yudi

18
BAB I PENDAHULUAN Latar Belakang Kelautan dan Perikanan adalah salah satu sektor ekonomi yang sang at strategis bagi perkembangan pembangunan Indonesia melalui kegi atan ekspor produk perikanan. Saat ini pemerintah berusaha menjad ikan sektor kelautan dan perikanan sebagai salah satu sektor anda lan yang diharapkan mampu mengeluarkan bangsa Indonesia dari kris is ekonomi yang berkepanjangan. Pembangunan sektor kelautan dan p erikanan bertujuan untuk menyediakan protein hewani pada makanan dan bahan mentah bagi industry perikanan, meningkatkan pendapatan petani ikan, menciptakan kesempatan kerja dan meningkatkan devisa Negara melalui promosi ekspor produk perikanan budidaya, dan duku ngan daerah sebagaimana pembangunan nasional berkelanjutan. Dalam era globalisasi dewasa ini arus lalulintas komoditas perika nan semakin meningkat. Perdagangan bebas mulai dirasakan, terlebi h lagi dengan perkembangan teknologi informasi dan komunikasi, hu bungan antar Negara hampir tiada batas. Hal ini semakin membuka p eluang kemungkinan dapat masuk dan tersebarnya hama dan penyakit ikan di luar negeri dan antar area atau daerah di dalam wilayah R epublik Indonesia. Sumber daya alam hayati tersebut merupakan salah satu modal dasar sekaligus sebagai faktor dominan yang perlu diperhatikan dalam pe mbangunan nasional untuk mewujudkan masyarakat adil dan makmur be rdasarkan Pancasila dan Undang – Undang Dasar 1945. Sebagian pulau – pulau di Indonesia masih bebas dari hama dan pen yakit ikan. Sejalan semakin meningkatnya lalulintas ikan antar Ne gara dan dari suatu area ke area lain dalam wilayah Republik Indo nesia, dalam rangka perdagangan, semakin membuka peluang bagi kem

Upload: mulyadi-dskyline

Post on 25-Sep-2015

218 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

yudi..

TRANSCRIPT

BABIPENDAHULUAN

LatarBelakang

KelautandanPerikananadalahsalahsatusektorekonomiyangsangatstrategisbagiperkembanganpembangunanIndonesiamelaluikegiataneksporprodukperikanan.SaatinipemerintahberusahamenjadikansektorkelautandanperikanansebagaisalahsatusektorandalanyangdiharapkanmampumengeluarkanbangsaIndonesiadarikrisisekonomiyangberkepanjangan.Pembangunansektorkelautandanperikananbertujuanuntukmenyediakanproteinhewanipadamakanandanbahanmentahbagiindustryperikanan,meningkatkanpendapatanpetaniikan,menciptakankesempatankerjadanmeningkatkandevisaNegaramelaluipromosieksporprodukperikananbudidaya,dandukungandaerahsebagaimanapembangunannasionalberkelanjutan.

Dalameraglobalisasidewasainiaruslalulintaskomoditasperikanansemakinmeningkat.Perdaganganbebasmulaidirasakan,terlebihlagidenganperkembanganteknologiinformasidankomunikasi,hubunganantarNegarahampirtiadabatas.HalinisemakinmembukapeluangkemungkinandapatmasukdantersebarnyahamadanpenyakitikandiluarnegeridanantarareaataudaerahdidalamwilayahRepublikIndonesia.

SumberdayaalamhayatitersebutmerupakansalahsatumodaldasarsekaligussebagaifaktordominanyangperludiperhatikandalampembangunannasionaluntukmewujudkanmasyarakatadildanmakmurberdasarkanPancasiladanUndangUndangDasar1945.

SebagianpulaupulaudiIndonesiamasihbebasdarihamadanpenyakitikan.SejalansemakinmeningkatnyalalulintasikanantarNegaradandarisuatuareakearealaindalamwilayahRepublikIndonesia,dalamrangkaperdagangan,semakinmembukapeluangbagikemungkinanmasukdanmenyebarnyahamadanpenyakitikanyangberbahayaataumenularyangdapatmerusaksumberdayaalamhayati.

SejalandenganarusglobalisasidanperdaganganbebastelahdisepakatibahwaaturanteknisikankarantinamerupakanhakberdaulatNegaraanggotaWTO(WorldTradeOrganization)yangimplikasinyamenjadikanaturankarantinasebagaiinstrumentdagangprodukprodukperikananmelaluiproteksionismeterselubung.Untukmenghindariaksesnegatifdarikondisitersebutmakajajarankarantinaharusdiperkuatsehinggaselainmencegahhamadanpenyakitkarantinajugamampumengendalikanprodukimporperikananyangtidakmemenuhistandarkarantinadanmampumemberikanjaminankualitasprodukeksporperikanan.

UntukmengantisipasisegalakemungkinanyangdapatmerusakkelestariansumberdayaperikananmakasesuaidenganUndangUndangNo.16tahun1992tentangKarantinaHewan,IkandanTumbuhan,padapasal3disebutkanbahwakarantinaikanbertujuanuntukmencegahmasuknyahamadanpenyakitikankarantinadariluarnegerikedalamwilayahRepublikIndonesia.Upayatersebutdirealisasikandalambentukpelaksanaantindakankarantinaataskomoditiataumediapembawalainnyabaikyangdiekspor,impormaupundomestikmelaluipelabuhanlautmaupunbandaraudarasertatempattempatpemasukanataupengeluaranlainnya(UUNo.16tahun1992).

Olehkarenaitupentingnyadilakukantindakankarantinapadakomoditiataumediapembawalainnyayangkeluarmaupunyangmasuk,untukmencegahmasukdantersebarnyaHamadanPenyakitIkanKarantinayangdapatmerusaksumberdayaperikanandidalamwilayahRepublikIndonesiaterutamapadakomoditikepitingbakau(scyllaserrata)yangmempunyainilaigiziyangtinggisehinggapermintaanakankepitingbakauterusmeningkatbaiksecaradomestikmaupunekspor,mengingatpentingnyahaltersebutmakapenulismengambiljudulMetodePemeriksaandanIdentifikasiBakteriVibriosppadaKepitingBakau(scyllaserrata).

BABIIIHASILDANPEMBAHASAN

A.UraianKegiatan

Adapunkegiatanyangdilakukanpadapraktikkerjalapangdistasiun KarantinaIkanPengendalianMutudanKeamananHasilPerikanan kelas 1 aceh terdiridaristerilisasialatdanbahan,pembuatanmediaagar danmediauji TSA,TCBS,TSIA,UREASE,SIMMON SITRAT,LIA,MIO,O/F,MR-VP,WP,GLATIN,GLUKOSA,SUKROSA,LAKTOSA,dan THREALOSA,isolasibakteri,Pemurnianbakteri,ujibiokimiabakteridanidentifikasibakteri.

1.SterilisasiAlatdanBahan

Sebelumdilakukanpemeriksaankesehatanterhadapsampeluji,terlebihdahulusiapkanalatyangdibutuhkan.Perlengkapantersebutberupaalatdanbahanyangharusdisterilkansebelumdansetelahdigunakan.

Yangdimaksuddengansterilladalahsuatukondisiyangbebasmikrobabaikvegetatifmaupunspora(Anonim1992),sedangkansterilisasiadalahkegiatanyangdiilakukansecarafisikataukimiawiuntukmemperolehkondisisteril.

.

a.Sterilisasipanaskering

Sterilisasipanaskeringyangdilakukanmenggunakanoven.Sterilisasiinidigunakanuntukmensterilkanalatalatyangterbuatdarikacaataugelassepertitabungreaksi,cawanpetri,Erlenmeyer,pipet,dll.Alatyangdisterilkanterlebihdahuludibungkusdengankertaslaludimasukkankedalamoven,tujuannyaagarsetelahdiovenalatalattersebuttidakkontaminanterhadapudara.Suhuyangdigunakanyaitu160Cselama2jam,halinidimaksudkanuntukmengoksidasicairanyangadapadatubuhbakterisehinggaterjadisuatudehidrasidanpadaakhirnyadapatmembunuhmikroorganismetersebut.

b.Sterilisasipanaslembap

Sterilisasipanaslembabyaitusterilisasiyangmenggunakansuhupanasdanuapairsecarabersamasamadenganautoclave.Umumnyasterilisasiinidilakukanuntukmensterilkanbahanyangakandigunakansepertibahanujilanjutataubahanmediatumbuh.Sterilisasidilakukandalamautoclavedengansuhu121Cdalamwaktu15menit,karenapadasuhutersebutmikroorganismetidakdapatbertahanhidup(Hadioetomo,1993).Setelah15menit,autoclavedapatdimatikan.Biarkantekanandalamautoclave0atmdansuhukurangdari100C,setelahitumediaataubahanyangadadidalamautoclavedapatdikeluarkan.

2.PembuatanMediaTumbuh

1 . TSA (Triptone soya agar) (M.2)

Bahan :

TSA 40 gram

Akuades 1000 ml (eg)

Cara pembuatan

Larutan TSA dalam akuades dan panaskan hinaga mendidih

Kemuadia disterilkan dengan autoclave suhu 121 C selama 15 menit

Distribusikan dalam cawan petrisk dan tabung reaksi.

simpan d

4.IsolasiBakteri

Isolasibakterimerupakancarauntukmemisahkanataumemindahkanmikrobatertentudarilingkungannyasepertiyangterdapatpadatubuhorganisme(ikan),sehinggadiperolehkulturbakteriyangmurniataubiakanyangtumbuhdidalammediatumbuh.Mengisolasibakteridilakukandalamlaminaryflowsecaraaseptikdanteliti.Isolasipadaagarcawandapatdilakukandenganduacara,yaitumetodegoresdantuang.Isolasiinidilakukanpadamikrobayangdapatmembentukkoloniyangmudahterpisahpadamediapadatsepertikebanyakanbakteri,jamur,danalgauniseluler(Hadioetomo1985).

TeknikisolasibakteriyangbiasadilakukandiBBKIPMyaituTeknikgores,Teknikinidigunakanuntukmengisolasibakteripadaikanmenggunakanjaruminokulum(ose).CaranyayaitusterilkanterlebihdahulujarumosedenganapiBunsen,agartidakterjadikontaminasibakteridariudara.Jarumoseyangtelahsterildigoreskankeorgantargetyangdidugamengandungpathogendanselanjutnyadigoreskankemediatumbuhsecarahati-hati.

Setelahprosesisolasibakteriselesai,makatindakanselanjutnyamemasukkanmediatadikedalamincubatordengansuhu27C30Catauincubator35oCselama2448jam.

5.TeknikPemurnianBakteri

Untukmempelajarisifat-sifatperturnbuhan,morfologidansifatfisiologibakteri,makamasing-masingbakteritersebutharusdipisahkansatudenganyanglainnya,sehinggaterbentukkulturmumi,yaitusuatubiakanyangterdiridarisel-selsatuspesiesatausatugalurmikroba(Fardiaz1989).Pemurniandilakukanpadahasilisolasibakteriyangtelahdiinkubasiselama24-48jam,bakteriyangtelahdiinkubasitersebutbiasanyaterdiridaribeberapakolonibakteri.Sehinggadiperlukanpemurnianbakterisecaraaseptikagarkitahanyamemperolahsatujenisbakterisajadalamjumlahyangbanyakdidalammediatumbuhtersebut.Bakteriyangdimurnikanadalahbakteriyangdominantumbuhdalammediadanterpisah.

Teknikmemurnikanbakterimenggunakanteknikgoresdenganmengambilsatukolonibakteridanmenggoreskannyakepermukaanmediatumbuhsecaraaseptik,Prosespemurnianbakteriinidilakukanuntukmendapatkankolonibakteriyangbenar-benarmurni.Umumnyabakteriyangakandimurnikanadalahbakteriyangkoloninyaterpisahdantumbuhpadahasilgoresanpadamediatumbuh.HalinisesuaidenganpendapatPelczar(2006),yangmenyatakanbahwakoloniyangberlainandapatmewakliorganismeyangberbeda-beda,setiapkoloniagaknyamerupakanbiakanmurnisatumacammikroorganisme.Setelahkulturmurniselesai,makahasilpemurniantersebutdimasukkankedalaminkubatorselama24-48jam.

6.UjiLanjut

Ujilanjutdilakukanuntukdapatmengidentifikasibakteriyangmenyerangikan,selaindenganmelihatbentukdanwarnakolonibakteri,kitaperlumelakukanujilanjutagarprosesidentifikasibakterilebihakuratsehinggakitadapatmenentukanjenisbakteriyangmenyerangkomodititersebut.

AdapunujilanjutyangdilakukandiBalaiBesarKarantinaIkanPengendalianMutudanKeamananHasilPerikananMakassaruntukmengidentifikasibakteriVibriospyangterdapatpadasampelujiKepitingBakau(Scyllaserrata)adalahsebagaiberikut:

a.Ujipewarnaangaram

Salahsatuteknikpewarnaandiferensialyangpalingpentingdanpalingluasdigunakanuntukbakteriialahpewarnaangram.Ujipewarnaangramdilakukanuntukmengetahuibentukdarikolonibakteritersebutdanuntukmenentukanwarnabakteriapakahtermasukgramnegatifataugrampositif.Dalamprosesiniolesanbakteriyangterfiksasikarenalarutan-larutanantaralainKristalviolet,larutanyodium,alkohol(bahanpemucat),dansafraninataubeberapapewarnatandinganlainyangsesuai(Pelczar,2006).

PrinsippewamaanGramadalahkemampuandindingselmengikatzatwarnadasar(kristalviolet)setelahpencuciandenganalkohol96%.Haliniberhubungandengankomposisisenyawapenyusundindingsel,yaitupadabakteriGrampositifmengandungpeptidoglikanlebihbanyakdaripadaGramnegatif(Prabaningtyas2003).BakteriGrampositifterlihatberwamaungukarenaasam-asamribonukleatpadasitoplasmasel-selGrampositifmembentukikatanlebihkuatdengankristalviolet.Namun,sel-selbakteriGramnegatifmempunyaikandunganlipidyanglebihtinggidanumumnyamudahlarutolehalkoholyangmemperbesarpori-poridindingsel.Dengandemikianpemucatanpadasel-selGramnegatiflebihcepat(Hadioetomo1985).

Tahap-tahappewarnaanGramadalahsebagaiberikut:mula-mulaobjekglassdibersihkandengankapasyangtelahdiberialkohol.Selanjutyadiberikode(label).Biakanbakteripadaagardiambilmenggunakanjarumosesterildandipindahkandibagiantengahobjekglassyangtelahditetesiakuadessteril,setelahitudiratakantipis-tipisagarbakteritersebuttidakmenumpuksehinggamudahdiamati.PreparatinidibiarkanmengeringdiudarakemudiandifiksasidiatasBunsenagarbakteritersebutbenar-benarmelekatpadaobjekglass,tetapiperludiingatbahwaprosesfiksasijanganterlalulamadanpanaskarenadapatmenyebabkanbakterirusak.Adapunprosespewarnaangramsebagaiberikut:

1.LarutangramA(kristalviolet)dandibiarkanselama1menit.Selanjutnyadibilasdenganakuades(airmengalir),selanjutnyadikeringanginkan.

2.PreparatiniditetesidenganlarutangramB(yodium)dandibiarkanselama1menitlaludibilasdenganakuades(airmengalir),selanjutnyadikeringanginkan.

3.Kemudianpreparatditetesilarutanpemucatwama,yaitualkohol95%selama30detik,selanjutnyadicucidenganlarutanakuades(airmengalir),selanjutnyadikeringanginkan.

4.YangterakhirditeteskandengangramD(safranin)selama2menit,laludibilasdenganakuades(airmengalir),selanjutnyadikeringanginkan.

Kemudiandiamatibentukselnyadenganmenggunakanmikroskopdenganperbesaran1000x.Sebelumnyapreparatditeteskandenganminyakimersi.BakteridinyatakanbersifatGrampositifapabilawarnaselnyaungudanGramnegatifapabilawamaselnyamerah.(iii)Pewarnaanspora(Hadioetomo1985).

b.Ujikatalase

Ujikatalasedilakukanuntukmengetahuiadatidaknyaenzimkatalasepadabakteri.Katalaseadalahenzimyangdapatmengkatalisasipenguraianhidrogenperoksida(H202)menjadiairdan02.Hidrogenperoksidabersifattoksikterhadapselkarenabahaninidapatmengaktifkanenzimdalamsel.Ujiinipentingdilakukanuntukmengetahuisifatbakteriterhadapkebutuhanakanoksigen(Lay1994).UjiinidilakukandengancaramengambilbiakanbakterilaluditaruhkeobjekglassyangtelahditetesiH2O2,jikaterjadigelembunggasmakaujikatalasepositif,sedangkanjikatidakterjadigelembungmakaujikatalasenegatif.

c.UjiOksidase

Ujioksidasedilakukanuntukmengetahuiadatidaknyaenzimoksidasepadabakteritersebut.Ujioksidaseberfungsiuntukmenentukanadanyacytochromeoksidaseyangditemukanpadabakteritertentu(Lay1994).Ujiinidilakukandengancaramengambilbiakanbakteridandigoreskanpadakertasoksidase,jikakertasoksidaseberubahwarnamenjadiwarnabiruatauungumakaujioksidasepositif,Hasilpositifmenunjukkanbahwaisolat-isolatbakteritersebutmampumenghasilkanenzimcytochromeoksidase,sehinggabakteritersebutmelakukanmetabolismeenergimelaluirespirasisedangkanapabilatidakterjadiperubahanwarnamakaujioksidasenegatif.

1)UjiMIO(MotilIndolOrnithine)

UjiMIOterdiridarimotiluntukmelihatpergerakanbakteri,indoluntukmengetahuiproduksiindoldaritrypthophanedanornithineuntukmengamatiperubahanwarnayangterjadidalammedia.UjiMIOdilakukandengancarabiakanbakteridiambilmenggunakanjarumoselurusdandiinkunbasiselama24-48jam,laludilihatperubahanyangterjadi.Apabilabiakanbakterimenyebardarigaristusukanmakamotilpositif,apabilaterjadiperubahanwarnamenjadiungutuamakaornithinepositif,danapabilaterjadicincinmerahsetelahdiberilarutankovaksmakaindolpostif.

2)UjiOF(OksidatifFermentatif)

UjiOFinidilakukanuntukmengetahuisifatoksidatifdanfermentatifsuatubakteriterhadapglukosa.UjiinidilakukandengancaramengambilbiakanbakterimenggunakanjarumoselurusdanditusukkansecaravertikalkedalamduatabungyangberisimediaOFdansalahsatudaritabungtersebutdiberiparafincair.AdapunpembacaanujiOFbisadilihatpadagambar.

3)UjiTSIA(TripleSugarIronAgar)

UjifermentasiguladanH2SmerupakanserangkaianujiyangdilakukandenganmenggunakanmediumTSIA(TripleSugarIronAgar).Tujuannyaadalahuntukmengetahuikemampuanbakteridalammemfermentasigulauntukmenghasilkanasamataugas.PadamediaTSIAmengandungtigamacamgula,yaituglukosa,laktosaatausukrosadanindikatormerahfenolsertaFeS04(Lay1994).Warnamerahpadaagarmenunjukkanreaksibasa,sedangkanwarnakuningmenunjukkanreaksiasam.Warnamerahpadapermukaanagardankuningdibagianbawahagarmenunjukkanterjadinyafermentasiglukosa.Warnakuningpadabagianpermukaandanbawahtabungmenunjukkanterjadinyafermentasilaktosadansukrosa(Fardiaz1989).

UjiTSIAinidilakukanuntukmelihatperubahanwarnayangterjadipadagoresanmiring(Slant)dantusukantegak(Butt)danmelihatreaksibakteriterhadapasamdanbasa,sertakemampuanbakterimanghasilkangasdanH2S.

apabilaterjadiperubahanwarnamerahpadagoresanmiringdantusukantegakmakabakteribersifatK/K(basa),sedangkanapabilaperubahanpadagoresanmiringmenjadiwarnakuningdanpadatusukantegakmenjadimakabakteribersifatA/K(Asam/Basa).Selainituapabilaterbentukwarnahitam,makabakterimenghasilkanH2Sdanapabilaadagas,makabakteridapatmenghasilkangas.

4)UjiArgininedihydrolisis

UjiArgininedihydrolisisdilakukandengancaramengambilbiakanbakteridenganmenggunakanjarumoselurus,laluditusukkansecaravertikalkemediaargininedandiinkubasiselama24jam.Jikaterjadiperubahanwarnadarikuningmenjadimerahmudaberartiujiargininepositif,sedangkanapabilatidakterjadiperubahanwarnamakaujiargininenegatif.

5)UjiMR-VP

Ujiinidilakukanuntukmengetahuimendeterminasibakteriyangmampumenghasilkanecethylcarbitol(acetion)darifermentasiglukosapadapengujianVogestProskauer(VP)danUntukmengetahuikemampuanbakterimenfermentasiglukosauntukmenghasilkanasampadapengujianMethylRed(MR).PembacaanMRdilakukandenganmenambahkanreagentMRsebanyak6tetes,apabilaterjadiperubahanwarnamenjadiwarnamerahmakahasilpembacaannyapositif,sedangkanapabilaterjadiperubahanwarnamenjadikuningmakahasilpembacaannyanegatif.SedangkanuntukpembacaanVPdilakukandenganmenambahkanreagentKOH40%dengandosis600latau0.6mldanA.Naphtoldengandosis200latau0.2ml.apabilaterjadiperubahanwarnamenjadimerah,makapembacaannyapositif.Sedangkanapabilaterjadiperubahanwarnamenjadikuning,makapembacaannyanegatif.

6)UjiNitrate

UjiinibertujuanuntukmengetahuikemampuanbakteriuntukmengubahNitratdanNitrit.JikaterjadiperubahanwarnamenjadimerahsetelahpenambahanSulfanicaciddanA-Napthylaminesebanyak5tetesmakaujinitratpositifdanapabilaperubahanwarnakuningmakahasilnyanegatif.

7)UjiKIA(KiglerIronAgar)

UjiKIAiniterdiridaridarigoresanmiring/slant(diaminase)dantusukantegak/butt(Decarboxylase),dilakukandengancaramengambilbiakanbakterimenggunakanjarumoselalugoreskankeslantdanditusukkankebutt,setelahitudiinkubasiselama24jam.Jikaterjadiperubahanpadaslantdanbuttdariwarnamerahmenjadikuning,berartidiaminasedandecarboxylasepositifataupembacaannyaA/A.JikaterjadiperubahanpadaslantdanbuttdarimerahmenjadimerahgelapmakadiaminasedandecarboxylasepositifataupembacaannyaK/K.Apabilapadamediaadanodahitam,berartibakteridapatmenghasilkanH2S.sedangkanapabilapadatabungterbentukgelembung,berartibakteridapatmenghasilkangas.

8)UjiSCA(SimonsCitrateAgar)

Prinsipnyauntukmendeterminasikemampuanbakterimenggunakanasamcitratsebagaisumberkarbonuntukmetabolisme.UjiSCAdilakukandengancaramengambilbiakanbakterimenggunakanjarumose,laludigoreskanpadamediaSCAdandiinkubasiselama24jam.Setelahdiinkubasi,diamatiperubahanwarnayangterjadi.JikaterjadiperubahanwarnadariwarnahijaumenjadiwarnabirumakaujiSCApositif,sedangkanapabilatidakterjadiperubahanwarna,makahasilnyanegatif.

9)UjiLIA(LysinIronAgar)

MediaLIAterdiridarigoresanmiring/slant(Diaminase)dantusukantegak/butt(Decarboxylase),dilakukandengancaramengambilbiakanbakterimenggunakanjarumoselalugoreskankeslantdanditusukkankebutt,setelahitudiinkubasiselama24jam.Jikaterjadiperubahanpadaslantmenjadiwarnamerahgelap,berartilysindiaminasepositif.Sedangkanpadabuttapabilamengalamiperubahanwarnaungutua,makalysindecarboxylasepositif.Apabilapadamediaadanodahitam,berartibakteridapatmenghasilkanH2S.Sedangkanapabilapadatabungterbentukgelembung,berartibakteridapatmenghasilkangas.

TUBE

1

2

3

4*

Deaminationoflysin

(darkredslant)

-

+

-

-

Decarboxylationoflysin

(anaerobicalkalinerx.)

-

-

+

+

10)UjiUrease

Ujiureaseinibertujuanuntukmengetahuikemampuanbakterimenghasilkanenzimurease.Ujiinidilakukandengancaramengambilbiakandiinkubasiselama24jam.Jikaterjadiperubahanwarnadarikuningmenjadimerahmuda,makaujiureasepositifdanapabilatidakterjadiperubahanwarnamakaujiureasenegatif.

11)UjiSukrosa,D-Xylose,Laktose,glukosa, Maltosa,Rhamnosa,Trehalose,D-Mannitol,L-Arabinose,Dextrose,Dulcitol,Tryptose,DL-Phenylanine,Sorbitol,Inositol,inulin,esculindanRaffinose

Ujigula-gulainidilakukanuntukmengetahuikemampuanbakterimelakukanfermentasikarbohidrat.Ujiinidilakukandengancaramengambilbiakanbakteridenganjarumoselaludimasukkankemediagula-guladandiinkubasiselama24jam.Jikaterjadiperubahanwarnamakahasilnyapositifdanjikatidakterjadiperubahanwarnamakahasilnyanegatif.

12)UjiNovobiocin

UjiNovobiocinbertujuanuntukmelihatsensitivitasbakteriterhadapnovobiocinatautingkatkerentananbakteriterhadapsuatuzatmikrobasepertiantibiotik.Ujiinidilakukandengancaramengambilbiakanbakteridandigoreskankemediadandiberinovobiocindandiinkubasiselama24jam.Setelahitudilakukanpengamatan,apabilabakterimenghindarinovobiocinmakahasilnyapositifdansebaliknyaapabilabakteritidakmenghindarinovobiocinmakahasilnyanegatif.

7.IdentifikasiBakteri

identifikasimikrobabergunauntukmempelajarisecaradetailkarakterfisik,kimiawi,danbiologismikrobasehinggadapatdiketahuidandimanfaatkansecaraoptimal.

Identifikasibakteridilakukandenganmelihatperubahanujibiokimiayangtelahdiinkubasiselama24-48jam.Hasilujibiokimiadanpewarnaangramditulisdalamblankopengujiandanselanjutnyadiidentifikasisecaramanualdenganbantuanbukuacuansebagaiberikut:

1.BacteriafromFishandOtherAquaticAnimals1(Buller,2004)

2.BacterialFishPathogens-DiseaseofFarmedandWildFish(Springer,2007)

3.Manualfortheidentificationofmedicalbacteria(CowanAndSteel's,1993)

AdapunsalahsatubakteriyangteridentifikasiselamamelaksanakanPraktikKerjaLapangdiBBKIPMadalahVibriosp.

BakteriVibriosp.adalahjenisbakteriyangdapathiduppadasalinitasyangrelatiftinggi.MenurutRheinheiner(1985)cit.Herawati(1996),sebagianbesarbakteriberpendarbersifathalofilyangtumbuhoptimalpadaairlautbersalinitas20-40.BakteriVibrioberpendartermasukbakterianaerobicfakultatif,yaitudapathidupbaikdenganatautanpaoksigen.BakteriVibriotumbuhpadapH4-9dantumbuhoptimalpadapH6,5-8,5ataukondisialkalidenganpH9,0(Baumannetal.,1984cit.Herawati,1996).Darihasilpengamatandimikroskop,terlihatbakterivibriospdenganbentukbatangkomaberjenisgramnegatif(R-).

Tabel.HasilUjiBiokimiadariBakteriVibriosp.yangmenginfeksiinsangkepitingbakau(Buller,2004)

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Katalase

+

Novobiocin

+

DMannitol

-

Oxidase

+

MR/VP

-/-

DLPhenil

-

Motility

+

Trehalose

-

Sorbitol

-

Indol

-

LArabinose

-

Inositol

-

Ornithin

-

Glukosa/gas

-/-

Raffinose

-

OF

F

Sukrosa

-

Malonate

-

TSIA

A/A

DXylose

-

SCA

-

LIA

-/-

Lactose

-

KIA

+/+

Arginine

+

Maltose

-

Urease

-

Nitrate

+

Rhamnose

-

Dextrose

-

a.Vibrioparahaemolyticus

Bakteriiniditemukanpadasampeldengankodeisolate1(kepitingbakau).Organyangdiisolasiadalahinsang,ditemukanbakteriVibrioparahaemolyticus,jenisbakterigramnegativeberbentukbatangkoma,dankoloniberwarnahijaupadamediatumbuhTCBS.

Tabel.HasilUjiBiokimiadariBakteriVibrioparahaemolyticusyangmenginfeksiinsangkepitingbakau(Buller,2004danG.IBarrow,1993)

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Katalase

+

Novobiocin

+

DMannitol

-

Oxidase

+

MR/VP

+/-

DLPhenil

-

Motility

+

Trehalose

+

Sorbitol

-

Indol

+

LArabinose

-

Inositol

-

Ornithin

+

Glukosa/gas

-/-

Raffinose

-

OF

F

Sukrosa

-

Malonate

-

TSIA

A/A

DXylose

-

SCA

-

LIA

-/-

Lactose

-

KIA

-/-

Arginine

-

Maltose

-

Urease

-

Nitrate

+

Rhamnose

-

Dextrose

-

b.Vibrioalginolyticus

Bakteriiniditemukanpadasampeldengankodeisolate7(kepitingbakau).Organyangdiisolasiadalahinsang,ditemukanbakteriV.alginolyticus,jenisbakterigramnegativeberbentukbatangkoma,dankoloniberwarnahijaupadamediatumbuhTCBS.

Tabel.HasilUjiBiokimiadariBakteriV.alginolyticusyangmenginfeksiinsangkepitingbakau(Buller,2004danG.IBarrow,1993)

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Ujibiokimia

Hasil

Katalase

+

Novobiocin

+

DMannitol

+

Oxidase

+

MR/VP

-/+

DLPhenil

-

Motility

+

Trehalose

+

Sorbitol

-

Indol

+

LArabinose

-

Inositol

-

Ornithin

+

Glukosa/gas

-/-

Raffinose

-

OF

F

Sukrosa

+

Malonate

+

TSIA

A/A

DXylose

-

SCA

-

LIA

-/+

Lactose

-

KIA

-

Arginine

-

Maltose

-

Urease

-

Nitrate

+

Rhamnose

-

Dextrose

-

8.FaktorPenyebabKesalahanIdentifikasiBakteri

PadakegiatanIdentifikasibakteriadabeberapafaktoryangperludiperhatikanyaitusebagaiberikut:

a.MekanismeIdentifikisi

Pastikanmenggunakankulturmurni

Bekerjadarikategori/sifatyangumummenujuyangspesifik

Gunakansemuainformasiyangadauntukmempersempitkemungkinan

Gunakancommonsensepadasetiaplangkah

Gunakankarakter(test)minimaluntukidentifikasi

Gunakanbakterireferenuntukmemastikanbahwakondisiujidilabvalid.

b.Identifikasi

Identifikasibakterisecarateoriadalahmembandingkanbakteriyangbelumdiketahuidenganbakteriyangsudahdiketahuiidentitasnya.

Sehinggabakteriyangbelumdiketahuidapatdiidentifikasidenganbenar.

c.KulturMurni

Bakteriyangdiidentifikasiharusbenar-benarberasaldarikulturmurni

Isolatbakteriyangdidapatdarimediumspesifik,sebaiknyadihindariuntukidentifikasikecualitelahdikulturpadamediumumum.Sebabbakteriyangtidaksepesifikmungkintumbuhlambatdimediumspesifik,sehinggakemungkinanakanterbawasaatdipindahkemediumlain

d.MediumSesuaiDenganPetunjuk

Pastikanmediumyangdigunakanbelumhabisumurteknisnya(expired)

pHmediumsesuaidenganpetunjukyangdikeluarkanolehprodusen

Carapembuatandansterilisasisesuaidenganpetunjukyangdikeluarkanolehprodusen

Inkubasipadasuhudanwaktuyangsesuai

KarakterYangDiujiMencukupi

Kurangnyakarakteryangdiujiseringmenimbulkankesulitandanketidaktepatandalamidentifikasibakteri

Jumlahkarakteryangdiujisebaiknyamengacupadabukupedomanyangdiacu(misalAustin&Austin,2007;Buller,2004dsb)