-1997 600-800 Anonymous, 2000

Great-Britain North Sea 1998 462 Northridge, com. pers.

* : fisheries for sole, cod and turbot; ** : extrapolation f or all Danish gill-net f isheries

threat for North Sea population threat for local population

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1.2. Evaluation par l’autopsie des mammifères marins échoués

… la plupart des animaux étant rejetés en mer!!!

Species Location Period Reference

Porpoise 10/ 41 British islands 1989-1991 Baker & Martin, 1992

Common dolphin

Striped dolphin

1/8

2/ 4

British islands 1989-1991 Baker, 1992

Common dolphin 30/ 38* British islands 1992 Kuiken et al., 1994

Porpoise

Common dolphin

66/ 234

86/138

British islands 1990-1995 Kirkwood, 1997

Porpoise 31/61 ** German coasts

(Baltic and Nort h Seas)

1991-1993 Benke, 1998

Porpoise 67/197 British islands 1990-1996 J epson, 2000

Porpoise 62/133** German coasts

(Baltic and Nort h Seas)

1991-1996 Siebert et al., 2001

Pays-Bas (2006): 62% (idem Belgique)

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Diagnostic basé sur :- Evidence de capture: lacérations cutanées, hématomes multiples- Evidence de libération des filets: amputations, éventrations- Etat de santé: absence de lésion, bon état d’embonpoint- Evidence d’hypoxie: congestion et oedème pulmonaire, pétéchie

Lésions pas toujours présentes, non pathognomoniques et pas de test spécifique

Estimation de la capture par autopsies “sous-estime” l’impact sur la population

MAIS

BESOIN METHODE SURE

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2. Infection virale : Morbillivirus (aussi Carré, rougeole, peste bovine)

Epidémies majeures chez 5 espèces (6épizooties)

Phoque commun (Mer du Nord)1988: 18.000/25.0002002: 23.000/50.000

Phoque Baikal1987: >10.000/80.000

Phoque de la Caspienne1997 et 2000: >10.000/400.000

Dauphin bleu-et-blanc (Méditerranée):1990: >1.000/20.0002007: ?

Grand dauphin (USA): 1987: 2500/5.000

Cas sporadiques dans d’autres espèces, y compris baleines