recipienten mikrobiologi - cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/vm... ·...
TRANSCRIPT
![Page 1: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/1.jpg)
RECIPIENTENMIKROBIOLOGI
INDIKATORORGANISMER
PATOGENA BAKTERIER
![Page 2: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/2.jpg)
Förhållandena i en näringsfattig sjö
Koldioxid + vatten + solljus Organiskt material och syre
Inga näringsämnen = ingen tillväxt
![Page 3: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/3.jpg)
Om näringsämnen tillförs
Näringsämnen
Assimilation och Fotosyntes
Koldioxid + vatten + näringsämnen + solljus Organiskt material och syre
![Page 4: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/4.jpg)
Källor till näringsämnen
Läckage från jordbruk
Avloppsreningsverk
Enskilda avlopp
Atmosfäriskt nedfall med ursprung
i förbränning av bränslen.
![Page 5: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/5.jpg)
Om näringsämnen tillförsNäringsämnen
Assimilation och Fotosyntes
Döda alger faller till botten
Organiskt material + syre koldioxid + vatten + närsalter
Syre förbrukas nära botten vilket kan leda till syrebrist och att svavelväte produceras så att bottenlevande organismer dör.
![Page 6: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/6.jpg)
Om näringsämnen tillförsNäringsämnen
Assimilation och Fotosyntes
Syrefria bottnar leder till att näringsämnet fosfor frisätts ur bottensedimentÄven ammonium frisätts från sediment när organiskt material bryts ned
Fosforn och kvävet tillförs ytvattnet under vår och höst när språngskiktet upplöses
![Page 7: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/7.jpg)
Språngskikt
Varmt vatten
Sommar situation när solen värmer ytvattnet
Kallt vatten
Stabil skiktning bottenvattnet stannar vid botten
![Page 8: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/8.jpg)
Språngskikt
Kallt vatten
Höstsituation när ytvattnet kyls
Kallt vatten
Språngskiktet upplöses och omblandning kan ske
![Page 9: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/9.jpg)
Språngskikt
Kallare vatten
Vintersituation när ytvattnet kyls ytterligare
Varmare vatten
Stabil skiktning bottenvattnet stannar vid bottenVid syrefria förhållanden avges fosfor från botten
sediment
![Page 10: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/10.jpg)
Språngskikt
Varmare vatten
Vårsituation när ytvattnet värms
Varmare vatten
Språngskiktet upplöses och omblandning kan skeFosforhaltigt vatten tillförs ytvattnet.
![Page 11: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/11.jpg)
Om näringsämnen tillförsNäringsämnen
Assimilation och Fotosyntes
Syrefria bottnar leder till att fosfor frisätts ur bottensedimentÄven ammonium frisätts från sediment när organiskt materialbryts ned
Fosforn och kvävet tillförs ytvattnet under vår och höst när språngskiktet upplöses
Detta resulterar i tillväxt, sk algblommning, varvid ammonium och fosfor tas upp ur vattnet
![Page 12: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/12.jpg)
![Page 13: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/13.jpg)
Om näringsämnen tillförsNäringsämnen
Assimilation och FotosyntesTillväxt av kvävefixerande cyanobakterier
När kväve tar slut:
Eftersom höga halter fosfor finns i ytvattnet får kvävefixerande bakterier konkurensfördelar jämfört med alger som behöver kväve från vattnet.
Tillväxten ger minskat sikdjup och därmed mindre vattenvolym som innehåller syre i vilket djur (syre) och växter (ljus) kan leva.
Luftkväve
![Page 14: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/14.jpg)
![Page 15: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/15.jpg)
![Page 16: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/16.jpg)
Tillväxtbegränsande ämnen
Eftersom kväve och fosfor är så viktiga (essentiella näringsämnen) talar man om kväve- respektive fosforbegränsning i sjöar och hav. Näringsämnesbegränsning betyder att om det finns lite eller inget alls kvar av dessa ämnen i vattnet i en för växterna/algerna tillgänglig form så omöjliggörs vidare tillväxt för algarterna i fråga.
Näringsämnena finnas tillgängliga i rätt förhållande till varandra (16 kväveatomer för varje fosforatom). Vanligtvis är det kväve som är det tillväxtbegränsande näringsämnet men i vissa kustområden, och i de flesta sjöar är det tillgången på fosfor som begränsar algtillväxten.
![Page 17: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/17.jpg)
Mikrobiologisk bestämmning
![Page 18: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/18.jpg)
Renodling av bakterier
Petri plattor med agar
inokuleras med provet som
skall undersökas
Plattorna placeras i
inkubator vid viss
temperatur. 30, 37 eller 44
grader är vanligt
![Page 19: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/19.jpg)
Prickarna kallas kolonier och kommer från en enskild bakterie. Bakterien är renodlad och kan studeras närmare.
Ofta får man fram bakteriekolonier av olika form färg och storlek.
![Page 20: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/20.jpg)
Identifiering av bakterier
Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering
Gramnegativ Grampositiv
![Page 21: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/21.jpg)
Identifiering av bakterier
Metabolism; odling på eller i olika medium
Det finns också reagenskit som ger utslag för olika metabola egenskaper hos bakterierna
![Page 22: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/22.jpg)
Ett sådant hör schema använder man när man bestämmer bakterier
![Page 23: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/24.jpg)
![Page 25: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/25.jpg)
Indikatororganismerindikerar förekomst av fekal förorening
Koliforma bakterer
Förekommer även i jord
Termotoleranta koliforma
Förekommer även i djurs avföring
E. coli
Mycket i mänsklig avföring och hos andra
varmblodiga djur
-------------------
Fekala streptokocker
lever längre i naturen än de andra
indikatororganismerna
![Page 26: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/26.jpg)
Metodik, indikatororganismer
MPN
MF
Most probable number
Provet späds 10 ggr mellan
varje odlingsrör. När det inte
blir tillväxt har provet spätts
så mycket att inga bakterier
finns kvar.
Membranfilter teknik
Provet filtereras
Filtret placeras på plattan och
inkuberas
Prickarna kallas kolonier och
motsvarar en bakterie av
den typ som mäts i provet.
![Page 27: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/27.jpg)
Vattenburna sjukdomar
Exempel:
Patogena protozoer Giardia lamblia
Chryptosporidium parvum
Patogena bakterier
Legionella pneumoniae
Salmonella typhi
Campylobacter
Virus poliovirus
![Page 28: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/28.jpg)
Protozoer: Giardia lambliaFlagellat m. 8 flageller
Parasit (tunntarm, tolvfingertarm)
Fäster vid slemhinnor med sugskiva
Orsakar Giardiasis – akut gastroenteritis
Symptom: diarré, magkramp, illamående,
gaser, viktminskning
![Page 29: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/29.jpg)
Protozoer: Cryptosporidium parvum
Små (2-5m)
Parasiter I magsäck och tarmar
Symptom – mild diarré
![Page 30: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/30.jpg)
Bakterier: Campylobacter
Tarmbakterie hos
boskap och andra djur
En av de vanligaste
orsakerna till magsjuka
![Page 31: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/31.jpg)
Bakterier: Salmonella typhi
Gram negativ,
kort stav, flageller
Orsakar tyfoidfeber: hög
feber, diarré,
svettningar, sårbildning i
tarmar
![Page 32: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081409/608a4e76f5a06f35fe1a6a8c/html5/thumbnails/32.jpg)
Virus
Patogena virus förekommer i avloppsvatten
Elimineras i vattenrening, klorkänsliga
Enterovirus (RNA-virus, finns i tarmar) Poliovirus
Norwalk virus
Hepatit A virus