tomáš polák
DESCRIPTION
Tomáš Polák. Prezentace. Základní informace. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
Tomáš Polák
Prezentace
1. Základní informace o fungování BBM
2. Představení aplikace BBM
3. Dosažené výsledky
Základní informace• BBM vznikla jako pracoviště spolupracující na realizaci projektu
„Projekt BBMRI_CZ v rámci budování české části velké distribuované výzkumné infrastruktury pan-evropského významu: vytvoření a provoz sítě bank biologického materiálu pro biomedicínský výzkum“ s cílem vybudovat českou část pan-evropské sítě bank biologického materiálu pro biomedicínský výzkum (Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure).
• Sběr vzorků biologických materiálů a jejich uchovávání• Uchovávání dat o vzorcích• Výzkum
– Objasnění mechanismu vzniku chorob– Objasnění vlivu podílu genetických faktorů a vlivu životního stylu i
vnějšího prostředí na dané onemocnění
Historie
10 / 2011Vznik BBM
09 / 2011 – 06/2012
Vybudování zázemí BBM
03 / 2012Souhlas etické
komise VFN
10 / 2012Zahájení prací na aplikaci
BBM
01 / 2013Spuštění provozu
BBM
BBM mapa
Odběr vzorků – ve spolupráci s pracovišti VFN
Gynekologicko-porodnická klinika I. Chirurgická klinika Stomatologická klinika Urologická klinika
Onkologická klinika Oční klinikaIV. Interní klinika – gastroenterologie a
hepatologie
I. Interní klinika – hematologie
Radiodiagnostická klinika
Dermatovenerologická klinika
Odběr vzorků - typy
Tkáň Krev Moč
Odběr vzorků - aplikace
Zpracování vzorků - pracoviště
Ústav lékařské biochemie a laboratorní
diagnostiky (ÚLBLD)
Ústav patologie (Hlavův ústav)
ÚLBLD
• 1. LF UK v Praze, Na Bojišti 3, 128 00 Praha • Administrativní sídlo• Vzorky sérum, plasma, plná krev, dna, moč• Pro úschovu mrazáky
ÚLBLD
Ústav Patologie
• 1. LF UK v Praze, Studničkova 2, 128 00 Praha 2• Vzorky tkáně a tkáně v RNA lateru• Pro úschovu mrazáky a Dewarovy nádoby• Rekonstrukce laboratoří BBM v roce 2011
Ústav patologie
Aplikace BBM
• Modul pro přidávání vzorků pro kliniky• Import export MSSQL databáze• MSSQL databáze Banky biologického materiálu• Webová aplikace Banky biologického
materiálu
Schéma aplikace BBM
Schéma datové komunikace
Moduly aplikace
Centrum aplikace
Sérový modul
Bioptický modul
Tkáňový modul
DNA modul
Mrazáky
Boxy
Skupiny uživatelů
Správci Etici Klinici UP Klinici ULBLD
Technici UP
Technici ULBLD
Klinici VFN
Odebráno vzorků
Tkáň Krev Moč0
102030405060708090
57
85
27
Počty odebraných vzorků
Řada 1
Počet alikvotů
Tkáň Tkáň Later
Plná krev
Sérum Plasma DNA Moč0
50100150200250300350400450500
250
11781
464
314
142 130
Počet alikvotů
Řada 1
Podporováno projektem LM2010004
Dotazy
Děkuji za pozornost