tekstovne podatkovne zbirke

Tekstovne podatkovne zbirke

Zvrsti,opisovanje vsebine,bibliografske zbirke.

Informatika (2010 / 2011): J. Dimec: Tekstovne podatkovne zbirke 2

Tekstovne zbirke - uvod

Velik del informacij v znanosti (tudi v medicini) je tekstovne narave. tiskane publikacije, e-publikacije, diagnoze, poročila o posegih, razlage nebesedilnih informacij...

Tudi za take informacije veljajo vse posledice informacijske eksplozije, zato postanejo obvladljive šele z uporabo informacijskih orodij.


Zvrsti tekstovnih zbirk

Bibliografske zbirke. Zbirke polnih “besedil”:

nestrukturirana besedila, hipertekstni in multimedijski dokumenti.

Kratki tekstovni podatki so vključeni tudi v tabele relacijskih zbirk, ki so vsebina enega naslednjih predavanj.


Bibliografske zbirke

Najstarejša in, v znanstvenem informiranju, še vedno najpomembnejša oblika tekstovne podatkovne zbirke.

Bibliografski zapis vsebuje osnovne podatke o dokumentu.

Načini uporabe: informacijska potreba vsebinske narave – t.i. retrospektivne

poizvedbe, iskanje po imenih avtorjev ali inštitucij – bibliografije, vrednotenje raziskovalnega dela...



Uporaba bibliografske zbirke je samo korak pri zadovoljitvi informacijske potrebe.

Povezava s knjižnico: v bibliografski zbirki izvemo za obstoj dokumenta,

ki ustreza informacijski potrebi, dokument dobimo v knjižnici, lahko z

medknjižnično izposojo. Vedno pogosteje bibliografski zapis vsebuje

spletni kazalec na polni dokument.


Bibliografske zbirke, primer

...



Bibliografska zbirka ni knjižnični katalog: bistvo knjižničnega kataloga so t.i. lokacijski

podatki - pozicija in zaloga enot gradiva v knjižnici,

knjižnični katalogi vsebujejo podatke o knjigah, zbornikih, revijah, zelo redko podatke o člankih.


Iskanje po tekstovni zbirki je najpogosteje iskanje po vsebini dokumentov.

Vsebina dokumenta mora biti opisana v bibliografskem zapisu v zbirki.

Elementi opisa vsebine - ključne besede ali deskriptorji.

Postopek imenujemo indeksiranje. Indekser uporablja elemente opisa vsebine za

opisovanje vsebine dokumenta. Iskalec uporablja elemente opisa vsebine za izražanje

svoje informacijske potrebe.

Bibliografske zbirke: opisovanje vsebine dokumentov


Bibliografske zbirke: opisovanje vsebine dokumentov

Iskanje in indeksiranje - zrcalna postopka. Med indeksiranjem dokumenta indekser

poskuša uganiti ključne besede ali deskriptorje, ki bi jih iskalec uporabil, če bi hotel poiskati dani dokument.

Indekser in iskalec pri klasičnem indeksiranju in iskanju uporabljata tezaver.


Tezaver

Tezaver je seznam deskriptorjev in navodil za njihovo uporabo.

Deskriptorji v tezavru so povezani s semantičnimi relacijami, najpogosteje so to hierarhične relacije.

Deskriptorji tvorijo umeten informacijski jezik: za vsak pojem obstaja en sam deskriptor

(kontrola sinonimov), vsak deskriptor opisuje en sam pojem (kontrola

homonimov).


Bibliografske zbirke: Medline

Največja bibliografska zbirka v biomedicini, avtor: National Library of Medicine (NLM),

Bethesda, ZDA, redno nastaja od l. 1947, na voljo v e-obliki za obdobje 1966 – danes, vključeni bibliografski podatki o člankih iz

5.400+ biomedicinskih revij, v zadnjih letih 76% zapisov z izvlečkom v angl.,

prej pribl. 50%.


Bibliografske zbirke: Medline > 50% zapisov ima kazalce na polne dokumente,

večinoma na spletišču založnika revije. Velikost: ~20.000.000 bibliografskih zapisov, trend naraščanja: 2000+ / dan,

450.000+ / leto. Vsak bibliografski zapis vsebuje opis vsebine

dokumenta, opis vsebine narejen z vsebinskimi koncepti iz

tezavra MeSH. MeSH = Medical Subject Headings.


Tezaver MeSH

Kaj je vsebinski koncept? najmanjša enota znanja, zapisana z besedami ali

besednimi zvezami, koncept ima samostojen pomen, koncept opisuje nek konkreten objekt ali pojem.

Vsebinski koncept v MeSH: vsebinski koncept vključuje vse sinonime in

leksične variante (načine zapisovanja), en sinonim je izbran kot “prednostno ime”

koncepta in ga imenujemo deskriptor.


Tezaver MeSH

Vsebina je v bibliografskem zapisu opisana z deskriptorji in kvalifikatorji, npr

myocardial infarction / drug therapy

(kvalifikatorji podrobneje omejijo vsebinski obseg deskriptorja),

pomožnimi koncepti, pretežno kemijske in farmakološke narave.

deskriptor kvalifikator


Tezaver MeSH

Face [A01] Cheek Chin Eye Forehead Mouth Nose

Respiratory System [A04] Larynx Lung Nose

Nasal BoneNasal CavityNasal MucosaNasal Septum

Sense Organs [A09] Ear Eye Nose

Olfactory MucosaVomeronasal Organ

Taste Buds

Deskriptorji so zelo pogosto uvrščeni na različna mesta istega hierarhičnega drevesa – primer deskriptorja Nose v hierarhiji Anatomy.


Tezaver MeSH

Deskriptorji (koncepti) v tezavru MeSH so urejeni hierarhično.

Vseh hierarhij je 15. En deskriptor je lahko

uvrščen v več ločenih hierarhij, npr.

Creutzfeldt-Jakob syndromeje lahko C10 - Nervous System Diseases ali F3 - Mental Disorders


MeSH: primer hierarhične pozicije deskriptorjaNorepinephrine


Tezaver MeSH

Tezaver MeSH se uporablja pri indeksiranju in iskanju.

Javno je dostopen na spletnem naslovuhttp://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

Med iskanjem njegova hierarhična narava pomaga pri navigaciji ob izbiri ustreznih deskriptorjev, širjenju ali oženju iskalne zahteve.


Medline

Podatki iz zbirke Medline so pri proizvajalcu (NLM) načeloma zastonj.

Obstajajo številne implementacije komercialnih ponudnikov.

Spletna implementacija na NLM je zastonj. Uporabniški vmesnik relativno neprijazen. Največja pomanjkljivost: pregledovalnik za

MeSH ni del uporabniškega vmesnika. Spletna implementacija PubMed na strežnikih NLM:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi


Medline - PubMed

Primer enostavnega iskanja:uporabljen deskriptor cardiovascular abnormalities. Rezultati so v obliki bibliografskih zapisov.


Medline - PubMed Rezultat iskanja je lahko tudi polni dokument.


Biomedicina Slovenica

Največja specializirana bibliografska zbirka pri nas.

Gradi jo Inštitut za biomedicinsko informatiko MF.

Pokriva ista vsebinska področja kot Medline. Veljajo ista načela gradnje, vključno z MeSH,

kot pri Medline. Vključuje dela slovenskih avtorjev objavljena

pri nas in po svetu in dela tujih avtorjev, objavljena pri nas.



V računalniški obliki nastaja od leta 1976! 2010: v zbirki nad 145.000 zapisov. Dostopna zastonj na spletnem naslovu

http://bswww.mf.uni-lj.si/pls/bs/bs_frm?lang=SLO


BiomedicinaSlovenica

Rezultati iskanja ziskalno zahtevoAvtor = Kansky AinDeskriptor =SKIN DISEASES,VESICULOBULLOUS



Rezultat iskanjaje lahko tudi polni dokument.


Zbirke polnih dokumentov

Bibliografski zapis je nadomestek pravega nosilca informacij.

Bibliografski zapis le opozarja na dokument. Informacijski potrebi lahko zadosti le polni

dokument. V sodobnih tekstovnih zbirkah

bibliografske nadomestke zamenjujejo polni dokumenti, ali pa

bibliografski zapis postane kazalec, ki omogoča dostop do polnega dokumenta.


Hipertekst, multimediji

Strokovni dokument ni linearno branje. Nevidna struktura strokovnega

dokumenta je semantična mreža. Tudi dokumenti v zbirki so na nek način

povezani s semantično mrežo. Strokovni dokument ni samo besedilo. Naravna načina zapisa strokovnih

dokumentov sta hipertekst in multimediji.

tekstovne podatkovne zbirke

Documents