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Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas Título del Proyecto: Identificación de genes homólogos a EmrB (de Escherichia coli ) como genes potenciales relacionados con el flujo de salida de Ácido Pirazinóico en Micobacterium tuberculosis

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Page 1: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de

membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Título del Proyecto: Identificación de genes homólogos a EmrB (de Escherichia coli) como genes potenciales relacionados con el flujo de salida de Ácido Pirazinóico en Micobacterium

tuberculosis

Page 2: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Pirazinamida Nicotinamida

PZA

Introducción

Page 3: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Resistencia: mutaciones en PZasa Resistencia: sin mutaciones y con actividad intacta

PZA

Introducción

+ H2O + NH4+PZasa

Monica Pajuelo Travezaño:

Prodroga

Enzima PZAsa

Monica Pajuelo Travezaño:

Prodroga

Enzima PZAsa

Page 4: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Antecedentes

1. Mecanismo de acción de la PZA

Page 5: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Mutación en PZasa ¿Bombas de flujo de salida involucradas? M. smegmatis:

Tiene dos PZasas activas Frente a inhibidores de transportadores: reserpina,

valinomicina, las cepas se hacen sensibles

Antecedentes

2. Resistencia a la PZA

Page 6: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Objetivos

Identificar genes homólogos a EmrB de E. coli relacionados con el flujo de salida de ácidos orgánicos débiles o de drogas en M. tuberculosis

Verificar que los posibles genes contribuyan con el flujo de salida de POA en M. tuberculosis

Objetivos

Page 7: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Planteamiento del Experimento

Búsqueda de genes homólogos a Emrb de E. coli

Búsqueda de genes homólogos a Emrb de E. coli

Uso de COG

Búsqueda en TubercuList

Predicción de Segmentos Transmembrana

Predicción de Segmentos Transmembrana

Uso de TMpred

Resultados PreliminaresResultados Preliminares

Page 8: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Planteamiento del Experimento

Acumulación de POA

Acumulación de POA

Uso de sustrato radiactivo marcado con C14

Determinación de la sensibilidad a PZA/POA

Determinación de la sensibilidad a PZA/POA

Determinación de MIC

Knockout de genesKnockout de genesRecombinación genética homóloga

Determinación de la actividad de PZasa

Determinación de la actividad de PZasa

Método de Wayne

Page 9: Tema propuesto: Identificación de genes potenciales relacionados con el eflujo de membrana de Mycobacterium tuberculosis utilizando herramientas bioinformáticas

Planteamiento del Experimento