rš par monosahar citoplazm vielas un ener ē ī...
TRANSCRIPT
Vielas un ener
ăijas m
aiĦa
citoplazmā
11. tēma
•V
ielu un eneră
ijas maiĦ
aLizosom
asH
eterofāgijaA
utofāgija
Mikro
ėermenīši
Olbaltum
vielu imports peroksisom
āsV
akuolasP
roteosomas
RNāze
Glikol īze
● Š
ūnās gandr
īz visi vielu sintēzes un transporta
procesi notiek, izmantojot A
TF
vai GT
F ener
ăiju,
vai arī reducējot t
ādus koenzīm
us kā N
AD
H,
NA
DP
H vai F
AD
H2 . Lielāk
ā daĜa no š
ūnām
šos savienojum
us iegū
st, import
ējot kompleksas
organiskās vielas, t
ādas kā polisahar
īdi tauki vai olbaltum
vielas. Vien
īgais izĦēm
ums ir š
ūnas, kas
satur hlorofilu. Tās savuk
ārt izmanto gaism
as ener ă
iju, lai sintezētu š
ūnām
nepieciešamās
organiskās vielas.
● S
aliktus ogĜhidrātus, tādus k
ā cieti, pārvērš par m
onosaharīdiem,
olbaltumvielas p
ārvēršas am
inoskābēs,
bet lipīdi sadalās tauksk
ābēs un
glicerolā. Vielas sadala ar oksid
ēšanas un reduc
ēšanas reakciju palīdzību.
● Ėīm
isko reakciju, kurā zaudē
elektronus sauc par oksidāciju
, bet reakciju, kurā ieg
ūst elektronus - par reduc
ēšanu.
Dažādi katabolisko reakciju etapi notiek daž
ādos šū
nu nodalījum
os:
● O
rganellu jeb polimēru sadalīšana notiek
lizosomās, vakuol
ās un peroksisomās.
● C
itosolā esoš
ās olbaltumvielas no
ārda proteosom
ās. RN
S no
ārda nukleāzes kodol
ā, hloroplastos, m
itohondrijos un citosolā.
● G
likozes sadalīšanu veic citosol
ā izvietotie ferm
enti, noārdot to l
īdz piruv
ātam(pirov
īnogskābei).
●D
audzi starpprodukti, kas rodas olbaltumvielu,
nukleīnsk
ābju un lipīdu sadalīšanas procesos, ar
ī var iesaist
īties glikolīzē.
Lizosomas
Lizo
som
as žu
rku n
ieru
šūnās.
Lizosomas atklāja K
. De D
juvs un R.N
ovikoffs šī gadsim
ta 50-os gados. Atšėirīb
ā no citām
organellām, lizosom
as atklāja, izmantojot šūnu
saturu centrifugācijas un bioė
īmiskās analīzes
metodes. K
onstatēja, ka, mainot centrifug
ācijas ātrum
u, no mitohondriju frakcijas var izdal
ītnelielas organellas, kas saturēja hidrolāzes. Lizosom
as ir konstatētas lielākajā daĜā eikariotisko šūnu. Īpaši daudz tās ir tajās dzīvnieku šūn
ās, kas nodarbojas ar fagocitozi. A
ugu šūnās lizosom
as ir novērojamas
novecošanas laikā. Lizosomām
var būt Ĝoti
atšėirīga forma, izm
ēri un iekšējā struktūra. Lizosom
u izmēri parasti ir no 0,2 - 0,5 µµµ µm
. Lizosom
u galvenā funkcija ir veikt iekššūnas
sagremošanu.
Kām
ju o
lšūnas. Lizo
somas krāsotas ar sarkan
o LysoTra
cker Re
d D
ND
-99, (Molecular P
robes # L-7528). Mitohondriji k
rāsoti ar za Ĝi a
r MitoT
racker G
reen F
M (M
olecu
lar Pro
bes # M-7514).
Kodols - zils, ar H
oechst 33342 (Molecular P
robes # H
-1399). h
ttp://d
ep
t.ken
t.ed
u/p
roje
cts/cell/im
ag
es3
.htm
Filmā redzam
a endosomu pievienošanās lizosom
ām.
Izmantots him
ērisks proteīns no lizosomālā m
embrānas proteīna Lam
p1 un zaĜā fluorescentā prote
īna. Lizosomālie prote
īni Lamp 1 ir glikozilēti.
Tie ir nov
ērojami lizosom
ās un nobriedušās endosomās.A
KT
IVË
T :P
ried
e/g
rozs/1
kurs-sh
uu
na
/lekcija
s/filma
s/lizoso
ma
s.mo
v
http
://ww
w.fm
i.ch/g
rou
ps/ro
hre
r.j/mo
vies/kissa
nd
run
.mo
v
Prokariotu š
ūnās hidrolītisk
ā sistēma ir atšėirīga. Š
o sistēmu
veido daudzu jaudīgu hidrolītisko fermentu kom
plekss, kas darbojas periplazm
atiskaj ā telpā, t.i., ārpusšūnas vidē. Šāda
sistēma nodrošina prokariotisko šūnu plastisko un enerăētisko
mai Ħu. B
ez šīs ārpusšūnas sistēmas, baktēriju š
ūnas sieniĦās v ēl ir latentu (neaktīvu) hidrolāžu grupa, kura nodrošina baktēriju š
ūnas sieniĦas sadalīšanu baktēriju vairošanās
proces ā. Šāda veida hidrolāzes ir arī augu šūnu sieniĦās. T
ur latentās hidrolāzes aktivizē, m
ainot pH līm
eni šūnu sieniĦās.
Augu š ūn
ās lizosomu lom
u var spēlēt arī centrālā vakuola. T
omēr gad
ījumos, kad šūnas sadalās, var novērot ėerm
enīšus, kas atg ādina lizosom
as. Līdz ar to var redzēt, ka lizosomas ir
visvairāk raksturīgas dzīvnieku šūn
ām.
Lizosomu ferm
enti spēj sadalīt praktiski visus dabīgos organisko
vielu polimērus. Ir izdalītas vairāk nekā 60 lizosom
u hidrolāzes(prote
āzes, lipāzes u.c.). N
o citoplazmas šos aktīvos ferm
entus atdala lizosomas m
embrāna.
Mem
br ānu barjeras loma tiek papildin
āta ar dažādiem ferm
entuinaktiv
ācijas mehānism
iem. T
o sasniedz, piemēram, ar noteikta
pH l īm
eĦa uzturēšanu lizosomas iekšienē, kas neatbilst ferm
entudarb
ības optimum
am. A
pmēram
20% no hidrolāzēm
irinaktiv
ētas, izmantojot to saistību ar m
embrānu lip
īdiem.
Pārējā ferm
entu daĜa atrodas lizosomu m
atriksā, kuru veidom
ukopolisahar īdi, un tos inaktivē, piemēram
,glikozam
īnglikonāts. D
ažādo hidrolāžu daudzuma attiecība
lizosomā ir sugu un šūnu specifiska. H
idrolāžu sastāvs var patatšėirties vienas šūnas ietvaros. Lizosomām
piemīt spēja ātri
pāriet aktīvā stāvoklī. T
o nodrošina lizosomu m
embrānu
receptoru sistēma. H
idrolāzes aktivē, samazinot pH
.
Lizosomas - sarkanas (pH
5).E
ndosomas(lizosom
as) - zilasun za Ĝas (pH
6).M
olecular Biology of the C
ell by B
ruce Alberts, D
ennis Bray, Julian
Lew
is, Martin R
aff, Keith R
oberts,and Jam
es D. W
atson,G
arland Publishing, N
Y 1994.
http
://neu
roscie
nce
.med
.uc.e
du
/IMA
GE
S/D
ea
n_
grf.g
if
Lizosomu ferm
entus sintezē granulārais endoplazmatiskais
tīkls. Pēc tam
tie pārvietojas uz Goldži aparātu, kur notiek to
“procesings”. No G
oldži apar āta tiek eksportētas nelielas vezikulas, kuras sauc par prim
ārajām lizosom
ām. Tās dažkārt
veic iekšš ūnas gremošanas funkcijas vai eksportē sekretoros
produktus. Šāds ferm
entu eksports notiek, kad, piemēram,
kaulaudi nomaina skrim
šĜaudus. Analoăiska parād
ība arī ir, kad tiek no ārd
īti bojātie kaulaudi. Šāda veida lizosom
as ir rakstur īgas osteoklastu šūn
ām. Lizosom
as nodrošina trīs šūnas procesu - heterofāgijas, autofāgijas un autolīzes, norisi.
Heterofāgija
Heterofāgijas procesā endosom
as, t.i., vezikulas, kas satur no š ūnas ārpuses nākošās vielas, saplūst ar pirm
ējām lizosom
ām.
Šādas lizosom
as sauc par otrējām vai sekundārām
lizosomām
. O
tr ējās lizosomās aktivējas hidrolītiskie ferm
enti, un lizosom
u saturs tiek sadalīts. Dažiem
vienkāršākajiem
organismiem
, t ādiem kā am
ēbas, endocitoze ir galvenais vielu ieg ūšanas veids. C
itos gadījumos tas var izpildīt arī
aizsargfunkciju. Piemēram
, specializētie leikocīti satver un sagrem
o organismā nonākušās baktērijas. Mugurkaulniekiem
var izdal īt divu tipu elem
entus - mikrofāgus un m
akrofāgus. M
ikrofāgi satur lielu skaitu pirm
ējo lizosomu. P
erifērijā esoš ās lizosom
as spēj izkĜūt no šūnas kopā ar citoplazm
as fragm
entiem. Š
aj ā procesā piedalās aktīna-miozīna fibrill
ārā sistēm
a. Savukārt lizosom
as no šūnas centra uz perifēriju pārvieto m
ikrocaurulītes.
Makrofāgi
Makrofāgs-purpurkrāsas, baktērijas-zaĜas.
ww
w.b
eta
-glu
can
-13
d.co
m/
Heterofāgija un autofāgija
Makrofāgiem
neaktīvajā stāvoklī ir salīdzinoši neliels lizosomu
skaits. Ta ču, kad šūna tiek aktiv
ēta, tad Ĝoti strauji notiek lizosom
ālo olbaltumvielu sintēze, un palielinās lizosom
u skaits. H
idrol ītiskie fermenti aktiviz
ējas un atbrīvojas, līdz ar to sadalot ar ī pašu šūnu. T
ādējādi m
akrofāgu lizosomas ir
iesaist ītas adaptīvas imunitātes nodrošināšanā. O
trējo lizosomu
var saukt arī par gremošanas vakuolu. S
agremojam
os produktus uz Ħem
no citoplazmas, tomēr da
Ĝa no vielām paliek
nesadalītā veidā. Otrējo lizosom
u, kura satur lielu daudzumu
nesadal ītu vielu sauc par atlieku ėermenīti. A
tlieku ėermenīši
parasti tiek transport ēti plazmatisk
ās mem
brānas virzienā un to saturu izsviež no š ūnas. D
ažos šūnu tipos, piemēram
, aknās, šādi
atlieku ėermenīši var arī uzkrāties.
Autof
āgija
Par autofāgiju sauc procesu ar
kura palīdzību šūna sadala tai nevajadz īgās un bojātās struktūras. N
o sākuma šādu
strukt ūru ietver vienkārša
mem
br āna, kas atdalās no gludā endoplazm
atisk ā tīkla. Pēc tam
m
embrānu cisterna saplūst ar
pirmējo lizosom
u. Tā rezultātā veidojas otrējā lizosom
a vai autof āgiskā vakuola, kurā bojātās strukt ūras tiek sadalītas
Autofāgiskā vakuola ar m
itohondrijiem.
Šādā veidā šūn
ās nomainās novecojušie vai bojātie organoīdi,
mem
brānas, ribosomas, m
itohondriji u.c. Autofāgija šūn
ās ir tipiska par ād
ība, jo lielāko organoīdu, tādu kā m
itohondriji, dz īves laiks ir dažas dienas, bet olbaltum
vielas dzīves laiks ir dažas stundas vai vienu diennakti. A
utofāgiju visbiežāk var nov ērot šūn
ās, kurās noris reorganizācija, kas ir saistīta ar diferenci āciju vai arī p
ēc šūnu pakĜaušanas stresa apstākĜiem
.
Kreisajā pusē fibroblasta šūna, kas kultivēta vid
ē ar azitromicīnu
un rāda elektronblīvus ieslēgumus lizosom
as mem
brānas tuvumā.
Liel ākā palielin
ājumā pa labi var novērot, ka tie sastāv no
mem
brānām
.
Mikro
ėermenīši
Jau kopš sešdesmito gadu sākum
a ir pazīstamas nelielas ovālas
š ūnas organellas, kuras nosauca par mikroėerm
enīšiem. T
aču, atbilstoši to pam
atfunkcijai, tās tiek sauktas arī par peroksisom
ām. T
o lielums svārstās starp 0,3 - 2 µµµ µm
. Neskatoties
uz savu plašo izplat ību, mikro
ėermenīši ir sastopam
i tikai noteiktu veidu šūn
ās. Zīdītājiem
- aknās un nierēs, augos - lapās
un krājaudos. Mikro
ėermenīšus aptver viena m
embrāna, un
parasti tos piepilda sam ērā amorfs m
atrikss. Dažos šūnu tipos
mikro
ėermenīšu m
atriksā ir blīva kristāliska serde (kodols). E
ksist ē vairāki mikro
ėermenīšu tipi, un katrs no tiem
ir saistīts ar prim
itīvu m
etabolisko reakciju kopumu. V
ar izdalīt dzīvnieku peroksisom
as, augu lapu peroksisomas, glioks
isomas,
glikosomas un hidrogenosom
as.
Peroksisom
as.
Katalāzes kristāla uzbūve.
Peroksisom
a nieru š ūnās.
Tas ir visizplatītākais m
ikroėerm
enīšu tips. Nosaukum
s ir radies no ūdeĦraža peroksīda, kurš peroksisom
ās ir galvenais starpprodukts oksidatīvajā m
etabolismā.
ŪdeĦraža peroksīds rodas lielas ferm
entu grupas darbības rezult ātā. Š
os fermentus sauc par H
tipa oksidāzēm. T
ie ir vair āku flavoprote
īdu vai arī varu saturošu olbaltumvielu
kompleksi. T
ie izmanto m
olekulāro skābekli kā elektronu
akceptoru un to reduc ē līdz ūdeĦraža peroksīdam.
Šo reakciju elektronu donori var būt am
inoskābes, acilkoferm
ents A, tauku atvasin ājum
i, purīni un daži
og Ĝhidrātu metabolism
a starpprodukti, tādi kā pienskābe.
ŪdeĦraža peroksīds, kas ir radies peroksisomās, tālāk tiek
metabolizēts ar ferm
enta katalāzes starpniecību. Katalāze
reduc ē ūdeĦraža peroksīdu līdz ūdenim. P
ar elektronu donoru var izm
antot vairākas nelielas molekulas, tādas kā etanols,
metanols, skudrsk ābe. G
adījumos, kad trūkst šādu m
olekulu, par elektronu donoru kalpo pats ūdeĦraža peroksīds. Šī shēm
a ir ārk
ārtīgi vienkārša, salīdzinājum
ā ar mitohondriālo elpošanu.
Rezultāts abos gadījum
os ir vienāds - tiek oksidēti noteikti
produkti, kam seko sk ābekĜa un ūdens atjaunošana. T
aču, ja m
itohondrijos lielākā daĜa no atbrīvotās enerăijas tiek
izmantota A
TF
sint ēzei, tad peroksisomās tā izdalās kā siltums.
Peroksisom
as darbības shēma.
Tauksk
ābju oksidācija peroksisom
ās
Taukskābju oksid
ācija peroksisomās noris līdzīgi k
ā m
itohondrijos. Taču, atšėirīb
ā no mitohondrijiem
, aktīvāk noris tādu taukskābju oksid
ācija, kas ir garākas par 10 oglekĜa atom
iem. N
ereti saīsinātās taukskābes pēc tam
tiek transportētas uz m
itohondrijiem tālākai oksid
ēšanai.
Peroksisom
ās taukskābju oksidācija sākas ar taukskābju im
portu no citosola. T
ransport ējot taukskābi caur
mem
brānu, tai tiek pievienots acil-C
oA. P
irmaj ā reakcijā tauku
acil-CoA
oksid āze izmanto
skābekli kā elektronu akceptoru
un izveido enoil-CoA
. Savuk ārt
ūdeĦraža peroksīdu, kas veidojas reakcijā, sadala katalāze. V
isa br īvā enerăija šajā reakcijā atbr īvojas siltum
a veidā.
Tālākajos etapos daĜa no brīvās
ener ăijas tiek uzkrāta reducētajā N
AD
H, kas bieži tiek transportēts uz
mitohondrijiem
un izmantots A
TF
sint ēzei. O
ksidācijas gala produkts ir tauku acil-C
oA, kas ir saīsināts par
diviem oglek Ĝa atom
iem. T
aukskābes oksid ācija var atk
ārtoties līdz tā ir pārvērsta par acetil-C
oA. Ja
oksid ējamai tauksk
ābei bija nepāra skaits oglek Ĝa atom
u, tad izveidojas savienojum
s, kas satur 5 oglekĜa atom
us - acetil-CoA
, kam pievienota
3 C atom
us saturoša propionil grupa.
Dzīvnieku peroksisom
asM
ugrkaulnieku peroksisomām
parasti ir mazāks ferm
entu skaits, piem
ēram, ir izzudis glioksilāta cikls. T
ās izpilda svarīgas funkcijas: 1) peroksisom
as ir iesaistītas dažos lipīdu metabolism
a ce Ĝos (holesterīna veidošanā); 2) piedalās am
inoskābju sadalīšanā, tai skait ā var sadalīt arī D
aminoskābes, kas ir raksturīgas
baktērijām; 3) piedalās purīnu katabolism
ā; 4)alkohola m
etabolismā aknu šūn
ās.P
eroksisomas nenodrošina š ūnas ar enerăiju, bet siltum
am, kas
izdalās, var būt liela fizioloăiska nozīm
e. Uzskata, ka brūnie
taukaudi, kuri pal īdz norvēău žurkām
pārciest ziem
as aukstumu,
savu termostabilit āti nodrošina, izm
antojot peroksisomas.
Peroksisom
ām ir b
ūtiska loma, realizējot noteiktu fosfolip
īdu sintēzi. P
eroksisomu trūkum
u nierēs un aknās sauc par Celvēgera
slimību. Jaundzim
ušie ar šo ăenētisko slimību dzīvo tikai dažus
mēnešus. Z
emākajiem dzīvniekiem
un vienšūĦiem
peroksisomas ir
v ēl daudzveidīgākas un nozīmīgākas.
Augu peroksisom
as
Augos m
ikroėerm
enīši specializējas dažādās m
etaboliskās funkcijās. G
lioksisomas ir specializētas peroksisom
as, kuras atrodas kr ājaudos un satur taukskābju βββ β-oksidācijas un glioksilāta cikla enzīm
us, lai pārvērstu sēklu rezerves lipīdus
cukuros. Lapu peroksisomas ir specializ ētas peroksisom
as, kuras atrodas fotosintez ējošos audos un piedalās fotorespirācijas reakcijās, to diam
etrs ir 2 - 5 µµµ µm. Tās ir
pildītas ar rupju, granulāru m
atriksu, citas satur nelielus iesl ēgum
us. A
bi peroksisomu veidi var pāriet viens otrā, t.i.,
peroksisomas var p ārv
ērsties par glioksisomām
un otrādi.
Lapu peroksisomas
Glikolāta oksidācija peroksisom
ās.
Fotosintēzes procesā ribulozes 1,5-bifosfāts var pievienot arī
sk ābekli. Tad hloroplastos izveidojas fosfoglikolāta m
olekulas. S
tromas enzīm
i to defosforilē un pārvērš par glikolātu.
Glikol āts tiek transportēts ārā no hloroplastiem
. Tas iekĜūst
peroksisomās un tur to pārv
ērš par glioksilātu. Glioksilātu
tālāk var pārvērst par am
inoskābi glicīnu, kuru tālāk
transport ē uz mitohondrijiem
un pārvērš par serīnu. Š
ajā proces ā izdalās C
O2. D
ažos augos fotorespirācijā aiziet pat 50%
no gaismas enerăijas.
Glioksisom
asG
lioksisomas satur oksidatīvos
fermentus, līdzīgi k
ā pārējās
peroksisomas. T
aču tajās atrodas ar ī glioksila cikla (K
rebsa cikla variants) ferm
enti. To uzdevum
s ir pārvērst taukus par ogĜhidrātiem
. S
ukcin ātu tālāk var pārvērst par
glikozi vai transportēt uz m
itohondrijiem, kur to izm
anto K
rebsa ciklā. Augiem
šis process palīdz sēklu d
īgšanas laikā ar ener ăiju bag
ātos taukus pārvērst
ogĜhidrātos un tālāk mitohondrijos
ieg ūt AT
F enerăiju. G
lioksilāta cikls ir sastopam
s ar ī zemākajiem
dz īvniekiem
.
Hidrogenosom
asD
aži organismi par elektronu akceptoru izm
anto protonu.2e +
2H+ →→→ →
H2
Tas ir neizdevīgs akceptors. Šāds veids eksistē nelielai
obligātu anaerobu organism
u grupai - klostrīdijām, kuras
sintezē ūdeĦradi. Starp šiem
organismiem
ir arī patogēni organism
i, kuri izsauc gāzes gangrēnu. ŪdeĦradi ražo arī
neliela dzīvnieku grupa - trihomonādes, kuras parazitē
dzīvnieku dzimum
ceĜos. Šie parazīti sp
ēj eksistēt gan skābekĜa klātb
ūtnē, gan bez tā. A
naerobos apstākĜos tie
apmierina savas enerăētisk
ās vajadzības ar specifisku reakciju palīdzību, kur pirov
īnogskābe oksidējas līdz etiėskābei un C
O2 , bet atbrīvotie elektroni saistās ar
ūdeĦradi. Aerobos apstāk
Ĝos trihomonādes pārstāj ražot
ūdeĦradi un pāriet uz prim
itīvu skābekĜa atkarīgu
metabolism
u. Prim
itīvu, jo šiem organism
iem nav
mitohondriju. T
rihomonādu m
ikroėerm
enīšus sauc par hidrogenosom
ām, t.i., tās satur visu ferm
entu sistēmu, kuri
nodrošina pirovīnogskābes sašėelšanu, kurā veidojas m
olekulārais ūdeĦradis.Līdzīgi darbojas arī sēĦu hidrogenosom
as.
Peroksisom
u veidošanās un
olbaltumvielu im
ports
Peroksisom
as šūnā dalās.
Izveidojas organellas (peroksisomas priekšteči) ar diam
etru 0,1 µµµ µm
. Tās aug un no citoplazm
as uzĦem olbaltum
vielas.P
eroksisomu olbaltum
vielas sintez ē citoplazmas ribosomās.
Mem
br ānai nepieciešamos lipīdus peroksisom
as saĦem no
endoplazmatiskā tīkla m
embrān
ām.
Olbaltum
vielu imports peroksisom
ās
Konstatēts, ka peroksisom
u matriksa olbaltum
vielām ir divas
aminoskābju sign
ālsekvences, kas nodrošina to nokĜūšanu organell ā. P
irmā sekvence atrodas m
olekulas karboksilterm
inālajā galā. Šī sekvence saglabājas arī p
ēc olbaltum
vielas importa peroksisom
ā. Sekvenci veido S
er-Lys-Leu. T
a ču daudzos gadījumos šajā sekvencē vienas
aminosk ābes var būt aizvietotas ar citām
. Piemēram
, raugiem
(Saccharomyces cerevisiae) katalāzei signālsekvenci
veido Ser-Lys-P
he. Otr ā signālsekvence atrodas m
olekulas am
inoterminālajā daĜā. T
o veido 26 - 30 aminoskābes. D
rīz pēc m
olekulas nonākšanas peroksisomu m
atriksā, šo sign ālsekvenci atdala no m
olekulas. Signālsekvences sākum
u veido (A
rg/Lys) un (Leu/Ile), bet beigu da Ĝu (His/G
ln-Leu).
Olbaltum
vielu imports peroksisom
ās
Olbaltum
vielas var iekĜūt peroksisomās trijos veidos:
• Pirm
aj ā gadījumā olbaltum
vielas monom
ēri saistās ar peroksisom
as mem
brānas receptoru. Tad tie caur
translokatoru nokĜūst m
atriksā, kur notiek m
onomēru
apvienošanās.• O
traj ā gadījumā, izm
antojot receptorus un translokatorus, peroksisom
ās nokĜūst olbaltumvielu kom
pleksi.
Olbaltum
vielu monom
ēru iek Ĝūšana peroksisomās.
Olbaltum
vielu kompleksu
iekĜūšana peroksisomās.
http
://ww
w.p
ero
xisom
e.o
rg/S
cien
tist/Bio
gen
esis/m
atrixim
po
rt.htm
l
Peroksisom
u bioă
enēze
ET
un peroksisomu bioăenēze
Vakuolas
Dzīvnieku šūn
ās ir samērā sīkas vakuolas - fagocitārās,
gremošanas un autof āgiskās vakuolas. Š
ajos gadījumos būtu
pareiz āk lietot terminu lizosom
as. Augu un sēĦu šūn
ās var būt daž āds vakuolu skaits un lielum
s. To kopējais tilpum
s var būt
starp 20 un 90% no šūnas tilpum
a. Augu šūn
ās, it īpaši parenh īm
ā un kolenhīmā, var redzēt, ka šūn
ās ir viena liela centr ālā vakuola. V
akuola ir ar šūnsulu pildīta un vienkāršu
mem
brānu pārklāta cisterna. V
akuolu ietverošo mem
brānu sauc par tonoplastu. Š ūnsula ir koncentrēts šė
īdums, kas satur
miner ālsāĜus, cukurus, organiskās skābes, O
2 , CO
2 , pigmentus
un daudzveidīgus otreizējā metabolism
a starpproduktus un atkritum
produktus. Bieži var konstat ēt, ka vienas šūnas
ietvaros vakuol ām var b
ūt dažādas funkcijas.
Vakuolu veidi
Kontraktil
ās vakuolas Paramecium
šūnās.
Augu vakuolas.
Vakuolas augu š
ūna
Vakuolu subpopulācijas A
rab
ido
bsis th
alia
na ep
idermas šūn
ās. A
tškiras to pH u
n, iespējams, fun
kcijas.h
ttp://w
ww
.bro
okes.ac.u
k/scho
ols/b
ms/research
/mo
lcell/haw
es/gfp
mo
viep
age.h
tml
Vakuolas raugu š
ūnās
ww
w.g
rc.uri.e
du
/pro
gra
ms/ 2
00
3/a
uto
.htm
1. attēls
2. attēls•1
.attēls. Pero
ksisom
u sad
alīšan
a raug
u šūn
as Pich
ia p
asto
ris vakuo
lās. Pero
ksiom
a-zila, vaku
ola-sarkan
a.•2
. Attēls. A
uto
fago
som
as raug
u
Sa
ccha
rom
yces ce
revisia
e vaku
olās slāp
ekĜa bad
a ietekm
ē.
Vakuolu funkcijas
Vakuolām
organismā var izdalīt piecas funkciju grupas:
Vakuolas rada š ūnas turgora spiedienu un nodrošina šūnas ūdens
rež īmu. Ū
dens iekĜūst vakuolā caur daĜēji caurlaidīgo tonoplastu
osmozes ceĜā. T
ā rezultātā palielinas vakuolas tilpums, šūn
ā rodas turgora spiediens, un citoplazm
a piespiež plazmatisko m
embr ānu
pie šūnas sieniĦas. Daži autori uzskata, ka augu šūnu stiepšanos
vair āk nodrošina osmotiska ūdens uzĦem
šana, nevis citoskeleta darb
ība.
Vakuolām
piemīt lītisk
ā funkcija. Tas ir tād
ēĜ, ka vakuolas satur hidrol ītiskos ferm
entus, kuri ir līdzīgi lizosomu
fermentiem
. Līdz ar to vakuolas var darboties analoăiski
dzīvnieku lizosomām
. Šūnai novecojot, tonoplasts pamazām
zaud ē savas puscaurlaidīgās īpašības, un ferm
enti, kuri izkĜūst no vakuolas, stim
ulē šūnas autolīzi.
AugĜos un novecojošos vai specializētos audos vakuolām
var b
ūt galaproduktu uzkrāšanas funkcija. Vakuolās
uzkr ājas nevajadzīgās vielas un otreizējie metabolism
a produkti. P
iemēram
, kalcija oksalāta kristāli. Daži no šiem
produktiem
izpilda organisma aizsargfunkciju, atbaidot
z ālēdājus. V
akuolās baltas emulsijas veidā var uzkrāties
arī latekss (augu piensula). Tas ir raksturīgi pienenēm
, kau
čukkokiem un daudziem
citiem augiem
.
Gandrīz visu šūnu tipu vakuolās notiek barības vielu
uzkrāšana. Daži no citoplazm
as produktiem var būt uz
laiku noglabāti vakuolās un vēlāk savukārt var atkal
ieslēgties citoplazmas m
etabolismā. Pie šād
ām vielām
pieder saharoze, m
iner ālsāĜi inulīns, aminoskābes u.c.
vielas.V
akuolas š ūnsula augĜos un ziedos var saturēt daudzus pigm
entus, tādus kā antociānus, kuriem ir sarkana, zila
vai purpursarkana krāsa, un radniecīgus savienojum
us ar dzeltenu vai krēm
krāsu. Šie savienojum
i lielā mērā
nosaka ziedu, lapu un aug Ĝu krāsu, kas kalpo augu apputeksn ēšanai un sēklu izplatīšanai.
Vielu apm
aiĦ
a starp vakuolu un citoplazm
u
Šūnās notiek ātra un efektīva vielu apm
aiĦa starp citoplazmu un
vakuolu. Vakuol ā vielas var iekĜūt un izkĜūt, izm
antojot tonoplasta puscaurlaidīg
ās īpašības, aktīvā vielu transporta m
ehānismus vai
eksocitozi. Vakuol ās var transportēt protonus, neorganisko vielu
jonus, cukurus, organisk ās skābes un aminoskābes. Šūnu sadalīšanās
produkti vakuol ās var iekĜūt eksocitozes ceĜā. Protonu pārnešanu
vakuolā nodrošina ar H + pārnešanu saistītā A
TFāze, kas atšėiras no
hloroplastu un mitohondriju iekš ējā m
embranā esošajām
, kā arī plazm
atiskajā mem
brānā esošajām
AT
Fāzēm
. Līdzīgi citām
A
TFāzēm
, tā darbojas kā protonu pumpis, radot transm
embrānas
potenciālu. Līdz ar to vakuolas iekšiene ir sk
ābāka un pozitīvi lād
ēta. G
radients kalpo k ā dzinējspēks, lai transportētu metabolītus vakuolās.
Gadījum
os, kad augi uzĦem palielinātus sāĜu daudzum
us, vakuol ās palielinās sāĜu koncentrācija. N
eorganisko vielu transports caur tonoplastu nosaka šūnu turgoscentās īpašības. T
omēr, neskatoties uz šī procesa lielo nozīm
i, vielu transporta m
ehānismi vēl ir neskaidri. V
akuolās pret koncentrācijas gradientu var transport ēt k
ālija, sulfāta, hlorīda, kalcija un nitr
āta jonus. Kalcija jonu uzkrāšana vakuolās ir viens no
meh ānism
iem, lai sam
azinātu brīvā kalcija daudzumu
citoplazmā. V
airumā gadījum
u šo jonu pārnešanu nodrošina ar H
+ pārnešanu saistītā A
TFāze.
Proteosom
as
●A
- negatīvi iekr āsoti proteosom
u kom
pleksi.
●B
- proteosom
as uzb
ūves 3D
m
odelis.
● Lielāko da
Ĝu no olbaltumviel
ām sadala
citoplazmā izvietotos olbaltum
vielu kompleksos -
proteosomās.
● P
roteosomu diam
etrs ir 25 nm un t
ās ir veidotas no vair
ākām
proteāzēm
. Proteosom
u viena puse ir sp
ējīga pievienot kĜū
dainas uzb
ūves olbaltum
vielas, savukārt otra puse
nodrošina bojāto olbaltum
vielu peptīdu saišu
pārraušanu. P
roteosomas pievienojas pie
olbaltumviel
ām, kur
ām ir pievienota neliela
olbaltumviela - ubikvit
īns.
● P
roteosomas pievienojas pie
olbaltumviel
ām, kur
ām ir pievienota neliela
olbaltumviela - ubikvit
īns. Pēc tam
olbaltum
viela tiek pakāpeniski p
ārvietota uz proteosom
as centrālo da
Ĝu, kurā prote
āzes veic pept īdsaišu p
ārraušanu. P
arasti ubikvitīns
kovolenti saistās ar olbaltum
vielām
, kurām
nav tipisk
ās molekulas tr
īsdimension
ālās strukt
ūras.
● P
ievienošanu nodrošina ubikvitīna
konjugēšanas enz
īmi, kuriem
ir atpazīšanas
subvienība. T
ie spēj saist
īties ar denaturētām
, kĜū
daini sakārtot
ām, oksid
ētām vai ar
ī neatbilstošas am
inoskābes saturoš
ām
olbaltumvielu m
olekulām
. Pirm
ajā etapā
ubikvitīna konjug
ēšanas enzīm
i pārbauda
olbaltumvielu un saist
ās ar to.●
Otrajā etap
ā pie molekulas pak
āpeniski tiek pievienotas ubikvit
īna molekulas. M
olekulu pievienošanai tiek izm
antota eneră
ija, ko dod A
TF
hidrolizēšana par A
MF
. Ubikvit
īna molekulas
pievieno pie olbaltumvielas s
ānu ėēdes am
ino grupas. T
rešajā etap
ā komplekss pie-vienojas
pie proteosomas. P
roteosoma atdala no
kompleksa ubikvit
īnu, bet olbaltumvielu sadala
nelielos peptīdos.
RNāze
● R
Nāzes ir
sastopamas kodol
ā, m
itohondrijos, hloroplastos, citosol
ā, lizosom
ās. Viena no
vislabāk izp
ētītajām
RNāzēm
ir ribonukleāze
A. T
as ir neliels 13,7 kD
liels enzīm
s. To sekret
ē aizku
Ħă
a dziedzeris. R
ibonukleāze A
katalizē
fosfodiestera saišu hidrol
īzi RN
S
molekul
ās.
● R
eakcija sākas ar
RN
S piesaistīšanu
katal ītiskajai RNāzes
daĜai. T
ad ribonukle
āzes A
aminosk
ābes piesaista protonu no R
NS
ribozes m
olekulas. Tad tiek
pārrauta saite starp
ribozes molekulas 5’
vietā novietoto fosforu un sk
ābekli.
Glikolīze
●V
isos prokariotu un eikariotu šū
nu tipos AT
F
enerăijas ieg
ūšanai izm
anto glikozi. Procesu,
kurā sadala glikozes m
olekulas, sauc par glikol
īzi. Glikol
īzes procesā tiek veiktas 9 sec
īgas ferm
entatīvas reakcijas. P
rocesa summ
āra form
ula ir sekojoša:●
glikoze + 2AD
F + F
n 2piruvāts + 2N
AD
H
+ 2AT
F●
Fn - neorganiskais fosfāts
●G
likolīzes gaitā katras molekulas sadal
īšanai sākotn
ēji hidrolizē 2 A
TF
molekulas. V
ēlāk glikol
īzes gaitā tiek reducētas 2 N
AD
+ molekulas
un izveidotas 4 AT
F m
olekulas.
Anim
ācija:h
ttp://w
ww
.no
rthla
nd
.cc.mn
.us/b
iolo
gy/B
iolo
gy1
11
1/a
nim
atio
ns/g
lycolysis
.htm
lA
KT
IVË
T :P
ried
e/g
rozs/1
kurs-sh
uu
na
/lekcija
s/filma
s/glyco
lysis.htm
l
● G
likolīze sākas ar A
TF
molekulas
sadalīšanu un fosfāta grupas
pievienošanu glikozes molekulai, veidojot
glikozes 6-fosfātu. G
likoze pati ir samērā
neaktīva, tāpēc šajā proces
ā iesaistās
ferments -
heksokināze. H
eksokināzes
aktivitāti regul
ē reakcijas produkta, glikozes 6-fosf
āta, koncentrācija š
ūnā. Ja
ir kavēti tālākie glikol
īzes etapi, palielinās
glikozes 6-fosfāta koncentr
ācija un tas inhib
ē heksokināzes aktivit
āti.
● G
likozes 6-fosfāts sam
ērā viegli iesaist
ās nākam
ajā reakcijā, kur
ā tiek main
īta m
olekulas struktū
ra, veidojot fruktozes 6-fosf
ātu.
Līdzīgi fosfofruktokin
āzes aktivitāti regulē arī citrāta, NA
DH
uncitu oksidat īvā m
etabolisma starpproduktu daudzum
s citoplazmā.S
avuk ārt šī ferm
enta aktivitāti palielina augsta AD
F koncentrācija.
Abās reizēs A
TF
hidrolīzē atbrīvotā enerăija tiek uzkrāta cukura
molekul ā. L
īdz ar to tā ir ėīm
iski tik aktīva, ka tālākās reakcijas
varētu norisināties bez ferm
entu klātbūtnes.
Nākam
ajā etapā hidrolizē vēl vienu A
TF
molekulu un pievieno fosfāta grupu
fruktozes 6-fosf ātam, izveidojot fruktozes
1,6-difosf ātu. To veic fosfofruktokin
āze.Š
o fermentu regul ē A
TF
koncentrācija šūnā. Ja palielinās A
TF
koncentrācija, tad ferm
enta darb ība tiek inhibēta. T
asnoved pie t ālāko glikolīzes reakciju apstāšanās un sam
azina substrātu A
TF
sint ēzei mitohondrijos.
Nākam
ajā rekcijā fruktozes 1,6-bifosfātu sadala divās daž ād
ās molekulās: gliceraldehīda 3-fosfātā un
dihidroksiacetona fosf ātā. Katra no tām
satur 3 oglekĜa atom
us. Triozofosf
āta izomerāze p
ārvērš dihidroksiacetona
fosfātu par gliceraldehīda 3-fosfātu.
Gliceraldeh
īda 3-fosfāta dehidrogen
āze pārveido gliceraldehīda 3-
fosfātu par 1,3-difosfoglicerātu. Š
ajā reakcijā daĜa no gliceraldehīda 3-fosfāta m
olekulas enerăijas tiek izmantota, lai
pievienotu no citoplazmas neorganisk
ā fosfāta grupu, atbrīvotu 2elektronus un 2 ūdeĦraža jonus. V
iens no H + joniem nokĜūst
citoplazmā, bet otrs tiek izm
antots NA
D + reducēšanai par NA
DH
.
● N
o 1,3-difosfoglicerāta atdala vienu fosf
āta grupu, un izveidojas 3-fosfoglicer
āts. Brīvā
ener ăija tiek izm
antota, lai šo fosfāta grupu
pievienotu AD
F m
olekulai, veidojot vienu AT
F
molekulu.
Fosfoglicerom
utāze maina fosfāta
grupas novietojumu m
olekulā, unizveidojas 2-fosfoglicer āts. N
o tātiek atšėelta viena ūdens m
olekula,veidojot fosfenilpiruv
ātu. Pēdējā
reakcijā piruvāta kin
āze nofosfenilpiruv
āta atdala fosfātagrupu, kuru pievieno A
DF
molekulai. P
iruvāta kin
āzesdarb
ību inhibē paaugstināta
AT
F koncentrācija. S
avukārtfosfenilpiruv
āts inhibē
fosfofruktokināzes darbību.
●G
likolīzes gaitā katras molekulas sadal
īšanai hidroliz
ē 2 AT
F m
olekulas. Vēlāk glikol
īzes gaitā tiek reduc
ētas 2 NA
D+ m
olekulas un izveidotas 4 A
TF
molekulas.