possible pathway for heterochromatin formation in drosophila. swaminathan j et al. genes dev....
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Possible pathway for heterochromatin formation in Drosophila.
Swaminathan J et al. Genes Dev. 2005;19:65-76
©2005 by Cold Spring Harbor Laboratory Press
(The endogenous siRNA pathway is involved in heterochromatin formation in Drosophila. Fagegaltier et al., 2009)
polII TF
RNA
(Octubre, 2012)(Nature Structural and Molecular Biology)
eyegone (eyg) y twin of eyegone (toe)• eyg y toe pertenecen a la familia de factores de transcripción Pax
• Miembros de la familia Pax gene existen también en vertebrados. Hay 9 genes Pax en humanos.
• Las proteinas PAX son factores de transcripción que unen ADN a través de sus dominios paired (PD) y homeodominio (HD).
eyegone (eyg) y twin of eyegone (toe)
eyg y toe son los únicos genes pax con un dominio paired truncado y estructuralmente son homólogos al Pax6(5a). Son represores transcripcionales.
June et al, 1998
Grewal and Elgin, 2007
Heterocromatina constitutiva: Centrómeros y telómeros
Heterocromatina facultativa: Regiones reguladoras
Represión por reclutamiento de factores remodeladores de la cromatina
Análisis de la estructura de la cromatina en la región reguladora de wg.
Ensayo de sensibiIidad a DNAsaI
eyg reprime a wg durante el desarrollo del ojo de Drosophila
Ensayo de sensibilidad a DNAse I
Extracción del ADN
+/- Tratamiento con DNAseI
Lisis celular (digestión con proteasa k)
Purification del ADN genómico
Ensayo de PCR-cuantitativa
Análisis de la estructura de la cromatina.
HETEROCHROMATIN
EUCHROMATIN
Ct
50UCt
0UDCt=Ct50U- Ct0U
Análisis de la estructura de la cromatina en la región reguladora de wg
wg1
Fenotipo embrionario de mutantes eyg