Pelabuhan Kelas Utama : Makassar

Pelabuhan Kelas Satu :

1. Samarinda

2. Balikpapan

3. Bitung

4. Ambon

5. Sorong

Pelabuhan Kelas Dua :

1. Tarakan

2. Pantoloan

3. Pare-pare

4. Kendari

5. Ternate

6. Jayapura

Pelabuhan Kelas Tiga :

1. Nunukan

2. Manokwari

3. Biak

4. Merauke

Pelabuhan Kelas Empat :

1. Tolitoli

2. Gorontalo

3. Fakfak

Pelabuhan UPK :

1. Tj. Redeb

2. Sengata

3. Bontang

4. Bandanaira

5. Makassar

6. Bitung