البروتينات و البروتينات الببتيدات و الببتيدات

22

الببتدية الروابط و بالببتيدات الببتدية تعريف الروابط و بالببتيدات تعريف سالسل لتكون بعضها مع األمينية األحماض ترتبط ان سالسل يمكن لتكون بعضها مع األمينية األحماض ترتبط ان يمكن

. ببتيدات وتسمى المتصلة األمينية األحماض من .طويلة ببتيدات وتسمى المتصلة األمينية األحماض من طويلة جزيء بإقصاء وتتم الببتدية الرابطة تسمى بينها جزيء والرابطة بإقصاء وتتم الببتدية الرابطة تسمى بينها والرابطة

ماء .ماء .

3-103-10 = قليل ببتيد اميني قليل = حمض ببتيد اميني حمض10-10010-100 = الببتيد عديد اميني الببتيد = حمض عديد اميني حمض من من اكثر بروتين = 100100اكثر اميني بروتين = حمض اميني حمض

33

Peptide Bond FormationPeptide Bond Formation

44

Peptide ChainPeptide Chain

55

الببتيدات الببتيدات تسمية تسمية: األمينية األحماض ترتيب و نوع حسب الببتيدات األمينية :تسمى األحماض ترتيب و نوع حسب الببتيدات تسمى يحتوي الذي الطرفي األميني بالحمض التسمية يحتوي تبدا الذي الطرفي األميني بالحمض التسمية تبدا

بالجهة تظهر التي و حرة طرفية أمين مجموCعة بالجهة على تظهر التي و حرة طرفية أمين مجموCعة على. للببتيد .اليسرى للببتيد اليسرى

, ( يل المقطع يضاف يل ) ,و المقطع يضاف اميني( ylylو حمض كل اسم اميني( بنهاية حمض كل اسم بنهايةمجموعة على يحتوي الذي االخير األميني الحمض مجموعة ماعدا على يحتوي الذي االخير األميني الحمض ماعدا

الكربوكسيل.الكربوكسيل. سيستايين تايروزيل جالسيل لوCسيل سيستايين مثل تايروزيل جالسيل لوCسيل مثل Leu-Gly-Tyr-CysLeu-Gly-Tyr-Cys )) ))

66

تصنيفها و البروتينات Cتصنيفها تعريف و البروتينات Cتعريف. كبير الجزيئي وزن ذات عديدة ببتيدات البروتينات .تعتبر كبير الجزيئي وزن ذات عديدة ببتيدات البروتينات تعتبر: قسمين الى :وتنقسم قسمين الى وتنقسم11 -بروتيني غير جزء اي على تحتوي ال انها حيث بسيطة بروتيني- بروتينات غير جزء اي على تحتوي ال انها حيث بسيطة بروتينات: الى :وتنقسم الى وتنقسم. الكوالجينات- مثل طويلة سالسل شكل على وهي الليفية البروتينات .أ الكوالجينات- مثل طويلة سالسل شكل على وهي الليفية البروتينات أ -مثل كروية اشكال ذات وهي المنطوية او المكورة البروتينات مثل- ب كروية اشكال ذات وهي المنطوية او المكورة البروتينات ب

اللبيومينات.اللبيومينات.22 -بروتينية غير اجزاء مع مرتبطة بروتينات وهي المعقدة بروتينية- البروتينات غير اجزاء مع مرتبطة بروتينات وهي المعقدة البروتينات

. الاليبوبروتينات .مثل الاليبوبروتينات مثل

77

البروتينات تركيب البروتينات مستويات تركيب مستويات: وهي مستويات اربعة الى :وتنقسم وهي مستويات اربعة الى وتنقسم : السلسلة في األمينية األحماض تسلسل االولي : التركيب السلسلة في األمينية األحماض تسلسل االولي التركيب

. للبروتين المكونة الببتدية السالسل .او للبروتين المكونة الببتدية السالسل او : الفراغي الشكل التركيب هذا يبين الثانوي : التركيب الفراغي الشكل التركيب هذا يبين الثانوي التركيب

. التفافها و التوائها وكيفية الببتدية .للسلسة التفافها و التوائها وكيفية الببتدية للسلسة البروتين جزيء فأين الهيدروجينبة الروابط لوجود ً البروتين ونظرا جزيء فأين الهيدروجينبة الروابط لوجود ً ونظرا

: التالية االشكال :يأخذ التالية االشكال يأخذ ( -الفا بإسم المعروف الحلزوني او اللولبي الشكل الفا- ) أ بإسم المعروف الحلزوني او اللولبي الشكل أ

هيلكس(.هيلكس(..) شيت- ) بيتا تركيب او المستوية الصحيفة شكل (.ب شيت- ) بيتا تركيب او المستوية الصحيفة شكل ب -على وجوده ويقتصر الكوالجيني الثالثي الحلزوني على- ج وجوده ويقتصر الكوالجيني الثالثي الحلزوني ج

الكوالج الكوالج بروتين بروتين

88

: السلسلة انثناء و التفاف وهو الثالثي : التركيب السلسلة انثناء و التفاف وهو الثالثي التركيبالمعين التركيب تكتسب حتى ترابطها و المعين الببتدية التركيب تكتسب حتى ترابطها و الببتدية

للبروتين.للبروتين.: التالية الروابط و القوى التركيب هذا :ويثبت التالية الروابط و القوى التركيب هذا ويثبت. الهيدروجينية- الروابط .أ الهيدروجينية- الروابط أ. للماء- الكرهة او للماء المحبة غير التجمعات .ب للماء- الكرهة او للماء المحبة غير التجمعات ب. الكبريت- ثنائية الروابط .ج الكبريت- ثنائية الروابط ج. -األيونية الروابط األيونية- .د الروابط د

: مع الببتدية السالسل ارتباط الرباعي : التركيب مع الببتدية السالسل ارتباط الرباعي التركيبحالة في للبروتين النهائي الشكل لتكون حالة بعضها في للبروتين النهائي الشكل لتكون بعضها

. سلسلة من اكثر من يتكون لبروتين .ان سلسلة من اكثر من يتكون لبروتين ان

99

Primary StructurePrimary Structure

• linear• ordered• 1 dimensional• sequence of amino

acid polymer• by convention, written

from amino end to carboxyl end

• a perfectly linear amino acid polymer is neither functional nor energetically favorable folding!

primary structure of human insulinCHAIN 1: GIVEQ CCTSI CSLYQ LENYC NCHAIN 2: FVNQH LCGSH LVEAL YLVCG ERGFF YTPKT

1010

Secondary StructureSecondary Structurenon-linearnon-linear33 dimensionaldimensionallocalized to regions of an localized to regions of an

amino acid chainamino acid chainformed and stabilized by formed and stabilized by

hydrogen bonding, hydrogen bonding, electrostatic and van der electrostatic and van der

Waals interactionsWaals interactions

1111

Tertiary StructureTertiary Structure

• non-linear• 3 dimensional• global but restricted to the

amino acid polymer• formed and stabilized by

hydrogen bonding, covalent (e.g. disulfide) bonding, hydrophobic packing toward core and hydrophilic exposure to solvent

• A globular amino acid polymer folded and compacted is somewhat functional (catalytic) and energetically favorable interaction!

1212

Quaternary StructureQuaternary Structure

• non-linear• 3 dimensional• global, and across

distinct amino acid polymers

• formed by hydrogen bonding, covalent bonding, hydrophobic packing and hydrophilic exposure

• favorable, functional structures occur frequently and have been categorized