obiectul biochimiei

115
PROTEINELE: STRUCTURA, CLASIFICAREA, ROLUL BIOLOGIC BIOCHIMIA BIOCHIMIA Silvia Stratulat Conferențiar universitar

Upload: dumitru-nuca

Post on 17-Jan-2016

18 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

ce studiaza biochimia

TRANSCRIPT

Page 1: Obiectul biochimiei

PROTEINELE: STRUCTURA, CLASIFICAREA, ROLUL BIOLOGIC

BIOCHIMIABIOCHIMIA

Silvia StratulatConferențiar universitar

Page 2: Obiectul biochimiei

OBIECTIVELE: 1.Rolul biochimiei în sistemul de instruire a medicului 2. Proteinele, rolul lor biologic 3. AA, structura, principiile de clasificare 4. Teoria polipeptidică a structurii proteinei Gradele de organizare ale moleculei proteice: a)structura primară şi principiul descifrării eib) Structura secundară c) Structura terţiară. Domeniile.d) Structura cuaternară 5) Colagenul 6) Proteinele fixatoare de Ca 7) Clasificarea proteinelor 8)Peptide biologic active

Page 3: Obiectul biochimiei

BIOCHIMIA:pentru prima dată ca termen a fost

introdus in 1903 de către Carl Neiberg. “bios” - înseamnă viaţăştiinţa despre structura şi

transformarea substanţelor chimice în organism, proceselor fizico-chimice care stau la baza activităţii vitale.

Page 4: Obiectul biochimiei

SCOPUL BIOCHIMIEI ESTE STUDIEREA:

legăturilor reciproce a substanţelor şi funcţiilor acestora;

modificărilor compuşilor chimici din organismul viu;

modului de transformare a energiei în sistemele vii;

mecanismelor de reglare ale transformărilor chimice şi ale proceselor fizico-chimice în celule, ţesuturi şi organe;

mecanismelor moleculare de transmitere a informaţiei genetice în organism.

Page 5: Obiectul biochimiei

DEOSEBIM:

Biochimia statică - studiează structura chimică a materiei vii (P, G; L; AN) şi proprietăţile lor.

Biochimia dinamică – studiează metabolismul P; G, L; AN şi reglarea hormonală sau enzimatică ale proceselor metabolice în organism.

Biochimia funcţională – cercetează procesele chimice ce stau la baza diferitelor manifestări ale vitalităţii.

Page 6: Obiectul biochimiei

ROLUL BIOCHIMIEIÎn domeniul practicii promovează progresul :- cercetărilor medicale;- diagnosticului clinic de laborator;- al farmacologiei şi farmaceuticii;- al microbiologiei, virusologiei şi imunologiei.Studiază: -compoziţia chimică a ţesuturilor şi lichidelor

biologice în condiţii fiziologice şi patologice, -corelaţiile dintre modificările metabolice ale diferitor

organe, ţesuturi şi lichide biologice; -dinamica indicilor metabolici în diverse stări

fiziologice (îmbătrânire, efort fizic) şi în patologii

Page 7: Obiectul biochimiei

PROTEINELE “protos” - primul, de prima

importanţă sunt substanţe organice azotate,

macromoleculare polimere, monomerii cărora sunt α-aminoacizii uniţi între ei prin legături peptidice

Page 8: Obiectul biochimiei

PRINCIPALELE CARACTERISTICI:

1. conţinutul de azot destul de constant (16% din masa uscată);

2. prezenţa permanentă a AA;

3. legăturile peptidice între AA;

4. masa moleculară mare (4-5000 – pînă la milioane de Da);

5. organizarea structurală complicată, care determină proprietăţile fizico-chimice, biologice ale proteinelor.

Page 9: Obiectul biochimiei

ROLUL BIOLOGIC AL PROTEINELOR:

1. structural (colagenul, elastina, keratina);2. catalitic (amilaza, pepsina, LDH);3. de recepţie (receptorii hormonali);4. contractil şi locomotor (dinamic) –actina,

miozina;5. transport şi depozitare (Hb transportă

oxigenul, iar Mb – îl depozitează în muşchi; transferina şi feritina transportă şi depozitează fierul în sănge, ficat);

Page 10: Obiectul biochimiei

ROLUL BIOLOGIC AL PROTEINELOR:

6. reglator şi hormonal - reglarea creşterii şi diferenţierii celulelor (insulina, proteinele- represor);

7. imunologic: de protecție faţă de corpi străini, viruşi, bacterii (imunoglobuline);

8. homeostatic – menţinerea constantelor sângelui (albuminele determină presiunea oncotică – cantitatea, volumul lichidului în vasele sanguine);

9. de rezervă, trofică – proteinele alimentare.

Page 11: Obiectul biochimiei

AMINOACIZII (AA) sunt derivaţii acizilor carboxilici la care un

atom de H este substituit de grupa aminică. În funcţie de poziţia în care a avut loc

substituţia deosebim: α, β, γ 20 de AA fundamentali proteinogeni sunt

α AA şi sunt de linia L.

Page 12: Obiectul biochimiei

PRINCIPIILE DE CLASIFICARE A AA:

1. După structura R lateral (alifatici – aromatici; tio-; hidroxi; mono- sau dicarboxilici)

2. În funcţie de proprietăţile fizico- chimice (acizi, bazici şi neutri)

3. după rolul biologic: indispensabili, semi – şi dispensabili

Page 13: Obiectul biochimiei

DUPĂ STRUCTURA R LATERAL

Page 14: Obiectul biochimiei

DUPĂ STRUCTURA R LATERAL

Page 15: Obiectul biochimiei
Page 16: Obiectul biochimiei
Page 17: Obiectul biochimiei
Page 18: Obiectul biochimiei
Page 19: Obiectul biochimiei

DUPĂ ROLUL BIOLOGIC:

1. AA indispensabili - AA care nu se sintetizează în celulele organismului ( 8 AA: Val, Leu, Ile; Lys, Met, Thr, Trp, Phe şi

2. AA semidispensabili - Arg, His

3. AA dispensabili

Page 20: Obiectul biochimiei

AA MODIFICAȚI

Page 21: Obiectul biochimiei

AA NEPTOTEINOGENI-alanina – component al CoAОrnitina - intermediar al ciclului

ureogeneticCitrulina - intermediar al ciclului

ureogeneticHomocisteina, Homoserina - intermediari

în metabolismul AAGABA - neuromodulator

Page 22: Obiectul biochimiei

GRADELE DE ORGANIZARE ALE MOLECULEI PROTEICE

Structura:

primară secundară terţiară cuaternară

Page 23: Obiectul biochimiei

STRUCTURA PROTEINELOR

Page 24: Obiectul biochimiei

STRUCTURA PRIMARĂ succesiunea AA din

lanţul polipeptidic determinată genetic. este stabilizată de

legăturile peptidice covalente, care se formează la interacţiunea grupei -carboxilice a unui AA cu -aminogrupa următorului AA.

Page 25: Obiectul biochimiei
Page 26: Obiectul biochimiei

FRAGMENT AL STRUCTURII PRIMARE

Page 27: Obiectul biochimiei

PROPRIETĂŢILE LEGĂTURII PEPTIDICE:

este o legătură covalentă coplanarea – toţi atomii grupelor peptidice se află

într-un singur plan

Page 28: Obiectul biochimiei

PROPRIETĂŢILE LEGĂTURII PEPTIDICE:

2 forme de rezonanţă

(ceto sau enol)

Page 29: Obiectul biochimiei

PROPRIETĂŢILE LEGĂTURII PEPTIDICE:

poziţia trans a substituienţilor în raport cu leg C-N

Page 30: Obiectul biochimiei

PROPRIETĂŢILE LEGĂTURII PEPTIDICE:

capacitatea de a forma legături de hidrogen (fiecare gr. peptidică poate forma 2 legături de hidrogen)

Page 31: Obiectul biochimiei

LEGĂTURA PEPTIDICĂ ATIPICĂ ESTEFORMATĂ DE GRUPA IMINO A PRO SAU HYP

Page 32: Obiectul biochimiei

DETERMINAREA STRUCTURII PRIMARE

2 etape: A. determinarea compoziției AA B. determinarea succesiunii AA

Page 33: Obiectul biochimiei

DETERMINAREA COMPOZIȚIEI AA ÎN PROTEINĂ

1. Hidroliza acidă completă2. Separarea AA (cromatografia pe hîrtie,

schimb de ioni)3. Determinarea cantitativă a fiecărui

fragment (spectrofotometric). În etapa a 2 și a 3 – se folosește

secvențiatorul AA

Page 34: Obiectul biochimiei

PRINCIPIILE DE DESCIFRARE A SUCCESIUNII AA-ETAPELE: Determinarea acidului N și C terminal hidroliza selectivă a proteinei (prin metodele

enzimatice (tripsina, chimotripsina, pepsina) sau chimice (cu bromura cianidică))

identificarea succesiunii AA în fragmentele obţinute prin metoda Edman.

restabilirea structurii primare a proteinelor prin suprapunerea diferitor segmente de peptide stablindu-se astfel segmentele de coincidenţă (metoda “amprentelor digitale” sau ” metoda hărţilor de peptidă”

Page 35: Obiectul biochimiei

SUPRAPUNEREA DIFERITOR SEGMENTE DE PEPTIDE

Page 36: Obiectul biochimiei

PRINCIPIILE DE DESCIFRARE A AA N ŞI C TERMINAL:

La determinarea AA N-terminal se utilizează: 1. -metoda Sandger (cu fluordinitrobenzol)2. - metoda Edmann (cu fenilizotiocianat)3. -metoda cu dansyl4. - metoda enzimatică (cu aminopeptidaza)Determinarea AA C-terminal se efectuează prin:1. metoda chimică cu hidrazina (metoda Acabori)2. metoda enzimatică (carboxipeptidază)3. folosind reducători: NaBH4 sau LiBH4

Page 37: Obiectul biochimiei

METODA LUI SANDGER

Page 38: Obiectul biochimiei
Page 39: Obiectul biochimiei

METODA LUI EDMAN

Page 40: Obiectul biochimiei

METODA EDMANN

Repetarea metodei: 30-40 AA

Metoda a fost automatizată cu ajutorul secvențiatorului Edmann.

Page 41: Obiectul biochimiei

METODA LUI ACABORI

Page 42: Obiectul biochimiei
Page 43: Obiectul biochimiei

ORICE DEREGLARE A STRUCTURII PRIMARE A PROTEINELOR DUCE LA AFECTAREA PROPRIETĂŢII BIOLOGICE.

Ex: - dacă în poziţia 6 a lanţului β al Hb în loc de Glu se include Val – Hb – S – care devine mai nestabilă, mai rău fixează O2 , este insolubilă şi duce la apariţia anemiei cu celule falciforme.

Page 44: Obiectul biochimiei

STRUCTURA SECUNDARĂ reprezintă modul înpachetarii catenei polipeptidice într-o

structură ordonată, datorită formării legăturilor de hidrogen între grupele peptidice ale unei catene sau a catenelor învecinate.

Page 45: Obiectul biochimiei

STRUCTURA SECUNDARĂ

După configuraţie structura secundară se împarte în:

1.-spirală (Mb)2.-structură (fibroina din mătase,

acvapurinele)3.spirala de colagen

Page 46: Obiectul biochimiei

PARTICULARITĂŢILE DE BAZA ALE -SPIRALEI:

1. Formată de o singură catenă polipeptidică

2. orientată spre dreapta

3. posedă simetrie elicoidală;

4. legăturile de hidrogen se formează între grupele peptidice ale 1şi ale celui de al 4 rest de AA;

5. radicalii laterali ai AA nu participă la formarea -spiralei şi sînt dispuşi în exterior.

Page 47: Obiectul biochimiei

PARTICULARITĂŢILE DE BAZA ALE -SPIRALEI:

6. regularitatea şi identitatea spirelor:

h unei spire=0,54 nm (5,4A) şi cuprinde 3,6 resturi de AA

(înălţimea unui AA este de 0,15 nm sau 1,5 A).

Page 48: Obiectul biochimiei

PARTICULARITĂŢILE DE BAZA ALE -SPIRALEI:

7. Periodicitatea regularităţii -spiralei este egală cu 5 spire sau cu 18 AA. Lungimea unei perioade este de 2,7 nm.

Page 49: Obiectul biochimiei

AMINOACIZII CE DIMINUIEAZĂ FORMAREA ELICEI:

Prezenţa: prolinei (atomul de N nu are H şi nu e capabil să

formeze legături de hidrogen intracatenar – se formează o îndoire, o încovoiere în lanţ)

radicalilor voluminoşi (Val, Ile; Asn conferă o strângere sterică a elicei)

Ser, Thr – gr. OH pot forma punţi de H – pot servi ca factori destabilizatori

Glu, Lyz, His, Arg – apar forţe electrostatice de respingere sau atragere

Page 50: Obiectul biochimiei

-STRUCTURĂ are configuraţia curbată, care se formează cu

ajutorul legăturilor de hidrogen intercatenare în limită unor sectoare a aceluiaşi lanţ polipeptidic sau a lanţurilor alăturate.

Această structură se mai numeşte structură în straturi pliate.

Page 51: Obiectul biochimiei

-structură poate fi de 2 tipuri:

1. „cross formă” – participă un singur lanţ

2. -structură completă – participă 2 sau mai multe catene, care poate fi:

paralelă (N-terminaţiile catenelor polipeptidice sunt îndreptate în aceeaşi direcţie)

antiparalelă (N-terminaţiile sînt îndreptate în diferite direcţii).

Page 52: Obiectul biochimiei
Page 53: Obiectul biochimiei
Page 54: Obiectul biochimiei
Page 55: Obiectul biochimiei

DEOSEBIRILE DE ALFA SPIRALĂ :

are formă plată distanţa între 2 resturi de AA este de 3,5 A punţile de H sunt intercatenare dar nu

intracatenare ca la spirală radicalii AA se orientează în ambele părţi

ale structurii beta Met, Val, Ile – favorizează formarea

structurii plisate, Lys, Ser, Asp - o destabilizează

Page 56: Obiectul biochimiei

STRUCTURA TERŢIARĂ reprezintă modul de împachetare a lanţului

polipeptidic în spaţiu tridimensional. proteinele se împart în: globulare (Mb) şi fibrilare (cheratina, fibrina, miozina,elastina)

Page 57: Obiectul biochimiei

FORMELE FIBRILARĂ ŞI GLOBULARĂ ALE STRUCTURII TERŢIARE A PROTEINELOR

Page 58: Obiectul biochimiei

keratin

collagen

catalase

Page 59: Obiectul biochimiei

LEGĂTURILE CE STABILIZEAZĂ STRUCTURA TERŢIARĂ:

se formează datorită interacţiunii dintre radicalii AA situaţi la distanta.

I. Legăturile covalente: disulfidice (Cys-SH + HS-Cys --- Cys-S-S-

Cys, Esterice (Glu-COOH + HO-Ser ----- Glu-CO-O-

Ser Pseudopeptidice - Glu-COOH + έH2N-Lys ---

Glu-CO-HN-Lys

Page 60: Obiectul biochimiei

LEGĂTURILE CE STABILIZEAZĂ STRUCTURA TERŢIARĂ:

II. Legături necovalente, slabe - de hidrogen,- hidrofobe,- ionice,

- -forţele Van der Waals (doi atomi se apropie la o distanţă de 3-4 A)

Page 61: Obiectul biochimiei

Anume organizarea în structură tridimensională conferă proteinelor activitate biologică.

Radicalii AA, care posedă rotaţie liberă interacţionează, catena ciudat se curbează în diferite locuri.

Page 62: Obiectul biochimiei

Radicalii hidrofobi evitând apa se concentrează în interior pe când grupele hidrofile se situează la suprafaţa moleculei şi interacţionează cu apa, de aceia molecula gigantă de proteină se dizolvă bine în apă.

Page 63: Obiectul biochimiei

În procesul stabilirii structurii terţiare se formează centrele de legătură (active) unde se leagă o anumită substanţă numită la general ligand.

Ligandul este steric şi electrostatic complementar CA (de ex. substratul cu centrul activ al enzimei respective).

Page 64: Obiectul biochimiei

STRUCTURA DOMENICĂ

Un domeniu al unei proteine multidomeniale corespunde unei porţiuni continue în structura primară a lanţului polipeptidic care este împachetat într-o entitate funcţională şi are o organizare proprie secundară şi terţiară.

Page 65: Obiectul biochimiei

DOMENIILE: – reprezintă regiuni

compacte, rigide cu organizare terţiară (globulară) , separate între ele de segmente mai puţin rigide care permit mişcarea unui domeniu în raport cu altul.

Page 66: Obiectul biochimiei

DOMENIILE:sunt responsabili de anumite funcţiicu structuri şi proprietăţi similare sunt

prezente în diferite proteine cu roluri asemănătoare.

- Ex:domeniul de legare a hemului în molecula Mb, Hb,citocromilor

Page 67: Obiectul biochimiei

FOLDINGUL După sinteză, proteine se impachetează în structura

secundară, deteminată de cea primară, apoi se asamblează în una din miile de variante posibile în structura tertiară.

doar o singură conformație pe care o poate lua proteina este asociată cu funcție biologică

FOLDING – aranjarea spaţială corectă a catenei

Page 68: Obiectul biochimiei

MOLECULELE CHAPERON (NOŢIUNE)

Reprezintă o familie de proteine care direcționează asamblarea proteinei spre

unica configurație biologic activă mai sunt definite ca “proteine de şoc hipertermic” sau “proteine însoţitoare” interacţionează cu polipeptidele în diverse etape ale procesului de pliere

Page 69: Obiectul biochimiei

MOLECULELE CHAPERON (CLASIFICARE)

După origine se împart în 2 grupe:- I - CPN60 ( cunoscut sub numele de HSP60 sau GroEL), gasite in bacterii, mitocondrii si plastide. -II (CCT, Tric sau termosome), găsite în citoplasma eucariotelor. După masa moleculară se împart în: HSP60,70,90...:Printre aceeste proteine sunt şi unele cu activitate enzimatică:-Protein disulfide isomerase (PDI),Peptidyl prolyl cis-trans-isomerase (PPI),

Page 70: Obiectul biochimiei

CHAPERONINELE:MECANISM DE ACŢIUNE

-CREAZĂ UN SPAŢIU ÎNCHIS UNDE ARE LOC ASAMBLAREA PRIMARĂ

- URTILIZEAZA ENERGIA SCINDĂRII ATP-ULUI

Page 71: Obiectul biochimiei

ASAMBLAREA INCORECTĂ A PROTEINELOR ÎN STRUCTURA

TRIDIMENSIONALĂ DUCE LA FORMARE DE PROTEINE:

- toxice - prionii –agenţi cauzaţi ai encefalopatii spongiforme transmisibile, boala Creutzfeldt-Jacob la om; scarpia la ovine, encefalopatia spongiformă la bovine (“boala vacii nebune”).

- inactive, care se acumulează sub formă de amiloizi –amiloidoze - apariţia unor structuri fibrilare lungi asamblate sub formă de foi pliate β, peptidele se agregă generînd amiloidul din parenhimul cerebral şi din jurul vaselor sanguine (boala Alzheimer, diferite cardiopatii şi polineuropatii)

- care se scindează rapid - egală cu insuficienţa unor proteine.

Page 72: Obiectul biochimiei

STRUCUTRA CUATERNARĂ

aranjarea spaţială într-o moleculă unică a mai multor catene polipeptidice Proteina integră reprezintă oligomerul şi posedă structură cuaternară.

Fiecare lanţ în parte e numit protomer sau subunitate.

Activitate biologică posedă doar molecula integră, protomerii separaţi sunt inactivi.

Ex.: CK (2); Hb (4); LDH (4); GDH (6)

Page 73: Obiectul biochimiei

MOLECULA HEMOGLOBINEI CONSTĂ DIN 4 PROTOMERI

Page 74: Obiectul biochimiei

LEGĂTURILE CE DETERMINĂ ŞI STABILIZEAZĂ STRUCTURA

CUATERNARĂ: legăturile necovalente (de hidrogen, forţele

Van der Waals, electrostatice, forţe hidrofobe etc.).

Cât priveşte legăturile covalente (disulfidice, pseudopeptidice), ele deasemenea stabilizează aceste structurii, însă nu determină formarea lor.

Asamblarea protomerilor în structura cuaternară se realizează între suprafeţele de contact complementare.

Interacţiunile prin suprafeţe complementare prezintă fenomenul de cooperare- primele interacţiuni favorizează formarea celorlalte

Page 75: Obiectul biochimiei

COLAGENUL cea mai răspândita proteină din

organism (30-35% din cantitatea totală de proteine).

este o proteină extracelulară, fibrilară, componenta majoră a ţesutului conjuctiv şi osos.

Rolul:1. în ţesutul conjuctiv ea oferă rezistenţă, 2. în cel osos constituie carcasa organică

a mineralizării.

Page 76: Obiectul biochimiei

PARTICULARITĂŢI STRUCTURALE:

1. Fiecare al treilea AA din catenă este prezentat prin glicină (30%)

2. Fiecare al patrulea - prin Pro şi hidroxiPro (25%)

3. Conţine 10% Ala4. Conţine hidroxilizină5. Conţinut redus de Tyr, absenţa Trp şi Cys

Se deosebesc 3 tipuri de lanţuri peptidice: 1, 2, 3. 1 prezintă 5 subtipuri:: 1I, 1II, 1III, 1IV, V. Prin combinarea lor se formează diverse tipuri de colagen.

Page 77: Obiectul biochimiei

(I)PARTICULARITĂŢILE STRUCTURII PRIMARE:

prezintă o catenă polipeptidică curbată alcătuită din circa 1000 AA. • succesiune repetitivă – (Gly-X-Y)n,

unde X şi Y sunt în majoritatea cazurilor Pro şi Hyp

un număr mare de legături peptidice atipice, formate de grupa imino a Pro şi hidroxi Pro

Page 78: Obiectul biochimiei

II. PARTICULARITĂŢILE STRUCTURII SECUNDARE:

α-spirala colagenică (alfa spirală cu simetrie elicoidală nu se poate forma din cauza Pro, OH-Pro şi Gly)

stabilizată de interacţiuni sterice între inelele Pro şi Hyp

răsucită spre stângamai laxă decât α-spirala clasică: 1 spiră – 3,3

resturi de AA

Page 79: Obiectul biochimiei

A. Alpha-helix B.Collagen helix

Page 80: Obiectul biochimiei

PARTICULARITĂŢILE STRUCTURII COLAGENULUI (III)

nu posedă structură terţiară tipică3 alfa catene spiralate, răsucite împreună

sub forma unei spirale comune formează tropocolagenul

Tropocolagenul - unitatea structurală a colagenului

este stabilizat de legături de hidrogen între grupele peptidice din diferite catene

Page 81: Obiectul biochimiei
Page 82: Obiectul biochimiei

COLAGENUL: .

Page 83: Obiectul biochimiei

COLAGENUL: Structura cuaternară:

aşezarea subunităţilor de tropocolagen sub formă de trepte, fiecare moleculă fiind deplasată cu ¼ din lungime faţă de moleculele vecine.

Monomerii sunt legaţi stabil prin legături covalente încrucişate inter şi intramoleculare, care le conferă microfibrilelor rezistenţă mecanică.

Page 84: Obiectul biochimiei

COLAGENUL:

Prin asocierea microfibrilelor se formează fibrilele, iar din ele - fibra de colagen.

Colagenul este proteina care activ fixează ionii de Ca2+.

Page 85: Obiectul biochimiei

ORGANIZAREA STRUCTURALĂ A COLAGENULUI

Page 86: Obiectul biochimiei

CLASIFICAREA PROTEINELOR

SIMPLECONJUGATE

Page 87: Obiectul biochimiei

PROTEINELE SIMPLE (HOLOPROTEINE)

Histonele localizate în nucleu, conţin AA bazici pînă la 30% (Arg,

Lys). au sarcina pozitivă, sunt legate electrostatic cu AN.

Rolul: reglarea metabolică a activităţii genomului, funcţie structurală

Page 88: Obiectul biochimiei

ALBUMINELE- – principalele P plasmatice.

Albuminele:

1. masă moleculară mică,

2. PI 4,7,

3. sarcină negativă,

4. solubile în apă.

Rolul: determină presiunea oncotică, participă la transportul substanţelor.

Page 89: Obiectul biochimiei

PROTEINELE CONJUGATE (HETEROPROTEINE, PROTEIDE):

1. Nucleoproteine2. Cromoproteine3. Fosfoproteine4. Lipoproteine5. Metaloproteine6. Glicoproteine

Page 90: Obiectul biochimiei

NUCLEOPROTEINELE compuse din proteine şi acizi nucleici. Ex.: cromatina; ribosomul Componenţa proteică o alcătuiesc

histonele, bogate în Arg şi Lys. Rol: stocarea, transmiterea şi exprimarea

informaţiei genetice, biosinteza proteinelor, diviziunea celulară.

Page 91: Obiectul biochimiei

CROMOPROTEINELE – COMPUSE DIN PROTEINĂ ŞI PARTEA NEPROTEICĂ

COLORATĂ.

Reprezentanţii: hemoproteidele (Mb; Hb), sistemul de citocromi, catalaza, peroxidaza, clorofila.

Rolul:

1. participă în fotosinteză

2. transportul oxigenului şi CO2

3. reacţiile de oxido-reducere

4. senzaţiile de lumină şi culoare

Page 92: Obiectul biochimiei

MIOGLOBINA STRUCTURĂ: Mb - alcătuită dintr-un singur lanţ polipeptidic (153

AA) de care este legat hemul prin legături necovalente.

Are formă globulară (77%- alfa helix înfăşurat spre dreapta; 23%- structură nehelicoidală, unde predomină Pro).

Rolul: fixează în mod reversibil O2 din muşchi (îl preia de la Hb şi îl cedează MC musculare)

Page 93: Obiectul biochimiei

HEMOGLOBINA STRUCTURĂ: Hb: formată din 4 lanţuri polipeptidice: 2 alfa

formate fiecare din 141 AA şi 2 beta formate fiecare din 146 AA. Fiecare lanţ polipeptidic este legat de un hem.

Rolul: Transportul oxigenului ca sistem tampon

Page 94: Obiectul biochimiei

STRUCTURA HEMULUI

4 inele pirolice + Fe 2+ +punţi metinice (α, β, γ, δ)

4 radicali metil

2 vinil 2 resturi de

a propionic

Page 95: Obiectul biochimiei

MB ŞI HB

•Mb proteină monomerică•Hb heterotetramer (a2b2)

myoglobin

hemoglobin

Page 96: Obiectul biochimiei

O moleculă de Hb acceptă 4 molecule de O2 după mecanismul cooperativ (ce înseamnă că alipirea primei molecule de O2 este mai lentă decît a celorlalte şi adiţionarea ei măreşte gradul de fixare a celorlalte molecule de O2.

Locul fixării este fierul hemoglobinei (în locul histidinei distale); fierul în oxihemoglobină rămîne cu gradul de oxidare +2.

Page 97: Obiectul biochimiei

OXYGEN BINDING CURVES

Page 98: Obiectul biochimiei

FOSFOPROTEINELE: P + ACIDUL FOSFORIC (LEGATE PRIN LEGĂTURI ESTERICE- DE HIDROXIAMINOACIZI SER, TRE ) : GLICOGEN FOSFORILAZA Reprezentanţi: glicogen fosforilaza; cazeinogenul

(proteina laptelui), vitelina, vitelenina (din gălbenuşul de ou), ihtulina (din icre de peşte).

Rolul:

- servesc ca material energetic, plastic în porocesul de embriogeneză şi creştere postnatală

- alimentar

Page 99: Obiectul biochimiei

LIPOPROTEINE - PROTEINE + LIPIDE (FOSFOLIPIDE, ACIZI GRAŞI LIBERI, COLESTEROL) Rolul: 1. Reprezintă constituienţi structurali ai celulelor2. intervin în permeabilitatea biomembranelor3. participă la transportul prin sânge şi limfă a unor

substanţe liposolubile (vitaminelor liposolubile A, D, E, K, unor hormoni, medicamente)

4. furnizează energia în plasma sanguină lipoproteinele se diferenţiază în 4

fracţiuni pe baza densităţii lor:1. - chilomicronii (d mai mică ca 0,95)2. - cu densitate foarte mică (VLDL) (d mai mică ca

1,006)3. - cu densitate mică (LDL) (d mai mică ca 1,065)4. - cu densitate mare (HDL) (d mai mică ca 1,2)

Page 100: Obiectul biochimiei
Page 101: Obiectul biochimiei

GLICOPROTEINELE – PROTEINE + GLUCIDICĂ (GLUCOZAMINĂ, GALACTOZAMINĂ, A. HIALURONIC, GLUCOZAMINGLICANI) Rolul:1. Receptori 2. sunt constituienţi plastici ai celulei, intră în

componenţa membranelor biologice3. au rol de protecţie a mucoaselor

gastrointestinale, ale aparatului respirator şi urogenital faţă de acţiunea enzimelor proteolitice, a unor compuşi chimici sau agenţi mecanici

4. sunt componente specifice de grup sanguin

5. participă în reacţiile imunologice

Page 102: Obiectul biochimiei
Page 103: Obiectul biochimiei

METALOPROTEINE: PROTEINĂ +METAL (FE, CU,

ZN, )

Feritina – conţine Fe, localizată în ficat, constituie rezerva, depozitul de Fe din organism

Transferina – conţine Fe, Cu şi Zn, se află în plasma sanguină, transportă Fe în oprganism

Ceruloplasmina – conţine Cu, se află în plasma sanguină, transportor al Cu în organism şi acţiune oxidazică asupra vitaminei C.

Page 104: Obiectul biochimiei

II. CLASIFICAREA PROTEINELOR proteine all-α -lanţul polipeptidic are

structură secundară de α-elice in proporţie de aproape 100% şi elicele sunt impachetate intr-o formă compactă, globulară;

proteine all-b -lanţul polipeptidic prin indoire formează structuri b cu lanţuri antiparalele,aşezate unele langă altele;

proteine α+b -segmentele cu organizare secundară α şi b sunt segregate in structura terţiară;

Page 105: Obiectul biochimiei

II. CLASIFICAREA PROTEINELOR

proteine α/b -segmentele α şi b alternează in structura terţiară;

e.) proteine fără organizare secundară α sau b , plierea lanţului fiind hotărată numai de interacţiunile intre R;in general sunt proteine mici ce cuprind un număr relativ mare de punţi disulfurice

Page 106: Obiectul biochimiei

PROTEINELE FIXATOARE DE CA sunt proteine ce posedă afinitate majoră de

legare a ionilor de Ca. conţin resturi de γ carboxiglutamat de care se

fixează ionii de Ca. γ carboxiglutamatul se formează din Glu sub

acţiunea enzimei, care ca coenzimă are vitamina K.

Exemple:1. calmodulina – o proteină mică ce posedă patru

locusuri de fixare pentru ionii de Ca2. factorii coagulării sângelui(II,VII,IX, X)3. fosfolipaza C4. Colagenul5. Ca-ATP-aza

Page 107: Obiectul biochimiei
Page 108: Obiectul biochimiei

PEPTIDELE ACTIVE: Renin/Angiotensina Peptidele natriuretice Leptina Endotelinele

Page 109: Obiectul biochimiei

ENDOTELINELE o familie de peptide noi cu activitate biologică activă

deosebită. ET- sunt cei mai efectivi factori vasoactivi. Clasificare: deosebim ET1, ET2, ET3 (izoforme). Deosebirile între ele:

1. sunt codificate de gene diferite

2. sunt expresate în mod diferit în ţesut vascular.

3. ET-1 şi ET2 – sunt vasoconstrictori puternici Structură: ET1 un peptid biciclic format din 21 aminoacizi.

Page 110: Obiectul biochimiei

ENDOTELINELE Rolul:1.reglează tonusul vaselor 2.participă în patogenia HTA esenţiale3.ET-1 şi ET-3 – posedă efecte

neurologice (în ţesutul nervos intensifică sinteza fosfoinozitolfosfatului), provoacă modificări în reacţiile de comportare, efect central cardiorespirator.

4.reglează starea funcţională a endoteliului, stratului intim arterial şi venos din diferite vase

Page 111: Obiectul biochimiei

ENDOTELINELE

Acţiune: 2 tipuri de receptori: ET-A şi ET-B – situaţi nu numai în endoteliul vaselor ci şi în rinichi, plămîni, suprarenale, ţesut nervos.

ET-A –receptorii + G proteină - mediază constricţia vaselor.

ET-B – receptorii - fosfolipazei C şi A2 - majorarea nivelului de Ca intracelular – ↑ prostaciclinei şi/sau tromboxanului A2 – atât constricţia cât şi dilatarea vaselor.

Page 112: Obiectul biochimiei

PEPTIDELE NATRIURETICE Familia pepidelor natriuretice

include:1. peptidul natriuretic atrial (ANP), 2. peptidul natriuretic de tip B

(BNP)3. peptidul natriuretic de tip C. Fiecare peptid este codat de gene

diferite

Page 113: Obiectul biochimiei

SINTEZA: Primar se sintetizează sub formă de

precursori, ce sunt clivate în fragmente de dimensiuni diferite

îşi produc efectul biologic prin legarea de receptori specifici din sistemul cardiovascular, rinichi, şi SNC .

Page 114: Obiectul biochimiei

ACŢIUNI FIZIOLOGICE:

vasodilataţie şi efect hipotensor, producerea de natriureză şi diureză, inhibarea sistemului nervos simpatic, facilitarea de interacţiuni complexe cu sistemul

neurohormonal (incluzînd sistemul renină-angiotensină-aldosteron, endoteline , cytokine şi vasopresină)

inhibarea mecanismelor fiziopatologice responsabile de hipertrofia şi remodelarea ventriculară şi vasculară,

efecte benefice asupra disfuncţiei endoteliale (secundară proceselor de ateroscleroză, incluzând acoperirea fisurilor de stres şi reglarea coagulării şi a fibrinolizei, precum şi inhibiţia activării plachetelor sanguine).

Page 115: Obiectul biochimiei

a. ANP 1. este produs predominant în atriile cardiace2. nivelele sanguine sunt ridicate la pacienţii cu volum intravascular

ridicat şi insuficienţă cardiacă congestivă. b. BNP 1. la oameni prezintă o concentraţie mai mare în cord (mai ales

ventriculi), decât în creier. 2. BNP este sintetizat ca răspuns la stresul ventricular şi creşterea

presiunii intraventriculare. Atât ANP cât şi BNP:1. vasodilataţie 2. reduc tonusul nervos simpatic 3. induc natriureză prin acţiunea asupra vaselor renale şi

tubulilor renali. c. CNP 1. este distribuit predominant în SNC, rinichi şi celulele endoteliale. 2. are proprietăţi vasodilatatorii şi de inhibiţie a factorilor de creştere.