tutorial farmakofor
TRANSCRIPT
-
8/18/2019 Tutorial Farmakofor
1/4
5. Lakukan Tutorial Penentuan Farmakofor menggunakan aplikasi MOE :
1.File Open Cari struktur yang telah diuat O!. !lik Minimi"e untuk
meminimalkan energi
#. File $e% Pharma&ophore 'uery atau Compute Pharma&ophore 'uery
Editor Ligand (nnotation ) Pilih *Long+ ,-ntuk menyalakan lael dari fiturfitur
farmakofor/.
0. !lik nfo ) 2on#) (CC#) P$ dimatikan.2on# adalah proyeksi ikatan hidrogen
donor 3(CC# adalah proyeksi aseptor ikatan hidrogen3 P$ adalah ikatan pi pada
&in&in aromatik. Tu4uannya adalah untuk menyederhanakan tampilan struktur.
-
8/18/2019 Tutorial Farmakofor
2/4
. Create Feature
Fiturfitur farmakofor diuat dengan &ara manual. Titiktitik pada senya%a yang
saling erhimpit dipilih
5. !lik Consensus Cal&ulate
-
8/18/2019 Tutorial Farmakofor
3/4
6. Pilih fitur farmakofor ,pilih erdasarkan himpitan/ Load sele&ted. 7elain itu untk
memilih seagai fitur farmakofor 4uga dilihat dari interaksi ligan dan reseptor melalui
8ligan intera&tion+.
Bagian struktur
yang berikatan
dengan
reseptor
(farmakofor)
-
8/18/2019 Tutorial Farmakofor
4/4