nomenklatura 2014

1

Nomenklatura enzimaNomenklatura enzima

Predavanja iz Kliničke enzimologijeIntegrisane akademske studije: Farmacija-

medicinska biohemijaŠkolska 2014/2015. godina

2

Klasifikacija i nomenklatura enzimaKlasifikacija i nomenklatura enzima

• Imena enzima prema istraživaču

• Prema supstratu na koji deluju:– Ureaza

– Arginaza

– Fosfataza

• Prema ulozi u metabolizmu– Dijaforaza

– Katalaza

• Trivijalna imena– Pepsin, tripsin, itd

• International Union of Biochemistry (IUB) 1955. je uspostavila komisiju za enzime

– Internacionalna enzimska komisija

– International Enzyme Commission (EC)

– International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB)

• Sistemska nomenklatura i klasifikacija

• Osnov je katalizovana reakcija, odražava i karakter reakcije• http://www. chem.qmw.ac.uk/iubmb/enzyme/accessed may 6.2011.

3

Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura

• Klasa• Podklasa• Pod-podklasa• Broj enzima klasifikacioni broj

• Podela enzima u 6 rodova• Enzimski broj EC (enzyme commission) četiri cifre, odvojene

tačkama EC 2.7.3.2.

Prva cifra klasa (rod) enzima 1. Oksidoreduktaze2. Transferaze3. Hidrolaze4. Liaze5. Izomeraze6. Ligaze (sintetaze)

4


Druga cifra podklasa enzima• Oksidoreduktaze• funkcionalna grupa u donoru koja podleže oksidaciji

1. alkoholna funkcija2. aldehidnu ili ketonsku

• Transferaze priroda grupe koja se prenosi1. grupa sa jednim C-atomom2. aldehidni ili ketonski ostatak

3. acil grupa

• Hidrolaze– Tip hemijske veze koja podleže hidrolizi

• Liaze tip veze koja se prekida• Izomeraze tip izomerizacije

5


Treća cifra pod-podklasa enzima• Oksidoreduktaze - tip akceptora koji sudeluje u reakciji

koenzim NAD ili NADPcitohrommolekulski kiseonik

• Transferaze - tip grupe na koju se prenosi C-1 grupaMetilKarboksil

Četvrta cifra serijski, individualni broj enzima

6

Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklaturaKlase enzimaKlase enzima

Oksidoreduktaze

Katalizuju razne reakcije oksidoredukcije

AH2 + B → A + BH2

Primeri:Alkohol dehidrogenaza (alkohol:NAD+ oksidoreduktaza, EC. 1.1.1.1)Citohrom oksidazaL- i D-amino oksidazaPodklase: dehidrogenaze, oksidaze, reduktaze, peroksidaze, katalaze i hidrolaze

Transferaze

Katalizuju prenos grupe izmeñu donora i akceptora

A-X + B → A + B-X

PrimeriHexokinase (ATP: D-heksoza- 6-fosfotransferaza, EC.2.7.1.1)Podklase: transaldolaze, transketolaze, aci-, metil-, glukozil- i fosforiltransferaze,

kinaze.

7

HidrolazeKatalizuje raskidanje veze sa vodom

A-B + H2O → AH + BOH

Primeri:Lipaza (triacilglicerol acil hidrolaza, EC. 3.1.1.3)Holin esteraza, kisela i alkalna fosfatata, ureazaPodklase: Esteraze, glikozidaze, fosfataze, peptidaze, tiolaze, fosfolipaze,

amidaze, dezaminaze i ribonukleaze

LiazeKatalizuje uklanjanje ili dodavanje grupa pri čemu dvoguba veza ili ostaje ili

se uklanja(nehidrolitičke i neoksidativne reakcije).

A-B + X-Y → AX + BY

Primeri:Aldolaza (ketoza 1-fosfat aldehid liaza, EC. 4.1.2.7), fumarazaPodklase: Dekarboksilaze, aldolaze, hidrataze, dehidrataze, sintaze.


8


IzomerazeKatalizuju izomerizaciju (recemizaciju) optičkih ili geometrijskih izomera.Intramolekularna premeštanja.

A → A’

Primeri:Trioza fosfat izomeraza (D-gliceraldehid 3-fosfat ketoizomeraza, EC. 5.3.1.1.),

retinol izomeraza i fosfoheksoza izomeraza.Racemaze, epimeraze, izomeraze i mutaze.

LigazeKatalizuju reakcije sinteze uz utroška energije ATP

A + B + ATP → A-B + ADP

Primeri:Glutamin sintetaza (L-glutamat amonijum ligaza, EC. 6.3.1.2)Acetil CoA karboksilazaSintetaze i karboksilaze

9

Primer EC broja enzimaPrimer EC broja enzimaKreatin kinaza

Kreatin + ATP ↔ kreatin-fosfat + ADP

EC 2. 7. 3. 2.

Klasa (Transferaze)

Podklasa (Fosfotransferaze)

Pod-podklasa (Azotna grupa ili akceptor)

Individualni broj

nomenklatura 2014

Health & Medicine