pubmed/como pesquisar, exibir, fazer download e enviar por email os resultados (módulo 4.1)
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PubMed/Como pesquisar, exibir, fazer download e enviar
por email os resultados(módulo 4.1)
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MÓDULO 4.1 PubMed/Como pesquisar,
exibir, fazer download e enviar por email os resultados
Instruções
• Esta parte do curso é uma demonstração em Power Point para introduzir os conceitos de Pubmed.
• Esta parte do módulo é off-line e deve ser usada como referência.
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Tópicos
Conectar-se ao PubMed Navegar no PubMed Selecionar um banco de dados para pesquisa Pesquisar no PubMed Dúvidas de traduções Mostrar opções Imprimir, salvar e opções para email
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Logging on to HINARI 1
Antes de entrar nos sites das editoras, é necessário conectar-se ao site do HINARI através da URL http://www.who.int/hinari . Mude para o site em português e clique no botão CONECTAR
Na página inicial do HINARI, encontra-se o link para a página do HINARI em português.
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Para se conectar na página eletrônica, é necessário digitar o código do usuário HINARI (user name) e a a senha (password) nos campos correspondentes e clicar no botão “Login” Nota: É preciso se conectar corretamente para ter acesso aos artigos na íntegra.
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Entrando na área de revistas HINARI
Para entrar na área de acesso às revistas, selecione a opção “revistas em texto completo, bases de dados e outros recursos” na coluna da esquerda da página principal do HINARI.
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A partir da página de “revistas em texto completo, bases de dados e outros recursos" pode-se acessar o PubMed através do link “Buscar artigos das revistas do HINARI via PubMed (Medline)”.
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PubMed home page 1
Bem-vindos à página eletrônica do PubMedEsta parte do módulo mostrará a interface de pesquisa, as opções de mostrar na tela (display) as referências, as opções de acesso às referências e como enviar por email dos resultados.
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Other NCBI databases
A barra preta acima da caixa de pesquisa contem links para outras bases de dados NCBI. As bases de dados destacadas acima são: PROTEIN, OMIM e revistas do PubMed. Para mudar entre as bases de dados clique no nome da base de dados.
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NCBI – OMIM database
Aqui esta a base de dados OMIM.Para voltar ao PubMed clique no link que está na barra de base de dados.
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PubMed home page 2
Do lado esquerdo da página eletrônica do PubMed há links para outros recursos do PubMed, como por exemplo, uma visão geral do PubMed (overview) ajuda e perguntas mais frequentes (help & FAQ), um Tutorial e notícias.
Abaixo, do lado esquerdo da página do PubMed estão também links para outras facilidades do PubMed como a base de dados de revistas, a base de dados MeSH (Medical Subject Headings), pesquisas clínicas, LinkOut e funções de citações.
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PubMed home page 3
A caixa de pesquisa no PubMed está ativada. Digite neste espaço o assunto de sua busca.
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PubMed search box
Neste exemplo nós entramos com a busca “malaria infections in Africa” na caixa de pesquisa. Para processar a busca clique no botão “Go”.
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Results - default display
Os resultados da busca são listados no corpo da página.
Existem duas guias adicionais para Free full text (texto integral e gratuito) e artigos HINARI (disponível desde 07 2007). Estas são as pesquisas MyNCBI que estão incluídas em todas as consultas HINARI/PubMed (ver módulo 4.5).
Dos 1854 articles, 687 estão disponíveis are via HINARI e 330 na guia Free full text (há sobreposição).
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The Details link
Para ver como o PubMed processou a busca, pode-se clicar no link “Details” (detalhes) destacado abaixo da caixa de pesquisa.
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Details page
PubMed usa um mapeamento automático de termos. O details (detalhes) mostra como o software do PubMed divide em partes o assunto da busca. Neste exemplo o PubMed buscou por Malaria como uma palavra do texto (text word) e como um termo MeSH devido a identificação automática de termos. Africa e Infections são também buscadas como palavras do texto e como termos MeSH (descritores de assunto).
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Results – display options
Destacados abaixo da caixa de pesquisa estão as opções de mostrar na tela os resultados encontrados - display. Os registros são apresentados em formato resumido, de 20 em 20 de um total de 1854, mostrados e ordenados pelo número de identificação do registro no PubMed – PubMed ID number.
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Display formats
Há diferentes formatos disponíveis para mostrar na tela os resultados da busca. A partir da lista de opções da função display pode-se ver os possíveis formatos de escolha.No PubMed pode-se selecionar tanto o formato Summary (resumido), Brief (curto), Abstract (resumo), Citation (citação), como o formato Medline. Os demais formatos são para outras bases de dados do NCBI.Normalmente, usa-se como padrão, o formato Summary . Para mudar o formato, clique no botão “Display” e selecione o formato desejado.
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Summary format
O formato resumido (Summary) mostra os nomes dos autores, o título do artigo, a fonte de publicação da citação mostrada e o número de identificação do registro no PubMed - PubMed ID number.
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Brief format
A partir das opções da função Display pode-se selecionar o formato curto para apresentação dos registros - “Brief”.
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Brief format 2
O formato curto (brief) mostra o nome do primeiro autor, parte do título do artigo e o número de identificação do registro no PubMed - ID number.
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Abstract format 1
A opção Abstract (resumo) foi selecionada.
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Abstract format – full text links
O formato “Abstract” destacado dentre as opções de display apresentará os "links" para as páginas eletrônicas dos editores que podem disponibilizar o texto completo do artigo. Neste exemplo, conectamos a página da editora Elsevier e ao lado encontramos o ícone HINARI que identifica o direito de acesso para as instituições registradas.
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Abstract format – Affiliation information
O formato Abstract também fornece informações adicionais. Estes dados são somente do primeiro autor listado no artigo, e não de todos os autores.
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AbstractPlus Example
Este é um exemplo do formato AbstractPlus. Note the realocação dos ícones HINARI e Elsevier.
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Citation format 1
A opção de formato “Citation” (citação) é similar ao formato resumo (abstract), mas mostra algumas informações adicionais, como termos MeSH e nomes de substâncias.
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Formato Citação – Informação MeSH
Aqui pode-se ver os termos MeSH (descritores de assunto) designados para este registro na indexação feita pela National Library of Medicine (NLM).
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MEDLINE format 1
Aqui, selecionou-se a opção do formato “MEDLINE”.
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MEDLINE field identifiers
O formato “MEDLINE” mostra todos os campos de um registro MEDLINE com o identificador do campo em cada linha.Este formato é o melhor para ser usado na exportação de registros para um software de gerenciamento de referências.
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Number of records displayed
Há algumas opções de quantidade de referências a serem mostradas por página ( de 5 a 500 referências).
É aconselhável listar o máximo de referências possíveis por página para economizar tempo na mostra dos resultados, eliminando a necessidade de passar por inúmeras páginas.
Neste exemplo foi selecionada a opção “200” na caixa. Para mudar o número mostrado, clique em uma outra opção na mesma caixa.
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Results pages
A página de resultados está agora listando os registros de 1 a 200 dos 1854 registros encontrados na busca.
Os artigos aparecem de 10 em 10.
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Sorting options
Os resultados podem ser ordenados alfabeticamente por autor ou por título da revista, ou ainda pela data de publicação. Neste exemplo usou-se a opção “Journal” (revista). Para alterar a ordem alfabética, clique sobre uma das opções no menu.
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Sorting by journal title
Pode-se ver os resultados de 1-200 mostrados em ordem alfabética pelo título da revista.
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Selecting references
Para selecionar referências a partir dos resultados, marca-se o quadrado que aparece ao lado esquerdo dos registros.
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Selecting references 2
Os resultados de 1 a 4 desta página foram marcados e estão selecionados.
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Send to Text option 1
Os resultados selecionados podem agora ser formatados para impressão selecionando a opção “text” a partir das opções da função “send to” (enviar para).
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Send to Text option 2
Esta é uma boa opção de formato de impressão.
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Send to File 1
Para salvar os resultados selecionados em um disquete, CD, disco removível ou em seu computador, selecione a opção “file” a partir do menu da função “send to”
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Send to File 2
Abra o arquivo ("open with notepad") e acrescente a extensão.txt (de texto). Para salvar o arquivo, selecione a opção Save File.
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Send to Email 1
Para enviar os resultados selecionados por email escolha a opção email a partir do menu da função “send to”.
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Send to Email 2
A partir desta tela pode-se escolher um formato e a forma de ordenar os resultados selecionados, e ainda acrescentar um texto de observação.
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Send to Email 3
Digite um endereço de email na linha oferecida à frente do item E-mail.
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Send to Email 5
Ao retornar à tela dos resultados, aparecerá uma barra de mensagem informando que o email foi enviado do servidor do PubMed para o endereço de email de um usuário.
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Send to Clipboard 1
Os resultados selecionados também podem ser enviados para uma área de trabalho. Selecione a opção “Clipboard” a partir do menu da função “Send to”.
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Send to Clipboard 2
Uma barra de informação aparecerá indicando o número de itens enviados para a área de trabalho, o limite de tempo que ficarão disponíveis até serem apagados e o número máximo de itens permitidos na área de trabalho.
Uma vez usada a guia HINARI e controlados os cinco itens, estes vão para a área de trabalho.
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Send to Clipboard 3
Para recuperar os itens colocados na sua área de trabalho, clique na opção Clipboard que está abaixo da caixa de pesquisa.
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Send to Clipboard 4
Dentro da área de trabalho pode-se reformatar e listar os resultados da mesma forma e com as mesmas opções oferecidas a partir da página principal dos resultados. Aqui, foi escolhida a opção Abstract (resumo).
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Send to Clipboard 5
Para remover um item da área de trabalho, selecione o item a ser removido e escolha a opção “Clip Remove” a partir do menu da função “Send to”.
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Send to Clipboard 6
Uma barra de informação aparecerá confirmando quantos itens foram removidos da área de trabalho.
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This is the end of Module 4 Part 1
Este é o fim do módulo 4 parte 1
Há um caderno de exercícios que acompanha esta parte do módulo. O caderno traz exercícios práticos sobre os temas apresentados neste módulo.
Atualizado 01 2009