siklus asam sitrat
TRANSCRIPT
SIKLUS ASAM SITRAT
WISNU ANGGRIAWAN
140210080086
Siklus Asam Sitrat
Dikenal pula dengan nama siklus asam trikarboksil (tricarboxilyc acid cycle atau TCA) atau Siklus Krebs
Siklus ini merupakan step kedua dari tiga major respirasi seluler
Acetil-CoA merupakan Starting material pada siklus asam sitrat
Produksi Acetil-CoA(Activated Acetate) Reaksi secara keseluruhan merupakan reaksi
dekarboksilasi oksidatif Reaksi dikatalisis oleh enzim piruvat dehidrogenase
kompleks yang terdiri dari tiga jenis enzim dan lima macam koenzim
Lima koenzim : 1. Thiamine Pyrophosphate (TPP)2. Flavin adenine dinucleotide (FAD)3. Coenzim A (CoA)4. Nicotinamide adenine dinucletide (NAD)5. lipoate
Overall Reaction
Trhee Distinct Enzym pada Komplek Piruvat
Dehidrogenase :
1. Pyruvate Dehidrogenase (E1)
2. Dihydrolipoyl Transacetylase (E2)
3. Dihydrolipoyl Dehydrogenase (E3)
Struktur Pyruvate Dehydrogenase Complex
E1 merupakan katalis pertama pada dekarboksilasi piruvat menajdi hidroksietil-TPP, kemudian mengoksidasi grup hidroksietil menjadi grup asetil
E2 mengkatalisis transfer grup asetil menjadi koenzim A, membentuk asetil-CoA
E3 katalis regenerasi disulfida menjadi lipoate, elektron menjadi FAD kemudian NAD+
Reaksi Siklus Asam Sitrat
8 Step Siklus Asam Sitrat
1. Pembentukan Sitrat
Kondensasi Asetil-CoA dengan Oksaloasetat menjadi Sitrat dikatalilis oleh Sitrat sintase
2. Pembentukan Isositrat via cis-Asonitat
- Ezim : asonitase
- Reaksi berjalan secara reversibel antara sitrat dan isositrat
3. Oksidasi isositrat menjadi α-ketoglutarat dan melepas CO2
- Enzim : isositrat dehidrogenase
- Mn2+ pada sisi aktif berinteraksi dengan gugus karbonil pada tahap intermediet oksalosuksinat
4. Oksidasi α-ketoglutarat menjadi suksinil-CoA dan CO2
- enzim : α-ketoglutarat dehidrogenase kompleks
- NAD+ sebagai aseptor elektron dan CoA sebagai pembawa gugus siksinil
5. Konversi Suksinil-CoA menjadi suksinat
- enzim : suksinil-CoA sintase / suksinik thiokinase
- enzim terdiri dari dua sub unit yaitu :
1. α sub unit (Mr = 32.000), yang memiliki p-his residue (His246)
2. sub unit (Mr = 42.000) pengubah GDP atau ADP
6. Oksidasi Suksinat menjadi fumarat
- enzim : suksinat dehidrogenase
- pada eukariotik, suksinat dehidrogenase terikat pada mitokondria bagian dalam. Pada prokariotik, terikat pada membran plasma
7. Hidrasi fumarat menjadi malat
- enzim : fumarase
8. Oksidasi malat menjadi fumarat
- enzim : L-malate dehidrogenase
Satu kali siklus asam sitrat menghasilkan 3 NADH, 1 FADH dan 1 GTP atau ATP serta 2 CO2
Selain Asetil-CoA, senyawa lain juga dapat menyumbangkan atom karbon menjadi senyawa berkarbon 4 atau 5 pada senyawa antara siklus asam sitrat
Contohnya pemecahan asam amino yang dapat dioksidasi melalui siklus asam sitrat
Reaksi Anaplerotik pada siklus Asam Sitrat Terjadi pada reaksi intermediet asam sitrat Menghasilkan senyawa intermediet berkarbon 4
dari senyawa berkarbon 3 dengan reaksi karboksilasi
Dikatalisis oleh enzim piruvat karboksilase, PEP karboksilase, PEP karboksikinase, dan malic enzym
Enzim bekerja dengan bantuan biotin untuk mengaktivasi CO2 dan dibawa ke aseptor seperti piruvat atau posfoenolpiruvat