slicer 3 チュートリアル spl における腹部アトラス
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Slicer 3 チュートリアル SPL における腹部アトラス. Ion-Florin Talos, M.D. 謝辞. NIH P41RR013218 (Neuroimage Analysis Center) NIH U54EB005149 (NA-MIC). 免責条項. 使用者は添付ライセンス内の内容と関連法に遵守して slicer を使用すること. 使用するソフトウェア , データセット. Slicer 3( このチュートリアルでは slicer3-3.0 を使用 ) - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
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Brigham and Women’s Hospital
Slicer 3 チュートリアルSPL における腹部アトラス
Ion-Florin Talos, M.D.
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Brigham and Women’s Hospital
謝辞
NIH P41RR013218 (Neuroimage Analysis Center)
NIH U54EB005149 (NA-MIC)
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免責条項
• 使用者は添付ライセンス内の内容と関連法に遵守して slicer を使用すること
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使用するソフトウェア , データセット
• Slicer 3( このチュートリアルでは slicer3-3.0 を使用 )
→http://www.slicer.org/pages/Special:SlicerDownloads
• アトラスデータ→http://www.spl.harvard.edu/publications/item/view/1266
• CT 画像• ラベルマップ• 3D モデル
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学習目標
• アトラスデータの読み込み
• 体内の独自の 3Dviewの製作と表示
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チュートリアルにおける必要条件
• Slicer Training データの読み込みと表示のチュートリアルを行うこと→http://wiki.na-mic.org/Wiki/index.php/Slicer:Workshops:User_Training_101
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要旨
• Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み
• Part 2: 体内の独自の 3Dview の製作と表示
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腹部アトラスデータの読み込み
• 解剖学的な濃淡値データ (CT や MRI 等の画像データ ) ………………….
• ラベルマップ……………………………
• 3D モデル………………………………
• MRML シーン ………………………… .
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アトラスデータの読み込みFile メニューより ,Load Scene を選択 .ポップウィンドウにおいて , Abdominal_Atlas2008.mrml を選択し , Open をクリック .
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3D モデル
アトラスデータの読み込み
ラベルマップでオーバーレイされたCT 画像
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要旨
• Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み
• Part 2: 体内の独自の 3Dview の製作と表示
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独自の 3Dview の製作
Models モジュールの visibility より ,3D モデルが各構造毎に表示するかどうかを選択できることから ,独自の体内の 3Dview を製作することが可能 .
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独自の 3Dview
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独自の 3Dview の製作 (1)
Modules より ,Models モジュールを選択 .Hierarchy & Display タブを開く
Model Display 欄より ,Select Model or Hierarchy において ,モデルを選択し , そのモデルを3DViewer 内で表示したいならば ,Visibility のチェック欄にチェックを入れる .( チェックを入れなければ , 表示されない )
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独自の 3Dview の製作 (2)
Modules より ,Data モジュールを選択 .
Create Scene Snapshot をクリックし , ポップアップウィンドウにおいて , 独自の 3Dviewの名前を記入 . ( 例: Portal Circulation)
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独自の 3Dview の製作 (3)
•Scene Snapshot の右側の欄をクリックすると , これまでに作成したスナップショットのデータファイル名も出てくるので ,そこから選ぶことも可能である .•保存ファイル名が決定すれば ,Restore をクリック .
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補足 (1)
• スライド 14~16 に関しては ,slicer3-3.0 バージョンにおけるスナップショット方法である .
• Slicer3-3.0 以降のもの (3.2 や 3.4 等 ) では上記のスナップショット方法と異なる .
• 3.2,3.4 バージョンにおけるスナップショット方法を説明する .
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補足 (2)
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補足 (3)
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補足 (4)
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翻訳
スライド翻訳:木西 基 ** 監守:波多 伸彦 *
* Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School** 知的画像処理研究室 , 立命館大学