8ciclul acidului citric

Upload: turcan-viviana

Post on 05-Apr-2018

225 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    1/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    Decarboxilarea oxidativ a piruvatului are loc n matriceamitocondrialsub aciunea catalitic a complexului, multienzimaticpiruvat dehidrogenaz.-E1, piruvat dehidrogenaza cu coenzima TPPataat prin fore

    coulombiene,-E2, dihidrolipoil transacetilaza cu coenzima lipoamidalegatcovalent i coenzima A care se acetileaz-E3, dihidrolipoil dehidrogenaza cu coenzima FADi coenzima

    NAD

    +

    , cea din urm se reduce iar apoi se oxideaz n LOBDe remarcat faptul c structurile complexelordecarboxilriioxidative a altor a-cetoacizi au tot 3 enzimece conin aceleaicoenzimei catalizeaz aceleai tipuri de reacii

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    2/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    CH3

    C

    O

    CO

    -

    CO2 C-

    OH

    TPP

    S

    R

    CoA

    NAD+

    NADH+H

    FAD

    SH

    SH

    FAD

    S

    S

    HS

    S

    HS

    HS

    R

    R

    SC

    O

    CH3 SC

    O

    CoA

    CH3

    CH3

    TPP

    O

    piruvat

    dehidrogenaza

    (E1)

    dihidrolipoiltransacetilaza

    (E2)

    dihidrolipoildehidrogenaza

    (E3)

    Hidroxietil-TPP

    Piruvat

    Acetil-dihidrolipoamida

    Acetil-CoA

    Degradarea unor hexoze: G, F, Gal, Man

    Degradarea unor aa: Ala, Cys, Ser

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    3/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    N

    C

    S

    H3C

    +

    R'

    -.E1

    R

    NC

    S

    H3C

    +

    R'

    -

    .E1R

    NC

    S

    H3C

    +

    R'

    .E1R

    TPP E1.

    C CH3

    OHO

    -O C

    C CH3

    O

    -O C

    O

    C CH3H

    + HOCO2

    piruvat

    intermediar

    hidroxietil-

    TPP E1.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    4/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    NC

    S

    H3C

    +

    R'

    -

    .E1R

    C CH3

    H+

    HO

    hidroxietil-

    TPP E1.

    E2

    S

    S

    +

    NC

    S

    H3C

    +

    R'

    - .E1R

    C CH3

    E2

    S

    HS

    CS

    H3C

    +

    R'

    -

    .E1R

    C CH3HO

    E2

    S

    HS

    +O

    lipoam

    ida-E2

    Reactia 1

    acetildihidro-lipoamida-E

    2

    NC

    S

    Sub aciunea enzimei E1are loc oxidarea grupriihidroxietilpn la acetat.Cei doi electroni rezultaiprin oxidare reduc punteadisulfuric la dou grupritiol una din ele fiindesterificat cu acetat. Seregenereaz astfel TPPE1,

    care poate relua reacia 1.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    5/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    C CH3

    E2

    S

    HS

    O

    acetildihidro-lipoamida-E2

    E2

    HS

    HS

    CoA SH

    CoA S CH3

    O

    C

    acetil-CoA

    dihidrolipoamida-E2

    Enzima dihidrolipoiltransacetilaza (E2)catalizeaz transferulgruprii acetil de la

    acetildihidrolipoamid-E2 la CoASHrezultnd principalulprodus alprocesului, acetil-

    CoA. Energianecesar formareatioesteruluimacroergic, estefurnizat de oxidarea

    hidroxietilului.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    6/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    E2

    HS

    HS

    FAD

    S

    S

    +

    E3 oxidat

    E2

    FAD

    +

    SH

    S

    SH

    S

    E3 redus

    Dihidrolipoildehidrogenaz (E3)care conine o

    legtur disulfuricreductibil la dougrupri tiol ceea ceregenereazlipoamida-E2 careapoi poate reluareacia 2. Astfel ceidoi electroni i doiprotoni pot trece de laE2 la E3.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    7/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    FAD

    S

    S

    FAD

    SH

    SH

    FADH2

    S

    S

    NAD+ NADH+H

    +

    Reacia este catalizat tot de E3, const n trecereaelectronilor i protonilor de la E3 la NAD+ prin intermediulFAD, produsul net fiind NADH +H+. Astfel, E

    3-FAD

    regenerat

    poate relua reacia 4.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    8/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    Otrvirea complexului -cetoacid-dehidrogenazaArsenitul este o otrav pentru complexul Pyr-DH datorit

    capacitii lui de a se lega covalent la dihidrolipoamid:

    Conform reaciei este inhibat lipoamida-E2 din compoziia piruvatdehidrogenazei i a-cetoglutarat, dehidrogenazei. Otrvireadecarboxilrilor oxidative este de fapt inhibiia unei etape, timpurii a

    respiraiei celulare. Compuii pe baz de arsen sunt mai toxici fa demicroorganisme dect fa de oameni. Aceastdiferen a fost folositpentru terapia unor boli cum ar fi sifilisul (care acum se trateazactualmente cu antibiotice) i tripanozomiaze (tripanozomii sunt o familiede protozoare parazite (musca ee)).Aceticompui arseno-organici au

    fost printre primele antibiotice, ei prezentnd ns severe efectesecundare(apariia diferitelor tipuri de cancer (cutanat))

    HS

    HS-O As

    OH

    OHR

    +

    R

    S

    S

    -O As + 2 H2O

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    9/19

    Ciclul acidului citricDecarboxilarea oxidativ a acidului piruvic

    Controlul activitii complexului Pyr-DHInhibiia prin produi. Acetil-CoA i NADH n exces ncetinesc reaciileacionnd direct asupra procesului de decarboxilare oxidativ. Excesul deacetil-CoA blocheaz enzima E2 prin meninerea ei n form acetilat(acetil-dihidrolipoamid-E2), incapabils accepte gruparea hidroxietil de

    la hidroxietil-TPPE1 care rmne blocat n aceast form. Aceastanseamn c sunt blocate reaciile 2 i 3. NADH n exces blocheazenzima E3 prin meninerea ei n form redus, incapabils accepte ceidoi electroni i doi protoni de la coenzima enzimei E2 care rmneblocatsub form acetilat. Aceastanseamnc sunt blocate reaciile 2-5. ntructcantitatea de E

    1este mic se va acumula piruvatul.

    Reglare prin mecanism covalent. Enzima E1 se inactiveazcnd restulde Ser se fosforileazcu ATP n prezena unei kinaze. Fosforilarea esteactivat de concentraii mari de acetil-CoA i NADH. E1 se reactiveazsubinfluena unei fosforilaze care, hidrolizeaz gruparea fosfat, avnd dreptstimulatori ionii de Ca i Mg, care sunt iinhibitorii kinazei care inactiveaz

    enzima

    O

    i

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    10/19

    Ciclul acidului citricMecanismul chimic

    ntregul echipament enzimatic al

    ciclului citric se gsete nmatricea mitocondrial cu

    excepia succinat dehidrogenazei

    care este "ngropat", n

    membrana intern.

    COO-

    O

    CCH3

    CH3

    O

    C S CoA

    piruvatdehidrogenaza

    CoASH+NAD+

    CO2 NADH+H+

    +

    COO-

    C O

    CH2

    *COO-

    *COO-

    CH2

    OC

    COO-

    CH2

    CH2

    COO-

    C

    CH2

    *COO-

    COO-

    HOHO

    CH2

    C

    COO-

    H

    COO-

    CH

    HCCOO

    -

    *COO-

    C

    COO-

    CH2

    CH

    CH2

    COO-

    C

    *COO-

    COO-

    H

    HO C H

    C

    H COO-

    *COO-

    C

    COO-

    CH2

    O

    COO-

    CH2

    CH2

    CH2

    CH2

    COO-

    COO-

    C O

    S CoA

    COO-

    COO-

    H2O CoASH

    NAD+

    NADH+H+CO2

    CoASH

    NAD+

    NADH+H+

    CoASH

    GTP

    GDP+Pi

    ADP+Pi

    ATP

    FADH2

    FAD

    NAD+

    NDAH+H+

    piruvat

    acetil-CoA

    oxaloacetat

    citrat

    cis-aconitat

    isocitrat

    oxalsuccinat

    -cetoglutarata

    succinil-CoA

    succinat

    fumarat

    L-malat

    1.Citratsintaza

    H2O

    H2O

    2.Aconitaza

    2.Aconitaza

    3.Isocitratdehidrogenaza

    3.Isocitratdehidrogenaza

    4. Cetoglutaratdehidrogenaza

    5.Succinil-CoAsintetaza

    6.Succinatdehidrogenaza

    H2O

    7.Fumaraza

    8.Malatdehidrogenaza

    CO2

    CICLUL

    ACIDULUI CITRIC

    *

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    11/19

    Ciclul acidului citricMecanismul chimic

    citrat sintaza

    citratoxaloacetat

    acetil-CoA

    CoASHH2O

    HO COO-

    *COO-

    CH2

    C

    COO-

    CH2

    *COO-

    CH2

    OC

    COO-

    CoASC

    O

    CH3

    aconitaza

    H2OH2O

    isocitratcis-aconitat

    HCHO

    H COO-

    *COO-

    C

    COO-

    CH2

    CH

    CH2

    COO-

    C

    *COO-

    COO-

    citrat

    HO COO-

    *COO-

    CH2

    C

    COO-

    CH2

    aconitaza

    Enzima aconitazaconine un complex

    (4Fe-4S) . Ionul de Fe2+joac un roldeosebit n aceast reacie, el formeazcu citratul un chelat (complex intern)stabil. Acest chelat este necesar pentruactivitatea enzimei.Doze mari de fluoruri, fac ca fluorul sreacioneze cu acidul citric, implicat nciclul Krebs, avnd drept urmare formareaacidului monofluorocitric care nemaiputndparticipa la reaciile ciclului citric,

    ntrerupe ciclul, deci

    producerea deenergie, consecinaeste moartea celulei.De asemenea acidulmonofluorocitric esteun inhibitor puternic

    al aconitazei.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    12/19

    Ciclul acidului citricMecanismul chimic

    CO2

    isocitratdehidrogenaza

    a-cetoglutaraoxalsuccinatisocitrat

    NADH+H+

    NAD+

    O

    CH2

    COO-

    C

    *COO-

    COO-H

    CHCHO

    H COO-

    *COO-

    C

    COO-

    CH2CH2

    COO

    -

    C O

    CH2

    *COO-

    isocitratdehidrogenaza

    Exist dou izoenzime aleizocitrat dehidrogenazei.Cea implicat n ciclul citriceste NAD dependent i segsete numai n matricea

    mitocondrial. Cealalteste NADP dependent segsete att n matriceamitocondrial ct i ncitosol, unde produceNADPH necesar

    proceselor anabolice.

    a-cetoglutaratdehidrogenaza

    succinil-CoAa-cetoglutarat

    NADH+H+

    NAD+

    CoASHCO2

    CoAS

    OC

    COO-

    CH2

    CH2CH2

    COO-

    C O

    CH2

    *COO-

    * Catalizator este complexul

    multienzimatic -cetoglutarat-DH,similar complexului Pyr-DH. Acestcomplex este format din urmtoarelesubuniti enzimatice: -cetoglutaratdehidrogenaz (E1), dihidrolipoiltranssuccinaz (E2) i dihidrolipoil

    dehidrogenaz (E3).

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    13/19

    Ciclul acidului citricMecanismul chimic

    succinil-CoAsintetaza

    (tiokinaza)

    succinatsuccinil-CoA

    CoASH

    CoAS

    OC

    COO-

    COO

    -

    CH2

    CH2

    CH2

    CH2

    COO-

    ATPADP+Pi

    GDP+Pi GTP

    Enzima, succinil-CoA sintetaza semai numete succinat tiokinaz n

    funcie de sensul n care este cititreacia. Se tie c la animale aceastenzim folosete GDP ca substrat.Formarea cuplat a ATP pe seamaenergiei eliberate prin decarboxilareaoxidativ a CG este un exemplu de

    fosforilare la nivel de substrat.Fosforilarea la nivel de substratimplic enzime solubile pe cndfosforilarea oxidativ implic enzimelegate de membrana internmitocondrial.

    succinat

    dehidrogenazafumaratsuccinat

    FAD FADH2

    COO-

    COO

    -

    CH2

    CH2

    COO-

    HC

    CH

    COO-Succinat-DH la eucariote este singura enzim aciclului citric care este asociat adnc lamembrana intern mitocondrial. Enzima coninecteva complexe [Fe-S] care intermediaztrecerea electronilor de la FADH2 la transportorii de

    electroni ai lanului respirator.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    14/19

    Ciclul acidului citricMecanismul chimic

    fumaraza

    H2O

    L-malatfumaratCOO

    -

    COO-

    HC

    CH

    COO-

    COO-

    CHO H

    CH2

    Hidratarea fumaratului cu formare de malat estecatalizat de fumarazFumaraza care are specificitate absolut adic eacatalizeaz hidratarea fumaratului nu i a maleatului,izomerul cis al fumaratului. n sens invers fumaraza

    catalizeaz numai deshidratarea L-malatului nu i aD-malatului.

    malatdehidrogenaza

    L-malat oxaloaceta

    NADH+H+

    NAD+

    COO-

    H

    COO-

    C

    CH2

    HO

    COO-

    CH2

    OCCOO

    - Oxidarea L-malatului cu refacerea

    oxalacetatului (OA) este catalizat demalat dehidrogenaz. Dei aceast reacieeste endergonic, ea este deplasat invivospre dreapta datorit ndeprtriirapide a produilor de reacie, oxalacetatuln reacia 1 i NADH oxidat n laulrespirator.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    15/19

    Ciclul acidului citricReglarea ciclului citric

    Reglarea ciclului citric asigur producerea de intermediari iprodui astfel nct s menin starea de echilibru acelulelor i pentru a evita supraproducianeeconomic

    de metabolii. Enzimele cheie ale ciclului citric suntcontrolate aproape exclusiv pe 3 ci simpleA. disponibilitatea substratuluiB. inhibiia prin acumulare de produi,

    C. feed back negativ competitivCele 3 enzime cheie:(a) citrat sintaza,(b) isocitrat dehidrogenaza,(c) a-cetoglutarat dehidrogenaza.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    16/19

    Ciclul acidului citricReglarea ciclului citric

    NADH

    Oxaloacetat

    Piruvat

    Acetil-CoA

    Citrat

    Isocitrat

    a-CetoglutaratSuccinil-CoA

    Succinat

    Fumarat

    Malat

    citrat sintaza

    izocitrat DH

    CG-DH

    GTP

    ATP

    NADH

    NADH

    NADH

    NADH

    Feet back

    Feet back

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    17/19

    Ciclul acidului citricCaracterul amfibolic al ciclului citric.

    Oxaloacetat

    Piruvat

    Acetil-CoA

    Citrat

    Isocitrat

    a-CetoglutaratSuccinil-CoA

    Succinat

    Fumarat

    Malat

    CO2

    PEPCO2

    Ac.cu nr.impar de

    atomi de carbon

    Ile

    MetVal

    AspPheTyr

    Glu

    Asp

    Acizigrasi

    Colesterol

    Porfirine

    Glucoz

    ,

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    18/19

    Ciclul acidului citricCaracterul amfibolic al ciclului citric.

    Printre reaciile anabolicese numr:- sinteza glucozei n citosol pe seama malatului- biosinteza lipidelor (acizi grai, colesterol) n citosol pornind de la

    acetil-CoA.Aceasta din urm poate traversa membrana mitocondrial prin inter-

    Mediul navetei citrat-piruvat. Citratul mitocondrial iese n citosol iarpiruvatul ptrunde n mitocondrie. Sub aciunea citrat liazei citratul setransform n acetil CoA.

    - biosinteza aminoacizilor utilizeaz intermediarii ciclului citric pe dou ci.aminarea reductiv a aCG catalizat de glutamat dehidrogenaza

    NAD+ sau NADP+ dependent:CG+NAD(P)H+NH3 Glu +NAD(P)++H2Otransaminarea la care particip aCG i oxalacetatul din rndulintermediarilor ciclului citric:

    CG + AlaGlu + Pyr OA +Ala Asp + Pyr

    - biosinteza hemului ncepe n mitocondrie utiliznd ca material de porniresuccinil-CoA.

  • 7/31/2019 8Ciclul Acidului Citric

    19/19

    Ciclul acidului citricCaracterul amfibolic al ciclului citric.

    Reaciile anapleroticerencarc ciclul pornind de la precursori ne-citrici.Principala reacie anaplerotic n ficat i rinichi este carboxilareapiruvatului.Pyr + CO2 + ATP + H2O OA + ADP +Pi -piruvat carboxilaz, biotin-

    dependentn miocard i muchiul scheletic are loc reacia:PEP + CO2+ GDP OA + GTP - PEP carboxikinzaO seric de ci catabolice produc intermediari ai ciclului citric printre caremenionm b-oxidarea acizilor cu numr impar de atomi de carbon i

    degradarea valinei, izoleucinei i metioninei, care dau natere propionil-CoA, care n urma a dou reacii ulterioare trece n succinil-CoA. Deasemenea fenilalanina, tirozina i aspartatul se degrada dnd natere lafumarat i acetoacetat n cazul Phe i Tyr i respectiv fumaratPropionic CoA+ CO2 + ATP Succinil- CoA + ADP +Pipropionil CoA

    carboxilaza