tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...kromosom 27 p...
TRANSCRIPT
![Page 1: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/1.jpg)
Atopisk dermatit hos schäfer Katarina Tengvall PhD Institutionen för Medicinsk Biokemi och Mikrobiologi Uppsala universitet
![Page 2: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/2.jpg)
Atopic dermatit hos hund (CAD)
� Vanlig sjukdom som drabbar mellan 3-15% av alla hundar ◦ Stora rasvariationer
� Komplex sjukdom ◦ Genetiska riskfaktorer ◦ Miljöfaktorer
� Lika symtom som atopisk dermatit hos människa ◦ Genetisk modell
Genetisk predisponerad inflammatorisk och kliande allergisk hudsjukdom associerad med IgE antikroppar mot allergen i omgivningen
Foto: Kerstin Bergvall
Halliwell 2006
![Page 3: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/3.jpg)
Schäfer � Predisponerad för immunmedierade sjukdomar ◦ CAD m.fl.
� Låga IgA nivåer ◦ Mätte även serum IgA hos schäfrarna i studien ◦ IgA är viktig för kroppens immunförsvar
� Vanlig ras
Mål med studien: - att hitta gener associerade med CAD - undersöka om serum IgA nivåer är
korrelerade med CAD
![Page 4: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/4.jpg)
p=1.1 x 10-5
� Lägre IgA nivåer hos CAD-
fall jämfört med kontroller
� IgA nivåer högre hos
äldre hundar
Ålder - år
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
1.4
0 2 4 6 8 10 12 14
IgA
leve
ls
R2=0.21 p=3.0 x 10-9
IgA
leve
ls
1.2
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
0.0
Sjuka N=91
Friska N=93
Karaktärisering av IgA nivåer i schäferpopulationen
![Page 5: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/5.jpg)
� Genotypade ~200 schäfrar ◦ SNP-chip ◦ 170,000 genetiska markörer
spridda över arvsmassan
� Två subpopulationer ◦ Den ena löper större risk att
drabbas av CAD
◦ Utställningstyp vs arbetstyp
Genomvid analys av schäfrarna
CAD case CAD control
![Page 6: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/6.jpg)
� Mixed model tar hänsyn till flera faktorer: ◦ IgA nivåer och ålder ◦ Subpopulationer
� 91 fall + 88 kontroller
Genetisk associationsanalys
Kromosom 27 Praw = 3.1x10-7
Pgenome = 0.03
![Page 7: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/7.jpg)
Starkast association på kromosom 27
Zoom in i den associerade regionen � ~1.5Mb � 21 SNP:ar � 8 gener
Kromosom 27
CPNE8 ALG10B
SYT10 YARS2
DNM1L PKP2
Plakophilin-2 (PKP2)
MRPL37 NAP1L1
![Page 8: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/8.jpg)
Proteinet plakophilin-2 uttrycks i hud
Desmosomer ◦ Sammankopplar celler mekaniskt ◦ Cell-cell signalering
� Hjärtmuskulatur ◦ Mutationer har visats orsaka
hjärtsjukdom
� Hudbarriär
Green et al., J Invest Dermatol. 2007
Plakophilin Desmosom
![Page 9: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/9.jpg)
Efter ytterligare analyser och funktionella studier…
� … är vår hypotes: ◦ Att ca nio mutationer tillsammans påverkar
uttrycket av genen PKP2 i hud ◦ Att detta påverkar utvecklingen av CAD hos
schäfer � I kombination med:
� Låga IgA nivåer � Miljöfaktorer � Andra genetiska riskfaktorer
![Page 10: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/10.jpg)
Möjlig applikation � Förutspå en ökad risk för CAD hos schäfrar baserat
på låga serum IgA och bärande av PKP2-riskvarianten ◦ Möjligen även hos westie
� Bärare av PKP2 risk, IgA status ej känt � Som liksom schäfer drabbas av jästinfektioner sekundärt till CAD ◦ Men sannolikt ej hos Labrador och Golden
� där ingen koppling setts mellan låga IgA eller PKP2-risk och CAD
Foto: Kerstin Bergvall
![Page 11: Tengvall atopi 151121 151119bstorage.hundpoolen.com/files/256da00d-ac48-4a7d-9439-ac...Kromosom 27 P raw = 3.1x10-7 P genome = 0.03 Starkast association på kromosom 27 Zoom in i den](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022021915/5ca4ba4988c993f9768b4851/html5/thumbnails/11.jpg)
Medverkande i projektet
Kerstin Lindblad-Toh Åke Hedhammar Göran Andersson Gerli Rosengren-Pielberg Marcin Kierczak Kerstin Bergvall Sergey Kozyrev Eva Murén Fabiana Farias Brita Ardesjö Lundgren
Mia Olsson Lennart Hammarström Örjan Carlborg Cecilia Johansson Susanne Gustafsson Ulla Gustafsson m.fl.