replikasi dna pokok bahasan - from ordinary people · pdf file•replikasi adalah...
TRANSCRIPT
![Page 1: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/1.jpg)
REPLIKASI DNA
![Page 2: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/2.jpg)
• REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya
• Pada tingkat molekul kimia hanya DNA yang dapat melakukan replikasi (dengan pengecualian RNA genom virus)
![Page 3: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/3.jpg)
REPLIKASI DNA & REPRODUKSI SEL
Replikasi DNA akan dilakukan sebelum sel membelah diri
MitosisG1 11j
S 6jG24j
M 1j
Replikasi DNA
![Page 4: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/4.jpg)
MODEL REPLIKASI DNA• A. Pola Semikonservatif
Pada setiap pembentukan heliks ganda DNA hanya satu utas yang dibentuk baru sedangkan yang lain berasal dari utas lama
• B. Terdapat Titik Asal Replikasi (Ori)Hanya DNA yang mempunyai titik Ori yang dapat bereplikasi
• C. Sintesis DNA bergerak Dwiarah atauUniarah dengan pertumbuhan 5-3
• DNA akan disintesis mulai dari titik Ori ke dua arah
• Nukleotida baru ditambahkan pada ujung 3’OH
• D. Replikasi Berjalan secara bertahap (fragmen Okazaki)
![Page 5: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/5.jpg)
MODEL REPLIKASI DNA SEMIKONSERVATIF
Lama
BaruLama
Lama
Baru Lama
Konservatif
Semikonservatif
Disversif
![Page 6: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/6.jpg)
BUKTI POLA SEMIKONSERVATIFMatthew Meselson and Franklin Stahl
Generasi00.3
0.71.01.11.51.92.53.04.10+1.90+4.1
Generasi-015N
Generasi-114N-15N
14N-15N 14N 14N 14N-15NGenerasi-2
![Page 7: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/7.jpg)
REPLIKASI DNA DIMULAI PADA TITIK ORI
• Hanya DNA yang mempunyai titik Ori yang dapat bereplikasi
• Titik Ori adalah runtunan basa yang menjadi tanda (signal) bagi Polimerase DNA untuk memulai replikasi
• Pada E. coli ada satu protein (DnaA) yang berfungsi mengenali titik Ori pada proses replikasi
• DNA dari spesies asing dapat bereplikasi pada suatu sel spesies yang lain hanya bila Polimerase DNA dari sel tersebut dapat mengenali Ori dari DNA spesies asing
• Jumlah Ori dalam suatu DNA beragam– Kromosom bakteri : 1 (satu)– Kromosom eukariot : banyak– Plasmid F : Ori-T dan Ori-V
![Page 8: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/8.jpg)
TITIK ORI PADA PROSES REPLIKASI
Autoradiografi
Eukariot
Ori
Bakteri
![Page 9: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/9.jpg)
Contoh ORI beberapa organisme
![Page 10: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/10.jpg)
PROSES REPLIKASI DNA serta Protein dan Enzim yang terlibat
1. Pengudaran Heliks Ganda
– Helikase : Berfungsi mengudar heliks ganda– Girase : Menghilangkan tegangan pada pangkal
percabangan replikasi– Protein SSB : Mencegah utas tunggal bergabung
membentuk kembali heliks ganda2. Sintesis Utas Baru
– Polimerase RNA : Sintesis RNA primer– Polimerase DNA III : Sintesis perpanjangan utasDNA
baru– Polimerase DNA I : Pengisian celah antara dua
fragmen Okazaki dan membuang RNA primer– Ligase : menyambung dua fragmen Okazaki
![Page 11: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/11.jpg)
Protein dan Enzim dalam Replikasi E. coli
P r o t e i n / E n z i m L o k u s F u n g s i
D n a A d n a A M e n g e n a l i t i t i k O r i
G i r a s e g y r A , g y r B M e n g u d a r s u p e r h e l i k s
H e l i k a s eR e p , D n a B , H e l i k a s e I , I I , I I I
r e p , d n a B ,t r a I , u v r D
M e n g u d a r p i l i n a n h e l i k sg a n d a
P r o t e i n S S B s s b M e n s t a b i l k a n u t a st u n g g a l
P o l i m e r a s e R N AP r i m a s e
r p od n a G
S i n t e s i s R N A p r i m e r
P r o t e i n I , n ’ , n ” ,D n a B , D n a C d n a B , d n a C
P e n y u s u n P r i m o s o m
P o l i m e r a s e D N A I I Iα , θ , τε , β , γ , δ d n a E ( P o l C ) ,
d n a N , d n a Z ,d n a X
S i n t e s i s p e r p a n j a n g a nD N A
P o l i m e r a s e D N A I P o l A P e n g i s i a n c e l a h a n t a r ad u a f r a g m e n O k a z a k i
L i g a s e l i g M e n y a m b u n g d u af r a g m e n O k a z a k i
![Page 12: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/12.jpg)
Helikase
Enzim dalam Replikasi
![Page 13: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/13.jpg)
5 3
53 5
5 3
53
5 3
53
53
53
5 3
533 5 3
Utas leading: sintesis berjalan kontinu
Utas lagging: sintesis berjalan
bertahapFragmen Okazaki
Replikasi Berjalan
secara bertahap
![Page 14: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/14.jpg)
Tahapan Kerja Enzim Replikasi
![Page 15: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/15.jpg)
MEKANISME REPLIKASI BERBAGAI JENIS DNA
1. Kromosm Eukariot : Terbentuk percabangan replikasi, dimulai dari banyak titik Ori berjalan dwiarah
2. Model θ pada kromosom bakteri sirkular: Terbentuk percabangan replikasi, mulai dari satu titik Ori berjalan dwiarah atau uniarah
3. Model σ pada plasmid atau virus sirkular: Tidak terbentuk percabangan replikasi, mulai dari satu titik berjalan uniarah
4. DNA mitokondria: Setiap utasan DNA mempunyai satu titik Ori, dari masing-masing Ori dimulai sintesis utas baru berjalan uniarah
![Page 16: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/16.jpg)
MODEL REPLIKASI KROMOSOM BAKTERI Ori-tunggal, Dwiarah atau Uni-arah
Ori Ori OriOri
Ori
Ori
Ori
OriOri Ori
Ori
Ori
Dwiarah
Uniarah
![Page 17: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/17.jpg)
MODEL REPLIKASI KROMOSOM EUKARIOT (Dwiarah, Ori-ganda)
![Page 18: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/18.jpg)
SISTEM KOREKSI DALAM REPLIKASI DNA
1. Sistem pembacaan ulang oleh Polimerase DNA, saat replikasi– Polimerase DNA (Bakteri) mempunyai kemampuan
aktivitas eksonuklease 3-5 yang berfungsi membuang nukleotida yang salah pada saat replikasi.
2. Sistem koreksi pasca replikasi.– Setelah replikasi selesai terdapat protein/enzim yang
dapat mengenali pasangan basa DNA yang tidak serasi. Basa yang tidak tepat akan diganti dengan yang seharusnya
![Page 19: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/19.jpg)
STRUKTUR POLIMERASE DNAMenjamin ketepatan yang tinggi dalam Replikasi
![Page 20: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/20.jpg)
REPLIKASI RNA GENOM VIRUSA. Replikasi RNA berlangsung dalam perbanyakan virus
RNAB. Replikasi RNA mengikuti Model KonservatifC. Virus RNA utas tunggal (ut) (-) akan membentuk RNA
utas (+) sebagai model cetakan replikasiD. Virus RNA ut (+) akan membentuk utas (-) sebagai
model cetakanE. Virus RNA utas ganda akan membentuk utas (+) sebagai
model cetakanF. Replikasi RNA disentesis oleh enzim ReplikaseG. Replikase virus Qβ mengandung empat polipeptida, dan
hanya satu yang berasal dari virus (bagian dari virion), yang lainnya dari inang
![Page 21: REPLIKASI DNA Pokok Bahasan - from ordinary people · PDF file•REPLIKASI adalah perbanyakan diri menghasilkan produk baru yang menghasilkan dirinya • Pada tingkat molekul kimia](https://reader035.vdocuments.site/reader035/viewer/2022081722/5a91458c7f8b9af27f8e3e2e/html5/thumbnails/21.jpg)
REPLIKASI RNA Contoh Utas +
(+)
(+)(-)
(-)
(+)(+)
(+)(+)
(+)(+)(+)
RNAVirion
Bentuk Replikatif
RNA turunan