nomenklatura 2014
TRANSCRIPT
![Page 1: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/1.jpg)
1
Nomenklatura enzimaNomenklatura enzima
Predavanja iz Kliničke enzimologijeIntegrisane akademske studije: Farmacija-
medicinska biohemijaŠkolska 2014/2015. godina
![Page 2: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/2.jpg)
2
Klasifikacija i nomenklatura enzimaKlasifikacija i nomenklatura enzima
• Imena enzima prema istraživaču
• Prema supstratu na koji deluju:– Ureaza
– Arginaza
– Fosfataza
• Prema ulozi u metabolizmu– Dijaforaza
– Katalaza
• Trivijalna imena– Pepsin, tripsin, itd
• International Union of Biochemistry (IUB) 1955. je uspostavila komisiju za enzime
– Internacionalna enzimska komisija
– International Enzyme Commission (EC)
– International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB)
• Sistemska nomenklatura i klasifikacija
• Osnov je katalizovana reakcija, odražava i karakter reakcije• http://www. chem.qmw.ac.uk/iubmb/enzyme/accessed may 6.2011.
![Page 3: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/3.jpg)
3
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
• Klasa• Podklasa• Pod-podklasa• Broj enzima klasifikacioni broj
• Podela enzima u 6 rodova• Enzimski broj EC (enzyme commission) četiri cifre, odvojene
tačkama EC 2.7.3.2.
Prva cifra klasa (rod) enzima 1. Oksidoreduktaze2. Transferaze3. Hidrolaze4. Liaze5. Izomeraze6. Ligaze (sintetaze)
![Page 4: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/4.jpg)
4
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Druga cifra podklasa enzima• Oksidoreduktaze• funkcionalna grupa u donoru koja podleže oksidaciji
1. alkoholna funkcija2. aldehidnu ili ketonsku
• Transferaze priroda grupe koja se prenosi1. grupa sa jednim C-atomom2. aldehidni ili ketonski ostatak
3. acil grupa
• Hidrolaze– Tip hemijske veze koja podleže hidrolizi
• Liaze tip veze koja se prekida• Izomeraze tip izomerizacije
![Page 5: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/5.jpg)
5
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Treća cifra pod-podklasa enzima• Oksidoreduktaze - tip akceptora koji sudeluje u reakciji
koenzim NAD ili NADPcitohrommolekulski kiseonik
• Transferaze - tip grupe na koju se prenosi C-1 grupaMetilKarboksil
Četvrta cifra serijski, individualni broj enzima
![Page 6: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/6.jpg)
6
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklaturaKlase enzimaKlase enzima
Oksidoreduktaze
Katalizuju razne reakcije oksidoredukcije
AH2 + B → A + BH2
Primeri:Alkohol dehidrogenaza (alkohol:NAD+ oksidoreduktaza, EC. 1.1.1.1)Citohrom oksidazaL- i D-amino oksidazaPodklase: dehidrogenaze, oksidaze, reduktaze, peroksidaze, katalaze i hidrolaze
Transferaze
Katalizuju prenos grupe izmeñu donora i akceptora
A-X + B → A + B-X
PrimeriHexokinase (ATP: D-heksoza- 6-fosfotransferaza, EC.2.7.1.1)Podklase: transaldolaze, transketolaze, aci-, metil-, glukozil- i fosforiltransferaze,
kinaze.
![Page 7: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/7.jpg)
7
HidrolazeKatalizuje raskidanje veze sa vodom
A-B + H2O → AH + BOH
Primeri:Lipaza (triacilglicerol acil hidrolaza, EC. 3.1.1.3)Holin esteraza, kisela i alkalna fosfatata, ureazaPodklase: Esteraze, glikozidaze, fosfataze, peptidaze, tiolaze, fosfolipaze,
amidaze, dezaminaze i ribonukleaze
LiazeKatalizuje uklanjanje ili dodavanje grupa pri čemu dvoguba veza ili ostaje ili
se uklanja(nehidrolitičke i neoksidativne reakcije).
A-B + X-Y → AX + BY
Primeri:Aldolaza (ketoza 1-fosfat aldehid liaza, EC. 4.1.2.7), fumarazaPodklase: Dekarboksilaze, aldolaze, hidrataze, dehidrataze, sintaze.
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklaturaKlase enzimaKlase enzima
![Page 8: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/8.jpg)
8
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklaturaKlase enzimaKlase enzima
IzomerazeKatalizuju izomerizaciju (recemizaciju) optičkih ili geometrijskih izomera.Intramolekularna premeštanja.
A → A’
Primeri:Trioza fosfat izomeraza (D-gliceraldehid 3-fosfat ketoizomeraza, EC. 5.3.1.1.),
retinol izomeraza i fosfoheksoza izomeraza.Racemaze, epimeraze, izomeraze i mutaze.
LigazeKatalizuju reakcije sinteze uz utroška energije ATP
A + B + ATP → A-B + ADP
Primeri:Glutamin sintetaza (L-glutamat amonijum ligaza, EC. 6.3.1.2)Acetil CoA karboksilazaSintetaze i karboksilaze
![Page 9: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/9.jpg)
9
Primer EC broja enzimaPrimer EC broja enzimaKreatin kinaza
Kreatin + ATP ↔ kreatin-fosfat + ADP
EC 2. 7. 3. 2.
Klasa (Transferaze)
Podklasa (Fosfotransferaze)
Pod-podklasa (Azotna grupa ili akceptor)
Individualni broj
![Page 10: Nomenklatura 2014](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022020307/55b5ad18bb61eb66448b473e/html5/thumbnails/10.jpg)
10