การศกษาความสมพนธของยนเครองหมายทเกยวของกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนในน านมในโคนม1

ลกผสมไทยโฮลสไตน 2

Association study of candidate gene marker of fat to protein ratio of milk in Thai Holstein crossbred 3

บทคดยอ: การศกษาครงนมวตถประสงคเพอศกษาผลของยนหลก LEP, ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, STAT5A ตอ4

ลกษณะสดสวนไขมนตอเปอรเซนตโปรตนในน านมจากตวอยางของโคนมลกผสมไทยโฮสไตน โดยทาการเกบตวอยาง5 5

เลอด (หรอ...)ของโคนมลกผสมไทยโฮสไตนจ านวน145 ตวอยาง นามาตรวจสอบรปแบบจโนไทปของแตละยน ดวย6

เทคนค PCR-RFLP ผลจากการวเคราะหรปแบบจโนไทปจากกลมยนทศกษาพบ 2 รปแบบ (ATP1A1, HP3, BTN) และ 3 7

รปแบบ (LEP, ARL4A, STAT5A ) มความถแตละรปแบบเกน 5 เปอรเซนต แสดงใหเหนถงความหลากหลายของตวอยาง8

ทน ามาใชศกษา และผลจากการวเคราะหความสมพนธระหวางยนกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนพบรปแบบของยน 9

ATP1A1 มแนวโนมทจะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนโดยพบวาจโนไทป AB มแนวโนมของคาสดสวนไขมนตอ10

โปรตนสงกวาจโนไทป BB นอกจากนจโนไทป AB ยงมแนวโนมของคาเปอรเซนตไขมนสงกวา จโนไทป BB ดวยเชนกน 11

ดงนนจากการศกษาครงนพบวามความเปนไปไดทจะน ายน ATP1A1 มความเปนไปไดทจะน าไปใชเปนยนเครองหมาย12

ส าหรบสดสวนไขมนตอโปรตนในน านมส าหรบโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน 13

ค าส าคญ: สดสวนไขมนมนตอโปรตน ยนเครองหมาย โคนมไทยลกผสมโฮลสไตน 14

ABSTRACT: The objective of this study was to study effect of major genes follow LEP, ARL4, ATP1A1, HP3, 15

BTN, and STAT5A. That gene may be associated with fat to protein ratio which we use 145 cows Thai-16

Holstein crossbred for collect and perform using PCR-RFLP analysis. The results found genotype frequency of 17

genes more than 5 percentages which we can conclude have polymorphism in this population. In addition the 18

result of association between major genes with fat to protein ratio we found the pattern ATP1A1 gene have 19

tentative association with fat to protein ratio which AB genotype show high fat to protein ratio than BB 20

genotype. Also AB genotype of ATP1A1 has tentative association with fat percentage too. So the result of this 21

study we found probability candidate gene is ATP1A1 to fat to protein ratio. 22

Keywords: fat to protein ratio, candidate gene, Thai-Holstein crossbred 23

ขอคดเหน[c1]: ควรเปลยนชอเรองใหม เนองจากชอเรองไมสอกบเนอหา เพราะในเนอหามทง ไขมน โปรตน สดสวนไขมนตอโปรตน และปรมาณนานม 305 วน เชน “การศกษาความสมพนธของยน LEP,

ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, STAT5A ตอปรมาณ และคณภาพของนานมโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน”

ขอคดเหน[c2]: แนะน ำอำจจะลองปรบชอเรองภำษำองกฤษเปน Study on candidate gene marker

associated with fat to protein ratio of milk in Thai-Holstein crossbred

ขอคดเหน[c3]: ควรระบวธการและเครองมอทใชวเคราะห

ขอคดเหน[c4]: ระบคา P-value

ขอคดเหน[c5]: นาจะแนะนาใหมการศกษาเพอยนยนผลอกครงมากกวาทจะแนะนาใหนาไปใชเลย เนองจากเปนเพยงแนวโนม

ขอคดเหน[c6]: ปรบใหสอดคลองกบทแกไขในภาษาไทยใหม/ ใน abstract ยงมความหมายไมชดเจนในบางประโยค โดยแนะน าปรบการเขยน abstract ใหม โดยไดแนะน าตามทแกไขเบองตน ...อยางไรกผ วจยสามารถเขยนภาษาองกฤษดวยรปประโยคแบบอนได

ขอคดเหน[c7]: ไมสอกบ “ยนเครองหมาย” นาจะเปน gene marker หรอ genetic marker

2

24

บทน า 25

ผลจากการคดเลอกทางพนธกรรมเพอเพมการใหผลผลตน านมในโคนมแมจะเพมศกยภาพในการใหผลผลต26

น านมไดสงขน แตกลบสงผลกระทบตอประสทธภาพการสบพนธ และ ระยะเวลาในการใชงานโคนมต าลง มความเสยงตอ27

การเกดโรค รวมถงการเกดปญหาดานสมดลพลงงานเนองจากแมโคมความตองการใชพลงงานในการใหผลตน านมตาม28

การใหผลผลตทเพมขน และผลกระทบดงกลาวจะยงสงผลมาขนหากไดรบผลกระทบจากปจจยทางดานสภาพภมอากาศ29

รวมดวย ผลจากการขาดสมดลพลงงานในแมโคนนเปนปจจยทท าใหเกดปญหาดานสขภาพตอแมโคนนคอ มความเสยง30

ตอการเกดโรค และสงผลตอการใหผลผลตน านมตลอดระยะการใหน านม (Patton et al., 2007; Nydam et al., 2009) ซง31

ทผานมามการแกไขปญหาสมดลพลงงานโดยเนนการจดการรวมถงการคดเลอกทางพนธกรรมซงเปนแนวทางหนงท32

น ามาใชในการแกปญหาดงกลาว ลกษณะสมดลพลงงานมตวชวดทแสดงใหเหนถงการเกดภาวะขาดสมดลพลงงานหลาย33

ปจจย แตพบวาลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน (Fat to protein ration, FPR) เปนตวชวดทงายและสามารถชวดภาวะ34

สมดลพลงงานได Toni et al. (2011) พบวาการเปลยนแปลงของเปอรเซนตไขมน และเปอรเซนตโปรตนในน านมของโคนม35

ในชวงหลงคลอดเปนชวงทขาดสมดลพลงงานจะมเปอรเซนตไขมนเพมขน แตมเปอรเซนตโปรตนต าลง พรอมทงเมอ36

พจารณาสหสมพนธระหวาง FPR กบลกษณะสมดลพลงงานในชวงใหผลผลตน านมระหวางวนท 15 ถง วนท 90 ของการ37

ใหผลผลตท 0.62 ซงเปนสหสมพนธทอยในระดบปานกลางนนแสดงใหเหนวา FPR สามารถน ามาใชเปนตวชวดสมดล38

พลงงานในโคนมได และเมอพจารณาคาอตราพนธกรรมของลกษณะ FPR อยในชวง0.20-0.54 (Buttchereit et al., 39

2011) ผลจากการรายงานคาอตราพนธกรรมดงกลาวแสดงใหเหนวาลกษณะ FPR มความสามารถในการแสดงออกทาง40

พนธกรรมไดด ศนยผลตน าเชอพนธโคนม (2552) กลาววาการประเมนพนธแบบดงเดมใชเวลา 5-6 ป ซงนานกวาระบบ41

การประเมนพนธจโนม (genome) ทใชเวลาเพยง 2-3 ป เนองดวยเทคโนโลยดานอณพนธศาสตรใชขอมลทางพนธกรรม42

ของสตวรวมกบวธการดงเดม (conventional breeding) เพอประเมนพนธกรรม จงชวยใหมความแมนย าและ43

ความกาวหนาทางพนธกรรมของลกษณะทตองการปรบปรงพนธสงขน (จรรตน และคณะ, 2553) ซงขอมลทางพนธกรรม44

ทนยมคอ candidate gene เปนเครองหมายทางพนธกรรมทมอทธพลตอการแสดงออกของลกษณะทสนใจอยางชดเจน 45

ขอคดเหน[c8]: เขยนใหกระชบมากกวาน เกรนยาวมากไป และเขยนใหครอบคลมถงลกษณะอนๆ ทจะทาการศกษาดวย เพราะเนนเฉพาะ FPR อยางเดยว

ขอคดเหน[c9]: หมายถง GEBV หรอไม หากใชควรเขยนอธบายและระบใหชดเจน

ขอคดเหน[c10]: ควรม Ref.

3

จากการแสดงออกของล าดบเบสทแตกตางกนสงผลใหอลลลและการแสดงออกของลกษณะนนแตกตางกนอยางชดเจนจง46

เปนวธทไดรบความนยม 47

ส าหรบการตรวจหายนทมความสมพนธกบลกษณะการแสดงออกของลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน คอยน 48

Leptin (LEP) อยบนโครโมโซมแทงท 4 ซงเปนเปปไทดฮอรโมนทผลตจากเซลลไขมนมบทบาทตอการท างานของระบบ49

ประสาทสวนกลาง ทเกยวของกบการท างานของไฮโปทาลามสทควบคมเกยวกบการกนได สมดลพลงงาน ระบบสบพนธ 50

และมความสมพนธกบการใหผลผลตน านม (Liefers et al., 2002) ยน ADP-ribosylation factor-like 4A (ARL4A) อยบน51

โครโมโซมแทงท 4 ในโคนมท าหนาทเปน สารตงตน (substrate) ของเอมไซม N-myristoyltransferase และมผลตอ52

พลาสมาเมมแบรนซงม pH เปนตวควบคม การท างาน รวมทงเปนยนทเกยวของกบการขนสงสารระหวางเซลล โดยโคนม53

ในชวงของการใหน านมนนพบวามการแสดงออกของยนดงกลาวมากทสดพบวามความสมพนธตอการใหผลผลตน านม 54

(Irmgard et al., 2007; Rincon et al., 2009) ยน ATPase Na+/K+ transporting alpha 1 (ATP1A1) เปนรปรางชนด55

หนงของ enzyme The bovine Na+, K+-ATPase ซงมรปแบบชนดเอลฟา เอมไซมดงกลาวมความเกยวของใน56

กระบวนการตอบสนองตอสภาวะเครยดเนองจากความรอนทมผลใหเกดภาวะ oxidative stress และยงไวตอการ57

เปลยนแปลงของ Na+, K+ ทเกดจากภาวะ oxidative stress รวมทงยงเปนตวชวดในการควบคมระบบฮอรโมนของทง58

สองไอออน (Liu et al., 2010) ยน Heat Shock Protein 70-2 (HP3) เปนยนทมบทบาทในการชวยบกปองและรกษา59

สภาพของเซลลจากหลายปจจยยกตวอยางเชน ความรอนทจะสงผลกระทบตอเซลล (จฬานย, 2553) ยนดงกลาวจงม60

ความสมพนธกบลกษณะการทนตอสภาพอากาศรอนในโคนม ยน Butyrophillin (BTN) เปนโปรตนชนดหนงซงพบไดใน 61

Milk fat globule membrane ของสตวเลยงลกดวยนมเปนยนทควบคมลกษณะองคประกอบโปรตนและไขมนในโคนม62

ลกผสมโฮลสไตนฟรเชยน (สายใจ และคณะ, 2553; Ogorevc et al., 2009 as cited by Ron et al. 2007) ความสมพนธ63

ของ polymorphisms ใน exon ท 7 ของยน BTN/HaeIII และBTN/SchI ซงพบวาทงสองสวนมการแสดงออกทแตกตางกน64

ของเปอรเซนตไขมน สวนลกษณะปรมาณโปรตน และผลผลตน านมสมพนธกบ BTN/HaeIII (Muszynska et al., 2010) 65

ยน Signal Transducer and Activator of Transcription 5A (STAT5A) เปนปจจยหนงทเกยวของกบตอมน านม และม66

ผลตอการท างานของโปแลคตน (Prolactin) ,การแสดงออกของยนโปรตนน านม SNP ใน STAT5A มความเกยวของกบ67

ลกษณะผลผลตน านม เปอรเซนตไขมน ในโคนมพนธ Jersey, Polish Black และ White, และ US Holstein cattle ( 68

Khatib et al., 2008) ซงจากรายงานของยนดงกลาวจะเหนวาแตละยนมผลตอการเปลยนแปลงและเกยวของกบ69

ขอคดเหน[c11]: นาจะเปน “การรายงานยนทเกยวของกบกระบวนการสรางไขมน โปรตน และผลผลตนานม เชน...” เนองจาก Ref. ทนามาอางอง ไมไดพดถง FPR โดยตรง

4

เปอรเซนตไขมนและโปรตนดงนนในการศกษาครงนจงมวตถประสงคเพอศกษาความสมพนธผลของรปแบบยนหลก 70

LEPLeptin, ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, และ STAT5A ตอลกษณะสดสวนไขมนตอเปอรเซนตโปรตนในน านม 71

72

วธการศกษา 73

ตวอยางและขอมลทใชในการศกษา 74

การศกษาครงนใชตวอยางเลอด?และขอมลจากแมโคนมลกผสมไทยโฮลสไตนจ านวน 145 ตว จากบรษทโคนม75

ฟารมโชคชย จงหวดนครราชสมา โดยแมโคแตละตวนนจะตองปรากฏขอมล ระดบเลอด วนทเกด วนทคลอด รวมทง76

ขอมลลกษณะทางเศรษฐกจดงน ขอมลการใหผลผลตน านม305วน (Aggregated milk yield 305-day, Milk 305-day) 77

เปอรเซนตไขมนนม (Milk fat percentage, %Fat) เปอรเซนตโปรตนนม (Milk protein percentage, %Pro) และสดสวน78

ไขมนตอโปรตน (Fat to protein ratio; FPR) 79

การสกดดเอนเอ 80

การสกดดเอนเอจากน าตวอยางเลอดโดยน ามาปนดวยความเรว 3,000 รอบตอนาท เปนเวลา 15 นาท เพอแยก81

เอาสวนของเมดเลอดขาวทแยกอยชนบนของชนเมดเลอดแดงใสหลอดใหม ลางตะกอนเมดเลอดแดงทปะปนมากบสวน82

ของเมดเลอดขาวดวย 0.9 เปอรเซนต NaCl ปรมาณ 4-5 มลลลตร เขยาเซลลใหสะอาด จากนน น าไปปนในเครองปน83

เหวยงทความเรว 2,500 รอบตอนาท เปนเวลา 5 นาท และท าซ าอก 2 ครง น าตะกอนทไดใสลงใน micro tube ขนาด 1.5 84

มลลลตร จากนนเตม Solution No.1 ปรมาณ 370 L ผสมใหเขากนดวย vortex ทงไวทอณหภมหอง 15 นาท (เขยา85

หลอดทก 5 นาท)น าไปปนทความเรว 10,000 rpm นาน1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน เตม Solution No.2 86

ปรมาณ 500 l vortex ประมาณ 5 วนาท น าไปปนทความเรว 10,000 rpm นาน 1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน87

ท าซ าขอ 4-5 อก 1 ครงลางตะกอนโดยการเตม Solution No.3 ปรมาณ 500 l จากนนน าไปปนทความเรว 10,000 rpm 88

นาน 1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน ผงตะกอนทงไวใหแหงทอณหภมหอง นาน 15 นาท เตมสารละลาย TE buffer 89

(หรอ DNA hydration) ปรมาณ 10-20 l (ขนกบปรมาณเลอดทใชเรมตน) Vortex นาน 5 วนาท น าไปอนใน water bath 90

หรอใน thermoblock ทอณหภม 55 oC นาน 2 ชม. ปนครงสดทายทความเรว 10,000 rpm นาน 5 นาท ดดเฉพาะสวนใส91

ของสารละลายดเอนเอใสลงในหลอดใหม และเกบทอณหภม -20 oC รอการใชงานตอไป 92

ขอคดเหน[c12]: ควรเพม วปส.หรอไม เนองจากในเนอหามมากกวาสดสวนไขมนตอโปรตนในนานม

ขอคดเหน[c13]: โปรดระบขอมลทนามาวเคราะหหาคา EBV วามกตวอยางในแตละลกษณะ (ใช 145 ตว?) พรอมทงใหเหตผลประกอบวาเหตใดจงใชทงชดขอมลลกษณะปรากฏ (คาสงเกต) และคา EBV

ทาไมไมเลอกอยางใดอยางหนง

ขอคดเหน[c14]: ควรใชค าใหสม าเสมอทงเอกสาร ตรวจสอบใหละเอยด

ขอคดเหน[c15]: หรอสามารถเขยนใหกระชบไดโดยใสอางองวธการจากงานวจยคนอนททาเชนเดยวกน เพอเปนการกระชบเนอหา (เนองจากวารสารแกนเกษตรก าหนดเนอหาไมเกน 15 หนา)

ขอคดเหน[c16]: (ดดมาเทาไหร)

ขอคดเหน[c17]: วธการสกดดเอนเอ ควรมอางองวธการ โดยเฉพาะการใช

สารละลาย solution 1, 2,,3 ผวจยควรให รายละเอยดถงสารทใชในแตละ solution)

ขอคดเหน[c18]: (ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)

ขอคดเหน[c19]: ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)

ขอคดเหน[c20]: ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)

ขอคดเหน[c21]: (vortex เขยนความหมายไทยดวยจะชวยผอานเขาใจมากขน ยกตวอยางเชน ผสมสารละลายดวยการเขยา (vortex) ซงแนะน าผวจยให ความส าคญการเขยนภาษาไทยในรายละเอยดทสามารถอธบายได)

ขอคดเหน[c22]: (ควรมการใชภาษาไทยอธบาย water bath)

ขอคดเหน[c23]: นาจะระบวามการตรวจสอบคณภาพและปรมาณ DNA ทสกดไดอยางไรกอนทจะ น าไปวเคราะหตอไป

5

การตรวจสอบจโนไทปของยนดวยเทคนค Polymerase Chain Reaction -Restriction Fragment Length 93

Polymorphism (PCR-RFLP) 94

ดเอนเอทสกดไดถกน าไปเพมชนสวนยนโดยใชเทคนค PCR ในแตละปฏกรยา ประกอบดวยดเอนเอตนแบบ 95

(DNA template) ทมความเขม 50 ng/µl ปรมาตร 1 ไมโครลตร,10X PCR-buffer ปรมาตร 1 ไมโครลตร, MgCl2 ปรมาตร 96

0.8 ไมโครลตร, dNTPs (1.0 mM/each) ปรมาตร 1 ไมโครลตร, Primer forward และ Primer reverse (Table 1) อยาง97

ละปรมาตร 1 ไมโครลตร, 5 U/µl Taq DNA Polymerase ปรมาตร 0.1 ไมโครลตร และปรบปรมาตรดวย sterile water ให98

มปรมาตรรวมทงสน 10 ไมโครลตร โดยมวงรอบการท า PCR อณหภม Initial denaturation 94 ºC 5 นาท Denaturation 99

94 ºC 30 วนาท Annealing ดงแสดงใน Table 1 Extention 72 ºC 30 วนาท จ านวน 30 รอบ และ Final extention 72 ºC 100

5 นาท จากนนน ามาตดดวยเอมไซมตดจ าเพาะการตรวจสอบจดตดทใชในแตละยนดงแสดงใน Table 1 101

Table 1 PCR primers and PCR-RFLP conditions to detect genetic variation of LEP ATP1A1 ARL4A HP3 BTN 102

and STAT5A genes. 103

Genes 5’-sequence-3’

Forward / reverse primer

Annealing

Temperatures

PCR sizes

(bp)

Restriction

enzymes References

LEP F:GTCTGGAGGCAAAGGGCAGAGT

R:CCACCACCTCTGTGGAGTAG

62 ºC 30 sec 522 BsaAI

LEP F:TGGAGTGGCTTGTTATTTTCTTCT

R:GTCCCCGCTTCTGGCTACCTAACT

62 ºC 30 sec 400 Sau3AI Liefers et al.,

(2002)

ATP1A1 F:TGAGCAACCAACGCAACACT

R:TGGAACTGCAATCACTGAGGT

62 ºC 30 sec 330 Rsal

ARL4A F:TTACTGCGACTTGGACCAGTT

R:GTCCACGACAAACACAATGC

60 ºC 30 sec 501 Ddel

HP3 F:GCACCACCTACTCCTGCGTA

R:CTTCATGTCCGACTGCACCA

60 ºC 30 sec 230 Hpy188I

BTN F:TGGAGCTCTATGGAAATGGG

R:TACCCAACAGGAAGAAACAG

60 ºC 30 sec 501 HaeIII สายใจ และคณะ

(2553)

STAT5A F:CCAGGGTGCATACAGGACAG 60 ºC 30 sec 224 MspA1I He et al., (2011)

ขอคดเหน[c24]: แนะน าใชภาษาไทย น ากลนฆาเชอ (sterile water)

ขอคดเหน[c25]: Ref.นนาจะมเพยง Leptin gene

6

R:GCAGGTTACGAGGACTCAGG

การวเคราะหขอมล 104

วเคราะหขอมลดวยโปรแกรม SAS เพอวเคราะหความสมพนธระหวางความถจโนไทป และ คาสงเกตและคาการ105

ผสมพนธ (Estimated Breeding Value, EBV) ของลกษณะFPR ส าหรบการพจารณาความถจโนไทปนนหากพบต ากวา 5 106

เปอรเซนตของฝงจะไมน ามาหาความสมพนธของรปแบบยนกบลกษณะทน ามา วเคราะหคา EBV ของแตละลกษณะดวย107

โปรแกรม REML จากนนน ามาหาความสมพนธของยนกบลกษณะทศกษาโดยใชหลกการ Generalize Linear Model, 108

(GLM) ภายใตโมเดล [1] ส าหรบหาคาสมพนธกบคาสงเกต และโมเดล [2] ส าหรบศกษาความสมพนธกบคา EBV 109

[1] 110

[2] 111

เมอ = คาสงเกตของลกษณะ FPR, และ Ym = คาEBV ของลกษณะ FPR, F%, P%, และMY305, = คาเฉลย112

ของลกษณะทศกษา, = อทธพลของระดบเลอด i (i=1เมอระดบเลอด ≤80.9%HF, 2 เมอระดบเลอด 81%- 113

93.6%HF, 3 เมอระดบเลอด≥ 93.7%HF ) = อทธพลของอายเมอคลอดท j = อทธพลของฤดเมอ114

คลอดทk, = อทธพลของปเมอคลอดทl = อทธพลของรปแบบจโนไทป m ( m = ยน LEP, 115

ARL4A, ATP1A1, HP3, BTN and STAT5A) และ genotype ของยน combine ของยน = ความคลาดเคลอน 116

ผลการศกษาและวจารณ 117

การศกษาขอมลพนฐานทางดานลกษณะปรากฏ (phenotype) ของลกษณะ FPR, F%, P%, และMY305 ดง118

แสดง Table 2 เพอน ามาวเคราะหหายนเครองหมาย (Candidate gene) ทมความสมพนธกบลกษณะดงกลาว เมอ119

พจารณาลกษณะปรากฏของ FPR พบคาเฉลยของขอมลโคนมลกผสมโฮลสไตนทน ามาศกษาครงน อยในชวง 0.68 ถง 120

2.48 ผลจากคา FPR ดงกลาวแสดงใหเหนถงโคนมกลมนอาจจะประสบกบปญหาภาวะขาดสมดลพลงงานเนองจากมคา 121

FPR ต ากวา 1 และมากกวา 2 ซงเปนตวชวดวาหากโคนมมคา FPR ต าหรอสงกวาชวงดงกลาวนนโคนมมความเสยงทจะ122

ประสบกบปญหาขาดสมดลพลงงาน (Toni et al., 2011) เมอพจารณาลกษณะอนจากรายงานคา MY305 ใน Table 2 123

พบวามคาสงกวา รายงานของ จรรตน และสายญ (2546); จรรตน และคณะ (2553) เลกนอย ซงรายงานคา MY305 อย124

ขอคดเหน[c26]: ระบโมเดลทใชในการวเคราะห EBV

ของแตละลกษณะดวย

ขอคดเหน[c27]: แตละอทธพลควรระบดวยวาเปนอทธพลคงท หรอ อทธพลสมในทกๆ อทธพล

ขอคดเหน[c28]: ขอความนเขยนใหมใหชดเจน

7

ในชวง 2,746.9 ถง 4,556.84 Z (ระบหนวย)ส าหรบผลของลกษณะ F% และP% พบวามคาเฉลยอยในชวงใกลเคยงกบ125

รายงานของ ธระ (2553) 126

Table 2 Data description of aggregated milk 305 days, percentage of milk fat and milk protein, the ratio of fat 127

to protein. 128

Traits Mean Standard Deviation Min Max

Fat percentage ( %,) 4.38 2.39 0.72 8.88

Protein percentage (%) 3.14 0.62 2.05 6.89

Fat to protein ratio 1.58 0.90 0.30 3.83

Milk 305-day (kg) 4,674.97 1,054.49 2525.18 7699.77

129

รปแบบความถจโนไทปและความถอลลล 130

ผลจากการตรวจสอบลกษณะรปแบบทางพนธกรรม (Genotype) ของกลมยน LEP/Sau3AI, LEP/BsaAI, 131

ARL4A, ATP1A1, HP3, BTN, และSTAT5A พบยนทแสดงรปแบบจโนไทป ได 3 รปแบบคอ LEP, ARL4A, และSTAT5A 132

และยนทพบจโนไทปเพยง 2 รปแบบจโนไทปคอ ATP1A1, HP3, และBTN ดงแสดงใน Table 3 เมอพจารณาการปรากฏ133

ของความถจโนไทป และความถอลลล พบวาบางรปแบบมความถคอนขางต า อาจเนองจากความถของกลมตวอยางท134

น ามาศกษานน ไดรบผลกระทบจากการคดเลอกเพอเพมประสทธภาพของการใหผลผลต ซงพจารณาไดจากยน 135

LEP/Sau3AI ทมความถจโนไทป AA AB และ BB เทากบ0.51, 0.40, 0.09 ตามล าดบ และแสดงความถอลลล Aเทากบ 136

0.71, และอลลล B เทากบ 0.29 จะเหนไดวารปแบบ BB พบนอยทสดในกลมตวอยาง นนแสดงใหเหนวารปแบบดงกลาว137

อาจมผลตอการใหผลผลตน านมต า อยางไรกตาม Liefers et al. (2002) กลบพบวาอลลล B มผลตอการใหผลผลตน านม138

สง แตกลบปรากฏในฝงนอยกวาอลลล A ซงอาจจะเปนผลมาจากอทธพลแบบ Pleiotropic ของยนLEP และเมอพจารณา139

ถงการแสดงออกของยน LEP ตอการใหผลผลตน านม Clempson et al. (2011) พบวาการแสดงออกของยน LEP 140

เกยวของกบการใหผลผลตน านมทต าแหนง A59V โดยลกษณะ Homozygous TT สงผลใหมการลดผลผลตน านม 1,365 141

กโลกรมตลอด MY305 นอกจากน Javanmard et al. (2010) พบวาลกษณะ Heterozygous AB ยงมความสมพนธกบ142

การใหผลผลตไขมนสง จากทกลาวมาจงอาจเปนสาเหตทท าใหลกษณะ Homozygous ดงกลาวถกคดออกจากฝงโคนม 143

ขอคดเหน[c29]: ควรระบจ านวน n ทนามาวเคราะหดวย และไมแนใจวาตารางนเปนของผ เขยนเอง หรออางอง หากอางองใหใส Ref. ดวย

ขอคดเหน[c30]: ควรใสรปภาพ gel ของแตละยนวาแตละ genotype มรปแบบเปนอยางไร และแตละ band มขนาดเทาไหรระบใหชดเจน เพอผอานจะไดนาไปศกษาตอได และระบรปแบบจโนไทปไดตรงกน

ขอคดเหน[c31]: (.ขอความ”รปแบบมความถคอนขางต า อาจเนองจากความถของกลมตวอยางทน ามาศกษานน ไดรบผลกระทบจากการคดเลอกเพอเพมประสทธภาพของการใหผลผลต“ผ วจยควรมเอกสารสนบสนนขอความดงกลาว ราบไดอยางไรวาความถยนนนๆ นอยเนองมาจากการคดเลอก ซงแสดงความคดเหนแตขาดหลกฐานทชดเจน )

ขอคดเหน[c32]: (ขาดผลการศกษาความสมพนธกบปรมาณน านม ผวจยยงไมนาสรปเชนนได ถาจะพดถงความสมพนธกบลกษณะทางการผลผลตควรมผลการวเคราะหมาสนบสนน)

ขอคดเหน[c33]: Pleiotropic effect คอ ยนต าแหนงหนงมผลในการควบคมลกษณะมากกวาหนงลกษณะ ซงไมนาจะเปนเหตเปนผลของเหตการณน ควรอภปรายใหม

ขอคดเหน[c34]: ชอยอของยนใหทาเปนตวเอยง

แกไขทงเอกสาร/ (เชค format การเขยนชอยนใหสอดคลองตามหลกสากล จะใชตวเอยง หรอตวตง ควรเลอกใชใหเปนรปแบบเดยวกน)

ขอคดเหน[c35]: ชอยอของยนใหทาเปนตวเอยง แกไขทงเอกสาร

8

ยน ATP1A1 พบรปแบบ AB และ BB ซงมความถจโนไทป 0.59 และ 0.41 ตามล าดบ จะเหนวารปแบบ AA ไมปรากฏใน144

ฝงตวอยางซงเมอพจารณาการแสดงออกของยนดงกลาว Liu et al. (2010) พบรปแบบ Heterozygous AB เปนรปแบบท145

สามารถทนตอสภาวะเครยดเนองจากความรอนไดกวาจโนไทปอนดงนนรปแบบ Homozygous AA ทไมปรากฏในกลม146

ตวอยางนนอาจจะเปนกลมโคมความสามารถในการทนรอนแตอาจจะถกคดออกจากฝงเนองจากการเพมผลผลตน านม147

โดยการเพมระดบเลอดโฮลสไตนจนท าใหระดบเลอดพนเมองไทยต ามาก ยน HP3 ปรากฏ 2 รปแบบจโนไทปคอ AA และ 148

AB มความถเทากบ 0.58 และ0.42 ความถอลลล A=0.79 และB=0.21 การปรากฏเพยง 2 รปแบบจโนไทปไมพบรปแบบ 149

BB เนองจาก จฬานย (2553) ศกษาความแตกตางของยนดงกลาวระหวาง 2 สายพนธพบวาโคพนธพนเมองไทยปรากฏ150

ได 2 รปแบบจโนไทปและ โคนมโฮลสไตนฟรเชยนนนไมพบรปแบบใดจงท าใหในการศกษาครงนพบรปแบบยน 2 รปแบบ 151

เนองจากตวอยางทใชในการศกษาเปนโคนมลกผสมกบพนธพนเมองไทย ยนBTN ซงเปนยนทพบ 2 รปแบบจโนไทปม152

ความถ AA=0.85, AB=0.15 และความถอลลล A=0.93, B=0.07 สอดคลองกบ สายใจ และคณะ (2553) พบรปแบบจโน153

ไทปของยน BTN ได 2 รปแบบและไมพบรปแบบ BB ซงเมอพจารณาความสมพนธของแตละรปแบบจโนไทป 154

Bhattacharay et al. (2006) พบวาจโนไทป AA มความสมพนธตอลกษณะทเกยวของกบคณภาพของน านมเชน 155

เปอรเซนตองคประกอบในน านม (Solid percentage, Solid %), เปอรเซนตองคประกอบไมรวมไขมนนม (Solid Not Fat 156

percentage, SNF %) และเปอรเซนตไขมนสงทสดม และจโนไทป BB เปนจไนไทปทแสดงเปอรเซนตไขมนต าสด157

นอกจากน Muszynska et al.(2010) พบวาGGHealll/AGschIเปนกลมทมเปอรเซนตไขมนต าทสดจากทกลาวมาอาจมผลท า158

ใหไมพบรปแบบ BB เนองจากเปนรปแบบทไมมความสมพนธกบลกษณะทดตอการใหผลผลต ส าหรบรปแบบยนของ 159

ARL4A นนยงไมมรายงานวารปแบบใดทมผลตอลกษณะการใหผลผลต และเมอพจารณา STAT5A นนเปนเพยงยนเดยว160

ทแตละรปแบบมความถทใกลเคยงกน 161

Table 3 The genotype and allele frequenciesy of each gene in Thai-Holstein crossbred. 162

Genes Related traits

No.

Animal

(n1)

Genotypic frequencies Allelic frequencies

AA (n) AB (n) BB (n) A B

LEP/Bsa1AI Fertility 142 0.10 (15) 0.37 (52) 0.53 (75) 0.29 0.71

ขอคดเหน[c36]: ควรใชภาษาเขยนวา “เทากบ” และเรยบเรยงประโยคใหม แทนสญลกษณ “=” เชน อลล A และ B มความถเทากบ 0.93 และ 0.07

ตามล าดบ เปนตน

9

LEP/Sau3AI Milk yield 145 0.51 (74) 0.40 (58) 0.09 (13) 0.71 0.29

ARL4A Milk yield 145 0.65 (94) 0.28 (41) 0.07 (10) 0.79 0.21

ATP1A1 Heat tolerance 145 0 0.59 (86) 0.41 (59) 0.30 0.70

HP3 Heat tolerance 143 0.58 (83) 0.42 (60) 0 0.79 0.21

BTN Fat percentage 128 0.85 (109) 0.15 (19) 0 0.93 0.07

STAT5A Protein percentage 133 0.34 (45) 0.40 (53) 0.26 (35) 0.54 0.46

1n is number of animal 163

แนะน าผวจยปรบตารางท 3 ใหม เนองจากในตารางท 3 เปนสวนของผลของความถยนและจโนไทป เทานน สวน related 164

traits ผวจยไมไดศกษาเอง ขอมลสวนนไมควรอยในตารางผลการทดลอง แตเปนสวนหนงของ วรรณกรรมทเกยวของ 165

166

ความสมพนธของยนเครองหมายตอลกษณะปรากฏ 167

สดสวนไขมนตอโปรตน 168

จากผลการศกษาในครงนไมพบความสมพนธระหวางลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนกบยน LEP, ARL4A, 169

BTN, และSTAT5A แตอยางไรกตามยงคงพบวายน ATP1A1 และ HP3 มแนวโนมสมพนธกบลกษณะสดสวนไขมนตอ170

โปรตน (P<0.15) ดงแสดงใน Table 4 และ Table 5 โดยรปแบบ AB ของยน ATP1A1 มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวา171

รปแบบ BB และเมอพจารณาคาทางพนธกรรมพบวารปแบบ BB มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB (Table 5) 172

และส าหรบยน HP3 พบวารปแบบ AA มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB เชนเดยวกบคาทางพนธกรรมพบวา173

รปแบบ AA มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB 174

เปอรเซนตไขมน 175

จากผลการศกษาในครงนไมพบความสมพนธของยน LEP, ARL4A, HP3, BTN, และSTAT5A ตอเปอรเซนต176

ไขมนนมแตอยางไรกตามพบวายน ATP1A1 มแนวโนมสมพนธกบลกษณะ F% (P<0.1) ดงแสดงใน Table 4 และ Table 177

5 โดยพบรปแบบ AB มแนวโนมทใหมเปอรเซนตไขมนสงกวารปแบบ BB แตเมอพจารณาคาทางพนธกรรมของกลบไมพบ178

ความแตกตางระหวาง 2 รปแบบ (Table 5) เมอพจารณายน LEP สอดคลองกบ Liefers et al. (2002); Chebel et al. 179

(2008) ทไมพบความสมพนธของรปแบบยน LEP กบคาสงเกต เชนเดยวกบยน BTN ซง สายใจ และคณะ (2553) ไมพบ180

ขอคดเหน[c37]: ควรใส genotype ดานบนแถวนดวย เนองจาก genotype ไมใช AA AB และ BB

ขอคดเหน[c38]: ) แนะน าใหใสคา P ทวเคราะหได จะใหขอมลไดชดเจนกวา

ขอคดเหน[c39]: 4 (ตาราง 4 และ 5 ใช

อธบายผลการทดลองแตกตางกน ในหวขอทผไมวจยไมไดกลาวถง EBV เลย ใหตดตารางท 5 ออกจากสวนน และเมอจะกลาวถงผล EBV จงจะใชอธบายได

ขอคดเหน[c40]: แนะน าใหใสคา P ทวเคราะหได จะใหขอมลไดชดเจนกวา

10

ความแตกตางในแตละรปแบบของยน BTN ตอคาสงเกต แตเมอพจารณาความสมพนธกบคาทางพนธกรรม สายใจ และ181

คณะ (2553) พบวารปแบบยนของ BTN มความสมพนธกบเปอรเซนตไขมน ผลจากการศกษาในครงนตางจาก 182

(Bhattacharay et al. 2006) ซงพบความสมพนธระหวางยนกบคาสงเกตโดยจโนไทป AA เปนกลมทแสดงเปอรเซนต183

ไขมนสงสด และส าหรบยน STAT5A สอดคลองกบ He et al. (2011) ซงไมพบความสมพนธของยนตอการแสดงออกของ184

เปอรเซนตไขมน 185

เปอรเซนตโปรตน 186

ส าหรบการศกษาความสมพนธของรปแบบยนพบเพยงยน ATP1A1 ทมความสมพนธกบเปอรเซนตโปรตน 187

(P<0.05) ดงแสดงใน Table 5 โดยพบรปแบบ AB มคาทางพนธกรรมของลกษณะดงกลาวสงกวารปแบบ BB แตไมพบ188

ความสมพนธของรปแบบยนกบคาเปอรเซนตโปรตน ส าหรบยน LEP, ARL4A, HP3, BTN, และSTAT5A จากการศกษา189

ครงนไมพบความสมพนธของตอคาสงเกต เมอพจารณายน LEPสอดคลองกบ Liefers et al. (2002) ทไมพบความสมพนธ190

รปแบบยนตอคาสงเกต ตางจาก Chebel et al. (2008)ทพบวารปแบบ AB มความผลท าใหเปอรเซนตโปรตนสงกวา191

รปแบบ AA และ BB ยนBTN สายใจ และคณะ (2553); Bhattacharay et al. 2006) ไมพบความแตกตางในแตละรปแบบ192

ของยน BTN ตอคาสงเกต แตเมอพจารณาความสมพนธกบคาทางพนธกรรม สายใจ และคณะ (2553) พบวาม193

ความสมพนธของรปแบบยน BTN ตอเปอรเซนตโปตน ยนSTAT5A ตางจาก He et al. (2011) ซงพบความสมพนธของ194

รปแบบยนตอคาสงเกตโดยพบวารปแบบ AG และ GG มผลตอเปอรเซนตโปรตนมากกวารปแบบ AA 195

Table 4 Association analysis tests (P-value) for %Fat, %Pro, FPR, and Milk 305-day with genotype of various 196

genes. 197

Genes Genotype %Fat %Pro FPR Milk 305-day

LS SE LS SE LS SE LS SE

LEP/BsaAI

AA 4.15 1.04 3.17 0.29 1.68 0.43 4833.96 345.63

AB 4.63 0.57 3.05 0.16 1.73 0.26 4943.55 264.26

BB 4.11 0.50 3.07 0.15 1.40 0.23 4805.50 240.81

P-value1/ 0.57 0.90 0.30 0.80

LEP/Sau3AI AA 4.42 0.52 3.03 0.15 1.53 0.24 4687.27 259.35

AB 4.70 0.57 3.05 0.16 1.73 0.26 4765.38 262.22

ขอคดเหน[c41]: (หนวย)

ขอคดเหน[c42]: SE หรอ SEM? ถาเปน SEM กรณาแกไขในทก Table

11

BB 4.38 1.06 3.14 0.29 1.76 0.44 4865.08 368.59

P-value 0.82 0.91 0.60 0.84

ARL4A

AA 4.68 0.50 3.04 0.15 1.64 0.23 4772.93 244.25

AB 4.09 0.60 3.04 0.17 1.55 0.27 4713.00 265.89

BB 4.51 1.06 2.74 0.29 1.66 0.47 3956.54 411.03

P-value 0.49 0.51 0.90 0.07

ATP1A1

AB 4.81 0.50 3.08 0.15 1.71 0.23 4731.21 242.90

BB 4.05 0.55 2.96 0.16 1.41 0.25 4762.49 272.63

P-value 0.09 0.30 0.13 0.86

HP3

AA 4.67 0.51 3.00 0.15 1.72 0.23 4635.37 243.72

AB 4.24 0.56 3.10 0.17 1.41 0.26 4958.54 259.52

P-value 0.35 0.43 0.14 0.07

BTN

AA 4.38 0.58 3.06 0.17 1.48 0.26 4815.97 254.03

AB 4.44 0.75 2.89 0.22 1.85 0.33 4893.91 293.70

P-value 0.92 0.36 0.19 0.79

STAT5A

AA 4.66 0.63 3.06 0.18 1.73 0.28 4804.06 270.32

AG 4.03 0.61 3.02 0.18 1.43 0.27 4803.81 261.78

GG 4.78 0.69 2.97 0.21 1.72 0.33 4956.30 268.89

P-value 0.37 0.87 0.39 0.79

1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene แนะน าปรบประโยคใหม ความหมายยง198

ไมสมบรณ 199

200

1. แนะน าปรบหวตารางใหมความชดเจน 201

2. ผวจยควรใหขอมลตวยอในตารางดวย เชน LS และ SE เปนคาอะไร 202

3. แนะน าผวจยใสคา P ในคอลมนเดยวกบคา LS 203

204

ผลผลตน านม 305 วน 205

ผลจากการศกษาความสมพนธของรปแบบยนตอMY305 ไมพบความสมพนธของยนทศกษาตอลกษณะ206

ดงกลาวแตพบแนวโนมของยน ARL4A และ HP3 มความสมพนธกบลกษณะดงกลาวดงแสดงใน Table 4 และ Table 5 207

12

ยน ARL4A มแนวโนมทสมพนธลกษณะMY305 (P< 0.1) โดยรปแบบ AA มแนวโนมใหผลผลตน านมสงสด แตเมอ208

พจารณาจากคาทางพนธกรรมพบวารปแบบ AB ใหผลผลตน านมสงสด (P<0.05) (Table 5) เมอพจารณายนHP3 พบ209

แนวโนมทจะมความสมพนธกบ MY305 ตอทงลกษณะฟโนไทป และคาทางพนธกรรมเมอพจารณาคาฟโนไทปพบวา 210

HP3-AB มแนวโนมใหผลผลตน านมสงกวา BB ท (P<0.1) เชนเดยวกบคาEBV ทพบวา AB นนมแนวโนมสงกวา BB ท 211

(P<0.15) 212

เมอพจารณายน LEP สอดคลองกบ Chebel et al. (2008); Javanmard et al. (2010)ทไมพบความสมพนธรปแบบยนตอ213

คาสงเกต ตางจาก Liefers et al. (2002) ทพบความสมพนธของรปแบบยน AB มความผลท าใหผลผลตน านมสงกวา214

รปแบบ AA และ BB ยน ATP1A1 ตางจาก Liu et al. (2012) ซงพบความสมพนธระหวางยนตอการใหMY305 โดยพบวา 215

ATP1A1-CC เปนกลมทใหผลผลตน านมต าสดแตกตางจากกลมอน และจากรายงานของ ยนBTN สายใจ และคณะ 216

(2553); Zegeye et al. (1999) ซงไมพบความแตกตางในแตละรปแบบของยน BTN ตอคาสงเกต ตางจาก Bhattacharay 217

et al. (2006) ซงพบรปแบบยน AA ทมผลท าตอการใหผลผลตน านมสง ยนSTAT5A สอดคลองกบ He et al. (2011) ซง218

ไมพบความสมพนธของยนตอการแสดงออกของเปอรเซนตไขมน 219

ความสมพนธระหวางสองยนเครองหมายตอลกษณะปรากฏ 220

เมอพจารณาความสมพนธระหวางยนแบบ combination ดงแสดงใน Table 6 ไมพบความสมพนธระหวางยน 221

combination กบ F% และP% แตพบวามยนบางกลมเมอ combination กนแลวมความสมพนธกบลกษณะFPR โดยพบ222

ความสมพนธระหวางยน combination กบFPR โดยมคยนcombination ทมผลตอลกษณะฟโนไทปคอ LEP/BsaAIxBTN, 223

LEP/Sau3AIxBTN และ ATP1A1xBTN เมอพจารณาคยนทมผลทงลกษณะทางฟโนไทปและคาEBVนนพบวามเพยง 224

ATP1A1xBTN ซงพบวาจโนไทป ABAB นนมแนวโนมของคาFPR สงทสด และเมอพจารณาคาEBVจะพบวา จโนไทป225

ดงกลาวมแนวโนมอยในกลมทสงเชนกน ท (P<0.1) แตส าหรบLEP/BsaAIxBTN และLEP/SauAIxBTN นนพบเพยงกลม226

ยนดงกลาวมความสมพนธกบคาฟโนไทปแตไมพบความสมพนธของกลมยนดงกลาวตอคาEBV ส าหรบLEP/BsaAIxBTN 227

พบจโนไทป BBAA แสดงคาFPRต าสดแตกตางจาก จโนไทป ABAA ท (P<0.05) และระหวางLEP/Sau3AIxBTN พบจโน228

ไทป AAAA ทแสดงคาFPRต าแตกตางจากจโนไทป ABAA ท (P<0.05) 229

Table 5 Association tests (P-value) for %Fat_EBV, %Pro_EBV, FPR_EBV, and Milk 305-day_EBV with 230

genotype of various genes. 231

13

Genes Genotype %Fat_EBV %Pro_EBV FPR_EBV Milk 305-day_EBV

LS SE LS SE LS SE LS SE

Leptin/BsaAI

AA -0.34 0.19 -0.08 0.048 -0.02 0.02 98.72 76.09

AB 0.06 0.07 -0.02 0.019 0.01 0.01 235.69 39.62

BB 0.04 0.07 0.01 0.017 0.00 0.01 176.27 34.24

P-value1/ 0.16 0.24 0.39 0.23

Leptin/Sau3

AI

AA 0.05 0.06 0.00 0.017 0.00 0.01 178.95 34.37

AB 0.02 0.07 -0.01 0.018 0.01 0.01 226.60 37.65

BB -0.34 0.19 -0.08 0.048 -0.02 0.02 121.04 81.14

P-value 0.17 0.30 0.50 0.42

ARL4A

AA 0.06 0.06 -0.00 0.015 0.00 0.01 182.28ab 29.76

AB -0.05 0.09 -0.01 0.022 0.01 0.01 259.69b 44.10

BB -0.12 0.20 -0.08 0.048 0.01 0.02 2.58a 94.58

P-value 0.47 0.30 0.83 0.04

ATP1A1

AB -0.02 0.06 0.01a 0.015 -0.01 0.01 215.21 31.10

BB 0.07 0.07 -0.04b 0.019 0.02 0.01 160.26 38.49

P-value 0.38 0.03 0.08 0.27

HP3

AA 0.05 0.06 -0.01 0.015 0.01 0.01 158.56 32.18

AB -0.01 0.08 0.01 0.020 -0.01 0.01 236.16 36.88

P-value 0.52 0.54 0.15 0.12

BTN

AA 0.00 0.06 -0.01 0.014 -0.00 0.01 196.52 28.49

AB 0.00 0.13 -0.02 0.030 0.01 0.01 252.25 69.20

P-value 0.99 0.70 0.72 0.46

STAT5A

AA 0.07 0.09 -0.02 0.021 -0.00 0.01 245.70 44.05

AG 0.04 0.08 0.01 0.019 0.01 0.01 184.93 40.49

GG -0.06 0.10 -0.02 0.025 0.01 0.01 179.34 50.69

P-value 0.57 0.61 0.85 0.51

ขอคดเหน[c43]: ตดออก

14

1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene ดค าแนะน าทใหไวในตารางท 4 232

a,b within a column in each gene with no common superscript are different (P<0.05) 233

234

Table 6 Association tests (P-value) for %Fat, %Fat_EBV, %Pro , %Pro_EBV, FPR , and FPR_EBV, with 235

genotype combine of various genes. 236

Genes Genotype %Fat %Fat_EBV %Pro %Pro_EBV FPR FPR_EBV

LS SE LS SE LS SE LS SE LS SE LS SE

LEP/BsaAI

x BTN

ABAA 5.15 0.70 0.05 0.09 3.02 0.21 -0.02 0.02 1.90b 0.30 0.01 0.01

BBAA 3.96 0.64 -0.01 0.08 3.09 0.20 0.01 0.02 1.20a 0.28 -0.01 0.01

BBAB 4.55 0.86 0.10 0.16 2.94 0.27 -0.02 0.03 1.88ab 0.37 0.03 0.02

P-value1/ 0.16 0.78 0.84 0.53 0.02 0.21

LEP/Sau3

Aix

BTN

AAAA 4.01 0.63 0.01 0.08 3.08 0.20 0.01 0.02 1.24a 0.28 -0.01 0.01

AAAB 4.68 0.83 0.10 0.15 2.93 0.26 -0.03 0.03 1.92b 0.36 0.02 0.02

ABAA 5.07 0.70 0.03 0.08 3.03 0.21 -0.02 0.02 1.85ab 0.30 0.01 0.01

P-value 0.20 0.88 0.83 0.59 0.04 0.33

ATP1A1x

BTN

ABAA 4.47 0.63 -0.08 0.07 3.13 0.19 0.01 0.01 1.46a 0.27 -0.01a 0.01

ABAB 5.05 0.93 0.04 0.17 2.86 0.26 -0.01 0.03 2.30b 0.38 0.02ab 0.02

BBAA 3.98 0.67 0.12 0.09 2.96 0.20 -0.04 0.02 1.28a 0.30 0.02b 0.01

BBAB 3.63 1.06 -0.04 0.18 2.92 0.31 -0.03 0.04 1.11a 0.45 -0.01ab 0.02

P-value 0.56 0.38 0.56 0.40 0.06 0.07

1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene 237 a,b within a column in each gene with no common superscript are different (P<0.05) 238

การวเคราะห combination อธบายเพมเตมดวยวาท าไมถงไมครอบคลมการ combination ของทกยน และผวจย239

มหลกการเลอกวเคราะห combination อยางไร ในการเลอก combine จโนไทปจะใหขอมลอะไรเพมเตม เพราะ240

เนอหาสวนนมส าคญทจะสามารถอธบายไดตอไปถงผลของยนแตละต าแหนง และหรอแสดงออกรวมกนของ241

ยน หรออทธพลอนๆ ขอใหผวจยใหขอมลเพมเตมดวย 242

243

244

15

สรป 245

ผลจากการศกษายนเพอหาความสมพนธกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน ส าหรบน าไปใชในการประเมน246

สภาวะขาดสมดลพลงงาน จากยนทมความเกยวของกบการเปลยนแปลง เปอรเซนตไขมน และเปอรเซนตโปรตน จากกลม247

ตวอยางโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน เมอพจารณาความถจโนไทปและความถอลลลจะเหนวาจโนไทปในแตละยนมความถ248

เกน 5 เปอรเซนตของตวอยางทน ามาศกษาในครงน ซงแสดงใหเหนวากลมตวอยางทศกษานนยงคงมความหลากหลายท249

สามารถน ายนดงกลาวมาใชในการคดเลอกได และเมอพจารณาความแตกตางระหวางปรมาณความถจโนไทปในแตละ250

ยนแสดงใหเหนถงกลมตวอยางทศกษานนไดผานการคดเลอกมาแลวจงท าใหบางจโนไทปพบไดนอยมาก และจากการ251

พจารณาความสมพนธระหวางยนกบสดสวนไขมนตอโปรตนพบเพยงมแนวโนมยนATP1A1 และHP3 ทจะสมพนธกบ252

สดสวนไขมนตอโปรตนซงเมอพจารณาแนวโนมของทงสองยนพบวายนATP1A1 นนมความเหมาะสมตอการน าไปใช253

มากกวายนHP3 เนองจากพบแนวโนมทจะมความสมพนธกบทงคาฟโนไทปและ EBV ของลกษณะสดสวนไขมนตอ254

โปรตน สงกวา ยนHP3 โดยATP1A1-AB เปนจโนไทปทมแนวโนมคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวาจโนไทป BB 255

นอกจากนนยงพบวายนATP1A1 มแนวโนมทจะมความสมพนธกบลกษณะเปอรเซนตไขมนดวย และเมอพจารณา256

ความสมพนธระหวางการท ายนcombineกบสดสวนไขมนตอโปรตน พบวายน LEPxBTN นนมความสมพนธกบสดสวน257

ไขมนตอโปรตนอยางมนยส าคญและพบ ATP1A1xBTN มแนวโนมทจะมความสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตน แต258

อยางไรกตามเมอพจารณาจากความสมพนธของจนโนไทปกบ EBV แลวพบวาATP1A1xBTN นนเปนยนเพยงกลมเดยวท259

มแนวโนมทจะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนโดยพบวาจโนไทปcombineของยน ATP1A1xBTN-ABAB เปนจโนไทป260

ทมแนวโนมคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวากลมอน ดงนนจากการศกษาในครงนจะเหนวายนATP1A1 นนมแนวโนมทม261

ความสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตน และเมอพจารณาจากการท ายนcombine แลวพบวา ATP1A1xBTN มแนวโนมท262

จะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนเชนกน นนแสดงใหเหนวาสามารถใชแคเพยงยน ATP1A1 ทมรปแบบจโนไทป AB 263

แสดงถงกลมโคนมทมแนวโนมจะแสดงคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวาจโนไทปอน 264

เอกสารอางอง 265

จรรตน แสนโภชน และสายนต บวบาน. 2546. การประเมนคาทางพนธกรรมของลกษณะผลผลตน านมส าหรบโคนมใน266

ประเทศไทย. เวชชสารสตวแพทย. 33: 79-90. 267

ขอคดเหน[c44]: - เขยนใหกระชบมากขน/ สรปยาว และใชค าฟ มเฟอย ลดค าทมความหมายซ า -โดยขอใหสรปวาผลการทดลองบอกวาเกดอะไรขนไมตองเขยนผลการทดลองซ าอกรอบ

16

จรรตน แสนโภชน, สายณห บวบาน, และกนกพร ไตรวทยากร. 2553. อทธพลของยนหลก DGAT1 ตอผลผลตและ268

คณภาพน านมในโคนมลกผสมไทย-โฮลสไตน. วารสารเทคโนโลยชวภาพการผลตปศสตว.1: 9-21. 269

จรรตน แสนโภชน, สายณห บวบาน, มนตชย ดวงจนดา, และวฒไกร บญคม. 2553. การประเมนพนธกรรมของลกษณะ270

การใหผลผลตน านมในโคนมลกผสมโฮลสไตนในแตละภมภาคของประเทศไทยโดยใชโมเดลวนทดสอบรเกรซชน271

สม. แกนเกษตร. 38: 55-56. 272

จฬานย นวมจตร. 2553. การศกษาเปรยบเทยบรปแบบและล าดบนวคลโอไทดของยน HSP70-2 ระหวางโคพนเมองไทย273

และโคโฮลสไตนฟรเชยน. วทยานพนธปรญญาวทยาศาสตรบญฑต มหาวทยาลยขอนแกน, ขอนแกน. 274

ธระ รกความสข. 2553. ปญหาพลงงานขาดสมดลในโคนมลกผสมโฮลสไตนฟรเชยนทเลยงในฟารมรายยอยเขตภาค275

ตะวนตกของประเทศไทย รายงานวจยฉบบสมบรณ คณะสตวแพทยศาสตร มหาวทยาลยเกษตรศาสตร. 276

ศนยผลตน าเชอพอพนธโคนม. 2552. การพฒนาระบบประเมนพนธกรรมจโนมเพอการปรบปรงพนธส าหรบลกษณะท277

ส าคญทางเศรษฐกจของโคนมในประเทศไทย.แหลงขอมล: http://www.dpogenetics.com/index. php? 278

Option = com_ content&view=article&id=170: คนเมอ 20 กนยายน 2557. 279

สายใจ ชนสข, ณชย ศราธพนธ, และกลยา เกงวกยกรรม. 2553. การศกษาการแสดงออกของยน Butyrophillin ตอ280

ปรมาณไขมนในน านมโคนมลกผสมไทย-โฮสไตน. วารสารเทคโนโลยชวภาพการผลตปศสตว. 1: 22-32. 281

Bhattacharya, T. K., S. S. Misra, F. D. Sheikh, S. Sukla, P.Kumar, and A. Sharma. 2006. Effect of Butyrophilin 282

gene polymorphism on milk quality traits in crossbred cattle. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 19: 922-926. 283

Buttchereit, N., E. Stamer, W. Junge, and G. Thaller. 2011. Short communication: Genetic relationships among 284

daily energy balance, feed intake, body condition score, and fat to protein ratio of milk in dairy cows. 285

J. Dairy Sci. 94: 1586-1591. 286

Chebel, R. C., F. Susca, and J. E. P. Santos. 2008. Leptin genotype is associated with lactation performance 287

and health of Holstein cows. J. Dairy Sci. 91: 2893-2900. 288

Clempson, A. M., G. E. Pollott, J. S. Brickell, N. E. Bourne, N. Munce, and D. C. Wathes. 2011. Evidence that 289

leptin genotype is associated with fertility, growth, and milk production in Holstein cows. J. Dairy Sci. 290

94: 3618-3628. 291

He, X. M., X. Chu, L. Qiao, J. N. He, P. Q. Wang, T. Feng, R. Di, G. L. Cao, L. Fang, and Y. F. An. 2011. 292

Polymorphisms of STAT5A gene and their association with milk production traits in Holstein cows. 293

Mol Biol Rep. 39: 2901-2907. 294

Heuera, C., W. M. Van Straalenb, Y. H. Schukkena, A. Dirkzwagerb, and J. P. T. M. Noordhuizen. 2000. 295

Prediction of energy balance in a high yielding dairy herd in early lactation: model development and 296

precision. Livest. Prod. Sci. 65: 91-105. 297

17

Irmgard, H., A. Thompson, Christopher M. Sanderson, and S. Munro. 2007. The Arl4 Family of small G 298

proteins can recruit the cytohesin Arf6 exchange factors to the plasma membrane. Curr. Biol. 17: 299

711-716. 300

Javanmard, A., K. Khaledi, N. Asadzadeh, and A. R. Solimanifarjam. 2010. Detection of polymorphism in the 301

Bovine Leptin (LEP) gene: association of a single nucleotide polymorphism with breeding value of 302

milk traits in Iranian Holstein Cattle. J. Mol. Genet. 2: 10-14. 303

Khatib, H., R. L. Monson, V. Schutxkus, D. M. Kohl, G. L. M. Rosa, and J. J. Rutledge. 2008. Mutation in the 304

STAT5A Gene Are Associated with Embryonic Survival and Milk Composition in Cattle. J. Dairy Sci. 305

91: 784-793. 306

Liefers, S. C., M. F. W. te Pas, R. F. Veerkamp, and T. van der Lende. 2002. Associations between Leptin 307

Gene Polymorphisms and Production, Live Weight, Energy Balance, Feed Intake, and Fertility in 308

Holstein Heifers. J. Dairy Sci. 85: 1633-1638. 309

Liu, Y. X., X. Zhou, D. Q. Li, Q. W. Cui, and G. L. Wang. 2010. Association of ATP1A1 gene polymorphism with 310

heat tolerance traits in dairy cattle. Genet. Mol. Res. 9: 891-896. 311

Liu, Y. X., C. H. Xu, T. Y. Gao, and Y. Sun. 2012. Polymorphisms of the ATP1A1 gene associated with mastitis 312

in dairy cattle. Genet. Mol. Res. 11: 651-660. 313

Madeja, Z., T. Adamowicz, A. Chmurzynska, T. Jankowski, J. Melonek, M. Switonski, and T. Strabel. 2004. 314

Short Communication: Effect of leptin gene polymorphisms on breeding value for milk production 315

traits. J. Dairy Sci. 87: 3925-3927. 316

Muszynska, M., I. Szatkowska, W. lhelm Grzesiak, A. Dybus, and D. Zaborski. 2010. Two single nucleotide 317

polymorphisms within bovine butyrophilin gene (BTN/HaeIII and BTN/SchI) and their association with 318

milk performance traits in Jersey cattle. Arch. Tierz. 53: 501-509. 319

Nydam, D. V., P. A. Ospina, T. Stokol, and T. R. Overton. 2009. Evaluation of the effect of non-esterified fatty 320

acid (NEFA) and β-hydroxybutyrate (BHB) concentrations on health, reproduction and production in 321

transition dairy cattle from the northeast USA. Paper presented at the 71st Conference for Feed 322

Manufacturers Proceedings of the Cornell Nutrition, New York. 323

Ogorevc, J., T. Kunej, A. Razpet, and P. Dovc. 2009. Database of cattle candidate genes and genetic 324

markers for milk production and mastitis. Anim. genet. 40: 832-835. 325

Patton, J., D. A. Kenny, S. McNamara, J. F. Mee, F. P. O’Mara, M. G. Diskin, and J. J. Murphy. 2007. 326

Relationships among milk production, energy balance, plasma analytes, and reproduction in 327

Holstein-Friesian cows. J. Dairy Sci. 90: 649-658. 328

18

Rincon, G., A. Islas-Trejo, J. Casellas, Y. Ronin, M. Soller, E. Lipkin, and J. F. Medrano. 2009. Fine mapping 329

and association analysis of a quantitative trait locus for milk production traits on Bos taurus autosome 330

4. J. Dairy Sci. 92: 758-764. 331

Sharifzadeh, A., A. Doosti, and S. Moshkelani. 2010. Genetic Polymorphism at the leptin Gene in Iranian 332

Holstein cattle by PCR-RFLP. J. Anim. Vet. Adv. 9: 1420-1422. 333

Toni, F., L. Vincenti, L. Grigoletto, A. Ricci, and Y. H. Schukken. 2011. Early lactation ratio of fat and protein 334

percentage in milk is associated with health, milk production, and survival. J. Dairy Sci. 94: 1772-335

1783. 336

Zegeye, A., M. Ashwell, S. Ogg, C. Rexroad, and I. H. Mather. 1999. RFLP markers in the bovine butyrophilin 337

gene. Anim. Genet. 30: 382-405. 338

Zegeye, A. 2003. Quantitative trait loci and promoter analysis of the bovine butyrophilin gene. P.H.D. Thesis. 339

Maryland University, Maryland. 340