spezielle genetik und molekularbiologie ss 2006 ribosomes mol. biol. of the cell

Spezielle Genetik und Molekularbiologie SS 2006

Ribosomes

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Prokaryotic ribosome

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Eukaroytic ribosome

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Sedimentation of ribosomes

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The „ribosome cycle“

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Polyribosomes (polysome)

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Peptidyl transferase reaction

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tRNA binding sites

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Overview on translation initiation

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Ribosome binding site (Shine-Dalgarno sequence) on mRNA

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Internal start site are important for polycistronic mRNAs

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N-formyl methionine

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Initiation factors bound to the ribosome

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Sequence of events during initiation in prokaryotes

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Capping

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Translation initiation in eukaryotes

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Start codon identification in eukaryotes

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Kozak sequence at start codon:G/ANNAUGG

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Circular polysomes in eukaryotes

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Circular polysomes

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Short upstream ORFs in eukaryotes

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Internal ribosome entry sites in eukaryotes (IRES)

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Overview of the elongation phase

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Binding of aa-tRNA to the A-site

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EF-Tu:protection of ester from hydrolysischeck for correct codon recognition

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Codon recognition by the anticodon

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EF-Tu GTP hydrolysis in codon recognition

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Accommodation as the second recognition control step

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Translocation

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Release factors

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Class I (stop codon recognition)prokaryotic:RF1: UAG, UAARF2: UGA, UAA

eukaryotic:eRF1: UAA, UAG, UGA

Class II (diss. of class I factors)RF3eRF3

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Action of release factors

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Ribosome recycling factor

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