zotero pour les médecins (3h)
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Votre bibliographie facile avec Zotero
Formation – internes de médecine BrestSCD UBO – 2011
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 2
Au programme
1.Découvrir2. Installer3. Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager
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1. Découverte
Démonstration en direct ou visionnage de la vidéo.
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Comment ça marche?
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En quoi Zotero peut m'être utile?
Veille
Gestion de références
Sauvegarde de références
Édition de bibliographies
Partage de références
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Présentation du logiciel
Une extension de Firefox, gratuite
Un équivalent performant aux logicielsprofessionnels payants (EndNote, Refworks)
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1.Découvrir2. Installer3. Importer une
référence4.Organiser5.Exporter une
bibliographie6.Partager
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Exercice
Installer Zotero sur Firefox
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Installer Zotero
http://www.zotero.org
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Installation terminée!
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Exercice
Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur.
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Zotero affiché
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Zotero masqué
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Zotero en pleine page
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Exercice
Créez votre compte personnel sur http://www.zotero.org[clic sur « register »]
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1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager
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Importation de références bibliographiques depuis le web
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Exercice
http://www.sudoc.abes.fr
Trouvez dans le catalogue SUDOC la notice de l'ouvrage suivant
Huas D, Rueff B. Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale. Paris: Springer; 2005.
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Exercice
Importez cette notice dans votre liste de références Zotero.
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Correction
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Correction (suite)
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Exercice 3
Trouvez et importez depuis le SUDOC dans Zotero trois références d'ouvrages sur le sevrage tabagique.
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Correction
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Correction (2)
On peut importer dans sa bibliothèque Zotero une liste de plusieurs ouvrages à
la fois.
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Correction (3)
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Correction (4)
Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer...
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Correction (5)
Remarque : dans cet exemple, deux des références importées sont des thèses.Les thèses sont représentées par une icône spécifique
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Exercice
Trouvez puis importez depuis la base PubMed la référence suivante
Dubar G. et al. « French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women ». PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n°10.
.
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Correction
Quand on importe un article, l'icône à droite de la barre d'adresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille.
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Correction
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Exercice : import d'une page web
Importez dans votre bibliothèque Zotero l'article de blog suivant
Flahaut, Antoine. « Grippe, la France Sentinelle de l'Europe? » in Le Blog d'Antoine Flahaut, 24 septembre 2009.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 33
Exercice : modifier une notice
Ajoutez à l'ouvrage de Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale (déjà dans votre bibliothèque Zotero) les éléments suivants
- son résumé (disponible sur Google Books)
- une note comportant la cote de l'ouvrage à la BU Santé.
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Import d'un livre via son numéro ISBN
Entrez l'ISBN du livre (numéro disponible sur la 4e de couverture) sans les tirets.Zotero va chercher automatiquement la notice sur le catalogue en ligne WorldCat.
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Nota Bene
Il est toujours possible dans Zotero de créer manuellement une notice.
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Exercice
Trouvez dans le CisMef un guide de recommandations de bonnes pratiques pour le traitement de l'otite moyenne aiguë chez l'enfant. Créez manuellement la notice de ce document dans Zotero.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 37
Récapitulatif des icônes d'importation
Importation d'une référence d'ouvrage
Importation simultanée d'une liste de références d'ouvrages ou d'articles
Importation d'une référence d'article
Importation d'une page web
Importation d'une référence de thèse
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 38
Quelques sites Zotero-compatibles
http://www.zotero.org/translators
Sites compatiblesCatalogue UBOCatalogue BIUMCatalogue SUDOC (thèses)MedlineEbscoHost (Pascal)Science Direct
Partiellement compatiblesUbodocCochrane LibraryHAL (archives ouvertes CNRS)
IncompatibleCisMef
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 39
1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6. Partager
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 40
Interface : les trois panneaux
1 : L a bibliothèque (possibilité d’organiser en dossiers et sous-dossier,
2 : Liste des notices du dossier sélectionné,
3 : La fiche de l’élément (article, ouvrage, page Internet etc.) sélectionné.Source : Mathieu Poujol
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La barre d'outils
Créer un dossier ou un sous-dossier
Importer, exporter une bibliothèque, réglage des préférences etc...
Annoter votre bibliothèque ou vos dossiers ou sous-dossiers
Faire une recherche dans les éléments de votre bibliothèque
Saisir manuellement une notice
Joindre un fichier à une référence
Créer une notice à partir de la page web en cours
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 42
Organiser sa bibliothèque
Par dossiersPar marqueurs (« tags »)
Source : Mathieu Poujol
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 43
Exercice
Enregistrez vos références sur le sevrage tabagique dans- un sous-dossier intitulé « sevrage tabagique »- qui se trouvera lui-même dans un nouveau dossier de la bibliothèque intitulé : « Tabacologie ».
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Correction
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 45
Correction (2)
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Correction (3)
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 47
Exercice
A l'ouvrage « Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale » (déjà dans votre bibliothèque Zotero)- enlevez le mot-clef : « alcooliques – soins médicaux »- ajoutez le mot-clef « thèse2012 »
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Exercice
- Ajoutez le mot-clef « thèse 2012 » à 3 références de votre bibliothèque Zotero
- Affichez ensuite tous les documents qui contiennent le mot-clef « thèse 2012 »
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 49
Associer un fichier à une référence
On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier en ligne
On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier qui se trouve sur l'ordinateur
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 50
Exercicehttp://hal.archives-ouvertes.fr
Dans l'archive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la référence de la thèse suivante
Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thèse] Université de Nantes, 2008.
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Exercice (suite)
Associez à la référence importée le fichier PDF du document (texte intégral de la thèse – version 1).
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Correction
Afficher le pdf dans Firefox
Sélectionner la référence du document dans Zotero
Cliquer sur « capture de la page » (menu Zotero > trombone)
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 53
Correction
1. On sélectionne la référence d'abord
2. On enregistre le pdf qui est affiché dans Firefox
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 54
Correction
Il sera possible, même sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 55
Exercice : annoter un document
- affichez la capture d'écran de l'article de 2009 d'Antoine Flahaut sur la grippe A (déjà importé).
- surlignez une phrase de texte et ajoutez-y un commentaire
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 56
Correction
(Malheureusement cette option ne fonctionne pour l'instant que pour les pages html, pas pour les pdf)
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 57
1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 58
Exportation d'une bibliographie dans un document texte
Bibliographie simple
Bibliographie intégrée
(dans le traitement de texte)
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 59
Exercice
Exportez l'ensemble de vos références traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style « Vancouver »
Bibliographie simple
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Correction
Bibliographie simple
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Correction (2)
Bibliographie simple
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Correction (3)Coller le presse-papier dans un document texte.
1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul.
2. Metzger-Flock A. Particularités de l'aide au sevrage tabagique en médecine générale : à propos d'une enquête réalisée auprès des médecins généralistes de la région mulhousienne. 2005 ;89 f.
3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003.
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Exercice
Installer le plug-in Zotero pour Word depuis le site Zotero.org
Bibliographie intégrée
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 64
Correction
Zotero.org> Support
> Word Processor Integration > Installation
> Word pour Windows plug-in
Bibliographie intégrée
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L'outil de citation (avec Word ou Open Office)
Source : Daniel Bourrion
Bibliographie intégrée
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 66
Bibliographie intégrée : 2 étapes
Insérer des citations – références
Insérer la bibliographie complète
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 67
Exercice
Dans un nouveau document Word, insérez trois références de votre
bibliothèque Zotero sous forme de citations avec le style « Vancouver »
Insérer des citations – références
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 68
Correction
Insérer des citations – références
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 69
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 70
Exercice
Insérer la bibliographie complète des références déjà ajoutées en citation.
Insérer la bibliographie complète
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 71
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 72
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 73
Exercice
Ajouter à cette bibliographie une référence qui ne fait pas partie des citations du document.
Insérer la bibliographie complète
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 74
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 75
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 76
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 77
De nombreux styles sur Zotero.org
http://www.zotero.org/styles
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 78
1. Découvrir2. Installer3. Importer une référence4. Organiser5. Exporter une bibliographie6. Partager
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 79
Sauvegarde de données
On peut sauvegarder manuellement sa bibliothèque Zotero sur un disque dur
Pour l'utiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero
Pour l'importer dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on décide d'en changer : EndNote, Mendeley etc
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 80
Exercice
Exportez votre bibliothèque Zotero en format RIS sur votre disque dur.
Envoyez vous le fichier par mail.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 81
Sauvegarde de données (2)
Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothèque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 82
Exercice
Depuis votre boîte mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (créé en début de séance)
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Exercice (suite)
Dans les préférences de Zotero, entrez les paramètres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos références avec votre compte en ligne
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 84
Correction
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 85
Correction
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 86
Exercice
Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligne
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 87
Correction
Vous avez dorénavant 2 bibliothèques Zotero
Une bibliothèque locale
Une bibliothèque « en ligne »
Ces 2 bibliothèques sont synchronisées.
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 88
Ma bibliothèque Zotero (Library) en ligne
Ma bibliothèque Zotero locale
Synchronisation
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 89
Exercice
- Connectez vous sur le site de Zotero (« login ») afin de pouvoir visualiser et gérer votre bibliothèque Zotero en ligne.
- Modifiez les paramètres de visibilité de votre page selon votre convenance
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 90
Paramètres de confidentialité : un exemple
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 91
Exercice : travail en commun sur Zotero
- trouvez puis rejoignez sur Zotero en ligne le groupe « Médecine UBO »
- ajoutez 3 références à la bibliothèque du groupe
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 92
Zotero People, le futur Facebook des chercheurs?
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 93
Merci de votre attention!
Pour aller plus loin http://delicious.com/phelly/zotero
Ce diaporama est visible et téléchargeable sur http://slideshare.com/phelly
Pour toute question sur Zoteroperrine.hellyATuniv-brest.fr
Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 94
Crédits photographiques
Nasa ImagesPdimension.netBoris sur FlickrXtof sur FlickrPascal Lemaire sur PicasaCaroline & Laurent sur Picasa