tlt104 biokim-bolum-nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç
TRANSCRIPT
![Page 1: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/1.jpg)
Genel Özellikleri sınıflandırılmaları
NÜKLEOTİTLER ve NÜKLEİK ASİTLER
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html1
Doç. Dr. Yasemin G. İŞGÖR
![Page 2: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/2.jpg)
Nükleotitlerin genel yapısı1. azot içeren baz, 2. pentoz (şeker) 3. fosfat
Nükleozitler (nükleositler): nükleozitlerin fosfat grubu çıkarıldığında oluşan yapıdır.
Azot içeren bazlar pirimidin ve pürin türevleridir. Fosfat grubu dışında Nükleotitler, Nekleozitler ve Nükleik Asitlerin yapısında yer
alan riboz ve azotlubazlar halkalı heteroatom bileşikleridir (heterosiklikbleşikler).
Nükleotitler, Nükleozitler ve Nükleik Asitler
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html2
![Page 3: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/3.jpg)
3 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 4: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/4.jpg)
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html4
Azotlu Bazlar
![Page 5: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/5.jpg)
5 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 6: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/6.jpg)
6 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 7: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/7.jpg)
7
Ribonükleortit ve deoksiribonükleotit arasında temel fark riboz şekeri halka yapısında 2.. Pozisyondaki OH grubudur:
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
Ribozlar
Deoksiribonükleotitlerde 2' karbondaki -OH grubu yerine -H gelir
![Page 8: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/8.jpg)
8
Deoksiribonükleotitler
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 9: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/9.jpg)
9
Ribonükleotitler
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 10: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/10.jpg)
10 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 11: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/11.jpg)
11 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 12: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/12.jpg)
12 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 13: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/13.jpg)
13
RNA Riboz şeker taşır Tek zincir A = U C ≡G
DNA Deoksiriboz taşır Çift sarmal yapı A = T C ≡ G
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 14: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/14.jpg)
14
Aktf ara ürünler oluşturarak bunların metabolik yollarda kullanılmasını sağlar UDP-Glukoz: Glikojen ve Glukoprotein
sentezinde GDP-Mannoz, GDP-Fruktoz ve UDP-
Galaktoz, CMP-Sialik asit: glukoproteinsentezinde,
ÖZETLE: ATP doğrudan enerji dengesinde, GTP protein senteziyle ilgili mekanizmalarda, CTP lipit (fosfolipit ) sentezi mekanizmalarında, UTP ise karbonhidrat meytabolizmasıyla ilgili mekanizmalarda önemle kullanılan nükleotitlerdir.
Enerji Metabolizmasında (ATP, GTP) Fosforilasyona neden olarak aktif
transportta DNA ve RNA yapısını oluşturmada Fizyolojik mekanizmaları
düzenlemede 2.cil mesajcı olarak (cAMP, cGMP, 7-metil-GTP gibi)
Kofaktörleri oluşturmada AMP: Koenzim A, NAD, FAD, NADP GTP: tetrahidrbiopterin (HB4) ün
öncülü olarak,
Nükleotitlerin Metabolik Fonksiyonu
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 15: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/15.jpg)
15
Hücre içeren besinlerle alınan nükleik asitler midedeki enzimlerden etkilenirler ve duodenumdaki pankreatik nükleazlarca parçalanırlar.
Pankreas Ribonükleazı RNA’yı, pirimidin mononükleotidleri ve pirimidin 3’-fosfat kalıntısıyla son bulan oligonükleotitleri serbestleştirerek hidroliz eder.
Deoksiribonükleaz Mg2+ ve Mn2+ varlığında etki gösterir ve DNA yı özgün olarak oligonükleotitlere hidroliz eder.
İnce barsak mukozasında ise diesterazların oligonükleotidleri mononükleotidlerehidroliz ettiği düşünülmektedir.
İnce Barsakta fosfataz ve nükleotdazlarca bu mononükleotidler tamamen nükleozid ve fosfatlara ayrıştırılır.
Nükleotitlerin Vücuda Alımı ve Sindirimi
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 16: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/16.jpg)
16
Genel Olarak [Ribonükleotit] >> [Deoksiribonükleotit]DNA replikasyonu Sırasında [Ribonükleotit] << [Deoksiribonükleotit]
Normal hücrelerde nükleotitlerin toplam konsantrasyonu sabittir. ATP +ADP+ AMP= sabit
Ancak, ATP/Total, ADP/Total, AMP/Total değişebilir. Bunun nedeni de novosentez ve salvage mekanizmalarıyla nükleozit, nükleotit ve bazların geri kazanılmasının mümkün olmasıdır.
Normal şartlar altında bu mekanizmalar sıkı metabolik kontrol altındadır.
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 17: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/17.jpg)
17
1. de Novo (yani sıfırdan sentez)2. Salvage (yani dışardan alınan besinlerle gelen (eksojen kaynaklı) bazların ya
daendojen kaynaklı bazların yeniden kullanımı) Hem de novo ve hem de salvage (kazanım)yolu ile RNA’nın yapısına giren
ribonükleotidler sentezlenir. De novo yolla nükleotidler yeni molekül olarak sentezlenirken, salvage (kazanım) yolu
ile ortamda var olan nükleotidlerin riboz şekerine bağlanarak yeniden kullanılmasısağlanır.
DNA oluşumunda Deoksiribonükleotidler ribonükleotidlerden yapılırlar. Bunun için, deoksiriboz şekeri riboz
şekerinin reduksiyonu ile oluşur. Timin’in Urasilden farklı olmasını sağlayan metil grubu en son basamakta eklenir.
Nükleotit Biyosentezi
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 18: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/18.jpg)
18
Pürin bazının oluşumunda rolü olan amino asitler:Aspartat, glisin ve Glutamin’dir
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 19: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/19.jpg)
19
Pirimidin bazının oluşumunda rolü olan amino asitler:Aspartat, glisin ve Glutamin’dir
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 20: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/20.jpg)
20
Pürin nükleotid çekirdeğinin N-1 atomuaspartatdaki α-amino grubundan, C-2 veC-8 atomları formiltetrahidrofolat’dan,
N-3 ve N-9 atomları glutamindeki amid grubundan,
C-4 ve C-5 ile N-7 atomları glisininkendisinden,
C-6’yı karbondioksitdeki karbon atomuoluşturmaktadır.
Ayrıca nükleotid sentezi için de glukozüzerinden sentezlenen riboz-5-fosfat veenerji kaynağı olarak ATP gerekmektedir.
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
![Page 21: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/21.jpg)
21
PÜRİN BİYOSENTEZİ
![Page 22: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/22.jpg)
22 Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
PİRİMİDİN BİYOSENTEZİ
![Page 23: TLT104 BIOKIM-bolum-Nukleotd metabolizması sentez ve … · 2019. 3. 12. · t u Ç Ç _ Ç](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022061000/60af928d8923aa30a56bb2d0/html5/thumbnails/23.jpg)
23
De Novo Sentez Yolları
Doç. Dr. yasemin G. İŞGÖR /Ankara Üniversitesi/ link: http://80.251.40.59/ankara.edu.tr/isgor/index.html
Basit Metabolitler
11 basamak
4 basamakRiboz üstündePürin halkasentezi
Pirimidin halkasentezi
Basit Metabolitler
Pirimidinhalkasının Ribozüstüne eklenmesi
UMP KinazGMP KinazAMP Kinaz
PÜRİNLER PİRİMİDİNLER
Nükleosit Difosfat Kinaz