nils rostoks lu bioloģijas fakultāte 2009/0218/1dp/1.1.1.2.0/09/apia/viaa/099
Post on 21-Mar-2016
55 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
VIDEI DRAUDZĪGĀ LAUKSAIMNIECĪBĀ NOZĪMĪGU AUGU PAZĪMJU ĢENĒTISKĀ KARTĒŠANA UN MOLEKULĀRO MARĶIERU IDENTIFIKĀCIJA
2010.03.04.
2
Izstrādāt un adaptēt molekulāros marķierus videi draudzīgā lauksaimniecībā nozīmīgām augu pazīmēm
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
PROJEKTA PĒTĪJUMA AKTIVITĀTES
3.1. aktivitāte. Jaunu selekcijas materiāla vērtēšanas metodiku izstrāde, pilnveidošana un pārbaude
3.3. aktivitāte. Videi draudzīgā lauksaimniecībā nozīmīgu augu pazīmju ģenētiskā kartēšana un molekulāro marķieru identifikācija
2010.03.04.
3
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
MOLEKULĀRO MARĶIERU
PRIEKŠROCĪBAS SELEKCIJĀ
Ļauj būtiski saīsināt selekcijas laiku, jo dod iespēju jau agrīnās paaudzēs identificēt indivīdus ar noteiktu genotipu (gēnu alēļu kombināciju) , apejot ilgstošus, darbietilpīgus lauka izmēģinājumus
Ļauj identificēt indivīdus ar noteiktām gēnu alēļu kombinācijām, kuras nav iespējams noteikt fenotipiski lauka izmēģinājumos
2010.03.04.
4
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
MARĶIERI
2010.03.04.
5
Almost all aspects of life are engineered at the molecular level, and without understanding molecules we can only have a very sketchy understanding of life itself
Francis Crick Tāpat kā ceļojumā orientēties palīdz ceļa
stabi, genomā orientēties palīdz marķieri Atšķirības genoma DNS sekvencē kalpo
kā molekulārie marķieri genoma kartēšanai
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
FENOTIPISKĀ UN ĢENĒTISKĀ
DAUZVEIDĪBA
2010.03.04.
6
Fenotipiskā daudzveidība atspoguļo atšķirības dažādu miežu šķirņu genomā
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
NO PAZĪMES LĪDZ POLIMORFISMAM GĒNA
SEKVENCĒ
2010.03.04.
7
Pazīme
Miežu genoms 5x109 bp
Pazīmi nosakošā gēna sekvence
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
GENOMIKA UN AUGU SELEKCIJA
2010.03.04.
8
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
MOLEKULĀRIE MARĶIERI ESF
PROJEKTĀ
2010.03.04.
9
Zināmu molekulāro marķieru adaptācija noteiktām pazīmēm, piemēram, slimības izturībai un jaunu marķieru izstrāde noteiktām slimības izturības gēnu alēlēm
Pazīmju kartēšana miežu populācijā izmantojot asociāciju ģenētikas pieeju un jaunu molekulāro marķieru veidošana noteiktām videi draudzīgā lauksaimniecībā nozīmīgām pazīmēm
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
MARĶIERI NOTEIKTIEM GĒNIEM
2010.03.04.
10
Darbs ar zinātnisko literatūru, lai identificētu marķierus noteiktiem gēniem
Identificēto marķieru tehniskā pārbaude
Identificēto marķieru pārbaude Latvijas laukaugu selekcijas materiālā
Jaunu marķieru izveide zināmiem gēniem un pārbaude Latvijas laukaugu selekcijas materiālā
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
MARĶIERI NOTEIKTIEM GĒNIEM – PAZĪMES
2010.03.04.
11
Mieži – putošā melnplauka un vārpu fuzarioze
Kartupeļi – lakstu puve un izturība pret nematodēm
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
GĒNU KARTĒŠANA
2010.03.04.
12
Ja gēns, kurš nosaka kādu pazīmi nav zināms, tad tas ir jākartē
Pazīmju kartēšanai izmantojot molekulāros marķierus nepieciešams liels skaits marķieru, kuri ir vienmērīgi izvietoti genomā un efektīva sistēma to genotipēšanai noteiktā augu materiālā
Illumina miežu genotipēšanas platforma
Vienlaicīga 3072 punktveida mutāciju (SNP) genotipēšana 96 miežu paraugos
Augsta datu kvalitāte, zināms marķieru novietojums miežu genomā
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
PIEMĒRS – MIEŽU GENOMA RAJONI, KURI IETEKMĒ -
GLIKĀNU SATURU
2010.03.04.
13
Lineāri genomā izvietoti molekulārie marķieri
Kor
elāc
ija a
r -g
likān
u sa
turu
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
UZSĀKTIE DARBI
2010.03.04.
14
Literatūras analīze publicētu molekulāro marķieru identificēšanai
Metodiku apgūšana; konkrētiem molekulāriem marķieriem nepieciešamo specifisko materiālu un reaģentu iepirkums
Miežu augu materiāla audzēšana DNS izdalīšanai no 96 miežu līnijām genotipēšanai
Iepriekšējos projektos iegūto datu analīze ar uzsvaru uz videi draudzīgā lauksaimniecībā nozīmīgām pazīmēm
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
2010.03.04.
15
Pateicības: • VIAA par atbalstu projekta realizācijā • VPLSI kolēģiem par sadarbību • LU par atbalstu projekta administrēšanā
2009/0218/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/099
top related