ptlv-1 の起源と進化 ～ニホンザルに感染してる stlv-1 の系統学的位置の解明...
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PTLV-1 の起源と進化 ～ニホンザルに感染してる STLV-1 の系統学的位置の解明 ～. 氏名： 307102 塚田幸絵 所属：熱帯医学研究所 国際保健学分野 担当教員：江口克之、山本太郎. 背景. 霊長類 T 細胞白血病ウイルス 1 型 (PTLV-1 ） はアフリカ、アジアに分布する真猿類のサル、類人猿、ヒトの T 細胞に感染するレトロウイルス。 サル、類人猿を自然宿主とするウイルスは サル T 細胞白血病ウイルス 1 型 (STLV-1) ヒトを宿主とするウイルスは 成人 T 細胞白血病ウイルス (HTLV-1 ） と便宜的に分類されている。 - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
PTLV-1 の起源と進化
～ニホンザルに感染してる STLV-1 の系統学的位置の解明 ～
氏名： 307102 塚田幸絵 所属：熱帯医学研究所 国際保健学分
野担当教員：江口克之、山本太郎
背景霊長類 T 細胞白血病ウイルス 1 型 (PTLV-1 ）はアフリカ、
アジアに分布する真猿類のサル、類人猿、ヒトの T細胞に感染するレトロウイルス。
• サル、類人猿を自然宿主とするウイルスはサル T 細胞白血病ウイルス 1 型 (STLV-1)• ヒトを宿主とするウイルスは成人 T 細胞白血病ウイルス (HTLV-1 ）
と便宜的に分類されている。
既知の STLV-1 と HTLV-1 は env 、 pX 、 LTR の各遺伝子領域でほぼ 90 ％の相同性を示すほど非常に近縁である。
でもね、、、
日本内における PTLV-1 の比較
目的
⇒
ニホンザルのSTLV-1 とヒトの HTLV-1 の感染自然史の違いを理解するための一助として、、、
ニホンザルのSTLV-1 とHTLV-1 の系統学的な関係性を明らかにする
PTLV-1 の遺伝子構造5’-LTR-ψ-gag-pol-env-LTR-3'
総塩基数は約 9000 塩基LTR （反復配列）
ψ （ RNA ゲノムがウィルス粒子内に取り込まれるのに 必要なパッケージングシグナル）
• 本研究では、 PTLV-1 に属する比較的遠縁なウィルス株の系統関係の解明を目指しているため進化速度が比較的遅いと考えられている pol 領域の一部（ 1502 塩基）を解析対象とした。
対象と方法
1.福井県内で捕獲された STLV-1 陽性ニホンザル６個体の末梢血から DNA を抽出。
2.それらの DNA について、 pol 領域の一部 1502 塩基を PCR 法によって増幅。
3. Exosap 処理した PCR 産物はサイクルシークエンス反応に供し、塩基配列を読み取る。
4.得られた配列を DNA Baser を用いて照合することにより、 1200 ～ 1500 塩基長の配列を決定。
5 ．決定された配列を GenBank に登録されているPTLV-1 株の配列とともに、最尤法により系統解析した。
結果
ニホンザルの STLV-1 は HTLV-1と１つのグループを形成している。
HTLV-1 USA
HTLV-1 日本 HTLV1 中国 HTLV-1 ブラジル
HTLV1
HTLV-1 カリブ STLV-1
STLV-1 中央アフリカ STLV-1 ニホンザル富山 1
STLV-1 ニホンザル富山 4
STLV-1 ニホンザル富山 226
HTLV-1 メラネシア亜型 STLV-1 スラウェシ
HTLV4
HTLV04
HTLV002
HTLV2
STLV02
STLV2
STLV03
STLV3
HTLV3Pyl
HTLV3Lobak
STLV1
AY590142
95
99
84
100
100
89
100
22
87
98
100
99
100
99
69
9989
100
100
79
0.1
HTLV-1 USA(AF139170 ）
HTLV-1 日本（ J02029 ）
HTLV1 中国
HTLV-1 ブラジル（ AY563954 ）
HTLV1
HTLV-1 カリブ（ D13784 ）
STLV01
STLV-1 中央アフリカ（ AF074966 ）
ニホンザル（ toyama1 ）
ニホンザル（ toyama4 ）
ニホンザル（ toyama226 ）
HTLV-1 メラネシア亜型（ L02534 ）
STLV-1 スラウェシ（ Z46900)
95
99
84
100
100
89
100
22
87
0.02
黒字： HTLV-1赤字： STLV-1
•STLV-1 株同士が一つのまとまりを作らない。•日本に存在する HTLV-1 と STLV-1 は PTLV-1群の中でかなり遠い位置にある。
Toyama1 との比較（％）
STLV-1 HTLV-1 toyama
結論
• ニホンザルの STLV-1 は HTLV-1 と１つのグループ（ PTLV-1群）を形成している。
• STLV-1 株同士が一つのまとまりを作らない。
• PTLV-1群の中では、日本に存在する HTLV-1と STLV-1 はかなり遠い位置にある。
• PTLV- １の中で、系統によって進化速度が違う可能性が示唆された。
謝辞
• この研究をするにあたり、研究する機会を頂いた山本太郎先生、何から何まで御助言を頂いた江口克之先生に深く御礼申し上げます。
打ち上げ楽しみです！！