Taverna – WMS

Discente:Raffael Bechara Rameh

UFJF/PGMC Mestrado - 1/2016Prof. Dr. Ciro Barros

Taverna – WMS

Introdução Conceitual

● Workflow

– Sequência de passos necessários para se automatizar processos (científicos), de acordo com regras definidas

– Envolve geralmente interação/comunicação entre pessoas ou grupos (participantes):

● Envolvidos diretos:– interagem entre si durante

a execução do processo ● Interessados nos resultados

● Experiência in silico

– Experimentação através da simulaçao computacional

● WMS: Workflow Management System

– Conjunto de ferramentas para design e execução de workflows científicos com objetivo de auxiliar experiências in silico

Taverna – WMS

Taverna - WMS● Disponível para download em:

– http://www.taverna.org.uk/● Disponível nas seguintes edições:

– Workbench (desktop designer/player)

– Server (cloud infrastructure)

– Player (interface web para execução no Server)

– Command Line

– Online

Taverna – WMS - Screenshot

Painel de Serviços: recursos p/ acesso a WebServices, DBMS, manipulação e transformaçao de dados (xml, text,...), criptografia, interaçao com usuário, etc..

Workflow Explorer: mostra a estrutura hierárquica do workflow em que estamos trabalhando

Diagrama de Workflow

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS - Tutorial

Taverna – WMS

myExperiment● Repositório de experimentos

● Torna possível o compartilhamento de experimentos entre as pessoas

● Possibilita acesso a diversos workflows e pacotes desenvolvidos pela comunidade

● Permite a localização de outros usuários e grupos da comunidade

Taverna – WMS

● WfMC– Workflow Management Coalition

– http://www.wfmc.org/

Referências

● Taverna– Site Oficial

– http://www.taverna.org.uk/

● MyExperiment– Repositório de Workflows

– http://www.myexperiment.org/

Taverna – WMS - Perguntas

1)Qual a relação entre WMS e Taverna?

2)Cite dois tipos de serviços suportados pelo Taverna.

3)O que é um WebService?

4)Defina o myExperiment.

5)Quais os benefícios de uma comunidade de experimentos científicos na internet?

Taverna – WMS

Obrigado!