1

Prof. dr. Hilada Nefić, redovna profesorica Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u

Sarajevu, uže naučne oblasti „Genetika“ i „Klinička biologija“ – predsjednik

Prof. dr. Izet Eminović, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu,

uže naučne oblasti „Biomedicina“ i „Genetika“, član

Prof. dr. Đemo Subašić, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu,

uže naučne oblasti „Klinička mikrobiologija“, „Fitopatologija“ i „Imunologija“ član

VIJEĆU PRIRODNO-MATEMATIČKOG FAKULTETA

UNIVERZITETA U SARAJEVU

Predmet: Izbor NASTAVNIKA u zvanje REDOVNOG PROFESORA za naučne oblasti „Genetika“ i

„Klinička biologija“ na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u

Sarajevu – 1 izvršilac sa punim radnim vremenom

Komisija za oblast „KLINIČKA BIOLOGIJA“

Rješenjem Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu broj 01/06-1070/3-2020 od 04.

06. 2020. godine, a na osnovu člana 106. Zakona o visokom obrazovanju („Službene novine Kantona

Sarajevo“, broj: 33/17), člana 104. Statuta Univerziteta u Sarajevu, prijedloga Vijeća Odsjeka za

biologiju od 28.05. 2020. godine i Odlukom Vijeća Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u

Sarajevu sa elektronske 61. sjednice, održane 04. 06. 2020. godine imenovani smo u Komisiju za

izbor nastavnika u zvanje redovnog profesora za naučnu oblast „Klinička biologija“ na Odsjeku za

biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu.

Nakon detaljnog uvida u priloženu dokumentaciju, podnosimo sljedeći

I Z V J E Š T A J

Komisija konstatira da se, u zakonskom roku, na raspisani Konkurs, objavljen 08. 05. 2020. godine u

dnevnom listu „Dnevni avaz“, na web-stranici Fakulteta i na web-stranici Univerziteta u Sarajevu

prijavila samo jedna (1) kandidatkinja:

2

Prof. dr. Amina Kozarić, vanredna profesorica na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog

fakulteta Univerziteta u Sarajevu. Dopisom broj 02/01-974/2-2020 od 28.05.2020. godine

obavješteni smo, od Komisije za prijem pristiglih prijava, da je prof. dr. Amina Kozarić uz prijavu u

zvanje redovnog profesora dostavila sve tražene priloge (18.05.2020. godine), te da blagovremenost i

potpunost prijave potvrđuje usklađenost prijave sa Konkursom.

Također, uz prijavu na Konkurs, kandidatkinja je dostavila sljedeće dokumente (u formi 3

knjige/skripte, 205 stranica, 79 stranica i 455 stranica):

SKRIPTA I 1. Osobni dokumenti

1.1. Biografija/životopis i Bibliografija (i na CD), str. 1-28. 1.2. Uvjerenje o državljanstvu-ovjerena kopija, str. 30-31. 1.3. Izvod iz matične knjige rođenih-ovjerena kopija, str. 32-33. 1.4. Ovjerena kopija diplome o doktoratu bioloških nauka, str. 34-38. 1.5. Ovjerena kopija diplome o završenom diplomskom studiju, str. 39-44. 1.6. Odluku o izboru u zvanje vanrednog profesora za oblasti „Klinička biologija“ i „Genetika“, str. 45-46. 1.7 Odluku o izboru u zvanje docenta za oblast Biološke nauke, str. 47-50.

2. Doprinos u podizanju nastavnog i naučnoistraživačkog kadra

2.1. Potvrde o mentorstvu odbranjenih doktorskih teza (III ciklus), str. 51-55. 2.2. Potvrde o mentorstvu odbranjenih radova II ciklusa, str. 56-72. 2.3. Potvrde o mentorstvu dvije doktorske teze, str. 73-75. 2.4. Učešća u komisijama za ocjenu i odbranu doktorskih disertacija i radova II ciklusa, str. 76-88. 2.5. Dokazi o recenzijama u međunarodnim naučnim časopisima, str. 89-122. 2.6. Priznanja i nagrade, 123-132. 2.7. Pozvana predavanja, str. 133-150. 2.8. Certifikati, edukacije i zahvalnice, 151-175.

3. Naučno-istraživački projekti i kliničke studije

3.1. Naučnoistraživački projekti i kliničke studije prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 175-180. 3.2. Naučnoistraživački projekti i kliničke studije nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 180-205.

4. Metode

4.1 Nove metode uvedene prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 206-207. 4.2 Nove metode uvedene nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 180-205.

3

SKRIPTA II 5. Publikacije prije izbora u vanrednog profesora

5.1. Lista publikacija na Web of Science, str. 1-4. 5.2. Bibliografija-kopije originalnih publikacija u naučnim časopisima, str. 5-59. 5.3. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index, str. 60-67. 5.4. Kongresna priopćenja na domaćim i inostranim kongresima, str. 68-79.

SKRIPTA III 6. Publikacije nakon izbora u vanrednog profesora

6.1. Lista publikacija na Web of Science, str. 1-5. 6.2. Bibliografija-kopije originalnih publikacija u naučnim časopisima, str. 6-363. 6.3. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index, str. 364-383. 6.4. Kongresna priopćenja na domaćim i inostranim kongresima, str. 384-424.

7. Knjige

7.1 Dokazi o objavljenoj knjizi prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 425-432. 7.2 Dokazi o objavljenoj knjizi nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 433-455.

1. BIOGRAFSKI PODACI KANDIDATKINJE Amina Kozarić Grbavička 9, 71000 Sarajevo +387-62-621-423 Datum rođenja: 27.04.1980 amina.kurtovic@gmail.com Obrazovanje

Cleveland Clinic, Cleveland, SAD Fulbright Scholar, US Department of State Taussig Cancer Center, Department of Translational Hematology and Oncology Univerzitet u Beču, Beč, Austrija Dr.rer. nat. - doktorat iz bioloških nauka Vienna Biocenter Internacionalni doktorski studij Tema: Characterization of putative odorant receptors in D. melanogaster. Doktorat odbranjen 13.04.2007. Nagrada za najbolji doktorat Cornell University, Ithaca, New York, SAD Biološke znanosti, diplomirani biolog. Diploma sa visokim priznanjem Tema: Characterization of human and bovine Streptococcus bovis strains using RFLP and PCR.

2012-2013 2003-2007 1998-2002

4

Friends Central School, Wynewood, PA, SAD Diploma srednje škole, sa najvišim priznanjem

1998-2002

Profesionalne pozicije

Vanredni profesor Univerzitet u Sarajevu, Prirodno-matemetički fakultet Predmeti: Farmakogenetika, Genetičko savjetovanje i testiranje i Humana genetika. Odgovorna za kreiranje nastavnog plana i programa, i ocijenjivanje studenata. Mentor studentima na I, II i III ciklusu Docent prirodnih znanosti Internacionalni Burch Univerzitet – Predavala Genetiku i Bioinformatiku (magistarski) Internacionalni Univerzitet u Sarajevu, Sarajevo, BiH Predavala Genetiku I, Genetiku II, Molekularnu biologiju I, Molekularnu biologiju II, Tehnike molekularne biologije. Odgovorna za kreiranje nastavnog plana i programa, i ocijenjivanje studenata. Biolog Odjeljenje molekularne dijagnostike i citogenetike, OJ Klinička patologija i citologija. Osnovala laboratorij za molekularnu dijagnostiku i citogenetiku OJ Klinička patologija i citologija KCUS. Odjeljenje i organizaciona jedinica preimenovani 2014 godine u Odjeljenje humane genetike, OJ Klinička patologija, citologija i humana genetika. Lista 103 analize koje sam uspostavila se nalaze u prilogu. Šef odjeljena humane genetike Uspostavila novu laboratoriju 2007 godine koja trenutno radi sljedeće analize (više od 100 citogenetskih i molekularnih analiza):

Prenatalna citogenetika: QF-PCR, kariotip i FISH. Hematologija: citogenetika (kariotip iz koštane srži). FISH (>

40 proba i panela za akutne i hronične leukemije, MDS, multipli mijelom i limfom na citološkim preparatima, direktnoj kulturi, kulturi stanica i tkivnim FFPE uzorcima (npr. AML panel od 5 analiza, ALL panel od 2 analize, CLL panel od 5 analiza, Multipli mijelom panel od 6 analiza, FFPE limfom od 6 proba, itd. Molekularne analize (ASO-PCR, real-time PCR, kapilarna elektroforeza, kvantitativni RQ-PCR, MLPA): FLT3 i NPM1 za akutne leukemije, JAK2, CALR, MPL za MPN; Kvantitativni qPCR BCR-ABL1 for CML svakih tri mjeseca za 60 pacijenata; MYD88 za Waldestrom, 8 rezistentnih BCR-ABL1 mutacija; Faktor II i V. FISH i STR profil za transplantacione pacijente i vijabilnost stanica; hemahromatoza.

2014- 09/2010-2015 09/2007-2011 06/2007-- 02/2016-

5

Pedijatrija: kariotip, mikrodelecijski FISH, MLPA za mikrodelecijske sindrome, cističnu fibrozu, spinalnu mišićnu atrofiju, razne sindrome, fragilni X, i druge. Hemato-onkološke analize: ALL FISH panel (BCR-ABL1, MLL i AML-ETO), FISH za limfome, neuroblastome, tumore mozga i sarkome (npr. C-MYC, N-MYC, EWSR1, itd.). NGS za 50 gena za epilepsiju.

Ginekologija: Y microdelecija, SRY FISH, kariotip za sterilitet. Patologija: FFPE FISH za razne tipove tumora, npr. MDM2,

SS18, N-MYC, 1p/19q, itd. Onkologija: Real time PCR za mutacij u BRAF, KRAS, NRAS,

EGFR, MSI, BRCA1, BRCA2. NGS za kolorektalne-plućne tumore. Genetičko savjetovanje: prenatalno, postnalano,

pedijatrijsko, itd. Tumorska banka Eksterna validaciju kroz CEQA (GenQA) i UKNEQAS

Molekularni biolog OJ Klinička mikrobiologija Klinički Centar Univerziteta u Sarajevu PCR dijagnostika za HCV, HPV, HIV i testiranje očinstva

03/2003-10/2003

Usavršavanja u naučno-istraživačkom radu i dijagnostici

Univerzitet u Heidelbergu, Njemačka. Odsjek za neuropatologiju. Molekularna dijagnostika tumora CNS-a. (Erasmus) Department of Translational Hematology and Oncology Research, Taussig Cancer Center, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA Fulbright Scholar kod Prof.dr. Jaroslaw Maciejewski

Institut Molekularne Patologije, Beč, Austrija Doktorski studij pod mentorstvom Dr. Barry J. Dickson

Kreiranje knock-out gena mogućih feromonskih receptora koristeći homolognu rekombinaciju u Drosophila melanogaster

Karakterizacija uloge mirisnih receptora Or67d u ponašanju parenja kod Drosophila mužjaka i ženki

Institut za mikrobiologiju, Cornell Univerzitet, Ithaca, New York, SAD Diplomski rad pod mentorstvom Dr. James B. Russell

Sposobnost lisozima i 2-deoksiglukoze u diferenciranju humanih i kravljih Streptococcus bovis

Asistent za istraživanje Fiziološka i genetska raznolikost kravljih Streptococcus bovis

3/2018 2012-2013 10/2003-05/2007 2001-2002 1998-2000

6

Institut za mikrobiologiju i imunologiju, Cornell Univerzitet, Veterinarski fakultet, Ithaca, New York, SAD Pomoćnik u istraživanju pod mentorstvom Dr. Eric Y. Denkers

Odgovor Toxoplasma-invaziranih makrofaga pod raznim bakterijskim stimulusima

Institut za mikrobiologiju i imunologiju, Medicinski fakultet Weill Cornell Medical College, New York, NY, SAD Asistent u istraživanju pod vodstvom Dr. Thomas J. Templeton

Kloniranje Plasmodium falciparum surface protein CCP3 Anotacija Cryptosporidium proteins bazirana na usporedbi sa

Plasmodium proteinima Trening at the Sveučilišna klinika Vuk Vrhovac Zagreb, Hrvatska. Trening za osnivanje prve sperm banke. Pod mentorstvom dr. Božo Čolak. Trening na University Hospital of Wales in Cardiff, Wales, Velika Britanija. Trening za osnivanje protočne citometrije i interfazne citogenetike limfoma. Pod mentorstvom Mag.sci. Stephen Couzens i Dr. Stefan Dojcinov. Trening na Johns Hopkins University School of Medicine, Cytogenetics Laboratory, Baltimore, MD, SAD. Trening u hematološkoj citogenetici i fluorescentnoj in situ hibridizaciji pod mentorstvom prof.dr. Constance Griffin.. Trening u citogenetskoj laboratoriji, Institut za patologiju, Brigham and Womens Hospital (Harvard Medical School), Boston, MA, SAD. Pod mentorstvom Dr. Stanislawa Weremowicz. Trening na Institutu za humanu genetiku, Medicinski fakultet Beč, Beč, Austrija. Pod mentorstvom Dr. Juergen Neesen. Clinical Cytogenetics Intensive Course, Goldrain, Italija. http://www.goldrain.ch/ Prenatal Genetic Diagnosis, August Goldrain, Italija. http://www.goldrain.ch/ 2nd EACR-OECI Joint Training Course. "Molecular Pathology approach to cancer", Amsterdam, Holandija.

2000-2001 2000 03/2011 09-10/2009 09-10/2008 11/2007 09/2007 9/2011 9/2010 5/2012

7

Mentorstva

Odbranjeni: Diplomski radovi/radovi I ciklusa - 17 Magistarski radovi/radovi II ciklusa - 17 (15 od izbora u vanrednog profesora)

1. Nejra Korić: Petogodišnje praćenje pacijenata sa akutnom mijeloidnom leukemijom primjenom fluorescentne in situ hibridizacije (FISH). (14.09.2015.)

2. Adisa Baltić: Učestalost hematoloških oboljenja u Kantonu Sarajevo od 1995 do 2014 godine. (17.07.2016.)

3. Amina Kugić: Patohistološke karakteristike gastrointestinalnog stromalnog tumora: desetogodišnje praćenje pacijenata u Federaciji Bosne i Hercegovine. (17.07.2016.)

4. Azra Frkatović: Genetic analysis of E1A binding protein p300 (ep300) expression levels in periapical granulomas and radicular cysts. (08.05.2017.)

5. Samira Smajlović: Gene expression of CC motif chemokine ligand 5 (CCL5) in chronic inflammatory lesions. (08.05.2017.)

6. Hana Komić: Frekvencija mutacija u genima Janus kinaza 2 (JAK2) i kalretikulin (CALR) kod pacijanata sa mijeloproliferativnim neoplazmama. (30.09.2017)

7. Adna Zeljković: Primjena fluorescentne in situ hibridizacije u detekciji MDM2 amplifikacije kod liposarkoma na tkivnim uzorcima. (16.10.2017.)

8. Džejna-Ema Bajramović: Upotreba fluorescentne in situ hibridizacije na tkivnim uzorcima limfoma. (22.01.2018)

9. Ahmed Osmanović: Evaluation of Primary culture of Periodontal Ligament Cell Viability in DMEM at Different Time Intervals. (15.03.2018)

10. Sabina Halilović: measurement of cellular metabolic activity using mtt assay (3-(4, 5-dimethylthiazolyl-2)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide) in periodontal ligament cells under different storage conditions. (15.03.2018)

11. Zana Halilović: Molekularna karakterizacija somatskih mutacija KRAS i NRAS gena kod pacijenata sa karcinomom debelog crijeva. (16.07.2018)

12. Dragana Stanišić: The overview of registration process and legislature of conducted and ongoing clinical trials in Bosnia and Herzegovina (30.11.2018)

13. Ammar Omanović: Prevalence of CALR type 2 (c.1092_1143del) and type 2 (c.1154_1155insTTGTC) mutations in general population of Canton Sarajevo. (23.09.2019)

14. Leila Keškić: Exploitation of synthetic lethal genetic interactions in pancreatic cancer subtypes. (16.04.2019)

15. Emina Omerović: Detekcija genetičkih aberacija kod pacijenata sa multiplim mijelomom putem fluorescentne in situ hibridizacije. (20.10.2019)

Doktorske teze/ III ciklus - 3

1. Senol Dogan: Genomic characterization and discovery of novel therapeutic targets and inhibitors in acute leukemia. (16.12.2015)

2. Aida Ćatić: A novel cytogenetic and molecular characterization of metanephric adenoma: identification of partner genes involved in translocation t(9;15)(p24;q24) and the frequency of BRAFV600E mutation. (13.07.2017)

3. Larisa Bešić: The Assessment of age related clonal hematopoiesis in general population of Hadzici and Ilijas. (13.06.2019)

8

U toku: Magistarski radovi/radovi II ciklusa - 3 Doktorske teze/ III ciklus - 2

1. Erna Islamagić: Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Početak 2016-

2. Lejla Mehinović: Molekularna karakterizacija pacijenata sa mijeloidnim neoplazmama sa područja Kantona Sarajevo: dvadesetogodišnje praćenje. Početak 2016-

Učešće u komisijama

Učešće u većem broju komisija I i II ciklusa studija na Prirodno-matematičkom fakultetu i Internationalnom Burč univerzitetu. Odbrana diplomskih radova/ radova I ciklusa - 11 Odbrana magistarskih radova/radovi II ciklusa - 9 Odbrana doktorskih disertacija/III ciklus - 4

Nagrade, pohvale i priznanja

Fulbright Scholar – US Department of State 2012-2013 Nagrada za najbolji doktorat, 11/2007. Vienna Biocenter, Beč, Austrija. Rektorova stipendija, puna školarina za 4 godine, Cornell University,1998-2002. Cornell University Howard Hughes Research stipendija za istraživanje, 2000. European Hematology Association, Copeanhagen, Danska. Dobitnica Short term

collaboration award 2016. American Society of Hematology Annual Meeting, New Orleans, USA. Dec 06-10,

2013. Dobitnica Abstract Achievement Award. European Society Human Genetics, Paris, June 2013. Dobitnik Travel award. Gordon Research Conference, Molecular and Cellular Neurobiology, Hong Kong,

Kina. Nagrada za najbolju poster presentaciju: The Role of Or67d in Drosophila Male Courtship Behavior.

Nagrada za najbolji poster, Institute of Molecular Pathology Recess. Oktobar, 2006.

Priznanje za diplomski rad, Cornell University, 2002. Phi Beta Kappa nagrada, 1998. Bausch Laumb nagrada, 1998.

9

Konferencije i kongresi

European Society of Human Genetics (ESHG), Gothenburg, 06/2018 godine. European Hematology Association (Europski kongres hematologa), Stockholm,

06/2017. European Hematology Association (Europski kongres hematologa), Kopenhagen,

06/2016. 12th Symposium on Myelodysplastic Syndromes. Berlin 05/ 2013. New Frontiers in Myeloid Malignancies, Berlin, Njemačka. 10/2011. 7th ISABS Conference, Bol, Brac, Hrvatska. 20-24/7, 2011. First Congress of Hematology and Transfuziology, Sarajevo, 19-21/5, 2011. Frontiers in Chronic Myeloid Leukemia, Dresden, 03/2010, Njemačka. European Human Genetics Conference, 22-26/05, 2009, Beč, Austrija. Targeted Therapy in CML, 6-8/3, 2009, Paris, Francuska. IAP, International Academy of Pathology, 27th Congress, Atina, Grčka. 11/2008 P53 Workshop and Li Fraumeni Syndrome Workshop, IARC, Lyon, Francuska. 11/2007 12th Regional Drosophila Meeting, 11/ 2006, Beč, Austrija. IMP Recess, October 2005. Poster Presentacija: The role of Or67d in Courtship

Behavior. Spring Conference, Institute of Molecular Pathology, 03/2005, Beč, Austrija. IMP Recess, 10/2005. Presentacija: The role of Or67d in Courtship Behavior. Beč,

Austrija. Projekti

Federalno ministarstvo nauke i obrazovanja

In vitro ispitivanje vitalnosti kancerogenih ćelijskih linija nakon aplikacije rutenij kompleksa Voditelj projekta. Naučno-istraživački projekat. (2018)

Detekcija i prisustvo molekularnih biljega klonalne hematopoeze u opštoj populaciji. Naučno-istraživački projekat. Član projekta. (2018)

Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Naučno-istraživački projekat. (2016)

Osnivanje prve tumorske banka u Bosni i Hercegovini. 2009 godina. Učesnik projekta. Razvojni projekat. (2009)

Osnivanje prve sperm banke u BiH. Učesnik projekta. Razvojni projekat. 2010. Kantonalno ministarstvo obrazovanja i nauke KS

Učestalost i kliničko-patološki značaj koegzistentnih (istovremenih) mutacija PIK3CA i PTEN gena u grupi invazivnih karcinoma dojke sa bazalnim fenotipom. Učesnik. 2009.

Kliničke studije:

A two stage Phase III, International, Multi-center, Randomized, Controlled, Open-label study to investigate the pharmacokinetics, efficacy and safety of rituximab SC in comination with CHOP or CVP versus rituximab IV in

10

comination with CHOP or COP in patients with previously untreated follicular lymphoma follwed by maintenance treatment with either rituximab SC or rituximab IV. SABRINA-Follicular lymphoma BO22334. (2012-2013)

Efficacy and safety of eraxis/Ecalta (anidulafungin) compared to cancidas (caspofungin) in neutropenic patients with invasive Candida infection. Pfizer. (2010)

MO39107 TeGaR - Studija faze II za ispitivanje sigurnosti i efikasnosti atezolizumaba primljenog u kombinaciji sa obinutuzumabom ili rituximabom, anti-CD20 monoklonskim antitijelom, kod pacijenata s recidivirajućim/refraktornim Mantl ćelijskim limfomom/Waldestrom makroglobulinemijom (WM). (2017-2018)

Open-label, Non-randomized Phase 2 Study With Safety Run-in Evaluating Efficacy and Safety of PQR309 in Patients with Relapsed or Refractory Lymphoma. PQR-309-002. (2016-2017)

Randomizirano, dvostruko-slijepo, komparativno ispitivanje boiekvivalentnosti Mabiona CD20 (Mabion SA) u odnosu na Mabteru (rituximab koji proizvodi HOffman La Roche) na paralelnim grupama kod pacijenata oboljelih od difuznog krupnoćelijskog B limfoma. MabionCD20-002NHL. (2017-2018)

Međunarodni projekti i mreže

Razvoj novih strategija za eliminaciju BCR-ABL1+ matičnih ćelija kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom (projekat sa Prof.dr. Frederik Thoren, Salhgrenska Institut, Gotenborg, Švedska). Voditelj projekta zajedno sa Prof.dr. Thoren. (2019-)

Establishment of translational research laboratory in Bosnia and Herzegovina: Novel Therapeutic Targets and Inhibitors in Acute Leukemia. Swiss National Science Foundation. 2014-2016. Voditelj projekta. Projekat obustavljen iz birokratskih razloga.

COST Action CA18233, COST Association European Network for Innovative Diagnosis and Treatment of Chronic Neutropenias. Član. 11/2019-

COST Action BM1006, Biomedicine And Molecular Biosciences Next Generation Sequencing Data Analysis Network. Član. 2016-

Klinički centar Univerziteta u Sarajevu

Desetogodišnji trend u prevalenciji Down sindroma u zemlji u razvoju: uticaj majčine dobi i prenatalnog skininga. Voditelj projekta (2016-2017).

Osnivanje baze podataka i molekularna karakterizacija pacijenata sa hematoonkološkim oboljenjima u Federaciji Bosne i Hercegovine. Voditelj projekta. (2014-2018)

Stomatoški fakultet (kolaboracija)

Kvantitativna analiza potencijalnih lider gena u periapikalnim inflamatornim lezijama. Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2019 godine.

Značaj održivosti vitaliteta ćelija periodontalnog ligamenta (PDL) kod avulziranih zuba. Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2018 godine.

11

Recenzije u časopisima

American Journal of Medical Genetics Cancer Medicine Hematology Journal of Pediatric Epilepsy Oncotargets and therapy Bosnian Journal of Basic Medical Sciences Environmental Health and Preventive Medicine Ecotoxicology and Environmental Safety Environmental Research Cancer Management and Research Gastrointestinal Cancer: Targets and Therapy Environment International Oncotargets and therapy

Pozvana predavanja

Myeloid malignancies: are they unique? Ludwig Boltzmann Institute for Cancer

Research. 31.05.2017 Beč, Austrija. Risk of myeloid malignancies of people living in areas contaminated with depleted

uranium. MPN-EuroNet conferencija. 11.05.2017. Gothenburg, Švedska. Praćenje mutacije kod pacijenata sa MPN: JAK2, CALR i MPL mutacije. Novartis

Expert Summit. 20-22.4.2018. Jahorina, BiH. Dugoročno praćenje odgovora pacijenata CML pacijenata. 12-14.04.2019. II

Novartis Expert Summit, Jahorina, BiH. Značaj mutacija kod BCR-ABL1 negativnih MPN pacijenata. MPN Scientific

Meeting. 07.12.2018 godine. Sarajevo, BiH. Metodologija naučnog istraživanja, Forum mladih hematologa. Sarajevo,

07.11.2016 godine. Sarajevo, BiH. Prognostičke mutacije u MF. Molecular signatures of primary myelofibrosis: the

effect on survival and therapy. Continue the Jakavi Journey. Sarajevo, 28.11.2019. Sarajevo, BiH.

Dijagnostika MPN kao terapijski preduslov. Forum mladih hematologa. 25.11.2017. Sarajevo, BiH.

Mutacije kod pacijenata sa MPN. Manage the Jakavi Journey. 07.11.2018. Sarajevo, BiH.

From translational research to clinical application. Udruženje onkologa: godišnji skup. 25.05.2018. Tarčin, BiH.

Trial design for early phase testing of new agents. Udruženje onkologa: godišnji skup. Tarčin, 26.05.2018. Tarčin, BiH.

Sveobuhvatno profiliranje genoma: dešifriranje tumorskog koda. Plenarno predavanje. Dvadeset godina Roche. 8.11.2018. Sarajevo, BiH.

Molekularne karakteristike melanoma. Roche onkološki panel o melanomu: Posvećeni melanomu. Banja Luka, 29-30.11.2019

Precizna medicina u melanomu. Roche onkološki panel o melanomu: Posvećeni melanomu. Banja Luka, 29-30.11.2019

Genetics in Pediatric Cardiology. Organizator: Akademija nauka i umjetnosti BiH 09.2012. Dubrovnik, Hrvatska.

Genetika srcanog ritma. Organizator: Akademija nauka i umjetnosti BiH. 09.2013

12

Sarajevo, BiH. Genetics of colon cancer, BHAAAS. 06/2011 Sarajevo, BiH. Etički aspekti genetičkog testiranja BHAAAS, 06/2011 Sarajevo, BiH. Upotreba FISH kod diagnostike CLL pacijenata. Prvi Kongres Hematologa i

transfuziologa BiH. 2011 Sarajevo, BiH.

2. RADOVI KANDIDATKINJE Ukupno radova: 89

Originalni naučni radovi (7 prije izbora, 30 nakon izbora u vanrednog profesora) Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science): (4 prije izbora, 9 nakon

izbora u vanrednog profesora) Kongresna priopćenja (10 prije izbora, 29 nakon izbora u vanrednog profesora)

Ukupno radova nakon izbora u vanrednog profesora: 68

Originalni naučni radovi: 30. Od toga 9 radova je u Q1 časopisima, 4 u Q2 časopisima Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science): 9. Od toga 8 u Q1

časopisima Kongresna priopćenja: 29. Od toga 5 u Q1 časopisima

2.1. ORIGINALNI NAUČNI RADOVI 2.1.1. Naučni radovi objavljeni prije izbora u zvanje vanrednog profesora (ukupno 7)

1. Kurtovic, A., Widmer, Dickson BJ. (2007) A single class of olfactory neurons mediates behavioral responses to a Drosophila sex pheromone. Nature A single class of olfactory neurons mediates behavioural responses to a Drosophila male sex pheromone. Nature. 446: 542-546. (IF 45.8; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

2. Keleman K, Vrontou E, Kru ttner S, Yu JY, Kurtovic-Kozaric A, Dickson BJ (2012) Dopamine neurons modulate pheromone responses in Drosophila courtship learning. Nature. 489(7414):145-9. (IF 45.8; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

3. Kurtovic A, Jarvis GN, Mantovani HC, Russell JB. (2003) Ability of lysozyme and 2-deoxyglucose to differentiate human and bovine Streptococcus bovis strains. Journal of Clinical Microbiology 41(8): 3951-4. (IF 4.59; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

4. Jarvis GN, Kurtovic A, Hay AG, Russell JB. (2001) The physiological and genetic diversity of bovine Streptococcus bovis strains. FEMS Microbiology Ecology 35(1): 49-56. (IF 4.1; Q1, PubMed/Medline, WoS, SCI Expanded, EBSCHO, Embase, CAS abstracts, itd).

5. Kurtovic-Kozaric A, Mesihovic-Dinarevic S. (2012) Molecular genetics in pediatric cardiology: applications and current advances. Acta Medica Academica, 43(1): 171-189. (IF 0.23; Q3, PubMed/Medline, EBSCOhost, CAB abstracts, CrossRef, itd).

6. Oruc, L, Gavrankapetanovic F, Kozaric A, Memic A. (2011) Public attitudes towards predictive genetic testing of psychiatric disorders. Medicinski Zurnal 17(2): 95-99. (EBSCOhost)

7. Kurtovic-Kozaric A, Bilalovic N, Gavrankapetanovic F. (2010) Development of cytogenetics and molecular diagnostics at the Clinical Center of the University of Sarajevo. Medicinski Zurnal 16(4): 31-37. (EBSCOhost)

13

2.1.2. Naučni radovi nakon izbora u vanrednog profesora

A. Naučnoistraživački radovi objavljeni u priznatim časopisima od posljednjeg izbora (ukupno 30, od toga 9 u Q1, 4 u Q2)

1. Fagnan A, Bagger F, Piqué-Borràs MR, Ignacimouttou C, Caulier A, Lopez C, Robert E, Uzan B,

Gelsi-Boyer V, Aid Z, Thirant C, Moll U, Kurtovic-Kozaric A, Maciejewski JP, Dierks C, Spinelli C, ... Thomas Mercher. Human erythroleukemia genetics and transcriptomes identify master transcription factors as functional disease drivers. Blood. https://doi.org/10.1182/blood.2019003062. In press. 2020. (IF 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

Akutna eritroleukemija (AML-M6 ili AEL) je rijetka agresivna hematološka bolest. Prijašnje

studije su pokazale da AEL leukemijske ćelije često nose kompleskne kariotipove i mutacije u poznatim AML-povezanim onkogenima. Da bi bolje definirali molekularne mehanizme koji vode ka eritroidnom fenotipu, analizirali smo 33 AEL uzorka koja predstavljaju tri genetičke AEL podgrupe koje uključujuje TP53-mutirane, epigentske modulatore-mutirane (npr. DNMT3A, TET2 or IDH2) i nedefinirani slučajevi sa niskim mutacionim burdenom. Etablirali smo eritroidna versus mijeloidna transkriptom-bazirana polja u kojima, neovisno o molekularnoj podgrupi, većina AEL uzoraka je pokazala unikatne karakteristike koje su različite od non-M6 AML i mijelodisplastičnog sindroma. Više od 25% AEL poacijanta, uključujući i genetički nedefinirane uzorke, su pokazali aberantnu ekspresiju ključnih transkripcionih regulatora kao što su SKI, ERG i ETO2. Ektopična ekspresija ovih faktora u mišjim eritroidnim progenitorima je blokirala in vitro eritroidnu diferencijaciju i vodila ka imortalizaciji povezanom sa smanjenjem hromatinske dostupnosti u GATA1 vezanim mjestima i funkcionalnu interferenciju sa GATA1 aktivnosti. In vivo mišji modeli su pokazali razvoj letalnih eritroidnih, miješanih eritroidnih/mijeloidnih ili drugih maligniteta u zavisnosti od ćelijske populacije u kojoj su AEL-vezane alteracije bile eksprimirane. Ovi podaci indiciraju da je AEL molekularno heterogena bolest sa eritroidnim identitetom koji rezultira iz aberantne aktivnosti ključnih eritroidnih transkripcionih faktora u hematološkim matičnim ili progenitorskim ćelijama.

2. Kurtovic-Kozaric A, Przychodzen B, Singh J, Konarska MM, Clemente MJ, Otrock ZK, Nakashima

M, Hsi ED, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Boultwood J, Makishima H, Maciejewski JP, Padgett RA. PRPF8 defects cause missplicing in myeloid malignancies. Leukemia. 2015 Jan;29(1):126-36. doi: 10.1038/leu.2014.144. PubMed PMID: 24781015. (IF 12.1; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

Mutacija u splajsozomu su česte u mijeloidnim neoplazmama. Jedan od mutiranih gena, PRPF8, kodira najkonzerviranijeg proteina splajsozoma. U ovom radu analizirano je 450 pacijenata i nađeno je 15 pacijenata sa mutacijama i 24 pacijenta sa hemizigotnom delecijom. 50% ovih mutacija je nađeno kod pacijenata sa akutnom mijeloidnom leukemijom, koje su bile povezane sa lošom prognozom. PRPF8 aberacije su bile povezane sa povećanim brojem mijeloblasta i prstenastim sideroblastima. RNAi PRPF8 u K562 staničnim linijama i CD34-pozitivinm primarnim stanicama koštane srži su pokazale povećanu proliferativnu sposobnost. RNK duboko sekvenciranje primarnih stanica pacijenata sa PRPF8 abnormalnostima je pokazao konsistentan defekat u spajsingu-prekrajanju RNK. Analizirali smo iste defekte i u kvascu kao modelu, gdje se pokazalo da ovi mutanti imaju zastoj u proof-reading.

3. Kurtovic-Kozaric A, Hasic A, Radich JP, Bijedic V, Nefic H, Eminovic I, Kurtovic S, Colakovic F,

Kozaric M, Vranic S, Bovan NS. The reality of cancer treatment in a developing country: the effects of delayed TKI treatment on survival, cytogenetic and molecular responses in chronic myeloid leukaemia patients. Br J Haematol. 2016 Feb;172(3):420-7. doi: 10.1111/bjh.13843. PubMed

14

PMID: 26554639. (IF 5.67; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Pacijenti sa rakom u zemljama u razvoju imaju ograničen pristup ciljanim terapijama. Na primjer, inhibitori tirozin kinaza (TKI) za hroničnu mijeloidnu leukemiju su često odgođeni. U Bosni, 16% paicjenata su dobili odmah TKI terapiju (<3 mjeseca od dijagnoze), dok 66% pacijenata je dobilo terpiju nakon 14-mjesečnog čekanja. Da bi analizirali efekat odgođenog tretmana na ishod, tri grupe pacijenata su analizirane na osnovu vremena između dijagnoze i tretmana (0-5 mjeseci, 6-12 mjeseci and >13 mjeseci od dijagnoze). Primarni cilj je bila analiza completne citogenteske remisije kao i velikog molekularnog odgovora nakon 12 mjeseci terapije. Nakon 12 mjeseci terapije, stope ulaska u CCyR i MMR na imatinibu su se signifikantno smanjile: CCyR je postignut kod 67% pacijenata u grupi koja je dobila odmah lijek, 18% pacijenata u grupi koja je čekala 6-12 mjeseci, i 15% pacijenata u grupi koja je čekala >13 mjeseci na početak terapije. MMR stope nakon 12 mjeseci su postignute u 10% pacijenata koji su odmah tretirani, 6% pacijenata u 6-12 mjeseci, i 0% u grupi koja je čekala više od 13 mjeseci na početak terapije. Međutim, CCyR i MMR kod pacijenata na nilotinibu nisu bile povezane sa dužinom čekanja. Naši podaci sugeriraju da loši efekti odgođene TKI terapije mogu biti prevaziđene sa nilotibom.

4. Kurtovic-Kozaric A, Kugic A, Hasic A, Beslija S, Ceric T, Pasic A, Vranic S, Kopric D, Iljazovic E,

Todorovic Barbuscia J, Kozaric M, Ibisevic N, Keskic L, Kurtovic S. Long-term outcome of GIST patients treated with delayed imatinib therapy. Eur J Cancer. 2017 Jun;78:118-121. doi: 10.1016/j.ejca.2017.03.024. PubMed PMID: 28437709. (IF 6.68; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

Uvođenje imatinib terapije je signifikantno poboljšao ishod pacijenata sa gastrointestinalnim stromalnim tumorom (GIST). Iako imatinib je poboljšao tretman pacijenata sa GIST, dostupnost u zemljama u razvoju kao što su Argentina, Brazil ili Bosna je bila ograničena radi finansijskih problema i nedostatka pristupa lijeku kroz osiguravajuće fondove. Radi ograničenog broja dostupnih imatinib terapija, mnogi GIST pacijenti nisu dobili lijek. Tijekom nekoliko godina, broj imatinib terapija se postepeno povećavao, ali nikada dovoljno da svi GIST pacijenti imaju potrebnu terapiju. Radi nedostupnosti imatiniba, GIST pacijenti su primili terapiju nakon 1 do 67 mjeseci nakon dijagnoze (medijan čekanja je bio 21 mjesec). Pošto ni jedna studija do sada nije sistematski analizirala efekat odgođenog tretmana imatinibom, analizirali smo efekat odgođene terapije na ukupno preživljenje, vrijeme do progresije i dužinu terapije imatinibom kod GIST pacijenata.

5. Osmanovic A, Halilovic S, Kurtovic-Kozaric A, Hadziabdic N. Evaluation of periodontal ligament

cell viability in different storage media based on human PDL cell culture experiments-A systematic review. Dental Traumatology. 2018 Dec;34(6):384-393. doi: 10.1111/edt.12437. Epub 2018 Oct 21. PubMed PMID: 30193009. (IF 1.49; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Najbolji tretman za avulzirani zub je reimplantacija. Ako to nije moguće, potrebno je zub staviti u transportni medij koji je potreban za održavanje vijabilnosti stanica perodontalnog ligamenta (PDL). Cilj studije je odrediti efikasnost različitih medija koji se koriste za preživljenje PDL stanica avulziranih zuba u in vitro uvjetima. Iz 15 studija, devet medija je analizirano u šest vremenskih perioda. Za vrijeme do 2 sata, HBSS, DMEM, milk, 10% propolis, 20% propolis, i Viaspan su održali više od 80% stanica. Za čuvanje do 24 h, Viaspan je pokazao najbolje preživljenje od 88.4%, zatim DMEM (70.9%) i 10% propolis (68.3%). Mlijeko i HBSS su pokazali sličan procenat (57.2% and 57.3%, respectively). Mlijeko je još uvijek najdostupnije i najjeftinije za većinu situacija.

6. Catic A, Gurbeta L, Kurtovic-Kozaric A, Mehmedbasic S, Badnjevic A. Application of Neural

Networks for classification of Patau, Edwards, Down, Turner and Klinefelter Syndrome based on

15

first trimester maternal serum screening data, ultrasonographic findings and patient demographics. BMC Med Genomics. 2018 Feb 13;11(1):19. doi: 10.1186/s12920-018-0333-2. PubMed PMID: 29439729. (IF 3.06; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Upotreba vještačkih neuralnih mreža (ANN) za genomsku klasifikaciju i uspostavu korelacije genoma i fenotipa se analizirala intenzivno u zadnjih nekoliko godina. Razlog tome jeste da ANN mogu da aproksimiraju kompleksne funkcije, tako da klasifikacija se može uraditi bez potrebe za eksplicitno definiranim input-output modelom. Ovaj alat se može koristiti za optimizaciju postojećih metoda za klasifikaciju bolesti i sindroma. Koristeći bazu podataka od 2500 trudnica, vrijednosti PAPP-A i β-hCG su mjerene, kao i ultrazvučni markeri nuhalnog nabora i prisustvo nazalne kosti. Klasifikacijska sensitivnost je bila 99%. Taačnost feedforward NN je bila 89.6%a feedback 98.8%. Rzultati u ovom članku dokazuju da ekspertni dijagnostički sistem baziran na ANN može da se koristi za klasifikaciju pet sindroma.

7. Asic A, Kurtovic-Kozaric A, Besic L, Mehinovic L, Hasic A, Kozaric M, Hukic M, Marjanovic D.

Chemical toxicity and radioactivity of depleted uranium: The evidence from in vivo and in vitro studies. Environ Res. 2017 Jul;156:665-673. doi: 10.1016/j.envres.2017.04.032. PubMed PMID: 28472753. (IF 5.01; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC, SCI, SCI Expanded, itd).

Glavni cilj ovog rada jeste analizirati trenutno stanje hemijskog toksiciteta i radioaktivnosti osiromašenog urana (DU) i njegovog efekta na žive sisteme i ćelijske linije. Većina in vivo i in vitro studija su koristile životinjske modele što se tiče mogućih efekata uzrokovanih akutnoj ili hroničnoj izloženosti DU. Vrijeme i doza izloženosti, solubilnost DU partikula, kao i isotopi su bili faktori koji su uticali na efekte DU. Posebno se obratila pažnja na formiranje mikronukleusa, epigenetske promjene, i slično. Stoga, ovaj pristup predstavlja novu oblast analize DU-povezanih iradijacijskih efekata na zdravlje.

8. Islamagic E, Hasic A, Kurtovic S, Suljovic Hadzimesic E, Mehinovic L, Kozaric M, Kurtovic-Kozaric

A. The Efficacy of Generic Imatinib as First- and Second-line Therapy: 3-Year Follow-up of Patients With Chronic Myeloid Leukemia. Clin Lymphoma Myeloma Leuk. 2017 Apr;17(4):238-240. doi: 10.1016/j.clml.2017.02.001. Epub 2017 Feb 16. PubMed PMID: 28283298. (IF 2.27; Q3, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Generici imatinib mesilata, prvog inhibitora tirozin kinaza, koji ciljaju fuzioni protein BCR-ABL1, su odobreni u mnogim zemljama kao alternativne, jeftine forme tretmana pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Cilj ove studije je da se evaluariaju dugoročni ishodi pacijenata sa CML-om koji su dobili prvu ili drugu liniju terapije sa genericima u Bosni i Hereegovini. Ovo je multicentrična retrospektivna studija pacijeanta koji su tretirani sa generičkim imatinibom od septembra 2013 do avgusta 2016 godine. Pacijenti su bili kategorizirani u dvije grupe: Grupa 1(n = 27) je uključivala novodijagnosticirane pacijente sa CML-om koji su dobijali prvu linije generičkog imatiniba, a Grupa 2 (n = 14) su pacijenti koji su primali prvu liniju Gliveca i prebačeni su na drugu liniju imatiniba. Medijan praćenja je bio 16 i 36 mjeseci za Grupu 1 i 2. Nakon 36 mjeseci, ukupno preživljenje za Grupu 1 je bilo 85%, a 81% pacijenata je imalo kompletan citogenetski odgovor. Nakon 24 mjeseca, veliki molekularni odgovor je bio 48%. Ukupno, 52% pacijenata se prebacilo sa prve linije generika na nilotinib radi zatajenja ili nus efekata. U Grupi 2, 93% pacijenata je zadržalo citogenetski i molekularni odgovor nakon 3 godine poslije prelaska sa Gliveca na genetički imatinib. Naši rezultati pokazuju da generički imatinib nema loš uticaj na ishod pacijenata.

9. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A, Frkatovic A, Smajlovic S, Letra A. Quantitative Analysis of CCL5 and ep300 in Periapical Inflammatory Lesions. Acta Med Acad. 2019 Aug;48(2):129-139. doi: 10.5644/ama2006-124.251. PubMed PMID: 31718213. (IF 0.23; Q3, PubMed/Medline, EBSCOhost, CAB abstracts, CrossRef, itd).

In silico bioinformatička analiza je pokazala da ekspresija dva gena, CCL5 (C-C Motif Chemokine Receptor 5) i ep300 (Histone acetyltransferase p300) može biti potencijalni novi biomarker za diferencijaciju između periapikalnih granuloma i radikularnih cisti. Stoga, naša hipoteza je bila da ekspresija CCL5 i ep300 u periapikalnim lezijama bi mogla klasificirati lezije kao granulome ili

16

ciste. Uzorci 122 pacijenta su uključivala 46 periapikalne granulome, 38 radikularnih cisti i 38 zdravih gingiva kao kontrola. Real-time PCR analiza transkripata ova dva gena je uspoređena sa SDHA kao referencom. Klinički parametri, npr. intenzitet inflamacije i veličina lezije, su se mjerile i korelirale sa CLL5 i ep300 ekspresijom. ROC i logistička regresija su se koristile da se dijagnostički karakteriziraju ΔCt vrijednosti. Granulome i radikularne ciste su imale signifikantno povećanu ekspresiju CLL5 i ep300 u poređenju sa kontrolama. Međutim, nije bilo razlike kada su se usporedili granulomi sa cistama. ROC analiza je pokazala da CCL5 i ep300 su imale dobru dijagnostičku tačnost, ali nisku za razlikovanje između lezija.

10. Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Komic H, Bilalovic N, Eminovic I, Burekovic A, Uzunovic A,

Kurtovic S. The effects of mutational profiles on phenotypic presentation of myeloproliferative neoplasm subtypes in Bosnia: 18 year follow-up. Bosn J Basic Med Sci. 2019 Oct 30. doi: 10.17305/bjbms.2019.4391. PubMed PMID: 31668145. (IF 2.14; Q3, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Identifikacija uzajamno nepodudarnih somatskih mutacija koje se mogu naći kod pacijenata sa mijeloproliferativnim neoplazmama se pokazala kao moćan alat za analizu evolucije MPN kao bolesti. Kliničke karakteristike, genske mutaicje, i preživljenje preko 18 godina su se analizirale kod MPN pacijenata. 138 MPN pacijenata je subkategorizirano prema MPN subtipovima: esencijalna trombocitopenija (ET, n=41), polycythemia vera (PV, n = 56), primarna mijelofibroza (PMF, n = 10), and MPN nekalsificirani (MPN-U, n = 31). Karakteristike pacijenata su uključivale kliničke parametre, ukupno preživljenje, mutacioni status gena JAK2, CALR i MPL. Uporedili smo hematološke i kliničke osobine JAK2V617F-ET naspram CALR-mutiranim ET naspram JAK2V617F-PV pacijentima. JAK2V617F pacijenti su imali više vrijednosti eritrocita, hemoglobina i hematokrita u poređenju sa CALR-mutiranim pacijentima. Mutant alel burden kod JAK2V617F-PV i JAK2V617F-ET pacijenata je direktno korelirala sa eritrocitima, hemoglobinom i hematokritom, ali inverzno sa brojem trombocita. Stoga, alel burden je indikator kliničkog fenotipa JAK2V617F-MPN pacijenata. Mutacioni status nije imao efekta na ukupno preživljenje. U sažetku, JAK2, CALR i MPL geni imaju specifične hematološke potpise.

11. Hadziabdic N, Dzinovic E, Udovicic-Gagula D, Sulejmanagic N, Osmanovic A, Halilovic S, Kurtovic-

Kozaric A. Nonsyndromic Examples of Odontogenic Keratocysts: Presentation of Interesting Cases with a Literature Review. Case Reports in Dentistry. 2019 Aug 14;2019:9498202. doi: 10.1155/2019/9498202. eCollection 2019. PubMed PMID: 31511794. (PubMed/Medline, WoS Core Collection, SCI Expanded, itd).

Odontogene keratociste (OKC) se mogu pojaviti u bilo kojem dobu. Uglavnom se pojavljuju u drugoj i trećoj dekadi života. U poređenju sa drugim odontogenim cistama, ovaj tip se može naći u oko 5-15% slučajeva. Češći je u mandibularnoj regiji i kod muškaraca. HIstološki, OKC se karakteriziraju prisustvom eksterne kapsule vezivnog tkiva, sa keratinizirajućim epitelom koji se sastoji iz 5-8 ćelijskih ninova sa značajnom palisadizacijom polariziranih bazalih ćelija i sa korugiranim parakeratinim nivoom. Ova studija prezentira slučajeve odontogenih keratocisti, sa referencom na zadnju klasifikacijom i dilemama. Ovaj projekat se realizira kao deskriptivna studija, sa prikazom slučaja. Detaljna histopatološka analiza, terapeutski pristup je prikazan.

12. Mehinovic L, Islamagic E, Husic-Selimovic A, Kurtovic-Kozaric A, Vukobrat-Bijedic Z, Suljevic D.

Evaluation of Diagnostic Efficiency of Alpha-Fetoprotein in Patients with Liver Cirrhosis and Hepatocellular Carcinoma: Single-Center Experience. Open Access Maced J Med Sci. 2018 Sep 24;6(9):1668-1673. doi: 10.3889/oamjms.2018.344. eCollection 2018 Sep 25. PubMed PMID: 30337985. (Pubmed, WoS, EBSCO, Hinari, Google scholar, Mendeley, SCImago Journal & Country Rank (SJR)).

Koncentracija AFP u serumu je dijagnostički alat koji je specifičan za hepatocelularni karcinom (HCC) kod pacijenata sa cirozom jetre. Ova studija je imala za cilj da analizira dijagnostičke

17

vrijednosti AFP kod HCC i korelira ih sa stadijem bolesti. Uključeno je 50 pacijenata sa cirozom jetre i 50 pacijenata sa HCC. Signifikantna razlike je uočena između pacijenata sa cirozom jetre i HCC u vrijednostima AST, ALT, GGT, bilirubin, AFP i AP. Pacijenti sa HCC su imali više nivoe AFP u poređenju sa pacijentima sa cirozom jetre. Veličina površine ispod ROC krive (AUC) je bila 0.877, što pokazuje da je AFP dobar biomarker koji zadovoljava dijagnostičke kriterije u razlikovanju pacijeanta sa HCC i cirozom jetre.

13. Kurtovic-Kozaric A, Vranic S, Kurtovic S, Hasic A, Kozaric M, Granov N, Ceric T. Lack of Access to

Targeted Cancer Treatment Modalities in the Developing World in the Era of Precision Medicine: Real-Life Lessons From Bosnia. Journal Global Oncology. 2018 Sep;4:1-5. doi: 10.1200/JGO.2016.008698. Epub 2017 May 4. PubMed PMID: 30241174. (IF 1.79; Q2, Pubmed, EBSCO, Hinari, Google scholar, Mendeley, SCImago Journal & Country Rank (SJR).

Pacijenti sa rakom u zemljama u razvoju imaju ograničen pristup ciljanim terapijama protiv raka. Tranzicijska priroda ovih ekonomija je imala uticaja na finansiranje zdravstvene njege, koja je rezultirala nedostupnošću ciljanih terapija. Osim tri studije koje su ovdje opisane, ne postoji literatura koja opisuje klinički ishod pacijenata tretiranih sa odgođenom ciljanom terapijom. Da bi podigli svijest o važnosti i pravovremenom tretamanu pacijenata sa rakom, nekoliko stvari će biti analizirane: 1) nizak broj ciljanih terapija za razne tipove raka, 2) odgođeni tretman, 3) nedostupnost dijagnostike.

14. Bešić L, Muhović I, Mrkulić F, Spahić L, Omanović A, Kurtovic-Kozaric A. Meta-analysis of

depleted uranium levels in the Middle East region. J Environ Radioact. 2018 Dec;192:67-74. doi: 10.1016/j.jenvrad.2018.06.004. PubMed PMID: 29890359. (IF 2.35; Q1-Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Kontaminacija osiromašenim uranijom tokom rata u Zalivu nije detaljno istražena, posebice moguća poveznica sa zdravljem populacije. Autori ove studije su imali za cilj da selektiraju podatke bazirane na striktim uključujućim i isključujućim kriterijima. Cilj je bio da se razjasni stopa kontamijacije sa DU tokom ratova u Zalivu u formi meta-analize. Autori su pokušali da koreliraju podatke o DU nivoima i mogućim efektima na populacije. Komparacija omjera isotopskih aktivnosti 234U/238U i 235U/238U, kao i maseni omjer 235U/238U u zraku, vodi, zemlji i hrani u uzorcima iz zemalja Bliskog istoka, kontaminacija nije nađena u Alžiru, Izraelu, Afganistanu, Omanu, Kataru, Iranu i Jemenu. Radi limitiranog broja pouzdanih podataka o zdravstvenom statusu populacija, nije bilo moguće napraviti korelaciju između niova DU i zdravstvenih efekata.

15. Catic A, Kurtovic-Kozaric A, Johnson SH, Vasmatzis G, Pins MR, Kogan J. A novel cytogenetic and

molecular characterization of renal metanephric adenoma: Identification of partner genes involved in translocation t(9;15)(p24;q24). Cancer Genetics. 2017 Aug;214-215:9-15. doi: 10.1016/j.cancergen.2017.03.001. PubMed PMID: 28595733. (IF 2.18; Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd).

Renalni metanefrični adenom je rijetiki benigni tumor koji je često pogrešno klasificiran kada se koristi samo mikroskopske karakteristike. Korektna klasifikacija renalnog tumora je važna za dijagnostički, prognostički i terapeutski pristup. Recentni podaci su pokazali da 90% MA ima BRAF V600E mutacije, a 10% je nejasno. Našli smo prisustvo t(9;15)(p24;q24) povezanih sa MA. Identificirali smo partnere u translokaciji, i to KANK1 gen na hromosomu 9 i NTRK3 gen na hromosomu 15. Mate-pair genomsko sekvenciranje je validiralo translokaciju i uključene gene.

16. Besic L, Muhovic I, Asic A, Kurtovic-Kozaric A. Meta-analysis of depleted uranium levels in the

Balkan region. J Environ Radioact. 2017 Jun;172:207-217. doi: 10.1016/j.jenvrad.2017.03.013. Epub 2017 Apr 7. PubMed PMID: 28395154. (IF 2.35; Q1-Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd).

18

Kontradiktorni podaci postoje o vezi između prisustva osiromašenog uranija i povećane incidence kod vojnika koji su bili u ratovima na Balkanu 1992-1995. Dosta istraživanja je analiziralo vezu između osiromašenog uranija u regionu. Cilj ove studije je da se prikupe podaci o prethodno objavljenim izvještajima o nivoima osiromašenog urana na Balkanu i prezentirati ga u obliku meta-analize. Testirali smo hipotezu da postoji korelacija između nivoa osiromašenog urana i zdravstvenih efekata. Naši rezultati sugeriraju da većina mjesta posjeduje prirodni uranij, dok Kosovo izgleda da ima najviše zagađenja sa osiromašenim uranom. Rezultati indiciraju da se ne može povući validna korelacija između zdravstvenih efekata i osiromašenog urana.

17. Dogan S, Cilic A, Marjanovic D, Kurtovic-Kozaric A. Detection of cytosine and CpG density in

proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2017 Apr 3;36(4):302-316. doi: 10.1080/15257770.2017.1279738. Epub 2017 Mar 21. PubMed PMID: 28323522. (IF 1.16; Q3-Q4, PubMed/Medline, CAS, EBSCOhost, EMBASE, Scopus, Science Citation Index Expanded, Web of Science, itd).

Aberantna metilacija vodi ka razvoju kancera. Iako stopa metilacije izgleda jako varijabilna u genomu, uglavnom se očituje kao modifikacija histona, organizacija hromatina, dostupnost DNK ili promotor sekvence. U ovoj studiji smo pokazali da C ponavljajuće sekvence koje se sastoje iz dva do sedam ponavljajućih citozina imaju različitu gustinu kod proto-onkogena, tumor supresora nego kod kontrolnih gena.

18. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, Mesanovic S, Jaros T, Stomornjak-Vukadin M,

Mackic-Djurovic M, Ibrulj S, Kurtovic-Basic I, Kozaric M. Ten-year trends in prevalence of Down syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2016 Nov;206:79-83. doi: 10.1016/j.ejogrb.2016.08.038. Epub 2016 Sep 12. PubMed PMID: 27639605. (IF 1.8; Q2, PubMed/Medline, CAS, EBSCOhost, EMBASE, Scopus, Science Citation Index Expanded, Web of Science, itd).

Ova studija analizira trendove prevalence sve rođene kao i živorođene djece sa trisomijom 21 (T21) u poređenju sa majčinom dobi i uvođenjem prenatalne dijagnoze u Bosnu i Hercegovinu. Prenatalna dijagnostika se uvela u januaru 2008 u 3 bolnice, i analizirana je do 31.12.2015 godine. U ovoj studiji, 99 fetusa i 330 novorođenčadi je dijagnosticirano sa T21 u trajanju studije. Svake godine, 33 T21 osobe su se rodile i 13 T21 fetusa je dijagnosticirano prenatalno. Incidenca za živorođene T21 u Bosni je 1:999. Prevalenca živorođenih T21 je 9.6 na 10.000 porođaja, sa ukupnom prevalencom od 19.1. Ukupna T21 prevalenca se eksponencijalno povećala sa starijom dobi majke. Prenatalna T21 prevalenca je 1.29 na 10,000 porođaja za majke <35, ali se eksponencijalno povećava sa dobi (32 za majke starije od >40 godina). Najčešća indikacija za invazivni prenatalni test je bila ultrazvučni pregled zajedno sa biohemijskom analizom seruma, kao i starija dob majke. Prevalenca živorođenih T21 je ostala konstantna. Iako povećanje dobi majke u zadnjoj deceniji je uticala na povećanje totale T21 prevalence, efekat prenatalne dijagnostike na živorođenu djecu je bio minimalan, što dovodi do zaključka da prenatalni skrining se treba poboljšati.

19. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Basic I, Catibusic F, Kozaric

M, Mesihovic-Dinarevic S, Hasanhodzic M, Glamuzina D. Diagnostics of common microdeletion syndromes using fluorescence in situ hybridization: single center experience in a developing country. Bosn J Basic Med Sci. 2016 Mar 3;16(2):121-5. doi: 10.17305/bjbms.2016.994. PubMed PMID: 26937776. (IF 2.14; Q3, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

Mikrodelecijski sindromi nastaju zboj hromosomalni delecija od manje od 5 megabaza, a koji se mogu detektirati putem fluorescentne in situ hibridizacije (FISH). Evaluirali smo najčešće mikrodelecije u periodu od 01.06.2008 do 01.06.2015 godine u Federaciji Bosne i Hercegovine,

19

uključujući DiGeorge, Prader-Willi/Angelman, Wolf-Hirschhorn, and Williams sindrome. Nađena su 4 pacijenta sa DiGeorge sindromom, 4 pacijenta sa Prader-Willi/Angelman, 4 pacijenta sa Wolf-Hirschhorn sindromom, and 3 pacijenta sa Williams sindromom. Izračunata je incidenca za Federaciju BiH. Ovo su prve raportirane frekvencije mikrodelecijskih sindroma u FBiH.

20. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A, Pojskic N, Sulejmanagic N, Todorovic L. Gene-expression

analysis of matrix metalloproteinases 1 and 2 and their tissue inhibitors in chronic periapical inflammatory lesions. J Oral Pathol Med. 2016 Mar;45(3):224-30. doi: 10.1111/jop.12347. PubMed PMID: 26293377. (IF 2.14; Q2, PubMed/Medline, WoS, SCI, SCI Expanded, CAS itd).

Periapikalne inflamatorne lezije su instraživane ranije, ali razumijevanje patogeneze ovih lezija (granuloma i radikularnih cisti) na molekularnom nivou je još uvijek diskutabilno. Matriks metaloproteinaze (MMP) su enzimi koji su uključeni u razvoj periapikalnih lezija, posebno u inflamaciji i destrukciji tkiva. Da bi razumjeli patogenezu peripaikalnih granuloma i radiularnih cisti, uradili smo detaljnu analizu genske ekspresije MMP-1, MMP-1 i njihovih tkivnih inhibitora TIMP-1 i TIMP-2. Ukupno 149 uzoraka je analizirano putem real-time PCR metode (59 radikularnih cisti, 50 periapikalnih granuloma i 40 zdravnih uzoraka gingive kao kontrole) za ekspresiju MMP-1, MMP-2, TIMP-1 i TIMP-2 gena. Određen je najbolji referentni gen, i to SDHA. POkazali smo da β-actin i GAPDH nisu najstabilnije referentne kontrole za gensku ekspresiju inflamatornih periapikalnih tkiva i zdrave gingive. Našli smo da granulomi i radikularne ciste imaju signifikantno povećanu ekspresiju sva četiri analizirana gena, MMP-1, MMP-2, TIMP-1 i TIMP-2 u poređenju sa kontrolama. Međutim, nije nađena razlika u ekspresiji između periapikalnih granuloma i radikularnih cisti.

21. Dogan S, Cilic A, Kurtovic-Kozaric A, Ozturk F. Detection of G-type density in promoter sequence

of colon cancer oncogenes and tumor suppressor genes. Bioinformation. 2015 Jun 30;11(6):290-5. doi: 10.6026/97320630011290. PubMed PMID: 26229289. (PubMed, PubMed Central (PMC), EBSCO, SCI Emerging source citation Index, Web of Science).

Gvanin bogata mjesta su prisutna u humanom genomu. Prethodne studije su pokazale prisustvo G bogatih sekvenci i motiva mogu biti važne za funkciju gena i njihovu aktivnost. Fokusirali smo se na identifikaciju G bogatih motiva u promotorima i tumor supresorima, gdje smo analizirali 100 najčešćih onkogena i tumor supresorskih gena. Sekvenca od 600 nukleotida, od -500 do 100 TSS (transcription start site) od onkogena i tumor supresorskih gena su analizirane, gdje je izračunata gustina gvanina. U analizu su bile uključene G ponavljajuće sekvence od 2 do 7 G. Rezultati su pokazali da se G gustina povećava od -500 do 100 i više kod tumor supresorskih gena. G gustina je imala maksimum u -/+100 od TSS. Gustina G je upoređena sa ekspresijom onkogena i tumor supresorskih gena kod pacijenata sa kolorektalnim karcinomom (n=174).

22. Islamagic E, Kurtovic S, Kozaric M, Hadzimesic ES, Hasic A, Mehinovic L, Kurtovic-Kozaric A. The

Three Year Follow-up of CML Patients Treated with First-line Generic and First-line Branded Imatinib in Bosnia and Herzegovina. International Journal of Hematology and Oncology. 2017;27(1),8-12. (IF 1.67; Web of Science, CrossRef, EBSCO, SCI Emerging source citation Index, CAS, Scopus).

Imatinib mesilat, selektivni BCR-ABL tirozin kinazni inhibitor, je etabliran kao standard u liječenju pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. U ovoj studiji, uporedili smo trogodišnje kliničke ishode pacijenata koji su dobili prvu liniju Gliveka (Grupa 1) sa pacijentima koji su dobili prvu liniju genetičkog imatiniba (Grupa 2) u Bosni i Hercegovini. Na 24 mjeseca nakon početka terapije, kompletan citogenetski odgovor i veliki molekularni odgovor su bili slični u dvije grupe (CCyR je bio 69% v. 70%; MMR je bio 54% vs. 48%). Pacijenti na prvoj liniji generičkog imatiniba su imali veću stopu zatajenja u poređenju sa pacijentima koji su tretirani prvom linijom terapije.

20

23. Hadziabdic N, Sulejmanagic H, Kurtovic-Kozaric A. (2017) The role of general dental practitioners in the detection of early-stage oral malignancies--A review. Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, Medicine and Pathology. 29: 363-376. (SiteScore 0.23; Scopus).

Pošto je rana dijagnoza važna u prognozi oralnog kancera, opći stomatolog mora imati sposobnost da prepozna kliničke znake i simptome ove bolesti. Ovaj revijalni članak opisuje ulogu stomatologa u prepoznavanju ranih stadija oralnog kancera.

24. Dogan S, Kurtovic-Kozaric A. Changes of Molecular, Cellular and Biological Activities According to

microRNA-mRNA Interactions in Ovarian Cancer. Computational Molecular Biology. 2015;5 (4); 1-8. (CrossRef).

mikroRNK je nekodirajuća RNK sekvenca, 20-22 nukleotida, koja ima funkciju u utišavanju genske ekspresije. Promjene u normalnoj mikroRNK ekspresiji vodi ka tumorskoj progesiji. Ova studija je urađena da se pojasne promjene u ekspresiji mikroRNK u kanceru ovarija u poređenju sa normalnom ekspresijom. U uzorcima tumora, od 680 mikroRNK tipova, 230 je imalo visoku ekspresiju, 295 je imalo nisku ekspresiju i 155 nije bilo eksprimirano. Kada smo kategorizirali mikroRNK na osnovu povećanja od >50 puta, našli smo 31 visoko i 89 nisko eksprimiranu mikroRNK. Velike razlike u aberantnoj ekspresiji su pokazale obim promjena koje imaju mikroRNK. Koristeći Cancerminer alatku, našli smo da mRNK mete ovih aberantno ekprimiranih mikroRNK. Našli smo da većina gena koje smo pronašli imaju ulogu u ćelijskoj proliferaciji i karcinogenezi.

25. S Dogan, A Kurtovic-Kozaric, A Hajrovic, M Lisic, E Gokgoz. (2016) Comparison of mll fusion genes

expression among the cytogenetics abnormalities of acute myeloid leukemia and their clinical effects. J Biom Biostat 7 (312), 2. (PubMed/Medline).

Mixed-lineage leukemia (MLL) je podtip akutne mijeloidne leukemije sa agresivnijom prognozom od drugih podtipova. Translokcije MLL gena sa drugim partner genima formira MLL fuzione proteine kao glavne karakteristike MLL leukemije. Dosta studija je demonstriralo da MLL fuzije kao što su MLL-AF4, MLL-AF6, MLL-AF9, MLL-AF10, MLL-ENL, MLL-ELL, MLL-EPS15 su najčešće abnormalnosti koji igraju signifikantnu ulogu u MLL leukemijama.

26. S Dogan, A Kurtovic-Kozaric, G Karli. (2016) The Detection of Extremely High and Low Expressed

Genes by EGEF Algorithm in Invasive Breast Cancer. J Biom Biostat 2016 7 (286), 2. DOI: 10.4172/2155-6180.1000286 (PubMed/Medline).

Invazivni rak dojke je heterogena bolest. Analiza ekspresije jedne ili grupe specifičnih gena nije dovoljna da se razumije molekularna aktivnost ćelija raka. Stoga, potrebna je metoda koja daje priliku da se uporede slične povišene ili smanjene ekspresije gena. Glavni cilj ovog rada je da se sortiraju ekstremno visoko i nisko eksprimirani geni, da se ekstrahuje, uporede i prikupe ti geni. Ekspresioni profili 598 uzoraka invazivnog raka dojke i 48 uzoraka normalnog tkiva je analizirano da se napravi novi algoritam pod nazivom Extreme Gene Expression Family (EGEF). EGEF agoritam sortira, grupiše i upoređuje najviše i najniže ekpresije gena.

27. M Karatas, Y Turan, A Kurtovic-Kozaric, S Dogan. (2016) Analysis of Gaucher Disease Responsible

Genes in Colorectal Adenocarcinoma. J Biom Biostat 7 (314), 2. (PubMed/Medline). Gaucher bolest je nasljedna genetička abnormalnost sa defektima u sfingolipidom katabolizmu.

Mutacije GBA gena koji kodira lisozomalnu β-glucosidazu je glavna karakteristika ove bolesti, a koja se takođe može naći u različitim vrstama kancera. Da bi se našla poveznica između ovog oboljenja i adenokarcinoma debelog crijeva, genska ekspresija je analizirana tako što se uporedila ekspreija gena u adenokarcinomu i Gaucher. Geni GBA, GBA2, GBA3, SCARB2 i PSAP imaju naviše promjena u genskoj ekspresiji.

21

28. M Kozaric, M Hukic, A Hasic, A Kozaric, A Kurtovic-Kozaric. (2016) Clinical Significance of Conventional Karyotype and QF-PCR in Detection of Fetal Chromosomal Abnormalities. Journal of Fetal Medicine. 4 (1), 7-12 DOI 10.1007/s40556-016-0108-9. (Google Scholar).

Ova studija upoređuje prednosti dvije metode za detekciju fetalni hromosomalnih aberacija: kariotip i QF-PCR, zajedno sa indikacijama za invazivnu prenatalnu dijagnozu. Retrospektivno smo analizirali 888 amniocenteza sa ili bez kariotipizacije u kombinaciji sa QF-PCR. Uporedili smo rezultate ovih analiza sa indikacijama za prenatalno testiranje: starija dob majke, ultrazvučni pregled i serumski skrining. Našli smo 39 (4.4%) abnormalnosti, gdje je 59% svih abnormalnosti bilo numeričke, dok je 41% bilo strukturne abnormalnosti koje se ne mogu detektirati sa QF-PCR. Mnoge sturkturne abnormalnosti nemaju kliničku signifikantnost i našli smo da 23% strukturnih abnormalnosti su klinički signifikantne ali nedetektabilne putem QF-PCR (0.3% svih amniocenteza). Iako je QF-PCR brza i pouzdana metoda za detekciju većine fetalnih aneuploidija, kariotip se treba koristiti ako postoji sumnja na druge abnormalosti.

29. L Mehinović, Z Vukobrat-Bijedić, A Husić-Selimović, A Kurtović-Kozarić, et al. (2018) Association

between alpha-fetoprotein and other serological markers in patients with hepatocellular carcinoma: one center's experience. Journal of IMAB–Annual Proceeding Scientific Papers. 24 (3), 2160-2165. (Google Scholar, CrossRef).

U ovoj studiji analizirani su biohemijski parametri u serumu pacijenata sa dijagnozom hepatocelularnog karcinoma (HCC) C i B virusne etiologije. Svi pacijenti, 31 muškarac i 20 žena, sa dijagnozom HCC su tretirani na Kliničkom centru Univerziteta u Sarajevu. Serum alfa-fetoprotein je analiziran kao tumorski marker kao i hepatitis markeri kao što su HBs Ag, anti-HBs, anti-HBc, anti-HCV and anti-HB. Najveći broj pacijenata (68.62%) je imao cirozu jetre sa C viralnom etiologijom a koji su razvili kancer. SIngifikantne razlike u AST i ALT su nađene između muškaraca i žena. Pozitivna korelacija je etablirana između AFP i drugih parametara, dok su signifikantne razlike nađene između AFP i γGT.

30. A Kurtovic-Kozaric, L Mehinovic, H Komic, M Kozaric, A Husic-Selimovic, Ziegler M, Liehr T.

(2017) Human Cytogenetics Case Report Yet Unreported Heteromorphic Variant in Chromosome 17. J Genetics Genomes 1 (101), 2. (Google Scholar, CrossRef).

Heteromofne varijante kao što su Yq12 se mogu ubaciti u autosomalne hromosome, gdje je do sada nađeno da su bili ubačeni u hromosome 1, 7, 11, 13, 14, 15, 21 i 22. Ovdje opisujemo novu iserciju Yq12 heterohromatina u hromosom 17. Metode: GTG-, C-banding, fluorescentna in situ hibridizacija (FISH), kao i human heterohromatin specifične multicolor FISH probe (HCM-mix). Whole chromosome painting (wcp) proba za #17 zajedno sa probom za Yq12 heterohromatin was je hibridizirana za uzorak pacijenta. Y mikrodelecije su urađene da se detektuju moguće AZF delecije. Muški pacijent je imao normalnu analizu sperme i nije imao delecije AZF regiona. GTG i C bojenje je pokazalo dodatni band na 17q21. FISH studije su otkrile da insercija je derivirana od Yq12.

B. Cjeloviti originalni naučnoistraživački radovi objavljeni u zbornicima međunarodnih

skupova– Proceedings od posljednjeg izbora (ukupno 9, od toga 8 u Q1) 31. Hadzimesic Suljovic E, Radovic S, Sofo-Hafizovic A, Kurtovic-Kozaric A. (2017) BCL2 and Ki-67

as independent predictors of poor risk IPI group of patients with diffuse large B cell lymphoma. Haematologica 102: 286. PB2087. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Analizirani su imunohistohemijski parametri BCL2 i Ki-67 na uzorcima difuznog velikostaničnog limfoma koji su se pokazali kao nezavisni prediktori lošeg ishoda pacijenata koji su klinički svrstani u IPI rizičnu grupu.

22

32. Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. (2017) Front-line nilotinib is a better choice than front-line imatinib for CML patients with delayed treatment: 11 year follow-up. Haematologica 102: 286. PB1837. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Pacijenti sa hroničnom mijelodnom leukemijom su tretirani sa dvije vrste lijekova, imatinibom i nilotinibom. Pacijenti koji su čekali napočetak terapije i terapiju započeli sa nilotinibom su imali bolji ishod nego pacijenti koji su započeli terapiju sa imatinibom. Pacijenti su praćeni 11 godina.

33. Catic A, Sophian A, Mazur L, Kurtovic-Kozaric A, et al. (2017) The frequency of a novel KANK1 and NTRK3 translocation and BRAF(V600E) mutation in patients diagnosed with metanephric adenoma utilizing molecular mechanisms. Journal of Clinial Oncology. 35 (15): 1537. 20. 05.2017. Poster prezentacija. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Nova translokacija je nađena u uzorcima metanefričnog tumora, i to između hromosoma 9 i 15. Molekularnim metodama je pokazano da je translokacija u KANK1 i NTRK3 genima. Dodatne analize su pokazale da metanefrični adenomi koji nemaju ovu translokaciju sadrže BRAF V600E mutaciju.

34. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Beslija S, et al. (2017) Long term efficacy of nilotinib as front- and second-line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Journal of Clinical Oncology. 35 (15): e18549. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

U ovom radu se analiziraju dugoročni efekti TKI nilotiniba kao prva i druga linija terapije u liječenju pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Pacijenti imaju bolji ishod ako su liječeni odmah sa nilotinibom nego ako su liječeni prvo sa imatinibom a onda sa nilotinibom.

35. Kurtovic Kozaric A, Kugic A, Kurtovic A, Beslija S, et al. (2016) The effects of delayed imatinib mesylate treatment on outcome in patients with GIST. Journal of Clinical Oncology. 35 (15): e22518. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

U ovom radu se analizira efekat odgođenog tretmana sa imatinibom na pacijente sa gastrointestinalnim tumorom. Efekat čekanja nije jako izražen, te pacijenti koji su čekali na imatinib imaju sličan ishod kao i oni koji su ga odmah primili.

36. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Radich JP, et al. (2016) The comparison of efficacy between generic and branded imatinib in achievement of overall survival and cytogenetic responses in CML patients in Bosnia and Herzegovina. Blood. 128 (22): 5451. 02.12.2016. (IF: 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Komparacija efikasnosti generičkog i brendiranog imatiniba je pokazala sličnost u ukupnom preživljenju, citogenetskom odgovoru i molekularnom odgovoru pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom.

37. Mehinovic L, Kozaric A, Dizdarevic A, et al. (2016) Clinical characteristics of acute myeloid leukemia patients from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica. 101 (1): 385-386. E941. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Pacijenti sa akutnom mijeloidnom leukemijom imaju lošije kliničke parametre u poređenju sa pacijentima koji dolaze iz oblasti pogođenih ratnim dešavanjima (bombardovanje sa artiljerijom koja ima osiromašeni uranij).

38. Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S. (2016) Clinical characteristics of patients with myeloid neoplasms from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica. 101(1): 506-506. E1228. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Pacijenti sa mijeloidnim neoplazmama kao što su AML, MDS i MPN imaju lošije kliničke parametre u poređenju sa pacijentima koji dolaze iz oblasti pogođenih ratnim dešavanjima (bombardovanje sa artiljerijom koja ima osiromašeni uranij).

23

39. Catic A, Kurtovic-Kozaric A, Sophian A, et al. (2018) Prevalence of KANK1-NTRK3 fusion in renal metanephric adenomas that lack BRAF mutations. Cancer Genetics. 224:59. 23. 08.2018. (IF 2.18; Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

Analiza metanefričnih adenoma koji imaju prisustvo KANK1-NTRK3 a nemaju BRAF mutaciju. C. Kongresna priopćenja nakon izbora u zvanje vanrednog profesora (ukupno 29, od toga 5

u Q1) 40. Dogan S, Kozaric A, Fatih Ozturk. (2015) New Possible Targetable Genes For Future Treatment of

MLL Leukemias. NCRI National Cancer Conference. Liverpool, UK. Novembar 9-11, 2015. Oralna prezentacija. (O)

41. Dogan S, Kurtovic-Kozaric A, Marjanovic D, Turan Y. (2015) Differential gene expression and methylation signatures of mixed lineage leukemias. Abstract number: ABS-465-ISABS-2015. Ninth ISABS Conference on Forensic, Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-26, 2015. (P)

42. Kozaric M, Godinjak Z, Nefic H, Kurtovic-Kozaric A. (2015) Clinical significance of conventional karyotype and qf-pcr in detection of fetal chromosomal abnormalities: 3-year single centre evaluation” Abstract number: ABS-462-ISABS-2015. Ninth ISABS Conference on Forensic, Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-26, 2015. (P)

43. Mehinovic L, Kurtovic-Kozaric A, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Basic I. (2015) Detection of chromosomal microdeletions and structural rearrangements in the pediatric population using conventional karyotyping and fluorescence in situ hibridization. II Symposium of Geneticists in B&H with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015. (P)

44. Kurtovic-Basic I, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Konjhodzic R. (2015) Cytogenetics and molecular-cytogenetics diagnostics of triploidy. II Symposium of Geneticists in B&H with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015. (P)

45. Komic H, Mehinovic L, Islamagic E, Eminovic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Detection of Y microdeletion in Bosnian males with fertility disorders. European Journal of Human Genetics. 2017 24 (1): E-P01.64. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (P)

46. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic-Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Potential risk of myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. 2017 24

(1): E-P07.40. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

47. Kurtovic-Kozaric A, Komic, Mehinovic L, et al. (2019) Incidence of Y chromosome microdeletions in different world populations: systematic review. European Human Genetic Conference, P01.94B. Poster prezentacija. Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1174–1813 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0494-2. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

48. Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Kurtovic-Kozaric A. (2019) How we treat CML patients in developing countries: 13 years experience. European Human genetic conference, E-P07.01 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

49. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Islamagic E, et al. (2019) Clinicopathological characteristics of patients with myeloid neoplasms: 20 year follow up. European Human genetic conference, E-

24

P07.05 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (P)

50. Komic H, Islamagic E, ... Kurtovic-Kozaric A. (2019) Clinical outcome of patients with JAK2, CALR and MPL positive myeloproliferative neoplasms. European Human genetic conference, E-P07.06 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

51. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, et al. (2016) Ten-year trends in prevalence of Down syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. European Journal of Human Genetics. 24 (1): 59. Poster prezentacija. 21-24.05.2016. Barcelona, Španija. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

52. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, et al. (2017) Systematic literature review of Y microdeletion in different world populations including case series from Bosnia and Herzegovina. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG29. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P)

53. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kozaric M, Husic-Selimovic A, Liehr T, Ziegler M. (2017) Yet unreported heteromorphic variant in chromosome 17. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG28. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P)

54. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S, Halilovic Z. (2017) Detection of JAK2 and CALR mutations in patients with myeloproliferative neoplasms from Bosnia and Herzegovina. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG51. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

55. Kurtovic-Kozaric A, Kugic A, Hasic A, et al. (2017) Impact of CD117 expression on the survival of GIST patients. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG53. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

56. Islamagic E, Komic H, Eminovic I, Kurtovic S, Hasic A, Mehinovic L, Halilovic Z, Suljovic Hadzimesic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Long term clinical outcomes of MPN patients with JAK2, CALR and MPL mutations in Bosnia and Herzegovina: 17 years follow-up. European Hematology Association, EHA23. 14.06.2018. PB2291. June 14 - 17, 2018. Stockholm, Švedska. Online abstrakt. (*,5)

57. S Beslija, T Ceric, B Hasanbegovic, Kurtovic-Kozaric A, A Pasic, N Mahic. (2017) Clinical outcomes of delayed start of trastuzumab treatment in patients with early breast cancer: ml25232 study. Annals of Oncology 28 (suppl_5). (IF: 14.20; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

58. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic-Bovan N, Bijedic V. (2017) The efficacy of generic and branded imatinib in CML patients in Bosnia and Herzegovina. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. Broj 85. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

59. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Molecular monitoring of BCR-ABL1 transcript in chronic myeloid leukemia patients using quantitative real-time PCR. Broj 87. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

60. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Zahirovic E, Kurtovic-Kozaric A. Chimerism detection after allogeneic transplant of hematopoietic stem cells at the Clinical Center of the University of Sarajevo. Broj 88. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

61. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of JAK2 V617F gene mutation in patients with myeloproliferative neoplasms during the period from 2015 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 89. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

25

62. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of thrombophilia: mutations in genes for Factor II, Factor V, MTHFR, PAI-1, and Factor XIII during the period from 2014 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 90. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

63. Suljovic Hadzimesic E, Radovic S, Sofo-Hafizovivc A, Obralic N, Bilalovic N, Kozaric A, Dizdarevic A, Kurtovic S, Bijedic V, Skuric-Tomic M. BCL-2 i Ki-67 kao nezavisni prognostički faktori kod oboljelih od difuznog B velikostaničnog limfoma nepovoljne IPI-grupe. Broj 91. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

64. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. First-line nilotinib compared to first-line imatinib in CML patients with delayed start of treatment. Broj 99. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

65. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic Bovan N, Bijedic V. Long term efficacy of nilotinib as second line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Broj 100. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

66. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. Potential risk of myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. Broj 101. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

67. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Komic H, Burekovic A. Clinical outcomes of patients with JAK2, CALR or MPL positive myeloproliferative neoplasms in Bosnia and Herzegovina. Broj 102. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

68. Islamagic E, Kurtovic S, Komic H, Eminovic I, Dizdarevic-Rekic A, Burekovic A, Uzunovic A, Kurtovic-Kozaric A. Mutational signatures affect the phenotypic presentation of disease subtypes in MPN patients from Bosnia and Herzegovina. European Hematology Association, EHA23. 15.06.2019. PB2234. June 14 - 17, 2019. Stockholm, Švedska. Online abstrakt. (*,5)

2.1.3. Osvrt Komisije na originalne naučne radove kandidatkinje Radovi kandidatkinje mogu se svrstati u sljedeće skupine: 1. Radovi o tumorskoj molekularnoj genetici hematoloških neoplazmi, a koji su u svrhu istraživanja

uključili primjenu različitih metoda: citogenetičkih, molekularnih i genomskih tehnika, 2. Radovi o prenatalnoj i postnatalnoj genetici , gdje su analizirani pacijenti sa rijetkim oboljenjima

prenatalno ili postnatalno, koristeći genetičke i molekularne tehnike, 3. Radovi o genetično-epidemiološkim analizama, gdje su se analizali trendovi povezanosti genetičkih

markera i bolesti, kao i nedostaci u liječenju pacijenata sa hemato-onkološkim bolestima radi nedostatka terapije, a koji su uticali na ishod pacijenata i njihovo praćenje molekularno-genetičkim metodama.

Prethodno prikazan pregled objavljenih originalnih radova prof. Kozarić nakon izbora u vanrednog profesora (njih 30), zatim 9 radova prezentiranih na kongresima koja prate Current Contents Citation Index (njih 9), kao i druge radove objavljene na kongresima (njih 29). Većina radova se fokusira na genetičku i genomsku analizu hemato-onkoloških tumora, kao što su akutna mijeloidna leukemija, hronična mijeloidna leukemija, mijeloproliferativne neoplazme i slično. U radovima su se koristile najnovije metode od genomskih analiza kao što su RNA-Seq, jednostanične transkirptomske analize, ekzomsko sekvenciranje, kao i genetičke metode poput PCR, real time PCR, sekvenciranja, kariotipizacije i FISH. Od navedenih radova, 9 od 30 originalnih radova je objavljeno u Q1 časopisima, 8 od 9 radova u Current Contents je objavljeno u Q1 časopisima, a 5 od 29 kongresnih radova je objavljeno u Q1 časopisima (ukupno 22 rada u Q1).

Posebno značajni radovi su pod brojem 1, 2, 3 i 4, koji se tiču genetičke i genomske karakterizacije mijeloidnih oboljenja. Radovi pod brojem 1 i 2 koriste najsavremenije genomske tehnike, eksprimente na model organizmima kao što su miš i kvasac, da bi otkrili genomske karakteristike mijeloidnih oboljenja a koje bi mogle imati važan značaj u dijagnostici ovih bolesnika.

26

Radovi 3 i 4 se tiču pacijenata u Bosni i Hercegovini, gdje se genetički i klinički analiziraju CML i GIST pacijenti koji su čekali na terapiju inhibitorima tirozin kinaza. Ove studije su karakteristične za BiH te daju važne podatke o biološkom razvoju bolesti tokom perioda čekanja. O interesu znanstvene javnosti za radove prof. Kozarić pokazuju podaci o citiranosti u radovima drugih autora u različitim bazama podataka što je prikazano u sljedećem poglavlju 2.1.4. Impozantni su brojevi citiranosti koji se mjere s nekoliko stotina puta.

2.1.4. Podaci o citiranosti u referentnim međunarodnim časopisima Podaci o citiranosti u referentnim međunarodnim časopisima

1950-2020 do 2015 od 2015

Web of Science Ukupno

Do zadnjeg izbora

Od zadnjeg izbora

Kurtovic-Kozaric A Broj radova 36 4 34

Broj citata 235 152 132

Bez samo citata 228 152 125

Kozaric A Broj radova 13 5 9

Broj citata 4 3 2

Bez samo citata 4 3 2

Kurtovic A Broj radova 30 15 16

Broj citata 494 467 35

Bez samo citata 493 467 35

Ukupno Broj citata 733 622 169

Bez samocitata 725 622 162

Google scholar Ukupno do 2015 od 2015

Kurtovic-Kozaric A 1029 375 654

h-index 12 11

i10-index 13 12 2.2. RADOVI PREZENTIRANI NA NAUČNIM SKUPOVIMA

Oralna prezentacija (O); Poster (P); Učešće s pozivom(*,5); Organizacija kongresa (**, 5)

2.2.1. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science) prije izbora u zvanje vanrednog profesora (ukupno 4, od toga 3 u Q1, 1 u Q2)

1. Kurtovic Kozaric A, Makishima H, Przychodzen B, et al. (2103) Novel mutations in spliceosomal gene PRPF8 show ring sideroblast phenotype in patients with myeloid neoplasms. Leukemia Research 37 (1): S36. (IF: 2.32; Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

2. Kurtovic A, Kozaric A, Kurtovic S, et al. (2014) The effect of delayed TKI treatment on cytogenetics and molecular responses: 8 year follow-up study in Bosnia. Haematologica 99 (1): 345. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

27

3. Kurtovic Kozaric A, Makishima H, Przychodzen BP, Singh J, Konarska MM, Otrock ZK, Nakashima M, Hsi ED, Yoshida K, Ogawa S, Maciejewski JP. (2013) PRPF8 Defects Cause Missplicing In Myeloid Malignancies. Blood 122(21):2838. Dobitnik Abstract Achievement Award Recepient. (IF: 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

4. Padgett R, Przychodzen B, Kozaric A, et al (2013) Somatic spliceosomal factor mutations in bone marrow neoplasms lead to alterations in alternative splicing patterns that relate to the splicing mechanism. RNA 2013: The 18th Annual Meeting of The RNA Society. Oral presentation 66. Davos, Switzerland. June 11-16, 2013. (IF: 4.94; Q1-Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents/Life Sciences, SCI, SCI Expanded, itd). (O)

2.2.2. Kongresna priopćenja prije izbora u zvanje vanrednog profesora

5. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A, et al. (2014) Expression of matrix metalloproteinases 1 and 2 and their tissue inhibitors in chronic inflammatory lesions (oral presentation). 19th Congress of the BaSS. Belgrade 24-27 April, 2014. (O)

6. Kurtovic-Kozaric A, Kozaric M, Stomornjak M, Bilalovic N. (2011) Two year summary of the efficacy of interphase FISH on prenatal samples at the Clinical Center of the University of Sarajevo. 7th ISABS Conference in forensic, anthropologic and medical genetics and Mayo Clinic Lectures in Translational Medicine, June 20-24, 2011, Bol, Croatia. ABS-245-ISABS-2011: 185. (P)

7. Kurtovic-Kozaric A, Donmez EE, Bejtovic I, Bilalovic N. (2011) Prognostic markers by interphase FISH for patients with chronic lymphocytic leukaemia (CLL). 7th ISABS Conference in forensic, anthropologic and medical genetics and Mayo Clinic Lectures in Translational Medicine, June 20-24, Bol, Croatia. ABS-243-ISABS-2011: 184. (P)

8. Kurtovic-Kozaric A, Kozaric M, Bilalovic N. (2011) Retrospective two year study of interphase FISH as molecular diagnsotics tool in diagnosis of acute pediatric leukemias at The Clinical Center of the Universit of Sarajevo. 5th Croatian Human Genetics Conference. June 20-22, 2011, Bol, Croatia. HDHG-ABS-235-ISABS-2011: 289. (P)

9. Kurtovic-Kozaric A, Kozaric M, Bilalovic N. (2011) The efficacy of interphase FISH diagnostics in pediatric acute leukemias over the period of two years at the Clinical Center of the University of Sarajevo. 5th Croatian Human Genetics Conference. June 20-22, 2011, Bol, Croatia. HDHG-ABS-234-ISABS-2011: 289. (P)

10. Kurtovic-Kozaric A, Bejtovic I., Donmez E, Bilalovic N. (2011) Prognostic markers by interphase fluorescence in situ hybridization for chronic lymphocytic leukemia (CLL). 1st Kongres Hematologa i Transfuziologa Bosne i Hercegovine. Sarajevo 19-22, 2011. 4:40. (P)

11. Kozaric A. (2011) Molekularna citogenetika kod pacijenata sa hronicnom limfocitnom leukemijom. 1st Kongres Hematologa i Transfuziologa Bosne i Hercegovine. Sarajevo 19-22, 2011. 26:19. (O)

12. Sofo Hafizovic A, Kozaric A, Dizdarevic A, Vila M, Jamakovic M. (2011) Prikaz tri specifična slučaja odoljelih od ALL, od ALL sa HES do ALL NUP214-ABL1. 1st Kongres Hematologa i Transfuziologa Bosne i Hercegovine. Sarajevo 19-22, 2011. str. 45. (O)

13. Kurtovic S, Skobic-Bovan N, Kadic M, Ahmetagic A, Kozaric A, Bijedic V, VIla M, Dizdarevic A, Medanhodzic A, Sofo-Hafizovic A, Sahovic S, Jamakovic M, Balic L. (2011) Trogodišnje praćenje uspješnosti liječenja imatinibom pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom, Philadelphia pozitivnom, u Federaciji BiH. 1st Kongres Hematologa i Transfuziologa Bosne i Hercegovine. Sarajevo 19-22, 2011. 16:46. (P)

14. Kozaric A, Mesihovic-Dinarevic S. (2012) Perspectives in Pediatric Cardiology. Medjunarodna naučna konferencija Akademija nauka i umjetnosti BiH, 20-22.09.2012, Dubrovnik, Hrvatska. Oralna prezentacija. (O)

28

2.2.3. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index nakon izbora u zvanje vanrednog profesora

15. Hadzimesic Suljovic E, Radovic S, Sofo-Hafizovic A, Kurtovic-Kozaric A. (2017) BCL2 and Ki-67 as independent predictors of poor risk IPI group of patients with diffuse large B cell lymphoma. Haematologica 102: 286. PB2087. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

16. Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. (2017) Front-line nilotinib is a better choice than front-line imatinib for CML patients with delayed treatment: 11 year follow-up. Haematologica 102: 286. PB1837. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

17. Catic A, Sophian A, Mazur L, Kurtovic-Kozaric A, et al. (2017) The frequency of a novel KANK1 and NTRK3 translocation and BRAF(V600E) mutation in patients diagnosed with metanephric adenoma utilizing molecular mechanisms. Journal of Clinial Oncology. 35 (15): 1537. 20. 05.2017. Poster prezentacija. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

18. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Beslija S, et al. (2017) Long term efficacy of nilotinib as front- and second-line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Journal of Clinical Oncology. 35 (15): e18549. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

19. Kurtovic Kozaric A, Kugic A, Kurtovic A, Beslija S, et al. (2016) The effects of delayed imatinib mesylate treatment on outcome in patients with GIST. Journal of Clinical Oncology. 35 (15): e22518. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

20. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Radich JP, et al. (2016) The comparison of efficacy between generic and branded imatinib in achievement of overall survival and cytogenetic responses in CML patients in Bosnia and Herzegovina. Blood. 128 (22): 5451. 02.12.2016. (IF: 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

21. Mehinovic L, Kozaric A, Dizdarevic A, et al. (2016) Clinical characteristics of acute myeloid leukemia patients from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica. 101 (1): 385-386. E941. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

22. Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S. (2016) Clinical characteristics of patients with myeloid neoplasms from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica. 101(1): 506-506. E1228. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

23. Catic A, Kurtovic-Kozaric A, Sophian A, et al. (2018) Prevalence of KANK1-NTRK3 fusion in renal metanephric adenomas that lack BRAF mutations. Cancer Genetics. 224:59. 23. 08.2018. (IF 2.18; Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

2.2.4. Kongresna priopćenja nakon izbora u zvanje vanrednog profesora

24. Dogan S, Kozaric A, Fatih Ozturk. (2015) New Possible Targetable Genes For Future Treatment of MLL Leukemias. NCRI National Cancer Conference. Liverpool, UK. Novembar 9-11, 2015. Oralna prezentacija. (O)

25. Dogan S, Kurtovic-Kozaric A, Marjanovic D, Turan Y. (2015) Differential gene expression and methylation signatures of mixed lineage leukemias. Abstract number: ABS-465-ISABS-2015. Ninth ISABS Conference on Forensic, Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-26, 2015. (P)

29

26. Kozaric M, Godinjak Z, Nefic H, Kurtovic-Kozaric A. (2015) Clinical significance of conventional karyotype and qf-pcr in detection of fetal chromosomal abnormalities: 3-year single centre evaluation” Abstract number: ABS-462-ISABS-2015. Ninth ISABS Conference on Forensic, Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-26, 2015. (P)

27. Mehinovic L, Kurtovic-Kozaric A, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Basic I. (2015) Detection of chromosomal microdeletions and structural rearrangements in the pediatric population using conventional karyotyping and fluorescence in situ hibridization. II Symposium of Geneticists in B&H with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015. (P)

28. Kurtovic-Basic I, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Konjhodzic R. (2015) Cytogenetics and molecular-cytogenetics diagnostics of triploidy. II Symposium of Geneticists in B&H with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015. (P)

29. Komic H, Mehinovic L, Islamagic E, Eminovic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Detection of Y microdeletion in Bosnian males with fertility disorders. European Journal of Human Genetics. 2017 24 (1): E-P01.64. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (P)

30. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic-Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Potential risk of myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. 2017 24 (1): E-P07.40. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

31. Kurtovic-Kozaric A, Komic, Mehinovic L, et al. (2019) Incidence of Y chromosome microdeletions in different world populations: systematic review. European Human Genetic Conference, P01.94B. Poster prezentacija. Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1174–1813 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0494-2. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

32. Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Kurtovic-Kozaric A. (2019) How we treat CML patients in developing countries: 13 years experience. European Human genetic conference, E-P07.01 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

33. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Islamagic E, et al. (2019) Clinicopathological characteristics of patients with myeloid neoplasms: 20 year follow up. European Human genetic conference, E-P07.05 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (P)

34. Komic H, Islamagic E, ... Kurtovic-Kozaric A. (2019) Clinical outcome of patients with JAK2, CALR and MPL positive myeloproliferative neoplasms. European Human genetic conference, E-P07.06 Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

35. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, et al. (2016) Ten-year trends in prevalence of Down syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. European Journal of Human Genetics. 24 (1): 59. Poster prezentacija. 21-24.05.2016. Barcelona, Španija. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

36. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, et al. (2017) Systematic literature review of Y microdeletion in different world populations including case series from Bosnia and Herzegovina. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in

30

Individual Medicine. MG29. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P) 37. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kozaric M, Husic-Selimovic A, Liehr T, Ziegler M.

(2017) Yet unreported heteromorphic variant in chromosome 17. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG28. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P)

38. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S, Halilovic Z. (2017) Detection of JAK2 and CALR mutations in patients with myeloproliferative neoplasms from Bosnia and Herzegovina. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG51. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

39. Kurtovic-Kozaric A, Kugic A, Hasic A, et al. (2017) Impact of CD117 expression on the survival of GIST patients. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG53. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

40. Islamagic E, Komic H, Eminovic I, Kurtovic S, Hasic A, Mehinovic L, Halilovic Z, Suljovic Hadzimesic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Long term clinical outcomes of MPN patients with JAK2, CALR and MPL mutations in Bosnia and Herzegovina: 17 years follow-up. European Hematology Association, EHA23. 14.06.2018. PB2291. June 14 - 17, 2018. Stockholm, Švedska. Online abstrakt. (*,5)

41. S Beslija, T Ceric, B Hasanbegovic, Kurtovic-Kozaric A, A Pasic, N Mahic. (2017) Clinical outcomes of delayed start of trastuzumab treatment in patients with early breast cancer: ml25232 study. Annals of Oncology 28 (suppl_5). (IF: 14.20; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

42. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic-Bovan N, Bijedic V. (2017) The efficacy of generic and branded imatinib in CML patients in Bosnia and Herzegovina. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. Broj 85. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

43. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Molecular monitoring of BCR-ABL1 transcript in chronic myeloid leukemia patients using quantitative real-time PCR. Broj 87. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

44. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Zahirovic E, Kurtovic-Kozaric A. Chimerism detection after allogeneic transplant of hematopoietic stem cells at the Clinical Center of the University of Sarajevo. Broj 88. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

45. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of JAK2 V617F gene mutation in patients with myeloproliferative neoplasms during the period from 2015 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 89. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

46. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of thrombophilia: mutations in genes for Factor II, Factor V, MTHFR, PAI-1, and Factor XIII during the period from 2014 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 90. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

47. Suljovic Hadzimesic E, Radovic S, Sofo-Hafizovivc A, Obralic N, Bilalovic N, Kozaric A, Dizdarevic A, Kurtovic S, Bijedic V, Skuric-Tomic M. BCL-2 i Ki-67 kao nezavisni prognostički faktori kod oboljelih od difuznog B velikostaničnog limfoma nepovoljne IPI-grupe. Broj 91. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

48. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. First-line nilotinib compared to first-line imatinib in CML patients with delayed start of treatment. Broj 99. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

49. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic Bovan N, Bijedic V. Long term efficacy of nilotinib as second line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Broj 100. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

50. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. Potential risk of myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. Broj 101. 2nd

31

Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O) 51. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Komic H, Burekovic A. Clinical outcomes of patients with JAK2,

CALR or MPL positive myeloproliferative neoplasms in Bosnia and Herzegovina. Broj 102. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

52. Islamagic E, Kurtovic S, Komic H, Eminovic I, Dizdarevic-Rekic A, Burekovic A, Uzunovic A, Kurtovic-Kozaric A. Mutational signatures affect the phenotypic presentation of disease subtypes in MPN patients from Bosnia and Herzegovina. European Hematology Association, EHA23. 15.06.2019. PB2234. June 14 - 17, 2019. Stockholm, Švedska. Online abstrakt. (*,5)

2.3. NAUČNOISTRAŽIVAČKI PROJEKATI 2.3.1. Projekti prije izbora u zvanje vanrednog profesora

1. Osnivanje prve tumorske banka u Bosni i Hercegovini. 2009 godina. Učesnik projekta. Razvojni projekat. Federalno ministarstvo nauke i obrazovanja. (2009)

2. Osnivanje prve sperm banke u BiH. Učesnik projekta. Federalno ministarstvo nauke i obrazovanja. Razvojni projekat. 2010.

3. Učestalost i kliničko-patološki značaj koegzistentnih (istovremenih) mutacija PIK3CA i PTEN gena u grupi invazivnih karcinoma dojke sa bazalnim fenotipom. Kantonalno ministarstvo obrazovanja i nauke KS . Učesnik. 2009.

4. Kliničke studija: A two stage Phase III, International, Multi-center, Randomized, Controlled, Open-label study to investigate the pharmacokinetics, efficacy and safety of rituximab SC in comination with CHOP or CVP versus rituximab IV in comination with CHOP or COP in patients with previously untreated follicular lymphoma follwed by maintenance treatment with either rituximab SC or rituximab IV. SABRINA-Follicular lymphoma BO22334. (2012-2013)

5. Kliničke studija: Efficacy and safety of eraxis/Ecalta (anidulafungin) compared to cancidas (caspofungin) in neutropenic patients with invasive Candida infection. Pfizer. (2010)

6. Establishment of translational research laboratory in Bosnia and Herzegovina: Novel Therapeutic Targets and Inhibitors in Acute Leukemia. Voditelj projekta. Projekat obustavljen iz birokratskih razloga. Swiss National Science Foundation. 2014-2016.

2.3.2. Projekti nakon izbora u zvanje vanrednog profesora

1. In vitro ispitivanje vitalnosti kancerogenih ćelijskih linija nakon aplikacije rutenij

kompleksa Voditelj projekta. Naučno-istraživački projekat. (2018) U saradnji sa prof. Kahrović sa odsjeka za hemiju, ovaj projekat testira novonapravljene

rutenij komplekse kao potencijalne lijekove protiv hematoloških maligniteta. Korištene su ćelijske linije hematoloških maligniteta, koje će se analizirati nakon aplikacije rutenij kompleksa putem MTT eseja, apoptotskih i drugih parametara.

2. Detekcija i prisustvo molekularnih biljega klonalne hematopoeze u opštoj populaciji. Naučno-istraživački projekat. Član projekta. (2018)

Klonalna hematopoeza je karakteristična za starije populacije ali se može detektirati kod mlađih osoba. Detekcija klonalne hematopoeze, odnosno mutacija u određenim genima, vodi ka povećanom riziku za razvoj hematoloških bolesti. U ovom istraživanju će se analizirati generalna populacija za prisustvo mutacija u genima vezanim za klonalnu hematopoezu.

3. Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Naučno-istraživački projekat. (2016)

Inhibitori tirozin kinaza se koriste kao lijekovi kod CML-a. Međutim, oko 20% pacijenata

32

ima rezistenciju na ove lijekove. Rezistencija se primarno očituje kao prisustvo mutacija u BCR-ABL genu. Ovaj projekat analizira mutacije u BCR-ABL1 u odnosu na kliničku i genetičku prezentaciju CML pacijenata.

4. Kliničke studija: MO39107 TeGaR - Studija faze II za ispitivanje sigurnosti i efikasnosti atezolizumaba primljenog u kombinaciji sa obinutuzumabom ili rituximabom, anti-CD20 monoklonskim antitijelom, kod pacijenata s recidivirajućim/refraktornim Mantl ćelijskim limfomom/Waldestrom makroglobulinemijom (WM). (2017-2018)

U ovoj kliničkoj studiji faze II učestvovali su pacijenti sa Mantl ćelijskim limfomom/Waldestrom makroglobulinemijom koji će se liječiti imunoterapijom obinutuzumabom ili rituximabom.

5. Kliničke studija: Open-label, Non-randomized Phase 2 Study With Safety Run-in Evaluating Efficacy and Safety of PQR309 in Patients with Relapsed or Refractory Lymphoma. PQR-309-002. (2016-2017)

U ovoj kliničkoj studiji faze II učestvovali su pacijenti sa relapsiranom ili refraktarnim limfomom, a koji će se liječiti novim lijekom, inihbitorom mTOR puta.

6. Kliničke studija: Randomizirano, dvostruko-slijepo, komparativno ispitivanje boiekvivalentnosti Mabiona CD20 (Mabion SA) u odnosu na Mabteru (rituximab koji proizvodi HOffman La Roche) na paralelnim grupama kod pacijenata oboljelih od difuznog krupnoćelijskog B limfoma. MabionCD20-002NHL. (2017-2018)

U ovoj kliničkoj studiji, upoređuje se imunoterapija rituximab koja je bila standard sa generičkom terapijom Mabiona (bioekvivalent).

7. Desetogodičnji trend u prevalenciji Down sindroma u zemlji u razvoju: uticaj majčine dobi i prenatalnog skininga. Voditelj projekta (2016-2017).

Odjeljenje humane genetike radi prenatalna i postnatalna genetička testiranja na Down sindrom. Rezultati ovog projekata su objavljenj 2016 godine: Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, et al. Ten-year trends in prevalence of Down syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2016 Nov;206:79-83.

8. Osnivanje baze podataka i molekularna karakterizacija pacijenata sa hematoonkološkim oboljenjima u Federaciji Bosne i Hercegovine. Voditelj projekta. (2014-2018)

Epidemiološka studija za frekvenciju, kliničke i molekularne parametre pacijenata sa hematoonkološkim pacijentima je služila kao baza za objavljivanje nekoliko radova.

9. Razvoj novih strategija za eliminaciju BCR-ABL1+ matičnih ćelija kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom (projekat sa Prof.dr. Frederik Thoren, Salhgrenska Institut, Gotenborg, Švedska). Voditelj projekta zajedno sa Prof.dr. Thoren. (2019-)

Studije sprovedene tokom prethodnih godina od strane laboratorije Profesora Thorena kao i drugih istraživačkih grupa su pokazale da glavne efektorske ćelije kod mijeloidne leukemije su ćelije prirodne ubojice (engl. natural killer, NK). Otkriveno je i da stimulatorna imunoterapija NK ćelija može doprinijeti eliminaciji ćelija leukemije. Nedavna studija je pokazala i da CML pacijenti sa velikim brojem funkcionalnih NK ćelija imaju veću šansu da ostanu u remisiji bez terapije nakon ukidanja tirozin-kinaznih inhibitora. Međutim, polovina pacijenata ima relaps oboljenja, te su noviji tretmani za liječnje CML pacijenata prijeko potrebni. Glavni ključ uspješnog liječenja CML pacijenata je ciljanje nezrelih leukemičnih ćelija koje liče na matične ćelije. Ovaj istraživački plan obuhvata molekularne pristupe pojedinačnim ćelijama u cilju otkrivanja novih meta kod CML matičnih ćelija i definisanje prisustva NK ćelijskih receptora na ovim ćelijama. Na osnovu našeg iskustva u istraživanjima sprovedenim na uzorcima AML pacijenata, procijenit ćemo i izvodljivost stimulatorne imunoterapije NK ćelija za uklanjanje rezidualnog CML oboljenja kod pacijenata tretiranih tirozin-kinaznim inhibitorima. Cilj ove studije je: Mogućnost trostruke terapije: imatinib/HDC/IL-2 kod CML pacijenata. Hipoteze su:

33

CML matične ćelije eksprimiraju ligande za aktivirajuće NK ćelijske receptore i mogu biti mete NK ćelija; Stimulatorna imunoterapija NK ćelija kao sto je HDC/IL-2 može: a) produžiti remisiju postignutu TKI terapijom b) povećati broj pacijenata koji mogu prekinuti TKI terapiju bez relapsa CML-a.

10. COST Action CA18233, COST Association European Network for Innovative Diagnosis and Treatment of Chronic Neutropenias. Član. 11/2019-

Nova istraživačka mreža za dijagnozu i tretman hroničnih neutropenija. 11. COST Action BM1006, Biomedicine And Molecular Biosciences Next Generation

Sequencing Data Analysis Network. Član. 2016- Istraživačka mreža za analizu podataka sekvenciranja nove generacija. 12. Kvantitativna analiza potencijalnih lider gena u periapikalnim inflamatornim lezijama.

Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2019 godine.

Projekat sa Stomatološkim fakultetom gdje su analizirane ekspresije raznih gena u periapikalnim lezijama.

13. Značaj održivosti vitaliteta ćelija periodontalnog ligamenta (PDL) kod avulziranih zuba. Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2018 godine.

Projekat sa Stomatološkim fakultetom gdje su analizirane primarne ćelijske kulture periodontalnog ligamenta nakon aplikacije različitih susbstanci.

2.4. KNJIGE, MONOGRAFIJE I POGLAVLJA U KNJIGAMA

2.4.1. Prije izbora u zvanje vanrednog profesora

1. Subasic D, Eminovic I, Kurtovic-Kozaric A, Salimovic I. Molekularna biologija: Primjena u medicine i transgenetici. Sarajevo: Klinicki Centar Univerziteta u Sarajevu. 2012. 269 stranica. ISBN 978-9958-631-88-7

2. Oruc L, Kurtovic-Kozaric A. Psihijatrijska genetika: klinicka primjena. Institut za naucnoistrazivacki rad i razvoj, Klinicki Centar Univerziteta u Sarajevu 2013. ISBN 978-9958-631-98-6.

3. Pojskic L, Oruc L, Kurtovic-Kozaric A, Pojskic N. Uvod u psihijatrijsku genetiku. Izdavac INGEB, Univerzitet u Sarajevu. 2013. ISBN 978-9958-9344-76.

2.4.1. Nakon izbora u zvanje vanrednog profesora

1. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A. Oral pathology: Gene expression in odontogenic cysts.

In: Gene Expression and Control. Editor: Fumiaki Uchiumi. 17.04.2019. ISBN: 978-1-78985-518-0. Print ISBN: 978-1-78985-517-03.

3. METODE 3. 1 Nove metode uvedene nakon izbora u vanrednog profesora: 1. MLPA (Multiple Ligation-dependent Probe Amplification):

1.1 Cistična fibroza (CFTR gen) 1.2 Mikrodelecijski sindromi (1p36 deletion syndrome, 22p16.1-p15 microdeletion syndrome 2p16.1-p156125132q23.1 microdeletion/ microduplication syndrome, Glass syndrome2q32-q33, 3q29 microdeletion syndrome, 3q29 microduplication syndrome, Wolf-Hirschhorn syndrome, Cri-du-Chat syndrome, Sotos, Williams-Beuren, Williams-

34

Beuren duplication, Langer-Giedion syndrome, 9q22.3 microdeletion syndrome, DiGeorge syndrome, Prader-Willi syndrome, Angelman syndrome, Witteveen-Kolk*/15q24 microdeletion syndrome, Rubinstein-Taybi syndrome, Miller-Dieker syndrome, Lissencephaly, Smith-Magenis syndrome, Potocki-Lupski syndrome, NF1 microdeletion syndrome, Koolen-de Vries syndrome, 22Q11.2 microduplication syndrome, 22Q11.2 deletion syndrome, Phelan-McDermid syndrome, Rett syndrome, MECP2 duplication syndrome 1.3 Duchenne/Becker mišićna distrofija (DMD1 i DMD2 geni) 1.4 Spinalna mišićna atrofija (SMN1 i SMN2 geni) 1.5 BRCA1 i BRCA2 delecije i duplikacije 1.6 Analiza MMR gena (nasljedni sindromi kancera debelog crijeva, Lynch sindrom) 1.7 Hemahromatoza 1.8 Osteogenesis imperfecta 1.9 Analiza subtelomera 1.10 Fragilni X sindrom 1.11 Cornelia de Lange sindrom

2. Fluorescentna in situ hibridizacija na uzorcima tkiva: 2.1 Limfomi (double-triple hit limfomi): BCL2, BCL6 i MYC 2.2 Marginal zone limfomi: MALT1-IGH i API-MALT1 translokacije 2.3 Sarkomi: EWSR1, FUS, SS18 i DDIT3 rearanžmani 2.4 CNS tumori: 1p-19q kodelecija, CDKN2A delecija 2.5 CNS i neuroblastom: NMYC i CMYC amplifikacija 2.6 Liposarkomi: MDM2 amplifikacija 2.7 Drugi limfomi: t(11;14), t(14;18), IGH break apart, i dr.

3. Sekvenciranje gena: 3.1 TTR gen 3.2 KIT i PDGFRA za GIST (gastrointestinalne stromalne tumore) 3.3 MPL gen za MPN pacijente (mijeloproliferativne neoplazme) 3.4 RAG1 gen za SCID

4. ASO-PCR metoda za hematologiju: 4.1 CALR mutacije kod MPN pacijenata 4.2 MYD88 za Waldestrom makroglobulinemiju (hematologija) 4.3 Nested PCR za BCR-ABL1 (hronicna mijeloidna leukemija) 4.4 Detekcija 8 najčešćih rezistentnih mutacija u BCR-ABL1

5. Real-time PCR metoda za hematologiju: 5.1 NPM1 mutacije za akutne leukemije 5.2 FLT3 mutacije za akutne leukemije 5.3 PML-RARA kvantitativno mjerenje transkripta kod akutne leukemije

6. Real-time PCR (COBAS Onkologija) na tkivnim uzorcima tumora: 6.1 KRAS mutacije (kolorektalni karcinom) 6.2 NRAS/BRAF mutacije (kolorektalni karcinom) 6.3 EGFR mutacije (karcinom pluca)

7. NGS- next generation sequencing 7.1 Panel za epilepsije od 50 gena 7.2 Panel za kancere debelog crijeva i pluća 7.3 BRCA1 i BRCA2 (germinativne i somatske mutacije)

35

4. NASTAVNO-PEDAGOŠKI RAD 4.1. Predmeti koje je kandidatkinja realizirala prije izbora u zvanje vanrednog profesora

I. ciklus studija: Internacionalni Univerzitet u Sarajevu: Genetika, Molekularna biologija I,

Molekularna biologija II, Strukturna biologija. 4.2. Predmeti koje je kandidatkinja realizirala nakon izbora u zvanje vanrednog profesora

I. ciklus studija: Humana genetika. Internacionalni Univerzitet Burč: Genetika, Molekularna biologija 2, Citogenetika, Humana genetika, Genomika. II. ciklus studija: Genetičko testiranje i konsultacije, Farmakogenetika, Magistarski programi. Internacionalni Univerzitet Burč: Biologija kancera.

4.3. Mentorstvo

4.3.1. Magistarski/završni radovi: 17 (15 od izbora u vanrednog profesora) 1. Jasminka Mujić: Molekularni monitoring BCR/ABL transkripata kod pacijenata sa

hroničnom mijeloidnom leukemijom primjenom RT PCR. (19.12.2011.) 2. Azra Kurtović: Efekat odgođenog tretmana inhibitorinma tirozin kinaza kod pacijenata sa

hroničnom mijeloidnom leukemijom. (09.07.2014) 3. Nejra Korić: Petogodišnje praćenje pacijenata sa akutnom mijeloidnom leukemijom

primjenom fluorescentne in situ hibridizacije (FISH). (14.09.2015.) 4. Adisa Baltić: Učestalost hematoloških oboljenja u Kantonu Sarajevo od 1995 do 2014

godine. (17.07.2016.) 5. Amina Kugić: Patohistološke karakteristike gastrointestinalnog stromalnog tumora:

desetogodišnje praćenje pacijenata u Federaciji Bosne i Hercegovine. (17.07.2016.) 6. Azra Frkatović: Genetic analysis of E1A binding protein p300 (ep300) expression levels in

periapical granulomas and radicular cysts. (08.05.2017.) 7. Samira Smajlović: Gene expression of CC motif chemokine ligand 5 (CCL5) in chronic

inflammatory lesions. (08.05.2017.) 8. Hana Komić: Frekvencija mutacija u genima Janus kinaza 2 (JAK2) i kalretikulin (CALR) kod

pacijanata sa mijeloproliferativnim neoplazmama. (30.09.2017) 9. Adna Zeljković: Primjena fluorescentne in situ hibridizacije u detekciji MDM2 amplifikacije

kod liposarkoma na tkivnim uzorcima. (16.10.2017.) 10. Džejna-Ema Bajramović: Upotreba fluorescentne in situ hibridizacije na tkivnim uzorcima

limfoma. (22.01.2018) 11. Ahmed Osmanović: Evaluation of Primary culture of Periodontal Ligament Cell Viability in

DMEM at Different Time Intervals. (15.03.2018) 12. Sabina Halilović: measurement of cellular metabolic activity using mtt assay (3-(4, 5-

dimethylthiazolyl-2)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide) in periodontal ligament cells under different storage conditions. (15.03.2018)

13. Zana Halilović: Molekularna karakterizacija somatskih mutacija KRAS i NRAS gena kod pacijenata sa karcinomom debelog crijeva. (16.07.2018)

14. Dragana Stanišić: The overview of registration process and legislature of conducted and ongoing clinical trials in Bosnia and Herzegovina (30.11.2018)

15. Ammar Omanović: Prevalence of CALR type 2 (c.1092_1143del) and type 2 (c.1154_1155insTTGTC) mutations in general population of Canton Sarajevo. (23.09.2019)

16. Leila Keškić: Exploitation of synthetic lethal genetic interactions in pancreatic cancer subtypes. (16.04.2019)

17. Emina Omerović: Detekcija genetičkih aberacija kod pacijenata sa multiplim mijelomom putem fluorescentne in situ hibridizacije. (20.10.2019)

36

4.3.2. Doktorske disertacije - 3 od izbora u vanrednog profesora 1. Senol Dogan: Genomic characterization and discovery of novel therapeutic targets and

inhibitors in acute leukemia. (16.12.2015) 2. Aida Ćatić: A novel cytogenetic and molecular characterization of metanephric adenoma:

identification of partner genes involved in translocation t(9;15)(p24;q24) and the frequency of BRAFV600E mutation. (13.07.2017)

3. Larisa Bešić: The Assessment of age related clonal hematopoiesis in general population of Hadzici and Ilijas. (13.06.2019)

4.3.3. Trenutno u realizaciji Doktorske disertacije - 3 od izbora u vanrednog profesora

1. Erna Islamagić: Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Početak 2016-

2. Lejla Mehinović: Molekularna karakterizacija pacijenata sa mijeloidnim neoplazmama sa područja Kantona Sarajevo: dvadesetogodišnje praćenje. Početak 2016-

Magistarski radovi/radovi II ciklusa - 3 kandidata 4.3.3. Osvrt Komisije na nastavno-pedagoški rad kandidatkinje Prikazani popis predmeta koje je prof. Amina Kozarić realizirala prije izbora i nakon izbora u zvanje vanrednog profesora uočava se da raspolaže sa širokim spektrom znanja iz obasti kliničke biologije, genetike i genomike. Treba naglasiti da za realizaciju navedenih predmeta prof. Kozarić je praktično radila sa studentima, posebice na predmetima Humana genetika i Genetičko testiranje i konsultacije. Tokom praktičnih vježbi, studenti u bili u mogućnosti sami raditi osnovne genetičke metode kao što su izolacija DNK, RNK, PCR, real time PCR, sekvenciranje, MLPA, FISH, kariotip, genetičke konsultacije i dr. Kompletan odnos prema nastavi, te njen talent za ovaj rad nameće zaključak da pripada skupini onih profesora koji vrlo odgovorno i s puno ljubavi obavljaju ovaj segment rada koji je u obavezi univerzitetskog profesora. Osim u nastavi prof. Kozarić sa puno pažnje i požrtvovanosti radi sa svojim kandidatima bilo u izradi diplomskih radova, bilo u realizaciji magistarskih/završnih radova kao i doktorskih teza i to od početaka do kraja zacrtanog projekta što je prepoznato od studenata, te je zbog toga prihvaćaju s puno uvažavanja i poštovanja. Veliki broj uspješno završenih radova drugog i trećeg ciklusa je objavljeno u prestižnim naučnim časopisima, što ukazuje na to da prof. Kozarić se u potpunosti posveti svojim studentima koji od nje mogu naučiti najkvalitetnije metode i pristup naučno-istraživačkom radu (primjeri: Amina Kugić: master student objavila u Eur J Cancer; Azra Kurtović: master student objavila u Br J Haem; Erna Islamagić: doktorant objavila u Clin Lymph Myel Leuk; Lejla Mehinović: objavila u Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. i Bosn J Basic Med Sci; Hana Komic master student koja je objavila na nekoliko kongresa, itd).

37

PRIJEDLOG S OBRAZLOŽENJEM

Na osnovu analize svih raspoloživih podataka u priloženoj dokumentaciji predviđenoj Konkursom, koju je dostavila dr. Amina Kozarić, vanredni profesor Odsjeka za Biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univeruiteta u Sarajevu, kao jedini kandidat za izbor u zvanje redovnog profesora za oblast Klinička biologija, Komisija je utvrdila da kandidatkinja:

1. ima naučni stepen doktora nauka iz oblasti za koju se bira; 2. u zvanju vanrednog profesora za oblasti “Genetika” i „Klinička biologija” je provela više

od pet godina (jedan puni izborni period); 3. od izbora u prethodno zvanje objavila je 68 radova, od kojih je 30 originalnih naučnih

radova (9 objavljeno u Q1 časopisima, a 4 u Q2 časopisima), zatim 9 kongresnih radova je objavljeno u u Current Contents Citation Index, od kojih je 8 u Q1 časopisima; zatim 29 kongresnih radova, od kojih je 5 u Q1 časopisima.

4. Svi objavljeni radovi kandidatkinje korespondiraju s oblastima bioloških nauka navedenih u Konkursu;

5. Podaci o citiranosti radova kandidatkinje u različitim bazama podataka broje više od hiljadu puta;

6. od izbora u prethodno zvanje, učestvovala je kao autor i koautor na 17 međunarodnih i domaćih naučnih i stručnih skupova. Sažeci 9 saopćenja prati Current Contents Citation Index;

7. Pokrenula je 37 novih genetičkih i genomskih metoda (MLPA, NGS, FISH, real time PCR i druge) za potrebe pacijenata u Federaciji BiH;

8. nakon izbora u prethodno zvanje, kao koautor, objavila je jednu knjigu; 9. Kandidatkinja posjeduje tri dodatna rada kao zamjenu za objavu druge knjige; 10. mentor je tri uspješno odbranjene doktorske disertacije, dok je za dvije doktorske

disertacije određena za supervizora; 15 odbranjenih magistarskih i završnih radova II. ciklusa studija biologije, a uz to bila je mentor nekoliko diplomskih i završnih radova studenata I. ciklusa studija;

11. bila je član ili predsjednik Komisija za odbranu dvije doktorske disertacije. Bila je član ili predsjednik Komisija za odbranu 42 magistarska rada ili Završna rada II ciklusa realiziranih na Odsjeku za biologiju PMF-a u Sarajevu;

12. u 13 eminentnih stranih časopisa koji objavljuju genetičke radove je status recenzenta; 13. u periodu od prethodnog izbora učestvovala je u 13 projekata, deset domaćih i tri

internacionalna projekata i to u svojstvu eksperta za genetiku tumora i drugih bolesti; 14. u toku nastavnog rada realizirala je veliki broj nastavnih sadržaja iz oblasti Genetike,

također iz oblasti Kliničke biologije za studente predbolonjskog i bolonjskog režima studija na Odsjeku za biologiju PMF-a u Sarajevu, a u realizaciji dodiplomskih predmeta s velikim uspjehom je organizirala i izvodila praktičnu nastavu na Kliničkom centru Univerziteta u Sarajevu;

15. član je strukovnih i znanstvenih društava; 16. Šefica je odjeljenja humane genetike KCUS, gdje je pokazala je odlične organizatorske

sposobnosti kao i vještine u uvođenju brojnih novih dijagnostičkih i istraživačkih metoda.

S obzirom na navedene činjenice, Komisija smatra da dr. Amina Kozarić, vanredni profesor na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta, ispunjava sve uvjete u skladu sa Zakonom o visokom obrazovanju (Službene novine Kantona Sarajevo, broj 33/17, čl. 96, stav f i čl. 115, stav (2)) i Statutom Univerziteta u Sarajevu (čl. 194. stav (1) tačka f) i čl. 199. stav (1)), za izbor u zvanje REDOVNOG PROFESORA za naučnu oblast “KLINIČKA BIOLOGIJA” na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu.

38

Na osnovu svega izloženog, Komisija sa zadovoljstvom predlaže Vijeću Prirodno-matematičkog fakulteta da Senatu Univerziteta u Sarajevu predloži izbor dr. AMINE KOZARIĆ u zvanje REDOVNOG PROFESORA za naučnu oblasti „KLINIČKA BIOLGOIJA” na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu, te da u vezi s tim nastavi zakonom predviđenu proceduru.

_________________________________________________ Prof. dr. sc. Hilada Nefić, predsjednik

_________________________________________________

Prof. dr. sc. Izet Eminović, član

_________________________________________________ Prof. dr. sc. Đemo Subašić, član

Sarajevo, juni 2020.